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doi:10.1155/2008/893941 Review Article Bioinformatic Tools for Inferring Functional Information from Plant Microarray Data II: Analysis Beyond Single Gene
While it is possible to interpret microarray experiments a single gene at a time, most studies generate long lists of differentially expressed genes whose interpretation requires the integration of prior biological knowledge. This prior knowledge is stored in various public and private databases and covers several aspects of gene function and biological information. In this review, we will describe the tools and places where to find prior accurate biological information and how to process and incorporate them to interpret microarray data analyses. Here, we highlight selected tools and resources for gene class level ontology analysis (Section 2), gene coexpression analysis (Section 3), gene network analysis (Section 4), biological pathway analysis (Section 5), analysis of transcriptional regulation (Section 6), and omics data integration (Section 7). The overall goal of this review is to provide researchers with tools and information to facilitate the interpretation of microarray data. Copyright © 2008 I. Coulibaly and GrierP. Page. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited. 1
Invagination intestinale aigüe secondaire chez l'enfant au service de chirurgie pédiatrique du CHU- Gabriel Touré
Objectifs : Décrire les aspects diagnostiques et thérapeutiques de l'invagination intestinale aigüe chez l'enfant. Matériel et méthodes : Il s'agissait d'une étude rétrospective réalisée du 1er Janvier 2012 au 31 Décembre 2017 soit une période de 6 ans chez tous les enfants de 0 à 15 ans admis au service de chirurgie pédiatrique du CHU- Gabriel Touré présentant l'IIA. Les enfants âgés de plus 15ans n'ont pas été inclus à cette étude
Abcès amibien du foie dans le service de chirurgie pédiatrique du Centre Hospitalière Universitaire Gabriel TOURE
Objectifs généraux : Déterminer la fréquence hospitalière de l'abcès amibien du foie en milieu chirurgical pédiatrique ; - Décrire les aspects cliniques, para-cliniques et thérapeutiques de l'abcès amibien du foie ; - Évaluer le résultat du traitement de l'abcès amibien du foie ; - Evaluer le coût de la prise en charge. Matériels et méthodes : Il s'agissait d'une étude rétrospective de 8 ans, allant du 1er Janvier 2010 au 31 Décembre 2017 effectuée dans le service de chirurgie pédiatrique du Centre Hospitalière Universitaire Gabriel TOURE. Pour 10164 admissions, 50 cas d'abcès amibiens du foie en ont été colligés, ce qui a représenté une fréquence hospitalière de 0,49 p.100 . L'âge moyen de nos patients a été de 6,7 ans. Le sexe masculin a été prédominant avec une sex-ratio de 1,4. Les signes cliniques les plus fréquents ont été la fièvre (100 p.100 ), l'hépatalgie (94,1 p.100 ), l'hépatomégalie (72 p.100 ) et nausées et/ou vomissements (62 p.100 ). Les collections objectivées à l'échographie abdominale étaient localisées dans le lobe droit dans 88,2 p.100, uniques dans 76,5 p.100 . La sérologie amibienne effectuée dans 100 p.100 des cas, a été positive dans 50 cas (100 p.100 ). Le traitement médical a été exclusif dans 6 cas (12 p.100 ), une ponction évacuatrice écho-guidée a été nécessaire dans 88 p.100 des cas. La chirurgie a été pratiquée dans 6 cas de péritonite (12 p.100 ). La morbidité est faible (6 p.100 ). Nous n'avons pas enregistré de décès dans notre série. Une prise en charge multidisciplinaire des abcès amibiens du foie associant le pédiatre, le chirurgien pédiatrique et le radiologue permettrait d'améliorer le pronostic
Prise en charge des hernies discales lombaires au Service de Neurochirurgie du Centre Hospitalier Universitaire Gabriel Touré
Nous avons étudié la prise en charge des hernies discales lombaires chez 136 patients dont 28 cas opérés durant une période de 12 mois. La moyenne d'âge de nos patients, était de 48 ans et le sex-ratio a été de 1,545 en faveur des femmes. Les professions les plus en cause ont été les cultivateurs et les employés de commerces avec respectivement 25% et 21,42%. La pathologie la plus associée est le canal lombaire étroit. Le type de chirurgie le plus usité a été la laminectomie + discectomie. Parmi les facteurs prédisposant l'obésité (plus sur poids) a été le plus remarqué (35,7%) avec l'activité professionnel (25%) L'examen complémentaire le plus usité a été le scanner lombaire qui s'est révélé le plus efficace au cours de notre étude. Le traitement médical a été efficace chez plus de 79,41% de nos patients
Les enjeux et les limites de la fidélisation du personnel en officine : cas de 63 officines
Le but de notre étude était de contribuer à l'amélioration de la fidélisation du personnel à l'officine de pharmacie. La taille de l'échantillon était fixé 63 Personnes choisies dans 63 officines ayant au moins dix ans d'existence dans le district de Bamako. Nous avons recueilli des données au moyen d'une fiche d'enquête auprès des pharmaciens gérants et le personnel officinal répondant aux critères d'inclusion et non d'inclusion. Il ressort de notre étude que la satisfaction n'est pas totale, mais le personnel officinal est satisfait des conditions de travail 76,2 p.100 et de la relation au sein de l'équipe 71,4 p.100. L'insatisfaction du personnel officinal interrogé porte sur, la rémunération 65,1 p.100. L'implication du personnel officinal est effective, 84,2 p.100 du personnel sont enthousiastes c'est-à-dire qu'ils sont fortement concernés par leur travail et qu'il le trouve fortement important, la capacité perçue d'action présente des résultats plus nuancés, plus 1/3 soit 39,7 p.100 du personnel estiment manquer de contrôle sur son travail
Aspects épidémiologiques et cliniques du Placenta Prævia hémorragique à l'hôpital Sominé DOLO de Mopti
Notre étude prospective s'était déroulée dans le service de gynécologie obstétrique de L'HSD de MOPTI du 1[er] Janvier 2009 au 31 décembre 2010. L'objectif principal était d'étudier le Placenta Prævia hémorragique dans notre service. Nous avons recruté durant cette période 40 cas de Placenta Prævia hémorragique sur 946 accouchements soit une fréquence de 4,22 p.100 Tous les âges de l'activité génitale sont concernés (15-45 ans) Les facteurs étiologiques sont : l'âge, la gestité, la parité les antécédents (d'avortements, de césariennes et de gémellités). Nous avons enregistré : + 15 cas soit 37,5 p.100 de Placenta non recouvrant contre 25 cas soit 62,5 p.100 de Placenta Recouvrant + 36 cas soit 87,5 p.100 de césarienne contre 5 soit 12,5 p.100 d'accouchement par voie basse. + 13 cas soit 32,5 p.100 de nouveau-nés étaient nés avant terme. 4 cas soit 10 p.100 de mort-nés
Incidence du paludisme chez les enfants de 0 à 6 ans vivants à Bandiagara, Mali
Depuis 1997, Bandiagara a servi de cadre à plusieurs études du MRTC, avec l'adoption de nouvelles stratégies de lutte contre le paludisme en 2007. Ces différentes interventions ont-elles eu un impact sur l'incidence du paludisme ? Pour tester cette hypothèse une cohorte de 300 enfants de 0-6 ans vivant à Bandiagara a été suivie de juin 2009 à mai 2010 suivant deux modalités. Une surveillance active constituée de passages mensuels au cours desquels une évaluation clinique et biologique a été faite chez tous les participants et au besoin une prise en charge médicale. Une surveillance passive qui a consisté à rendre disponible et permanent l'offre gratuite de soins pour la prise en charge des cas de paludisme. Au total, 13 visites mensuelles ont été réalisées. Le taux de fréquence du portage des plasmodies a été le plus élevé au mois de décembre (15 p.100 ) et le plus faible en mai (4,1 p.100 ). Les enfants de 5-6 ans ont fait 142 cas de paludisme-infection sur les 268 cas détectés. La surveillance passive a détecté 306 épisodes cliniques de paludisme ; 72,5 p.100 des cas étaient fébriles et les enfants âgés de 0-4 ans ont fait le plus grand nombre d'épisodes (192). Le taux d'incidence global a été 1,1 accès clinique par enfant et par an. La moitié des enfants de 0-2 ans ont fait leur premier accès après 7 mois ; pour les 3-4 ans cela est arrivé après 5 mois et 4 mois pour les 5-6 ans. Nos résultats suggèrent une diminution du taux d'incidence du paludisme chez les 0-6 ans en comparaison avec les résultats de 1999-2000 ; cependant le paludisme demeure un problème de santé publique majeur à Bandiagara
Etude épidémiologique et prise en charge des prolapsus génitaux à la maternité de garnison de Kati
Il s'agit d'une étude rétrospective descriptive sur une période de 5 ans, soit du 1[er] Janvier 2005 au 31 Décembre 2009 inclus. Au cours de cette étude, nous avons colligé 119 cas de prolapsus génitaux. La plus jeune patiente avait 17 ans, contre 73 ans pour la plus âgée. La moyenne d'âge est de 45,39 ans. Les grandes multigestes prédominaient avec 49,6 p.100 . Les grandes multipares étaient majoritaires avec 49,6 p.100 de l'effectif total des cas. L'expression abdominale était le mode d'accouchement le plus pratiqué avec 72,3 p.100 . La constipation chronique était la pathologie la plus fréquente associée au prolapsus génital avec 67,2 p.100 . L'hysterocèle était le signe clinique le plus marqué avec 43,6 p.100, suivi de cystocèle+rectocèle soit 35,2 p.100 . Le diagnostic du prolapsus génital a été posé cliniquement, et le stade du 3è degré était le plus fréquent avec 86,6 p.100 . La triple opération périnéale avec hystérectomie totale par voie vaginale a été la méthode chirurgicale la plus pratiquée avec 61,3 p.100 des patientes. La durée du sondage urinaire était de deux (2) jours pour 92,2 p.100 des patientes. Les résultats des patientes opérées à la sotie étaient satisfaisants à 100 p.100 . Dans les 3 mois qui ont suivi l'intervention, 29 patientes sur 119 opérées furent revues pour un contrôle, soit 24,36 p.100 . A court terme, on a trouvé 93,1 p.100 de bons résultats anatomiques, et 82,7 p.100 de bons résultats fonctionnels
Etude de la satisfaction des soins en post-partum à la maternité du centre de santé de référence de la Commune V du District de Bamako.
En santé, la satisfaction est un indicateur de la qualité des soins. C'est pour cette raison que l'évaluation de la satisfaction des patientes est une obligation. Mais l'obstétrique est une spécialité où les nombreuses attentes des parents et l'urgence des interventions peuvent parfois se heurter. Ce travail avait pour but d'identifier les différents facteurs obstétricaux influençant la satisfaction des femmes. Nous avons mené une étude transversale de type descriptive à la maternité du centre de santé de référence de la Commune V du 11 Juillet 2011 au 14 Janvier 2012, à l'aide d'un questionnaire sur la satisfaction des soins en post partum élaboré puis validé sur un échantillon de 432 patients au Canada, en France et au Sénégal et d'un recueil de données sur le dossier médical. L'analysa a montré un taux global de satisfaction de 98 p.100 . Les femmes ayant présenté une complication ou ayant perdu leurs nouveau- nés à la naissance sont significativement moins satisfaites. Le niveau d'étude et le type d'activité exercée par la femme influence également la satisfaction. En conclusion les facteurs obstétricaux influençant la satisfaction ne sont modifiables que par endroit
Evaluation de la prise en charge du paludisme dans les clubs de 1ère division de Football de Bamako (ASko et Stade Malien de Bamako
Nous avons effectué juin à`octobre 2013 une étude prospective descriptive sur l`évaluation de la prise en charge du paludisme dans le milieu du foot Ball au Mali à propos de deux clubs de 1ère division (ASko et Stade Malien de Bamako). L`enquête a porté sur 150 joueurs de 1ère division appartenant au Stade Malien et/ou à l'ASKO. Toutes les enquêtes ont eu lieu sur les terrains d`entrainement de ces deux clubs . L`analyse des données ont montré que : La prévalence du paludisme était de 53,33 p.100 des cas
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