1,720,979 research outputs found
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Analyse intégrative des données multi-dimensionnelles pour l'étude de la vaccination vis-à-vis des infections mammaires et pulmonaires chez les bovins
No full textIn order to prevent selection of multi-resistant bacteria to antibiotics, reduction of their use in veterinary medicine is expected by the society in general. The development of alternative methods such as vaccination seems necessary to help reducing the disease prevalence. However, in the bovine species, and in particular with regard to mammary and pulmonary infections, while understanding of the complex immune mechanisms is not optimal and many grey areas remain, the development of innovative strategies is necessary. The topic of my Doctoral thesis is related to the study of vaccination using multidimensional approaches with the double purpose of deciphering associated mechanisms and improve development of new vaccine methods with improved efficacy. High throughput technics such as transcriptomics or targeted proteomics are increasingly present in the research arsenal. Indeed, their implementation allows the discovery of mechanisms that are still poorly known, particularly in the field of infectious diseases. A prime and pull vaccine strategy against mastitis caused by E. coli was more efficient at preventing clinical signs than the systemic vaccination alone. To understand the protective immune mechanisms associated with this protocol of immunization, a high-throughput transcriptomic study by RNA sequencing was carried out in the blood and mammary tissues. In parallel, a medium throughput proteomic study via the determination of cytokines in plasma, milk and mammary tissue extract was carried out using a multiplex method. An integrative analysis of these data coupled with information on clinical records after an experimental infectious challenge was performed. This study made it possible to attribute the protection induced by the vaccination to the activity of CD4 lymphocytes producing IL-17 in the mammary tissue. The second study was carried out on vaccination against respiratory diseases. Within the frame of a study on the benefits of a preconditioning programme, a vaccine strategy was evaluated in fattening young bulls and immune monitoring, in parallel to recording of growth and clinical signs was carried out. Using multivariate methods, a lack of protective effect even after multiple vaccine injections was observed. Preconditioning in poor housing conditions has a negative impact on respiratory health and growth performances of the animals despite multiple vaccinations against the main respiratory pathogens. Our study paves the way to novel vaccine strategies in addition to providing important information on the mechanisms provided by vaccination against two of the most frequent infectious diseases that motivate antibiotic treatment in cattle.Dans le but de prévenir la sélection de bactéries résistantes aux antibiotiques, la volonté de réduire leur usage en médecine vétérinaire est un choix sociétal largement affiché. Le développement de méthodes alternatives telles que la vaccination est nécessaire. Dans l’espèce bovine, les infections mammaires et pulmonaires restent très présentes, et de nombreuses zones d’ombre subsistent sur la compréhension des mécanismes immunitaires de défense pour les prévenir. Cette thèse s’inscrit dans le cadre de l’étude de la vaccination à l’aide d’approches multidimensionnelles dans le double objectif de comprendre les mécanismes qu’elles mobilisent et d’élaborer de nouvelles méthodes vaccinales plus performantes. Les techniques dites de haut débit telles que la transcriptomique ou encore la protéomique ciblée sont de plus en plus utilisées dans les questions de recherche. En effet, leur utilisation permet d’identifier et d’étudier de façon large et sans a priori des mécanismes encore méconnus notamment dans le domaine de l’infectiologie. La stratégie vaccinale associant une immunisation par les voies systémique et locale permet une meilleure protection des vaches laitières vis-à-vis d’une infection expérimentale par E. coli, comparée à l’immunisation systémique seule. Pour la compréhension des mécanismes immunitaires protecteurs induits par la vaccination locale, une étude transcriptomique haut débit à l’aide du séquençage de l’ARN a été réalisée sur les cellules du sang, puis sur les lymphocytes CD4 extraits du tissu mammaire. En parallèle, une étude protéomique moyen débit via le dosage de cytokines par une méthode multiplexe utilisant des billes magnétiques a été conduite en parallèle. Une intégration de l’ensemble des données couplées à des informations sur l’état clinique après l’épreuve infectieuse a permis d’attribuer la protection induite par la vaccination à l’activité des lymphocytes producteurs d’interleukine 17 dans le tissu mammaire. La deuxième étude s’inscrit dans le cadre de l’étude de la vaccination contre les maladies respiratoires des bovins. Les effets d’un protocole de préparation des animaux incluant la vaccination ont été mesurés chez des jeunes bovins et un suivi de la réponse immunitaire, en parallèle des performances zootechniques et de la morbidité a été réalisé. Via l’utilisation de méthodes multidimensionnelles, les résultats montrent que la prévalence des signes cliniques et des lésions pulmonaires n’ont pas été efficacement prévenus par les interventions vaccinales. Des conditions d’hébergement défavorables ont un impact négatif sur la santé respiratoire malgré la vaccination. Ces travaux, outre la collection d’informations nouvelles sur la réponse immunitaire induite par la vaccination, ouvrent des perspectives sur de nouvelles modalités de prévention des deux principales maladies justifiant l’utilisation d’antibiotiques en élevage bovin
Integrative analysis of multidimensionnal data for the study of vaccination against bovine mammary and lung infections
No full textDans le but de prévenir la sélection de bactéries résistantes aux antibiotiques, la volonté de réduire leur usage en médecine vétérinaire est un choix sociétal largement affiché. Le développement de méthodes alternatives telles que la vaccination est nécessaire. Dans l’espèce bovine, les infections mammaires et pulmonaires restent très présentes, et de nombreuses zones d’ombre subsistent sur la compréhension des mécanismes immunitaires de défense pour les prévenir. Cette thèse s’inscrit dans le cadre de l’étude de la vaccination à l’aide d’approches multidimensionnelles dans le double objectif de comprendre les mécanismes qu’elles mobilisent et d’élaborer de nouvelles méthodes vaccinales plus performantes. Les techniques dites de haut débit telles que la transcriptomique ou encore la protéomique ciblée sont de plus en plus utilisées dans les questions de recherche. En effet, leur utilisation permet d’identifier et d’étudier de façon large et sans a priori des mécanismes encore méconnus notamment dans le domaine de l’infectiologie. La stratégie vaccinale associant une immunisation par les voies systémique et locale permet une meilleure protection des vaches laitières vis-à-vis d’une infection expérimentale par E. coli, comparée à l’immunisation systémique seule. Pour la compréhension des mécanismes immunitaires protecteurs induits par la vaccination locale, une étude transcriptomique haut débit à l’aide du séquençage de l’ARN a été réalisée sur les cellules du sang, puis sur les lymphocytes CD4 extraits du tissu mammaire. En parallèle, une étude protéomique moyen débit via le dosage de cytokines par une méthode multiplexe utilisant des billes magnétiques a été conduite en parallèle. Une intégration de l’ensemble des données couplées à des informations sur l’état clinique après l’épreuve infectieuse a permis d’attribuer la protection induite par la vaccination à l’activité des lymphocytes producteurs d’interleukine 17 dans le tissu mammaire. La deuxième étude s’inscrit dans le cadre de l’étude de la vaccination contre les maladies respiratoires des bovins. Les effets d’un protocole de préparation des animaux incluant la vaccination ont été mesurés chez des jeunes bovins et un suivi de la réponse immunitaire, en parallèle des performances zootechniques et de la morbidité a été réalisé. Via l’utilisation de méthodes multidimensionnelles, les résultats montrent que la prévalence des signes cliniques et des lésions pulmonaires n’ont pas été efficacement prévenus par les interventions vaccinales. Des conditions d’hébergement défavorables ont un impact négatif sur la santé respiratoire malgré la vaccination. Ces travaux, outre la collection d’informations nouvelles sur la réponse immunitaire induite par la vaccination, ouvrent des perspectives sur de nouvelles modalités de prévention des deux principales maladies justifiant l’utilisation d’antibiotiques en élevage bovin.In order to prevent selection of multi-resistant bacteria to antibiotics, reduction of their use in veterinary medicine is expected by the society in general. The development of alternative methods such as vaccination seems necessary to help reducing the disease prevalence. However, in the bovine species, and in particular with regard to mammary and pulmonary infections, while understanding of the complex immune mechanisms is not optimal and many grey areas remain, the development of innovative strategies is necessary. The topic of my Doctoral thesis is related to the study of vaccination using multidimensional approaches with the double purpose of deciphering associated mechanisms and improve development of new vaccine methods with improved efficacy. High throughput technics such as transcriptomics or targeted proteomics are increasingly present in the research arsenal. Indeed, their implementation allows the discovery of mechanisms that are still poorly known, particularly in the field of infectious diseases. A prime and pull vaccine strategy against mastitis caused by E. coli was more efficient at preventing clinical signs than the systemic vaccination alone. To understand the protective immune mechanisms associated with this protocol of immunization, a high-throughput transcriptomic study by RNA sequencing was carried out in the blood and mammary tissues. In parallel, a medium throughput proteomic study via the determination of cytokines in plasma, milk and mammary tissue extract was carried out using a multiplex method. An integrative analysis of these data coupled with information on clinical records after an experimental infectious challenge was performed. This study made it possible to attribute the protection induced by the vaccination to the activity of CD4 lymphocytes producing IL-17 in the mammary tissue. The second study was carried out on vaccination against respiratory diseases. Within the frame of a study on the benefits of a preconditioning programme, a vaccine strategy was evaluated in fattening young bulls and immune monitoring, in parallel to recording of growth and clinical signs was carried out. Using multivariate methods, a lack of protective effect even after multiple vaccine injections was observed. Preconditioning in poor housing conditions has a negative impact on respiratory health and growth performances of the animals despite multiple vaccinations against the main respiratory pathogens. Our study paves the way to novel vaccine strategies in addition to providing important information on the mechanisms provided by vaccination against two of the most frequent infectious diseases that motivate antibiotic treatment in cattle
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
Analyse intégrative des données multi-dimensionnelles pour l'étude de la vaccination vis-à-vis des infections mammaires et pulmonaires chez les bovins
No full textIn order to prevent selection of multi-resistant bacteria to antibiotics, reduction of their use in veterinary medicine is expected by the society in general. The development of alternative methods such as vaccination seems necessary to help reducing the disease prevalence. However, in the bovine species, and in particular with regard to mammary and pulmonary infections, while understanding of the complex immune mechanisms is not optimal and many grey areas remain, the development of innovative strategies is necessary. The topic of my Doctoral thesis is related to the study of vaccination using multidimensional approaches with the double purpose of deciphering associated mechanisms and improve development of new vaccine methods with improved efficacy. High throughput technics such as transcriptomics or targeted proteomics are increasingly present in the research arsenal. Indeed, their implementation allows the discovery of mechanisms that are still poorly known, particularly in the field of infectious diseases. A prime and pull vaccine strategy against mastitis caused by E. coli was more efficient at preventing clinical signs than the systemic vaccination alone. To understand the protective immune mechanisms associated with this protocol of immunization, a high-throughput transcriptomic study by RNA sequencing was carried out in the blood and mammary tissues. In parallel, a medium throughput proteomic study via the determination of cytokines in plasma, milk and mammary tissue extract was carried out using a multiplex method. An integrative analysis of these data coupled with information on clinical records after an experimental infectious challenge was performed. This study made it possible to attribute the protection induced by the vaccination to the activity of CD4 lymphocytes producing IL-17 in the mammary tissue. The second study was carried out on vaccination against respiratory diseases. Within the frame of a study on the benefits of a preconditioning programme, a vaccine strategy was evaluated in fattening young bulls and immune monitoring, in parallel to recording of growth and clinical signs was carried out. Using multivariate methods, a lack of protective effect even after multiple vaccine injections was observed. Preconditioning in poor housing conditions has a negative impact on respiratory health and growth performances of the animals despite multiple vaccinations against the main respiratory pathogens. Our study paves the way to novel vaccine strategies in addition to providing important information on the mechanisms provided by vaccination against two of the most frequent infectious diseases that motivate antibiotic treatment in cattle.Dans le but de prévenir la sélection de bactéries résistantes aux antibiotiques, la volonté de réduire leur usage en médecine vétérinaire est un choix sociétal largement affiché. Le développement de méthodes alternatives telles que la vaccination est nécessaire. Dans l’espèce bovine, les infections mammaires et pulmonaires restent très présentes, et de nombreuses zones d’ombre subsistent sur la compréhension des mécanismes immunitaires de défense pour les prévenir. Cette thèse s’inscrit dans le cadre de l’étude de la vaccination à l’aide d’approches multidimensionnelles dans le double objectif de comprendre les mécanismes qu’elles mobilisent et d’élaborer de nouvelles méthodes vaccinales plus performantes. Les techniques dites de haut débit telles que la transcriptomique ou encore la protéomique ciblée sont de plus en plus utilisées dans les questions de recherche. En effet, leur utilisation permet d’identifier et d’étudier de façon large et sans a priori des mécanismes encore méconnus notamment dans le domaine de l’infectiologie. La stratégie vaccinale associant une immunisation par les voies systémique et locale permet une meilleure protection des vaches laitières vis-à-vis d’une infection expérimentale par E. coli, comparée à l’immunisation systémique seule. Pour la compréhension des mécanismes immunitaires protecteurs induits par la vaccination locale, une étude transcriptomique haut débit à l’aide du séquençage de l’ARN a été réalisée sur les cellules du sang, puis sur les lymphocytes CD4 extraits du tissu mammaire. En parallèle, une étude protéomique moyen débit via le dosage de cytokines par une méthode multiplexe utilisant des billes magnétiques a été conduite en parallèle. Une intégration de l’ensemble des données couplées à des informations sur l’état clinique après l’épreuve infectieuse a permis d’attribuer la protection induite par la vaccination à l’activité des lymphocytes producteurs d’interleukine 17 dans le tissu mammaire. La deuxième étude s’inscrit dans le cadre de l’étude de la vaccination contre les maladies respiratoires des bovins. Les effets d’un protocole de préparation des animaux incluant la vaccination ont été mesurés chez des jeunes bovins et un suivi de la réponse immunitaire, en parallèle des performances zootechniques et de la morbidité a été réalisé. Via l’utilisation de méthodes multidimensionnelles, les résultats montrent que la prévalence des signes cliniques et des lésions pulmonaires n’ont pas été efficacement prévenus par les interventions vaccinales. Des conditions d’hébergement défavorables ont un impact négatif sur la santé respiratoire malgré la vaccination. Ces travaux, outre la collection d’informations nouvelles sur la réponse immunitaire induite par la vaccination, ouvrent des perspectives sur de nouvelles modalités de prévention des deux principales maladies justifiant l’utilisation d’antibiotiques en élevage bovin
Analyse intégrative des données multi-dimensionnelles pour l'étude de la vaccination vis-à-vis des infections mammaires et pulmonaires chez les bovins
Full text linkDans le but de prévenir la sélection de bactéries résistantes aux antibiotiques, la volonté de réduire leur usage en médecine vétérinaire est un choix sociétal largement affiché. Le développement de méthodes alternatives telles que la vaccination est nécessaire. Dans l’espèce bovine, les infections mammaires et pulmonaires restent très présentes, et de nombreuses zones d’ombre subsistent sur la compréhension des mécanismes immunitaires de défense pour les prévenir. Cette thèse s’inscrit dans le cadre de l’étude de la vaccination à l’aide d’approches multidimensionnelles dans le double objectif de comprendre les mécanismes qu’elles mobilisent et d’élaborer de nouvelles méthodes vaccinales plus performantes. Les techniques dites de haut débit telles que la transcriptomique ou encore la protéomique ciblée sont de plus en plus utilisées dans les questions de recherche. En effet, leur utilisation permet d’identifier et d’étudier de façon large et sans a priori des mécanismes encore méconnus notamment dans le domaine de l’infectiologie. La stratégie vaccinale associant une immunisation par les voies systémique et locale permet une meilleure protection des vaches laitières vis-à-vis d’une infection expérimentale par E. coli, comparée à l’immunisation systémique seule. Pour la compréhension des mécanismes immunitaires protecteurs induits par la vaccination locale, une étude transcriptomique haut débit à l’aide du séquençage de l’ARN a été réalisée sur les cellules du sang, puis sur les lymphocytes CD4 extraits du tissu mammaire. En parallèle, une étude protéomique moyen débit via le dosage de cytokines par une méthode multiplexe utilisant des billes magnétiques a été conduite en parallèle. Une intégration de l’ensemble des données couplées à des informations sur l’état clinique après l’épreuve infectieuse a permis d’attribuer la protection induite par la vaccination à l’activité des lymphocytes producteurs d’interleukine 17 dans le tissu mammaire. La deuxième étude s’inscrit dans le cadre de l’étude de la vaccination contre les maladies respiratoires des bovins. Les effets d’un protocole de préparation des animaux incluant la vaccination ont été mesurés chez des jeunes bovins et un suivi de la réponse immunitaire, en parallèle des performances zootechniques et de la morbidité a été réalisé. Via l’utilisation de méthodes multidimensionnelles, les résultats montrent que la prévalence des signes cliniques et des lésions pulmonaires n’ont pas été efficacement prévenus par les interventions vaccinales. Des conditions d’hébergement défavorables ont un impact négatif sur la santé respiratoire malgré la vaccination. Ces travaux, outre la collection d’informations nouvelles sur la réponse immunitaire induite par la vaccination, ouvrent des perspectives sur de nouvelles modalités de prévention des deux principales maladies justifiant l’utilisation d’antibiotiques en élevage bovin
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