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Structural study of bacterial sporulation and bacterial cell envelope by cryo cellular electron microscopy
No full textLa sporulation bactérienne est un cycle de développement cellulaire qui induit la formation d’une spore, libérée dans l’environnement une fois mature. Au cours de ce processus de différentiation, une cellule mère et une préspore vont subir divers changements morphologiques et physiologiques, gouvernés des programmes d’expression génique spécifiques et compartimentalisés.Les spores bactériennes sont des cellules dormantes, insensibles aux antibiotiques et résistantes à des conditions environnementales extrêmes, notamment les détergents, les radiations et les hautes températures. Cette résilience rend les pathogènes sporulants difficiles à éliminer et contribue à leur persistance. L'incroyable résistance des spores est due à des structures moléculaires protectrices, telles que le revêtement extracellulaire multi-protéique appelé le manteau et la compaction de l'ADN au cœur de la spore.La grande majorité des sporulants appartient au groupe des bactéries Gram-positives, caractérisées par une enveloppe cellulaire composée d’une membrane cytoplasmique et d'une épaisse couche de peptidoglycane, un polymère de sucres et de peptides, qui protège et donne forme à la cellule, ainsi que d'acides teichoïques dont la fonction exacte est encore débattue. L'enveloppe bactérienne joue un rôle crucial dans de nombreux processus, tels que les interactions hôte-pathogène, la résistance à la pression osmotique et aux stress environnementaux.Malgré leur importance pour la survie de la cellule, les mécanismes impliqués dans la maturation de la spore et dans l'architecture de l'enveloppe ne sont pas totalement élucidés, principalement parce qu'ils impliquent des complexes macromoléculaires de dimensions nanométriques, dont l'assemblage nécessite l'environnement cellulaire. De ce fait, l’étude de ces processus nécessite des méthodes d'observation cellulaires à haute résolution.Pour répondre à ce défi et analyser l’ultrastructure de la préspore et de l'enveloppe cellulaire, j’ai utilisé des approches de microscopie électronique (ME) cellulaire, en particulier la section de cellules par sonde ionique focalisée combinée à la cryo-tomographie électronique cellulaire (cryo-FIBM/ET). Cette technique de pointe, qui révolutionne actuellement la compréhension des structures cellulaires, a permis d'obtenir des données structurales en trois dimensions, dans des états quasi-natifs et à haute résolution.L’étude en cryo-FIBM/ET a fourni des informations nanométriques sur l'assemblage des différentes couches du manteau et de toroïdes d'ADN dans les spores de Bacillus subtilis. Un accent particulier a été mis sur la compréhension de l'organisation structurale de SpoIVA, qui est la protéine du manteau la plus conservée parmi les sporulants, car elle sert de base pour fixer le manteau à la surface de la spore. La tomographie a également révélé des détails moléculaires de l'enveloppe cellulaire qui soutiennent l'existence d'un espace périplasmique chez les bactéries à Gram-positif. Dans ce contexte, nous avons étudié la contribution des acides teichoïques dans le maintien de cet espace chez B. subtilis et Streptococcus pneumoniae par diverses approches de ME cellulaire.En parallèle à ces études cellulaires, j’ai étudié la structure de SpoIIIAG en cryo-ME de particules isolées. SpoIIIAG forme un oligomère annulaire au sein du complexe macromoléculaire SpoIIIA-SpoIIQ. Cette nanomachine protéique, nécessaire au développement de la spore, serait un nouveau type de système de sécrétion reliant la cellule mère à la préspore. Nos données, acquises sur la forme totale membranaire de la protéine, ont révélé l’architecture et le positionnement des anneaux de SpoIIIAG à la surface de la membrane.L’ensemble de mes travaux, qui mettent en lumière des processus moléculaires essentiels au sein des cellules bactériennes, ouvrent la voie vers une meilleure compréhension des facteurs qui contribuent à la résistance des spores et à l'architecture de l'enveloppe cellulaire.Bacterial sporulation is a cycle of cell development that leads to the formation of a spore, released into the environment once mature. During this differentiation process, a mother cell and a forespore undergo various morphological and physiological changes, governed by specific, compartmentalized gene expression programs.Bacterial spores are dormant cells, insensitive to antibiotics and resistant to extreme environmental conditions, including detergents, radiation and high temperatures. This resilience makes spore-forming pathogens difficult to eliminate and contributes to their persistence. The incredible resistance of the spores to external aggression is due to protective molecular structures, such as the multi-protein extracellular shell known as the coat and the compaction of DNA at the core of the spore.The vast majority of spore-formers are Gram-positive bacteria, whose cell envelope is composed of a cytoplasmic membrane surrounded by a thick layer of peptidoglycan, a polymer of sugars and peptides that protects and shapes the cell, as well as teichoic acids whose exact function is still debated. The bacterial envelope plays a crucial role in many processes, such as host-pathogen interactions, resistance to osmotic pressure and environmental stresses.Despite their importance for cell survival, the mechanisms involved in spore maturation and envelope architecture are not fully elucidated, mainly because they involve macromolecular complexes of nanometric dimensions, the assembly of which requires the cellular environment. As a result, the study of these processes requires high-resolution cellular observation methods.To address this challenge and analyze the ultrastructure of the forespore and cell envelope, I used cellular electron microscopy (EM) approaches, in particular cell sectioning by focused ion beam combined with cellular electron cryo-tomography (cryo-FIBM/ET). This cutting-edge technique, which is currently revolutionizing the understanding of cellular structures at the molecular level, has provided structural data in three dimensions, in quasi-native states and at high resolution.The cryo-FIBM/ET study provided nanometric information on the assembly of the different coat layers and of DNA toroids in Bacillus subtilis forespores. Particular emphasis was placed on understanding the structural organization of SpoIVA, which is the most conserved coat protein among spore-formers, as it serves as a scaffold for attaching the coat to the spore surface. Tomography also revealed molecular details of the cell envelope that support the existence of a periplasmic space in Gram-positive bacteria. In this context, we investigated the contribution of teichoic acids in maintaining this space in B. subtilis and Streptococcus pneumoniae using various cellular EM approaches.In parallel with these cellular studies, I investigated the structure of SpoIIIAG by single-particle cryo-EM. SpoIIIAG forms a ring-shaped oligomer within the macromolecular complex SpoIIIA-SpoIIQ. This proteic nanomachine, necessary for spore development, would be a new type of secretion system linking the mother cell to the forespore. Our data, acquired on the total membrane form of the protein, revealed the architecture and positioning of SpoIIIAG rings at the membrane surface.My work as a whole, which sheds light on essential molecular processes within bacterial cells, paves the way towards a better understanding of the factors contributing to spore resistance and cell envelope architecture
Etude structurale de la sporulation bactérienne et de l'enveloppe cellulaire bactérienne par cryo-microscopie électronique cellulaire
No full textBacterial sporulation is a cycle of cell development that leads to the formation of a spore, released into the environment once mature. During this differentiation process, a mother cell and a forespore undergo various morphological and physiological changes, governed by specific, compartmentalized gene expression programs.Bacterial spores are dormant cells, insensitive to antibiotics and resistant to extreme environmental conditions, including detergents, radiation and high temperatures. This resilience makes spore-forming pathogens difficult to eliminate and contributes to their persistence. The incredible resistance of the spores to external aggression is due to protective molecular structures, such as the multi-protein extracellular shell known as the coat and the compaction of DNA at the core of the spore.The vast majority of spore-formers are Gram-positive bacteria, whose cell envelope is composed of a cytoplasmic membrane surrounded by a thick layer of peptidoglycan, a polymer of sugars and peptides that protects and shapes the cell, as well as teichoic acids whose exact function is still debated. The bacterial envelope plays a crucial role in many processes, such as host-pathogen interactions, resistance to osmotic pressure and environmental stresses.Despite their importance for cell survival, the mechanisms involved in spore maturation and envelope architecture are not fully elucidated, mainly because they involve macromolecular complexes of nanometric dimensions, the assembly of which requires the cellular environment. As a result, the study of these processes requires high-resolution cellular observation methods.To address this challenge and analyze the ultrastructure of the forespore and cell envelope, I used cellular electron microscopy (EM) approaches, in particular cell sectioning by focused ion beam combined with cellular electron cryo-tomography (cryo-FIBM/ET). This cutting-edge technique, which is currently revolutionizing the understanding of cellular structures at the molecular level, has provided structural data in three dimensions, in quasi-native states and at high resolution.The cryo-FIBM/ET study provided nanometric information on the assembly of the different coat layers and of DNA toroids in Bacillus subtilis forespores. Particular emphasis was placed on understanding the structural organization of SpoIVA, which is the most conserved coat protein among spore-formers, as it serves as a scaffold for attaching the coat to the spore surface. Tomography also revealed molecular details of the cell envelope that support the existence of a periplasmic space in Gram-positive bacteria. In this context, we investigated the contribution of teichoic acids in maintaining this space in B. subtilis and Streptococcus pneumoniae using various cellular EM approaches.In parallel with these cellular studies, I investigated the structure of SpoIIIAG by single-particle cryo-EM. SpoIIIAG forms a ring-shaped oligomer within the macromolecular complex SpoIIIA-SpoIIQ. This proteic nanomachine, necessary for spore development, would be a new type of secretion system linking the mother cell to the forespore. Our data, acquired on the total membrane form of the protein, revealed the architecture and positioning of SpoIIIAG rings at the membrane surface.My work as a whole, which sheds light on essential molecular processes within bacterial cells, paves the way towards a better understanding of the factors contributing to spore resistance and cell envelope architecture.La sporulation bactérienne est un cycle de développement cellulaire qui induit la formation d’une spore, libérée dans l’environnement une fois mature. Au cours de ce processus de différentiation, une cellule mère et une préspore vont subir divers changements morphologiques et physiologiques, gouvernés des programmes d’expression génique spécifiques et compartimentalisés.Les spores bactériennes sont des cellules dormantes, insensibles aux antibiotiques et résistantes à des conditions environnementales extrêmes, notamment les détergents, les radiations et les hautes températures. Cette résilience rend les pathogènes sporulants difficiles à éliminer et contribue à leur persistance. L'incroyable résistance des spores est due à des structures moléculaires protectrices, telles que le revêtement extracellulaire multi-protéique appelé le manteau et la compaction de l'ADN au cœur de la spore.La grande majorité des sporulants appartient au groupe des bactéries Gram-positives, caractérisées par une enveloppe cellulaire composée d’une membrane cytoplasmique et d'une épaisse couche de peptidoglycane, un polymère de sucres et de peptides, qui protège et donne forme à la cellule, ainsi que d'acides teichoïques dont la fonction exacte est encore débattue. L'enveloppe bactérienne joue un rôle crucial dans de nombreux processus, tels que les interactions hôte-pathogène, la résistance à la pression osmotique et aux stress environnementaux.Malgré leur importance pour la survie de la cellule, les mécanismes impliqués dans la maturation de la spore et dans l'architecture de l'enveloppe ne sont pas totalement élucidés, principalement parce qu'ils impliquent des complexes macromoléculaires de dimensions nanométriques, dont l'assemblage nécessite l'environnement cellulaire. De ce fait, l’étude de ces processus nécessite des méthodes d'observation cellulaires à haute résolution.Pour répondre à ce défi et analyser l’ultrastructure de la préspore et de l'enveloppe cellulaire, j’ai utilisé des approches de microscopie électronique (ME) cellulaire, en particulier la section de cellules par sonde ionique focalisée combinée à la cryo-tomographie électronique cellulaire (cryo-FIBM/ET). Cette technique de pointe, qui révolutionne actuellement la compréhension des structures cellulaires, a permis d'obtenir des données structurales en trois dimensions, dans des états quasi-natifs et à haute résolution.L’étude en cryo-FIBM/ET a fourni des informations nanométriques sur l'assemblage des différentes couches du manteau et de toroïdes d'ADN dans les spores de Bacillus subtilis. Un accent particulier a été mis sur la compréhension de l'organisation structurale de SpoIVA, qui est la protéine du manteau la plus conservée parmi les sporulants, car elle sert de base pour fixer le manteau à la surface de la spore. La tomographie a également révélé des détails moléculaires de l'enveloppe cellulaire qui soutiennent l'existence d'un espace périplasmique chez les bactéries à Gram-positif. Dans ce contexte, nous avons étudié la contribution des acides teichoïques dans le maintien de cet espace chez B. subtilis et Streptococcus pneumoniae par diverses approches de ME cellulaire.En parallèle à ces études cellulaires, j’ai étudié la structure de SpoIIIAG en cryo-ME de particules isolées. SpoIIIAG forme un oligomère annulaire au sein du complexe macromoléculaire SpoIIIA-SpoIIQ. Cette nanomachine protéique, nécessaire au développement de la spore, serait un nouveau type de système de sécrétion reliant la cellule mère à la préspore. Nos données, acquises sur la forme totale membranaire de la protéine, ont révélé l’architecture et le positionnement des anneaux de SpoIIIAG à la surface de la membrane.L’ensemble de mes travaux, qui mettent en lumière des processus moléculaires essentiels au sein des cellules bactériennes, ouvrent la voie vers une meilleure compréhension des facteurs qui contribuent à la résistance des spores et à l'architecture de l'enveloppe cellulaire
Etude structurale de la sporulation bactérienne et de l'enveloppe cellulaire bactérienne par cryo-microscopie électronique cellulaire
No full textBacterial sporulation is a cycle of cell development that leads to the formation of a spore, released into the environment once mature. During this differentiation process, a mother cell and a forespore undergo various morphological and physiological changes, governed by specific, compartmentalized gene expression programs.Bacterial spores are dormant cells, insensitive to antibiotics and resistant to extreme environmental conditions, including detergents, radiation and high temperatures. This resilience makes spore-forming pathogens difficult to eliminate and contributes to their persistence. The incredible resistance of the spores to external aggression is due to protective molecular structures, such as the multi-protein extracellular shell known as the coat and the compaction of DNA at the core of the spore.The vast majority of spore-formers are Gram-positive bacteria, whose cell envelope is composed of a cytoplasmic membrane surrounded by a thick layer of peptidoglycan, a polymer of sugars and peptides that protects and shapes the cell, as well as teichoic acids whose exact function is still debated. The bacterial envelope plays a crucial role in many processes, such as host-pathogen interactions, resistance to osmotic pressure and environmental stresses.Despite their importance for cell survival, the mechanisms involved in spore maturation and envelope architecture are not fully elucidated, mainly because they involve macromolecular complexes of nanometric dimensions, the assembly of which requires the cellular environment. As a result, the study of these processes requires high-resolution cellular observation methods.To address this challenge and analyze the ultrastructure of the forespore and cell envelope, I used cellular electron microscopy (EM) approaches, in particular cell sectioning by focused ion beam combined with cellular electron cryo-tomography (cryo-FIBM/ET). This cutting-edge technique, which is currently revolutionizing the understanding of cellular structures at the molecular level, has provided structural data in three dimensions, in quasi-native states and at high resolution.The cryo-FIBM/ET study provided nanometric information on the assembly of the different coat layers and of DNA toroids in Bacillus subtilis forespores. Particular emphasis was placed on understanding the structural organization of SpoIVA, which is the most conserved coat protein among spore-formers, as it serves as a scaffold for attaching the coat to the spore surface. Tomography also revealed molecular details of the cell envelope that support the existence of a periplasmic space in Gram-positive bacteria. In this context, we investigated the contribution of teichoic acids in maintaining this space in B. subtilis and Streptococcus pneumoniae using various cellular EM approaches.In parallel with these cellular studies, I investigated the structure of SpoIIIAG by single-particle cryo-EM. SpoIIIAG forms a ring-shaped oligomer within the macromolecular complex SpoIIIA-SpoIIQ. This proteic nanomachine, necessary for spore development, would be a new type of secretion system linking the mother cell to the forespore. Our data, acquired on the total membrane form of the protein, revealed the architecture and positioning of SpoIIIAG rings at the membrane surface.My work as a whole, which sheds light on essential molecular processes within bacterial cells, paves the way towards a better understanding of the factors contributing to spore resistance and cell envelope architecture.La sporulation bactérienne est un cycle de développement cellulaire qui induit la formation d’une spore, libérée dans l’environnement une fois mature. Au cours de ce processus de différentiation, une cellule mère et une préspore vont subir divers changements morphologiques et physiologiques, gouvernés des programmes d’expression génique spécifiques et compartimentalisés.Les spores bactériennes sont des cellules dormantes, insensibles aux antibiotiques et résistantes à des conditions environnementales extrêmes, notamment les détergents, les radiations et les hautes températures. Cette résilience rend les pathogènes sporulants difficiles à éliminer et contribue à leur persistance. L'incroyable résistance des spores est due à des structures moléculaires protectrices, telles que le revêtement extracellulaire multi-protéique appelé le manteau et la compaction de l'ADN au cœur de la spore.La grande majorité des sporulants appartient au groupe des bactéries Gram-positives, caractérisées par une enveloppe cellulaire composée d’une membrane cytoplasmique et d'une épaisse couche de peptidoglycane, un polymère de sucres et de peptides, qui protège et donne forme à la cellule, ainsi que d'acides teichoïques dont la fonction exacte est encore débattue. L'enveloppe bactérienne joue un rôle crucial dans de nombreux processus, tels que les interactions hôte-pathogène, la résistance à la pression osmotique et aux stress environnementaux.Malgré leur importance pour la survie de la cellule, les mécanismes impliqués dans la maturation de la spore et dans l'architecture de l'enveloppe ne sont pas totalement élucidés, principalement parce qu'ils impliquent des complexes macromoléculaires de dimensions nanométriques, dont l'assemblage nécessite l'environnement cellulaire. De ce fait, l’étude de ces processus nécessite des méthodes d'observation cellulaires à haute résolution.Pour répondre à ce défi et analyser l’ultrastructure de la préspore et de l'enveloppe cellulaire, j’ai utilisé des approches de microscopie électronique (ME) cellulaire, en particulier la section de cellules par sonde ionique focalisée combinée à la cryo-tomographie électronique cellulaire (cryo-FIBM/ET). Cette technique de pointe, qui révolutionne actuellement la compréhension des structures cellulaires, a permis d'obtenir des données structurales en trois dimensions, dans des états quasi-natifs et à haute résolution.L’étude en cryo-FIBM/ET a fourni des informations nanométriques sur l'assemblage des différentes couches du manteau et de toroïdes d'ADN dans les spores de Bacillus subtilis. Un accent particulier a été mis sur la compréhension de l'organisation structurale de SpoIVA, qui est la protéine du manteau la plus conservée parmi les sporulants, car elle sert de base pour fixer le manteau à la surface de la spore. La tomographie a également révélé des détails moléculaires de l'enveloppe cellulaire qui soutiennent l'existence d'un espace périplasmique chez les bactéries à Gram-positif. Dans ce contexte, nous avons étudié la contribution des acides teichoïques dans le maintien de cet espace chez B. subtilis et Streptococcus pneumoniae par diverses approches de ME cellulaire.En parallèle à ces études cellulaires, j’ai étudié la structure de SpoIIIAG en cryo-ME de particules isolées. SpoIIIAG forme un oligomère annulaire au sein du complexe macromoléculaire SpoIIIA-SpoIIQ. Cette nanomachine protéique, nécessaire au développement de la spore, serait un nouveau type de système de sécrétion reliant la cellule mère à la préspore. Nos données, acquises sur la forme totale membranaire de la protéine, ont révélé l’architecture et le positionnement des anneaux de SpoIIIAG à la surface de la membrane.L’ensemble de mes travaux, qui mettent en lumière des processus moléculaires essentiels au sein des cellules bactériennes, ouvrent la voie vers une meilleure compréhension des facteurs qui contribuent à la résistance des spores et à l'architecture de l'enveloppe cellulaire
Etude structurale de la sporulation bactérienne et de l'enveloppe cellulaire bactérienne par cryo-microscopie électronique cellulaire
No full textBacterial sporulation is a cycle of cell development that leads to the formation of a spore, released into the environment once mature. During this differentiation process, a mother cell and a forespore undergo various morphological and physiological changes, governed by specific, compartmentalized gene expression programs.Bacterial spores are dormant cells, insensitive to antibiotics and resistant to extreme environmental conditions, including detergents, radiation and high temperatures. This resilience makes spore-forming pathogens difficult to eliminate and contributes to their persistence. The incredible resistance of the spores to external aggression is due to protective molecular structures, such as the multi-protein extracellular shell known as the coat and the compaction of DNA at the core of the spore.The vast majority of spore-formers are Gram-positive bacteria, whose cell envelope is composed of a cytoplasmic membrane surrounded by a thick layer of peptidoglycan, a polymer of sugars and peptides that protects and shapes the cell, as well as teichoic acids whose exact function is still debated. The bacterial envelope plays a crucial role in many processes, such as host-pathogen interactions, resistance to osmotic pressure and environmental stresses.Despite their importance for cell survival, the mechanisms involved in spore maturation and envelope architecture are not fully elucidated, mainly because they involve macromolecular complexes of nanometric dimensions, the assembly of which requires the cellular environment. As a result, the study of these processes requires high-resolution cellular observation methods.To address this challenge and analyze the ultrastructure of the forespore and cell envelope, I used cellular electron microscopy (EM) approaches, in particular cell sectioning by focused ion beam combined with cellular electron cryo-tomography (cryo-FIBM/ET). This cutting-edge technique, which is currently revolutionizing the understanding of cellular structures at the molecular level, has provided structural data in three dimensions, in quasi-native states and at high resolution.The cryo-FIBM/ET study provided nanometric information on the assembly of the different coat layers and of DNA toroids in Bacillus subtilis forespores. Particular emphasis was placed on understanding the structural organization of SpoIVA, which is the most conserved coat protein among spore-formers, as it serves as a scaffold for attaching the coat to the spore surface. Tomography also revealed molecular details of the cell envelope that support the existence of a periplasmic space in Gram-positive bacteria. In this context, we investigated the contribution of teichoic acids in maintaining this space in B. subtilis and Streptococcus pneumoniae using various cellular EM approaches.In parallel with these cellular studies, I investigated the structure of SpoIIIAG by single-particle cryo-EM. SpoIIIAG forms a ring-shaped oligomer within the macromolecular complex SpoIIIA-SpoIIQ. This proteic nanomachine, necessary for spore development, would be a new type of secretion system linking the mother cell to the forespore. Our data, acquired on the total membrane form of the protein, revealed the architecture and positioning of SpoIIIAG rings at the membrane surface.My work as a whole, which sheds light on essential molecular processes within bacterial cells, paves the way towards a better understanding of the factors contributing to spore resistance and cell envelope architecture.La sporulation bactérienne est un cycle de développement cellulaire qui induit la formation d’une spore, libérée dans l’environnement une fois mature. Au cours de ce processus de différentiation, une cellule mère et une préspore vont subir divers changements morphologiques et physiologiques, gouvernés des programmes d’expression génique spécifiques et compartimentalisés.Les spores bactériennes sont des cellules dormantes, insensibles aux antibiotiques et résistantes à des conditions environnementales extrêmes, notamment les détergents, les radiations et les hautes températures. Cette résilience rend les pathogènes sporulants difficiles à éliminer et contribue à leur persistance. L'incroyable résistance des spores est due à des structures moléculaires protectrices, telles que le revêtement extracellulaire multi-protéique appelé le manteau et la compaction de l'ADN au cœur de la spore.La grande majorité des sporulants appartient au groupe des bactéries Gram-positives, caractérisées par une enveloppe cellulaire composée d’une membrane cytoplasmique et d'une épaisse couche de peptidoglycane, un polymère de sucres et de peptides, qui protège et donne forme à la cellule, ainsi que d'acides teichoïques dont la fonction exacte est encore débattue. L'enveloppe bactérienne joue un rôle crucial dans de nombreux processus, tels que les interactions hôte-pathogène, la résistance à la pression osmotique et aux stress environnementaux.Malgré leur importance pour la survie de la cellule, les mécanismes impliqués dans la maturation de la spore et dans l'architecture de l'enveloppe ne sont pas totalement élucidés, principalement parce qu'ils impliquent des complexes macromoléculaires de dimensions nanométriques, dont l'assemblage nécessite l'environnement cellulaire. De ce fait, l’étude de ces processus nécessite des méthodes d'observation cellulaires à haute résolution.Pour répondre à ce défi et analyser l’ultrastructure de la préspore et de l'enveloppe cellulaire, j’ai utilisé des approches de microscopie électronique (ME) cellulaire, en particulier la section de cellules par sonde ionique focalisée combinée à la cryo-tomographie électronique cellulaire (cryo-FIBM/ET). Cette technique de pointe, qui révolutionne actuellement la compréhension des structures cellulaires, a permis d'obtenir des données structurales en trois dimensions, dans des états quasi-natifs et à haute résolution.L’étude en cryo-FIBM/ET a fourni des informations nanométriques sur l'assemblage des différentes couches du manteau et de toroïdes d'ADN dans les spores de Bacillus subtilis. Un accent particulier a été mis sur la compréhension de l'organisation structurale de SpoIVA, qui est la protéine du manteau la plus conservée parmi les sporulants, car elle sert de base pour fixer le manteau à la surface de la spore. La tomographie a également révélé des détails moléculaires de l'enveloppe cellulaire qui soutiennent l'existence d'un espace périplasmique chez les bactéries à Gram-positif. Dans ce contexte, nous avons étudié la contribution des acides teichoïques dans le maintien de cet espace chez B. subtilis et Streptococcus pneumoniae par diverses approches de ME cellulaire.En parallèle à ces études cellulaires, j’ai étudié la structure de SpoIIIAG en cryo-ME de particules isolées. SpoIIIAG forme un oligomère annulaire au sein du complexe macromoléculaire SpoIIIA-SpoIIQ. Cette nanomachine protéique, nécessaire au développement de la spore, serait un nouveau type de système de sécrétion reliant la cellule mère à la préspore. Nos données, acquises sur la forme totale membranaire de la protéine, ont révélé l’architecture et le positionnement des anneaux de SpoIIIAG à la surface de la membrane.L’ensemble de mes travaux, qui mettent en lumière des processus moléculaires essentiels au sein des cellules bactériennes, ouvrent la voie vers une meilleure compréhension des facteurs qui contribuent à la résistance des spores et à l'architecture de l'enveloppe cellulaire
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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