1,721,307 research outputs found
Évolution temporelle des études qualitatives et quantitatives de la qualité de l’environnement aquatique
No full textDepuis longtemps les hommes se sont préoccupés de la qualité de leur environnement, en particulier en milieu urbain. Cependant, c’est seulement à partir de la fin du XIXe siècle que des essais qualitatifs et quantitatifs de l’estimation de l’état de santé de l’environnement ont été mis au point. Il est assez instructif de voir l’évolution temporelle des polluants retenus dans les préoccupations humaines et dans les études menées par les scientifiques. De même, nous pouvons suivre au cours du temps une évolution des milieux prioritairement étudiés. Par ailleurs, la quantification de la qualité des milieux aquatiques a débuté par des mesures des polluants dans les eaux. Ensuite les scientifiques ont pris en compte le compartiment sédimentaire, soit les sédiments déposés au fond des rivières et des mers, soit les particules en suspension dans les eaux. La troisième étape de quantification de la qualité de l’environnement aquatique a consisté à prendre comme outil les organismes vivants, soit comme « bioindicateurs » par leur présence ou absence du milieu, soit comme « bioaccumulateurs » par la capacité qu’ont certaines espèces à concentrer très fortement certains polluants. L’état actuel vise à utiliser des molécules synthétisées normalement par les organismes mais à des taux variables ou des molécules exceptionnellement présentes dans les cellules de l’organisme en présence de polluants dans leur milieu ; ce sont les « biomarqueurs ».Geffard Alain, Amiard Jean-Claude. Évolution temporelle des études qualitatives et quantitatives de la qualité de l’environnement aquatique. In: Côtes et estuaires : milieux naturels. Actes du 124e Congrès national des sociétés historiques et scientifiques, « Milieu littoral et estuaires », Nantes, 1999. Paris : Editions du CTHS, 2002. pp. 177-189. (Actes du Congrès national des sociétés savantes, 124
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Biomarkers linked to energy metabolism in freshwater amphipod Gammarus fossarum : Development, link with reproductive success and in situ approach
No full textDans le cadre de l'évaluation de la qualité des écosystèmes aquatiques, les réponses en lien avec l'énergie semblent particulièrement pertinentes pour appréhender l'état physiologique des êtres vivants et prévoir des effets populationnels. Dans ce contexte, l'objectif de ce travail a été de proposer un biomarqueur de l'assimilation de l'énergie chez un amphipode d'eau douce Gammarus fossarum. La caractérisation des activités enzymatiques digestives (amylase, cellulase et trypsine) et des réserves énergétiques (glycogène, lipides et protéines) soumises à l'influence de divers facteurs biotiques et abiotiques (sexe, stade reproducteur, température, conductivité et quantité de nourriture) a permis d'identifier l'amplitude des réponses étudiées afin d'améliorer l'interprétation des réponses obtenues en milieu naturel. Ces résultats ont également validé l'utilisation d'organismes mâles standardisés et nourris ad libitum dans le cadre d'approche active. D'autre part, la pertinence écologique des enzymes digestives en tant que biomarqueur a été évaluée en étudiant le lien existant entre une perturbation des réponses enzymatiques digestives au niveau sub-individuel et ses conséquences au niveau individuel sur le succès reproducteur des gammares. Par ailleurs, dans le cadre de deux campagnes de terrain, les mesures des activités enzymatiques digestives réalisées chez les organismes transplantés ont permis de discriminer les sites en fonction de leur qualité chimique et de proposer pour chaque marqueur une valeur référence et seuil traduisant un effet. Ainsi les activités enzymatiques digestives peuvent être utilisées comme outil pour établir un diagnostic de risque environnemental.For the assessment of the aquatic ecosystems health, responses related to energy metabolism seem particularly relevant to understanding the physiological state of living organisms and provide population- effects. In this context, the objective of this work was to propose a biomarker of energy assimilation in a freshwater amphipod Gammarus fossarum. The characterization of digestive enzymes activities ( amylase , cellulase and trypsin) and energy reserves (glycogen , lipids and proteins) submited to the influence of various biotic and abiotic factors (sex, reproductive stage , temperature, conductivity and amount of food ) determine the range of responses studied to improve the interpretation of data obtained in the field. These results can also validate the use of standardized male fed ad libitum in caging approach. On the other hand, the ecological relevance of digestive enzymes was assess, the link between digestive enzyme impairments at sub -individual level and its consequences on the fitness of the gammarid population at individual level was established. Furthermore, in the context of two field campaigns, measures of digestive enzyme activities in organisms transplanted allowed to discriminate sites according to their chemical quality and to propose for each marker a benchmarck and a threshold value reflecting an effect. Thus, digestive enzyme activities can be used as diagnostic tool for environmental risk assessment
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Analysis of functional landscape connectivity : Study of movements and genes flow of a forest mustelid, the Pine marten (Martes martes)
No full textLes modifications du paysage engendrées par les activités humaines sont une des causes majeures du déclin de la biodiversité. En générant une perte de la connectivité fonctionnelle du paysage, elles limitent les déplacements des individus et entraînent la rupture des flux de gènes, processus clés dans le maintien et la persistance des populations. Cependant, le lien entre ces processus et la structure du paysage est encore mal compris. Dans ce contexte, nous avons conduit une étude sur la Martre des pins, une espèce a priori forestière, bien que capable de s’installer durablement dans des paysages fragmentés. A partir de l’analyse de la variabilité génétique de groupes échantillonnées sur 13 sites forestiers à l’échelle de la région Champagne-Ardenne, et du suivi des déplacements d’individus à fine échelle, en milieu continu et fragmenté, nous avons estimé la résistance du paysage aux différents déplacements, c’est-à-dire dans quelle mesure ceux-ci sont freinés ou facilités par les éléments du paysage. Nous avons mis en évidence que les déplacements sont freinés, d’une part par la présence d’une large plaine agricole, et d’autre part, par certaines infrastructures de transport. Nous avons également mis en évidence que les déplacements des martres entre les taches d’habitats sont facilités par la présence de haies et que la hauteur du couvert végétal des habitats non boisés pourrait jouer un rôle dans ces déplacements. Cette étude apporte d’importantes connaissances sur l’écologie des déplacements de la Martre des pins et souligne la nécessité de la prise en compte de la réponse des organismes dans l’établissement des futurs réseaux écologiques.Landscape changes, generated by anthropogenic activities, are widely recognised as one of the main causes of global biodiversity decline. Leading to a loss of functional landscape connectivity, they disrupt movements and gene flow which play a primordial role for the persistence of populations. However, the relationship between these processes and landscape structure remains unclear. In this context, we studied landscape connectivity in European pine marten, a forest species present in fragmented landscapes. We evaluated landscape resistance, i.e. how landscape features impede or facilitate movements and gene flow, analysing genetic variability of groups sampled in 13 forest sites of the Champagne-Ardenne regional area, and studying individual fine-scale movements in both continuous and fragmented areas. We showed that intensive agricultural plain and certain linear infrastructures could impede movements. In addition, we showed that hedgerows facilitate movements between forest patches and we suggested that vegetation height of open habitats could play a role for these movements. This study provides important insights on movement ecology of the European pine marten and underlines the need to take into account responses of organisms in the establishment of ecological networks
Interaction protozoa - zebra mussel (Dreissena polymorpha) : interest for sanitary and environmental biomonitoring
No full textL'évaluation de la contamination des cours d'eau par les agents parasites protozoaires est fondamentale puisqu'on estime qu'une personne sur deux dans le monde est ou a été infectée par une zoonose d'origine parasitaire. Les trois principaux parasites responsables d'épidémies hydriques sont Cryptosporidium parvum, Giardia duodenalis et Toxoplasma gondii. Actuellement, seule la matrice eau est utilisée pour analyser la présence de ces parasites dans l'environnement aquatique. Peu reproductible et chronophage, cette méthode ne permet pas de mettre en place une surveillance de routine. Le projet de thèse propose l'utilisation de la moule zébrée, Dreissena polymorpha, comme un nouvel outil complémentaire pour évaluer la qualité biologique des milieux d'eau douce. Au travers d'expérimentations combinant différentes approches in vivo, ex vivo et in situ, le potentiel de la dreissène à accumuler les parasites protozoaires ainsi que leurs cinétiques d'accumulation dans les tissus ont été déterminés. Utilisée comme espèce sentinelle des contaminations chimiques, l'effet d'un stress biologique dû aux protozoaires a été évalué au laboratoire sur les cellules clefs de l'immunité des bivalves, les hémocytes. Ainsi, le projet permet de placer l'organisme Dreissena polymorpha dans une double stratégie de biosurveillance : une biosurveillance sanitaire liée à l'utilisation de la dreissène en tant que vecteur de parasites considérés comme enjeux de santé publique et une biosurveillance environnementale liée à la compréhension des facteurs de confusion avec les réponses biologiques utilisées comme biomarqueurs.Assessment of the water biological contamination by protozoa is crucial since one in two person of the world population is or has been infected by a parasitic zoonosis. The main protozoa responsible of waterborne outbreaks are Cryptosporidium parvum, Giardia duodenalis and Toxoplasma gondii. Currently, protozoa detection is only based on water analysis. Irrelevant and time consuming, water analysis do not permit accurate biomonitoring. These project aims to use the freshwater mussel, Dreissena polymorpha, as a new complementary tool for biological quality analysis of freshwater. Through in vivo, ex vivo and in situ experiments, we determine the utility of zebra mussel for protozoa accumulation and their accumulation pattern within mussel tissues. Already use as a sentinel specie for chemical contamination, biological stress caused by protozoa has been determined in laboratory experiments on key cells of bivalve immunity, the hemocytes. Hence, Dreissena polymorpha could be involved in a twofold biomonitoring tactics: sanitary biomonitoring related to the use of zebra mussel as vector to protozoa with public health issue and environmental biomonitoring on understanding of the confounding factors in biological responses used as biomarkers
Bivalve molluscs : bioindicators of freshwater contamination by the cyanotoxins microcystins and the environmental toxin β-N-methylamino-L-alanine (BMAA)?
No full textLa fréquence et l’intensité des proliférations de cyanobactéries toxiques dans les eaux douces augmentent depuis plusieurs années, y compris dans celles utilisées pour l’adduction d’eau potable ou les activités récréatives. Parmi les cyanotoxines, les hépatotoxines microcystines (MCs) sont les plus fréquemment synthétisées et les plus étudiées, alors que peu de données sont disponibles sur l’occurrence de la neurotoxine β-méthylamino-L-alanine (BMAA), également produite par des diatomées. En raison des fortes variations spatio-temporelles des efflorescences de cyanobactéries, les prélèvements ponctuels d’eau comme outils de surveillance de la présence de cyanotoxines semblent peu adaptés et sont susceptibles de sous-estimer le risque. En revanche, l’utilisation d’outils intégrateurs telles des espèces bioaccumulatrices, comme les bivalves, peut s’avérer pertinent. La glande digestive des invertébrés est connue pour être l’organe cible majoritaire de l’accumulation des MCs, à la fois sous une forme libre rapidement éliminée, et sous une forme liée à des protéines ayant un temps de résidence plus long dans les tissus. Cependant, peu de données sont disponibles concernant l’organotropisme et les différentes fractions d’accumulation de la BMAA. Cette thèse a contribué à (i) évaluer la pertinence des bivalves Dreissena polymorpha et Anodonta anatina comme outils de biosurveillance de la présence de BMAA et d’organismes producteurs de MCs dans les eaux douces, et (ii) identifier les fractions d’accumulation des toxines les plus pertinentes pour caractériser le niveau et la dynamique de contamination environnementale. Les résultats montrent que la BMAA est accumulée par les bivalves à la fois sous forme libre et associée aux polypeptides de faible poids moléculaire, sans organe cible particulier, soulignant l’utilisation possible de l’analyse de la fraction totale (libre et liée) comme proxy de contamination. L’analyse du corps entier de D. polymorpha permet d’évaluer le niveau de contamination du milieu par la BMAA, à des concentrations environnementales (10 à 50 µg/L) ; les glandes digestives d’A. anatina permettant de révéler la présence de cette toxine dans le milieu à partir de 50 µg BMAA/L. Concernant la présence de producteurs de MCs dans l’eau, les MCs libres quantifiées chez les organismes reflètent plus fidèlement les variations temporelles de contamination du milieu que les MCs totales, particulièrement chez D. polymorpha, en raison de ses capacités de détoxification. L’accumulation de MCs libres chez D. polymorpha permet également de discriminer différents niveaux de contamination environnementale (10 vs. 100 µg/L MCs intracellulaires). Chez A. anatina, les fortes capacités d’accumulation de MCs, dès 1 µg MCs intracellulaires/L dans le milieu, associée à une élimination tardive, restreignent son usage à l’indication d’une présence/absence de contamination, sans évaluation fine de son intensité ni de sa temporalité.The frequency and intensity of toxic cyanobacterial blooms in fresh waters used for drinking water supply or recreational activities have increased for several years. Among the cyanotoxins, the hepatotoxins microcystin (MCs) are the most frequently produced by cyanobacteria and the most studied, whereas few data are available on the occurrence of the neurotoxin β-methylamino-L-alanine (BMAA), also produced by diatoms. Due to spatio-temporal variations in cyanobacterial bloom location, monitoring the cyanotoxins by punctual water sampling may underestimate the risk. By contrast, the use of integrative tools, such as bioaccumulative bivalve species, may be relevant. MCs accumulate mainly in the digestive gland of invertebrates in two forms: free in the cells, rapidly eliminated, and covalently bound to proteins, having a longer residence time in the tissues. However, few data are available on the organotropism and the different accumulation forms of BMAA. This thesis contributed (i) to evaluate the relevance of the bivalves Dreissena polymorpha and Anodonta anatina as tools for MC and BMAA biomonitoring in fresh waters, and (ii) to identify the most appropriate fraction of each toxin that should be analysed in order to characterize the level and the dynamic of environmental contaminations. Results reveal that BMAA is accumulated by bivalves both in free form and associated to low molecular weight polypeptides, with no particular target organ, underling the interest to analyse the total BMAA (free and bound) in bivalves to biomonitor this toxin. The analysis of BMAA in D. polymorpha whole body allows the evaluation of the water contamination level of at environmental concentrations (10 to 50 μg BMAA/L); A. anatina digestive glands allowing to reveal the presence of BMAA from 50 µg/L. Regarding the presence of MC producers in the water, free MC quantification in bivalves reflects more accurately the temporal variations of the environmental contamination than total MCs, particularly in D. polymorpha, because of its high detoxification capacities. The quantification of free MCs in D. polymorpha also allows discriminating environmental contamination levels (10 vs. 100 μg/L intracellular MCs). The high capacity of MC accumulation by A. anatina, from 1 μg intracellular MCs /L in the medium, associated with a late elimination, seemed to restrict its use to the indication of the presence/absence of MC producers in waters, without any detailed assessment of the intensity nor the temporal dynamics of the contamination
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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