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Transmission of arboviruses during breastfeeding : Zika virus and yellow fever virus
No full textLa transmission de certains arbovirus (« arthropode-borne virus ») par allaitement a été suggérée chez l'Homme (e.g. virus Zika (ZIKV), virus de la fièvre jaune (YFV), virus de la Dengue, virus West Nile'). Parmi ceux-ci, ZIKV et YFV sont particulièrement discutés. Pour ZIKV, de nombreuses études de cas rapportent la présence du virus dans le lait maternel et l'infection du nourrisson allaité tandis que pour YFV la transmission virale par allaitement a été observée pour la souche vaccinale, non transmise par les moustiques. Il est nécessaire de comprendre l'importance que représente l'allaitement dans la transmission de ces arbovirus afin de prévenir l'infection des nourrissons par allaitement lors de futures épidémies. Au laboratoire, nous avions précédemment montré la transmission de ZIKV par allaitement sur le modèle murin A129 (IFNAR KO). Nous avions également démontré que ZIKV dissémine aux glandes mammaires et infecte les cellules épithéliales mammaires (à l'aide du modèle murin, de cellules épithéliales mammaires humaines primaires et de lignées cellulaires). Enfin nous avions montré que ZIKV franchit la barrière intestinale in vivo et in vitro et nous avions proposé un mécanisme de franchissement comme étant l'infection productive de l'épithélium sans altération de sa fonction de barrière. Cependant, certaines études de cas ont rapporté une absence de transmission de ZIKV à des nourrissons allaités par une mère infectée. Différents facteurs biologiques ou génétiques contrôlant la transmission d'autres virus par allaitement (i.e. virus de l'immunodéficience humaine, virus T-lymphotrope humain, cytomégalovirus) ont été décrits : la charge virale et la forme virale infectieuse dans le lait, le statut immunologique de la mère, la durée de l'allaitement, etc. Dans ce projet doctoral, nous avons étudié la forme infectieuse de ZIKV dans le lait maternel murin et nous avons détecté du virus libre et « cellule-associé ». Nous avons également étudié l'effet des composants du lait sur l'infection par ZIKV et nous avons observé un effet inhibiteur des acides gras à longue chaîne carbonée. Dans un second axe, nous avons étudié les mécanismes de transmission de YFV par allaitement au nourrisson à l'aide de modèles in vitro et in vivo (souris A129). Nous avons étudié la souche vaccinale 17D-204 (transmise par allaitement chez l'Homme) ainsi que 2 souches sauvages (Asibi et Dakar) afin d'évaluer si ces dernières pourraient également être transmises par allaitement. Nous avons montré que YFV dissémine aux glandes mammaires murines après l'infection et que des particules infectieuses sont excrétées dans le lait. In vitro, nous avons montré que des lignées épithéliales mammaires humaines sont permissives à l'infection et nous avons proposé un mécanisme de franchissement de la barrière intestinale du nourrisson. À l'instar de ZIKV, les 3 souches de YFV testées franchissent la barrière intestinale par infection productive de l'épithélium sans altération de sa fonction de barrière. En conclusion, ce projet doctoral a permis de mettre en évidence la présence de ZIKV dans le lait maternel murin sous forme libre et « cellule-associée », d'identifier un effet inhibiteur de certains acides gras libres du lait sur ZIKV, ainsi que d'aborder les mécanismes de passage transépithélial de YFV au niveau des barrières mammaire et intestinale. Ces résultats apportent des éléments de compréhension dans l'évaluation, voire la prévention, du risque de transmission de ces deux virus par allaitement.The transmission of certain arboviruses ('arthropod-borne viruses') by breastfeeding has been suggested in humans (e.g. Zika virus (ZIKV), yellow fever virus (YFV), Dengue virus, West Nile virus...). Among these, ZIKV and YFV are particularly discussed. For ZIKV, numerous case reports show the presence of the virus in breast milk and the infection of the breastfed infant, while for YFV, viral transmission through breastfeeding has been observed for the vaccine strain (not transmitted by mosquitoes). It is necessary to understand the importance of breastfeeding in the transmission of these arboviruses to prevent their transmission to newborns through breastfeeding during future outbreaks. In our laboratory, we have previously demonstrated the transmission of ZIKV by breastfeeding in the A129 mouse model (IFNAR KO). We also demonstrated that ZIKV disseminates to the mammary glands and infects mammary epithelial cells (using the mouse model, primary human mammary epithelial cells and cell lines). Finally, we showed that ZIKV crosses the intestinal barrier in vivo and in vitro, and we identified the mechanism of crossing as being the productive infection of the epithelium without alteration of its barrier function. However, some case studies have reported a lack of transmission of ZIKV to breastfed newborns by an infected mother. Different biological or genetic factors controlling the transmission of other viruses by breastfeeding (i.e. human immunodeficiency virus, human T-lymphotropic virus, cytomegalovirus) have been described: viral load and infectious viral form in breast milk, immunological status of the mother, duration of breastfeeding, etc. In this doctoral project, we studied the infectious form of ZIKV in murine breast milk and detected free and cell-associated virus. We also studied the effect of milk components on ZIKV infection and observed an inhibitory effect of long chain fatty acids. In a second axis, we studied the mechanisms of YFV transmission to newborns during breastfeeding, using in vitro and in vivo models (A129 mice). We studied the vaccine strain 17D-204 (transmitted by breastfeeding in humans) as well as two wild type strains (Asibi and Dakar) to assess whether the latter could also be transmitted by breastfeeding. We showed that YFV disseminates to murine mammary glands after infection and that free infectious viral particles are excreted in breast milk. In vitro, we have shown that human mammary epithelial cell lines are permissive to infection, and we have suggested a mechanism of intestinal barrier crossing of the newborn. Like ZIKV, the three YFV strains tested cross the intestinal barrier by productive infection of the epithelium without altering its barrier function. In conclusion, this doctoral project has allowed us to demonstrate the presence of ZIKV in murine breast milk both in a free and "cell-associated" form, to identify an inhibitory effect of certain free fatty acids in milk on ZIKV, and to address the mechanisms of transepithelial passage of YFV at the mammary and intestinal barriers. These results provide elements of understanding in the evaluation, or even prevention, of the risk of transmission of these two viruses by breastfeeding
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Musculoskeletal damages caused by two emerging arboviruses : example of zika and chikungunya viruses
No full textEn vue de contribuer à une meilleure compréhension des atteintes du système musculo-squelettique consécutives à une infection par un arthropod-borne-virus (arbovirus), deux arbovirus ont été étudiés : le virus du chikungunya (CHIKV) et le virus Zika (ZIKV), respectivement de la famille des Togaviridae et des Flaviviridae. Cette étude a été réalisée selon deux axes. Le premier s’intéresse aux atteintes articulaires consécutives à l’infection par le CHIKV. Nous avons mis au point un modèle d’imagerie in vivo reposant sur l’utilisation d’un virus recombinant exprimant la NanoLuciférase. Dans ce modèle, nous démontrons une persistance du signal bioluminescent dans les articulations 34 jours après infection. Par isolement des cartilages articulaires et des cellules constitutives, nous avons pu démontrer que les chondrocytes des cartilages métatarso-phalangiens sont infectés par le CHIKV de manière persistante, suggérant un rôle de réservoir de ces cellules. Les conséquences de l’infection au niveau cellulaire ont ensuite été étudiées in vitro. En utilisant des chondrocytes primaires humains, nous avons confirmé ces observations. De plus, les chondrocytes infectés produisent de nombreuses cytokines, induisant une stimulation du catabolisme du cartilage avec en particulier la synthèse de métalloprotéinases de matrice 3 et 9. De plus, l’infection par le CHIKV provoque la mort des cellules par apoptose, comme démontré par marquage TUNEL et par mesure de l’activité des caspases. Nous avons ensuite étudié les atteintes musculaires et le tropisme cellulaire du ZIKV. Dans un modèle murin, nous avons confirmé la présence de lésions musculaires, et l’utilisation de cellules musculaires primaires humaines a montré la sensibilité des myoblastes à l’infection, les myotubes étant résistants, suggérant un tropisme du ZIKV dépendant de la différenciation cellulaire. Trois souches virales ont été testées, sans relever de différences significatives en termes de cinétique d’infection, de nombre de cellules infectées et de production virale. L’infection des myoblastes entraîne la mort de ces cellules par un mécanisme caspase-indépendant. Des observations en microscopie électronique ont mis en évidence une vacuolisation du cytoplasme suite à l’infection, caractéristique d’une mort cellulaire par paraptose. Une analyse protéomique a démontré que l’infection des myoblastes par une souche asiatique conduit à une modification du protéome s’accentuant entre 24 heures et 48 heures post-infection, avec 225 protéines modulées 24 heures après infection contre 473 après 48 heures, indiquant une activation des voies de synthèse Interferon de type I et l’inhibition des capacités de synthèse des protéines. Ces résultats permettent une meilleure compréhension des atteintes du système-musculo-squelettique par les arbovirusMusculoskeletal lesions caused by arthropod-borne-viruses (arboviruses) are invalidating for patients and remain poorly understood. In this study, we investigated the development of these manifestations after infection with two arboviruses: chikungunya virus (CHIKV) from the Togaviridae family, and Zika virus (ZIKV) from the Flaviviridae family. The first part of the study focused on arthritis following CHIKV infection. For this purpose, we developed a reporter virus expressing NanoLuciferase and performed experimental infections in a murine model. In vivo, a strong bioluminescent signal indicated viral replication and we observed persistence of the signal in the joints up to 34 days post-infection. By isolating primary murine cells from cartilage, we demonstrated the susceptibility of chondrocytes to CHIKV infection suggesting a role of reservoir of these cells. Furthermore, we investigated the consequences of the infection using in vitro models. We showed that primary human chondrocytes are also susceptible to CHIKV infection, which leads to the production of several cytokines involved in cartilage catabolism and induces apoptosis. In the second part of the study, we studied ZIKV muscular tropism and the associated lesions. Firstly, we confirmed the development of muscular lesions in a mouse model of ZIKA. Then, using human primary muscle cells we observed the infection of myoblasts but not myotubes, suggesting a differentiation-dependent tropism. We compared three viral strains and observed no significant difference in terms of replication, number of infected cells and viral production. Myoblasts infection induced a caspase-independent cells death mechanism and electronic microscope observations revealed intense vacuolization of cytoplasm, suggesting a paraptosis-like cell death. Proteomic analysis revealed that the Asian ZIKV strain modulated protein expression of infected cells with an increased effect after 48 hours. ZIKV-infection induced an important upregulation of biological processes associated with type I interferon and an inhibition of protein synthesis in the infected cells. These results provide valuable information about the mechanisms involved in the development of musculoskeletal lesions during arbovirose
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Inhibition du transport axonal du virus rabique dans le systeme nerveux central
No full textSIGLEINIST T 76021 / INIST-CNRS - Institut de l'Information Scientifique et TechniqueFRFranc
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
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