1,720,969 research outputs found
Structure and function of tetrapyrrole biosynthesis enzymes: ALA synthase and cobalt chelatase
No full textModified tetrapyrroles are versatile compounds that are universally utilized by enzymes as co-factors in a myriad of enzyme cata lyzed reaction s. Examples include heme, the cofactor of hemoglobin and myoglobin, that carries and stores molecular oxygen in the blood and muscle respectively, and cobalamin a cofactor that is synthesized by prokaryotes and which is an important nutrient for humans. This work focuses on the enzymatic mechanism of metal chelation and in particular on the structural characterization of the cobalt-chelatases CbiK from Salmonella enterica and CbiX from Archaeoglobus /u/gidus that take part in the biosynthesis of cobalamin. Crystal structures of the enzyme-tetrapyrrole complex were obtained that reveal radically different modes of binding compared to the well characterized ferrochelatases. Furthermore protein structures reveal the evolutionary re lationships between cobaltochelatases from different organisms. The second part of this thesis is focusing on 5-aminolevulinic acid synthase (ALAS), an enzyme that catalyzes the synthesis of the first common precursor in t he biosynthesis of all tetrapyrroles, 5-aminolevulinic acid (ALA). Mutations in the C-terminal region of the human erythroid specific ALAS (ALAS2) lead to X-linked dominant protoporphyria a condition that is characterized by the accumulation of protoporphyrin in red blood cells leading to photosensitivity and liver disease. The erythroid specific ALAS2 and its disease - causing variants have been characterized using steady state kinetic methods to investigate the molecular basis of the disorder. Furthermore the "house-keeping" ALASl isoenzyme was characterized as well and the effect of mutations equivalent to the disease causing ALAS2 mutations have been tested on the enzyme. Chimeric bacterial enzymes that have been engineered to contain the human erythroid specific C-terminal extension were characterized as an alternative to understanding the role of the C-terminal extension in regulating the activity of the human ALASl and ALAS2EThOS - Electronic Theses Online ServiceGBUnited Kingdo
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
Βιομηχανικές διεργασίες και σχεδιασμός της παραγωγής ηλεκτρικού οξέος μέσω συνεχών μικροβιακών ζυμώσεων με χρήση αποβλήτων που προέρχονται από βιομηχανίες παραγωγής χαρτοπολτού
No full textThe scope of this thesis is the evaluation of spent sulphite liquor (SSL) as the main fermentation carbon source for succinic acid (SA) production in continuous cultures. Subsequently, a techno-economic analysis of a process that produces SA from SSL under continuous and fed-batch fermentations strategies is presented. The purpose of the techno-economic analysis is to investigate the economic feasibility of the succinic acid that derived from the utilization of SSL and factors in which the succinic acid production cost has high dependence.SSL is the liquid by-product stream derived from the acidic sulphite process of mainly hardwoods. This waste stream contains solubilised lignin in the form of lignosulphonates and sugars which arise after hemicelluloses degradation. The type of the using wood and the processing conditions employed in the plant are the two main elements that define the sugars contained in SSL. In this study the waste stream that was used resulting from the pulp and paper industry of the Eucalyptus globulus wood.This work was initiated with the evaluation of SSL as substrate in continuous cultures using the wild-type rumen bacterial strains Actinobacillus succinogenes and Basfia succiniciproducens. These strains are considered as two of the most promising strains for industrial implementation. The cultures were initially carried out at constant dilution rate (0.04 h-1) and varying initial commercial xylose concentrations (23-55 g/L) or constant xylose concentration (40 g/L) and varying dilution rates (0.02-0.25 h-1) showing that dilution rates of 0.02-0.15 h-1 led to satisfactory succinic acid production by both microbial strains. In continuous cultures using nanofiltrated SSL, maximum yields of SA were achieved at dilution rate of 0.02 h-1 (0.48 g/g for A. succinogenes and 0.55 g/g for B. succiniciproducens) while maximum values of productivity were obtained at dilution rate of 0.04 h-1 in the case of A. succinogenes (0.67 g/L/h) and 0.1 h-1 (1.6 g/L/h) in the case of B. succiniciproducens. During the fermentation of both strains observed biofilm creation at the solid parts of the reactor. Due to this the biomass concentration was impossible to measure, so the biomass concentrations at different dilution rates for both strains was estimated using metabolic flux analysis. In the techno-economic analysis of SA, the design of the entire SA production process was based on data obtained from experimental results and the material and energy balances were carried out using spreadsheets and validated through UniSim software. Bacterial fermentations were conducted with Basfia succiniciproducens as the SA producer. The down stream design based on direct crystallization process using ion-exchange resins for acidification step, with final purified SA crystals equal to 99% and with a recovery yield of 97% which achieved by recirculation of the side sterams in down stream process. Process simulation was performed for a range of plant capacities, 5, 30, 100 kt of SA per year. The study indicated the feasibility of fermentative SA production from SSL and the minimum selling price (MSP) for 10% annual return on investment was calculated at 2.70 /kg for fed-batch strategy when commercial nitrogen sources were applied. The MSP was reduced to 2.16 /kg for continuous and fed-batch respectively assuming that commercial nitrogen sources are substituted with hydrolysates of corn steep liquor (CSL). The fermentation and evaporation units were identified as significant capital and operating cost contributors and therefore the optimization of bioreactor geometrical characteristic and alternative more cost-effective evaporation technics should be considered in future research.Στόχος της παρούσας διατριβής υπήρξε η αξιολόγηση του παράπλευρου ρεύματος που παράγεται από βιομηχανίες χαρτοπολτού (SSL), ως κύρια πρώτη ύλη για την παραγωγή ηλεκτρικού οξέος, μέσω μικροβιακών ζυμώσεων σε συνθήκες συνεχούς καλλιέργειας σε βιοαντιδραστήρα. Στα πλαίσια της επίτευξης οικονομικότερων διεργασιών, εκπονήθηκε τεχνοοικονομική ανάλυση των διεργασιών παραγωγής ηλεκτρικού οξέος, με χρήση του SSL ως πρώτη ύλη, σε συνεχείς και ημισυνεχείς ζυμώσεις. Απώτερος στόχος του εγχειρήματος αυτού ήταν η διερεύνηση της οικονομικής βιωσιμότητας της παραγωγής ηλεκτρικού οξέος αξιοποιώντας το SSL ως πρώτη ύλη, καθώς και η εύρεση στοιχείων που υποδεικνύουν τους οικονομικούς παράγοντες που σχετίζονται με την παραγωγή του προϊόντος. Το SSL αποτελεί το κύριο παράπλευρο ρεύμα που προκύπτει μετά την όξινη διαδικασία που πραγματοποιείται για την παραγωγή χαρτοπολτού κυρίως σε σκληρά ξύλα. Το υποπροϊόν αυτό περιέχει διαλύτη λιγνίνη υπό την μορφή λιγνοσουλφονικών αλάτων καθώς και σάκχαρα τα οποία προκύπτουν κατά την αποικοδόμηση της ημικυτταρίνης. Το είδος του χρησιμοποιούμενου ξύλου και οι συνθήκες επεξεργασίας αποτελούν τα δύο κύρια σημεία που καθορίζουν το είδος και την περιεκτικότητα των σακχάρων που περιέχονται στο SSL. Στη μελέτη αυτή, χρησιμοποιήθηκε το υποπροϊόν που προέκυψε από τη βιομηχανία επεξεργασίας του φυτού Eucalyptus globulus.Σαν πρώτο στάδιο της μελέτης, αξιολογήθηκε η ικανότητα χρήσης του SSL ως υπόστρωμα σε συνεχείς ζυμώσεις, χρησιμοποιώντας τα βακτηριακά στελέχη Actinobacillus succinogenes και Basfia succiniciproducens. Τα στελέχη αυτά θεωρούνται ως τα δύο πιο υποσχόμενα στελέχη για βιομηχανική εφαρμογή. Αρχικά, οι ζυμώσεις διεξήχθησαν με σταθερό ρυθμό αραίωσης ίσο με 0,04 h-1 και διαφορετικές αρχικές συγκεντρώσεις εμπορικής ξυλόζης (23-55 g/L) ή σταθερή συγκέντρωση ξυλόζης (40 g/L) και διαφορετικές τιμές ρυθμών αραίωσης (0,02-0,25 h-1). Τα αποτελέσματα αυτών των συνθηκών έδειξαν ότι και τα δύο στελέχη παρείχαν ικανοποιητική παραγωγή ηλεκτρικού οξέος σε ένα εύρος ρυθμών αραίωσης μεταξύ 0,02-0,15 h-1. Στις συνεχείς καλλιέργειες με χρήση SSL το οποίο είχε προεπεξεργαστεί με νανοδιήθηση, επετεύχθησαν μέγιστες αποδόσεις ηλεκτρικού οξέος σε ρυθμό αραίωσης 0,02 h-1. Συγκεκριμένα το στέλεχος A. succinogenes είχε απόδοση 0,48 g/g και το στέλεχος B. Succiniciproducens 0,55 g/g. Ωστόσο, η μέγιστη παραγωγικότητα του A. Succinogenes (0,67 g/L/h) παρουσιάστηκε με ρυθμό αραίωσης 0,04 h-1 ενώ στην περίπτωση του B. succiniciproducens η μέγιστη παραγωγικότητα ίση με 1,6 g/L/h επιτεύχθηκε σε ρυθμό αραίωσης 0,1 h-1. Κατά την πραγματοποίηση των ζυμώσεων και στα δύο στελέχη, παρατηρήθηκε η δημιουργία φυσικής ακινητοποίησης του μικροοργανισμού στα μέρη του βιοαντιδραστήρα. Εξαιτίας αυτού, η συγκέντρωση της βιομάζας καθίστανται αδύνατο να μετρηθεί επομένως οι συγκεντρώσεις της βιομάζας σε διαφορετικούς ρυθμούς αραίωσης και για τα δύο στελέχη προσδιορίστηκε με χρήση ανάλυσης μεταβολικής ροής. Για την τεχνοοικονομική ανάλυση του ηλεκτρικού οξέος, ο σχεδιασμός όλης της διεργασίας βασίστηκε στα πειραματικά αποτελέσματα ενώ τα ισοζύγια μάζας και ενέργειας πραγματοποιήθηκαν λύνοντας εξισώσεις που διέπουν οι νόμοι της θερμοδυναμικής και επαληθεύτηκαν μέσω του λογισμικού UniSim. Οι ζυμώσεις για την παραγωγή του ηλεκτρικού οξέος στα αποτελέσματα των οποίων βασίστηκαν οι υπολογισμοί, διενεργήθηκαν με τον μικροοργανισμό Basfia succiniciproducens. Ο πειραματικός σχεδιασμός για την παραλαβή του προϊόντος βασίστηκε στη διαδικασία της απευθείας κρυστάλλωσης του ηλεκτρικού οξέος όπου χρησιμοποιήθηκαν ρητίνες ιοντοανταλλαγής ως μέσω για την μετατροπή των οργανικών αλάτων σε οργανικά οξέα. Οι κρύσταλλοι ηλεκτρικού οξέος που προκύπτουν μέσω αυτής της διαδικασίας έχουν καθαρότητα ίση με 99% ενώ η ανάκτηση του προϊόντος τέθηκε ως 97%. Ο μεγάλος συντελεστής ανάκτησης του προϊόντος οφείλεται στην περαιτέρω επεξεργασία των παράπλευρων ρευμάτων που προκύπτουν από την συνολική διεργασία διαχωρισμού. Κατά την τεχνοοικονομική ανάλυση έγινε προσομοίωση της παραγωγής ηλεκτρικού οξέος για συνεχείς και ημισυνεχείς ζυμώσεις σε τρεις διαφορετικές δυναμικότητες παραγωγής (5, 30 και 100 kt) ηλεκτρικού οξέος ανά έτος. Σκοπός της μελέτης ήταν να αξιολογήσει την οικονομική βιωσιμότητα της βιοχημικής παραγωγής ηλεκτρικού οξέος με χρήση SSL ως πηγής άνθρακα. Από την μελέτη προέκυψε ως ελάχιστη τιμή πώλησης (MSP) ηλεκτρικού οξέος τα 2,70 /kg στις ημισυνεχείς με τη χρήση εμπορικών πηγών αζώτου. Περεταίρω μελέτη για την μείωση των ελάχιστων τιμών πώλησης έδειξε ότι η χρήση πηγών αζώτου προερχόμενων από υδρολύματα θα μείωνε το κόστος πώλησης στα 2,16 /kg, στις συνεχείς και ημισυνεχείς ζυμώσεις αντίστοιχα. Τα στάδια της ζύμωσης καθώς και η εξάτμιση αποδείχθηκαν σημαντικοί οικονομικοί παράγοντες όσον αφορά το λειτουργικό κόστος και το κόστος του κεφαλαίου. Επομένως, η βελτιστοποίηση των γεωμετρικών χαρακτηριστικών του βιοαντιδραστήρα καθώς και εναλλακτικές πιο οικονομικά προσιτές τεχνικές εξάτμισης, θα πρέπει να εξεταστούν σε μελλοντική έρευνα
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
- …
