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Relier les échelles dans la symbiose mycorhizienne à arbuscules
No full textThe microscopic life of soils is responsible for large macroscopic flows of matter at a planetary scale. However, the complexity of ecosystems and the organisms that comprise them makes it difficult to scale from one level to another. The thesis titled "Linking Scales in Arbuscular Mycorrhizal Symbiosis" establishes connections between objects ranging from the size of a lipid droplet (~500nm) to the total length of fungal hyphae at a planetary scale (~10^20m).The first chapter introduces a framework for analyzing fungal colonies through 'travelling waves', connecting the microscopic scale of individual hyphal behavior to macroscopic variables such as density and propagation speed. These results constitute the first analysis of experimental data with high degree of spatiotemporal resolution of a branching organism's morphogenesis dynamics.The second details the ecological consequences of this macroscopic propagation by quantifying the resource exchange it entails. This result sheds new light on mycorrhizal science by linking phenotypic traits of fungal colonies to their impact on trade with plants in different environments.The third chapter focuses on the microscopic underpinning of bidirectional resource trade within the Arbuscular Mycorhizhal (AM) fungal colonies. It aims at characterizing the robust physical mechanisms that allow the directed transport of carbon and phosphorous over the centimeter wide colony.In an annex chapter, the results are projected at the scale of ecosystems. The work on the radius of the hyphae particularly helps to reduce the calculation uncertainty on the total biomass of mycorrhizal fungi in an ecosystem and at a planetary scale.La vie microscopique des sols est responsable de large flux macroscopique de matière à l’échelle planétaire. Mais la complexité des écosystèmes et des organismes qui les constituent rend difficile le passage d’une échelle à l’autre. La thèse intitulée "Relier les échelles dans la symbiose mycorhizienne arbusculaire" tisse des liens entre des objets allant de la taille de la gouttelette de lipide (~500nm) à la longueur totale d’hyphe de champignons à l’échelleplanétaire (~10^20 m).Le premier chapitre introduit un cadre d'analyse des colonies fongiques par des "ondes de propagation", reliant l'échelle microscopique du comportement individuel des hyphes à des variables macroscopiques telles que la densité et la vitesse de propagation. Ces résultats constituent la première analyse de données expérimentales avec un degré de résolution spatiotemporel élevé d’une dynamique de morphogénèse d’un organisme ramifié.Le chapitre 2 décrit en détail les conséquences écologiques de cette propagation macroscopique en quantifiant l’échange de ressources qu’elle implique. Ce résultat jette un éclairage nouveau sur la science des mycorhizes en permettant de relier des traits phénotypiques de colonies de champignon à leur conséquence sur la croissance des plantes dans différents environnements. Le troisième chapitre se concentre sur le lien entre les flux de matière dans la colonie de champignons, l'allongement et l'épaississement des hyphes, mettant en lumière l'importance du transport de lipides dans ces champignons, responsables de flux significatifs de carbone à l'échelle planétaire. Enfin, dans un chapitre annexe les résultats sont projetés à l’échelle d’écosystèmes. Le travail sur le rayon des hyphes permet en particulier de réduire l’incertitude de calcul sur la biomasse totale de champignon mycorhiziens dans un écosystème et à Arbuscule à l’échelle planétaire
Relier les échelles dans la symbiose mycorhizienne à arbuscules
No full textLa vie microscopique des sols est responsable de large flux macroscopique de matière à l’échelle planétaire. Mais la complexité des écosystèmes et des organismes qui les constituent rend difficile le passage d’une échelle à l’autre. La thèse intitulée "Relier les échelles dans la symbiose mycorhizienne arbusculaire" tisse des liens entre des objets allant de la taille de la gouttelette de lipide (~500nm) à la longueur totale d’hyphe de champignons à l’échelleplanétaire (~10^20 m).Le premier chapitre introduit un cadre d'analyse des colonies fongiques par des "ondes de propagation", reliant l'échelle microscopique du comportement individuel des hyphes à des variables macroscopiques telles que la densité et la vitesse de propagation. Ces résultats constituent la première analyse de données expérimentales avec un degré de résolution spatiotemporel élevé d’une dynamique de morphogénèse d’un organisme ramifié.Le chapitre 2 décrit en détail les conséquences écologiques de cette propagation macroscopique en quantifiant l’échange de ressources qu’elle implique. Ce résultat jette un éclairage nouveau sur la science des mycorhizes en permettant de relier des traits phénotypiques de colonies de champignon à leur conséquence sur la croissance des plantes dans différents environnements. Le troisième chapitre se concentre sur le lien entre les flux de matière dans la colonie de champignons, l'allongement et l'épaississement des hyphes, mettant en lumière l'importance du transport de lipides dans ces champignons, responsables de flux significatifs de carbone à l'échelle planétaire. Enfin, dans un chapitre annexe les résultats sont projetés à l’échelle d’écosystèmes. Le travail sur le rayon des hyphes permet en particulier de réduire l’incertitude de calcul sur la biomasse totale de champignon mycorhiziens dans un écosystème et à Arbuscule à l’échelle planétaire.The microscopic life of soils is responsible for large macroscopic flows of matter at a planetary scale. However, the complexity of ecosystems and the organisms that comprise them makes it difficult to scale from one level to another. The thesis titled "Linking Scales in Arbuscular Mycorrhizal Symbiosis" establishes connections between objects ranging from the size of a lipid droplet (~500nm) to the total length of fungal hyphae at a planetary scale (~10^20m).The first chapter introduces a framework for analyzing fungal colonies through 'travelling waves', connecting the microscopic scale of individual hyphal behavior to macroscopic variables such as density and propagation speed. These results constitute the first analysis of experimental data with high degree of spatiotemporal resolution of a branching organism's morphogenesis dynamics.The second details the ecological consequences of this macroscopic propagation by quantifying the resource exchange it entails. This result sheds new light on mycorrhizal science by linking phenotypic traits of fungal colonies to their impact on trade with plants in different environments.The third chapter focuses on the microscopic underpinning of bidirectional resource trade within the Arbuscular Mycorhizhal (AM) fungal colonies. It aims at characterizing the robust physical mechanisms that allow the directed transport of carbon and phosphorous over the centimeter wide colony.In an annex chapter, the results are projected at the scale of ecosystems. The work on the radius of the hyphae particularly helps to reduce the calculation uncertainty on the total biomass of mycorrhizal fungi in an ecosystem and at a planetary scale
Relier les échelles dans la symbiose mycorhizienne à arbuscules
No full textThe microscopic life of soils is responsible for large macroscopic flows of matter at a planetary scale. However, the complexity of ecosystems and the organisms that comprise them makes it difficult to scale from one level to another. The thesis titled "Linking Scales in Arbuscular Mycorrhizal Symbiosis" establishes connections between objects ranging from the size of a lipid droplet (~500nm) to the total length of fungal hyphae at a planetary scale (~10^20m).The first chapter introduces a framework for analyzing fungal colonies through 'travelling waves', connecting the microscopic scale of individual hyphal behavior to macroscopic variables such as density and propagation speed. These results constitute the first analysis of experimental data with high degree of spatiotemporal resolution of a branching organism's morphogenesis dynamics.The second details the ecological consequences of this macroscopic propagation by quantifying the resource exchange it entails. This result sheds new light on mycorrhizal science by linking phenotypic traits of fungal colonies to their impact on trade with plants in different environments.The third chapter focuses on the microscopic underpinning of bidirectional resource trade within the Arbuscular Mycorhizhal (AM) fungal colonies. It aims at characterizing the robust physical mechanisms that allow the directed transport of carbon and phosphorous over the centimeter wide colony.In an annex chapter, the results are projected at the scale of ecosystems. The work on the radius of the hyphae particularly helps to reduce the calculation uncertainty on the total biomass of mycorrhizal fungi in an ecosystem and at a planetary scale.La vie microscopique des sols est responsable de large flux macroscopique de matière à l’échelle planétaire. Mais la complexité des écosystèmes et des organismes qui les constituent rend difficile le passage d’une échelle à l’autre. La thèse intitulée "Relier les échelles dans la symbiose mycorhizienne arbusculaire" tisse des liens entre des objets allant de la taille de la gouttelette de lipide (~500nm) à la longueur totale d’hyphe de champignons à l’échelleplanétaire (~10^20 m).Le premier chapitre introduit un cadre d'analyse des colonies fongiques par des "ondes de propagation", reliant l'échelle microscopique du comportement individuel des hyphes à des variables macroscopiques telles que la densité et la vitesse de propagation. Ces résultats constituent la première analyse de données expérimentales avec un degré de résolution spatiotemporel élevé d’une dynamique de morphogénèse d’un organisme ramifié.Le chapitre 2 décrit en détail les conséquences écologiques de cette propagation macroscopique en quantifiant l’échange de ressources qu’elle implique. Ce résultat jette un éclairage nouveau sur la science des mycorhizes en permettant de relier des traits phénotypiques de colonies de champignon à leur conséquence sur la croissance des plantes dans différents environnements. Le troisième chapitre se concentre sur le lien entre les flux de matière dans la colonie de champignons, l'allongement et l'épaississement des hyphes, mettant en lumière l'importance du transport de lipides dans ces champignons, responsables de flux significatifs de carbone à l'échelle planétaire. Enfin, dans un chapitre annexe les résultats sont projetés à l’échelle d’écosystèmes. Le travail sur le rayon des hyphes permet en particulier de réduire l’incertitude de calcul sur la biomasse totale de champignon mycorhiziens dans un écosystème et à Arbuscule à l’échelle planétaire
Relier les échelles dans la symbiose mycorhizienne à arbuscules
No full textThe microscopic life of soils is responsible for large macroscopic flows of matter at a planetary scale. However, the complexity of ecosystems and the organisms that comprise them makes it difficult to scale from one level to another. The thesis titled "Linking Scales in Arbuscular Mycorrhizal Symbiosis" establishes connections between objects ranging from the size of a lipid droplet (~500nm) to the total length of fungal hyphae at a planetary scale (~10^20m).The first chapter introduces a framework for analyzing fungal colonies through 'travelling waves', connecting the microscopic scale of individual hyphal behavior to macroscopic variables such as density and propagation speed. These results constitute the first analysis of experimental data with high degree of spatiotemporal resolution of a branching organism's morphogenesis dynamics.The second details the ecological consequences of this macroscopic propagation by quantifying the resource exchange it entails. This result sheds new light on mycorrhizal science by linking phenotypic traits of fungal colonies to their impact on trade with plants in different environments.The third chapter focuses on the microscopic underpinning of bidirectional resource trade within the Arbuscular Mycorhizhal (AM) fungal colonies. It aims at characterizing the robust physical mechanisms that allow the directed transport of carbon and phosphorous over the centimeter wide colony.In an annex chapter, the results are projected at the scale of ecosystems. The work on the radius of the hyphae particularly helps to reduce the calculation uncertainty on the total biomass of mycorrhizal fungi in an ecosystem and at a planetary scale.La vie microscopique des sols est responsable de large flux macroscopique de matière à l’échelle planétaire. Mais la complexité des écosystèmes et des organismes qui les constituent rend difficile le passage d’une échelle à l’autre. La thèse intitulée "Relier les échelles dans la symbiose mycorhizienne arbusculaire" tisse des liens entre des objets allant de la taille de la gouttelette de lipide (~500nm) à la longueur totale d’hyphe de champignons à l’échelleplanétaire (~10^20 m).Le premier chapitre introduit un cadre d'analyse des colonies fongiques par des "ondes de propagation", reliant l'échelle microscopique du comportement individuel des hyphes à des variables macroscopiques telles que la densité et la vitesse de propagation. Ces résultats constituent la première analyse de données expérimentales avec un degré de résolution spatiotemporel élevé d’une dynamique de morphogénèse d’un organisme ramifié.Le chapitre 2 décrit en détail les conséquences écologiques de cette propagation macroscopique en quantifiant l’échange de ressources qu’elle implique. Ce résultat jette un éclairage nouveau sur la science des mycorhizes en permettant de relier des traits phénotypiques de colonies de champignon à leur conséquence sur la croissance des plantes dans différents environnements. Le troisième chapitre se concentre sur le lien entre les flux de matière dans la colonie de champignons, l'allongement et l'épaississement des hyphes, mettant en lumière l'importance du transport de lipides dans ces champignons, responsables de flux significatifs de carbone à l'échelle planétaire. Enfin, dans un chapitre annexe les résultats sont projetés à l’échelle d’écosystèmes. Le travail sur le rayon des hyphes permet en particulier de réduire l’incertitude de calcul sur la biomasse totale de champignon mycorhiziens dans un écosystème et à Arbuscule à l’échelle planétaire
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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