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Rôle des domaines MCC/eisosome et des modifications de la chromatine dans le pouvoir pathogène d'A. brassicicola.
No full textAlternaria brassicicola is a phytopathogenic necrotrophic fungus responsible for the black spot disease of Brassicaceae. In addition to contaminating the vegetative organs of its host plants, this fungus is known to infect their reproductive organs, including seeds. Seeds are particular organs with very low water content, therefore A. brassicicola must be able to withstand extremely high water and osmotic stress conditions. Two molecular mechanisms, the MCC/eisosome domains and chromatin remodelling, have been identified as potential actors involved in seedcolonization, both in terms of pathogenicity and stress resistance. To this end, we carried out a reverse genetic approach to study the influence of these two mechanisms on the response of A. brassicicola to constraints in vitro (plant defence molecules and water stress, osmotic, oxidative, etc.) and in vivo (colonization of arabette seeds and cabbage leaves). We showed that MCC/eisosome domains were weakly involved in the stress response of A. brassicicola but played an important role in the synthesis of A. brassicicola appressoria. We also showed that chromatin remodelling was extremely important for response of A. brassicicola to osmotic and oxidative stresses and for regulation of secondary metabolite production. The results obtained during this thesis led to clarify the role of MCC/eisosome domains and chromatin remodelling process in A. brassicicola and highlight the role of other mechanisms, such as nitrogen metabolism and reactive oxygen species in its pathogenicity.Alternaria brassicicola est un champignon nécrotrophe phytopathogène responsable de la maladie des taches noires des Brassicacées. Outre la contamination des organes végétatifs de ses plantes hôtes, ce champignon est connu comme étant capable d’infecter leurs organes reproducteurs, et notamment les semences. Ces semences sont des organes particuliers très pauvres en eau, par conséquent A. brassicicola doit être capable de résister à des conditions de stress hydrique et osmotique extrêmement importantes. Deux mécanismes moléculaires, les domaines MCC/eisosome et le remodelage de la chromatine, ont été identifiés comme de potentiels acteurs impliqués dans la colonisation des semences, que ce soit en terme de pouvoir pathogène ou de résistance aux stress. Pour cela, nous avons procédé à une approche de génétique inverse afin d’étudier l’influence de ces deux mécanismes dans la réponse d’A. brassicicola à des contraintes in vitro (molécules de défense des plantes et stress hydrique, osmotique, oxydatif, etc.) et in vivo (colonisation de semences d’arabette et de feuilles de chou). Nous avons montré que les domaines MCC/eisosome sont faiblement impliqués dans la réponse au stress d’A. brassicicola mais jouent un rôle important dans la synthèse des appressoria d’A. brassicicola. Nous avons également montré que le remodelage de la chromatine est extrêmement important pour la réponse aux stress osmotiques et oxydatifs d’A. brassicicola et pour la régulation de sa production en métabolites secondaires. Les résultats obtenus lors de cette thèse permettent de préciser le rôle des domaines MCC/eisosome et du remodelage de la chromatine chez A. brassicicola et mettent en avant le rôle d’autres mécanismes tels que le métabolisme azoté et les espèces réactives de l’oxygène dans son pouvoir pathogène
Rôle des domaines MCC/eisosome et des modifications de la chromatine dans le pouvoir pathogène d'A. brassicicola.
No full textAlternaria brassicicola is a phytopathogenic necrotrophic fungus responsible for the black spot disease of Brassicaceae. In addition to contaminating the vegetative organs of its host plants, this fungus is known to infect their reproductive organs, including seeds. Seeds are particular organs with very low water content, therefore A. brassicicola must be able to withstand extremely high water and osmotic stress conditions. Two molecular mechanisms, the MCC/eisosome domains and chromatin remodelling, have been identified as potential actors involved in seedcolonization, both in terms of pathogenicity and stress resistance. To this end, we carried out a reverse genetic approach to study the influence of these two mechanisms on the response of A. brassicicola to constraints in vitro (plant defence molecules and water stress, osmotic, oxidative, etc.) and in vivo (colonization of arabette seeds and cabbage leaves). We showed that MCC/eisosome domains were weakly involved in the stress response of A. brassicicola but played an important role in the synthesis of A. brassicicola appressoria. We also showed that chromatin remodelling was extremely important for response of A. brassicicola to osmotic and oxidative stresses and for regulation of secondary metabolite production. The results obtained during this thesis led to clarify the role of MCC/eisosome domains and chromatin remodelling process in A. brassicicola and highlight the role of other mechanisms, such as nitrogen metabolism and reactive oxygen species in its pathogenicity.Alternaria brassicicola est un champignon nécrotrophe phytopathogène responsable de la maladie des taches noires des Brassicacées. Outre la contamination des organes végétatifs de ses plantes hôtes, ce champignon est connu comme étant capable d’infecter leurs organes reproducteurs, et notamment les semences. Ces semences sont des organes particuliers très pauvres en eau, par conséquent A. brassicicola doit être capable de résister à des conditions de stress hydrique et osmotique extrêmement importantes. Deux mécanismes moléculaires, les domaines MCC/eisosome et le remodelage de la chromatine, ont été identifiés comme de potentiels acteurs impliqués dans la colonisation des semences, que ce soit en terme de pouvoir pathogène ou de résistance aux stress. Pour cela, nous avons procédé à une approche de génétique inverse afin d’étudier l’influence de ces deux mécanismes dans la réponse d’A. brassicicola à des contraintes in vitro (molécules de défense des plantes et stress hydrique, osmotique, oxydatif, etc.) et in vivo (colonisation de semences d’arabette et de feuilles de chou). Nous avons montré que les domaines MCC/eisosome sont faiblement impliqués dans la réponse au stress d’A. brassicicola mais jouent un rôle important dans la synthèse des appressoria d’A. brassicicola. Nous avons également montré que le remodelage de la chromatine est extrêmement important pour la réponse aux stress osmotiques et oxydatifs d’A. brassicicola et pour la régulation de sa production en métabolites secondaires. Les résultats obtenus lors de cette thèse permettent de préciser le rôle des domaines MCC/eisosome et du remodelage de la chromatine chez A. brassicicola et mettent en avant le rôle d’autres mécanismes tels que le métabolisme azoté et les espèces réactives de l’oxygène dans son pouvoir pathogène
Role of MCC/eisosome domains and chromatin modifications in A. brassicicola pathogenicity.
No full textAlternaria brassicicola est un champignon nécrotrophe phytopathogène responsable de la maladie des taches noires des Brassicacées. Outre la contamination des organes végétatifs de ses plantes hôtes, ce champignon est connu comme étant capable d’infecter leurs organes reproducteurs, et notamment les semences. Ces semences sont des organes particuliers très pauvres en eau, par conséquent A. brassicicola doit être capable de résister à des conditions de stress hydrique et osmotique extrêmement importantes. Deux mécanismes moléculaires, les domaines MCC/eisosome et le remodelage de la chromatine, ont été identifiés comme de potentiels acteurs impliqués dans la colonisation des semences, que ce soit en terme de pouvoir pathogène ou de résistance aux stress. Pour cela, nous avons procédé à une approche de génétique inverse afin d’étudier l’influence de ces deux mécanismes dans la réponse d’A. brassicicola à des contraintes in vitro (molécules de défense des plantes et stress hydrique, osmotique, oxydatif, etc.) et in vivo (colonisation de semences d’arabette et de feuilles de chou). Nous avons montré que les domaines MCC/eisosome sont faiblement impliqués dans la réponse au stress d’A. brassicicola mais jouent un rôle important dans la synthèse des appressoria d’A. brassicicola. Nous avons également montré que le remodelage de la chromatine est extrêmement important pour la réponse aux stress osmotiques et oxydatifs d’A. brassicicola et pour la régulation de sa production en métabolites secondaires. Les résultats obtenus lors de cette thèse permettent de préciser le rôle des domaines MCC/eisosome et du remodelage de la chromatine chez A. brassicicola et mettent en avant le rôle d’autres mécanismes tels que le métabolisme azoté et les espèces réactives de l’oxygène dans son pouvoir pathogène.Alternaria brassicicola is a phytopathogenic necrotrophic fungus responsible for the black spot disease of Brassicaceae. In addition to contaminating the vegetative organs of its host plants, this fungus is known to infect their reproductive organs, including seeds. Seeds are particular organs with very low water content, therefore A. brassicicola must be able to withstand extremely high water and osmotic stress conditions. Two molecular mechanisms, the MCC/eisosome domains and chromatin remodelling, have been identified as potential actors involved in seedcolonization, both in terms of pathogenicity and stress resistance. To this end, we carried out a reverse genetic approach to study the influence of these two mechanisms on the response of A. brassicicola to constraints in vitro (plant defence molecules and water stress, osmotic, oxidative, etc.) and in vivo (colonization of arabette seeds and cabbage leaves). We showed that MCC/eisosome domains were weakly involved in the stress response of A. brassicicola but played an important role in the synthesis of A. brassicicola appressoria. We also showed that chromatin remodelling was extremely important for response of A. brassicicola to osmotic and oxidative stresses and for regulation of secondary metabolite production. The results obtained during this thesis led to clarify the role of MCC/eisosome domains and chromatin remodelling process in A. brassicicola and highlight the role of other mechanisms, such as nitrogen metabolism and reactive oxygen species in its pathogenicity
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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