1,720,992 research outputs found
Anticancer activity of salinomycin quaternary phosphonium salts
No full textWe report the synthesis of a series of twelve novel salinomycin conjugates and their characterization by spectroscopic and spectrometric methods.The .mnova files can be accessed with the Mnova software free trial available at https://mestrelab.com/evaluate/single.</p
Rate of translocation across lipid bilayer of triphenylphosphonium-linked salinomycin derivatives contributes significantly to their K+/H+ exchange activity on membranes
No full textSalinomycin (SAL), a polyether antibiotic exerting K+/H+-exchange on cellular membranes, effectively kills cancer stem cells. A series of cationic triphenylphosphonium (TPP+)-linked SAL derivatives were synthesized aiming to render them mitochondria-targeted. Remarkably, attaching a TPP+ moiety via a triazole linker at the C-20 position of SAL (compound 5) preserved the ion carrier potency of the antibiotic, while analogs with TPP+ linked at the C-1 position of SAL (6, 8) were ineffective. On planar bilayer lipid membranes (BLM), the SAL analogs 6 and 8 exhibited slow electrical current relaxation upon a voltage jump, similar to previously studied alkyl-TPP compounds. However, 5 demonstrated much faster current relaxation, which suggested its high permeability through BLM resulting in its pronounced potency to transport potassium and hydrogen ions across both artificial (liposomal) and mitochondrial membranes. SAL and 5 did not induce a steady-state electrical current through the planar lipid bilayer, thereby confirming that the transport mechanism is the electrically silent K+/H+ exchange. The ion exchange mediated by 5 in energized mitochondria was more active than that caused by SAL, which was apparently due to accumulation of 5 in mitochondria. Thus, compound 5 can be regarded as a promising lead compound for testing anticancer and antimicrobial activity.The dataset will be updated.</p
Synthesis, structural analysis, and biological activity evaluation of salinomycin derivatives
No full textWydział ChemiiSalinomycyna jest antybiotykiem jonoforowym produkowanym przez Streptomyces albus. Celem pracy doktorskiej była chemiczna modyfikacja salinomycyny, analiza jej struktury oraz ocena właściwości biologicznych. Opisano reakcję rozkładu salinomycyny w warunkach kwasowych oraz syntezę koniugatów z kationami fosfoniowymi, modyfikując pozycje C1 i C20. Struktury potwierdzono technikami spektroskopowymi i krystalograficznymi. Badania wykazały, że produkt reakcji rozkładu zachowuje zdolność do kompleksowania jonów metali, a pochodne z kationem fosfoniowym wykazują większą cytotoksyczność wobec komórek nowotworowych (zastosowane linie ludzkich komórek nowotworowych: SW480, SW620, PC3, MDA-MB-231, A549) niż salinomycyna i doksorubicyna. Ponadto udowodniono, że otrzymane pochodne wpływają na funkcjonalność mitochondriów. Analiza obejmowała wpływ na mitochondria, cykl komórkowy i apoptozę. Związki wykazywał umiarkowaną aktywność przeciwbakteryjną wobec bakterii Gram-dodatnich. Wyniki wskazują, że koniugacja bioaktywnych cząsteczek to obiecujący kierunek w poszukiwaniu nowych leków przeciwnowotworowych.
Salinomycin is an ionophore antibiotic produced by Streptomyces albus. The aim of the doctoral dissertation was the chemical modification of salinomycin, structural analysis, and evaluation of its biological properties. The study described the degradation reaction of salinomycin under acidic conditions and the synthesis of its conjugates with phosphonium cations by modifying positions C1 and C20. The structures were confirmed using spectroscopic and crystallographic techniques. Research showed that the degradation product retains the ability to complex metal ions, and the derivatives containing a phosphonium cation exhibit higher cytotoxicity against cancer cell lines (used cancer cell lines: SW480, SW620, PC3, MDA-MB-231, A549) than salinomycin and doxorubicin. Furthermore, it was demonstrated that the obtained derivatives affect mitochondrial functionality. The analysis included the impact on mitochondria, the cell cycle, and apoptosis. The compounds also exhibited moderate antibacterial activity against Gram-positive bacteria. The results indicate that conjugation of bioactive molecules is a promising direction in the search for new anticancer drugs.Narodowe Centrum Nauki w ramach projektu OPUS nr 2021/41/B/ST4/00088.
Projekty nr 048/13/UAM/0004; 003/13/UAM/0010 z programu „Inicjatywa doskonałości – uczelnia badawcza”
Synthesis, structural and spectroscopic studies as well as anticancer and antimicrobial activity of the new salinomycin derivatives
No full textWydział Chemii: Pracownia Chemii BioorganicznejBadania naukowe z ostatnich kilku lat udowodniły, że salinomycyna hamuje namnażanie ludzkich komórek nowotworowych oraz doprowadza do ich śmierci. W literaturze brakowało natomiast doniesień poświęconych chemicznej modyfikacji salinomycyny. Dlatego też głównym celem pracy doktorskiej było opracowanie wydajnych metod syntezy amidów oraz estrów salinomycyny. Równie ważnym celem pracy było określenie aktywności biologicznej otrzymanych związków. W ramach pracy doktorskiej opracowane zostały wydajne metody syntezy 66 różnorodnych pochodnych salinomycyny, które doprowadziły do otrzymania 39 amidów, 14 estrów oraz 13 O-acylowanych w pozycji C(20) pochodnych jonoforu. Badania aktywności przeciwdrobnoustrojowej pozwoliły udowodnić, że niektóre pochodne salinomycyny wykazują aktywność przeciwbakteryjną, przeciwgruźliczą, przeciwwąglikową oraz aktywność wobec trypanosomatozy afrykańskiej. Ponadto wybrane pochodne salinomycyny przełamują oporność wielolekową komórek nowotworowych. Zsyntezowane pochodne charakteryzowały się silniejszym przełamywaniem lekooporności komórek LoVo/DX niż salinomycyna oraz związki referencyjne. Wykonane pomiary udowodniły, że większość amidów oraz estrów salinomycyny cechuje mniejsza toksyczność wobec prawidłowych komórek organizmu od powszechnie stosowanych leków cytostatycznych. Wszystkie wykonane badania doprowadziły finalnie do wyznaczenia korelacji pomiędzy strukturą otrzymanych pochodnych a ich aktywnością biologiczną. Dzięki temu możliwe będzie racjonalne projektowanie syntezy nowych pochodnych salinomycyny.The scientific research over the past several years have demonstrated that salinomycin inhibits proliferation of human cancer cells and leads to their death. However, any informations about the chemical modification of salinomycin have been missed. Therefore, the main aim of this dissertation was to develop the efficient methods for the synthesis of amides and esters of salinomycin. An equally important objective was also to determine the biological activity of the compounds obtained. In this context, the efficient methods of synthesis of 66 different salinomycin derivatives, which led to afford 39 amides, 14 esters and 13 O-acylated at the C(20) position derivatives were developed. Moreover, it was proved that some derivatives show antibacterial, antitubercular, antianthrax and antitrypanosomal activity. In addition, salinomycin derivatives break multidrug resistance of tumour cells tested. The synthesized derivatives were characterized by stronger overcoming of drug resistance of LoVo/DX cells than salinomycin and the reference compounds. The measurements have shown that the majority of amides and esters are less toxic to normal cells of the body than the commonly used cytostatic drugs. All these tests led finally to determine the correlation between the structure of the resulting compounds and their biological activity. This will enable in the nearest future the rational design of the new synthetic derivatives of salinomycin
Synthesis, spectroscopic studies and biological activity evaluation of derivatives of natural products – monensin A and colchicine
No full textWydział ChemiiRozprawę doktorską tworzy 5 publikacji oraz polski patent, których przedmiotem jest chemiczna modyfikacja dwóch związków pochodzenia naturalnego o szerokim spektrum aktywności biologicznej. W pracy opisano syntezę i właściwości pochodnych monenzyny A i kolchicyny. Struktura i czystość otrzymanych związków zostały określone za pomocą różnorodnych technik analitycznych: ESI-MS, EA, FT-IR, a także 1H NMR, 13C NMR i 2D NMR. We współpracy z naukowcami z polskich i zagranicznych ośrodków naukowych przeprowadzono badania aktywności biologicznej - wyznaczono cytotoksyczność otrzymanych związków wobec kilku linii komórek nowotworowych, a także określono ich współczynniki selektywności i oporności. Kolchicyna oraz jej najbardziej aktywne pochodne zostały również poddane szczegółowym badaniom hamowania cyklu komórkowego. Dla wybranych pochodnych monenzyny została także określona ich zdolność do hamowania namnażania bakterii z rodzaju Staphylococcus. Pochodne kolchicyny zostały również poddane badaniom dokowania molekularnego. Przeprowadzenie wyżej wymienionych badań pozwoliło na zaobserwowanie zależności pomiędzy strukturą otrzymanych związków a ich aktywnością biologiczną (ang. structure-activity relationship).The doctoral dissertation consists of 5 peer-reviewed scientific publications and a Polish patent, in which the chemical modification of two natural products showing a broad spectrum of biological activity are described. The dissertation describes the synthesis and properties of monensin A and colchicine derivatives. The analytical techniques used to verify the structure and determine the purity of the obtained compounds included ESI-MS, EA, FT-IR as well as 1H NMR, 13C NMR, and 2D NMR. The biological activity of new compounds was examined in cooperation with scientists from the Polish and foreign institutes. The cytotoxicity of the obtained compounds was determined against several cancer cell lines, and their selectivity and resistance index values were determined. Colchicine and its most active derivatives were also studied for their effects on cell death and mitotic arrest. The antibacterial activity of the selected monensin derivatives was tested in vitro against Staphylococcus genus. Colchicine derivatives were also subjected to molecular docking studies. All the above-mentioned studies allowed us to draw some conclusions on the structure-activity relationship of the tested compounds
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Synthesis, spectroscopic and structural studies and evaluation of anticancer properties of new colchicine derivatives
No full textWydział ChemiiPrzedmiotem rozprawy doktorskiej zatytułowanej „Synteza, badania spektroskopowe i strukturalne oraz ocena właściwości przeciwnowotworowych nowych pochodnych kolchicyny” była chemiczna modyfikacja kolchicyny w pozycji C(4) w pierścieniu A, w pozycji C(7) w pierścieniu B oraz w pozycji C(10) w pierścieniu C. Kolchicyna jest głównym pseudoalkaloidem izolowanym z Colchicum autumnale i Gloriosa superba. Kolchicyna jest jedną z najstarszych substancji leczniczych znanych ludzkości. Klinicznie kolchicyna jest stosowana w leczeniu rodzinnej gorączki śródziemnomorskiej, dnie moczanowej czy chorobie Behceta. W rozprawie doktorskiej przedstawiono syntezę i właściwości mocznikowych, uretanowych, aminowych pochodnych kolchicyny i tiokolchicyny. W celu potwierdzenia struktury i określenia czystości otrzymanych związków wykorzystano techniki spektroskopowe np. spektrometrię mas (ESI-MS), analizę elementarną (EA), spektroskopię w podczerwieni (FT-IR) oraz spektroskopię magnetycznego rezonansu jądrowego (1H NMR, 13C NMR). W przypadku dwóch pochodnych kolchicyny wykonano dodatkowo analizę krystalograficzną we współpracy z prof. Janem Janczakiem z Instytutu Niskich Temperatur i Badań Strukturalnych Polskiej Akademii Nauk. We współpracy z naukowcami z polskich i zagranicznych ośrodków naukowych (zespołem prof. Joanny Wietrzyk z Instytutu Immunologii i Terapii Doświadczalnej Polskiej Akademii Nauk, dr Alicją Urbaniak i prof. Timothym C. Chambersem z Zakładu Biochemii i Biologii Molekularnej na Uniwersytecie Nauk Medycznych w Arkansas, USA) przeprowadzono badania aktywności biologicznej nowych związków. Do oceny aktywności przeciwnowotworowej kolchicyny i jej mocznikowych pochodnych wykorzystano linie komórek ludzkich nowotworów. Dla kolchicyny i jej najaktywniejszych pochodnych wykonano analizę cyklu komórkowego oraz badanie wpływu na organizację mikrotubul w komórkach nowotworowych za pomocą metod immunofluorescencyjnych. Dodatkowo oceniono aktywność wybranych związków w stosunku do komórek pierwotnej ostrej białaczki limfoblastycznej (ALL) oraz nowotworu piersi (BC) (badania in vitro i ex vivo). Dzięki współpracy z prof. Jackiem Tuszyńskim z Wydziału Onkologii na Uniwersytecie Alberta w Kanadzie przeprowadzono dokowanie molekularne otrzymanych pochodnych kolchicyny do kolchicynowego miejsca wiążącego (ang. colchicine binding site CBS), zbadano ich interakcje z βI tubuliną w oraz obliczono energię wiązania otrzymanych związków z docelowym miejscem wiążącym w tubulinie. Przeprowadzenie wszystkich wyżej wymienionych badań pozwoliło na zaobserwowanie zależności pomiędzy strukturą a aktywnością biologiczną otrzymanych związków (ang. structure-activity relationship). Aktywność biologiczna pochodnych kolchicyny silnie zależy od chemicznej natury wprowadzonego łańcucha alifatycznego w pozycji C(7) czy C(10) oraz heteroatomu (Cl, Br, I) wprowadzonego w pozycji C(4). Najbardziej aktywnymi związkami okazały się pochodne niewielkich podstawnikach (krótkie łańcuchy alifatyczne). Uretanowe pochodne wykazywały dużo lepszą aktywność przeciwnowotworową niż pochodne mocznikowe czy aminowe. Przedstawione badania w niniejszej rozprawie doktorskiej nad modyfikacją chemiczną znanego związku naturalnego - kolchicyny udowodniły jednoznacznie, że modyfikacja chemiczna tego związku może doprowadzić do analogów cechujących się większą cytotoksycznością i lepszą selektywnością działania oraz synergistycznym działaniem z wybranymi lekami przeciwnowotworowymi.The subject of the doctoral dissertation entitled "Synthesis, spectroscopic and structural studies and evaluation of the anti-cancer properties of new colchicine derivatives" was chemical modification of colchicine at position C(4) in ring A, at position C(7) in ring B and at position C (10) in ring C. Colchicine is the major pseudoalkaloid isolated from Colchicum autumnale and Gloriosa superba and is one of the oldest healing substances known to mankind. Clinically, colchicine is used to treat Familial Mediterranean fever, gout and Behcet's disease. In the dissertation the syntheses and properties of urea, urethane and amine derivatives of colchicine and thiocolchicine has been described. In order to confirm the structure and to determine the purity of the obtained compounds, several spectroscopic techniques like electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS), infrared spectroscopy (FT-IR) and nuclear magnetic resonance spectroscopy (1H and 13C NMR) were used. The crystallographic analysis of two crystalline derivatives of colchicine was performed in cooperation with Prof. Jan Janczak from the Institute of Low Temperature and Structure Research, PAS. In cooperation with scientists from Polish and foreign research centres (Prof. Joanna Wietrzyk's team from the Institute of Immunology and Experimental Therapy of the Polish Academy of Sciences or Dr. Alicja Urbaniak and Prof. Timothy C. Chambers from the Department of Biochemistry and Molecular Biology at the University of Medical Sciences in Arkansas) the biological activity of the new compounds were tested using several human cancer cell lines. Moreover, for colchicine and its most active derivatives the cell cycle analysis was performed and the influence of these compounds on microtubule organization in cancer cells was tested using immunofluorescence methods. Additionally, the activity of the compounds against acute lymphoblastic leukaemia (ALL) and breast cancer (BC) (in vitro and ex vivo studies) was evaluated. In cooperation with Prof. Jacek Tuszyński from the Faculty of Oncology at the University of Alberta, molecular docking of the obtained colchicine derivatives was performed showing the interactions of colchicine derivatives with the colchicine binding site (CBS) of βI tubulin. Results of the above-mentioned studies allowed concluding about the structure-activity relationship. The biological activity of colchicine derivatives strongly was found to depend on the chemical nature of the introduced aliphatic chain at C(7) or C (10) position and the heteroatom (Cl, Br, I) introduced at C (4) position. The most active compounds turned out to be the derivatives with small substituents (short aliphatic chains). Urethane derivatives showed much better in vitro antitumor activity than urea or amine derivatives. The studies presented in this doctoral dissertation on the chemical modification of colchicine have clearly proven that the chemical modification of this compound may lead to analogues characterized by greater cytotoxicity and better selectivity of action than anticancer drugs as well as synergistic action with selected anticancer drugs
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
- …
