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Solitary foundation or colony fission in ants: an intraspecific study shows that worker presence and number increase colony foundation success
No full text<p>Datasets for the paper published in Oecologia entitled "Solitary foundation or colony fission in ants: an intraspecific study shows that worker presence and number increase colony foundation success"</p>
<p>Script_article.R : R code to analyze the data</p>
<p>Data.txt : Growth data</p>
<p>donnees_survie.txt : Survival data</p>
<p>donnees_presence_nid.txt : Data of the presence of queens in the nest</p>
Habitat fragmentation through urbanization selects for low dispersal in an ant species
No full text<p>Datasets for the paper published in Oikos entitled "Habitat fragmentation through urbanization selects for low dispersal in an ant species"</p><p>Visual_data_table.xlsx: Visual table of the data (not used for the analysis)<br>Script_<i>R.r, </i>data_<i>R.xlsx, </i>Var_sites_R.xlsx: script and data used for the analysis</p>
Evolution of dispersal and community structure in ants in response to habitat fragmentation
No full textLa fragmentation de l’habitat est une des menaces majeures qui pèse sur la biodiversité. Les principales causes sont dues à l’activité humaine. Elle est produite par l’augmentation de l’urbanisation, de l’agriculture, de la déforestation ou des infrastructures de transport. La fragmentation de l’habitat est caractérisée par une diminution de la quantité d’habitat favorable et par un isolement de cet habitat. L’objectif de cette thèse est de mieux comprendre son effet à plusieurs échelles, de la population en regardant les différences inter-individuelles notamment liées aux différentes stratégies de dispersion, et à l’échelle des communautés et des métacommunautés en observant leurs compositions. Plusieurs approches sont utilisées : théorie, étude empirique et observations sur le terrain. La dispersion est un trait d’histoire de vie clé pour la survie dans un habitat fragmenté car elle permet le passage d’individus d’un fragment à un autre et la colonisation des fragments vides. Cependant, plusieurs forces ont des effets opposés sur le maintien des espèces dans un contexte de fragmentation de l’habitat. La fragmentation augmente les coûts liés à la dispersion dans un habitat défavorable, augmente l’hétérogénéité mais également la compétition entre apparentés. La fragmentation de l’habitat a un impact à l’échelle des communautés en faisant varier le nombre d’espèces ou la composition de celles-ci. Les fourmis sont de bons modèles d’études pour répondre aux problématiques de cette thèse car elles sont présentes dans de nombreux milieux contrastés et ont un fort polymorphisme de dispersion. Il existe des reines qui dispersent sur de longues distances en étant ailées et seules, ou des reines qui dispersent sur de plus courtes distances en étant aptères et accompagnées d’un groupe d’ouvrières. A l’échelle des populations, j’ai étudié la fourmi graminicole Myrmecina graminicola qui a l’intérêt d’utiliser les deux stratégies de dispersion. A l’échelle des communautés, je me suis intéressé aux espèces de fourmis des parcs parisiens, habitat très fragmenté, et des forêts proches de Paris, habitat peu fragmenté. Dans le premier chapitre, j’ai montré avec une approche théorique que la distance de dispersion augmente quand la fragmentation de l’habitat augmente dans un contexte de compromis compétition/colonisation. Cependant la structuration de l’habitat peut fortement affecter ces résultats avec une diminution de la dispersion quand l’habitat est agrégé. Dans un deuxième chapitre, j’ai mis en évidence l’existence de ce compromis compétition/colonisation chez M. graminicola et l’importance de la présence d’ouvrières lors de la fondation d’une nouvelle colonie, leur présence augmentant la survie et la croissance de la colonie. Dans un troisième chapitre, j’ai montré une diminution de la dispersion avec l’augmentation de la fragmentation de l’habitat en milieu urbain chez M. graminicola, suggérant que le coût à la dispersion en milieu urbain fortement fragmenté sélectionne contre la dispersion. Pour finir, j’ai observé une augmentation de la richesse spécifique, avec des communautés de fourmis très différentes, entre le milieu urbain et forestier et une baisse de la richesse spécifique avec la taille du parc en ville. Il n’y a pas d’effet de la fragmentation en forêt. Cette thèse montre la diversité des réponses à la fragmentation de l’habitat, que ce soit à l’échelle des populations et des communautés, et ouvre la voie à de nouvelles études.Habitat fragmentation is one of the major threats to biodiversity. The main causes are due to human activity. It is produced by increased urbanisation, agriculture, deforestation, or transport infrastructure. Habitat fragmentation is characterised by a decrease in the amount of favourable habitat and by the isolation of this habitat. The objective of this thesis is to better understand its effect at several scales, from the population level by looking at inter-individual differences linked to different dispersal strategies, to the community and metacommunity level by observing their composition. Several approaches are used: theory, an empirical study and field observations. Dispersal is a key life-history trait for survival in a fragmented habitat as it allows the movement of individuals from one fragment to another and the colonisation of empty fragments. However, several forces have opposing effects on the maintenance of species in a fragmented habitat. Fragmentation increases the costs of dispersal in an unfavourable habitat, increases heterogeneity and competition between relatives. Habitat fragmentation has an impact at the community level by changing the number of species or the composition of communities. Ants are good models to study because they are present in many contrasting environments and have a strong dispersal polymorphism. There are winged queens that disperse alone over long distances, or apterous queens that disperse accompanied by a group of workers over shorter distances. At the population level, I studied the ant Myrmecina graminicola which advantageously uses both dispersal strategies. At the community level, I studied ant species in Parisian parks, a highly fragmented habitat, and in forests near Paris, a less fragmented habitat. In the first chapter, I showed with a theoretical approach that the dispersal distance increases when the habitat fragmentation increases in a context of competition/colonisation trade-off. Habitat structure can strongly affect these results with a decrease of the dispersal when the habitat is aggregated. In a second chapter, I highlighted the existence of this competition/colonisation trade-off in M. graminicola and the importance of the presence of workers during the foundation of a new colony, their presence increasing the survival and growth of the colony. In a third chapter, I showed a decrease in dispersal with increased habitat fragmentation in urban environments in M. graminicola, suggesting that the cost of dispersing in highly fragmented urban environments selects against dispersal. Finally, I observed an increase in species richness, with very different ant communities, between urban and forest environments and a decrease in species richness with increasing park size in the city. There is no effect of fragmentation in forests. This thesis shows the diversity of responses to habitat fragmentation, both at the population and community levels, and opens the way for further studies
Évolution de la dispersion et structure des communautés de fourmis en réponse à la fragmentation de l'habitat
No full textHabitat fragmentation is one of the major threats to biodiversity. The main causes are due to human activity. It is produced by increased urbanisation, agriculture, deforestation, or transport infrastructure. Habitat fragmentation is characterised by a decrease in the amount of favourable habitat and by the isolation of this habitat. The objective of this thesis is to better understand its effect at several scales, from the population level by looking at inter-individual differences linked to different dispersal strategies, to the community and metacommunity level by observing their composition. Several approaches are used: theory, an empirical study and field observations. Dispersal is a key life-history trait for survival in a fragmented habitat as it allows the movement of individuals from one fragment to another and the colonisation of empty fragments. However, several forces have opposing effects on the maintenance of species in a fragmented habitat. Fragmentation increases the costs of dispersal in an unfavourable habitat, increases heterogeneity and competition between relatives. Habitat fragmentation has an impact at the community level by changing the number of species or the composition of communities. Ants are good models to study because they are present in many contrasting environments and have a strong dispersal polymorphism. There are winged queens that disperse alone over long distances, or apterous queens that disperse accompanied by a group of workers over shorter distances. At the population level, I studied the ant Myrmecina graminicola which advantageously uses both dispersal strategies. At the community level, I studied ant species in Parisian parks, a highly fragmented habitat, and in forests near Paris, a less fragmented habitat. In the first chapter, I showed with a theoretical approach that the dispersal distance increases when the habitat fragmentation increases in a context of competition/colonisation trade-off. Habitat structure can strongly affect these results with a decrease of the dispersal when the habitat is aggregated. In a second chapter, I highlighted the existence of this competition/colonisation trade-off in M. graminicola and the importance of the presence of workers during the foundation of a new colony, their presence increasing the survival and growth of the colony. In a third chapter, I showed a decrease in dispersal with increased habitat fragmentation in urban environments in M. graminicola, suggesting that the cost of dispersing in highly fragmented urban environments selects against dispersal. Finally, I observed an increase in species richness, with very different ant communities, between urban and forest environments and a decrease in species richness with increasing park size in the city. There is no effect of fragmentation in forests. This thesis shows the diversity of responses to habitat fragmentation, both at the population and community levels, and opens the way for further studies.La fragmentation de l’habitat est une des menaces majeures qui pèse sur la biodiversité. Les principales causes sont dues à l’activité humaine. Elle est produite par l’augmentation de l’urbanisation, de l’agriculture, de la déforestation ou des infrastructures de transport. La fragmentation de l’habitat est caractérisée par une diminution de la quantité d’habitat favorable et par un isolement de cet habitat. L’objectif de cette thèse est de mieux comprendre son effet à plusieurs échelles, de la population en regardant les différences inter-individuelles notamment liées aux différentes stratégies de dispersion, et à l’échelle des communautés et des métacommunautés en observant leurs compositions. Plusieurs approches sont utilisées : théorie, étude empirique et observations sur le terrain. La dispersion est un trait d’histoire de vie clé pour la survie dans un habitat fragmenté car elle permet le passage d’individus d’un fragment à un autre et la colonisation des fragments vides. Cependant, plusieurs forces ont des effets opposés sur le maintien des espèces dans un contexte de fragmentation de l’habitat. La fragmentation augmente les coûts liés à la dispersion dans un habitat défavorable, augmente l’hétérogénéité mais également la compétition entre apparentés. La fragmentation de l’habitat a un impact à l’échelle des communautés en faisant varier le nombre d’espèces ou la composition de celles-ci. Les fourmis sont de bons modèles d’études pour répondre aux problématiques de cette thèse car elles sont présentes dans de nombreux milieux contrastés et ont un fort polymorphisme de dispersion. Il existe des reines qui dispersent sur de longues distances en étant ailées et seules, ou des reines qui dispersent sur de plus courtes distances en étant aptères et accompagnées d’un groupe d’ouvrières. A l’échelle des populations, j’ai étudié la fourmi graminicole Myrmecina graminicola qui a l’intérêt d’utiliser les deux stratégies de dispersion. A l’échelle des communautés, je me suis intéressé aux espèces de fourmis des parcs parisiens, habitat très fragmenté, et des forêts proches de Paris, habitat peu fragmenté. Dans le premier chapitre, j’ai montré avec une approche théorique que la distance de dispersion augmente quand la fragmentation de l’habitat augmente dans un contexte de compromis compétition/colonisation. Cependant la structuration de l’habitat peut fortement affecter ces résultats avec une diminution de la dispersion quand l’habitat est agrégé. Dans un deuxième chapitre, j’ai mis en évidence l’existence de ce compromis compétition/colonisation chez M. graminicola et l’importance de la présence d’ouvrières lors de la fondation d’une nouvelle colonie, leur présence augmentant la survie et la croissance de la colonie. Dans un troisième chapitre, j’ai montré une diminution de la dispersion avec l’augmentation de la fragmentation de l’habitat en milieu urbain chez M. graminicola, suggérant que le coût à la dispersion en milieu urbain fortement fragmenté sélectionne contre la dispersion. Pour finir, j’ai observé une augmentation de la richesse spécifique, avec des communautés de fourmis très différentes, entre le milieu urbain et forestier et une baisse de la richesse spécifique avec la taille du parc en ville. Il n’y a pas d’effet de la fragmentation en forêt. Cette thèse montre la diversité des réponses à la fragmentation de l’habitat, que ce soit à l’échelle des populations et des communautés, et ouvre la voie à de nouvelles études
Évolution de la dispersion et structure des communautés de fourmis en réponse à la fragmentation de l'habitat
No full textHabitat fragmentation is one of the major threats to biodiversity. The main causes are due to human activity. It is produced by increased urbanisation, agriculture, deforestation, or transport infrastructure. Habitat fragmentation is characterised by a decrease in the amount of favourable habitat and by the isolation of this habitat. The objective of this thesis is to better understand its effect at several scales, from the population level by looking at inter-individual differences linked to different dispersal strategies, to the community and metacommunity level by observing their composition. Several approaches are used: theory, an empirical study and field observations. Dispersal is a key life-history trait for survival in a fragmented habitat as it allows the movement of individuals from one fragment to another and the colonisation of empty fragments. However, several forces have opposing effects on the maintenance of species in a fragmented habitat. Fragmentation increases the costs of dispersal in an unfavourable habitat, increases heterogeneity and competition between relatives. Habitat fragmentation has an impact at the community level by changing the number of species or the composition of communities. Ants are good models to study because they are present in many contrasting environments and have a strong dispersal polymorphism. There are winged queens that disperse alone over long distances, or apterous queens that disperse accompanied by a group of workers over shorter distances. At the population level, I studied the ant Myrmecina graminicola which advantageously uses both dispersal strategies. At the community level, I studied ant species in Parisian parks, a highly fragmented habitat, and in forests near Paris, a less fragmented habitat. In the first chapter, I showed with a theoretical approach that the dispersal distance increases when the habitat fragmentation increases in a context of competition/colonisation trade-off. Habitat structure can strongly affect these results with a decrease of the dispersal when the habitat is aggregated. In a second chapter, I highlighted the existence of this competition/colonisation trade-off in M. graminicola and the importance of the presence of workers during the foundation of a new colony, their presence increasing the survival and growth of the colony. In a third chapter, I showed a decrease in dispersal with increased habitat fragmentation in urban environments in M. graminicola, suggesting that the cost of dispersing in highly fragmented urban environments selects against dispersal. Finally, I observed an increase in species richness, with very different ant communities, between urban and forest environments and a decrease in species richness with increasing park size in the city. There is no effect of fragmentation in forests. This thesis shows the diversity of responses to habitat fragmentation, both at the population and community levels, and opens the way for further studies.La fragmentation de l’habitat est une des menaces majeures qui pèse sur la biodiversité. Les principales causes sont dues à l’activité humaine. Elle est produite par l’augmentation de l’urbanisation, de l’agriculture, de la déforestation ou des infrastructures de transport. La fragmentation de l’habitat est caractérisée par une diminution de la quantité d’habitat favorable et par un isolement de cet habitat. L’objectif de cette thèse est de mieux comprendre son effet à plusieurs échelles, de la population en regardant les différences inter-individuelles notamment liées aux différentes stratégies de dispersion, et à l’échelle des communautés et des métacommunautés en observant leurs compositions. Plusieurs approches sont utilisées : théorie, étude empirique et observations sur le terrain. La dispersion est un trait d’histoire de vie clé pour la survie dans un habitat fragmenté car elle permet le passage d’individus d’un fragment à un autre et la colonisation des fragments vides. Cependant, plusieurs forces ont des effets opposés sur le maintien des espèces dans un contexte de fragmentation de l’habitat. La fragmentation augmente les coûts liés à la dispersion dans un habitat défavorable, augmente l’hétérogénéité mais également la compétition entre apparentés. La fragmentation de l’habitat a un impact à l’échelle des communautés en faisant varier le nombre d’espèces ou la composition de celles-ci. Les fourmis sont de bons modèles d’études pour répondre aux problématiques de cette thèse car elles sont présentes dans de nombreux milieux contrastés et ont un fort polymorphisme de dispersion. Il existe des reines qui dispersent sur de longues distances en étant ailées et seules, ou des reines qui dispersent sur de plus courtes distances en étant aptères et accompagnées d’un groupe d’ouvrières. A l’échelle des populations, j’ai étudié la fourmi graminicole Myrmecina graminicola qui a l’intérêt d’utiliser les deux stratégies de dispersion. A l’échelle des communautés, je me suis intéressé aux espèces de fourmis des parcs parisiens, habitat très fragmenté, et des forêts proches de Paris, habitat peu fragmenté. Dans le premier chapitre, j’ai montré avec une approche théorique que la distance de dispersion augmente quand la fragmentation de l’habitat augmente dans un contexte de compromis compétition/colonisation. Cependant la structuration de l’habitat peut fortement affecter ces résultats avec une diminution de la dispersion quand l’habitat est agrégé. Dans un deuxième chapitre, j’ai mis en évidence l’existence de ce compromis compétition/colonisation chez M. graminicola et l’importance de la présence d’ouvrières lors de la fondation d’une nouvelle colonie, leur présence augmentant la survie et la croissance de la colonie. Dans un troisième chapitre, j’ai montré une diminution de la dispersion avec l’augmentation de la fragmentation de l’habitat en milieu urbain chez M. graminicola, suggérant que le coût à la dispersion en milieu urbain fortement fragmenté sélectionne contre la dispersion. Pour finir, j’ai observé une augmentation de la richesse spécifique, avec des communautés de fourmis très différentes, entre le milieu urbain et forestier et une baisse de la richesse spécifique avec la taille du parc en ville. Il n’y a pas d’effet de la fragmentation en forêt. Cette thèse montre la diversité des réponses à la fragmentation de l’habitat, que ce soit à l’échelle des populations et des communautés, et ouvre la voie à de nouvelles études
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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