1,721,060 research outputs found
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Optimization of SAAT (Sonication-Assited Agrobacterium-Mediated transformation) technique to transform Phaseolus vulgaris
No full textPhaseolus vulgaris L. era considerado recalcitrante à transformação por Agrobacterium. Entretanto, alterações no meio de co-cultivo, utilização de linhagens hipervirulentas de Agrobacterium e de vetores binários contendo genes vir demonstraram que o feijoeiro é susceptível à Agrobacterium. No entanto, ainda não foram obtidas plantas transgênicas de feijoeiro por meio deste método. Em 1997, Trick & Finer descreveram a metodologia SAAT ("Sonication assisted Agrobacterium mediated transformation"). Esta técnica consiste em produzir microferimentos no explante através da sonicação por curtos períodos de tempo na presença do Agrobacterium. Por meio deste método foram obtidas plantas transgênicas de soja e trigo. O objetivo do presente trabalho foi ajustar a metodologia SAAT para a transformação de P. vulgaris. A variedade de feijoeiro utilizada foi a Olathe Pinto, a linhagem de Agrobacterium tumefaciens foi LBA4404:pTOK. Foram estudados o efeito do pré-tratamento, tempo de co-cultivo, duração do SAAT e presença de acetoceringona. Os resultados demonstram que a expressão transitória e estável da β-glucoronidase foi maior quando os eixos embrionários foram pré-tratados por 10 a 14 dias em meio de multibrotação. O antibiótico geneticina (G418) apresentou maior capacidade de seleção de brotos do que canamicina, nas concentrações estudadas. SAAT de 60 segundos dos explantes apresenta melhor expressão transitória e estável da β-glucoronidase. O tempo de co-cultivo líquido de 2 horas seguido de 48 horas em meio sólido, na ausência de acetoceringona, apresentou a maior expressão transitória. A presença de acetoceringona (20 mg/l) aumentou a expressão transitória. Pré-incubação por 24 horas não aumentou a eficiência do tratamento SAAT. As análises de microscopia óptica e de varredura demonstraram a presença de rupturas na epiderme, quebras da parede celular e invasão do Agrobacterium nos tecidos subepidérmicos. Os resultados demonstraram que o método SAAT é uma técnica viável para a transformação de P. vulgaris via Agrobacterium.Common bean was considered recalcitrant to Agrobacterium-mediated transformation. After some studies with co-cultivation medium, pre-treatment of explants, hipervirulent Agrobacterium strains and binary vectors with vir genes, it has been reported the susceptibility of Phaseolus vulgaris to some Agrobacterium strains. However, still no transgenic bean has been reported using this method. The Agrobacterium-mediated transformation of P.vulgaris presents several problems, such as the interaction Agrobacterium-host, explant maturity, pre-culture conditions, co-cultivation medium, and selection strategies. The technique SAAT consists to produce microwounds of the explant through sonication during short period of time in presence of Agrobacterium. Using this method Trick & Finer (1997; 1998) obtained transgenic wheat and soybean. The objective of the present work is to adjust the SAAT method to transform common bean. The bean variety used was Olathe Pinto, and Agrobacterium tumefaciens strain LBA4404:pTOK. Transient and stable transformation increased when mature embryos were pre-treated during 10 to 14 days in cytokinin-induced shoot organogenesis medium. Geneticin (G418) was observed to be better than kanamycin to select shoots. SAA T duration effect on transient and stable transformation shown, in both experiments, that 60 seconds presents the best results. Co-cultivation conditions, without acetosyringone, of 2 hours in liquid medium followed by 48 hours in solid medium presented the higher transient expression. Acetosyringone (20 mg/L) increases transient expression and pre-incubation for 24 hours didn't increase SAAT efficiency. Scanning and optical microscopy demonstrated that sonication produces microwounds in the explant epidermal surface, cell wall break and Agrobacterium invasion of subepidermal tissue. Results shown that SAAT is a promising method to transform of P. vulgaris
Alterações na composição da comunidade bacteriana e no perfil metabólico de uma usina de primeira geração de etanol em diferentes condições de produtividade
No full textGrowing concerns about the greenhouse gases emmisions, produced by the fossil fuel combustion, on climate change have intensified the search for alternative sources of energy. In this scenario, bioethanol was recognized as a viable alternative for the replacement of certain fossil fuels. The main route for ethanol production is the ethanolic fermentation of sugary feedstocks. Through the fermentation of sugarcane derivatives, Brazil is the second-largest ethanol producer in the world. The presence of bacterial contaminants is common in all stages of Brazilian ethanol production. It is well known that the presence of contaminants can lead to a decrease in ethanol productivity and cause financial losses for the ethanol industry. In order to evaluate if there are differences in the bacterial community of distinct ethanol productivity yield, samples from must and fermentation tanks were collected from an industrial ethanol production distillery in the Piracicaba region (SP-Brazil) running in a continues system of fermentation. Bacterial communities were identified through metabarcoding sequencing of regions of the 16S rDNA gene. We were able to observe differences in the microbiota from samples representing low and normal ethanol productivity. In the must samples we observed different proportions of bacterial genera. In the fermentation tanks, as expected, we observed a predominance of Lactobacillus. However, despite microbes being from this genus, we observe some differences in OTU patterns in samples from Low and Normal productivity. Since our data showed that there are differences in the distillery community on different productivity conditions, our second goal was to examine the metabolic profile aiming to find potential key metabolites for process monitoring. Using untargeted GC-MS the extracellular and intracellular metabolic profile of the same distillery were explored in low and normal productivity conditions. This approach proved to be effective to select metabolites from the extracellular medium to be further explored for the distillery as potential monitoring markers of productivity, such as the metabolites Oleic acid, Tagatose, 3-O-methyl-Glucose, 5 beta- Dihydrotestosterone, NA 1045 and NA901. Through intracellular analysis it was possible to identify metabolites related to changes in metabolic pathways. We noticed a greater abundance of energy-related metabolism pathways in Normal productivity, such as: Glucose, Glucose-6- phosphate, Lactulose, Maltotriose and Sorbose. It was also possible to detect metabolites related to changes in the microbiological community under different conditions of productivity, such as the metabolite mannitol, for example to select metabolites to be further explored for the distillery as potential monitoring markers of productivity. It was also possible to identify, through GC-MS approaches, some metabolites probably related to changes of the microbial community under distinct fermentative yield situations.As crescentes preocupações sobre os efeitos da queima de combustíveis fósseis nas mudanças climáticas intensificaram as buscas por fontes alternativas de energia. Nesse cenário, o bioetanol despontou como uma alternativa viável para a substituição de combustíveis fósseis na matriz energética. No mundo todo, a fermentação é a via principal de produção de etanol. No Brasil, que é o segundo maior produtor de etanol no mundo, a produção do álcool é obtida principalmente por meio da fermentação de derivados da cana-de-açúcar por leveduras. No entanto, a presença de contaminantes bacterianos é comum em todas as etapas da produção. É de amplo conhecimento que a presença de contaminantes pode levar a uma diminuição na produtividade do etanol e levar a indústria a grandes perdas financeiras. Para avaliar se existem diferenças na comunidade bacteriana em situações distintas de produtividade, amostras de mosto e de dornas de fermentação foram coletadas de uma destilaria industrial de produção de etanol na região de Piracicaba (SP-Brasil), operando em sistema contínuo de alimentação do mosto. As comunidades bacterianas de ambas as situações foram identificadas por meio da metodologia de metabarcoding que sequencia regiões específicas do gene 16S rDNA. Com base nessa metodologia foi possível observar diferenças na microbiota dos grupos de produtividade baixa e normal de etanol. No mosto observamos diferentes proporções de gêneros bacterianos em situações distintas de produtividade. Já nas dornas de fermentação, como esperado, observamos a predominância de bactérias pertencentes ao gênero Lactobacillus. Entretanto, observamos algumas diferenças nos padrões de OTUs atribuídas a Lactobacillus nos grupos de produtividade normal e baixa. Considerando que nossos experimentos demonstraram que há diferenças na comunidade bacteriana da destilaria em diferentes condições de produtividade, nosso segundo propósito foi examinar o perfil metabólico, com o objetivo de encontrar possíveis metabólitos-chave para o monitoramento de processos. Utilizando a cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas não direcionada, o exometaboloma e o perfil metabólico intracelular da mesma destilaria foi explorado em condições de produtividade baixa e normal. Com essa metodologia foi possível selecionar metabólitos no meio extracelular com o potencial de serem explorados como futuros marcadores de monitoramento da produtividade, como os metabólitos Oleic acid, Tagatose, 3-O- methyl-Glucose, 5 beta-Dihydrotestosterone, NA 1045 e NA901. Também foi possível identificar metabólitos provavelmente relacionados a alterações em vias metabólicas. Notamos uma maior abundancia de metabólitos relacionados a vias do metabolismo energético em produtividade Normal, como: Glucose, Glucose-6-phosphate, Lactulose, Maltotriose e Sorbose. Ao analisarmos o perfil intracelular também detectamos metabólitos relacionados com alterações na comunidade microbiológica em condições distintas de produtividade, como o metabólito mannitol, por exemplo
Industrial production of second-generation ethanol: methods for characterizing biomass and metabolites throughout the production process
No full textA crescente demanda por energia aliada a necessidade de fontes diversificadas e renováveis classificam o biocombustível como uma das principais alternativas disponíveis em escala mundial. O Brasil, segundo maior produtor de bioetanol com aproximadamente 28 bilhões de litros produzidos em 2021, combustível o qual a principal matéria prima é a cana-de-açúcar, detém o título de maior produtor mundial desta monocultura. A Raízen, joint venture entre a Cosan e a Shell produz atualmente 3,2 bilhões de litros de etanol e tem investido na tecnologia de etanol de segunda geração (E2G) que utiliza bagaço de cana-de-açúcar como biomassa em estratégia para aumentar sua produção em até 1 bilhão de litros de etanol a mais, utilizando a mesma área plantada. Este processo permite a produção mais sustentável do biocombustível adicionando valor à cadeia de produtos e subprodutos do setor sucroenergético. O presente estudo teve como objetivo aplicar métodos clássicos de pesquisa voltados para caracterização da matéria prima e a busca de marcadores através de metabólitos gerados na fermentação da xilose. Ao considerar as 3 etapas fundamentais da produção de etanol celulósico: pré-tratamento (explosão a vapor catalisado), hidrólise (enzimática) e fermentação (corrente de xilose concentrada) como processos estáveis, temos na variabilidade da matéria prima o maior impacto na produtividade e eficiência da planta como um todo. Os dados das safras de 2017 e 2018 evidenciaram a estabilidade do pré-tratamento e mostraram boas correlações entre os métodos de análise composicional e métodos físico-químicos trazendo a oportunidade para desenvolver novas linhas de pesquisa. A importância de se desenvolver uma pesquisa em ambiente mais controlado, como uma bancada de laboratório, para condução dos bioprocessos de fermentação e hidrolise também é reforçado nesse trabalho em função da alta variabilidade na indústria ao longo da safra 2017 e 2018 da unidade Raízen E2G Costa Pinto. Enfim a jornada de conduzir o doutorado em paralelo com a responsabilidade profissional de consolidar a tecnologia do etanol de segunda geração, sendo uma das primeiras plantas com produção de (E2G) em escala industrial no mundo, traz uma reflexão da riqueza da integração do meio acadêmico com a indústria e como promover mais teses como esta.The growing demand for energy combined with the need for diversified and renewable energy sources rank biofuel as one of the main alternatives available worldwide. Brazil, the second largest producer of bioethanol with approximately 28 billion liters of biofuel produced in 2021, using sugarcane as main raw material, holds the title of world\'s largest producer of this monoculture. Raízen, a joint venture between Cosan and Shell, currently produces 3.2 billion liters of ethanol and has invested in second-generation ethanol (E2G) technology that uses sugarcane bagasse as biomass in a strategy to increase its production up to 1 billion liters more of ethanol, using the same planted area. This process allows for a more sustainable production of biofuel, adding value to the chain of products and by-products in the sugar-energy sector. The objective of the present study is to apply classical analysis methods aimed at characterization of raw materials and the search for markers through metabolites generated in xylose fermentation. When considering the 3 fundamental stages of cellulosic ethanol production: pre-treatment (catalyzed steam explosion), hydrolysis (enzymatic) and fermentation (concentrated xylose stream) as stable processes where raw material quality affects productivity and yields significantly considering industrial operations. Data collected throughout the 2017 and 2018 harvesting seasons reveal the pre-treatment stability and the expected correlation between compositional and physico chemical analysis leading to new opportunities of development in this area. Also the high variability of fermentation data collected from industrial site of Raízen E2G Costa Pinto reinforces the use of controlled laboratory experiments as critical for research porpoise. So, the journey of industry development, been Costa Pinto one of the first industrial scale production worldwide, brought to light the beauty of interaction between academia and industry and thoughts on how to promote more thesis like this
Bioinformatics applied to systems biology for regulatory factors identification of the sucrose accumulation in sugarcane stalk
No full textA cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma das principais gramíneas cultivadas do mundo e o Brasil é seu maior produtor, ela se tornou uma importante cultura devido às altas taxas de assimilação de carbono permitindo a síntese e acumulação de grandes quantidades de sacarose em seus entrenós. Com isso, faz-se necessário uma melhor compreensão dos mecanismos moleculares que regulam o acúmulo de sacarose nesta planta. Tais mecanismos têm sido estudados em vários níveis, tais como, identificação e localização de genes, identificação de lócus controladores de características quantitativas, transcriptoma, proteôma, caracterização e identificação de metabólitos. Com todos esses estudos é evidente a necessidade de uma abordagem holística para o entendimento global da planta durante o acúmulo de sacarose. Assim este trabalho teve por objetivo integrar dados de metabolômica e proteômica de tecidos da cana-de-açúcar da variedade SP80-3280 durante o desenvolvimento e o acúmulo de sacarose, utilizando a bioinformática para unir esses resultados por meio da análise de correlação canônica regularizada em uma abordagem de biologia sistêmica. Os resultados obtidos indicam diferenças no perfil metabólico e proteico da cana-açúcar durante o desenvolvimento e acúmulo de sacarose. Foram propostas classes de metabólitos que podem estar relacionados com o acúmulo de sacarose na cana-de-açúcar tais como glicerolipídeos, glicerofosfolipídeos, cumarinas e derivados, esteroides e derivados de esteroides e acil graxos. Também foram propostas proteínas que podem estar relacionadas com o acúmulo de sacarose, onde as histonas foram as que mais se destacaram. Nas redes biológicas de correlações também foram observadas correlações entre possíveis metabólitos e proteínas que podem estar correlacionadas com o acúmulo de sacarose na cana-de-açúcarSugarcane (Saccharum spp.) is one of the most important cultivated grasses of the world and Brazil is the largest producer, it has become an important crop due to high carbon assimilation rates allowing the synthesis and accumulation of large amounts of sucrose in their internodes. Thus, it is necessary a high understanding of the molecular mechanisms involved in the regulation of sucrose accumulation in this plant. These mechanisms have been studied at various levels, such as gene identification and localization, identification of quantitative trait locus controlling, transcriptome, proteome, characterization and metabolites identification. With all these studies is evident the necessity for a holistic approach to global understanding of the plant during the sucrose accumulation. Thus, this work aims to integrate metabolomics and proteomics data from tissues of sugarcane variety SP80-3280, during plant development and sucrose accumulation, using bioinformatics to link these results by regularized canonical correlation analysis in a systems biology approach. The results indicate differences in the metabolic and protein profile of sugarcane during development and sucrose accumulation. Metabolites classes have been proposed that may be related to sugarcane sucrose accumulation as glycerolipids, glycerophospholipids, coumarins and derivatives, steroids and steroid derivatives and fatty acyl. In addition, some proteins have been proposed that may be related to sucrose accumulation, where the most highlighted were the histones. In the biological correlations networks, have been also observed correlations between possible metabolites and proteins that can be correlated with the accumulation of sucrose in sugarcan
Effect of endophytic fungi on the photosynthetic metabolism of banana (Musa Cavendish) and maize (Zea mays L.) plants
No full textFungos endofíticos são aqueles que ocorrem no interior das plantas e causam infecções assintomáticas em tecidos. O trabalho teve por objetivo estudar o efeito de fungos endofíticos no metabolismo fotossintético de plantas de banana (Musa cavendish) e milho (Zea mays L.). O desempenho fotossintético das plantas axênicas e inoculadas com fungos endofíticos foi avaliado através de parâmetros como fixação de CO2 e evolução de O2, fluorescência da clorofila, conteúdo de clorofila total, conteúdo de carboidratos (amido e sacarose) e conteúdo de metabólitos. Os resultados mostraram a existência de diferenças na capacidade fotossintética, em função do aumento da intensidade de luz. As plantas axênicas de ambas espécies apresentaram uma taxa fotossintética maior que as plantas inoculadas. O conteúdo de clorofila total nas plantas axênicas foi superior ao encontrado em plantas inoculadas. Os parâmetros de fluorescência da clorofila mostraram que as plantas inoculadas de banana (ϕpopen) e de milho estão sofrendo algum tipo de estresse provavelmente devido à presença do fungo. Plantas inoculadas de milho mostraram elevado conteúdo de ácido 3-fosfoglicérico quando comparadas com as plantas axênicas e controle. Os valores de fosfoenolpiruvato e piruvato das plantas axênicas e inoculadas foram superiores aos das plantas controle. As alterações no conteúdo de metabólitos das plantas inoculadas sugerem mudanças na atividade de enzimas do ciclo C4 e do ciclo de Calvin, possivelmente devido à alterações no metabolismo da planta induzidas pelo fungo. As plantas inoculadas de milho apresentaram ainda menor conteúdo de carboidratos totais e um aumento na taxa respiratória quando comparadas com as plantas axênicas. Estes resultados sugerem que a presença do fungo pode estar alterando o processo de partição de carbono nas plantas inoculadas e dessa forma diminuindo a capacidade fotossintética nessas plantas. A redução na capacidade fotossintética das plantas inoculadas poderia ainda ser provocada pelo metabolismo do próprio fungo, absorvendo produtos fotoassimilados e produzindo toxinasEndophytic fungi occur inside plants causing asymptomatic infections in tissues. The present study focuses on the effect of endophytic fungi on the photosynthetic metabolism of banana (Musa Cavendish) and maize (Zea mays L.) plants. The photosynthetic performance of axenic and endophytic inoculated plants was assessed by determining CO2 fixation and O2 evolution, chlorophyll fluorescence, total chlorophyll content, carbohydrate contents (starch and sucrose) and metabolite content. The results showed differences in photosynthetic capacity, with increasing light intensity. Axenic plants of both species display higher photosynthetic rates than inoculated plants. Total chlorophyll content was generally higher in axenic plants than inoculated plants. Fluorescence results indicate that inoculated banana (ϕpopen) and maize plants are under some form of stress, possibly due to the presence of the fungus. Inoculated maize plants exhibited an elevated levei of 3-phosphoglyceric acid compared to the axenic and control plants. Phosphoenolpyruvate and pyruvate values for axenic and inoculated plants were higher than those for control plants. Metabolite contents were also different for the inoculated plants, suggesting changes in the enzymatic activities of the C4 pathway and Calvin cycle, probably due to alterations in plant metabolism caused by the presence of the fungus. Inoculated maize plants also had lower total carbohydrate content and higher respiratory rates relative to axenic plants. These combined results suggest that the fungus may be altering carbon partitioning in inoculated plants, decreasing the photosynthetic capacity of the plants. The decrease in photosynthetic capacity for inoculated plants could also be caused by the fungus' metabolic activities, consuming photoassimilates and producing toxins
Analysis of the transcriptome of the Eucalyptus grandis cambial region and the identification of differentially expressed genes in juvenile and mature trees
No full textO Brasil é hoje o maior produtor mundial de papel e celulose à partir de fibra curta de Eucalyptus, com um setor florestal bem desenvolvido e estabelecido, que gera muitos empregos e divisas ao país. A madeira utilizada pelas indústrias brasileiras é exclusivamente obtida de florestas plantadas, sendo que 1,27 milhões de hectares correspondem a plantações de Eucalyptus. Durante muitos anos, os programas de melhoramento genético exploraram as características de altas taxas de crescimento, produção de biomassa e adaptabilidade deste gênero para alcançar uma alta produtividade, que hoje é de 45 m3/ha/ano. Entretanto, a demanda do mercado nacional e internacional por madeira de Eucalyptus é crescente. Para manter a competitividade do setor, torna-se necessária a busca por uma madeira de melhor qualidade, que leve a uma maior eficiência na produção de papel e celulose. O conhecimento dos processos que levam à formação da madeira, um tecido que se diferencia a partir do câmbio vascular, certamente irá contribuir para que essa qualidade superior da madeira seja alcançada. As árvores só apresentam as características desejadas pela indústria quando adultas, entretanto, o Eucalyptus é cortado ainda em fase juvenil de desenvolvimento. Portanto, o objetivo deste trabalho foi traçar um perfil transcricional da região cambial de Eucalyptus grandis em fase juvenil de desenvolvimento e, com as informações geradas, comparar a expressão de alguns genes envolvidos na formação da madeira entre a região cambial de árvores juvenis e adultas. A técnica SAGE foi utilizada para construção de uma biblioteca que gerou 22660 tags, das quais 2942 representavam tags únicas com número de cópias igual ou maior que 2. Dessas, 874 puderam ser associadas a uma provável função e classificadas em categorias funcionais. O SAGE permitiu o acesso a genes com baixos níveis de expressão, a identificação de potenciais transcritos antisense e alternativos, e revelou a presença de muitas sequências ainda não caracterizadas. Os dados obtidos foram organizados, também, nas principais vias responsáveis por cada fase da diferenciação que ocorre na xilogênese. Os genes que codificam as principais enzimas responsáveis pela expansão celular, deposição de parede celular secundária e lignificação foram encontrados, e seus níveis de expressão indicaram as prováveis vias metabólicas utilizadas pelas células da região cambial de E. grandis para produzir madeira juvenil. Os dados de expressão gênica obtidos com o SAGE foram validados através de RT-PCR em tempo real. Vinte e cinco genes envolvidos com a expansão celular, biossíntese de celulose e hemicelulose, deposição de parede secundária, lignificação e metabolismo foram selecionados para urna comparação entre as regiões cambiais de árvores juvenis e adultas de E. grandis através de RT-PCR em tempo real. Os resultados mostraram que existe uma expressão diferencial entre idades, sendo que 15 genes foram mais expressos nas árvores juvenis e 6 mais expressos nas árvores adultas. A caracterização quantitativa dos genes expressos na região cambial de E. grandis constitui, portanto, uma grande fonte de informação que pode direcionar para diferentes enfoques relacionados ao complexo processo de biossíntese da madeira.Currently, Brazil is the largest producer of pulp and paper using short fiber from Eucalyptus, with a well developed and established forest sector, that generates many jobs and income for the country. The wood for the Brazilian industries is taken exclusively from planted forests, where 1.27 million hectares correspond to Eucalyptus plantations. During many years, genetic improvement programs have explored the high growth rates, biomass production and adaptability of this genus to reach high productivity, approximately 45 m3/ha/year. However, national and international demand for Eucalyptus wood is increasing and to ensure the competitiveness of this sector, it is necessary to search for a better quality wood, which allows more efficient pulp and paper production. The knowledge of the processes that lead to the wood formation, a tissue that differentiates from the vascular cambium, will certainly contribute to reach this goal. Trees normally acquire the characteristics desired by industry when adult, but Eucalyptus is cut when it is still in juvenile phase of development. Therefore, the objective of this work was to produce a transcriptional profile of the cambial region of Eucalyptus grandis in the juvenile phase of development and, with this information, compare the expression of some genes involved in wood formation in the cambial region of juvenile and mature trees. A SAGE library was produced generating 22660 tags, of which 2942 represented unique tags with two or more copies. Of these, 874 could be associated with a probable function and were classified in functional categories. SAGE allowed the access to genes with low expression levels, the identification of potential anti-sense and alternative transcripts, and disclosed the presence of many sequences not yet characterized. The data were also organized to demonstrate the main pathways involved at each differentiation stage during xylogenesis. The genes for the major enzymes involved in cell wall expansion, secondary cell wall deposition and lignification were found and their expression levels indicated the preferential use of alternative branches in some of the metabolic pathways used by the cambial cells of E. grandis to produce juvenile wood. The expression data obtained with SAGE was validated through Real Time RT-PCR. Twenty five genes involved with cell wall expansion, cellulose and hemicelulose biosynthesis, secondary wall deposition, lignification and metabolism were selected to compare the cambial regions of juvenile and mature E. grandis trees using Real Time RT-PCR. The results showed the existence of a differential expression pattern between the ages, were 15 genes were more expressed in the juvenile trees and 6 genes were more expressed in the mature trees. The quantitative characterization of the genes expressed in the cambial region of E. grandis constitutes, therefore, a great information source that might drive the studies to different approaches related to the complex process of wood biosynthesis
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