1,720,961 research outputs found
Benttisten syanobakteerien bioaktiiviset yhdisteet
No full textSyanobakteerit tuottavat bioaktiivisia sekundääri- eli erikoismetabolian tuotteita. Syanobakteerien bioaktiivisia yhdisteitä on rakenteiltaan lukuisia erilaisia ja ne voidaan jakaa pääryhmiin peptidit, polyketidit, alkaloidit ja lipopolysakkaridit. Yhdisteistä on löydetty muun muassa antibakteerisia, antifungaalisia ja antiviraalisia ominaisuuksia. Lisäksi näihin bioaktiivisiin aineisiin kuuluu terveysriskin aiheuttavia toksisia yhdisteitä. Planktiset syanobakteerit ovat saaneet runsaasti huomiota niiden muodostamien massaesiintymien vuoksi, mutta myös benttiset eli sedimentissä tai erilaisilla pinnoilla elävät syanobakteerit voivat aiheuttaa terveysriskin. Benttisillä syanobakteereilla on myös potentiaalia uusien bioaktiivisten yhdisteiden löytymisessä biotekniikan tai lääketeollisuuden tarkoituksiin. Tutkimuksessa seulottiin Itämeren ja järven benttisten syanobakteerien tuottamia bioaktiivisia yhdisteitä. Syanobakteerikannat tunnistettiin 16S rRNA geenin avulla ja niiden bioaktiivisuutta tarkasteltiin maljadiffuusiomenetelmän avulla, PCR:n avulla etsittiin tunnettuja biosynteesigeenejä. Bioaktiivisia yhdisteitä pyrittiin tunnistamaan LC/MS-menetelmällä.
Tunnistetut syanobakteerit muodostivat monipuolisen benttisille syanobakteereille tyypillisen lajikirjon, jossa bioaktiivisia ominaisuuksia havaittiin 24 % tutkituista kannoista. Bioaktiivisia ominaisuuksia löydettiin niin meri- kuin järviympäristöistä eristetyiltä kannoilta. Useita bioaktiivisuuksia esiintyi muun muassa Nostoc- ja Anabaena-syanobakteereilla. Benttiset syanobakteerit tuottivat antifungaalisia yhdisteitä, kuten hassallidiinia ja skytofysiiniä sekä sytotoksista anabaenolysiiniä. Lisäksi löydettiin useita syanobaktiinien biosynteesigeenejä. Benttisiltä syanobakteereilta ei havaittu mikrokystiinin tai anatoksiini-a:n biosynteesigeenejä. Antimikrobisia ominaisuuksia löydettiin kahdesta syanobakteerikannasta, joiden tuottamia bioaktiivisia yhdisteitä ei vielä tunnistettu. Benttiset syanobakteerit tuottavat siis useita tunnettuja bioaktiivisia yhdisteitä ja ovat myös potentiaalinen uusien bioaktiivisten yhdisteiden lähde
Antifungal and Antileukemic Compounds from Cyanobacteria : Bioactivity, Biosynthesis, and Mechanism of Action
Full text linkNature is a treasury of bioactive natural products that are developed into pharmaceuticals, cosmetics and other industrial applications. Natural products have an impact on all of us, for instance, in the form of antibiotics. Most of the drugs sold today are natural products or their derivatives. However, the need for new natural products has not decreased but is rather increasing. The incidences of certain diseases such as cancers are rising and resistance to treatment is a major problem. Especially prokaryotes and plants produce these intriguing natural products, which display several different bioactivities. Cyanobacteria are photosynthetic prokaryotes that belong to the most prolific sources of bioactive compounds.
This study expands the knowledge of cyanobacterial natural products, including their activities, biosynthesis, and mechanisms of action. The University of Helsinki Cyanobacteria Culture Collection was utilized in this study. Cultured cyanobacteria were screened for antileukemic and antifungal activity using cell assays and disk diffusion analyses. Bioactive compounds were identified with spectrometric methods. The screenings revealed several bioactive hits, including antifungal, antileukemic and cytotoxic activities. Novel compound candidates and known compounds from new habitats or genera were found. In addition, novel variants of known compounds were identified.
The results from screening were used to select cyanobacterial strains for whole genome sequencing. Genomic analysis was used to identify the biosynthesis gene clusters of the cytotoxic compounds swinholide and scytophycin. In addition, the production of swinholide was confirmed for the first time using axenic cyanobacteria. In the last part of the study, the mechanism of action of hassallidin was determined using cellular assays, imaging, and lipid models (in vitro and in silico). Hassallidin D purified from Anabaena sp. showed cholesterol-dependent lytic activity against eukaryotic cells.
The development of a natural product into a drug or other application is a long process, but natural products are needed also in the future. This thesis contributes to this effort by increasing the understanding of several bioactive cyanobacterial natural compounds at both the functional and molecular level.Luonto on kuin aarreaitta, josta ammennamme uusia bioaktiivisia yhdisteitä lääkkeiden, kosmetiikan ja muun teollisuuden käyttöön. Luonnon bioaktiivisilla yhdisteillä on merkittävä vaikutus meidän kaikkien elämään, esimerkiksi antibioottien muodossa. Suurin osa myydyistä lääkkeistä onkin luonnonyhdisteitä tai niitä mukailevia synteettisiä yhdisteitä. Uusien luonnonyhdisteiden löytäminen on kuitenkin edelleen tärkeää, sillä joidenkin sairauksien on todettu lisääntyneen. Esimerkiksi syöpien määrä on kasvussa, ja lisäksi lääkeresistenssi on vakava ja kasvava ongelma. Erityisesti prokaryootit ja kasvit tuottavat yhdisteitä, joilla on useita erilaisia bioaktiivisuuksia ja potentiaalia muun muassa lääkeaineiksi. Fotosynteettiset prokaryootit syanobakteerit kuuluvat parhaimpiin bioaktiivisten aineiden tuottajiin.
Tässä väitöskirjatutkimuksessa tutkittiin syanobakteerien bioaktiivisia yhdisteitä, mukaan lukien niiden aktiivisuus, biosynteesi ja toimintamekanismi. Tutkimuksessa hyödynnettiin Helsingin yliopiston syanobakteerikantakokoelmaa. Syanobakteerikantoja seulottiin erityisesti niiden antileukeemisten ja antifungaalisten ominaisuuksien osalta käyttäen soluviljelytestejä. Massaspektrometrisiä menetelmiä käytettiin yhdisteiden tunnistamiseen. Työssä havaittiin useita aktiivisia syanobakteerikantoja, joilta löydettiin mahdollisia uusia
yhdisteitä. Lisäksi löydettiin useita tunnettuja yhdisteitä ja niiden aiemmin tunnistamattomia variantteja uusilta syanobakteerikannoilta tai uusista elinympäristöistä.
Seulontatutkimusten perusteella valittiin syanobakteerikannat kokogenomisekvensointiin. Genomianalyysin avulla pystyttiin selvittämään biosynteesireitti tunnetuille sytotoksisille yhdisteille nimeltä swinholidi ja skytofysiini. Lisäksi swinholidin tuotto pystyttiin osoittamaan ensimmäisen kerran laboratoriossa kasvatetussa puhtaassa syanobakteerikannassa. Väitöskirjan viimeisessä osatyössä tutkittiin tunnetun yhdisteen hassallidiinin toimintamekanismia, missä hyödynnettiin solutestejä, kuvantamista ja lipidimallinnusta. Anabaena-syanobakteerista puhdistetun hassallidiinin havaittiin hajottavan kolesterolia sisältävien eukaryoottisolujen solukalvon.
Luonnonyhdisteen kehittäminen lääkkeeksi tai muuksi lopputuotteeksi on hyvin hidasta, mutta tarpeellista tulevaisuuden kannalta. Tämä väitöskirjatutkimus lisää ymmärrystämme useista syanobakteerien tuottamista bioaktiivisista yhdisteistä sekä toiminnallisella että molekulaarisella tasolla.ei saavutettav
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
- …
