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cogan-shimizu-wsu/modular-ontology-design-library: MODL 1.0.0
No full text<p>First release of MODL!</p>
Mechanistic interrogations of ribosomal and non-ribosomal natural product enzymes
No full textDescribed herein is my thesis work towards structural and biochemical characterization of bacterial proteins involved in metabolite regulation and natural product biosynthesis. In the first case, I will describe the structural basis for transcriptional regulation of a small molecule metabolite, p-coumarate, and the remaining cases involve enzymes responsible for biosyntheses of complex natural products. Among the natural product cases are those falling under the class of ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides (RiPPs), with a particular emphasis on the thiopeptide subclass of RiPPs. Additionally, characterization of an off-loading enzyme involved in hybrid polyketide/non-ribosomal peptide (PK-NRP) natural product biosynthesis is described.Submission published under a 24 month embargo labeled 'Closed Access', the embargo will last until 2021-05-01The student, Dillon Cogan, accepted the attached license on 2019-04-03 at 18:53.The student, Dillon Cogan, submitted this Dissertation for approval on 2019-04-03 at 19:08.This Dissertation was approved for publication on 2019-04-08 at 16:47.DSpace SAF Submission Ingestion Package generated from Vireo submission #13487 on 2019-08-22 at 16:20:40Made available in DSpace on 2019-08-23T20:44:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2
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Atypisches Cogan Syndrom und Morbus Basedow: beiderseitige Ertaubung, Neuritis nervi optici und systemische Manifestationen bei einer Schwarzafrikanerin
No full textKasuistik: Wir berichten über den schubweisen, jahrelangen Krankheitsverlauf eines atypischen Cogan Syndroms einer 49-jährigen Kenianerin, die sich bei uns mit einer zunächst einseitigen akuten Ertaubung, Tinnitus und Gangunsicherheit bei vorbestehender mittelgradiger Innenohrschwerhörigkeit kontralateral vorstellte. Die Eigenanamnese gab Hinweise auf eine vor 17 Jahren durch Korticosteroide ausgeheilte Iritis. Weiterhin war die Patientin seit 9 Jahren wegen beiderseitig rezidivierenden Hörstürzen alio loco mehrmalig antiphlogistisch-rheologisch infundiert worden. Die akute Ertaubung führte zur stationären Aufnahme. Eine Tympanotomie mit Abdichtung des runden Fensters und die antiphlogistisch-rheologische Infusionstherapie blieben erfolglos. Das MRT-Schädel stellte eine Signalintensitätserhöhung okzipital links dar, die am ehesten einem ischämischen Herd entsprach und im Vergleich zum Vorbefund von 1998 neu war. Ein retrocochleäres Geschehen konnte ausgeschlossen werden. Das Routinelabor ergab keine wegweisenden Befunde. Die Luesserologie war negativ. Drei Monate später ertaubte die Patientin auf der Gegenseite. Weder operative noch konservative Therapien waren erfolgreich, so dass die Vorbereitungen zur Cochlea Implantation einseitig aufgenommen wurden. Ein Monat später beklagte die Patientin eine akute Sehverschlechterung ipsilateral, die durch eine Neuritis nervi optici erklärt werden konnte. Serologisch ergaben sich keine Hinweise auf eine Vaskulitis. Mit der neu aufgetretenen Augensymptomatik konnte erstmals die Diagnose eines Cogan Syndroms gestellt werden. Aufgrund der Gefahr einer Cochleaobliteration beim Cogan Syndrom entschlossen wir uns umgehend beiderseitig zu implantieren. Die Visusverschlechterung erholte sich ad integrum auf die hoch dosierte Kortikosteroidtherapie. Drei Monate postoperativ entwickelt die Patientin, trotz einer Prednisolon Erhaltungsdosis plötzlich eine Verschlechterung ihres Allgemeinzustandes mit Arthralgien der großen Gelenke. Gleichzeitig fielen im Serum um das 3- bis 5fach erhöhte freie Schilddrüsenhormonwerte auf bei massiv erniedrigtem TSH. Wir interpretieren den aktuellen Krankheitsverlaufverlauf als eine systemische Manifestation eines atypischen Cogan Syndroms, wobei eine hyperthyreote Stoffwechsellage in diesem Zusammenhang bisher nicht beschrieben wurde. Die mannigfaltigen Erscheinungsformen des atypischen Cogan Syndroms mit systemischem Verlauf erschweren die Erstdiagnosestellung. Darüber hinaus ist eine interdisziplinäre Strategieplanung hinsichtlich Diagnostik und Therapie unumgänglich
Cogan syndrome in children: early diagnosis and treatment is critical to prognosis
No full textAm J Ophthalmol. 2004 Apr;137(4):757-8.
Cogan syndrome in children: early diagnosis and treatment is critical to prognosis.
Orsoni JG, Zavota L, Vincenti V, Pellistri I, Rama P.
SourceOphthalmology Department, University of Parma, Parma, Italy. [email protected]
Abstract
PURPOSE: To present two cases of pediatric Cogan Syndrome and to highlight the differences between the adult and pediatric forms of the disease, as well as the importance of early diagnosis and treatment.
DESIGN: Interventional case report.
METHODS: Institutional setting.
RESULTS: Corneal lesions were much more diffuse than those observed in adult Cogan syndrome. Immunosuppressive drug combination therapy successfully resolved systemic and ocular inflammation, but the involvement of the pupillary area caused permanent low vision in one case and amblyopia in the other.
CONCLUSION: When chronic ocular inflammation is observed in association with sensory neural hearing loss and any systemic signs of autoimmune inflammation, a diagnosis of Cogan syndrome should be suspected. If immunosuppressive treatment is not initiated as soon as possible, permanent low vision and deafness can result
Ortalidina apaxa Cogan, comb. nov.
No full text<i>Ortalidina apaxa</i> (Cogan), comb. nov. <p> <i>Toropamecia apaxa</i> Cogan 1978: 235. Chile. Tarapaca: Azapa. HT 3 (Fig. 12), CNC.</p>Published as part of <i>Gaimari, Stephen D., 2012, A new genus and species of Chamaemyiidae (Diptera: Lauxanioidea) from South America feeding on Ceroplastes wax scales (Hemiptera: Coccidae), and status of the genus Ortalidina as a chamaemyiid, pp. 39-50 in Zootaxa 3342</i> on page 44, DOI: <a href="http://zenodo.org/record/211348">10.5281/zenodo.211348</a>
Ortalidina nigripalpis Cogan, comb. nov.
No full text<i>Ortalidina nigripalpis</i> (Cogan), comb. nov. <p> <i>Toropamecia nigripalpis</i> Cogan 1978: 235. El Salvador. San Salvador. HT 3 (Fig. 24), USNM.</p>Published as part of <i>Gaimari, Stephen D., 2012, A new genus and species of Chamaemyiidae (Diptera: Lauxanioidea) from South America feeding on Ceroplastes wax scales (Hemiptera: Coccidae), and status of the genus Ortalidina as a chamaemyiid, pp. 39-50 in Zootaxa 3342</i> on page 46, DOI: <a href="http://zenodo.org/record/211348">10.5281/zenodo.211348</a>
Ortalidina longipennis Cogan, comb. nov.
No full text<i>Ortalidina longipennis</i> (Cogan), comb. nov. <p> <i>Toropamecia longipennis</i> Cogan 1978: 237. Ecuador. El Angel: Carchi. HT 3 (Fig. 18), CNC.</p>Published as part of <i>Gaimari, Stephen D., 2012, A new genus and species of Chamaemyiidae (Diptera: Lauxanioidea) from South America feeding on Ceroplastes wax scales (Hemiptera: Coccidae), and status of the genus Ortalidina as a chamaemyiid, pp. 39-50 in Zootaxa 3342</i> on page 46, DOI: <a href="http://zenodo.org/record/211348">10.5281/zenodo.211348</a>
Ortalidina veenota Cogan, comb. nov.
No full text<i>Ortalidina veenota</i> (Cogan), comb. nov. <p> <i>Toropamecia veenota</i> Cogan 1978: 233. Argentina. 15 km S Jujuy. HT 3 (Fig. 27), CNC.</p>Published as part of <i>Gaimari, Stephen D., 2012, A new genus and species of Chamaemyiidae (Diptera: Lauxanioidea) from South America feeding on Ceroplastes wax scales (Hemiptera: Coccidae), and status of the genus Ortalidina as a chamaemyiid, pp. 39-50 in Zootaxa 3342</i> on page 49, DOI: <a href="http://zenodo.org/record/211348">10.5281/zenodo.211348</a>
Ortalidina multipunctata Cogan, comb. nov.
No full text<i>Ortalidina multipunctata</i> (Cogan), comb. nov. <p> <i>Toropamecia multipunctata</i> Cogan 1978: 233. Argentina. Jujuy: Cieneguillas. HT 3 (Fig. 17), CNC.</p>Published as part of <i>Gaimari, Stephen D., 2012, A new genus and species of Chamaemyiidae (Diptera: Lauxanioidea) from South America feeding on Ceroplastes wax scales (Hemiptera: Coccidae), and status of the genus Ortalidina as a chamaemyiid, pp. 39-50 in Zootaxa 3342</i> on page 46, DOI: <a href="http://zenodo.org/record/211348">10.5281/zenodo.211348</a>
Ortalidina macalpinei Cogan, comb. nov.
No full text<i>Ortalidina macalpinei</i> (Cogan), comb. nov. <p> <i>Toropamecia macalpinei</i> Cogan 1978: 236. Chile. Malleco: Liucara. HT 3 (Fig. 19), CNC.</p>Published as part of <i>Gaimari, Stephen D., 2012, A new genus and species of Chamaemyiidae (Diptera: Lauxanioidea) from South America feeding on Ceroplastes wax scales (Hemiptera: Coccidae), and status of the genus Ortalidina as a chamaemyiid, pp. 39-50 in Zootaxa 3342</i> on page 46, DOI: <a href="http://zenodo.org/record/211348">10.5281/zenodo.211348</a>
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