1,721,065 research outputs found
Investigations into anti-rotavirus activity of cranberry proanthocyanidins and this molecule's component of catechin and epicatechin
No full textFlavonoidlerin (ikincil bitki metabolitleri) duyarlı konaklardaki antiviral aktivitesi enfektivite titrasyon testi ile gösterilebilmektedir. Ancak, hücresiz test sisteminde flavonoidlerin dogrudan virus enfektivitesi/kapsit bütünlüğüne olan etkisine yönelik henüz bir çalışma bildirilmemiştir. Bu çalışma proantosiyanidin ve proantosiyanidinin yapısal olarak farklı molekül bileşenleri olan kateşin [(+)- Catechin hydrate] ve epikateşinin [(-)- Epicatechin; EC] antiviral aktivitesini belirlemek amacıyla yapılmıştır. Simian rotavirus SA-11 suşu (ATCC VR-1565) temsili bir enterik viral sistem için kullanılmıştır. Antigen capture [viral kapsid protein 6 (VP6)] enzyme immunoassay (ELISA), rotavirusun proantosiyanidin, kateşin ve epikateşin ile muamelesi sonucu viral enfektivite/kapsit bütünlüğünde meydana gelen kaybı ölçmek için kullanıldı. Rotavirus enfektivite titresi, monkey kindey (MA-104) monolayer hücre kültürleri kullanılarak tespit edilmiştir. ELISA sonucunda rotavirusa karşı antiviral etkisi belirlenen numunelerin etkili oldukları konsantrasyon ve süresinin hücrelere toksik olup olmadığı sitotoksisite testi ToxilightR Non-Destructive Cytotoxicity BioAssay (Lonza) ile belirlendi. Araştırmada, Gold labeled immunelektron mikroskopi, virus-proantosiyanidin komplekslerinin mikroskop altında inceleyebilmek için kullanılmıştır. Kırmızı kan hücreleri ve rotaviruslar arasındaki hemaglutinasyonu proantosiyanidinlerin inhibe etme yeteneklerinin olup olmadığını belirlemek için mikrohemaglütinasyon testinden yararlanılmıştır. İkiyüz ve 100 ug/ml kızılcık proantosiyanidini sırasıyla %91.8 ve %50 oranlarında virus enfektivite kaybına neden olmuştur. Proantosiyanidin bileşenlerinden flavan-3-ol monomerleri olan kateşin ve epikateşinin yüksek konsantrasyonları (5.000 ve 10.000 ug/ml) kontrol grubu ile karşılaştırıldığında en fazla %30-50'ye varan rotavirus enfektivite kaybına sebep olmuştur. İkiyüz ug/ml proantosiyanidin konsantrasyonu ile muamele edilen rotavirusların hemaglütinasyon yetenekleri üzerinde proantosiyanidinlerin inhibitör etkisi olduğu belirlenmiştir. Rotavirus antijenik determinantlarının kırmızı kan hücrelerindeki sialik asit reseptörüne bağlanmasını proantosiyanidinlerin inhibe ettiği düşünülmektedir. Gold labeled immunelektron mikroskopi çalışmasında rotavirus parçacıkları proantosiyanidinler tarafından sarıldığı, hapsolduğu Transmisyon Elektron Mikroskobunda (TEM) gözlenmiştir. Bu çalışmada kullanılan proantosiyanidinler, kateşin ve epikateşin konsantrasyonları MA-104 monolayer hücre kültüründe sitotoksisite göstermemiştir. Bu çalışmada elde edilen verilerle ilk kez hücresiz deney sistemi kullanılarak rotavirus enfektivite/kapsit bütünlüğüne olan direkt antiviral etkisi gösterilmiştir. Kateşin ve epikateşin proantosiyanidinin bileşenleri olmasına rağmen, tek tek test edildiğinde minimal etkili olduğu, bileşik haldeyken daha etkili olduğu tespit edilmiştir.Flavonoids (secondary plant metabolites) display antiviral activity upon infectivity titration testing in susceptible hosts. However, no studies have reported the direct loss of virus infectivity/virus structural integrity by flavonoids in the cell-free assay system. Accordingly, experiments were performed to determine the extent of antiviral activity by proanthocyanidins (PACs) and the structurally different PAC component molecules catechin [(+)- Catechin hydrate] and epicatechin [(-)- Epicatechin; EC]. The simian rotavirus stain SA-11 (ATCC VR-1565) was used as a representative enteric viral system. A quantitative antigen capture [viral capsid protein 6 (VP6) enzyme immunoassay assay was used to measure loss of viral infectivity/viral capsid integrity in the presence and absence of treatment regimens with PACs, catechin and EC. Rotavirus (RTV) stock titers were determined by monkey kidney epithelial (MA-104) cell culture monolayers grown in 96-well microtiter plates. Cytotoxicity testing was performed by the ?ToxilightR Non-Destructive Cytotoxicity BioAssay? (Lonza). Gold-labeled immunoelectron microscopy was performed to visualize the virus-PAC complexes. A microhemagglutination assay was used to investigate whether PACs were capable of inhibiting red blood cell (RBC) aggregation by rotavirus. Two hundred and 100 ug/ml PACs affected a direct loss of virus infectivity to 91.8 and 56% of control, respectively. PAC component flavan-3-ol monomers (i.e., catechin and EC), mandated elevated concentrations (ca., 5,000 to 10,000 ug/ml) to affect a RTV loss of infectivity approaching 30-50% of control. At a concentration of 200 ug/ml, PACs displayed an inhibitory effect upon the RTV-induced hemagglutination. These data suggest an inhibitory effect on the binding of RTV antigenic determinants to RBC sialic acid receptor sites. Utilizing gold-labeled immunoelectron microscopy technique, RTV particles were found to be shrouded within solubilized PACs and sequestered within PAC aggregates by Transmission Electron Microscopy (TEM). At the concentrations used in this study, neither PACs, catechin, nor EC, proved cytotoxic to MA-104 cells grown in monolayer culture. The data from this study show for the first time, a direct antiviral effect on rotavirus infectivity/structural integrity using a cell-free assay system. Catechin and EC, although components of PACs, were minimally effective as antiviral agents when individually tested. The components were found to be more effective when the compound
Determination of antiviral activity of resveratrol on bovine coronavirus In Vitro system and evaluation of immunological gene expression levels
No full textCoronaviruslar (CoV'ler) birçok farklı türü içinde barındıran, zarflı ve pozitif sarmallı RNA viruslarıdır. CoV'ler evcil ve yabani hayvanlarda, kümes hayvanlarında ve kemirgenlerde hafif ila şiddetli enterik, respiratorik ve sistemik hastalıklara kadar geniş bir hastalık spektrumuna sahiptir. Ayrıca insanlarda ve sığırlarda yaygın enterit tablosu, soğuk algınlığı hatta zatürreye yol açmaktadır ve özellikle sığır endüstrisinde önemli ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Son zamanlarda ortaya çıkan COVID-19 pandemisi ile birlikte viral enfeksiyonların sağlık ve ekonomi üzerindeki olumsuz etkileri küresel olarak gözlemlenmiştir ve günümüzde viral enfeksiyon dinamikleri ile immünopatogenez hakkında hala sınırlı bilgiler bulunmaktadır. Bu çalışma ile Resveratrol'ün (Rv) Bovine Coronavirus (BCoV) üzerindeki antiviral aktivitesi; replikasyon, adsorbsiyon ve seri pasajlar ile antiviral kinetiğin değerlendirilmesi olacak şekilde 3 farklı yöntemin kullanımı ile değerlendirilirken, Rv'nin bağışıklık yanıtı üzerinde gerçekleştirdiği etkilerin immunolojik gen ifadesi analizleri için 2–∆∆Ct metodu kullanıldı. Üç tekrarlı gerçekleştirilen çalışmanın test sonuçları neticesinde, 70 μM Rv'nin BCoV replikasyonunu %99'a kadar inhibe edebileceği görüldü ve virusun adsorbsiyon süreci üzerinde herhangi bir anlamlı etki oluşturmadığı belirlendi. Ayrıca, yapılan immunolojik gen ifadesi analizleri ile Rv'nin, proinflamatuar sitokinler ve MHC-I seviyeleri üzerine etki edebileceği tespit edildi. Özellikle BCoV ile enfekte hücrelerde yükselen IL-6 seviyelerinin ortama verilen 70 µM Rv ile önemli ölçüde azaldığı ve MHC-1 ile IFN-β gen ifadesi seviyelerinde ise indükleyici bir etki oluşturduğu belirlendi. Sonuç olarak, Rv'nin BCoV enfeksiyonlarında potansiyel bir fitoterapötik madde olabileceği ve bağışıklık sistemini regüle eden destekleyici bir ajan olarak kullanılabileceği öngörülmektedir.Coronaviruses (CoVs) are enveloped, positive-sense RNA viruses that encompass many different species. CoVs have a wide spectrum of disease manifestations, ranging from mild to severe enteric, respiratory, and systemic diseases in domestic and wild animals, poultry, and rodents. In addition, they cause widespread enteritis, the common cold, and even pneumonia in humans and cattle, leading to significant economic losses, particularly in the cattle industry. With the recent emergence of the COVID-19 pandemic, the adverse effects of viral infections on health and the economy have been globally observed, and there is still limited information about the dynamics of viral infections and immunopathogenesis. This study evaluates the antiviral activity of Resveratrol (Rv) against Bovine Coronavirus (BCoV) using three different methods: replication, adsorption, and serial passages to assess antiviral kinetics. In addition The effects of Rv on the immune response were assessed using the 2–∆∆Ct method for immunological gene expression analyses. The test results of the study, conducted in triplicate, showed that 70 μM Rv could inhibit BCoV replication by up to 99% and had no significant effect on the virus adsorption process. Additionally, immunological gene expression analyses revealed that Rv could affect pro-inflammatory cytokines and MHC-I levels. Specifically, elevated IL-6 levels in BCoV-infected cells were significantly reduced by 70 µM Rv, and there was an inductive effect on MHC-1 and IFN-β gene expression levels. In conclusion, Rv is suggested to be a potential phytotherapeutic agent in BCoV infections and may be used as a supportive agent that regulates the immune system.Bu araştırma Selçuk Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü tarafından 21212032 proje numarası ile desteklenmiştir
Comparative diagnosis of BOHV-1 infection by Real-time PCR and LAMP methods and subtyping
No full textBovine Herpesvirus 1 (BoHV-1) dünya çapında dağılım gösteren, subklinik, hafif veya şiddetli bir hastalık olarak ortaya çıkan önemli bir sığır patojenidir. Solunum, genital, oküler ve ensefalomiyelit formunda geniş ölçüde değişebilen klinik bulgulara sahiptir. Bu çalışmada, Konya YILET Et Entegre Tesislerine kesime getirilen solunum sistemi klinik bulguları gösteren 150 adet sığırdan nazal swap örnekleri alınmıştır. Örneklerin nükleik asit ekstraksiyonu yapıldıktan sonra maliyet, zaman ve pratikliği açısından daha avantajlı olduğu bildirilen LoopMediatedIsothermalAmplification (LAMP) metodu ile Real-Time PCR (PolymeraseChainReaction) metodu karşılaştırılmıştır. Her iki testte de BoHV-1 pozitif çıkan numunelerin, Madin-DarbyBovineKidneycells (MDBK) hücre kültürüne ekimleri yapılmıştır. İzole edilebilen örneklerin moleküler karakterizasyonunun belirlenmesi için konvansiyonel PCR uygulanmıştır. Araştırmada kullanılan nazal swap örneklerinden 8 adedi (%5,33) Real-Time PCR testi ile pozitif olarak belirlenirken, 13 adedi (%8,66) LAMP testi ile pozitif olarak belirlenmiştir. Yapılan McNemar testi sonucuna göre LAMP ve Real-Time PCR testleri arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark olmadığı (p˃0,05) belirlendi. Hücre kültürüne ekimi yapılan 8 adet örnekten 3'ünde BoHV-1 izole edildi. Bu 3 örneğin PCR işleminden sonra yapılan sekans analizinde, izolatların moleküler karakterizasyonu yapılarak, BoHV-1.1 alt tipe ait olduğu belirlendi.Sonuç olarak BoHV-1 enfeksiyonunun hızlı tanısında LAMP metodunun kullanılabileceği ve enfeksiyonla mücadelede BoHV-1.1 alt tipinin göz önünde bulundurulması gerektiği kanaatine varılmıştır.Bovine Herpesvirus 1 (BoHV-1) is an important bovine pathogen with a worldwide distribution, presenting as a subclinical, mild or severe disease. It has widely varying clinical manifestations in the form of respiratory, genital, ocular and encephalomyelitis. In this study, nasal swab samples were taken from 150 cattle with respiratory clinical signs brought to Konya YILET Meat Integrated Facility for slaughter. After nucleic acid extraction of the samples, Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP) method, which is reported to be more advantageous in terms of cost, time and practicality, and Real-Time PCR (Polymerase Chain Reaction) method were compared. The samples that were positive for BoHV-1 in both tests were cultured in Madin-Darby Bovine Kidney cells (MDBK) cell culture. Conventional PCR was applied to determine the molecular characterization of the isolated samples. Among the nasal swap samples used in the study, 8 (5.33%) were positive by Real-Time PCR test, while 13 (8.66%) were positive by LAMP test. According to the McNemar test, there was no statistically significant difference between LAMP and Real-Time PCR tests (p˃0,05). BoHV-1 was isolated in 3 of 8 samples cultured in cell culture. In the sequence analysis of these 3 samples after PCR, the isolates were molecularly characterized and determined to belong to BoHV-1.1 subtype. As a result, it was concluded that LAMP method can be used in the rapid diagnosis of BoHV-1 infection and BoHV-1.1 subtype should be considered in the fight against infection.Bu araştırma Selçuk Üniversitesi Bilimsel Araştırma Proje Koordinatörlüğü tarafından 20112002 proje numarası ile desteklenmiştir
Molecular diagnosis of bovine papillomavirus-induced warts in the Konya region
No full textBovine papillomaviruslar sığırlarda papillomatozis olarak adlandırılan bulaşıcı bir viral hastalığa neden olmaktadır. Bu tez çalışmasında Konya ilinde yetiştirilen sığırlarda papillomavirus varlığının moleküler varlığını ortaya koymak için yapılmıştır. Bu maksatla Konya ilinin Ahırlı, Bozkır ve Yalıhüyük ilçelerinde süt ve et üretimi amacıyla yetiştirilen 25 sığıra ait baş, boyun ve meme başı bölgelerinde gelişen toplam 25 papillom lezyonu örneklenmiştir. Bu lezyonlar, moleküler düzeyde konvansiyonel PCR yöntemi kullanılarak FAP 59/64 ve MY11/09 konsensüs primerleri ile analiz edilmiştir. FAP 59/64 primer çifti ile gerçekleştirilen analizlerde hiçbir örnekte pozitiflik saptanmazken, MY11/09 primeri ile yapılan incelemede 25 örneğin 2'sinde (%8) pozitif sonuç elde edilmiştir. Tüm örneklerde tip spesifik primerler kullanılarak gerçekleştirilen ikinci aşama analizde, 25 örneğin 24'ünde (%96) Bovine Papillomavirus (BPV) tipleri tespit edilmiştir. Hiçbir örnekte BPV-3, BPV-5 ve BPV-11 tiplerine rastlanmamıştır. Tip spesifik primerlerle belirlenen BPV tipleri; BPV-1, BPV-2, BPV-4, BPV-6, BPV-8, BPV-9, BPV-10 ve BPV-12 olarak saptanmıştır. Genel dağılımda en yaygın tipin BPV-12 (%95,83) olduğu belirlenmiştir. Tip spesifik primerler ile pozitif sonuç veren 24 örneğin 19'unda (%79,16) birden fazla BPV tipi ile ko-enfeksiyon tespit edilmiştir. Ko-enfekte örneklerde ikili, üçlü ve dörtlü tip kombinasyonlarının bulunduğu belirlenmiş olup, bunlar arasında en sık ikili ko-enfeksiyonlar (%50; 12 örnek) gözlenmiştir. Makroskobik inceleme sonucunda lezyonların %52'si tipik morfolojik formda değerlendirilmiştir. Lezyonların makroskobik görünümü, anatomik lokalizasyonu ve tespit edilen BPV tipleri arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulunmamıştır (p>0,05). Sonuç olarak Konya ilinde yetiştirilen sığırlarda papillomatozis hastalığına neden olan çeşitli BPV tiplerinin mevcut olduğu belirlenmiştir.Bovine papillomaviruses cause papillomatosis, an infectious viral disease of cattle. This study aimed to reveal the molecular presence of papillomavirus in cattle raised in the province of Konya. To this end, a total of 25 papilloma lesions that developed in the head, neck, and teat regions of 25 cattle bred for milk and meat production in Konya's Ahırlı, Bozkır, and Yalıhüyük districts were sampled. These lesions were analyzed with FAP 59/64 and MY11/09 consensus primers using the conventional PCR method at the molecular level. While no positivity was detected in any sample in the analyses performed with the FAP 59/64 primer pair, a positive result was obtained in 2 (8%) of 25 samples in the analysis performed with the MY11/09 primer. In the second stage analysis performed using type-specific primers in all samples, Bovine Papillomavirus (BPV) types were detected in 24 (96%) of 25 samples. No BPV-3, BPV-5, and BPV-11 types were found in any sample. BPV types determined by type-specific primers were BPV-1, BPV-2, BPV-4, BPV-6, BPV-8, BPV-9, BPV-10, and BPV-12. BPV-12 was determined to be the most prevalent type (95.83%) in the overall distribution. Co-infection with more than one BPV type was detected in 19 (79.16%) of 24 samples with positive results with type-specific primers. It was determined that there were binary, triple, and quadruple type combinations in the co-infected samples, and among these, binary co-infections (50%; 12 samples) were observed most frequently. As a result of macroscopic examination, 52% of the lesions were evaluated to have a typical morphological form. No statistically significant relationship was found between the macroscopic appearance and anatomical localization of the lesions and the types of BPV detected (p>0,05). The findings indicate that various BPV types causing papillomatosis disease are present in cattle raised in Konya province.Bu araştırma Selçuk Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü tarafından 23212019 Proje numarası ile desteklenmiştir
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Investigation of bovine coronavirus and bovine rotavirus by rapid diagnosis kit and RT-PCR in diarrheic calf feces
No full textDünyada ve ülkemizde ekonomik kayıplara neden olan buzağı ishallerinin en önemli etkenlerinden sığır coronavirusu (BCoV) ve sığır rotavirusu (BRV), en güvenilir tanı yöntemlerinden olan Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) ile varlığı tespit edilerek, bu yöntem ile sahada klinisyen veteriner hekimlerimizin kullandığı ticari Rota-Corona Hızlı Tanı kitlerinin duyarlılıkları karşılaştırılmıştır. Bu çalışmada; Konya ve Afyon çevresindeki sığır çiftliklerindeki ishalli buzağılardan toplanmış 96 adet dışkı örneği, BRV ve BCoV bakımından, önce Bovid-5 Ag hızlı tanı kiti ile incelenmiş sonra RT-PCR testi uygulanmıştır. Her bir dışkı örneğinden viral Ribo Nükleik Asit (RNA) izole edilmiştir, elde edilen RNA'dan Reverse Transcription System kiti kullanılarak Complementer Deoksiribo Nükleik Asit (cDNA) sentez edilmiştir. Daha sonra cDNA ürünü, PCR protokollerine uygun şekilde termocyle cihazında amplifikasyona tabi tutulmuş, elde edilen PCR ürünleri de elektroforezde incelenerek sonuçlar değerlendirmeye alınmıştır. Çalışma sonucunda; hızlı tanı kitiyle 96 dışkı örneğinin 15'inde BRV, 1'inde BCoV pozitifliği, RT-PCR tekniği ile 18 örnekte BRV, 13 örnekte BCoV pozitifliği saptanmıştır. Ayrıca RT-PCR ile incelemede 4 örnekte hem BRV hem de BCoV pozitifliği bulunmuştur. Hızlı tanı kitinin RT-PCR ile sensitivite ve spesifitesi bakımından karşılaştırılmasında; BRV'un sensitivitesi %83 - spesifitesi %100, BCoV'nin ise sensitivitesi %7,6 - spesifitesi %100 olarak tespit edilmiş olup sensitivite bakımından düşük sonuçlar elde edilmiştir. Enterik enfeksiyonlarda hastalığın seyri boyunca saçılan virus miktarındaki değişikliklere bağlı olarak hızlı tanı kitinin düşük düzeydeki virus partiküllerini saptayamaması, sensitivitenin düşük çıkmasına neden olmuştur. Bu çalışmada; çiftliklerdeki buzağı ishal vakalarında BRV ve BCoV'nin tanısında klinisyen veteriner hekimler tarafından kullanılan hızlı tanı kitlerinin duyarlığının tespiti ve Konya-Afyon çevresindeki çiftliklerde buzağı ishallerindeki BRV ve BCoV dağılımının araştırılması yapılmıştır. Bu araştırma sonucunda; veteriner hekimler tarafından, sahada hastalığın pratik ve hızlı teşhisinde hızlı tanı kitinin kullanılmasının faydalı olabileceği, fakat enfeksiyonun ileriki dönemlerinde virus sayısının azalmasıyla testin duyarlılığının düşmesinden dolayı sonuçların dikkatli yorumlanması gerektiği ortaya çıkmıştır. Enfeksiyonların tanısında kullanılan hızlı tanı kitlerinin sonuçlarının teyit edilmesi ve değerlendirilmesinde, RT-PCR gibi daha duyarlı ve teknik testlerin kullanılması koruma ve kontrole yönelik doğru çözümler üretilmesini mümkün kılacaktır.BRV and BcoV, which are the most important causes of calf diarrhea that causing economic loss in the world and in our country, were identified by Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction RT-PCR which is one of the most reliable diagnostic methods and then the sensitivity of this method was compared with the sensitivity of commercial Rota-Corona Rapid Diagnostic Kit used by our clinician veterinarians. In this study; 96 feces samples which were collected from calves with diarrhea around Konya and Afyon, were firstly examined with Bovid-5 Rapid Diagnosis Kit in terms of BRV and BCoV, and then RT-PCR test was applied. Viral Ribo Nücleic Acid (RNA) was isolated from each feces samples, Complementer Deoxyribose Nucleic Acid (cDNA) was synthesized from the obtained RNA by using the Reverse Transcription System Kit. The cDNA product was amplified in thermocycler according to PCR protocols, the obtained PCR products were examined by electrophoresis and the results were evaluated. As a result of study; by using Rapid Diagnosis kit, BRV positivity in 15 samples, BCoV positivity in 1 sample, and by using RT-PCR, BRV positivity in 18 samples, BCoV positivity in 13 samples of 96 feces sampleswere determined. Also, by using RT-PCT test, in 4 samples both BRV positivity and BCoV positivity was found. As a result of comparing the Rapid Diagnosis kit with RT-PCR in terms of sensitivity and specificity; the sensitivity and specificity of BRV were detected as 83% and 100%, respectively, and the sensitivity and specificity of BcoV were detected as 7.6% and 100%, respectively, low results were obtained in terms of sensitivity. Because of the Rapid Diagnosis kit couldn't detect low level virus particles depending on the changes in amount of scattered virus during the disease course in enteric infections, sensitivity was found low. In this study; determination of the sensitivity of Rapid Diagnosis kit used by clinician veterinarians and the distrubition of BRV and BCoV in calve diarrhea events in farms around Konya-Afyon was investigated. As a result of this research; in the practical and rapid diagnosis of the disease the using of the Rapid Diagnosis kit by clinician veterinarians may be useful, but the results must be interpreted with caution because of the sensitivity decreases due to the reduction in the number of viruses in the later stages of the infection. In confirming and evaluating of the results of Rapid Diagnosis kit using for the diagnosis of infections, the using of more sensitive and technical tests such as RT-PCR make it possible to produce correct solutions for safe and control
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
- …
