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Melatonin rhythms beyond the pineal organ: gene expression of receptors and biosynthesis enzymes in wild and F1 Senegalese sole
No full textFish gonadal melatonin production is still unexplored and could contribute to a better understanding of its role in reproduction control, especially for species with reproductive impairments. This study aimed to comprehend if Senegalese sole testes are an extra-pineal production site of melatonin and if it has seasonal and daily variations. Wild and F1 broodstocks were sampled in the breeding season (BS) and out of the reproductive season (OS), at mid-light (ML) and mid-dark (MD) daytimes. Blood plasma melatonin concentration was determined by radioimmunoassay (RIA). The expression of genes involved in melatonin biosynthesis (tph1a, tph2, hiomt1, aanat1a, aanat1b, and aanat2) and melatonin receptors (mel1, mel1c, and mel2) was evaluated in the brain, eye, and testis by quantitative real-time PCR (qPCR). Plasma melatonin concentration in wild sole displayed day/night differences in both seasons (average ML: 36 ± 22 pg/mL, MD: 108 ± 63 pg/mL), whereas differences in the F1 broodstock were only found OS (ML: 100 ± 54 pg/mL, MD: 187 ± 88 pg/mL). Gene expression of mel1 and mel2 receptors, and tph1a, aanat1a, aanat2, and hiomt1 enzymes was detected and quantified in the fish testes. Moreover, daily and seasonal fluctuations in the expression of those genes were found in all tissues and broodstock groups. However, the F1 group showed distinct gene expression patterns compared to the wild type, suggesting a disruption in the circadian system. This study revealed that Senegalese sole testes are a melatonin production site and, at the same time, suggested a dysregulation in the hypothalamus-pituitary-gonad (HPG) axis of F1 males.Peer reviewe
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
Enhancement of spermiation in meagre (Argyrosomus regius) using two administration methods of GnRHa
Full text linkDissertação de mestrado, Aquacultura e Pescas, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2017Reared – produced meagre (Argyrosomus regius) males (n=15) with 4 years old were monitored and sampled, during the reproductive season for spermiation, collecting sperm and blood 5 times on May 2016. The fish were treated with gonadotropin-releasing hormone agonist (GnRHa) injection and implant (EVAc). The fish were randomly allocated in three treatments, named Control (n=5), Injection (n=5) and Implant (EVAc) (n=5). The experiment on the enhancement of sperm production was performed using GnRHa injection and implant at 15 and 50 μg GnRHa mean weight kgˉ¹ dose respectively. During this time the fish were sampling at days 0, 2, 5, 12 and 19 after treatment and sperm and blood were collected. Sperm samples were evaluated for the sperm condition (arbitrary scale), initial sperm motility (min), motility percentage (%), spermatozoa density (cell/ml) and survival at 4ºC using the common method of analysis for sperm quality and the Computer-Assisted Sperm Analysis (CASA), a system that analyses and track each spermatozoa movement. The collected blood was centrifuged to separate the plasma in order to identify the steroid hormones testosterone (T), 11-ketotestosterone (11-KT) and 17,20β-dihydroxy-4-pregnen-3-one (17,20β-P) using ELISA protocol. One fish per treatment was killed for histologic analysis in the last day of experiment. The obtained data from the common analysis of the sperm, CASA and the hormones were evaluated using a two-way ANOVA, with time (0, 2, 5, 12, and 19 Days) and treatment (Control, Injection and Implant) as the factors. GnRHa injection showed a short period of 2 days of effect regarding sperm production enhancement in meagre, while GnRHa implant proved to enhance the sperm production for a prolonged time. The results obtained for fish treated with GnRHa did not present statistical differences regarding the sperm quality parameters analysed both using the common methods of analysis and CASA. Furthermore, testosterone was the major steroid influencing spermiation. In conclusion, GnRHa implants seemed to be more appropriate to induce spermiation in meagre. Analysis of sperm should be conducted with accurate methods such as CASA.Um stock de corvinas (Argyrosomus regius) machos (n=15) de 4 anos de idade foi monitorizado, sendo os indivíduos amostrados durante a estação de reprodução. Durante este período foram recolhidos esperma e sangue 5 vezes durante o mês de Maio de 2016. Os indivíduos foram separados em 3 tanques, sendo 2 deles tratados com injeções de gonadotrofina (GnRHa, n=5) e implantes de GnRHa (EVAc, n=5). Um tanque foi deixado para controlo da experiência (sem injeção, n=5). A produção seminal foi estimulada através de injeções e implantes de doses de 15 e 50 μg GnRHa por média de peso kgˉ¹, respetivamente. Durante esse período, os peixes foram amostrados nos dias 0, 2, 5, 12 e 19 depois de tratados com GnRHa, recolhendo-se amostras de esperma e sangue. As amostras de esperma foram avaliadas segundo os seguintes parâmetros: condição do esperma (escala arbitraria), mobilidade (min) e percentagem de espermatozoides móveis (%), densidade (células/ml), sobrevivência do esperma armazenado a 4ºC e Computer- Assisted Sperm Analysis (CASA). As amostras de sangue foram preparadas para a determinação das seguintes hormonas esteroides: testosterona (T), 11-ketotestosterona (11-KT) e 17,20β-dihydroxy-4-pregnen-3-one (17,20β-P) através do método de ELISA. No final da experiência, foram realizadas análises histológicas às gonadas para confirmar os estados de desenvolvimento gonadal. Os resultados obtidos com as análises comuns do esperma, CASA e determinações hormonais foram submetidos a análise estatística (ANOVA de duas vias), com o tempo (0, 2, 5, 12 e 19 dias) e tratamentos (controlo, injeção e EVAc) como fatores. Observou-se que os indivíduos tratados com injeção de GnRHa apresentaram um curto efeito (2 dias) em relação a produção de esperma, enquanto que os indivíduos tratados com implantes (EVAc) sofreram um prolongamento na produção de esperma durante todo o período amostrado. Os resultados para as análises comuns e com CASA revelaram que o esperma de corvina não apresentou diferenças estatísticas em relação aos parâmetros de qualidade. Em relação aos níveis de testosterona determinados, verificou-se que esta hormona atuou como a principal hormona influenciando a espermiação. Em conclusão, os implantes de GnRHa parecem ser o tratamento mais apropriado para a indução da espermiação na corvina. A análise do sémen deve ser realizada utilizando métodos precisos, tais como o CASA
Caracterização da microbiota bacteriana associada ao muco da pele de corvinas (Argyrosomus regius) produzidas em diferentes sistemas multitróficos integrados (IMTA)
Full text linkDissertação de mestrado, Aquacultura e Pescas, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2017Atualmente, têm vindo a ser observados inúmeros problemas ligados à sustentabilidade em aquacultura convencional, devido à acumulação de nutrientes orgânicos, derivados do resto de ração não consumida e produtos de excreção, resultantes dos organismos produzidos nos sistemas de cultivo. Como alternativa, nos últimos anos, vem-se prestando uma maior atenção à Aquacultura Multitrófica Integrada (Integrated Multitrophic Aquaculture – IMTA), que é um sistema de cultivo que permite um aproveitamento de forma sustentável da energia e matéria, através da reciclagem dos nutrientes, possibilitando um manuseamento equilibrado do ambiente, o que se refletirá
na qualidade da água e no bem-estar dos peixes cultivados. Com o presente trabalho pretende-se caracterizar a microbiota bacteriana associada ao muco da pele de corvinas (Argyrosomus regius) produzidas em diferentes sistemas IMTA. Para este efeito foram efectuadas amostragens mensais, durante os meses de maio a novembro de 2016. Diariamente em cada tanque foram determinados os parâmetros físico-químicos da água, nomeadamente o pH, a temperatura, oxigénio dissolvido, salinidade e turbidez. Em cada amostragem foram recolhidas 6 corvinas de cada tanque, divididos em três sistemas de cultivo IMTA com dois replicados (IMTA 1: Peixe + Ostras + Macroalgas, IMTA 2: Peixes + Ostras, e IMTA 3: Peixes + Macroalgas) para a recolha dos dados biométricos (comprimento e peso) e bacteriológicos (muco). Os resultados permitiram observar que os parâmetros físico – químicos influenciaram fortemente na variação dos parâmetros microbiológicos, (teor de bactérias marinhas totais, Vibrionaceae e Pseudomonas), rondando o número de bactérias marinhas totais, no muco da pele das corvinas entre 103-105 cfu. g-1. Os géneros identificados no muco da pele das corvinas produzidas nos três sistemas - IMTA foram Vibrio ssp., Pseudomonas spp., Flavobacterium spp. e Aeromonas spp.
Concluiu-se assim, que o sistema de cultivo IMTA 2, comparativamente aos outros sistemas, foi o que exibiu os valores mais baixos de colonização bacteriana no muco, fator que pode estar associada a alta capacidade de filtração das ostras presentes
Optimization of in vitro fertilization using cryopreserved sperm of Crassostrea angulata and establishment of a cryopreservation protocol for Chamelea gallina
Full text linkThe development of methods that allow the conservation of genetic resources as sperm cryopreservation are necessary to avoid the pressure on the natural populations and the risk of extinction of Crassostrea angulata and Chamelea gallina, improving the reproductive strategies for eventually restocking programs and even aquaculture production with commercial purposes. Therefore, this work aimed to optimize the cryopreservation protocol for C. angulata testing different combinations of cryoprotectants, to assess the fertilization conditions for oyster and to assess the sperm quality parameters before and after exposure of C. gallina sperm to cryoprotectants solutions, determining the best cryopreservation conditions in terms of freezing rates. For optimization of a cryopreservation protocol for C. angulata, motility, viability and DNA integrity analysis were performed for cryopreserved sperm with dimethyl sulfoxide (DMSO), DMSO+trehalose and DMSO+sucrose. Fertilization trials with different sperm-to-egg ratios and volumes were tested and the success of fertilization trials was determined. For the assessment of sperm quality parameters of C. gallina, toxicity tests and cryopreservation assays were performed. For toxicity tests, fresh sperm was exposed to cryoprotectants (DMSO, ethylene glycol and methanol) and motility analysis were recorded. For cryopreservation assays, the same cryoprotectant conditions and two freezing rates were analysed. Motility and viability analysis were performed in post-thaw sperm. Supplementation of DMSO with sugars did not optimize motility, viability or decrease DNA fragmentation in Crassostrea angulata sperm. In fertilization trials, the best sperm-to-egg ratio using post-thawed sperm was 50,000 spermatozoa per egg. Trehalose did not improve the fertilization rate and no effect of fertilization volume was seen between different volumes. For Chamelea gallina, the toxicity trials demonstrated that DMSO was the most suitable cryoprotectant. However, post-thawed sperm showed no motility but DMSO showed the higher viability results, being the best conditions for sperm cryopreservation achieved with the fastest freezing rate. More studies are necessary to develop successfully a cryopreservation protocol for C. gallina.O desenvolvimento de métodos que permitam a conservação dos recursos genéticos, tais como a criopreservação de sémen, é necessário de modo a evitar a pressão exercida sobre as populações naturais e diminuir o risco de extinção de ostra portuguesa (Crassostrea angulata) e de pé-de-burrinho (Chamelea gallina). Estes métodos permitem melhorar as estratégias reprodutivas destas espécies permitindo eventuais programas de repovoamento e ainda a produção em aquacultura com fins comerciais. Portanto, a realização deste trabalho teve como objetivos a otimização do protocolo de criopreservação para a C. angulata testando diferentes combinações de crioprotetores internos e externos e avaliar as condições de fertilização desta espécie em condições experimentais. Outro dos objetivos foi avaliar os parâmetros de qualidade do sémen para a C. gallina antes e depois de ser exposto às soluções de criopreservação (crioprotetores) e determinar as melhores condições de criopreservação em relação a rampas de congelação. Para a otimização do protocolo de criopreservação de C. angulata, foram realizadas análises de mobilidade, viabilidade e de integridade de DNA (cometas) em sémen criopreservado com dimetilsulfóxido (DMSO) e duas combinações de DMSO com açucares (DMSO+trealose e DMSO+sacarose). Para esta espécie foram também realizados ensaios de fertilização onde foram testados diferentes rácios de espermatozóides por ovo e diferentes volumes de fertilização. Com isto, foi calculada uma taxa de fertilização para determinar o sucesso destes ensaios. Na avaliação dos parâmetros de qualidade de sémen de C. gallina, foram realizados testes de toxicidade e ensaios de criopreservação. Nos testes de toxicidade, o sémen fresco foi exposto durante 10 minutos a diferentes crioprotetores (DMSO, etilenoglicol e metanol), tendo sido realizadas análises de mobilidade. Nos ensaios de criopreservação, o sémen foi exposto às mesmas condições anteriormente descritas para os testes de toxicidade (mesmos crioprotetores e mesmo tempo de equilíbrio) tendo sido posteriormente exposto a duas rampas de congelação. Depois de descongelado, realizaram-se análises de mobilidade e a viabilidade. Com a realização destes procedimentos concluiu-se que a suplementação de DMSO com açucares não melhora a mobilidade, viabilidade ou diminui a fragmentação de DNA no sémen de Crassostrea angulata. Nos ensaios de fertilização, quando foi usado sémen criopreservado o melhor rácio de espermatozóide por ovo foi 50000:1, a trealose não melhora a taxa de fertilização e não foi observado qualquer efeito na variação do volume de água na fertilização. Para a Chamelea gallina, os testes de toxicidade demonstraram que o DMSO foi o crioprotector mais adequado. No entanto, o sémen descongelado não apresentou qualquer mobilidade. Em termos de viabilidade, o DMSO mostrou resultados mais elevados, e as melhores condições para a criopreservação do sémen desta espécie foram atingidas com a rampa de congelação mais rápida. No entanto, serão necessários mais estudos para o desenvolvimento de um protocolo de criopreservação com sucesso para a C. gallina
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