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Eduardo Arango Arango… ¡El maestro! : entrevista concedida a David Guillermo Sebá Gómez
No full textEl diálogo transcrito en este aparte de la Revista, entre los profesores Eduardo Arango Arango y David Guillermo Sebá Gómez, registra los principales hitos, referentes, influencias y proyectos del primero a lo largo de su carrera profesional como arquitecto. Las palabras de Arango, en respuesta a las acotadas preguntas de Sebá, dejan ver su pensamiento hondo, los intereses y propósitos profundos que se materializan en sus arquitecturas, con un oportuno respeto por las condiciones básicas de lo urbano y con el deseo de contribuir con la construcción de un hábitat más humano, contextualizado y coherente. (Texto tomado de la fuente)Entrevista realizada por el profesor ocasional de la Facultad de Arquitectura de la Universidad Nacional de Colombia David Guillermo Sebá Gómez al arquitecto, urbanista y profesor jubilado de la Universidad Nacional de Colombia y de la Universidad Pontificia Bolivariana, Eduardo Arango Arango, el 19 de mayo de 2017 en los jardines públicos del barrio Suramericana en Medellín. La conversación hizo parte de la investigación para la tesis de Maestría en Arquitectura de la Universidad Nacional de Colombia titulada Compacidad y continuidad: el equilibrio tipo-morfológico en la vivienda colectiva de Eduardo Arango Arango, sustentada el mismo año. Las notas a pie de página son del edito
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Characterization of the role of ALIX and CD9 in the biogenesis pathway of extracellular vesicles in a human mesenchymal lineage cell model
No full textilustraciones, diagramas, fotografíasLas vesículas extracelulares (VEs) son microestructuras esféricas liberadas por las células como un mecanismo de comunicación celular, tanto a nivel local como sistémico. Estas vesículas desempeñan un papel esencial en la regulación de la homeostasis celular y están implicadas en diversas patologías, incluyendo el cáncer, enfermedades neurodegenerativas y autoinmunes. Su baja inmunogenicidad, toxicidad reducida y presencia en distintos fluidos corporales han despertado un creciente interés en su estudio, especialmente en aplicaciones diagnósticas y terapéuticas. Investigaciones recientes han profundizado en los mecanismos de biogénesis de las VEs, destacando el papel de complejos proteicos como ESCRT, así como de proteínas auxiliares como ALIX o estructurales como CD9, en su formación, selección y empaquetamiento de biomoléculas. Sin embargo, aún no se comprende completamente cómo las alteraciones en la expresión de estas proteínas podrían modificar las interacciones con el complejo ESCRT durante la biogénesis de VE, lo que podría cambiar las características estructurales, de producción, de contenido o funcionales. Resolver esta cuestión es crucial para optimizar la aplicación de VEs en la biomedicina y la biotecnología.
Los modelos celulares basados en células de linaje mesenquimal (CLM), como la línea celular MRC-5, ofrecen una plataforma ideal para estudiar procesos de inmunomodulación en ambientes in vitro de inflamación. A partir de VEs derivadas de estas células de linaje mesenquimal humano se puede evaluar la funcionalidad de las VEs después de generar cambios en la expresión de ALIX y CD9, siguiendo los cambios en la inmunomodulación de células del sistema inmune en modelos in vitro de inflamación.
Con base en lo anterior, el objetivo principal de esta investigación consistió en dilucidar el rol de las proteínas ALIX y CD9 durante la biogénesis de VEs derivadas de células de linaje mesenquimal humano a través de alteraciones en la expresión de estas proteínas y el impacto generado las características estructurales, concentración, selección de contenido y funcionales de las VEs en un modelo biológico de inmunomodulación. Los resultados conseguidos en la tesis evidenciaron que ALIX y CD9 cumplen funciones fundamentales y complementarias durante la biogénesis de las VEs. Las modificaciones genéticas llevadas a cabo en la línea celular de linaje mesenquimal humano, MRC-5, demostraron la importancia de ALIX y CD9 como reguladores esenciales de la maquinaria del complejo
X
ESCRT, participando en la selección de biomoléculas y en la escisión y posterior liberación de las VEs (Texto tomado de la fuente).Abstract
Extracellular vesicles (EVs) are spherical microstructures released by cells as a mechanism of cellular communication at both local and systemic levels. These vesicles play a crucial role in regulating cellular homeostasis and are involved in various pathologies, including cancer, neurodegenerative diseases, and autoimmune disorders. Their low immunogenicity, reduced toxicity, and presence in different bodily fluids have generated increasing interest in their study, particularly for diagnostic and therapeutic applications. Recent research has deepened our understanding of EV biogenesis mechanisms, highlighting the role of protein complexes such as ESCRT, as well as auxiliary proteins like ALIX and structural proteins like CD9, in their formation, selection, and packaging of biomolecules. However, the extent to which alterations in the expression of these proteins may modify their interactions with the ESCRT complex during EV biogenesis remains incompletely understood, potentially affecting structural characteristics, production, content, or functional properties. Addressing this question is crucial for optimizing the application of EVs in biomedicine and biotechnology.
Cell models based on mesenchymal lineage cells (MLCs), such as the MRC-5 cell line, provide an ideal platform for studying immunomodulatory processes in in vitro inflammation environments. EVs derived from these human mesenchymal lineage cells can be used to evaluate their functionality after inducing changes in ALIX and CD9 expression, thereby assessing subsequent immunomodulatory effects on immune system cells in in vitro inflammation models.
Based on these premises, the main objective of this research was to elucidate the role of ALIX and CD9 proteins during the biogenesis of EVs derived from human mesenchymal lineage cells by altering their expression and analyzing the impact on the structural characteristics, concentration, content selection, and functional properties of EVs in a biological immunomodulation model. The findings of this study demonstrated that ALIX and CD9 play fundamental and complementary roles in EV biogenesis. Genetic modifications performed in the human mesenchymal lineage cell line MRC-5 underscored the importance of ALIX and CD9 as essential regulators of the ESCRT complex machinery, participating in biomolecule selection as well as in membrane scission and subsequent EV release.MaestríaMagíster en Genética HumanaPara cumplir los objetivos planteados en el trabajo se dividió la metodología en cuatro
fases:
El silenciamiento de un gen facilita la comprensión de su papel en una vía de biogénesis
al analizar las repercusiones de su falta en los procesos específicos de la célula. Al limitar
su expresión, es posible examinar qué fases del proceso se ven modificadas o
interrumpidas, lo que ofrece indicios esenciales acerca de su función, ya sea en la
formación, liberación o composición de estructuras como las vesículas extracelulares. Por
tal motivo, en una primera fase se generaron varias de líneas celulares MRC-5 silenciadas
para el gen ALIX del complejo ESCRT y se determinó el nivel de silenciamiento o reducción
de la expresión de este gen con el fin de cumplir la primera parte del objetivo. Para obtener
las líneas celulares MRC-5 silenciadas parcialmente (Knockdown) o totalmente (Knock out)
para el gen ALIX se utilizaron dos metodologías de transfección distintas. En el primer
método de transfección se realizó una nucleofección de un plásmido de expresión del
sistema CRISPR-Cas9 asociado a un gen de resistencia a la puromicina para su selección
(pSpCas9(BB)-2A-Puro_ pX459 v2.0). El vector seleccionado tiene un sitio de inserción de
los sgARN, que previamente fueron seleccionados bioinformáticamente, y clonados en el
vector. Las sgARN diseñas van dirigidas a secuencias en los exones 1 y 5 del gen ALIX.
Para la clonación en el vector, se realizó la hibridación de ambas hebras, su clonación en
el plásmido y se confirmaron tanto por PCR convencional como por secuenciación Sanger.
La endonucleasa Cas9 se expresa en conjunto con la ARN guías dentro de las células
MRC-5 nucleofectadas para que generen un corte en la región codificante y mediante una
reparación de unión de extremos no homólogos (NHEJ) introducir indels para que generen
una mutación “frameshift” o de desplazamiento de marco de lectura y finalmente, un codón
de parada prematuro y tener un knock out para ALIX. Para la selección de solo las células
modificas, posterior a la nucleofección se colocaron las células MRC-5 en cultivo con el antibiótico puromicina, que a altas concentraciones es letal para las células eucariotas.
Para evaluar el silenciamiento obtenido por este método se realizaron varias pruebas: (i)
Una marcación intracelular de una cola de histidinas DYKDDDDK (Flag) que también se
expresa el plásmido nucleofectado por citometría de flujo, (ii) una cuantificación relativa de
la expresión de génica de ALIX y Beta 2 microglobulina (B2M) por RT-qPCR, (iii) también
se realizó inmunotransferencia o Western Blot para evaluar expresión a nivel de proteína
de ALIX frente a la proteína GAPDH como control y (iv) por último, se confirmó por
secuenciación Sanger si las células seleccionada contenía algún indel en los exones.Terapia celular y génic
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
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