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Il sistema immunitario della pianta: basi biochimiche e molecolari del riconoscimento dei patogeni e dell'attivazione delle difese della pianta
No full textDurante tutta la loro vita, le piante sono impegnate in una continua lotta con
potenziali agenti patogeni. Per essere patogenici, la maggior parte dei microbi
deve avere accesso all’interno della pianta, penetrando direttamente attraverso
la superficie della foglia o della radice o entrando attraverso ferite o
aperture naturali come gli stomi. Nelle fasi iniziali dell’infezione, il patogeno
viene contrastato da difese strutturali preformate (ad esempio la parete
cellulare della pianta) e biochimiche (ad esempio le fitoanticipine). Inoltre,
le cellule vegetali sono in grado di riconoscere rapidamente un microrganismo
potenzialmente pericoloso e attivare una vasta gamma di risposte volte
a ucciderlo e a limitarne la diffusione nell’ospite. È importante sottolineare
che le piante discriminano tra patogeni e microbi innocui o benefici, assicurando
che adeguate risposte, che sono costose per la pianta, siano indotte solo
quando necessarie. Le piante non hanno cellule immunitarie circolanti e non
hanno un sistema immunitario adattativo come nei vertebrati; invece, ogni
cellula è in grado di riconoscere la presenza di un agente patogeno, attraverso
meccanismi biochimici autonomi che assomigliano al sistema immunitario
innato degli animali. Per questo motivo, parliamo spesso della immunità innata
delle piante per descrivere il complesso di risposte di difesa che vengono
rapidamente indotte nel sito di infezione. Successivamente, si possono osservare
risposte più a lungo termine non solo nei tessuti direttamente a contatto
con l’agente patogeno, ma anche nel resto della pianta, e può verificarsi una
resistenza acquisita alle infezioni successive
Ruolo degli ormoni vegetali nella regolazione delle risposte immunitarie
No full textEssendo organismi sessili, le piante monitorano continuamente l’ambiente
che le circonda e modificano, di conseguenza, la loro crescita, sviluppo e difesa
al fine di adattarsi e ottimizzare la produttività. Le piante hanno spesso
necessità di contrastare i tentativi di invasione di diversi agenti patogeni microbici:
virus, batteri, funghi e oomiceti. Sulla base delle diverse strategie di
infezione, i fitopatogeni possono essere classificati come biotrofici o necrotrofici.
I patogeni biotrofici si moltiplicano dapprima negli spazi intercellulari
nutrendosi di cellule vegetali viventi, mentre i patogeni necrotrofici uccidono
le cellule ospiti utilizzando metaboliti tossici e quindi ottengono i nutrienti
dalle cellule morte. Durante la coevoluzione con gli agenti patogeni, le piante
hanno sviluppato sofisticati sistemi di percezione e sistemi di difesa inducibili
per limitarne l’invasione. Gli ormoni vegetali, o fitormoni, sono piccole
molecole di segnalazione endogene con diverse proprietà chimiche che svolgono
ruoli critici nell’adattamento ai cambiamenti ambientali e governano le
risposte a un’ampia varietà di stress biotici e abiotici regolando l’equilibrio tra
crescita delle piante e risposta di difesa. L’attività di un determinato ormone
dipende dalla sua biosintesi, coniugazione, trasporto a lunga e/o breve distanza,
degradazione nonché attivazione e inattivazione ormonale. Gli ormoni vegetali
comprendono etilene (ET), acido jasmonico (JA) e acido salicilico (SA)
che svolgono un ruolo centrale nella regolazione delle risposte immunitarie
delle piante. Inoltre, anche per altri ormoni vegetali, come l’auxina (acido indol-
3-acetico, IAA), l’acido abscissico (ABA), le citokinine, le gibberelline e i
brassinosteroidi (BR), ben noti per il loro ruolo nella regolazione dello sviluppo
e della crescita delle piante, è emerso recentemente un ruolo come regolatori
chiave dell’immunità delle piante. Gli ormoni vegetali interagiscono tra
di loro in complessi network per bilanciare la risposta a segnali di sviluppo e
ambientali e quindi limitare i costi di fitness associati alla difesa. I meccanismi
molecolari che regolano questi network di segnalazione ormonali sono
in gran parte sconosciuti. Inoltre, i patogeni mirano alle vie di segnalazione
ormonale per disturbare ed eludere le risposte di difesa delle piante
Structural requirements of endopolygalacturonase for the intreraction with PGIP (polygalacturonases inhibiting protein)
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The crystal structure of PGIP2 from Phaseolus vulgaris: new insight into the mode of interaction of a plant LRR protein
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Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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