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Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Développement de biomarqueurs en imagerie ultrasonore fonctionnelle (fUS) dans deux modèles précliniques de Sclérose en Plaques
No full textMultiple Sclerosis (MS) is an autoimmune disease of the central nervous system (CNS) resulting in demyelination. It is affecting 2.8 million people worldwide and it is the commonest non-traumatic disabling disease to affect young adults. Although treatments exist to manage the condition, no cure has been found to stop the progression of neurodegeneration. Many aspects of the disease have been described with Magnetic Resonance Imaging (MRI) but the underlying cause and mechanisms remain poorly understood. To develop new treatments and investigate the multiple systems impacted by MS, new imaging technologies are needed at the preclinical stage. Functional ultrasound (fUS) imaging has recently been demonstrated to robustly measure brain cerebral blood volume (CBV) dynamics as an indirect measure of neural activity. The aim of my PhD was to propose biomarkers de- and re- myelination in two animal models of MS using fUS imaging.In order to study the changes of CBV evoked by whiskers stimulation, first we developed a protocol to trigger the whiskers stimulations and reduce user-dependent variability. The parameters of the stimulation (frequency, duration of stimulation) were optimized, along with the plane of imaging through a fully-automatic ultrasound-based neuro-navigation approach. This protocol was used with other imaging modalities, such as functional connectivity and Ultrasound Localization Microscopy (ULM), in two animal models of MS. The lysolecithin (LPC) model showed poor results, probably due to the small lesion induced and the effect of the injection itself. The longitudinal study of the Cuprizone model however, showed very interesting results concerning the temporal and spatial aspects of the activation of the cortex at the early stage of the model development, at the full demyelination stage and after 2 weeks of spontaneous remyelination.Our results show that extended demyelination induced an increased hemodynamic response in the primary sensory cortex both spatially and temporally, which is coherent with fMRI data collected on MS patients. The velocity measured with ULM in penetrating arterioles was reduced in cuprizone treated mice, suggesting an alteration of the neurovascular unit.Finally, we assessed the potential of these results as strong biomarkers in a preclinical context using classification and regression models. The fUS biomarkers were able to accurately classify animals as demyelinated with high accuracy (88%), sensitivity (88%), and specificity (100%). Furthermore, these fUS measures significantly predicted the myelin level in the median corpus callosum, which is often used as an indicator of the severity of the cuprizone model. These promising results highlight the potential of fUS as a valuable tool for assessing and monitoring demyelination in preclinical research.La sclérose en plaques (SEP) est une maladie auto-immune du système nerveux central entraînant une démyélinisation. Elle touche 2,8 millions de personnes dans le monde et elle est première cause de handicap sévère non traumatique chez les jeunes adultes. Bien que des traitements existent pour gérer la maladie, aucun remède n'a été trouvé pour arrêter la neurodégénérescence progressive. De nombreux aspects de la maladie ont été décrits avec l'imagerie par résonance magnétique (IRM), mais sa cause sous-jacente et ses mécanismes restent mal compris. Pour développer de nouveaux traitements et étudier les différents aspects de la SEP, de nouvelles technologies d'imagerie sont nécessaires au stade préclinique. L’imagerie par ultrasons fonctionnels (fUS) a déjà été utilisée pour mesurer indirectement l’activité du cerveau en suivant les changements de volume sanguin cérébral (CBV). Le but de cette thèse était d'identifier les biomarqueurs de la démyélinisation et remyélinisation dans deux modèles animaux de la SEP grâce à l’imagerie fUS.De façon à étudier les altérations de réponse fonctionnelle à la stimulation de la moustache, nous avons d’abord développé un protocole pour stimuler automatiquement les moustaches et réduire la variabilité due à l'utilisateur. Les paramètres de la stimulation (fréquence, durée de stimulation) ont été optimisés, ainsi que le plan d'imagerie grâce à une approche de neuro-navigation automatique basée sur les ultrasons. Enfin, ce protocole a été utilisé avec d’autres modalités d’imagerie, telles que la connectivité fonctionnelle et la Microscopie de Localisation Ultrasonore (ULM) dans deux modèles animaux de la SEP. Le modèle lysolécithine (LPC) n’a pas montré de résultats satisfaisants, ce qui est probablement dû à la petite taille de la lésion induite et à l’effet de l’injection elle-même. Cependant, l’étude longitudinale du modèle Cuprizone a montré des résultats très intéressants, autant sur les aspects temporels que spatiaux de l'activation du cortex au stade précoce du développement du modèle, au stade de démyélinisation complète et au stade de la remyélinisation spontanée.Nos résultats montrent une augmentation de la réponse fonctionnelle dans le cortex somatosensoriel, sur le plan spatial et temporel, exclusivement au stade de la démyélinisation complète. Une diminution de la vitesse de flux sanguin dans les artérioles pénétrantes a aussi été mesurée avec l’ULM, suggérant une altération du couplage neurovasculaire.Enfin, nous avons évalué le potentiel de ces résultats en tant que biomarqueurs robustes dans un contexte préclinique en utilisant des modèles de classification et de régression. Les biomarqueurs fUS ont été capables de classifier les animaux comme démyélinisés avec une grande précision (88%), sensibilité (88%) et spécificité (100%). De plus, ces mesures fUS ont prédit de manière significative le niveau de myéline dans le corps calleux médian, souvent utilisé comme indicateur de la sévérité du modèle cuprizone. Ces résultats prometteurs mettent en évidence le potentiel du fUS à évaluer et surveiller la démyélinisation dans la recherche préclinique
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Développement de biomarqueurs en imagerie ultrasonore fonctionnelle (fUS) dans deux modèles précliniques de Sclérose en Plaques
No full textMultiple Sclerosis (MS) is an autoimmune disease of the central nervous system (CNS) resulting in demyelination. It is affecting 2.8 million people worldwide and it is the commonest non-traumatic disabling disease to affect young adults. Although treatments exist to manage the condition, no cure has been found to stop the progression of neurodegeneration. Many aspects of the disease have been described with Magnetic Resonance Imaging (MRI) but the underlying cause and mechanisms remain poorly understood. To develop new treatments and investigate the multiple systems impacted by MS, new imaging technologies are needed at the preclinical stage. Functional ultrasound (fUS) imaging has recently been demonstrated to robustly measure brain cerebral blood volume (CBV) dynamics as an indirect measure of neural activity. The aim of my PhD was to propose biomarkers de- and re- myelination in two animal models of MS using fUS imaging.In order to study the changes of CBV evoked by whiskers stimulation, first we developed a protocol to trigger the whiskers stimulations and reduce user-dependent variability. The parameters of the stimulation (frequency, duration of stimulation) were optimized, along with the plane of imaging through a fully-automatic ultrasound-based neuro-navigation approach. This protocol was used with other imaging modalities, such as functional connectivity and Ultrasound Localization Microscopy (ULM), in two animal models of MS. The lysolecithin (LPC) model showed poor results, probably due to the small lesion induced and the effect of the injection itself. The longitudinal study of the Cuprizone model however, showed very interesting results concerning the temporal and spatial aspects of the activation of the cortex at the early stage of the model development, at the full demyelination stage and after 2 weeks of spontaneous remyelination.Our results show that extended demyelination induced an increased hemodynamic response in the primary sensory cortex both spatially and temporally, which is coherent with fMRI data collected on MS patients. The velocity measured with ULM in penetrating arterioles was reduced in cuprizone treated mice, suggesting an alteration of the neurovascular unit.Finally, we assessed the potential of these results as strong biomarkers in a preclinical context using classification and regression models. The fUS biomarkers were able to accurately classify animals as demyelinated with high accuracy (88%), sensitivity (88%), and specificity (100%). Furthermore, these fUS measures significantly predicted the myelin level in the median corpus callosum, which is often used as an indicator of the severity of the cuprizone model. These promising results highlight the potential of fUS as a valuable tool for assessing and monitoring demyelination in preclinical research.La sclérose en plaques (SEP) est une maladie auto-immune du système nerveux central entraînant une démyélinisation. Elle touche 2,8 millions de personnes dans le monde et elle est première cause de handicap sévère non traumatique chez les jeunes adultes. Bien que des traitements existent pour gérer la maladie, aucun remède n'a été trouvé pour arrêter la neurodégénérescence progressive. De nombreux aspects de la maladie ont été décrits avec l'imagerie par résonance magnétique (IRM), mais sa cause sous-jacente et ses mécanismes restent mal compris. Pour développer de nouveaux traitements et étudier les différents aspects de la SEP, de nouvelles technologies d'imagerie sont nécessaires au stade préclinique. L’imagerie par ultrasons fonctionnels (fUS) a déjà été utilisée pour mesurer indirectement l’activité du cerveau en suivant les changements de volume sanguin cérébral (CBV). Le but de cette thèse était d'identifier les biomarqueurs de la démyélinisation et remyélinisation dans deux modèles animaux de la SEP grâce à l’imagerie fUS.De façon à étudier les altérations de réponse fonctionnelle à la stimulation de la moustache, nous avons d’abord développé un protocole pour stimuler automatiquement les moustaches et réduire la variabilité due à l'utilisateur. Les paramètres de la stimulation (fréquence, durée de stimulation) ont été optimisés, ainsi que le plan d'imagerie grâce à une approche de neuro-navigation automatique basée sur les ultrasons. Enfin, ce protocole a été utilisé avec d’autres modalités d’imagerie, telles que la connectivité fonctionnelle et la Microscopie de Localisation Ultrasonore (ULM) dans deux modèles animaux de la SEP. Le modèle lysolécithine (LPC) n’a pas montré de résultats satisfaisants, ce qui est probablement dû à la petite taille de la lésion induite et à l’effet de l’injection elle-même. Cependant, l’étude longitudinale du modèle Cuprizone a montré des résultats très intéressants, autant sur les aspects temporels que spatiaux de l'activation du cortex au stade précoce du développement du modèle, au stade de démyélinisation complète et au stade de la remyélinisation spontanée.Nos résultats montrent une augmentation de la réponse fonctionnelle dans le cortex somatosensoriel, sur le plan spatial et temporel, exclusivement au stade de la démyélinisation complète. Une diminution de la vitesse de flux sanguin dans les artérioles pénétrantes a aussi été mesurée avec l’ULM, suggérant une altération du couplage neurovasculaire.Enfin, nous avons évalué le potentiel de ces résultats en tant que biomarqueurs robustes dans un contexte préclinique en utilisant des modèles de classification et de régression. Les biomarqueurs fUS ont été capables de classifier les animaux comme démyélinisés avec une grande précision (88%), sensibilité (88%) et spécificité (100%). De plus, ces mesures fUS ont prédit de manière significative le niveau de myéline dans le corps calleux médian, souvent utilisé comme indicateur de la sévérité du modèle cuprizone. Ces résultats prometteurs mettent en évidence le potentiel du fUS à évaluer et surveiller la démyélinisation dans la recherche préclinique
Développement de biomarqueurs en imagerie ultrasonore fonctionnelle (fUS) dans deux modèles précliniques de Sclérose en Plaques
No full textMultiple Sclerosis (MS) is an autoimmune disease of the central nervous system (CNS) resulting in demyelination. It is affecting 2.8 million people worldwide and it is the commonest non-traumatic disabling disease to affect young adults. Although treatments exist to manage the condition, no cure has been found to stop the progression of neurodegeneration. Many aspects of the disease have been described with Magnetic Resonance Imaging (MRI) but the underlying cause and mechanisms remain poorly understood. To develop new treatments and investigate the multiple systems impacted by MS, new imaging technologies are needed at the preclinical stage. Functional ultrasound (fUS) imaging has recently been demonstrated to robustly measure brain cerebral blood volume (CBV) dynamics as an indirect measure of neural activity. The aim of my PhD was to propose biomarkers de- and re- myelination in two animal models of MS using fUS imaging.In order to study the changes of CBV evoked by whiskers stimulation, first we developed a protocol to trigger the whiskers stimulations and reduce user-dependent variability. The parameters of the stimulation (frequency, duration of stimulation) were optimized, along with the plane of imaging through a fully-automatic ultrasound-based neuro-navigation approach. This protocol was used with other imaging modalities, such as functional connectivity and Ultrasound Localization Microscopy (ULM), in two animal models of MS. The lysolecithin (LPC) model showed poor results, probably due to the small lesion induced and the effect of the injection itself. The longitudinal study of the Cuprizone model however, showed very interesting results concerning the temporal and spatial aspects of the activation of the cortex at the early stage of the model development, at the full demyelination stage and after 2 weeks of spontaneous remyelination.Our results show that extended demyelination induced an increased hemodynamic response in the primary sensory cortex both spatially and temporally, which is coherent with fMRI data collected on MS patients. The velocity measured with ULM in penetrating arterioles was reduced in cuprizone treated mice, suggesting an alteration of the neurovascular unit.Finally, we assessed the potential of these results as strong biomarkers in a preclinical context using classification and regression models. The fUS biomarkers were able to accurately classify animals as demyelinated with high accuracy (88%), sensitivity (88%), and specificity (100%). Furthermore, these fUS measures significantly predicted the myelin level in the median corpus callosum, which is often used as an indicator of the severity of the cuprizone model. These promising results highlight the potential of fUS as a valuable tool for assessing and monitoring demyelination in preclinical research.La sclérose en plaques (SEP) est une maladie auto-immune du système nerveux central entraînant une démyélinisation. Elle touche 2,8 millions de personnes dans le monde et elle est première cause de handicap sévère non traumatique chez les jeunes adultes. Bien que des traitements existent pour gérer la maladie, aucun remède n'a été trouvé pour arrêter la neurodégénérescence progressive. De nombreux aspects de la maladie ont été décrits avec l'imagerie par résonance magnétique (IRM), mais sa cause sous-jacente et ses mécanismes restent mal compris. Pour développer de nouveaux traitements et étudier les différents aspects de la SEP, de nouvelles technologies d'imagerie sont nécessaires au stade préclinique. L’imagerie par ultrasons fonctionnels (fUS) a déjà été utilisée pour mesurer indirectement l’activité du cerveau en suivant les changements de volume sanguin cérébral (CBV). Le but de cette thèse était d'identifier les biomarqueurs de la démyélinisation et remyélinisation dans deux modèles animaux de la SEP grâce à l’imagerie fUS.De façon à étudier les altérations de réponse fonctionnelle à la stimulation de la moustache, nous avons d’abord développé un protocole pour stimuler automatiquement les moustaches et réduire la variabilité due à l'utilisateur. Les paramètres de la stimulation (fréquence, durée de stimulation) ont été optimisés, ainsi que le plan d'imagerie grâce à une approche de neuro-navigation automatique basée sur les ultrasons. Enfin, ce protocole a été utilisé avec d’autres modalités d’imagerie, telles que la connectivité fonctionnelle et la Microscopie de Localisation Ultrasonore (ULM) dans deux modèles animaux de la SEP. Le modèle lysolécithine (LPC) n’a pas montré de résultats satisfaisants, ce qui est probablement dû à la petite taille de la lésion induite et à l’effet de l’injection elle-même. Cependant, l’étude longitudinale du modèle Cuprizone a montré des résultats très intéressants, autant sur les aspects temporels que spatiaux de l'activation du cortex au stade précoce du développement du modèle, au stade de démyélinisation complète et au stade de la remyélinisation spontanée.Nos résultats montrent une augmentation de la réponse fonctionnelle dans le cortex somatosensoriel, sur le plan spatial et temporel, exclusivement au stade de la démyélinisation complète. Une diminution de la vitesse de flux sanguin dans les artérioles pénétrantes a aussi été mesurée avec l’ULM, suggérant une altération du couplage neurovasculaire.Enfin, nous avons évalué le potentiel de ces résultats en tant que biomarqueurs robustes dans un contexte préclinique en utilisant des modèles de classification et de régression. Les biomarqueurs fUS ont été capables de classifier les animaux comme démyélinisés avec une grande précision (88%), sensibilité (88%) et spécificité (100%). De plus, ces mesures fUS ont prédit de manière significative le niveau de myéline dans le corps calleux médian, souvent utilisé comme indicateur de la sévérité du modèle cuprizone. Ces résultats prometteurs mettent en évidence le potentiel du fUS à évaluer et surveiller la démyélinisation dans la recherche préclinique
Développement de biomarqueurs en imagerie ultrasonore fonctionnelle (fUS) dans deux modèles précliniques de Sclérose en Plaques
No full textMultiple Sclerosis (MS) is an autoimmune disease of the central nervous system (CNS) resulting in demyelination. It is affecting 2.8 million people worldwide and it is the commonest non-traumatic disabling disease to affect young adults. Although treatments exist to manage the condition, no cure has been found to stop the progression of neurodegeneration. Many aspects of the disease have been described with Magnetic Resonance Imaging (MRI) but the underlying cause and mechanisms remain poorly understood. To develop new treatments and investigate the multiple systems impacted by MS, new imaging technologies are needed at the preclinical stage. Functional ultrasound (fUS) imaging has recently been demonstrated to robustly measure brain cerebral blood volume (CBV) dynamics as an indirect measure of neural activity. The aim of my PhD was to propose biomarkers de- and re- myelination in two animal models of MS using fUS imaging.In order to study the changes of CBV evoked by whiskers stimulation, first we developed a protocol to trigger the whiskers stimulations and reduce user-dependent variability. The parameters of the stimulation (frequency, duration of stimulation) were optimized, along with the plane of imaging through a fully-automatic ultrasound-based neuro-navigation approach. This protocol was used with other imaging modalities, such as functional connectivity and Ultrasound Localization Microscopy (ULM), in two animal models of MS. The lysolecithin (LPC) model showed poor results, probably due to the small lesion induced and the effect of the injection itself. The longitudinal study of the Cuprizone model however, showed very interesting results concerning the temporal and spatial aspects of the activation of the cortex at the early stage of the model development, at the full demyelination stage and after 2 weeks of spontaneous remyelination.Our results show that extended demyelination induced an increased hemodynamic response in the primary sensory cortex both spatially and temporally, which is coherent with fMRI data collected on MS patients. The velocity measured with ULM in penetrating arterioles was reduced in cuprizone treated mice, suggesting an alteration of the neurovascular unit.Finally, we assessed the potential of these results as strong biomarkers in a preclinical context using classification and regression models. The fUS biomarkers were able to accurately classify animals as demyelinated with high accuracy (88%), sensitivity (88%), and specificity (100%). Furthermore, these fUS measures significantly predicted the myelin level in the median corpus callosum, which is often used as an indicator of the severity of the cuprizone model. These promising results highlight the potential of fUS as a valuable tool for assessing and monitoring demyelination in preclinical research.La sclérose en plaques (SEP) est une maladie auto-immune du système nerveux central entraînant une démyélinisation. Elle touche 2,8 millions de personnes dans le monde et elle est première cause de handicap sévère non traumatique chez les jeunes adultes. Bien que des traitements existent pour gérer la maladie, aucun remède n'a été trouvé pour arrêter la neurodégénérescence progressive. De nombreux aspects de la maladie ont été décrits avec l'imagerie par résonance magnétique (IRM), mais sa cause sous-jacente et ses mécanismes restent mal compris. Pour développer de nouveaux traitements et étudier les différents aspects de la SEP, de nouvelles technologies d'imagerie sont nécessaires au stade préclinique. L’imagerie par ultrasons fonctionnels (fUS) a déjà été utilisée pour mesurer indirectement l’activité du cerveau en suivant les changements de volume sanguin cérébral (CBV). Le but de cette thèse était d'identifier les biomarqueurs de la démyélinisation et remyélinisation dans deux modèles animaux de la SEP grâce à l’imagerie fUS.De façon à étudier les altérations de réponse fonctionnelle à la stimulation de la moustache, nous avons d’abord développé un protocole pour stimuler automatiquement les moustaches et réduire la variabilité due à l'utilisateur. Les paramètres de la stimulation (fréquence, durée de stimulation) ont été optimisés, ainsi que le plan d'imagerie grâce à une approche de neuro-navigation automatique basée sur les ultrasons. Enfin, ce protocole a été utilisé avec d’autres modalités d’imagerie, telles que la connectivité fonctionnelle et la Microscopie de Localisation Ultrasonore (ULM) dans deux modèles animaux de la SEP. Le modèle lysolécithine (LPC) n’a pas montré de résultats satisfaisants, ce qui est probablement dû à la petite taille de la lésion induite et à l’effet de l’injection elle-même. Cependant, l’étude longitudinale du modèle Cuprizone a montré des résultats très intéressants, autant sur les aspects temporels que spatiaux de l'activation du cortex au stade précoce du développement du modèle, au stade de démyélinisation complète et au stade de la remyélinisation spontanée.Nos résultats montrent une augmentation de la réponse fonctionnelle dans le cortex somatosensoriel, sur le plan spatial et temporel, exclusivement au stade de la démyélinisation complète. Une diminution de la vitesse de flux sanguin dans les artérioles pénétrantes a aussi été mesurée avec l’ULM, suggérant une altération du couplage neurovasculaire.Enfin, nous avons évalué le potentiel de ces résultats en tant que biomarqueurs robustes dans un contexte préclinique en utilisant des modèles de classification et de régression. Les biomarqueurs fUS ont été capables de classifier les animaux comme démyélinisés avec une grande précision (88%), sensibilité (88%) et spécificité (100%). De plus, ces mesures fUS ont prédit de manière significative le niveau de myéline dans le corps calleux médian, souvent utilisé comme indicateur de la sévérité du modèle cuprizone. Ces résultats prometteurs mettent en évidence le potentiel du fUS à évaluer et surveiller la démyélinisation dans la recherche préclinique
Développement de biomarqueurs en imagerie ultrasonore fonctionnelle (fUS) dans deux modèles précliniques de Sclérose en Plaques
No full textLa sclérose en plaques (SEP) est une maladie auto-immune du système nerveux central entraînant une démyélinisation. Elle touche 2,8 millions de personnes dans le monde et elle est première cause de handicap sévère non traumatique chez les jeunes adultes. Bien que des traitements existent pour gérer la maladie, aucun remède n'a été trouvé pour arrêter la neurodégénérescence progressive. De nombreux aspects de la maladie ont été décrits avec l'imagerie par résonance magnétique (IRM), mais sa cause sous-jacente et ses mécanismes restent mal compris. Pour développer de nouveaux traitements et étudier les différents aspects de la SEP, de nouvelles technologies d'imagerie sont nécessaires au stade préclinique. L’imagerie par ultrasons fonctionnels (fUS) a déjà été utilisée pour mesurer indirectement l’activité du cerveau en suivant les changements de volume sanguin cérébral (CBV). Le but de cette thèse était d'identifier les biomarqueurs de la démyélinisation et remyélinisation dans deux modèles animaux de la SEP grâce à l’imagerie fUS.De façon à étudier les altérations de réponse fonctionnelle à la stimulation de la moustache, nous avons d’abord développé un protocole pour stimuler automatiquement les moustaches et réduire la variabilité due à l'utilisateur. Les paramètres de la stimulation (fréquence, durée de stimulation) ont été optimisés, ainsi que le plan d'imagerie grâce à une approche de neuro-navigation automatique basée sur les ultrasons. Enfin, ce protocole a été utilisé avec d’autres modalités d’imagerie, telles que la connectivité fonctionnelle et la Microscopie de Localisation Ultrasonore (ULM) dans deux modèles animaux de la SEP. Le modèle lysolécithine (LPC) n’a pas montré de résultats satisfaisants, ce qui est probablement dû à la petite taille de la lésion induite et à l’effet de l’injection elle-même. Cependant, l’étude longitudinale du modèle Cuprizone a montré des résultats très intéressants, autant sur les aspects temporels que spatiaux de l'activation du cortex au stade précoce du développement du modèle, au stade de démyélinisation complète et au stade de la remyélinisation spontanée.Nos résultats montrent une augmentation de la réponse fonctionnelle dans le cortex somatosensoriel, sur le plan spatial et temporel, exclusivement au stade de la démyélinisation complète. Une diminution de la vitesse de flux sanguin dans les artérioles pénétrantes a aussi été mesurée avec l’ULM, suggérant une altération du couplage neurovasculaire.Enfin, nous avons évalué le potentiel de ces résultats en tant que biomarqueurs robustes dans un contexte préclinique en utilisant des modèles de classification et de régression. Les biomarqueurs fUS ont été capables de classifier les animaux comme démyélinisés avec une grande précision (88%), sensibilité (88%) et spécificité (100%). De plus, ces mesures fUS ont prédit de manière significative le niveau de myéline dans le corps calleux médian, souvent utilisé comme indicateur de la sévérité du modèle cuprizone. Ces résultats prometteurs mettent en évidence le potentiel du fUS à évaluer et surveiller la démyélinisation dans la recherche préclinique.Multiple Sclerosis (MS) is an autoimmune disease of the central nervous system (CNS) resulting in demyelination. It is affecting 2.8 million people worldwide and it is the commonest non-traumatic disabling disease to affect young adults. Although treatments exist to manage the condition, no cure has been found to stop the progression of neurodegeneration. Many aspects of the disease have been described with Magnetic Resonance Imaging (MRI) but the underlying cause and mechanisms remain poorly understood. To develop new treatments and investigate the multiple systems impacted by MS, new imaging technologies are needed at the preclinical stage. Functional ultrasound (fUS) imaging has recently been demonstrated to robustly measure brain cerebral blood volume (CBV) dynamics as an indirect measure of neural activity. The aim of my PhD was to propose biomarkers de- and re- myelination in two animal models of MS using fUS imaging.In order to study the changes of CBV evoked by whiskers stimulation, first we developed a protocol to trigger the whiskers stimulations and reduce user-dependent variability. The parameters of the stimulation (frequency, duration of stimulation) were optimized, along with the plane of imaging through a fully-automatic ultrasound-based neuro-navigation approach. This protocol was used with other imaging modalities, such as functional connectivity and Ultrasound Localization Microscopy (ULM), in two animal models of MS. The lysolecithin (LPC) model showed poor results, probably due to the small lesion induced and the effect of the injection itself. The longitudinal study of the Cuprizone model however, showed very interesting results concerning the temporal and spatial aspects of the activation of the cortex at the early stage of the model development, at the full demyelination stage and after 2 weeks of spontaneous remyelination.Our results show that extended demyelination induced an increased hemodynamic response in the primary sensory cortex both spatially and temporally, which is coherent with fMRI data collected on MS patients. The velocity measured with ULM in penetrating arterioles was reduced in cuprizone treated mice, suggesting an alteration of the neurovascular unit.Finally, we assessed the potential of these results as strong biomarkers in a preclinical context using classification and regression models. The fUS biomarkers were able to accurately classify animals as demyelinated with high accuracy (88%), sensitivity (88%), and specificity (100%). Furthermore, these fUS measures significantly predicted the myelin level in the median corpus callosum, which is often used as an indicator of the severity of the cuprizone model. These promising results highlight the potential of fUS as a valuable tool for assessing and monitoring demyelination in preclinical research
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
- …
