1,720,963 research outputs found
Étude des interactions entre le catabolisme de la proline et le métabolisme de l'azote dans le développement de la graine chez Arabidopsis thaliana
No full textProline is a proteinogenic amino acid with numerous functions in plants especially in stress adaptations and development. Its metabolism is now well described but some of its physiological roles remained enigmatic. Synthesized in the cytosol from glutamate, proline is catabolized in the mitochondrion by the sequential action of two enzymes: proline dehydrogenase (ProDH) and Pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase (P5CDH). Preliminary experiments showed weak germination rates for p5cdh mutants and weak nitrogen remobilization rate during senescence. The objectives of this thesis were to charaterize this remobilization defect and its impact on seed development. We have shown that p5cdh mutant presented a remobilization defect for nitrogen and carbon, especially when plants were grown under non limiting concentration of nitrates. Seeds produced by this mutant are out of shape and lighter. Imagery analysis have shown that embryo development of p5cdh mutant is blocked at the transition between embryogenesis and maturation phase when it is grown under high concentrations of nitrates. Embryo is blocked in its develoment in torpedo stage et is surrounded by endosperm. During the dehydration phase, embryo dies. In order to identify the role of P5CDH in seed development, developmental, metabolomics and proteomics studies were performed on maturing and dehydrating seeds. These studies have shown that during seed development, the first sign of disturbance in p5cdh mutant is visible at the beginning of the maturation phase with a weak and shorter greening phase compared to the wild-type. It is followed by a limited lipids accumulation and storage proteins. But an important accumulation of free proline were measured. These studies have also revealed an accumulation of free amino acids in p5cdh mutant's seeds and a marked disturbance of carbon metabolism. Numerous markers of anaerobic energy metabolism are induced probably linked to the loss of photosynthetic capacities of the embryo. The lower content in HSP and LEA proteins and in non-reducting sugars in p5cdh mutant reinforce the idea that the seed is not prepared to be dehydrated. Since the processes of maturation and dehydration are strongly energy demanding processes, the arrest of seed development in p5cdh mutant could be linked to a lack of energy. This lack of energy seems affect also the development of the male gametophyte since 50% of p5cdh pollen grain die during its maturation. This study shows that proline catabolism is essential to seed and pollen development, especially after the embryogenesis by provinding reduced power and ATP. It confirms the numerous hypothesis about the importance of proline and its catabolism in energy production during growth recovery after a stress but also in fast growth organs like pollen tube, root tip or cancer cells in animal models.La proline est un acide aminé protéinogène qui a aussi de nombreuses fonctions à l’état libre chez les plantes notamment dans leur adaptation aux stress et leur développement. Son métabolisme est bien décrit à ce jour mais certains de ses rôles physiologiques restent encore énigmatiques. Synthétisée dans le cytosol à partir de glutamate, la proline est catabolisée dans la mitochondrie par l’action séquentielle de deux enzymes : la proline déshydrogénase (ProDH) et la pyrroline-5-carboxylate déshydrogénase (P5CDH). Des expériences préliminaires ont montré un très faible taux de germination des graines du mutant p5cdh ainsi qu’une faible remobilisation de l’azote au cours de la senescence. Les objectifs de cette thèse étaient de caractériser ce défaut de remobilisation de l’azote ainsi que son impact sur le développement de la graine. Nous avons pu montrer que le mutant p5cdh présentait un défaut de remobilisation de l’azote mais aussi du carbone, notamment lorsqu’il était cultivé avec un apport non limitant en azote. Les graines produites par ce mutant sont déformées et plus légères. Des analyses en imagerie ont montré que le développement embryonnaire du mutant p5cdh est bloqué à la transition entre les phases d’embryogenèse et de maturation lorsqu’il est exposé à de fortes concentrations en nitrates. L’embryon est alors bloqué dans son développement au stade torpille et est entouré d’albumen. Lors de la phase de déshydratation de la graine, l’embryon meurt. Afin d’identifier le rôle de P5CDH dans le développement de la graine, des études développementales, métabolomiques et protéomiques ont été entreprises sur des graines en cours de maturation et de déshydratation. Ces études ont montré qu’au cours du développement de la graine, le premier signe de perturbation chez le mutant p5cdh se manifeste au début de la phase de maturation par une phase de verdissement peu marquée et plus courte que chez le sauvage, suivie une accumulation limitée de lipides et de protéines de réserve. En revanche une accumulation très importante de proline est mesurée. Ces études ont également révélé dans les graines du mutant p5cdh une accumulation d’acides aminés libres ainsi qu’une perturbation marquée du métabolisme carboné. De nombreux marqueurs du métabolisme énergétique anaérobie sont induits probablement liés à la perte des capacités photosynthétiques de l’embryon. La teneur réduite en protéines HSP et LEA ainsi que de plusieurs sucres non-réducteurs chez le mutant p5cdh renforce le fait que la graine n’est pas préparée à cette phase de déshydratation. Les processus de maturation et de déshydratation étant fortement métaboliquement énergivores, l’arrêt du développement de la graine du mutant p5cdh pourrait être lié à une insuffisance énergétique. Ce déficit énergétique semble également toucher également le développement du gamétophyte mâle, puisque 50% des grains de pollen p5cdh meurent lors de leur maturation. Cette étude montre que le catabolisme de la proline est essentiel au développement de la graine et du pollen, notamment après la phase d’embryogénèse, en fournissant du pouvoir réducteur et de l’ATP. Elle vient confirmer de nombreuses hypothèses quant à l’importance de la proline et de son catabolisme pour la production d’énergie notamment lors de la reprise de la croissance après un stress mais également dans les organes à croissance rapide tels quel le tube pollinique, les pointes racinaires ou les cellules cancéreuses chez les modèles animaux
Étude des interactions entre le catabolisme de la proline et le métabolisme de l'azote dans le développement de la graine chez Arabidopsis thaliana
No full textProline is a proteinogenic amino acid with numerous functions in plants especially in stress adaptations and development. Its metabolism is now well described but some of its physiological roles remained enigmatic. Synthesized in the cytosol from glutamate, proline is catabolized in the mitochondrion by the sequential action of two enzymes: proline dehydrogenase (ProDH) and Pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase (P5CDH). Preliminary experiments showed weak germination rates for p5cdh mutants and weak nitrogen remobilization rate during senescence. The objectives of this thesis were to charaterize this remobilization defect and its impact on seed development. We have shown that p5cdh mutant presented a remobilization defect for nitrogen and carbon, especially when plants were grown under non limiting concentration of nitrates. Seeds produced by this mutant are out of shape and lighter. Imagery analysis have shown that embryo development of p5cdh mutant is blocked at the transition between embryogenesis and maturation phase when it is grown under high concentrations of nitrates. Embryo is blocked in its develoment in torpedo stage et is surrounded by endosperm. During the dehydration phase, embryo dies. In order to identify the role of P5CDH in seed development, developmental, metabolomics and proteomics studies were performed on maturing and dehydrating seeds. These studies have shown that during seed development, the first sign of disturbance in p5cdh mutant is visible at the beginning of the maturation phase with a weak and shorter greening phase compared to the wild-type. It is followed by a limited lipids accumulation and storage proteins. But an important accumulation of free proline were measured. These studies have also revealed an accumulation of free amino acids in p5cdh mutant's seeds and a marked disturbance of carbon metabolism. Numerous markers of anaerobic energy metabolism are induced probably linked to the loss of photosynthetic capacities of the embryo. The lower content in HSP and LEA proteins and in non-reducting sugars in p5cdh mutant reinforce the idea that the seed is not prepared to be dehydrated. Since the processes of maturation and dehydration are strongly energy demanding processes, the arrest of seed development in p5cdh mutant could be linked to a lack of energy. This lack of energy seems affect also the development of the male gametophyte since 50% of p5cdh pollen grain die during its maturation. This study shows that proline catabolism is essential to seed and pollen development, especially after the embryogenesis by provinding reduced power and ATP. It confirms the numerous hypothesis about the importance of proline and its catabolism in energy production during growth recovery after a stress but also in fast growth organs like pollen tube, root tip or cancer cells in animal models.La proline est un acide aminé protéinogène qui a aussi de nombreuses fonctions à l’état libre chez les plantes notamment dans leur adaptation aux stress et leur développement. Son métabolisme est bien décrit à ce jour mais certains de ses rôles physiologiques restent encore énigmatiques. Synthétisée dans le cytosol à partir de glutamate, la proline est catabolisée dans la mitochondrie par l’action séquentielle de deux enzymes : la proline déshydrogénase (ProDH) et la pyrroline-5-carboxylate déshydrogénase (P5CDH). Des expériences préliminaires ont montré un très faible taux de germination des graines du mutant p5cdh ainsi qu’une faible remobilisation de l’azote au cours de la senescence. Les objectifs de cette thèse étaient de caractériser ce défaut de remobilisation de l’azote ainsi que son impact sur le développement de la graine. Nous avons pu montrer que le mutant p5cdh présentait un défaut de remobilisation de l’azote mais aussi du carbone, notamment lorsqu’il était cultivé avec un apport non limitant en azote. Les graines produites par ce mutant sont déformées et plus légères. Des analyses en imagerie ont montré que le développement embryonnaire du mutant p5cdh est bloqué à la transition entre les phases d’embryogenèse et de maturation lorsqu’il est exposé à de fortes concentrations en nitrates. L’embryon est alors bloqué dans son développement au stade torpille et est entouré d’albumen. Lors de la phase de déshydratation de la graine, l’embryon meurt. Afin d’identifier le rôle de P5CDH dans le développement de la graine, des études développementales, métabolomiques et protéomiques ont été entreprises sur des graines en cours de maturation et de déshydratation. Ces études ont montré qu’au cours du développement de la graine, le premier signe de perturbation chez le mutant p5cdh se manifeste au début de la phase de maturation par une phase de verdissement peu marquée et plus courte que chez le sauvage, suivie une accumulation limitée de lipides et de protéines de réserve. En revanche une accumulation très importante de proline est mesurée. Ces études ont également révélé dans les graines du mutant p5cdh une accumulation d’acides aminés libres ainsi qu’une perturbation marquée du métabolisme carboné. De nombreux marqueurs du métabolisme énergétique anaérobie sont induits probablement liés à la perte des capacités photosynthétiques de l’embryon. La teneur réduite en protéines HSP et LEA ainsi que de plusieurs sucres non-réducteurs chez le mutant p5cdh renforce le fait que la graine n’est pas préparée à cette phase de déshydratation. Les processus de maturation et de déshydratation étant fortement métaboliquement énergivores, l’arrêt du développement de la graine du mutant p5cdh pourrait être lié à une insuffisance énergétique. Ce déficit énergétique semble également toucher également le développement du gamétophyte mâle, puisque 50% des grains de pollen p5cdh meurent lors de leur maturation. Cette étude montre que le catabolisme de la proline est essentiel au développement de la graine et du pollen, notamment après la phase d’embryogénèse, en fournissant du pouvoir réducteur et de l’ATP. Elle vient confirmer de nombreuses hypothèses quant à l’importance de la proline et de son catabolisme pour la production d’énergie notamment lors de la reprise de la croissance après un stress mais également dans les organes à croissance rapide tels quel le tube pollinique, les pointes racinaires ou les cellules cancéreuses chez les modèles animaux
Study of the interactions between proline catabolism and nitrogen metabolism in seed development of Arabidopsis thaliana
No full textLa proline est un acide aminé protéinogène qui a aussi de nombreuses fonctions à l’état libre chez les plantes notamment dans leur adaptation aux stress et leur développement. Son métabolisme est bien décrit à ce jour mais certains de ses rôles physiologiques restent encore énigmatiques. Synthétisée dans le cytosol à partir de glutamate, la proline est catabolisée dans la mitochondrie par l’action séquentielle de deux enzymes : la proline déshydrogénase (ProDH) et la pyrroline-5-carboxylate déshydrogénase (P5CDH). Des expériences préliminaires ont montré un très faible taux de germination des graines du mutant p5cdh ainsi qu’une faible remobilisation de l’azote au cours de la senescence. Les objectifs de cette thèse étaient de caractériser ce défaut de remobilisation de l’azote ainsi que son impact sur le développement de la graine. Nous avons pu montrer que le mutant p5cdh présentait un défaut de remobilisation de l’azote mais aussi du carbone, notamment lorsqu’il était cultivé avec un apport non limitant en azote. Les graines produites par ce mutant sont déformées et plus légères. Des analyses en imagerie ont montré que le développement embryonnaire du mutant p5cdh est bloqué à la transition entre les phases d’embryogenèse et de maturation lorsqu’il est exposé à de fortes concentrations en nitrates. L’embryon est alors bloqué dans son développement au stade torpille et est entouré d’albumen. Lors de la phase de déshydratation de la graine, l’embryon meurt. Afin d’identifier le rôle de P5CDH dans le développement de la graine, des études développementales, métabolomiques et protéomiques ont été entreprises sur des graines en cours de maturation et de déshydratation. Ces études ont montré qu’au cours du développement de la graine, le premier signe de perturbation chez le mutant p5cdh se manifeste au début de la phase de maturation par une phase de verdissement peu marquée et plus courte que chez le sauvage, suivie une accumulation limitée de lipides et de protéines de réserve. En revanche une accumulation très importante de proline est mesurée. Ces études ont également révélé dans les graines du mutant p5cdh une accumulation d’acides aminés libres ainsi qu’une perturbation marquée du métabolisme carboné. De nombreux marqueurs du métabolisme énergétique anaérobie sont induits probablement liés à la perte des capacités photosynthétiques de l’embryon. La teneur réduite en protéines HSP et LEA ainsi que de plusieurs sucres non-réducteurs chez le mutant p5cdh renforce le fait que la graine n’est pas préparée à cette phase de déshydratation. Les processus de maturation et de déshydratation étant fortement métaboliquement énergivores, l’arrêt du développement de la graine du mutant p5cdh pourrait être lié à une insuffisance énergétique. Ce déficit énergétique semble également toucher également le développement du gamétophyte mâle, puisque 50% des grains de pollen p5cdh meurent lors de leur maturation. Cette étude montre que le catabolisme de la proline est essentiel au développement de la graine et du pollen, notamment après la phase d’embryogénèse, en fournissant du pouvoir réducteur et de l’ATP. Elle vient confirmer de nombreuses hypothèses quant à l’importance de la proline et de son catabolisme pour la production d’énergie notamment lors de la reprise de la croissance après un stress mais également dans les organes à croissance rapide tels quel le tube pollinique, les pointes racinaires ou les cellules cancéreuses chez les modèles animaux.Proline is a proteinogenic amino acid with numerous functions in plants especially in stress adaptations and development. Its metabolism is now well described but some of its physiological roles remained enigmatic. Synthesized in the cytosol from glutamate, proline is catabolized in the mitochondrion by the sequential action of two enzymes: proline dehydrogenase (ProDH) and Pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase (P5CDH). Preliminary experiments showed weak germination rates for p5cdh mutants and weak nitrogen remobilization rate during senescence. The objectives of this thesis were to charaterize this remobilization defect and its impact on seed development. We have shown that p5cdh mutant presented a remobilization defect for nitrogen and carbon, especially when plants were grown under non limiting concentration of nitrates. Seeds produced by this mutant are out of shape and lighter. Imagery analysis have shown that embryo development of p5cdh mutant is blocked at the transition between embryogenesis and maturation phase when it is grown under high concentrations of nitrates. Embryo is blocked in its develoment in torpedo stage et is surrounded by endosperm. During the dehydration phase, embryo dies. In order to identify the role of P5CDH in seed development, developmental, metabolomics and proteomics studies were performed on maturing and dehydrating seeds. These studies have shown that during seed development, the first sign of disturbance in p5cdh mutant is visible at the beginning of the maturation phase with a weak and shorter greening phase compared to the wild-type. It is followed by a limited lipids accumulation and storage proteins. But an important accumulation of free proline were measured. These studies have also revealed an accumulation of free amino acids in p5cdh mutant's seeds and a marked disturbance of carbon metabolism. Numerous markers of anaerobic energy metabolism are induced probably linked to the loss of photosynthetic capacities of the embryo. The lower content in HSP and LEA proteins and in non-reducting sugars in p5cdh mutant reinforce the idea that the seed is not prepared to be dehydrated. Since the processes of maturation and dehydration are strongly energy demanding processes, the arrest of seed development in p5cdh mutant could be linked to a lack of energy. This lack of energy seems affect also the development of the male gametophyte since 50% of p5cdh pollen grain die during its maturation. This study shows that proline catabolism is essential to seed and pollen development, especially after the embryogenesis by provinding reduced power and ATP. It confirms the numerous hypothesis about the importance of proline and its catabolism in energy production during growth recovery after a stress but also in fast growth organs like pollen tube, root tip or cancer cells in animal models
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
- …
