1,133 research outputs found
Dr. Abi Adegboye Awomolo, CAU, August 2011
No full textThis video is a conversation with Dr. Abi Adegboye Awomolo. Dr. Abi Awomolo talks about her book, "Wanna B Prez?: 10 Life Strategies From President Barack Obama's Journey to the White House". Ola Ijimayowa, AUC Woodruff Library, is the interviewer
Seroprevalence of Schmallenberg virus and other Simbu group viruses among the Lebanese sheep
Get PDFIn order to evaluate for the first time, the serological prevalence of Schmallenberg virus (SBV) and other Simbu group viruses in Lebanon, sheep originating from 15 Lebanese regions were sampled in September 2016. A total number of 750 serum samples from Awassi sheep were tested by ELISA for viral nucleoprotein antibodies. From the sampled animals, 122 animals were seropositive to SBV/Simbu group viruses. The seropositive sheep were mainly located in South Lebanon. At herd level, a seroprevalence of 53.33% was recorded in the Seven Lebanese governorates, whereas the animal level seroprevalence was 16.26%. The seroprevalence was negative in Mount-Lebanon. Despite that there was some serological evidence showed the presence of some Simbu group viruses in the Middle East, no study was done in Lebanon. In this study, we report for the first time the prevalence of SBV and other Simbu group viruses in Lebanon
Les Fables de La Fontaine, illustrations de Willy Aractingi, traduction arabe de Georges Abi Saleh et Georges Chebli, Beyrouth, Éditions FMA, Khalifé Printing Est., 1995
No full textGénetiot Alain. Les Fables de La Fontaine, illustrations de Willy Aractingi, traduction arabe de Georges Abi Saleh et Georges Chebli, Beyrouth, Éditions FMA, Khalifé Printing Est., 1995. In: Le Fablier. Revue des Amis de Jean de La Fontaine, n°10, 1998. La Fontaine et le Moyen Âge (actes de Reims, 5-6 juin 1998) p. 146
Les Fables de La Fontaine, illustrations de Willy Aractingi, traduction arabe de Georges Abi Saleh et Georges Chebli, Beyrouth, Éditions FMA, Khalifé Printing Est., 1995
No full textGénetiot Alain. Les Fables de La Fontaine, illustrations de Willy Aractingi, traduction arabe de Georges Abi Saleh et Georges Chebli, Beyrouth, Éditions FMA, Khalifé Printing Est., 1995. In: Le Fablier. Revue des Amis de Jean de La Fontaine, n°10, 1998. La Fontaine et le Moyen Âge (actes de Reims, 5-6 juin 1998) p. 146
Genetic characterization of the Awassi sheep breed using endogenous retrovirus and mitochondrial DNA markers
No full textLa domestication des bétails représente une étape importante dans l'histoire de l'humanité. Le mouton était l'un des premiers animaux à être domestiqués dans le croissant fertile. Ces événements de domestication, probablement initiés au début du Néolithique, ont génétiquement construit les races contemporaines du Moyen-Orient mais aussi du monde entier. L'élevage de moutons, principalement mouton de la race Awassi, représente une activité économique essentielle du Liban ; cependant, jusqu'à présent, il n'existe que très peu de données génétiques sur cette race. De nos jours, les outils moléculaires disponibles nous permettent de définir en détail la diversité génétique des populations de moutons et de retracer leur histoire évolutive. Par conséquent, l'objectif principal de mon projet de thèse était de caractériser génétiquement la race Awassi du Liban. Pour cette étude, 277 échantillons d'ADN génomique prélevés des moutons Awassi du Liban (n = 254) et de la Syrie (n = 23) ont été analysés. Au début, nous avons utilisé cinq rétrovirus endogènes (rétrovirus endogène de moutons de Jaagsiekte-enJSRV) qui sont polymorphiques par insertion dans les génomes du mouton domestique (enJSRV-18, -7, -15, -16 et -22) et ont été précédemment considérés comme très informatifs principalement pour distinguer génétiquement les moutons primitifs des races plus modernes (c.-à-d. le dernier issu de l'épisode migratoire impliquant des moutons avec des traits de production améliorés). En utilisant cette approche, nos résultats montrent une prédominance du type R2 (enjSRV-18 seulement) confirmant que le mouton Awassi du Liban est une race moderne. Comme prévu, le rétrotype R4 (à la fois enJSRV-18 et enJSRV-7), une caractéristique commune des populations de moutons du bassin méditerranéen, se trouve également dans le génome des moutons d'Awassi du Liban et plus accentué dans les troupeaux Syriens. Il est intéressant de noter que les populations de moutons d'Awassi situés dans le nord-est du Liban et ayant ainsi un accès plus restreint à la mer Méditerranée que les autres populations (c'est-à-dire en raison de la chaîne de montagne centrale qui coupe le pays sur deux), présentent une faible fréquence de R4. Bien que l'origine des animaux utilisés pour établir les troupeaux analysés au cours de cette étude soit inconnue, nos résultats fournissent également certaines preuves que le mode d'élevage (ouvert ou fermé) peut influencer les rétrotypes observés et en particulier le R4. De manière surprenante, au cours de cette étude, nous avons également dévoilé la présence de soi-disant "Solo-LTR" (c'est-à-dire généré par une recombinaison homologue) pour un autre enJSRV (enJSRV-6) qui prédomine dans deux troupeaux d'une région particulière du Liban (Nabatieh). Et comme approche complémentaire, deux marqueurs mitochondriaux ont été utilisés, le cytochrome b (Cyt-b) et D-Loop, pour étudier l'origine maternelle de cette race et sa relation phylogénétique au sein de la famille Ovis aries. Dans notre étude, le Cyt-b se révèle plus discriminant que le D-Loop. Des mouton d'Awassi analysé, quatre haplogroupes (HPG) du Moyen-Orient ont été trouvés avec l'analyse du Cyt-b : HPG A, B, C et E, ce dernier étant peu fréquent. De même, l’analyse de la super-séquence, alignement Cyt-b_D-Loop, a permis l’identification de l’HPG D, un HPG extrêmement rare et limité jusqu’à présent aux moutons à queue grasse tel que l’Awassi. Enfin, une expansion passée de la population est observée pour les HPG A, B et C (mais pas pour HPG E) avec les distributions incompatibles et des tests de neutralité négatifs significatifs. Dans l'ensemble, les résultats obtenus au cours de cette étude fournissent une caractérisation génétique complète ainsi que quelques idées sur la structure phylogéographique des populations de moutons de la race Awassi au Liban.Livestock domestication represents a milestone in the history of mankind. Sheep was one of the first animals to be domesticated in the Fertile Crescent. These domestication events, probably initiated in the early Neolithic, have genetically built the contemporary races of the Middle East but also of the whole world. Sheep farming, mainly sheep of Awassi breed, represents an essential economic activity of Lebanon; however, so far, only very few genetic data exist on this breed. Nowadays, the molecular tools available allow us to define in details the genetic diversity of sheep populations and to trace their evolutionary history. Hence, the main objective of my PhD project was to genetically characterize the Awassi breed of Lebanon. For this study, 277 genomic DNA samples collected from Awassi sheep of Lebanon (n=254) and Syria (n=23) were analyzed. Initially, we used five endogenous retroviruses (endogenous Jaagsiekte sheep retrovirus-enJSRV) that are insertionally polymorphic within the genomes of domestic sheep (enJSRV-18, -7, -15, -16 and -22) and have been previously shown to be very informative mainly to genetically distinguish between primitive sheep from more modern breeds (i.e. the latter originating from the migratory episode involving sheep with improved production traits). Using this approach, our results show a predominance of the R2 retrotype (enJSRV-18 only) confirming that the Awassi sheep of Lebanon is a modern breed. As expected, the R4 retrotype (both enJSRV-18 and enJSRV-7), a common feature of the sheep populations present within the Mediterranean area, is also found in the Awassi sheep of Lebanon and to more extend in those of Syria. Interesting, the populations of Awassi sheep located in the northeast of Lebanon and thus having a more restricted access to the Mediterranean Sea than the other populations (i.e. due to the central mountain chain cutting the country in two) present R4 weaklier. Even though the origin of the animals used to establish the herds analyzed during this study is unknown, our results also provide some evidences that the mode of rearing (open or closed) may influence the observed retrotypes and in particular R4. Surprisingly, during this study, we also unveiled the presence of so-called “Solo-LTR” (i.e. generated by homologous recombination) for another enJSRV (enJSRV-6) that are predominant in two herds of a particular region of Lebanon (Nabatieh). As a complementary approach, two mitochondrial markers were used, the cytochrome b (Cyt-b) and D-Loop, to investigate the maternal origin of this breed and its phylogenetic relationship within the Ovis aries family. In our study, the Cyt-b turns out to be more discriminative than the D-Loop. From the Awassi sheep analyzed, four haplogroups (HPGs) of the Middle-East were found with Cyt-b analysis: HPG A, B, C and E, the latter being the least frequent. Also, the super-sequence analysis, Cyt-b_D-Loop alignment, allowed the identification of HPG D, an extremely rare HPG, limited till now to fat-tailed sheep such as Awassi. Finally, a past population expansion is observed for the HPG A, B and C (but not for HPG E) with mismatch distributions and significant negative neutrality tests. Overall, the results obtained during this study provide a comprehensive genetic characterization as well as some insights into the phylogeographic structure of the sheep populations of the Awassi breed in Lebanon
Screening for abnormal eating attitudes in a population of Egyptian secondary school girls
No full textThe author screened a population of secondary school girls in Cairo, Egypt (n= 351), for abnormal eating attitudes, using a translated version of the Eating Attitude Test questionnaire (EAT-40). 11.4% scored positively on the questionnaire, a higher percentage than those reported by Mann et al (1983), Szmukler (1983) and Sabine et al (1988) of 6.9%, 6.2% and 8.2% respectively. This variance could be interpreted as a measure of genuine concern over weight or a reflection of a difference in the performance of the questionnaire in this population. In an attempt to determine the latter a confirmatory factor analysis was carried out modelled on Garner et al (1982) and Eisler & Szmukler (1985). The results of the analyses pointed to the coherence of the instrument which showed reasonable psychometric standards in this population. Three cases clearly fulfilled Russell's criteria for a diagnosis of a full syndrome of bulimia nervosa (1.2%), this is broadly in keeping with the rates of the UK studies of 1.9% and 1.1% in Cooper & Fairburn (1983) and King (1989) respectively. Twelve pupils (3.35) showed sufficient concern over their weight to qualify for partial syndrome of bulimia nervosa. The results of this study confirm the initial impression that disorders of eating are emerging in cultures that did not produce such morbidity before with more or less the same prevalence as in the UK. The author discussed the findings in relation to issues of cultural immunity and vulnerability in this respect, and concluded that no society is truly protected against the development of such disorders due to the globalisation of culture by virtue of the media.</p
Reconstruction hyperspectrale haute résolution par inversion de mesures spectroscopiques à integrale de champ. Application au spectromètreinfrarouge MIRI-MRS du télescope spatial James webb
No full textCette thèse traite des approches de type problème inverse pour reconstruire une image 3D spatio-spectrale (2D+λ) à partir d’un ensemble de mesures infrarouges 2D fournies par l’instrument “Integral Field Spectrometer” (IFS) (Mid-ResolutionSpectrometer: MRS) de l’instrument “Mid-Infrared” à bord du “James Webb Space Telescope” (JWST). Plusieurs difficultées se posent lors de la reconstruction car l’instrument IFS contient des composantes complexes qui dégradent et modifient les mesures: (1) les réponses des composantes ne sont pas parfaites et introduisent un flou spatial et spectral aux mesures qui dépendent de la longueur d’onde, (2) l’instrument considère plusieurs observations avec plusieurs champs de vue (comme les canaux spectraux et les fentes parallèles), (3) les sorties de l’instrument sont projetées sur plusieurs détecteurs 2D et échantillonnées avec des pas d’échantillonnage hétérogènes.La reconstruction d’image 2D+λ est un problème mal posé principalement en raison du flou spatio-spectral et de l’échantillonnage spatial insuffisant. Pour compenser la perte d’informations spatiales, le MRS permet des observations multiples de la même scène d’entrée en décalant le pointage du télescope, conduisant à un problème de Super-Résolution (SR). Nous proposons un algorithme de reconstruction qui traite conjointement les informations spatiales et spectrales des mesures 2D suivant deux étapes. Tout d’abord, nous concevons un modèle direct qui décrit la réponse des composantes de l’instrument IFS comme une série d’opérateurs mathématiques et qui établit une relation entre les mesures et l’image 2D+λ d’entrée qu’on cherche à reconstruire. Ensuite, le modèle direct est utilisé pour reconstruire l’image 2D+λ en s’appuyant sur l’approche des moindres carrés régularisée avec une régularisation convexe pour la préservation des contours. Nous nous appuyons sur les approches semi quadratiques rapides basées sur la formulation de Geman et Reynolds pour résoudre le problème. L’algorithme de reconstruction proposé comprend principalement une étape de fusion des mesures issues de différentes observations spatio-spectrales avec différents flous et différents échantillonnages, une étape de SR à partir des différents pointages de l’instrument, et une étape de déconvolution pour minimiser le flou. Un autre modèle direct pour le même instrument est également développé dans notre travail, en supposant que l’image 2D+λ d’entrée vit dans un sous-espace de faible dimension et peut être modélisée comme une combinaison linéaire de composantes spectrales, supposées connues, pondérées par des coefficients de mélange inconnus. Nous nous appuyons ensuite sur l’algorithme d’optimisation Majorize-Minimize Memory Gradient (3MG) pour estimer les coefficients de mélange inconnus. L’approximation par sous-espace réduit le nombre d’inconnues. Par conséquent, le rapport signal sur bruit augmente. De plus, le modèle de mélange de source avec des composantes spectrales connues permet de conserver l’information spectrale complexe de l’image 2D+λ reconstruite. La reconstruction proposée est testée sur plusieurs images 2D+λ synthétiques ayant des différentes distributions spatiales et spectrales. Notre reconstruction montre une déconvolution nette et une amélioration significative des résolutions spatiales et spectrales des images 2D+λ reconstruites par rapport aux algorithmes de l’état de l’art, notamment autour des bords.This thesis deals with inverse problem approaches to reconstruct a 3D spatio-spectral image from a set of 2D infrared measurements provided by the Integral Field Spectrometer (IFS) instrument (Mid-Resolution Spectrometer: MRS) of the Mid-Infrared Instrument onboard the James Webb Space Telescope. The reconstruction is challenging because the IFS involves complex components that degrade the measurements: (1) the responses of the components are not perfect and introduce a wavelength-dependent spatial and spectral blurring, (2) the instrument considers several observations of the input with several spatial and spectral fields of views, (3) the output measurements are projected onto multiple 2D detectors and sampled with heterogeneous step sizes. The 3D image reconstruction is an ill-posed problem mainly due to spatio-spectral blurring and insufficient spatial sampling. To compensate for the loss of spatial information, the MRS allows multiple observations of the same scene by shifting the telescope pointing, leading to a multi-frame Super-Resolution (SR) problem. We propose an SR reconstruction algorithm that jointly processes the spatial and spectral information of the degraded 2D measurements following two main steps. First, we design a forward model that describes the response of the IFS instrument as a series of mathematical operators and establishes a relationship between the measurements and the unknown 3D input image. Next, the forward model is used to reconstruct the unknown input.The reconstruction is based on the regularized least square approach with a convex regularization for edge-preserving. We rely on the fast half-quadratic approaches based on Geman and Reynolds formulation to solve the problem. The proposed algorithm mainly includes a fusion step of measurements from different spatio-spectral observations with different blur and different sampling, a multi-frame Super-Resolution step from the different pointing of the instrument, and a deconvolution step to minimize the blurring. Another forward model for the same instrument is also developed in our work, by assuming that the 3D input image lives in a low dimensional subspace and can be modeled as a linear combination of spectral components, assumed known, weighted by unknown mixing coefficients, known as the Linear Mixing Model (LMM). We then rely on the Majorize-Minimize Memory Gradient (3MG) optimization algorithm to estimate the unknown mixing coefficients. The subspace approximation reduces the number of the unknowns. Consequently, the signal-to-noise ratio is increased. In addition, the LMM formulation with known spectral components allows preserving the complex spectral information of the reconstructed 3D image. The proposed reconstruction is tested on several synthetic HS images with different spatial and spectral distributions. Our algorithm shows a clear deconvolution and a significant improvement of the spatial and spectral resolutions of the reconstructed images compared to the state-of-art algorithms, particularly around the edges
Identification, isolement et caractérisation des progéniteurs bronchioloalvéolaires ovins
No full textBronchioloalveolar stem cells located at the bronchiolar/alveolar junction may be involved inembryogenesis or regeneration. These cells have not yet been described in large animals, and they mayenable the development of new therapeutics to treat acute or chronic lung disease. In this study, weaimed to establish the presence of bronchioloalveolar stem cells in ovine lungs and to characterize theirstemness properties. Lung cells were studied using immunohistochemistry on frozen sections of the lung,and immunocytochemistry and flow cytometry were conducted on derived cells. The stem cells wereidentified by co-expression of CCSP, SP-C and the CD34 hematopoietic stem-cell marker. A minorpopulation of CD34pos/SP-Cpos/CCSPpos cells (0.33% ± 0.31) was present ex vivo in cell suspensions fromdissociated lungs. Using CD34 magnetic positive cell sorting, undifferentiated SP-Cpos/CCSPpos cellswere purified (>80%) and maintained in culture. Using synthetic media and various extracellular matrixes,SP-Cpos/CCSPpos cells differentiated into either Clara cells or alveolar epithelial type-II cells. Furthermore,bronchioloalveolar stem cells obtained ex vivo and in vitro expressed the stem cell-specific genesNANOG, OCT4 and BMI1. We report for the first time in a large animal the existence ofbronchioloalveolar stem cells with dual differentiation potential and the expression of stem cell-specificgenes.Les progéniteurs bronchioloalvéolaires situés aux jonctions bronchioloalvéolaires peuvent être impliquésdans l'embryogenèse ou la régénération. Ces cellules non décrites chez les gros animaux peuventparticiper au développement de nouvelles thérapies contre les maladies pulmonaires aiguës ouchroniques. Dans cette étude, nous avons établi la présence de progéniteurs bronchioloalvéolaires dansles poumons des ovins nouveaux nés. Ces cellules ont été identifiées par leur co-expression desprotéines CCSP, SP-C et CD34. Une population mineure de cellules CD34pos/SP-Cpos/CCSPpos (0,33% ±0,31) était présente ex vivo. Le tri magnétique des cellules CD34pos a permis l’isolement des progéniteursSP-Cpos/CCSPpos (> 80%). Ces cellules étaient maintenues et amplifiées in vitro en interfaceliquide/liquide. De même, ces progéniteurs étaient capables de se différencier soit en cellules de Clarasoit en AEC II dans différents milieux de cultures synthétiques et diverses matrices extracellulaires. Enoutre, les progéniteurs bronchioloalvéolaires obtenus ex vivo et in vitro exprimaient les gènes NANOG,Oct4 et BMI1 spécifiques aux cellules souches. Nous rapportons ainsi, pour la première fois dans ungrand animal, l’existence de cellules progénitrices bronchioloalvéolaires à fort potentiel de doubledifférenciation et d’expression de certains gènes de cellules souches
IDENTIFICATION, ISOLEMENT ET CARACTERISATION DES PROGENITEURS BRONCHIOLOALVEOLAIRES OVINS
No full textBronchioloalveolar stem cells located at the bronchiolar/alveolar junction may be involved in embryogenesis or regeneration. These cells have not yet been described in large animals, and they may enable the development of new therapeutics to treat acute or chronic lung disease. In this study, we aimed to establish the presence of bronchioloalveolar stem cells in ovine lungs and to characterize their stemness properties. Lung cells were studied using immunohistochemistry on frozen sections of the lung, and immunocytochemistry and flow cytometry were conducted on derived cells. The stem cells were identified by co-expression of CCSP, SP-C and the CD34 hematopoietic stem-cell marker. A minor population of CD34pos/SP-Cpos/CCSPpos cells (0.33% ± 0.31) was present ex vivo in cell suspensions from dissociated lungs. Using CD34 magnetic positive cell sorting, undifferentiated SP-Cpos/CCSPpos cells were purified (>80%) and maintained in culture. Using synthetic media and various extracellular matrixes, SP-Cpos/CCSPpos cells differentiated into either Clara cells or alveolar epithelial type-II cells. Furthermore, bronchioloalveolar stem cells obtained ex vivo and in vitro expressed the stem cell-specific genes NANOG, OCT4 and BMI1. We report for the first time in a large animal the existence of bronchioloalveolar stem cells with dual differentiation potential and the expression of stem cell-specific genes.Les progéniteurs bronchioloalvéolaires situés aux jonctions bronchioloalvéolaires peuvent être impliqués dans l'embryogenèse ou la régénération. Ces cellules non décrites chez les gros animaux peuvent participer au développement de nouvelles thérapies contre les maladies pulmonaires aiguës ou chroniques. Dans cette étude, nous avons établi la présence de progéniteurs bronchioloalvéolaires dans les poumons des ovins nouveaux nés. Ces cellules ont été identifiées par leur co-expression des protéines CCSP, SP-C et CD34. Une population mineure de cellules CD34pos/SP-Cpos/CCSPpos (0,33% ± 0,31) était présente ex vivo. Le tri magnétique des cellules CD34pos a permis l'isolement des progéniteurs SP-Cpos/CCSPpos (> 80%). Ces cellules étaient maintenues et amplifiées in vitro en interface liquide/liquide. De même, ces progéniteurs étaient capables de se différencier soit en cellules de Clara soit en AEC II dans différents milieux de cultures synthétiques et diverses matrices extracellulaires. En outre, les progéniteurs bronchioloalvéolaires obtenus ex vivo et in vitro exprimaient les gènes NANOG, Oct4 et BMI1 spécifiques aux cellules souches. Nous rapportons ainsi, pour la première fois dans un grand animal, l'existence de cellules progénitrices bronchioloalvéolaires à fort potentiel de double différenciation et d'expression de certains gènes de cellules souches
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