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Spektroskopische Untersuchungen zur Bestimmung von RNA-Ligand-Wechselwirkungen und RNA-Dynamiken
No full textThis thesis describes the structural characterization of interactions between biological relevant ribonucleic acid biomacromolecules (RNAs) and selected ligands to optimize the methodologies for the design of pharmacological lead compounds. To achieve this aim, not only the structures of the RNA, the ligand and their complexes need to be known, but also information about the inherent dynamics, especially of the target RNA, are necessary. To determine the structure and dynamics of these molecules and their complexes, liquid state nuclear magnetic resonance spectroscopy (NMR) is a suitable and powerful method. The necessity for these investigations arises from the lack of knowledge in RNA-ligand interactions, e.g. for the development of new medicinal drugs targeting crucial RNA sequences. In the first chapters of this thesis (Chapters II to IV), an introduction into RNA research is given with a focus on RNA structural features (Chapter II), into the interacting molecules, the biology of the specific RNA targets and the further development of their ligands (Chapter III) and into the NMR theory and methodologies used within this thesis (Chapter IV). Chapter II begins with a description of RNA characteristics and functions, placing the focus on the increasing attention that these biomacromolecules have attracted in recent years due to their diverse biological functionalities. This is followed by a detailed description of general structural features of RNA molecules. The biological functions of the RNAs investigated in this thesis (Human immunodeficiency virus PSI- and TAR-RNA and Coxsackievirus B3 Stemloop D in the 5’-cloverleaf element), together with their known structural characteristics are introduced in Chapter III. Furthermore, a description of the investigated ligands is given, focusing on the methods how their affinity and specificity were determined. The introduction is completed in Chapter IV, where the relevant NMR theory and methodologies are explained. First, kinetics and thermodynamics of ligand binding are summarized from an NMR point of view. Subsequently, a detailed description of the resonance assignment procedures for RNAs and peptidic ligands is given. This procedure mainly concentrates on the assignment of the proton resonances, which are essential for the later structure calculation from NMR restraints. The procedure for NMR structure calculation of RNA and its complexes follows with a short introduction into the programs ARIA and HADDOCK. The final part of this chapter explains the relaxation theory and the methodology to extract dynamic information from autocorrelated relaxation rates via the model-free formalism. In the Chapters V to VII of this thesis, the original publications are included and grouped into three topics. Chapter V comprehends the publications on the investigations of HIV PSI-RNA and its hexapeptidic ligand. These three publications[1-3] focus on the characterization of the ligand and its binding properties, its structure and the optimization of its composition aiming to improve its usage for further spectroscopic investigations.Die vorliegende Doktorarbeit behandelt die strukturelle Aufklärung von Wechselwirkungen zwischen biologisch relevanten Ribonukleinsäuren (RNA) und ausgewählten Liganden, sowie die Bestimmung der inhärenten Dynamik der RNA, um zur Methodenentwicklung für den Entwurf neuer Pharmaka beizutragen. Zur Bestimmung sowohl der Strukturen, als auch der Dynamiken stellt die Flüssig-Kernspinresonanz-Spektroskopie (NMR) eine ideale biophysikalische Methode dar. Die ersten Hälfte dieser Doktorarbeit gibt zum einen eine Einleitung in die RNA-Forschung mit besonderem Fokus auf den allgemeinen strukturellen und dynamischen Eigenschaften von Ribonukleinsäuren, stellt zweitens die ausgewählten RNA-Zielstrukturen und deren mit verschiedenen Methoden bestimmten Liganden vor, und erklärt drittens die zugrundeliegende NMR-Theorie und die verwendeten Methoden zur Untersuchung der Bindungs¬charakteristika, zur Strukturbestimmung der RNA und der Liganden und zur Ableitung dynamischer Parameter aus experimentellen Daten. Die zweite Hälfte dieser Arbeit ist der kumulative Teil und enthält die Originalpublikationen, die in drei Themenbereiche eingeteilt sind. Zuerst sind die drei Publikationen gruppiert, in denen die Bestimmung und Charakterisierung peptidischer Liganden der HIV Psi-RNA und deren Wechselwirkungen miteinander behandelt werden. Durch einen Phage-Display Assay wurde zunächst eine Konsensus¬sequenz eines peptidischen Liganden identifiziert (HWWPWW). Zur Verbesserung der Bindungseigenschaften wurde das Hexapeptid mittels einer Sequenzvariierung auf einer Membranoberfläche (SPOT-Assay) weiter optimiert (HKWPWW). Die weiteren strukturellen Untersuchungen der RNA-Ligand-Wechselwirkungen wurden per Fluoreszenz- und NMR-Spektroskopie durchgeführt, wobei die NMR-Spektroskopie aufzeigen konnte, dass das Peptid HKWPWW in zwei Konformationen der zentralen Prolinpeptidbindung zu beinahe gleichen Anteilen vorliegt. Die nächsten zwei Publikationen beschreiben die Ligandselektion gegen die Zielstruktur HIV TAR und die Strukturaufklärung des Komplexes mittels NMR-Spektroskopie. Als Liganden wurden Tripeptide synthetisiert, in denen zwei Arginine eine synthetische Aminosäure mit aromatischen oder hetero¬aromatischen Gruppierungen in ihrer Seitenkette flankieren. Mittels Fluoreszenz-Resonanz¬energietransfersichtung (FRET-Assay) wurde eine Vorauswahl der Liganden vorgenommen und die Interaktionen der ausgewählten Liganden mit der RNA per NMR-Spektroskopie konkretisiert. Eine intensive strukturelle Untersuchung des Liganden mit einer Pyrimidinylgruppe in der Seitenkette der zentralen Aminosäure in Komplex mit der TAR RNA ergab eine 2:1 Bindungsstöchiometrie des Liganden. Die erste stärkere Bindungsstelle im Bulge der RNA war bereits weitgehend bekannt als Ziel von Arginin-tragenden Liganden. Die strukturellen Untersuchungen konnten jedoch auch die zweite Bindungsstelle des Tripeptids unterhalb des Bulges lokalisieren. Zuletzt sind die zwei Publikationen zur Untersuchung der RNA-Dynamik zusammengefasst. Aus autokorrelierten Relaxationsraten der Kerne C1’ und C8 (für Purine) bzw. C6 (für Pyrimidine) in Nukleotiden der RNA Tetraloopsequenzen UUCG und CACG wurden mittels des Model-Free Formalismus Parameter abgeleitet, die über Dynamiken auf der Zeitskala von Pico- bis Nanosekunden der C-H Vektoren berichten. Die Verwendung optimierter und neuer Werte der C-H Bindungslänge und der Anisotropie der 13C-chemischen Verschiebung (13C-CSA) ermöglichte eine genauere Ableitung der inhärenten Dynamiken dieser RNA Moleküle. Diese Informationen konnten in die strukturellen Untersuchungen der glykosidischen Bindung durch kreuzkorrelierte Relaxationsraten eingebaut werden. Des Weiteren konnten die dynamischen Parameter bei verschiedenen Temperaturen mit Parametern abgeglichen werden, die aus Molekular-Dynamischen (MD) Trajektorien abgeleitet wurden. Dies ermöglichte die Visualisierung der internen Bewegungen zweier strukturell ähnlicher Tetraloops aus der YNMG-Familie, die sich aber in ihrer Stabilität unterscheiden. Bei Temperaturen nahe dem Schmelzpunkt des weniger stabilen CACG-Tetraloops offenbarten sich die Änderungen in der Dynamik, die zum Aufschmelzen des Loops führen
Fürst Casimir : Operette in drei Akten; Text der Gesänge
No full textvon Max Neal und Max Ferner. Musik von C. M. Ziehre
Ferner, Dorothy W.
No full textBody cremated. Raymond C. Ferner- husbandhttps://stars.library.ucf.edu/cfm-ch-memoranda-1939/1113/thumbnail.jp
Global games and general claims: locating the contribution of Kristensen and Zeitlin.
No full textThis is a pre-copy-editing, author-produced PDF of an article accepted for publication in Socio-Economic Review following peer review. The definitive publisher-authenticated version Ferner, A.M. (2008) Global games and general claims: locating the contribution of Kristensen and Zeitlin. Socio-Economic Review, 6 (2) pp. 379-384. is available online at: http://dx.doi.org/doi:10.1093/ser/mwn00
Acting for women: A social psychological approach to women's political decisions and identity
No full textRelevamiento, identificación y evaluación de riesgos en sector de inyecto soplado de industria alimenticia
No full textLos objetivos del siguiente proyecto son los siguientes:
• Identificar de manera adecuada los riesgos presentes en el puesto de
trabajo en la cual se desarrollará el proyecto.
• Evaluar los riesgos identificados.
• Implementar medidas preventivas y correctivas con el fin de prevenir
incidentes, accidentes, y/o el desarrollo de enfermedades profesionales
del operario del puesto. El puesto de trabajo en el cual se desarrollará este proyecto final es la sala de Inyecto-soplado de saleros. Donde una (1) persona es operario de 2 (dos) maquinas Inyecto-sopladoras las cuales realizan la fabricación de los envases de sal (Saleros) partiendo desde un pellet de polietileno.
Se analizará cada elemento del proceso, partiendo desde la búsqueda de la materia prima (bolsas de pellet de 25 kg c/u) en el depósito de insumos utilizando un autoelevador, hasta su finalización de producto terminado. También se relevará el cambio de formato de la inyecto-sopladora (Cambio de moldes, despiece de la misma) ya que el operario debe reemplazar piezas de gran peso y tamaño desde el interior de la máquina, lo que demanda sobre esfuerzos, malas posturas, posiciones incomodas de trabajo, y exposición a altas temperatura de las piezas.
Se desarrollarán medidas correctivas para cada riesgo detectado, así como también un estudio de costos de las medidas a implementar.Fil: Ferner, Jeremías. Universidad FASTA. Facultad de Ingeniería; Argentina.Fil: Velázquez, Claudio Fernando. Universidad FASTA. Facultad de Ingeniería; Argentina
Multinational companies and the diffusion of employment practices from outside the country of origin explaining variation across firms
No full textThis paper analyses the issue of variation between multinational companies in the extent to which they use their foreign operating units as the origin of employment practices that are subsequently transferred across the firm.
It uses data from a nationally representative survey of MNCs in the UK and contrasts the relative influences of three sets of factors on diffusion.
The results demonstrate that while the nationality of the parent firm and the way in which the multinational is configured have only modest effects on diffusion, the organisational conduits through which the diffusion of practices can occur are central to explaining variation between firms
Complete nucleotide sequence of the circular megaplasmid pHCG3 of Oligotropha carboxidovorans: function in the chemolithoautotrophic utilization of CO, H-2 and CO2
No full textOligotropha carboxidovorans harbors the low-copy-number, circular, 133,058-bp DNA megaplasmid pHCG3, which is essential in the chemolithoautotrophic utilization of CO (carboxidotrophy), H-2 (hydrogenotrophy) and CO2 under aerobic conditions. The complete nucleotide sequence of pHCG3 revealed 125 open reading frames. Of these, 95 were identified as putative structural genes. The plasmid carries the four gene clusters cox (14.54 kb, 12 genes), ebb (13.33 kb, 13 genes), hox (23.35 kb, 19 genes plus one ORE) and tra/trb (25.01 kb, 22 genes plus 2 ORFs), which assemble the functions required for the utilization of CO, CO2 or H-2, and the conjugal transfer of the plasmid, respectively. The gene clusters cox, ebb and hox form a 51.2-kb chemolithoautotrophy module. The tra/trb cluster on the plasmid pHCG3 of O. carboxidovorans has a similar architecture as the Ti-plasmid of Agrobacterium tumefaciens. The tra/trb cluster is separated from the chemolithoautotrophy module by two regions (25.2 and 29.6 kb) with miscellaneous or mostly unknown functions. These regions carry a number of single genes coding for replication and stabilization of pHCG3 as well as the components of a putative system of global regulation of plasmid replication in O. carboxidovorans. An oriV encodes the replication proteins RepABC. Sequence comparisons of pHCG3-encoded genes suggest that major genetic exchange between O. carboxidovorans and the proteobacteria has occurred. (C) 2003 Elsevier B.V. All rights reserved
Employee representation and consultative voice in multinational companies operating in Britain
No full textMultinational companies (MNCs) from different countries of origin are widely held to have distinct preferences regarding the presence of employee representative structures and the form that employee 'voice' over management decisions takes. Such preferences are said to derive from the national models that prevail in the different countries of origin in which MNCs are based. Findings from a large-scale survey of the UK operations of MNCs indicate that country-of-origin influences on patterns of employee representation and emphasis on direct or indirect channels of employee 'voice' are attenuated by other factors, notably sector and method of growth. They also reveal significant recent innovation in representation and voice arrangements by this key group of employers
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