1,721,004 research outputs found
In vitro susceptibility of Spanish isolates of Neisseria gonorrhoeae to cefditoren and five other antimicrobial agents
No full textFil: Vázquez, Julio A. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Laboratorio de referencia para Neisseria, Madrid; España.Fil: Martín, E. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Laboratorio de referencia para Neisseria, Madrid; España.Fil: Galarza, Patricia G. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología. Servicio de Enfermedades de Transmisión Sexual; Argentina.Fil: Giménez, María José. Universidad Complutense. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología, Madrid; España.Fil: Aguilar, Lorenzo. Universidad Complutense. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología, Madrid; España.Fil: Coronel, P. Meiji Pharma Spain, S.A. Departamento Científico, Madrid; España
Echinocandin susceptibility testing of Candida spp. using the EUCAST EDef 7.1 and CLSI M27-A3 standard procedures: Analysis of the influence of Bovine Serum Albumin Supplementation, Storage Time and Drug Lots
Full text linkThe MICs of echinocandins against Candida isolates with fks mutations are higher than those for wild-type (WT) isolates. However, the MIC ranges for susceptible and mutant populations overlap or are poorly separated. It was recently reported that a greater separation could be achieved in the presence of serum. To more fully explore this possibility, we compared the performances of the reference microdilution methods by using standard and bovine serum albumin (BSA)-supplemented growth medium. Anidulafungin, caspofungin, and micafungin MICs were determined according to EUCAST and CLSI methods and with 50% BSA in the medium for 93 clinical isolates, including Candida albicans (20/10 [number of isolates/number of mutants]), C. glabrata (19/10), C. dubliniensis (2/1), C. krusei (16/3), C. parapsilosis (19), and C. tropicalis (19/4) isolates. Stability of the plates was tested after storage at -80°C for 2 and 6 months, and the performance of two different lots of caspofungin was investigated. The addition of BSA to the medium resulted in higher MICs (1 to 9 2-fold dilution steps) for all isolates and compounds. The increases were greatest for anidulafungin and micafungin and, among WT isolates, for C. parapsilosis. The number of very major errors (VMEs) was reduced (24% [20/84 isolates] versus ≤ 7% [6/84 isolates]) using BSA-supplemented EUCAST medium but not using BSA-supplemented CLSI medium (6% versus 9%). MIC results were unchanged after 6 months of storage of test plates. The two lots of caspofungin yielded identical results. Addition of BSA to the EUCAST medium increases the ability to differentiate between WT isolates and isolates harboring resistance mutations.Fil: Arendrup, Maiken Cavling. Statens Serum Institut. Unit of Mycology and Parasitology; DinamarcaFil: Rodriguez Tudela, Juan Luis. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Servicio de Micología; EspañaFil: Park, Steven. UMDNJ-New Jersey Medical School. Public Health Research Institute; Estados UnidosFil: Garcia, Guillermo Manuel. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas; Argentina. UMDNJ-New Jersey Medical School. Public Health Research Institute; Estados Unidos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Santa Fe; ArgentinaFil: Delmas, Guillaume. UMDNJ-New Jersey Medical School. Public Health Research Institute; Estados UnidosFil: Cuenca Estrella, Manuel. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Servicio de Micología; EspañaFil: Gómez López, Alicia. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Servicio de Micología; EspañaFil: Perlin, David Scott. UMDNJ-New Jersey Medical School. Public Health Research Institute; Estados Unido
Molecular characterization of invasive serogroup Y Neisseria meningitidis strains isolated in the Latin America region
Full text linkFil: Abad, Raquel. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Reference Laboratory for Meningococci; España.Fil: Agudelo, Clara Inés. Instituto Nacional de Salud (INS). Microbiología; Colombia.Fil: Brandileone, María Cristina. Adolfo Lutz Institute. Bacteriology Branch; Brasil.Fil: Chanto, Grettel. Centro Nacional de Referencia en Bacteriología (INCIENSA); Costa Rica.Fil: Gabastou, Jean-Marc. Pan American Health Organization (PAHO)/World Health Organization (WHO). Vacunas y Tecnologías de Salud. Unidad de Medicamentos Esenciales; Ecuador.Fil: Hormazabal, Juan Carlos. Instituto de Salud Pública (ISP). Bacteriología; Chile.Fil: O Gorla, M Cecilia. Adolfo Lutz Institute. Bacteriology Branch; Brasil.Fil: Maldonado, Aurora. Instituto de Salud Pública (ISP). Bacteriología; Chile.Fil: Moreno, Jaime. Instituto Nacional de Salud (INS). Microbiología; Colombia.Fil: Muros-Le Rouzic, Erwan. Sanofi-Pasteur. Global Scientific and Medical Affairs; Francia.Fil: Lersch, Robert. Sanofi-Pasteur. Global Scientific and Medical Affairs; Francia.Fil: Regueira, Mabel. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología; Argentina.Fil: Salcedo, Celia. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Reference Laboratory for Meningococci; España.Fil: Sorhouet, Cecilia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología; Argentina.Fil: Vázquez, Julio A. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Reference Laboratory for Meningococci; España.Objectives: To improve the understanding of serogroup Y invasive meningococcal disease (IMD) in Latin America, particularly IMD molecular epidemiology; 166 Y serogroup isolates received at the National Reference Laboratories of Argentina, Brazil, Chile, Colombia, and Costa Rica during 2000-2006 were characterized by their molecular markers.
Methods: This analysis included serological assays to determine serogroup/serotype/serosubtype, DNA sequencing and genotyping of the porB and/or porA genes, multilocus sequence typing (MLST) and fetA allele determination.
Results: Sixteen different antigenic combinations were observed. Sixty-two (37.3%) isolates were NT:P1.5 and 36 (21.7%) isolates were 14:NST. Thirty-two different STs appeared, but 3 STs (ST-1624, ST-23, and ST-5770) accounted for 69.9% (116) of the strains. Most of the IMD isolates belonged to the ST-23, ST-167 clonal complexes or the group composed by ST-5770 and related STs.
Conclusions: Isolates obtained in Colombia and Costa Rica were similar to that of the United States, in that most sequence types belonged to the ST-23 clonal complex. IMD isolates found in Argentina appear to be the result of an independent event and did not spread from nearby countries, being the sequence type ST-1624 (ST-167 clonal complex) the most frequently found. We were unable to correlate an antigenic shift of outer membrane proteins with an increase of serogroup Y meningococcal cases in our collection of isolates
Molecular epidemiology of echovirus 30: temporal circulation and prevalence of single lineages
No full textFil: Palacios, Gustavo. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virología. Servicio de Neurovirosis; Argentina.Fil: Casas, Inmaculada. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Services of Diagnostic Microbiology and Virology; Argentina.Fil: Cisterna, Daniel. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virología. Servicio de Neurovirosis; Argentina.Fil: Trallero, G. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Services of Diagnostic Microbiology and Virology; Argentina.Fil: Tenorio, Antonio. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Services of Diagnostic Microbiology and Virology; Argentina.Fil: Freire, María Cecilia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virología. Servicio de Neurovirosis; Argentina.Echovirus 30 (EV30) is one of the most frequently isolated EVs, causing extensive outbreaks of EV30 aseptic meningitis in temperate climates. EV30 is antigenically heterogeneous, and three major antigenic groups have been defined, although the basis for the antigenic differences is unknown. A reverse transcription-nested PCR which amplifies the 3'-terminal region of the VP1 gene directly from clinical samples was selected for studying EV30 molecular epidemiology, since the major antigenic sites in this region reflect the serotypic pattern of this virus. The different previous approaches to the genetic classification of EV30 were analyzed. A complete study of the EV30 strains was performed by analyzing the sequences from the 112 EV30 strains amplified in this work and the complete set of EV30 strains previously published. A total of 318 strains of EV30 were divided into two broad genotypes (I and II). This classification was supported by the phylogenetic trees obtained from amino acid sequences, and it correlated with the antigenic heterogeneity of the reference strains described in earlier studies. The genotypes could be further divided into subgroups, and these subgroups could be divided into lineages based on their nucleotide distances and levels of bootstrapping. On the other hand, the subgroups and lineages did not result in the same correlation between amino acid and nucleotide differentiation. The molecular epidemiology of EV30 can be compared to influenza virus epidemiology, where prevailing lineages displace the less established lineages on the basis of immune escape. This pattern of evolution is clearly different from that of other entero-viruses. A single lineage at a time appears to be circulating worldwide. This behavior may be related to the epidemic activity of EV30
Seropositividad a Coxiella burnetii (agente de la fiebre Q) en caninos domésticos de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires
Full text linkQ fever is a worldwide zoonotic disease caused by Coxiella burnetii. It is usually associated with contact with cattle, sheep and goats, and in urban areas highlights the importance of dogs and cats, in its transmission. There are few studies of prevalence in dogs from Argentina, so we conducted a serological survey for C. burnetii in domestic dogs from different poor neighborhoods of the Buenos Aires. IgG titers were determined by indirect immunofluorescence in a total of 123 serums. A 15.4% of the dogs tested positive at a titer ? 1/50, of which only a 2.4 % presented titers ? 1/200. These results suggest the circulation of this pathogen in the analyzed population. It is necessary to extend this study to other areas of CABA and of Argentina, and to assess the possible infection sources of animals.Fil: Cicuttin, G.L. Ministerio de Salud, Gobierno de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires. Instituto de Zoonosis Luis Pasteur. Sección Serología y Pruebas Biológicas. Buenos Aires, ArgentinaFil: Lobo, B. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Laboratorio de Espiroquetas y Patógenos Especiales. Madrid, EspañaFil: Anda, P. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Laboratorio de Espiroquetas y Patógenos Especiales. Madrid, EspañaFil: Jado García, I. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología. Laboratorio de Espiroquetas y Patógenos Especiales. Madrid, EspañaLa fiebre Q es una zoonosis de amplia distribución mundial, causada por Coxiella burnetii. Habitualmente está asociada con el contacto con ganado bovino, ovino y caprino, y en zonas urbanas se ha demostrado la importancia de perros y gatos en su transmisión. En Argentina existen pocos datos sobre prevalencia en caninos domésticos. El objetivo del presente trabajo fue detectar anticuerpos contra C. burnetii en caninos domésticos procedentes de distintos barrios con necesidades básicas insatisfechas de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires (CABA). Se estudiaron por inmunofluorescencia indirecta 123 sueros caninos. El 15,4 % de los caninos resultaron positivos a un título IgG ? 1/50, mientras que sólo el 2,4 % presentó títulos IgG ? 1/200. Estos resultados sugieren la circulación de este patógeno, siendo necesario ampliar el estudio al resto de zonas de la CABA y de Argentina, así como evaluar las posibles fuentes de infección de los animales
Programas de Vigilancia Microbiológica. Centro Nacional de Microbiología
Full text linkEste libro recoge en pequeñas “cápsulas” de unas pocas páginas la información condensada de los Programas de Vigilancia Microbiológica del CNM en los últimos años. Una de las principales actividades del Centro Nacional de Microbiología (CNM) se fundamenta en dar soporte al Sistema Nacional de Salud en el control y prevención de las enfermedades infecciosas, incluyendo la detección precoz de infecciones emergentes o infrecuentes, de nuevas variantes problemáticas de agentes infecciosos más comunes, y la caracterización de brotes. Todo ello forma parte de la vigilancia microbiológica, que en el CNM se estructura en torno a los Programas de Vigilancia que abordan la mayoría de los principales
microorganismos patógenos para el ser humano.Programa de Enfermedad Meningocócica Invasiva. Programa de Listeriosis. Programa de Infección Gonocócica. Sensibilidad Antimicrobiana, 1991-2020. Programa de Streptococcus pneumoniae. Programa de enfermedad invasiva por Streptococcus pyogenes. Programa de Haemophilus influenzae. Programa de Resistencia a Antibióticos. Programa de infecciones producidas por los estafilococos. Programa de infecciones entéricas bacterianas transmitidas por agua y alimentos. Programa de Legionelosis. Programa de infecciones causadas por especies toxigénicas del género Corynebacterium. Programa de resistencias en el complejo tuberculoso. Programa de micobacterias no tuberculosas. Programa de GRIPE. Programa de SARS-CoV-2. Programa de Enterovirus y Parálisis Flácida en menores de 15 años. Programa de Parotiditis. Programa de Sarampión y Rubeola. Enfermedades víricas transmitidas por vectores. Programa de Rabia. Programa de Variantes del Virus de la Hepatitis B de Impacto en Salud Pública y Estudio de Brotes de Hepatitis. Programa de Leishmaniasis Humana en el Area-9 de la Comunidad Autónoma de Madrid. Programa de la Enfermedad de Chagas. Programa de la Resistencia a los antifúngicos en España.N
Vacuna del Neumococo conjugada. Recomendaciones de Salud Pública
No full textDe los datos aportados en el informe se desprende que la vacuna conjugada de neumococos es una vacuna segura y eficaz para la enfermedad neumocócica invasiva. Sin embargo, los datos epidemiológicos existentes de enfermedad neumocócica infantil en España no parecen justificar la inclusión de esta vacuna en calendario, al menos en el momento actual. No obstante, se debe reconocer que los datos epidemiológicos disponibles pueden, quizá, minusvalorar la importancia de la enfermedad en nuestro pais.El agente etiológico, Mecanismo de transmisión, Cuadro Clínico y complicaciones, Otitis media y sinusitis, Meningitis, Neumonía neumocócica, Enfermedades neumocócica invasora, Resistencia a antibioticos y tratamiento, Epidemiología de la enfermedad neumocócica en España y posible impacto de la vacunación en la misma, Comparación de los datos básicos de la epidemiología de la enfermedad neumocócica en España y otros paises, Vacunas clásicas frente a neumococo, Vacunas conjugadas frente a neumococo, Serotipos de la vacuna y cobertura de los serotipos aislados en España, Conclusiones y Recomendaciones, Bibliografía
Annual Epidemiological Report: Acute Flaccid Paralysis Surveillance and Enterovirus Surveillance, Spain, 2019
Full text linkCentro Nacional de Epidemiología y Centro Nacional de Microbiología. ISCIII. Plan de acción en España para la Erradicación de la Poliomielitis. Vigilancia de la Parálisis Flácida Aguda y Vigilancia de Enterovirus en España, año 2019. Madrid, 1 julio 2020.[ES]Los resultados de la vigilancia de parálisis flácida aguda (PFA) y de la vigilancia de enterovirus (EV) muestran que en España en el año 2019 no hubo casos de poliomielitis ni circulación de poliovirus. La sensibilidad del sistema está por debajo del objetivo establecido por la OMS–Europa de 1 caso de PFA al año por cada 100.000 menores de 15 años, al situarse en 0,55/104 hab (0,58/104 <15años en 2018 ). Sin embargo, su estudio una vez detectados es adecuado. El índice de vigilancia, que sintetiza la sensibilidad del sistema de vigilancia y su estudio en laboratorio, fue de 0,28, similar a otros años. Gracias a la vigilancia de EV se detectó un PV derivado de vacuna (PVDV) en un paciente excretor inmunodeprimido; además se hallaron diferentes EV-no polio, los serotipos identificados fundamentalmente fueron E-7, E-30, E-11, CV-A6 y E-13. En 2019 la OMS declaró la eliminación del PV salvaje tipo 3(PVS3) a nivel mundial, aunque resulta preocupante el aumento en la detección de PVS1 y PVDVc 2 tanto en muestras humanas como medioambientales. La Evaluación de la Comisión Regional de Certificación clasifica a España en 2018 como de riesgo bajo de transmisión de poliovirus. En Europa hay tres países con riesgo alto, debido fundamentalmente a la baja inmunidad de su población. Hay que mantener los sistemas ya establecidos de vigilancia de la circulación de EV -polio y no polio- (vigilancia de PFA, meningitis víricas y EV), de manera que permitan detectar a tiempo la circulación inesperada de un poliovirus o de otro tipo de EV clínicamente relevante. [EN]The results of acute flaccid paralysis (AFP) and enterovirus (EV) surveillance show that there were no cases of polio or poliovirus circulation in Spain in 2019. The sensitivity of the system is below the target set by WHO-Europe of 1 case of AFP per year per 100,000 children under 15 years, at 0.55/104 inhab (0.58/104 <15 years in 2018 ). However, their study once detected is adequate. The surveillance index, which synthesizes the sensitivity of the surveillance system and its laboratory study, was 0.28, similar to other years. Thanks to the surveillance of EV, a vaccine derived PV (PVDV) was detected in an immunosuppressed excretory patient; in addition, different non-polio-EV were found. The serotypes identified were mainly E-7, E-30, E-11, CV-A6 and E-13. In 2019 the WHO declared the elimination of wild PV type 3 (PVS3) worldwide, although the increase in detection of PVS1 and cVP2 in both human and environmental samples is of concern. The evaluation of the Regional Certification Commission classifies Spain in 2019 as having a low risk of poliovirus transmission. In Europe there are three countries at high risk, mainly due to the low immunity of their population. The already established systems for surveillance of the circulation of EV-polio and non-polio- (surveillance of AFP, viral meningitis and EV) must be maintained, so that the unexpected circulation of a poliovirus or other clinically relevant EV can be detected in time.N
Molecular identification of human enteroviruses in children with neurological infections from the central region of Argentina
No full textIn the central area of Argentina, epidemiological and molecular characteristics of human enterovirus infections are still unknown. RT-nested PCR of the highly conserved 5′NCR was used to detect enteroviruses in 168 samples of cerebrospinal fluid from hospitalized patients with suspected infection of the central nervous system (2007-2008), and 13 (7.7%) were positive. Molecular typing was performed by sequencing of the 3′-half VP1 region. Echovirus 30 was the predominant type detected, followed by coxsackie viruses A9 and B4. All echovirus 30 strains of 2007 clustered in lineage H, whereas the echovirus 30 isolate obtained in 2008 was more distantly related, possibly representing a new lineage. © 2010 Springer-Verlag.Fil: Farías, Adrián Alejandro. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; ArgentinaFil: Cabrerizo, María. Instituto de Salud Carlos III. Centro Nacional de Microbiología; EspañaFil: Ré, Viviana Elizabeth. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Glatstein, Nora Viviana. Ministerio de Salud de la Nación; ArgentinaFil: Pisano, María Belén. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Spinsanti, Lorena Ivana. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; ArgentinaFil: Contigiani de Minio, Marta Silvia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentin
Vigilancia centinela de Infección Respiratoria Aguda en Atención Primaria (IRAs) y en Hospitales (IRAG) en España. Gripe, COVID-19 y otros virus respiratorios. Semana 02/2025 (del 06 de enero al 12 de enero de 2025).
No full textInforme elaborado por el Grupo de Vigilancia de la Gripe. Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica Servicio de Vigilancia Epidemiológica. Centro Nacional de Epidemiología. En la elaboración de este Informe ha participado el Grupo de Vigilancia de Gripe y otros virus respiratorios, el Grupo de Monitorización de la Mortalidad Diaria del Área de Vigilancia de la Salud Pública del Centro Nacional de Epidemiología (Instituto de Salud Carlos III) y el Laboratorio de gripe y virus respiratorios del Centro Nacional de Microbiología (Instituto de Salud Carlos III). Este informe es el resultado del trabajo de todos los integrantes del Sistema de Vigilancia de infecciones respiratorias agudas en España (SiVIRA): https://cne.isciii.es/documents/d/cne/grupo-sivira-de-vigilancia-y-efectividad-vacunal-temporada-2024-25.A nivel sindrómico, la tasa de IRAs a nivel nacional es de 805,9 casos/100.000 habitantes (641 casos/100.000 habitantes en la semana previa), encontrándose desde la semana 39/2024 por encima del umbral epidémico y presentando desde entonces intensidad baja. La tasa de síndrome gripal es de 118,8 casos/100.000 habitantes (64 casos/100.000 habitantes en la semana previa), habiendo superado el umbral epidémico en la semana 52/2024 y constituyendo hasta el momento una epidemia de intensidad baja. La tasa de COVID-19 (síndrome) es de 6,4 casos/100.000 habitantes (4,9 casos/100.000 habitantes en la semana previa) y la de bronquitis y bronquiolitis en menores de 5 años de 225,5 casos/100.000 habitantes (275,5 casos/100.000 habitantes en la semana previa). El porcentaje de positividad es de 40,7% para gripe (33,3% en la semana previa), 1,9% para SARS-CoV-2 (1,7% en la semana previa) y 8% para VRS (11,8% en la semana previa). El proxy de gripe (IRAs x positividad a gripe) estima una incidencia de gripe de 328 casos/100.000 habitantes (213,5 casos/100.000 habitantes en la semana previa). El proxy de COVID-19 (IRAs x positividad a COVID-19) estima una incidencia de COVID-19 de 15,3 casos/100.000 habitantes (10,9 casos/100.000 habitantes en la semana previa).El proxy de VRS (IRAs x positividad a VRS) estima una incidencia de VRS de 64,5 casos/100.000 habitantes (75,6 casos/100.000 habitantes en la
semana previa).N
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