68 research outputs found
Estimation of immune cell densities in immune cell conglomerates: an approach for high-throughput quantification.
BackgroundDetermining the correct number of positive immune cells in immunohistological sections of colorectal cancer and other tumor entities is emerging as an important clinical predictor and therapy selector for an individual patient. This task is usually obstructed by cell conglomerates of various sizes. We here show that at least in colorectal cancer the inclusion of immune cell conglomerates is indispensable for estimating reliable patient cell counts. Integrating virtual microscopy and image processing principally allows the high-throughput evaluation of complete tissue slides.Methodology/principal findingsFor such large-scale systems we demonstrate a robust quantitative image processing algorithm for the reproducible quantification of cell conglomerates on CD3 positive T cells in colorectal cancer. While isolated cells (28 to 80 microm(2)) are counted directly, the number of cells contained in a conglomerate is estimated by dividing the area of the conglomerate in thin tissues sections (ConclusionIn summary, we recommend our approach as an objective and robust strategy for quantifying immune cell densities in immunohistological sections which can be directly implemented into automated full slide image processing systems
Abstract 795: Patterns of T-cell distribution at the invasive margin of colorectal cancer liver metastases: Downstream recruitment of T cells and spatial heterogeneity
Sequential metastases of colorectal cancer: Immunophenotypes and spatial distributions of infiltrating immune cells in relation to time and treatments
The role of the immune system in the course of colorectal cancer has been elucidated in the last decade. While quantification of immune cell infiltrates within the resected specimen at diagnosis has a clear power to estimate the prognosis of the patient, the role of infiltrating immune cells within the metastatic situation and especially within the metastatic lesion itself requires further detailed analyses. Recent analyses of infiltrates in colorectal cancer liver metastases revealed a role for the infiltrate density not only for prognosis but also in the prediction of treatment response. This not only broadens the view on these infiltrates and indicates a systematic role of the local immunological microenvironment, but also raises the question how these infiltrates change during repeated courses of treatment (i.e., resection, chemotherapy, etc.). To address this question, sequential lung or sequential liver metastases of colorectal cancer patients were analyzed using whole slide image quantification after immunohistochemical staining against CD3, CD8, FOXP3, CD68 and Granzyme B. The clinical data and interventions were associated with each individual patient and the metastatic lesions. The resulting cell densities reveal a heterogeneous profile: after successful treatment of a metastatic lesion, the recurrent lesion can still have the same immunophenotype with similar cell distributions. In a situation of a favorable immune cell profile, this profile can return and apparently convey a similar favorable course throughout the disease. But also the opposite was found: the recurrent metastatic lesion could have a different profile with alterations in specific immune cell subsets over time. Further analyses are required to elucidate the different patterns and their associations to the treatment, the tumor cell phenotype and other dynamic factors. However, it is clear from this data however, that there is an immune cell plasticity that needs to be analyzed for individual patients
Hepatic metastases of colorectal cancer are rather homogeneous but differ from primary lesions in terms of immune cell infiltration
The immune system plays an important role in shaping the clinical course of colorectal cancer (CRC). However, it is still unclear how the immune infiltrates of primary CRC lesions and distant metastases by immune effector cells are related to each other. To address this issue, we quantified CD3+, CD8+ and granzyme B+ lymphocytes in primary CRC samples and corresponding liver metastases. This analysis showed that the prognostic predictions that can be drawn from the infiltration of immune cells in primary CRCs and their metastases are heterogeneous. To investigate whether such heterogeneity would also be observed within CRC hepatic metastases, the density of the immune infiltrate and cytokine production were assessed in opposite sides of the same metastatic lesion. In addition, tumor-infiltrating lymphocytes were assessed in sequential sections of the same metastatic lesion, with a spacing of 30 μm. In summary, consistent cell counts and cytokine levels were detected within the same lesion. The study of a case of synchronous metastases, however, suggested that different metastatic lesions within the same patient may be heterogeneous, perhaps indicating a major impact for local causes on tumor infiltration by immune cells. In summary, our study demonstrates a consistent degree of heterogeneity between primary tumors and hepatic metastases but an excellent intra-lesional homogeneity. These findings may be of key importance for patient stratification and the development of personalized strategies against CRC
Quantification of prognostic immune cell markers in colorectal cancer using whole slide imaging tumor maps
To analyze intratumoral heterogeneity of immune cells and the resulting impact of heterogeneity on the level of individual patient prediction
Quantification of prognostic immune cell markers in colorectal cancer using whole slide imaging tumor maps
To analyze intratumoral heterogeneity of immune cells and the resulting impact of heterogeneity on the level of individual patient prediction
Natural Killer Cells are Scarce in Colorectal Carcinoma Tissue Despite High Levels of Chemokines and Cytokines
Abstract
Purpose: Tumor infiltrating T lymphocytes in colorectal cancer (CRC) have prognostic impact, but the role of natural killer (NK) cells in CRC tissue is unclear. The contribution of intratumoral cytokines and chemokines in shaping the composition of the inflammatory lymphocytic infiltrate is also unclear.
Experimental Design: In this study, localization and densities of NK and T cells within primary CRC, CRC liver metastases, adenomas, and normal tissues were analyzed on whole tissue sections from 112 patients. In a subset of these patients, the most important 50 cytokines and chemokines were quantified in paired serum, primary CRC and adjacent mucosa samples and in CRC liver metastases and correlated with NK and T-cell infiltration, respectively.
Results: The various compartments displayed characteristic differences like significantly higher chemokine concentrations in CRC tissue. Most importantly, despite high local chemokine levels, NK cells were generally scarce within CRC tumor tissues, independent of human leukocyte antigen (HLA) class I expression. Adjacent normal mucosa contained normal levels of NK cells. In contrast, corresponding T-cell numbers varied substantially and were positively correlated with higher chemokine levels.
Conclusions: Our findings indicate a distinct regulation of NK cells versus T cells in the CRC tumor microenvironment. NK-cell migration into CRC tumor tissue is obviously impaired early during tumor development by mechanisms that do not affect T-cell infiltration. Clin Cancer Res; 17(4); 678–89. ©2011 AACR.</jats:p
‘La position problématique’: problembegrebet i fransk epistemologi
Blandt de problemfilosofiske traditioner udmærker fransk epistemologi sig ved at fokusere på problemets aktive konstruktion. Men problemets katalyserende og konkretiserende effekt skildres ofte som en spontan og intentionel skabelsesproces. Og på grund af den udbredte anti-hegelianisme i fransk tænkning, negligeres dets dialektiske karakter. Jeg argumenterer for at hegeliansk dialektisk logik må spille en væsentlig rolle for at problembegrebet kan blive virksomt for en kritisk analyse ved at se på Jacques Martin, Gaston Bachelard og Louis Althussers respektive forståelser af begrebet
Belastningsskader i håndball - forårsaket av en forventning om å trene/spille med smerter?
Oppmerksomheten mot alvorlighetsgraden og omfanget som belastningsskader i en idrettslig kontekst kan ha, har økt de siste årene. Denne studien har til hensikt å undersøke hvordan ulike psykososiale risikofaktorer kan henge sammen med risikoen for å utvikle belastningsskader i håndball. Studien belyser hvordan risikokultur, underkommunikasjon og trener-utøver relasjon spiller inn for en slik risiko.
I denne studien har 364 håndballspillere svart på et elektronisk spørreskjema. Utvalget består av både menn og kvinner i alderen 16-48 år. Videre er en bredde av nivåer representert, fra elitedivisjon og helt ned til 3.divisjon og lavere. Resultatene fra undersøkelsen presenteres hovedsakelig gjennom deskriptiv statistikk og en korrelasjonsmatrise.
Resultatene viser at litt over halvparten av utvalget sliter med belastningsskader når undersøkelsen ble gjennomført. Dette indikerer at belastningskader også et utbredt i denne studien. Både risikokultur og underkommunikasjon ser ut til å kunne sees i sammenheng med risikoen for belastningsskader ut ifra de statistiske testene. Nesten alle dimensjonene under disse faktorene viser til en statistisk sammenheng på 0.05 nivå. Derimot viste ikke analysene til noen statistisk signifikant sammenheng mellom trener-utøver relasjonen og belastningsskader. Likevel kan det argumenteres for at det kan finnes en indirekte sammenheng, sett i lys av tidligere forskning og korrelajsonsmatrisen i denne studien. Korrelasjonsmatrisen viste til en statistisk signifikant korrelasjon mellom underkommunikasjon av smerte og trener-utøver relasjonen. Tidligere forskning bygger også opp mot denne sammenhengen, at kommunikasjon er helt avgjørende i enhver relasjon.
Studien tyder på at belastningsskader er en utbredt problematikk innen håndball. Det ser ut til at både risikokultur, underkommunikasjon og trener-utøver relasjonen kan ha en sentral påvirkende rolle i denne sammenhengen. Studien indikerer at utøvere som opplever idretten som en risikokultur og som underkommuniserer smerte, kan ha en økt risiko for å utvikle belastningsskader
Den Usyngende Sanger : En undersøgelse af stemmeløse indstuderingsmetoder for klassiske sangere.
Denne bacheloropgave undersøger værdien af indstuderingsmetoder for sangere, hvor stemmen ikke anvendes. Dette indebærer metoder som musikalsk analyse, visualisering og anvendelsen af klaveret. Projektet er baseret på idéen om, at kunne optimere sangerens øvning på trods af begrænset tid eller mulighed for dette. Derfor omhandler et af opgavens hovedpunkter også, hvordan man skaber et fokus i øvningen, som effektiverer den. Dette er baseret på en tankegang om sansefuld øvning, som bl.a. er beskrevet i bøgerne “Passionate Practice” af Margret Elson og “You are your instrument” af Julie Lyonn Lieberman. Det er vigtigt for sangere at tage vare på deres stemme, og sørge for at den ikke overanstrenges. Man kan f.eks. være plaget af sygdom eller stemmetekniske problemer, der gør det svært at øve. Derfor undersøger denne opgave, hvordan man kan komplementere sin fysiske sangøvning med andre metoder, så man stadig kan udnytte tiden bedst muligt. Da jeg selv studerer klassisk sang, er jeg min egen forsøgskanin i dette projekt, og jeg har over en periode på omkring 3 måneder implementeret øvemetoderne i min daglige øvning. Resultatet er derfor således en refleksion over, hvordan jeg har oplevet min øvning, og i diskussionen perspektiverer jeg til nogle af de refleksioner, som Lieberman har beskrevet i sit eget arbejde med øvning. Undervejs i projektet lærte jeg, hvordan den nok vigtigste faktor i min daglige øvning er fokus. Uden fokus – ingen effektiv øvning. Jeg opdagede også, hvor stor en hjælp det er at kunne spille klaver og anvende det til indstuderingsarbejdet af nyt materiale. I diskussionen beskriver jeg en af de interessante opdagelser, jeg gjorde mig i forbindelsen mellem mit analysearbejde og min fysiske sang. Et fænomen som Lieberman også beskriver i sin bog. Selvom man har gjort sig en grundigt stykke analysearbejde, og virkelig sat sig ind i sangen karakter og udtryk, så er det ikke nødvendigvis sådan, at en given følelse, som man prøver at udtrykke, gavner sangteknikken. Det er derfor altid vigtigt at man også arbejder ud fra et fysisk perspektiv i sit stemmeløse arbejde, således at man kan udtrykke sangens karakter og følelser, men samtidig være afspændt og grundet i sin teknik.Program for hele eksamenskoncerten: Skal altid fæste mit hår under hue (Dyvekes Sange), Musik: Peter Heise, tekst: Holger Drachmann Seit ich ihn gesehen (Frauenliebe und -leben), Musik: Robert Schumann, tekst: Adelbert von Chamisso The Salley Gardens (Folk Song Arrangements), Arr.: Benjamin Britten Galadriel's Song of Eldamar, Musik: Caspar Reiff, tekst: J.R.R. Tolkien, arr.: Anna Bæk Christensen Blåbær-Li (Haugtussa), Musik Edvard Grieg, tekst: Arne Garborg Ak, hvem der havde en hue (Dyvekes Sange) Hvad vil den mand? (Dyvekes Sange) Ich kann's nicht fassen, nicht glauben (Frauenliebe und -leben) As I was goin' to Ballynure (Three Irish Country Songs), Arr.: Rebecca Clarke Lord of the Rings Medley (arr. for klaver og sang), Musik: Howard Shore, arr.: Anna Bæk ChristensenKillingdans (Haugtussa) Helft mir ihr Schwestern (Frauenliebe und -leben) Vildt, vildt, vildt suser blæsten (Dyvekes Sange) A Dream, Musik Rebecca Clarke, tekst: William B. Yeats Det stiger (Dyvekes Sange) Das verlassene Mägdlein (Mörike Lieder), Musik: Hugo Wolf, tekst: Eduard Mörike Elven Hymn to Elbereth Gilthoniel, Musik: Caspar Reiff, tekst: J.R.R. Tolkien, arr.: Anna Bæk Christensen Ved Gjætle-Bekken (Haugtussa) Sleep, Musik: Eric Whitacre, tekst: Charles Anthony Silvestry (Encore: Ein Traum (Op. 48 nr. 6), Musik: Edvard Grieg, tekst: Friedrich Martin von Bodenstedt)Solister: Anna Bæk Christensen, Ella Vahtras, Emmi Kauppinen, Karin Malm, Karolina Åsberg. Pianist: Octavian Andrei Leyva Dragomir Dirigent: Gustav Aske Sønksen Kor: Erica Leys, Sara Nyberg, Eveliina Ainsalo, Siri Anna Flensburg, Jessika Grape, Fanny Papay, Ellinor Bakhuizen, Annie Björkman, Viktor Olsson, Gino Almondo, Markus Hägg, Ahmed Can Kizilcan, David Edström, Jakob Lundvall, Johan Kullander, Martin Hillberg. Uddrag fra eksamenskoncerten er vedhæftet som MP3-fil under navnet "Uddrag af Dyvekes Sange". Program for dette lyduddrag: Skal altid fæste mit hår under hue (Dyvekes Sange), Musik: Peter Heise, tekst: Holger DrachmannAk, hvem der havde en hue (Dyvekes Sange) Hvad vil den mand? (Dyvekes Sange)Vildt, vildt, vildt suser blæsten (Dyvekes Sange)Det stiger (Dyvekes Sange) Derudover indgår følgende sange fra eksamenskoncerten også på MP3-filen: Ved Gjætle-Bekken (Haugtussa) Ein Traum (Op. 48 nr. 6), Musik: Edvard Grieg, tekst: Friedrich Martin von BodenstedtSopran: Anna Bæk Christensen, Pianist: Octavian Andrei Leyva Dragomir</p
- …
