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Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
L'analyse du métabolisme des muscles squelettiques est crucial pour la conception d'exercices de précision dans le diabète de type 2 : les leçons tirées de modèles souris de fond génétique, de sexe et d'étiologie différents
No full textLe diabète de type 2 (T2DM) est une maladie métabolique chronique dont l'incidence ne cesse d'augmenter dans le monde et qui est impliquée, en tant que facteur de comorbidité, dans de nombreuses maladies. Le T2DM est généralement associé à une alimentation riche en calories et à un mode de vie sédentaire, ce qui entraîne une résistance à l'insuline et une perturbation de l'homéostasie du glucose. Le régime alimentaire et l'activité physique sont recommandés comme traitement de première intention chez les adultes atteints de T2DM, mais les résultats de ce traitement sont contrastés. Un aspect important qui pourrait influencer la réponse des patients aux programmes d'exercice est le statut métabolique des muscles. En effet, le muscle est impliqué de manière cruciale dans la modulation du métabolisme systémique et reste le principal consommateur de substrats énergétiques pendant l'exercice. Dans cette étude, nous avons déterminé la signature métabolique du muscle squelettique du quadriceps dans plusieurs modèles de souris qui diffèrent en terme de fond génétique, sexe et d'étiologie dans lesquels le diabète a été induit à l'âge adulte. Sur la base des caractéristiques systémiques du diabète, telles que la composition corporelle, le poids et la glycémie à jeun, nous avons sélectionné des modèles de souris reflétant l'hétérogénéité de la maladie humaine, y compris le statut d'obésité. Nous avons ensuite mené une étude métabolomique non biaisée par RMN dans le muscle rapide quadriceps, et comparé par RT-qPCR les profils d'expression d'une batterie de gènes impliqués dans les voies métaboliques des glucides, lipides et protéines. Nous avons constaté que, selon le contexte génétique, le sexe et le mode d'induction du diabète, des adaptations musculaires spécifiques se produisaient, notamment une inhibition de la glycolyse associée à une expression élevée de PDK4, un shift vers la betta-oxydation et une dérégulation de l'homéostasie des acides aminés. Nous avons ensuite sélectionné des modèles de souris représentatifs de chacune de ces signatures métaboliques musculaires et les avons soumis à trois programmes d'exercice différents, basés sur de la nage, visant soit à restaurer l'expression de PDK4, soit à inverser le shift vers la''-oxydation, soit à favoriser la '-oxydation Nous avons constaté que les exercices dédiés étaient dans tous les cas optimaux pour améliorer les caractéristiques du T2DM, et induisent une réduction significative de la résistance à l'insuline, une amélioration de l'homéostasie du glucose, le tout associé à un retard des altérations des fonctions sensorimotrices des souris. L'ensemble de ces résultats suggère que le métabolisme musculaire est une caractéristique importante du phénotype diabétique, qui devrait être pris en compte pour la conception d'exercices personnalisés pour la réhabilitation des patients.Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a chronic metabolic disease whose incidence constantly increases worldwide and which is involved, as a co-morbidity factor, in many diseases. T2DM is commonly associated to high-calorie diet and sedentary lifestyle, leading to insulin resistance and perturbation in glucose homeostasis. Diet regimen and physical activity are recommended as first-line treatment in T2DM adults, but lead to contrasting results. An important aspect that could influence patient response to exercise programs, is the muscle metabolic status. Muscle is indeed crucially involved in the modulation of whole-body metabolism and remains the principal consumer of substrates during exercise. In the present study, we drew the metabolic signature of the quadriceps skeletal muscle in several mouse models of different genetic background, gender and etiology in which diabetes was induced at the adult age. Based on systemic T2DM hallmarks, including changes in body composition, body weight, and non-fasting glycaemia, we selected mouse models reflecting the human disease heterogeneity, including the obesity status. We then conducted an unbiased NMR metabolomic study in the fast-twitch quadriceps of the selected mouse models, and compared by RT-qPCR the expression pattern of a battery of genes involved in carbohydrate, lipid and protein metabolic pathways. We found that, depending on the genetic background, the gender and the mode of TD2M induction, specific muscular adaptations occurred, including depressed glycolysis associated to elevated PDK4 expression, shift to '-oxidation and deregulation of amino-acid homeostasis. We then selected mouse models that are representative of each specific muscular metabolic signatures, and submitted them to three different swimming-based programs, aimed at either restoring PDK4 expression, reversing the shift to '-oxidation, or favoring betta-oxidation. We found that the dedicated exercises were in all cases optimal in improving T2DM hallmarks, notably the insulin resistance, the glucose homeostasis, leading to a delay in sensorimotor function alterations. Thus, we suggest here that the basal muscular metabolism is an important clue to characterize diabetic phenotype and should be considered for the design of personalized exercise for patients
Prédire la vulnérabilité induite par le stress à la dépression chez les diabétiques
No full textL'état de stress post-traumatique (PTSD), un trouble psychiatrique étendu, se déclenche suite à l'exposition à des événements potentiellement mortels tels que la guerre, la torture et l'exploitation. En absence de traitement, le PTSD est bien décrit comme facteur induisant un trouble dépressif majeur et une démence chez les patients. De la même manière, les études confirment que le diabète de type 2 (T2DM) peut endommager le système nerveux central, conduisant simultanément à la dépression et à des dysfonctionnements cognitifs. Cependant, les facteurs contributifs ainsi que les mécanismes moléculaires impliqués dans leurs pathogenèses restent non caractérisés. Dans notre intérêt, des analyses récentes de données cliniques indiquent que les patients diabétiques provenant de régions touchées par la guerre ont une prévalence plus élevée de dépression et de déclin cognitif, mais les éventuels facteurs prédisposants restent inconnus. Dans cet esprit, la connaissance des facteurs de risque contribuant à la susceptibilité au stress et des mécanismes par lesquels ils agissent dans le développement ultérieur de la dépression est cruciale. Par conséquent, l'étude suivante vise à étudier l'impact des traumatismes liés à la guerre en tant que facteur de risque dans la médiation des complications cérébrales induites par le T2DM plus tard dans la vie, et à évaluer les voies mécanistiques qui pourraient être impliquées. Les données obtenues dans notre étude révèlent un modèle de stress à double impact par lequel un premier impact de stress psychosocial agit comme un déclencheur de mécanismes pathologiques qui laissent les individus prédisposés à un risque accru de développer un déclin émotionnel et cognitif avec le diabète rencontré plus tard dans la vie. En effet, nos résultats mettent en évidence l'impact négatif du stress précoce dans l'aggravation des complications cérébrales associées au diabète. Notre étude montre également que cette vulnérabilité prédisposée est médiée par l'inactivation de l'AMPK cérébrale qui conduit ensuite à une activité excessive de la NADPH oxydase et à la production connexe de stress oxydatif, à une diminution de la réponse antioxydante dépendante de Nrf2 ainsi qu'à une diminution de l'activité des astrocytes. En parallèles, nous avons également mis en avance les effets neuro-protecteurs de la restauration de l'activation cérébrale de l'AMPK grâce au traitement à la metformine et à un exercice de résistance sur échelle nouvellement conçu comme thérapies potentielles pour atténuer les troubles du comportement associés au stress et au T2DM. D'un point de vue fondamental, notre projet actuel permet l'identification probable de nouveaux mécanismes moléculaires impliqués dans la vulnérabilité du cerveau, et d'un point de vue clinique, il offre une fenêtre pour réorienter des thérapies sûres et efficaces pour prévenir ou inverser la progression des dysfonctionnements émotionnels et cognitifs chez les personnes vulnérables, ainsi que les patients diabétiques prédisposés.Post-traumatic stress disorder (PTSD), an extended psychiatric disorder, arises from experiencing or witnessing life threatening events such as warfare, torture, and exploitation. If left untreated, PTSD is well described to increase the risk for the occurrence of major depression disorder and dementia in patients. In a similar manner, recent evidence from our team and others confirms that type 2 diabetes (T2DM) can damage central nervous system precipitating concurrently depression and cognitive dysfunctions. To our interest, recent analyses of clinical data indicate that diabetic patients coming from conflict regions of the world have higher prevalence of depression and cognitive decline, suggesting a possible crosstalk between social stress and diabetes onset and development. However, the possible predisposing factors remain unknown. In this spirit, knowledge of the risk factors contributing to susceptibility to stress and of the mechanisms by which they act in the subsequent development of depression is crucial. Therefore, the following study aims to investigate the impact of traumatic incidents serve as a risk factor in mediating T2DM induced brain complications later in life, and to assess the mechanistic pathways that could be involved. The data obtained during my PhD research work uncovers a double hit model of stress by which a first hit of psychosocial stress act as a trigger for pathological mechanisms that leave predisposed individuals at increased risk of developing emotional and cognitive decline with diabetes encountered later in life. Indeed, our findings shed the light on the negative impact of early life stress in aggravating diabetes associated brain complications. Our study also shows that this predisposed vulnerability is mediated through brain 5' adenosine monophosphate-activated protein kinase (AMPK) inactivation which subsequently leads to excessive nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH) oxidase activity and related production of ROS, diminished Nrf2 dependent antioxidant response as well as decreased activity of astrocytes. In parallel experiments, we also put forward the neuroprotective effects of restoring brain AMPK activation through Metformin treatment and a newly designed ladder climbing resistance exercise as potential therapies for alleviating behavioral disorders associated with social stress and T2DM. From a fundamental perspective, our present project allows the identification of novel molecular mechanisms involved in brain vulnerability, and from the clinical angle, it offers a window for repurposing safe and effective therapeutics to prevent or reverse the progression of emotional and cognitive dysfunctions in vulnerable individuals as well as predisposed diabetic patients
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Mécanismes des lésions nerveuses périphériques lors du développement du diabète : rôle de la voie cytochrome P450
No full textLe diabète est un problème de santé majeur en raison du spectre des troubles métaboliques associés à son apparition. Plus important encore, il s'agit d'une maladie potentiellement mortelle en raison des complications complexes de plusieurs organes. Parmi les complications microvasculaires associées au diabète, la neuropathie diabétique (DN) est l'une des plus rapportées touchant 50% à 70% des sujets diabétiques. La neuropathie diabétique périphérique (DPN) est caractérisée par un dysfonctionnement des nerfs périphériques. Cliniquement, la DPN est caractérisée par une réduction des enregistrements électrophysiologiques, une perte sensori-motrice et une paresthésie. Les travaux de recherche ont corrélé ces observations avec des lésions des fibres nerveuses conduisant à une dégénérescence, une atrophie axonale, une démyélinisation avec un potentiel de régénération limité. Le stress oxydatif est maintenant considéré comme le médiateur clé commun final, et la surproduction des dérivés actifs de l'oxygène (ROS) a été suggérée pour orchestrer les complications diabétiques, y compris la DPN. Cependant, les mécanismes cellulaires et moléculaires par lesquels le diabète contribue au stress oxydatif dans la DPN restent inconnus. De plus, la thérapie antioxydante non ciblée n'a montré qu'une efficacité limitée. Par conséquent, il existe un besoin critique d'explorer des sources spécifiques de ROS qui sont modifiées d'une manière spécifique à la cellule au cours de la DPN afin que des thérapies ciblées puissent être développées. Une source majeure est la famille d'enzymes Cytochromes P450 (CYP). Il a été démontré que les enzymes CYP interviennent dans d'autres complications diabétiques. Pourtant, aucune étude n'a étudié leur rôle dans la DPN. Ce travail étudie deux branches importantes de la famille, 20-HETE produisant des ω-hydroxylases et EET produisant des époxygénases. Respectivement, nous examinons le rôle de CYP4A et CYP2C dans les cellules de Schwann (SC) de DPN et les nerfs sciatiques extraits d'un nouveau modèle de souris de diabète sucré de type 2 (MKR). Les données révèlent que l'altération des protéines CYP et des métabolites entraîne un état de stress oxydatif qui était corrélé à l'apoptose des SC, à des défauts de flux autophagique, à des profils de protéines de myéline perturbés et à des déficits comportementaux chez les animaux diabétiques. Les effets de l'hyperglycémie et de la perturbation homéostatique des CYP ont été étudiés de plus afin d'identifier les altérations des voies de signalisation AKT et AMPK qui sont essentielles pour la fonction nerveuse périphérique, la myélinisation des SC et la survie. Nous avons donc émis l'hypothèse que l'interception pharmacologique des axes CYP4A / 20-HETE ou CYP2C / EET pourrait être une stratégie thérapeutique prometteuse pour arrêter la progression de la DPN.Diabetes is a leading health concern due to the spectrum of metabolic disorders associated with its onset. More importantly, it is a life-threatening disease owing to the complex multiorgan complications. Among the microvascular complications associated with diabetes, diabetic neuropathy (DN) is one of most reported affecting 50% - 70% of diabetic subjects. Diabetic Peripheral Neuropathy (DPN) is characterized by peripheral nerve dysfunction. Clinically, DPN is characterized by reduced electrophysiological recordings, sensorimotor loss, and paresthesia. Research has correlated these observations with nerve fiber injury leading to degeneration, axonal atrophy, demyelination with limited regenerative potential. Oxidative stress is now considered the final common key mediator, and the overproduction of Reactive Oxygen Species (ROS) has been suggested to orchestrate diabetic complications including DPN. However, the cellular and molecular mechanisms by which diabetes contributes to oxidative stress in DPN remain unknown. Moreover, untargeted antioxidant therapy has only exhibited limited efficacy. Therefore, there is a critical need to explore specific sources of ROS that are altered in a cell-specific manner during the course of DPN so that targeted therapies can be developed. One major source is the Cytochromes P450 (CYP) family of enzymes. CYPs enzymes are shown to mediate other diabetic complications. Yet, no studies have investigated their role in DPN. This work investigates two important arms of the family, 20-HETE producing ω-hydroxylases and EET producing epoxygenases. Respectively, we examine the role of CYP4A and CYP2C in DPN in Schwann cells (SCs) and sciatic nerves from a new murine model of Type 2 Diabetes Mellitus (MKR). The data reveal that CYP protein and metabolite alteration results in a state of oxidative stress which was correlated with SC apoptosis, autophagic flux defects, disrupted myelin protein profiles, and behavioral deficits in diabetic animals. The effects of hyperglycemia and CYPs homeostatic disruption were further investigated to identify alterations in AKT and AMPK signaling pathways which are essential for peripheral nerve function and SC myelination and survival. We hypothesized that the pharmacological interception of either CYP4A/20-HETE or CYP2C/EET axes may be promising therapeutic strategy to halt the progression of DPN
Diabetes and colorectal cancer : epidemiological and physiopathological studies
No full textLe diabète est une dérégulation systémique chronique caractérisée par des perturbations métaboliques permanentes à l’origine de nombreuses complications, y compris le cancer. Le diabète augmente le risque du cancer colorectal (CRC) de 1,2 à 1,5 fois. Cependant, les voies moléculaires et cellulaires en jeu ne sont pas assez élucidées. Nos résultats témoignent d’une dérégulation de la voie AMPK/mTORC1 dans le diabète et le CRC avec une surexpression de la NADPH oxydase Nox4, augmentant ainsi la production de ROS. Ceci provoque un stress oxydatif qui s’élève en cas de diabète et contribue à la progression du CRC. De plus, nos résultats montrent que ce stress induit une altération de la voie de signalisation AMPK/mTORC1, aboutissant à une agressivité accrue du comportement des cellules cancéreuses du côlon et de la formation de polypes. Notre projet permet, d’une part, d’identifier de nouveaux mécanismes moléculaires impliqués dans la progression du CRC induite par le diabète et d’autre part, de développer des stratégies thérapeutiques efficaces pour inverser la progression du CRC chez les patients diabétiques.Diabetes is a chronic systemic malfunction characterized by persistent metabolic disturbances that culminate in a high rate of complications to which cancer was recently annexed. In fact, diabetes inflates colorectal cancer (CRC) risk by 1.2-1.5 folds. However, the cellular and molecular pathways involved are not well understood. Our results show that AMPK/mTORC1 pathway is deregulated in both diabetes and CRC. This was paralleled by an elevation in the expression of the NADPH oxidase Nox4 leading to an increase in ROS production. Furthermore, our results show that oxidative stress, secondary to alteration in the level and activity of Nox4 is augmented in diabetes and contributes to the progression of CRC. The resulting oxidative stress further led to an alteration in the signaling of the AMPK/mTORC1 pathways culminating in an exacerbated aggressiveness in cancer cell behavior and colon polyp formation. Our project allows the identification of novel molecular mechanisms involved in diabetes-induced CRC progression and development of effective therapeutic strategies to reverse the progression of CRC in diabetic patients
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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