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Supplementary_Tables_-_revision_final – Supplemental material for Incidence, Mortality, and Spatiotemporal Distribution of Cutaneous Malignant Melanoma Cases Across Canada
No full textSupplemental material, Supplementary_Tables_-_revision_final for Incidence, Mortality, and Spatiotemporal Distribution of Cutaneous Malignant Melanoma Cases Across Canada by Feras M. Ghazawi, Michelle Le, François Lagacé, Janelle Cyr, Nebras Alghazawi, Andrei Zubarev, Simon F. Roy, Elham Rahme, Elena Netchiporouk, Osama Roshdy, Steven J. Glassman, Denis Sasseville and Ivan V. Litvinov in Journal of Cutaneous Medicine and Surgery</p
Comparison of prior distributions for bayesian inference for small proportions
No full textOften, Bayesian analyses for epidemiological applications use objective prior distributions. These prior distributions are chosen with the goal of allowing the posterior distribution to be determined by the observed data alone. While this is achieved in most situations, it is not the case for Bayesian estimation of a small proportion. Such a situation might arise, for example, when estimating the prevalence of a rare disease. Several candidate objective prior distributions have been proposed for a Binomial proportion, including the Uniform distribution and Jeffrey's distribution. Each of these prior distributions may lead to very different posterior inferences when the number of events in the Binomial experiment is small, but it is unclear which of these would lead to better estimates on average. We explore this question by examining the frequentist performance of the posterior credible interval in two problems: i) estimating a single proportion, ii) estimating the difference between two proportions. The credible intervals obtained when using standard objective prior distributions as well as informative prior distributions motivated by real-life examples are compared. To assess frequentist performance, numerous statistics, including average coverage and average length of the posterior credible intervals were considered.Souvent des analyses bayésiennes de données épidémiologiques utilisent les distributions à priori objectives. Ces distributions à priori sont sélectionnées de sorte que les distributions à posteriori soient déterminées uniquement par les données observées. Bien que cette méthode soit efficace dans plusieurs situations, elle ne l'est pas dans le cas de l'estimation bayésienne de petites proportions. Cette situation peut survenir, par exemple lors de l'estimation de la prévalence d'une maladie rare. Plusieurs distributions à priori objectives ont été proposées pour l'estimation d'une proportion, telle que, par exemple la distribution uniforme de Jeffrey. Chacune de ces distributions à priori peut conduire à de différentes distributions à posteriori lorsque le nombre d'événements dans l'expérience binomiale est petit. Mais il n'est pas clair laquelle de ces distributions, en moyenne, donne de meilleurs estimés. Nous explorons cette question en examinant la performance fréquentiste des intervalles crédibles à posteriori obtenus, respectivement, avec chacune de ces distributions à priori. Pour évaluer cette performance, nous considèrons des statistiques comme la couverture moyenne et la longueur moyenne des intervalles crédibles à posteriori. Nous considérons aussi des distributions à priori plus informatives comme les distributions uniformes définies sur un sous-intervalle de l'intervalle [0, 1]. La performance des distributions à priori est évaluée en utilisant des données simulées de situations où l'intérêt de recherche est concentré sur l'estimation d'une seule proportion ou sur la différence entre deux proportions
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Estimating rheumatoid arthritis prevalence and care quality in a large sample from the Quebec population
No full textStudy # 1: A Bayesian approach was implemented to estimate rheumatoid arthritis (RA) prevalence, adjusted for misclassification, using three data sources (self-reported RA diagnoses, disease-modifying anti-rheumatic drug (DMARD) use, and RA physician billing codes) in Quebec, Canada. Our methods estimated RA prevalence in 2010 among adults aged 40- 69 to be 1.1% (95% credible interval: 0.9, 1.3%) combining all three ascertainment approaches, under the conditional independence assumption and using uninformative prior distributions. Gains in sensitivities were found when combining two or three methods. This is the first RA prevalence study to adjust for misclassification error inherent in each data source, when combing self-report and administrative data. The methods used respond to the needs of public health researchers working on surveillance of chronic diseases like RA. Study # 2: This study's specific objective is to calculate, using eleven different observation periods, unadjusted and adjusted RA prevalence estimates, as well as estimates of sensitivity and specificity of the Régie de l'assurance maladie du Québec (RAMQ) health services administrative databases ascertainment approach, using administrative data (alone or combined with self-report data). We studied CARTaGENE participants. RA prevalence estimates both unadjusted and adjusted for misclassification error were derived using Bayesian methods. The three-year 2010 prevalence estimate among adults aged 40 to 69 years old using the three ascertainment methods, assuming conditional dependence between self-report information, and adjusting for misclassification error in each method was 0.9% (95% CrI: 0.7, 1.2). Our results show variations in the prevalence point estimates related to the length of observation period within administrative data, the inclusion of self-reported information on RA, and adjustment for misclassification error in administrative data. There was negligible change in the sensitivity estimates for RA ascertainment using administrative data with more years of observation, but a noticeable increase in sensitivity when self-reported information on RA diagnosis and current disease-modifying anti-rheumatic drug use were added. Our study illustrates that, when using administrative data, RA point prevalence estimates are lower if few years of data are observed, and that multiple data sources can help capture more RA cases. Study # 3: The objectives of this study were to determine whether some quality indicators could be assessed from self-reported data using CARTaGENE linked with the Quebec health administrative databases administered by Régie de l'assurance maladie du Québec (RAMQ) administrative data. A cohort of RA patients was constructed. We assessed six QIs, four pertained to RA management and treatment received (use of DMARD therapy, annual medical visits, use of folate supplementation with methotrexate therapy, and use of calcium and vitamin D in steroid-exposed patients) and two pertained to lifestyle factors (physical activity and smoking cessation). QIs were reported in terms of proportion of patients fulfilling them. Bayesian logistic regression analyses were preformed to investigate potential variation with DMARD use which was our outcome of interest defined as a binary variable of current use/non-use. Our cohort included 142 RA patients. The QIs that pertain to RA pharmacotherapy and medical management (i.e. DMARDs, annual medical check-ups, folate, calcium and vitamin D) ranged from 60% to 80%. Regarding the QIs focusing on lifestyle factors, 55% patient reported performing moderate physical activity and only 16.6 % reported current smoking. Results from the Bayesian logistic regression showed no definite associations between DMARD use and patient characteristics (age, education, income, and sex). Our findings suggest a seemingly modest performance of Quebec's health care system for RA patients, with respect to these QIs.Étude # 1: Une analyse statistique bayésienne a été mise en œuvre pour estimer la prévalence de la polyarthrite rhumatoïde, ajustée pour la classification biaisée, en utilisant trois sources de données dont les diagnostics autodéclarés de polyarthrite rhumatoïde ainsi que l'utilisation de médicaments antirhumatismaux modificateurs de la maladie et finalement des codes de facturation des médecins au Québec. Nos méthodes ont estimé que la prévalence de la polyarthrite rhumatoïde en 2010 chez les adultes âgés de 40 à 69 ans était de 1.1% (intervalle crédible 95%: 0.9, 1.3%) combinant les trois approches de vérification, sous l'hypothèse d'indépendance conditionnelle et utilisant des distributions a priori non informatives. Des gains dans les sensibilités ont été observés en combinant deux ou trois méthodes. Il s'agit de la première étude de prévalence de la polyarthrite rhumatoïde à corriger les erreurs de classification inhérentes à chaque source de données, lors de la combinaison des données auto-déclarées et administratives. Étude # 2: L'objectif spécifique de cette étude est de calculer, en utilisant onze périodes d'observation, des estimations non ajustées et ajustées de la prévalence de la polyarthrite rhumatoïde, ainsi que des estimations de sensibilité et de spécificité de l'approche de calcul utilisant les données administratives de la Régie de l'assurance maladie du Québec seules ou combinées avec des données auto-déclarées. Nous avons étudié les participants à CARTAGÈNE. Les estimations de la prévalence de la polyarthrite rhumatoïde, non corrigées et corrigées pour les erreurs de classification, ont été calculées à l'aide de méthodes d'analyses bayésiennes. En utilisant trois méthodes de détermination ainsi qu'en supposant une dépendance conditionnelle entre les données autodéclarées et une erreur de classification pour chaque méthode, la prévalence sur trois ans chez les adultes âgés de 40 à 69 ans a été estimée à 0.9% (95% intervalle crédible: 0,7; 1.2%). Nos résultats montrent des variations dans les estimations de la prévalence liées aux trois facteurs. Les changements dans les estimations de sensibilité liées à la durée de la période d'observation dans les données administratives étaient négligeables, mais une augmentation notable a été observée dans la sensibilité lorsque des informations auto-déclarées ont été ajoutées. Étude # 3: Les objectifs de cette étude étaient de déterminer si certains indicateurs de qualité pouvaient être évalués à partir des données auto-déclarées de CARTAGÈNE. Une cohorte de patients atteints de polyarthrite rhumatoïde a été construite. Nous avons évalué six Indicateurs de qualité, dont quatre concernaient la prise en charge de la polyarthrite rhumatoïde et le traitement et deux ont trait à des facteurs liés au mode de vie. Les Indicateurs de qualité ont été rapportés en termes de proportion de patients les remplissant. Des analyses de régression logistique bayésienne ont été conduites d'abord pour étudier la variation potentielle de l'utilisation d'un agent antirhumatismal modificateur de la maladie qui était notre issue clinique d'intérêt représentée par une variable binaire (utilisation oui/non). Notre cohorte comprenait 142 patients atteints de polyarthrite rhumatoïde. Les Indicateurs de qualité se rapportant à la pharmacothérapie et à la prise en charge médicale de la polyarthrite rhumatoïde variaient de 60% à 80%. En ce qui concerne les indicateurs de qualité axés sur les facteurs liés au mode de vie, 55% des patients ont déclaré avoir fait de l'activité physique modérée et seulement 17% ont déclaré fumer présentement. Les résultats de la régression logistique bayésienne n'ont montré aucune association précise entre l'utilisation des antirhumatismaux modificateurs de la maladie et les caractéristiques des patients (âge, niveau de scolarité, revenu et sexe)
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Gestational diabetes as a diabetes risk factor for the child
No full textGestational diabetes (GDM) is associated with excess weight gain and insulin resistance in offspring. Less is known about the association between GDM and diabetes incidence in youth. While type 2 diabetes (T2D) is the subtype of diabetes most consistently associated with insulin resistance, there is evidence that among those at risk immunologically for type 1 diabetes (T1D), insulin resistance may accelerate or precipitate its manifestation. This MSc Project examined the association between maternal GDM and overall diabetes incidence in adolescents and young adults. A retrospective cohort study was undertaken using both health administrative databases and birth and death registry data from the province of Quebec. Cohort inception was from April 1, 1990 to December 31, 1998, and follow-up from age 12 years to March 31, 2012, the developmental period when insulin resistance typically emerges. Randomly-selected singleton live births between April 1, 1990 and December 31, 1998 complicated by GDM were eligible for inclusion. These were 1:1 matched to those without GDM (i.e., matching by year of delivery, mother's age-group, and health region).The primary exposure was GDM in mothers, defined as one hospital discharge diagnosis and/or two outpatient physician claims for GDM within 6 months of delivery. The primary outcome was incident diabetes in youth, defined as one hospital discharge diagnosis and/or two outpatient visit diagnoses within a 2-year time period. The relationship between GDM status and diabetes in offspring was evaluated through survival analysis (Cox proportional hazard models).A total of 36,762 children were studied (mean birth weight 3,364g (SD 582g) with maternal GDM; 3,342g (SD 556g) without GDM in mothers). In total, 147 children were diagnosed with diabetes between 12 years of age and 2012 (maximum age 22 years).Diabetes incidence in offspring of mothers with GDM was more than twice as high as diabetes incidence in offspring of mothers without GDM, in both unadjusted (HR 2.25, 95% CI 1.56, 3.25) and adjusted models (HR 2.12, 95% CI 1.41, 3.17; with adjustment for sex, gestational age, birth weight, maternal education, ethnocultural origin, maternal age, maternal history of previous pregnancy, and stillbirth) This work conclusively demonstrates that GDM in mothers is associated with diabetes in youth. T1D and T2D cannot be distinguished in health administrative databases in Quebec. Given that T1D represents approximately 90% of diabetes cases in youth, our findings indirectly support the accelerator hypothesis (i.e., T1D develops earlier in a context of insulin resistance). The association between GDM and T2D in youth may be underestimated. In light of its strong association with diabetes in youth and young adulthood, maternal GDM may thus serve as an indicator to guide future strategies aimed at diabetes prevention and early disease detection.Le diabète gestationnel (DG) est associé avec la prise du poids et la résistance à l'insuline chez les progénitures. L'association entre le DG et l'incidence du diabète chez les jeunes est quant à elle moins connue. Tandis que le diabète type 2 (DB2) est le sous-type du diabète le plus régulièrement associé avec la résistance à l'insuline, des preuves démontrent que la résistance à l'insuline peut accélérer ou même précipiter le risque immunologique pour le diabète type 1 (DB1). L'objectif de ce mémoire fut d'examiner l'association entre le DG maternel et l'incidence globale du diabète (DB1 et DB2) chez les adolescents et les jeunes adultes. Une étude de cohorte rétrospective a été réalisée en utilisant à la fois les bases de données médico-administratives et les registres de naissances et décès de la province du Québec. Le début de la cohorte était du 1er avril 1990 au 31 décembre 1998, et l'âge du suivi était de 12 ans au 31 mars 2012, soit la période du développement où la résistance à l'insuline se manifeste typiquement. Des naissances simples sélectionnées aléatoirement entre le 1er avril 1990 et le 31 décembre 1998 compliquées par le DG étaient éligibles à être inclus. Elles étaient appariées selon un rapport 1:1 avec des naissances sans DG (c.-à-d., appariement par l'année de l'accouchement, groupe d'âge des mères et région de santé). L'exposition primaire était le DG chez les mères, défini par un diagnostic-congé et/ou deux réclamations médicales pour le DG à moins de 6 mois après l'accouchement. Le résultat principal était le diabète incident chez les jeunes, défini par un diagnostic-congé et/ou deux visites externes pendant une période de 2 ans. L'association entre le DG et le diabète chez les progénitures a été évaluée par une analyse de survie (modèles des risques proportionnels de Cox). Trente-six mille sept cent soixante-deux enfants ont été évalués (poids moyen à la naissance 3 364g (DS 582g) avec DG maternel, 3 342g (DS 556g) sans DG maternel). En total, 147 enfants ont été diagnostiqués avec le diabète entre l'âge de 12 ans et 2012 (l'âge maximum de 22 ans). L'incidence de diabète chez les progénitures des mères avec le DG était plus que deux fois plus élevée que chez les progénitures des mères sans DG, dans les modelés non-ajustes (IR 2.25, IC 95% 1.56, 3.25) et ajustés (IR 2.12, IC 95% 1.41, 3.17; ajustements pour sexe, âge gestationnel, poids à la naissance, éducation maternelle, origine ethnoculturelle de l'enfant, âge maternel, grossesse antérieure et antécédent de mort-né chez la mère). Cette étude montre d'une manière conclusive que le DG maternel est associé avec le diabète chez les jeunes. On ne peut distinguer le DB1 et le DB2 dans les bases de données administratives québécoises. Étant donné que le DB1 représente environ 90% du diabète chez les jeunes, nos résultats appuient indirectement l'hypothèse d'accélérateur du diabète (c.-à-d., le DB1 se développe plus tôt dans le contexte de la résistance à l'insuline). L'association entre le DG maternel et le DB2 chez les jeunes est possiblement sous-estimée. En tenant compte de l'association forte entre le DG maternel et le diabète chez les jeunes, le DG peut ainsi servir d'indicateur pour guider futures stratégies visant à la prévention du diabète et la détection précoce de cette maladie
Conjoint associations of gestational diabetes, and hypertension with diabetes, hypertension, and cardiovascular disease in parents
No full textDiabetes, hypertension and cardiovascular disease (CVD) are leading non-communicable causes of morbidity and mortality worldwide in both women and men. Early preventative strategies targeting lifestyle behaviors can reduce an individual's risk of developing these diseases. In women, pregnancy offers an opportunity to assess cardiometabolic responses and identify those at high risk of post-partum disease based on the occurrence of gestational diabetes (GDM) and/or gestational hypertension (GH) during pregnancy. Despite the rising prevalence of GDM and GH and their demonstrated individual effects, their conjoint effects have not been well studied. This thesis aims to evaluate the relationship of GDM/GH to diabetes, hypertension, and CVD in mothers. Given shared couple behaviours, this thesis also examines these associations in fathers. The main study presented uses a large merged data set that includes health administrative, birth registry, and death registry data on 40,000 triads (mother-father-offspring) with GDM matched to triads without GDM on maternal age, year of delivery and health region. Couples with a history of diabetes, hypertension or CVD were excluded along with their matched triad. Subsequently, mothers were categorized as 'neither' (no GDM and no GH), 'either' (GDM or GH) and 'both' (GDM and GH). Cox regression analysis was then performed to evaluate associations of these categories with diabetes, hypertension, and a composite of CVD and mortality in mothers and in fathers. Graded increased risks across GDM/GH categories were identified for all outcomes in mothers. Smaller but parallel increases operated across these exposure categories for diabetes risk in fathers. These findings signal a need for prevention and surveillance of cardiometabolic disease in both mothers and fathers, particularly those with concurrent GDM and GH during pregnancy in mothers.Le diabète, l'hypertension et les maladies cardiovasculaires (MCV) sont des causes importantes de morbidité et mortalité dans le monde, tant chez l'homme que chez la femme. Des stratégies de prévention ciblant la modification des habitudes de vie peuvent réduire le risque de développer ces maladies. La grossesse devrait saisie comme une opportunité d'évaluer les réponses cardio-métaboliques, ainsi que d'identifier celles ayant un risque élevé de maladie cardiovasculaire, notamment, celles ayant eu du diabète gestationnel (DG) et / ou de l'hypertension gestationnelle (HTAG). Malgré leur prévalence croissante, ainsi que leurs conséquences bien connues, leurs effets combinés n'ont pas été bien étudiés. Cette thèse vise à évaluer la relation entre le DG / l'HTAG avec le diabète, l'hypertension et les MCV chez les mères. Compte tenu que les habitudes de vie et comportements sont souvent similaires au sein du couple, cette thèse examine également ces relations chez le père. L'étude principale utilise un grand ensemble de données fusionnées comprenant des données administratives de santé, registres des naissances et de décès sur 40 000 triades (mère-père-enfant) avec DG jumelé à l'âge maternel, l'année de naissance et la région ou les services de santé ont été administrés, à triades sans DG. Les couples ayant des antécédents de diabète, d'hypertension ou de MCV ont été exclus avec leur triade jumelée. Par la suite, les mères ont été réparties dans trois catégories distinctes : «aucun» (pas de DG ni d'HTAG), «l'un ou l'autre » (DG ou HTAG) ou « les deux » (DG et HTAG). Les analyses de régression de Cox ont ensuite été effectuées pour évaluer les associations entre ces catégories avec le diabète, l'hypertension et un composite de MCV et de mortalité chez les mères et chez les pères. Les risques les plus élevés ont été observés dans la catégorie ou les mères font de l'HTAG et le DG. Chez les pères atteint de diabète, des augmentations plus petites, ont été notées dans toutes ces catégories d'exposition. Ces résultats indiquent un besoin de prévention et de surveillance de la maladie cardiovasculaire chez les couples, en particulier ceux dont la femme a été atteint de DG et d'HTAG
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