37 research outputs found
Modellering zandtransport zeereep: Windrichting, vegetatiegroei en seizoensvariatie
No full textRekenmodel om effect van vegetatie op zandtransport door wind in rekening te brengen.TAW/EN
25. Boxel, Hugo (1607?-1680?)
No full textHugo Boxel was the author of Ep51, 53, and 55 to Spinoza, and the recipient of Ep52, 54, and 56. This correspondence took place from September to October/November 1674 and suggests the two had met before and conversed. It covers the unlikely topic of apparitions and ghosts and has often been regarded as one of the oddest episodes in Spinoza’s correspondence, although during the second half of the seventeenth century the belief in ghosts, witches, and magic was still widespread across Europe; the Dutch Republic was no exception.<br/
De turbulente stroming over de zeereep
No full textDoel van het project "Fysische modellering zeereepontwikkeling" is de ontwikkeling van een model waarmee effecten van beheersmaatregelen op de morfologische ontwikkeling van de zeereep kunnen worden voorspeld, teneinde daarmee het zeereepbeheer te optimaliseren. Dit model bestaat uit een tweetal deelmodellen. Een stromingsmodel berekend de luchtstroming over de zeereep en de effecten van topografie en vegetatie op deze turbulente stroming. Een zandtransportmodel berekend op grond van de resultaten van het stromingsmodel de mate van zandtransport, de plaatsen waar erosie en waar depositie optreedt en de nieuwe vorm van de zeereep. Ais de vorm van de zeereep significant veranderd wordt het stromingsmodel opnieuw aangeroepen. Op grond van een eerdere haalbaarheidsstudie was aan het licht gekomen dat het stromingsmodel op een aantal punten verbeterd moest worden: Het model diende niet meer vast te lopen op recirkulatiewervels, de snelle redistributie van turbulente kinetische energie moest verbeterd worden, een fout in de berekening van de laterale wind moest verwijderd worden, de effecten van de kromming van de stroomlijnen op de turbulentie moesten opgenomen worden, de uitvoer moest geschikt gemaakt worden voor het SCOPE-model en het interpolatiealgoritme dat gebruikt werd voor de ruwheidslengte moest gewijzigd worden. Bovendien diende een validatie plaats te vinden op grond van meetgegevens. Alle genoemde wijzigingen zijn uitgevoerd en hebben de betrouwbaarheid van het model aanzienlijk verbeterd. Een gevoeligheidsstudie laat zien dat het model voor een aantal parameters gevoelig is. Het zou aan te raden zijn een meer gedetailleerde gevoeligheidsstudie uit te voeren. Bij deze studie bleek de impulsflux op enige hoogte (tussen 10 en 1000 m) onderschat werd door het model. De oorzaak hiervan is zeer waarschijnlijk een procedure voor het vereffenen van het impulsfluxprofiel. Dit zal moeten worden gewijzigd. Bij de validatie op grond van over Nederlandse zeerepen gemeten windprofielen bleek dat de windprofielen aan de zeewaartse zijde en op de top van het duin redelijk worden benaderd. Het is niet duidelijk in hoeverre afwijkingen te wijten zijn aan de onjuist gemodelleerde impulsflux. De vertraging van de stroming aan de lijzijde van de zeereep wordt door het model onderschat. Hieraan is gezien de geringe relevante voor het berekende zandtransport weinig aandacht besteed. De gevoeligheidsstudie zien dat voor een goede validatie van het model ook gegevens nodig zijn omtrent de impulsflux of de wrijvingssnelheid, daar deze laatste de belangrijkste invoerparameter is voor de berekening van het zandtransport.TAW/EN
Learning curve for adoption of robot-assisted minimally invasive esophagectomy: a systematic review of oncological, clinical, and efficiency outcomes
No full textBackground: robot-assisted minimally invasive esophagectomy (RAMIE) is gaining increasing popularity as an operative approach. Learning curves to achieve surgical competency in robotic-assisted techniques have shown significant variation in learning curve lengths and outcomes. This study aimed to summarize the current literature on learning curves for RAMIE. Methods: a systematic review was conducted in line with PRISMA guidelines. Electronic databases PubMed, MEDLINE, and Cochrane Library were searched, and articles reporting on learning curves in RAMIE were identified and scrutinized. Studies were eligible if they reported changes in operative outcomes over time, or learning curves, for surgeons newly adopting RAMIE. Results: fifteen studies reporting on 1767 patients were included. Nine studies reported on surgeons with prior experience of robot-assisted surgery prior to adopting RAMIE, with only four studies outlining a specified RAMIE adoption pathway. Learning curves were most commonly analyzed using cumulative sum control chart (CUSUM) and were typically reported for lymph node yields and operative times, with significant variation in learning curve lengths (18–73 cases and 20–80 cases, respectively). Most studies reported adoption without significant impact on clinical outcomes such as anastomotic leak; significant learning curves were more likely in studies, which did not report a formal learning or adoption pathway. Conclusion: reported RAMIE adoption phases are variable, with some authors suggesting significant impact to patients. With robust training through formal programmes or proctorship, however, others report RAMIE adoption without impact on clinical outcomes. A formalized adoption curriculum appears critical to prevent adverse effects on operative efficiency and patient care
Structure and functional analysis of the IGF-II/IGF2R interaction
No full textEmbryonic development and normal growth require exquisite control of insulin-like growth factors (IGFs). In mammals the extracellular region of the cation-independent mannose-6-phosphate receptor has gained an IGF-II-binding function and is termed type II IGF receptor (IGF2R). IGF2R sequesters IGF-II; imbalances occur in cancers and IGF2R is implicated in tumour suppression. We report crystal structures of IGF2R domains 11–12, 11–12–13–14 and domains 11–12–13/IGF-II complex. A distinctive juxtaposition of these domains provides the IGF-II-binding unit, with domain 11 directly interacting with IGF-II and domain 13 modulating binding site flexibility. Our complex shows that Phe19 and Leu53 of IGF-II lock into a hydrophobic pocket unique to domain 11 of mammalian IGF2Rs. Mutagenesis analyses confirm this IGF-II 'binding-hotspot', revealing that IGF-binding proteins and IGF2R have converged on the same high-affinity site.James Brown, Carlie Delaine, Oliver J Zaccheo, Christian Siebold, Robert J Gilbert, Gijs van Boxel, Adam Denley, John C Wallace, A Bassim Hassan, Briony E Forbes and E Yvonne Jone
Modellering zandtransport zeereep: Rekenprocedures SAFE 0.0
No full textIn dit rapport wordt ingegaan op de modellering van sedimenttransport door de wind op het strand en in de zeereep. Het doel is te komen tot een model waarmee effect en van beheersmaatregelen op de morfologie van de zeereep kunnen worden voorspeld, ten einde het zeereepbeheer te optimaliseren. Dit rapport beschrijft (a) versie 0.0 van het SAFE-model (Simulation of Aeolian Foredune Evolution) en (b) een stromingsmodel (HILL_MDL) dat het verloop van het windprofiel over een transect simuleert als functie van de topografie en de oppervlakteruwheid. Het stromingsmodel is gebaseerd op het werk van Zeman en Jensen (1987). Het is een twee-dimensionaal, tweede orde sluitingsmodel (d.w.z. dat ook turbulente variaties in de stroming worden gesimuleerd). Het stromingmodel levert windinvoergegevens voor het sedimenttransportmodel. SAFE 0.0 beperkt zich tot simulatie van zandtransport bij aanlandige wind, loodrecht op de zeereep. Het simuleert de ontwikkeling van een dwarsdoorsnede van strand en zeereep als functie van de topografie, vegetatie en sedimenteigenschappen. Er kan gerekend worden met een uniform windveld (dat wel in de tijd kan varieren) of met een windveld dat door het stromingmodel wordt gegenereerd. De effecten van vegetatie, hellingshoek, vocht en sedimenteigenschappen zijn uitgewerkt in kwantitatieve relaties. Zowel het stromingsmodel als het transportmodel kunnen op een aantal punten worden uitgebreid/verbeterd. Vooral de interactie vegetatie, wind en sedimenttransport dient nader te worden onderzocht.TAW/EN
Machine learning to predict early recurrence after oesophageal cancer surgery
No full textBackground: Early cancer recurrence after oesophagectomy is a common problem, with an incidence of 20–30 per cent despite the widespread use of neoadjuvant treatment. Quantification of this risk is difficult and existing models perform poorly. This study aimed to develop a predictive model for early recurrence after surgery for oesophageal adenocarcinoma using a large multinational cohort and machine learning approaches. Methods: Consecutive patients who underwent oesophagectomy for adenocarcinoma and had neoadjuvant treatment in one Dutch and six UK oesophagogastric units were analysed. Using clinical characteristics and postoperative histopathology, models were generated using elastic net regression (ELR) and the machine learning methods random forest (RF) and extreme gradient boosting (XGB). Finally, a combined (ensemble) model of these was generated. The relative importance of factors to outcome was calculated as a percentage contribution to the model. Results: A total of 812 patients were included. The recurrence rate at less than 1 year was 29·1 per cent. All of the models demonstrated good discrimination. Internally validated areas under the receiver operating characteristic (ROC) curve (AUCs) were similar, with the ensemble model performing best (AUC 0·791 for ELR, 0·801 for RF, 0·804 for XGB, 0·805 for ensemble). Performance was similar when internal–external validation was used (validation across sites, AUC 0·804 for ensemble). In the final model, the most important variables were number of positive lymph nodes (25·7 per cent) and lymphovascular invasion (16·9 per cent). Conclusion: The model derived using machine learning approaches and an international data set provided excellent performance in quantifying the risk of early recurrence after surgery, and will be useful in prognostication for clinicians and patients.</p
Formal assessment of the learning curve for minimally invasive methods is vital in retrospective cohort studies
No full textNucleotide binding affinities of the intact proton-translocating transhydrogenase from Escherichia coli
No full textAbstractTranshydrogenase (E.C. 1.6.1.1) couples the redox reaction between NAD(H) and NADP(H) to the transport of protons across a membrane. The enzyme is composed of three components. The dI and dIII components, which house the binding site for NAD(H) and NADP(H), respectively, are peripheral to the membrane, and dII spans the membrane. We have estimated dissociation constants (Kd values) for NADPH (0.87 μM), NADP+ (16 μM), NADH (50 μM), and NAD+ (100–500 μM) for intact, detergent-dispersed transhydrogenase from Escherichia coli using micro-calorimetry. This is the first complete set of dissociation constants of the physiological nucleotides for any intact transhydrogenase. The Kd values for NAD+ and NADH are similar to those previously reported with isolated dI, but the Kd values for NADP+ and NADPH are much larger than those previously reported with isolated dIII. There is negative co-operativity between the binding sites of the intact, detergent-dispersed transhydrogenase when both nucleotides are reduced or both are oxidised
Minimally invasive surgery for large gastric gastrointestinal stromal tumors.
No full text<p>These files contain video illustrations of a gastrointestinal stromal cell tumor of the stomach which is removed by minimally invasive gastric surgery. </p>
