1,721,008 research outputs found
A highly polymorphic insertion in the Y-chromosome amelogenin gene can be used for evolutionary biology, population genetics and sexing in <it>Cetacea </it>and <it>Artiodactyla</it>
No full textAbstract Background The early radiation of the Cetartiodactyla is complex, and unambiguous molecular characters are needed to clarify the positions of hippotamuses, camels and pigs relative to the remaining taxa (Cetacea and Ruminantia). There is also a need for informative genealogic markers for Y-chromosome population genetics as well as a sexing method applicable to all species from this group. We therefore studied the sequence variation of a partial sequence of the evolutionary conserved amelogenin gene to assess its potential use in each of these fields. Results and discussion We report a large interstitial insertion in the Y amelogenin locus in most of the Cetartiodactyla lineages (cetaceans and ruminants). This sex-linked size polymorphism is the result of a 460–465 bp inserted element in intron 4 of the amelogenin gene of Ruminants and Cetaceans. Therefore, this polymorphism can easily be used in a sexing assay for these species. When taking into account this shared character in addition to nucleotide sequence, gene genealogy follows sex-chromosome divergence in Cetartiodactyla whereas it is more congruent with zoological history when ignoring these characters. This could be related to a loss of homology between chromosomal copies given the old age of the insertion. The 1 kbp Amel-Y amplified fragment is also characterized by high nucleotide diversity (64 polymorphic sites spanning over 1 kbp in seven haplotypes) which is greater than for other Y-chromosome sequence markers studied so far but less than the mitochondrial control region. Conclusion The gender-dependent polymorphism we have identified is relevant not only for phylogenic inference within the Cetartiodactyla but also for Y-chromosome based population genetics and gender determination in cetaceans and ruminants. One single protocol can therefore be used for studies in population and evolutionary genetics, reproductive biotechnologies, and forensic science.</p
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Multiplexed microsatellites for rapid identification and characterization of individuals and populations of cercopithecidae
No full textProcessus démographiques et sélectifs expliquant les profils de diversité et de différenciation génétique des populations du macaque cynomolgus (Macaca fascicularis), espèce à vaste distribution discontinue
No full textTOULOUSE3-BU Sciences (315552104) / SudocSudocFranceF
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Multiplex microsatellites for rapid identification and characterization of individuals and populations of cercopithecidaeA
No full textDynamique intra- et inter-spécifique d'une famille de microsatellites localisés sur les chromosomes sexuels des primates
No full textCette thèse, à l'interface de l'évolution moléculaire et de la génétique des populations, a un double objectif: (i) comprendre les facteurs impliqués dans la dynamique évolutive de microsatellites dupliqués et homologues localisés sur les chromosomes sexuels et (ii) utiliser cette information pour interpréter des profils de diversité en génétique des populations. Notre modèle d'étude est une famille de 6 microsatellites (CAIII) localisée dans une région d'homologie sur les chromosomes sexuels. Par une approche bio-informatique, nous montrons que ces microsatellites sont localisés sur des duplications segmentaires à proximité des gènes VCXY (~ 2.5 kb). Par une approche évolutive, basée sur la comparaison des microsatellites chez treize espèces de primates nous montrons: (i) une évolution différente de leur structure moléculaire malgré un environnement génomique identique, suggérant l'existence de facteurs locus-spécifiques (e.g. taux de mutation régional), et (ii) une divergence des séquences flanquantes 3 à 4 fois plus faible qu'attendue en régions non codantes, probablement liée à la proximité des gènes VCXY: influence indirecte (effet auto-stop) ou directe (gène régulé par le microsatellite). Le génotypage de dix populations humaines d'Afrique et d'Europe montre que (i) la diversité génétique sur le Y est plus faible que sur le X, nous démontrons que ceci peut s'expliquer par des migrations 4 fois plus importantes ou/et un effectif efficace 10 fois plus important chez les femmes que chez les hommes; (ii) les distances génétiques entre populations sont plus faibles que celles de la littérature, ce qui pourrait s'expliquer par des contraintes de taille sur les microsatellites. Pour expliquer ce dernier résultat , nous émettons l' hypothèse que la sélection agit sur les microsatellites. Cette hypothèse est renforcée par (i) la proximité des gènes VCXY qui limiterait la divergence interspécifique et (ii) des distributions alléliques liées au chromosome X différentes entre hommes et femmes: ceci suggère une sélection intra-locus sexe-spécifique. Enfin, les microsatellites sur le chromosome Y sont localisés sur des duplications segmentaires présentant une homologie > 99.997%, maintenue par conversion génique. Cette quasi-parfaite homologie soulève un problème méthodologique en génétique des populations car la co-amplification de ces microsatellites empêche de définir des haplotypes ordonnés. Nous proposons et testons 4 méthodes d'assignation des allèles en haplotypes ordonnés. La méthode choisie a une influence sur l'estimation de la diversité intra-population mais l'estimation de la différenciation inter-populations reste inchangée. Par conséquent, il semble qu'une bonne connaissance de l'histoire évolutive et l'environnement génomique des microsatellites sont essentiels à l'élaboration de scénarii démographiques ou sélectifs précis pour expliquer l'évolution de la diversité génétique des populationsPARIS-Museum Hist.Naturelle (751052304) / SudocSudocFranceF
Genetic variation and population structure of western Mediterranean and northern Atlantic Stenella coeruleoalba populations inferred from microsatellite data.
No full text- …
