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Image Descriptors of Transformed Foci in BALB/c 3T3 Cell transformation Assay: a Statistical Analysis
No full textThe prediction of the carcinogenic potential for humans still relies, at regulatory level, on life-time bioassays in rodents, extremely costly in terms of time, animal used and trained personnel hours. Among the proposed alternatives to the animal bioassay for human carcinogenicity prediction, the in vitro cell transformation assays (CTAs) have shown to model important stages of in vivo carcinogenesis and have the potential to predict carcinogenicity in humans. The endpoint of the CTA is focus formation (colony of transformed cells), and requires classification under light microscopy based on morphology.
Thus current limitations for the wide adoption of the assay partially depend on a fair degree of subjectivity in foci scoring.
Following the suggestion by EURL ECVAM (ECVAM, 2012), the aim of this study was to develop statistical descriptors which represent eye-scored morphological features adopted to classify transformed foci of BALB/c 3T3 CTA in a quantitative way through digital image processing
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Objective scoring of transformed foci in BALB/c 3T3 cell transformation assay by statistical image descriptors
No full textIn vitro cell transformation assays (CTAs) have been shown to model important stages of in vivo carcinogenesis and have the potential to predict carcinogenicity in humans.
Advantages of CTAs are their ability of revealing both genotoxic and non-genotoxic carcinogens while reducing both experimental costs and the number of animals used. The endpoint of the CTA is foci formation, and requires classification under light microscopy based on morphology. Thus current limitations for the wide adoption of the assay partially depend on a fair degree of subjectivity in foci scoring. An objective evaluation may be obtained after separating foci from background monolayer in the digital image, and quantifying values of statistical descriptors which are selected to capture eye-scored morphological features. The aim of this study was to develop statistical descriptors to be applied to transformed foci of BALB/c 3T3, which cover foci size, multilayering and invasive cell growth into the background monolayer. Proposed descriptors were applied to a database of 407 foci images to explore the numerical features, and to illustrate open problems and potential solutions
LA SEGNALAZIONE DEGLI EVENTI SENTINELLA NELLA REGIONE VENETO
No full textINTRODUZIONE: Con il Decreto Ministeriale del 11 dicembre 2009 “Istituzione del sistema informativo per il monitoraggio degli errori in sanità” è stato istituito il cosiddetto flusso SIMES, finalizzato alla raccolta delle informazioni relative agli eventi sentinella (EVS) ed alla denuncia dei sinistri, e tale decreto ha previsto come Regioni e Province Autonome dovessero mettere a disposizione le informazioni relative agli eventi sentinella verificatesi dal 1 Gennaio 2009 ed alle denunce dei sinistri presentate a far data dal 1 luglio 2009, adempimento ricompreso tra quelli cui le regioni devono ottemperare per l'accesso al finanziamento integrativo a carico dello Stato, ai sensi dell'Intesa sancita dalla Conferenza Stato-Regioni il 23 marzo 2005 e successive integrazioni e modifiche.
Allo scopo di dimensionare il ricorso alla segnalazione degli EVS è stata condotta nella regione Veneto, dimensionando il fenomeno nel primo quinquennio di applicazione e indagando la tipologia di eventi segnalati e le relative cause/fattori di rischio. MATERIALI E METODI: Dall’analisi del flusso SIMES relativamente al quinquennio 2009-2013, sono stati considerati tutti gli EVS comprensivi della scheda B e validati a livello regionale segnalati dalle strutture sanitarie operanti nella Regione Veneto, sia pubbliche che private accreditate, presso la quale operano n. 21 Az. ULSS, n. 2 Az. Ospedaliere, n. 1 IRCCS oncologico; n. 28 strutture private accreditate. RISULTATI: Sono stati segnalati complessivamente 363 EVS, mediamente 72,6/anno, con il dato relativo al primo anno dell’analisi presumibilmente sottodimensionato (n. 35) in considerazione dell’imputazione a posteriori.
Per quanto concerne le segnalazioni, ognuna delle 16 tipologie di EVS proposte è stata segnalata e alle segnalazioni hanno contribuito tutte le 24 strutture pubbliche e 23 delle 28 private accreditate, con un range di segnalazioni piuttosto ampio (1-83) e non rapportabile alla tipologia e ai volumi di prestazioni erogate.
L’evento “morte o grave danno per caduta di paziente”, con 137 segnalazioni pari al 38%, rappresenta l’EVS più frequentemente segnalato, seguito da “ogni altro evento avverso che causa morte o grave danno al paziente” con 50 (14%), e dal “suicidio o tentato suicidio di paziente in ospedale” con 34 (9%).
Da riportare come la letalità degli EVS segnalati si sia attestata al 21%, con un picco del 43% riferito al primo anno, e come l’esito più frequentemente riportato sia stato, come atteso in virtù della tipologia di EVS segnalati, il “trauma maggiore conseguente a caduta di paziente” nel 27% dei casi, con la tipologia di EVS relativo alla caduta dei pazienti che nel 71% dei casi ha esitato in un trauma maggior e nel 11% nel decesso.
Per quanto concerne le aree di accadimento, la maggior parte degli EVS segnalati erano appannaggio dell’area medica (43%), seguita dalla chirurgica (20%) e dalla materno infantile (10%), e, dall’analisi per luogo di accadimento, emerge come quasi la metà degli EVS si sia verificata presso le unità di degenza (48%), con la sala operatoria a rappresentare il secondo luogo in termini di frequenza assoluta (16%) e il principale luogo di accadimento per le unità operative dell’area chirurgica (55%).
Di rilievo come dall’analisi delle cause e fattori contribuenti, riportati nelle segnalazioni, l’accadimento degli EVS, oltre a carenze formative e comunicative (33%), fosse principalmente riconducibile a inadeguatezza, violazioni o assenza di linee guida, istruzioni operative o protocolli interni (51%).
Contenuto infine l’impatto delle segnalazioni relative a errori nella terapia farmacologica (5%) e di rilievo invece come le segnalazioni siano pervenute anche da strutture extraospedaliere (4%). CONCLUSIONI: Quanto emerso, oltre a confermare la problematicità della sottonotifica delle segnalazioni, testimoniata dall’elevatissima letalità degli EVS segnalati, pari al 21%, a rappresentazione di un contesto comunque gravato dall’effetto paradosso secondo il quale le istituzioni con un numero maggiore di segnalazioni rappresentano le realtà più attente e sensibili alle politiche della sicurezza e qualità delle cure, conferma la tipologia degli EVS riportati nella letteratura maggiormente accreditata
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Poly(butylene terephthalate) nanocomposites containing organoclay prepared via intercalation with polymer precursor
No full textAppropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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