38 research outputs found
Learned IE thesis: Docker image
This dataset contains a Docker image for reproducing the numerical experiments in the PhD thesis
Title: Learned infinite elements for helioseismology
Author: Janosch Preuß
Advisors: Prof. Christoph Lehrenfeld, Prof. Thorsten Hohage, Dr. Damien Fournier
Doctoral programme: Georg-August University School of Science (GAUSS)
It includes all software and most of the data for the reproduction. To keep the image of a reasonable size, the remaining data has been uploaded in the following datasets on GRO.data:
Learned IE thesis: Comparison of different atmospheric models for helioseismology
Learned IE thesis: Comparison of transparent boundary conditions for the Atmo model
Learned IE thesis: Transparent boundary conditions for the VAL-C model
There is no need for action from the user here since the docker image contains scripts which automatically download this data for further postprocessing if required.
The image was built based on the github repository https://gitlab.gwdg.de/learned_infinite_elements/diss_jp_repro at commit: ac895f4a341444e5eb186d93276345578ef765a1. The tarball
diss_jp_repro.tar.gz contains an archive of this repository.
A README file is included in the repository as well as in the docker image learnedIE_diss_repro.tar, which contains detailed instructions (which commands to execute and so on) on how to obtain the results given in the thesis. An online version of the README file can be found here.
The image can additionally be found on Docker Hub: janosch2888/diss_jp:191021.
Important note: If you have a problem with downloading the docker image, please use the alternative URL https://data.goettingen-research-online.de/download/learnedIE_diss_repro.tar
Janosch e a “arte de viver”
Freudian “art of living” is applied here to study German children’s literature author Janosch. The purpose is mainly focused studying this writer from an analytic perspective in Civilisation and Its Discontents by Sigmund Freud. It is selected a corpus of the Germanauthor, where previously is study the concepts of pleasure and displeasure in Freud work. Thus, it is suggested how Janosch works propose a different choice to overcome the discontents against the traditional libidinal economy. The analysis shows how the charactersbuild their own strategies, which allow to speak regarding the “art of living” as an intransitive desire; that jeopardizes traditional logic, a revaluation of the other from solidarity and aradical option for pleasure over culture. The results display a renewed and complex vision of an author of children’s literature. The creation by Janosch questions the values of thecontemporary society and appeals to the reader to review its hierarchies.Situamos la obra del escritor infantil alemán Janosch dentro de la corriente del “arte de vivir”. Este busca la plena realización del sujeto desde un planteamiento personal y crítico. El propósito central de este artículo será determinar la particularidad de Janosch abriendo un diálogo desde laproblematización de Freud en El malestar en la cultura. Para el análisis optamos por una revisión de un corpus escogido de Janosch. Previa síntesis de la problemática del placer y el displacer según Freud, se determinan cuáles son las principales salidas de Janosch al malestar y cómo se diferencia de una economía libidinal tradicional. El análisis muestra cómo los personajes construyen sus propias estrategias, lo que permite hablar de un “arte de vivir”. Estas son: un “deseo intransitivo” que pone en jaque la lógica tradicional, una revaloración del otro desde la solidaridad y una radical opción por el placer por sobre la cultura. Los resultados de la reflexión permiten una visión renovada y compleja de un autor de literatura infantil. El mundo creado por Janosch cuestiona desde una inusitada frescura los valores de nuestra sociedad contemporánea y apela al lector a una revisión de sus jerarquías.Classifica-se a obra do escritor infantil alemão Janosch dentro da corrente da “arte de viver”. Essa procura a total realização do sujeito a partir de um posicionamento pessoal e crítico. O propósito central deste artigo será determinar a particularidade de Janoschabrindo um diálogo a partir da problematização de Freud em O mal-estar na cultura. Para a análise decidiu-se por uma revisão de um corpus escolhido de Janosch. Prévia síntese da problemática do prazer o do desprazer segundo Freud, determinam-se quais são as principais saídas de Janosch ao mal-estar e como se diferencia de uma economia libidinal tradicional.A análise expõe como as personagens constroem as suas próprias estratégias, o que permite falar de uma “arte de viver”. Essas são: um “desejo intransitivo”, que põe em xeque a lógicatradicional, uma revalorização do outro por meio da solidariedade e uma radical opção pelo prazer em detrimento da cultura. Os resultados da reflexão possibilitam uma visão renovadae complexa de um autor da literatura infantil. O mundo criado por Janosch questiona a partir de um inusitado frescor os valores da nossa sociedade contemporânea e convida o leitor auma reflexão das suas hierarquias
Janosch e a “arte de viver”
Freudian “art of living” is applied here to study German children’s literature author Janosch. The purpose is mainly focused studying this writer from an analytic perspective in Civilisation and Its Discontents by Sigmund Freud. It is selected a corpus of the Germanauthor, where previously is study the concepts of pleasure and displeasure in Freud work. Thus, it is suggested how Janosch works propose a different choice to overcome the discontents against the traditional libidinal economy. The analysis shows how the charactersbuild their own strategies, which allow to speak regarding the “art of living” as an intransitive desire; that jeopardizes traditional logic, a revaluation of the other from solidarity and aradical option for pleasure over culture. The results display a renewed and complex vision of an author of children’s literature. The creation by Janosch questions the values of thecontemporary society and appeals to the reader to review its hierarchies.Situamos la obra del escritor infantil alemán Janosch dentro de la corriente del “arte de vivir”. Este busca la plena realización del sujeto desde un planteamiento personal y crítico. El propósito central de este artículo será determinar la particularidad de Janosch abriendo un diálogo desde laproblematización de Freud en El malestar en la cultura. Para el análisis optamos por una revisión de un corpus escogido de Janosch. Previa síntesis de la problemática del placer y el displacer según Freud, se determinan cuáles son las principales salidas de Janosch al malestar y cómo se diferencia de una economía libidinal tradicional. El análisis muestra cómo los personajes construyen sus propias estrategias, lo que permite hablar de un “arte de vivir”. Estas son: un “deseo intransitivo” que pone en jaque la lógica tradicional, una revaloración del otro desde la solidaridad y una radical opción por el placer por sobre la cultura. Los resultados de la reflexión permiten una visión renovada y compleja de un autor de literatura infantil. El mundo creado por Janosch cuestiona desde una inusitada frescura los valores de nuestra sociedad contemporánea y apela al lector a una revisión de sus jerarquías.Classifica-se a obra do escritor infantil alemão Janosch dentro da corrente da “arte de viver”. Essa procura a total realização do sujeito a partir de um posicionamento pessoal e crítico. O propósito central deste artigo será determinar a particularidade de Janoschabrindo um diálogo a partir da problematização de Freud em O mal-estar na cultura. Para a análise decidiu-se por uma revisão de um corpus escolhido de Janosch. Prévia síntese da problemática do prazer o do desprazer segundo Freud, determinam-se quais são as principais saídas de Janosch ao mal-estar e como se diferencia de uma economia libidinal tradicional.A análise expõe como as personagens constroem as suas próprias estratégias, o que permite falar de uma “arte de viver”. Essas são: um “desejo intransitivo”, que põe em xeque a lógicatradicional, uma revalorização do outro por meio da solidariedade e uma radical opção pelo prazer em detrimento da cultura. Os resultados da reflexão possibilitam uma visão renovadae complexa de um autor da literatura infantil. O mundo criado por Janosch questiona a partir de um inusitado frescor os valores da nossa sociedade contemporânea e convida o leitor auma reflexão das suas hierarquias
Rational, computer-aided design of multi-target ligands : poster presentation from 6th German Conference on Chemoinformatics, GCC 2010, Goslar, Germany. 7-9 November 2010
Over the past two decades the “one drug – one target – one disease” concept became the prevalent paradigm in drug discovery. The main idea of this approach is the identification of a single protein target whose inhibition leads to a successful treatment of the examined disease. The predominant assumption is that highly selective ligands would avoid unwanted side effects caused by binding to secondary non-therapeutic targets. In recent years the results of post-genomic and network biology showed that proteins rarely act in isolated systems but rather as a part of a highly connected network [1]. In addition this connectivity leads to more robust systems that cannot be interfered by the inhibition of a single target of that network and consequently might not lead to the desired therapeutic effect [2]. Furthermore studies prove that robust systems are rather affected by weak inhibitions of several parts than by a complete inhibition of a single selected element of that system [3]. Therefore there is an increasing interest in developing drugs that take effect on multiple targets simultaneously but is concurrently a great challenge for medicinal chemists. There has to be a sufficient activity on each target as well as an adequate pharmacokinetic profile [4]. Early design strategies tried to link the pharmacophors of known inhibitors, however these methods often lead to high molecular weight and low ligand efficacy. We present a new rational approach based on a retrosynthetic combinatorial analysis procedure [5] on approved ligands of multiple targets. These RECAP fragments are used to design a large combinatorial library containing molecules featuring chemical properties of each ligand class. The molecules are further validated by machine learning models, like random forests and self-organizing maps, regarding their activity on the targets of interest
Pyrazolo[1,5a]pyrimidines as a new class of FUSE binding protein 1 (FUBP1) inhibitors
The transcriptional regulator FUSE binding protein 1 (FUBP1) is aberrantly upregulated in various malignancies, fulfilling its oncogenic role by the deregulation of critical genes involved in cell cycle control and apoptosis regulation. Thus, the pharmaceutical inhibition of this protein would represent an encouraging novel targeted chemotherapy. Here, we demonstrate the identification and initial optimization of a pyrazolo[1,5a]pyrimidine-based FUBP1 inhibitor derived from medium throughput screening, which interferes with the binding of FUBP1 to its single stranded target DNA FUSE. We were able to generate a new class of FUBP1 interfering molecules with in vitro and biological activity. In biophysical assays, we could show that our best inhibitor, compound 6, potently inhibits the binding of FUBP1 to the FUSE sequence with an IC50value of 11.0 μM. Furthermore, hepatocellular carcinoma cells exhibited sensitivity towards the treatment with compound 6, resulting in reduced cell expansion and induction of cell death. Finally, we provide insights into the corresponding SAR landscape, leading to a prospective enhancement in potency and cellular efficacy.Fil: Hauk, Stefanie. Georg Speyer-haus; AlemaniaFil: Hiesinger, Kerstin. Goethe Universitat Frankfurt; AlemaniaFil: Khageh Hosseini , Sabrina. Georg Speyer-haus; AlemaniaFil: Achenbach, Janosch. Goethe Universitat Frankfurt; AlemaniaFil: Biondi, Ricardo Miguel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; Argentina. Goethe Universitat Frankfurt; Alemania. German Cancer Consortium; AlemaniaFil: Proschak, Ewgenij. University Hospital Frankfurt; AlemaniaFil: Zörnig, Martin. Georg Speyer-haus; AlemaniaFil: Odadzic, Dalibor. Goethe Universitat Frankfurt; Alemani
Selbstorganisierende Karten zur Erkennung von Polypharmakologie in der Wirkstoffentwicklung
Polypharmakologie hat in den letzten Jahren mehr und mehr an Bedeutung in der pharmazeutischen Forschung gewonnen und könnte in Zukunft zu einem Umdenken in der Entwicklung neuer Wirkstoffe führen. Das wachsende Verständnis für biologische Zusammenhänge, im speziellen für die starke Vernetzung zwischen verschiedenen Signalwegen oder Gewebearten, und die daran beteiligten Proteine, könnten zu gänzlich neuen Strategien führen. Beispiele aus dem Bereich der Onkologie und der Entwicklung von Neuroleptika haben bereits gezeigt, dass eine Intervention an mehreren Stellen eines solchen komplexen Netzwerkes zu wirksameren und gleichzeitig sichereren Wirkstoffen führen kann. Erkenntnisse aus der Systembiologie und die retrospektive Analyse bereits zugelassener Wirkstoffe machen deutlich, dass viele erfolgreiche Wirkstoffe nur aufgrund ihres polypharmakologischen Wirkprofils so effektiv sind – wenngleich dies bei Ihrer Entwicklung oftmals nicht beabsichtigt war.
Das rationale Design sogenannter „multitarget Wirkstoffe“ stellt bis heute eine große Herausforderung dar. Aus Sicht eines medizinischen Chemikers bedeutet es die Verknüpfung zweier, auf unterschiedliche Targets aktiver, Liganden zu einem neuen Wirkstoff, ohne einen signifikanten Aktivitätsverlust auf die einzelnen Targets herbeizuführen. Ein naheliegender Ansatz zur Verbindung zweier Liganden ist die Verknüpfung der Moleküle über einen flexiblen Linker. Dieser Ansatz kann zwar in vitro zu sehr potenten Wirkstoffen führen, birgt jedoch pharmakokinetische Nachteile, bedingt durch das hohe Molekulargewicht, die sich oft erst in vivo zeigen. Die Schwierigkeit besteht also zum einen in der Aufrechterhaltung der individuellen Aktivität auf das jeweilige Target und zum anderen im Erreichen einer guten Balance zwischen Aktivität und Komplexität des Liganden. Damit soll ausreichend Raum für spätere Optimierung von pharmakokinetischen und pharmakodynamischen Eigenschaften gewährleistet werden. Bisher wurden nur wenige Computer-gestützte Ansätze entwickelt um diese und ähnliche Fragestellungen zu bearbeiten. Aus diesem Grund ist die Entwicklung neuer in silico Verfahren zur Identifzierung von multitarget Liganden ein Kernthema dieser Arbeit. Die Implementierung eines Fragment-basierten Ansatzes hält die Komplexität der Liganden möglichst gering und bietet genügend Raum für eine anschließende, multi-dimensionale Optimierung an zwei oder mehreren Targets.
In der ersten Studie wurde eine Pharmakophor-basierte Strategie verfolgt. Die Repräsentation eines Liganden durch ein Pharmakophormodell stellt eine abstrakte dreidimensionale Darstellung der für die biologische Aktivität relevanten Strukturmerkmale dar. Diese Abstraktion vereinfacht den Vergleich zweier Verbindungen und erlaubt gleichzeitig Spielraum für chemische Variabilität. Bei diesem Ansatz wurden Pharmakophormodelle, jeweils für eine Vielzahl aktiver Liganden zweier Targets, erzeugt und paarweise miteinander verglichen. Sobald zwei Pharmakophormodelle eine genügend große Anzahl an Pharmakophorpunkten in räumlich ähnlicher Orientierung teilen, stellt dieses gemeinsame Pharmakophor die Basis eines potentiellen multitarget Liganden dar. In der beschriebenen Studie wurde dieses Verfahren anhand von aktiven Liganden der löslichen Epoxid Hydrolase (sEH) und 5-Lipoxygenase (5-LO) evaluiert. Die auf dieser Grundlage identifizierten multitarget Pharmakophormodelle wurden zum anschließenden Screening einer Fragement-Datenbank verwendet und führten zu 9 aktiven Liganden für sEH und 5-LO. Diese Liganden besitzen chemische Grundgerüste (Scaffolds), die in der Literatur bisher noch nicht als aktive sEH- oder 5-LO-Liganden beschrieben wurden und somit eine ideale Grundlage für die Entwicklung neuer Wirkstoffe darstellen. Für eine der gefundenen Verbindungen, basierend auf einem Benzimidazol-Gerüst, wurden Aktivitäten im niedrig mikromolaren Bereich für beide Targets bestimmt. Diese Verbindung und weitere Derivate werden zu diesem Zeitpunkt weiter charakterisiert um eine erste Struktur-Aktivitäts-Beziehung aufzustellen und die Eignung dieser Substanzklasse als potentielle Leitstruktur für neue, duale sEH/5-LO Liganden zu überprüfen.
Parallel dazu wurde eine Substruktur-basierte Strategie verfolgt um Rückschlüsse auf jene Strukturmerkmale zu ziehen, die für die Aktivität auf dem jeweiligen Target verantwortlich sein könnten. Dazu wurden in einem ersten Schritt alle aktiven Liganden zweier Targets auf ihre möglichst maximalen gemeinsamen Substrukturen reduziert. Für jedes Target wird damit ein Set von Substrukturen generiert, welches die für die Bindung an das jeweilige Target charakteristische Strukturmerkmale enthält. Diese Substrukturen, repräsentieren den chemischen Raum des jeweiligen Targets und stellten die Trainingsdaten für den entwickelten multiSOM Ansatz dar. Dieser Ansatz basiert auf dem automatisierten Vergleich von selbst-organisierenden Karten und hebt Gemeinsamkeiten zwischen diesen Substruktursets in einer leicht zu interpretierenden, visuellen Form hervor. Dies erlaubt die Identifizierung von gemeinsamen Substrukturen aus beiden verwendeten Substruktursets, welche potentielle duale Strukturelemente darstellen.
Die Validierung dieses Ansatzes erfolgte erneut auf Basis bekannter 5-LO- und sEH-Liganden. Unter 24 ausgewählten Verbindungen konnten neun Fragmente identifiziert werden, die auf einem der beiden Targets und 5 Fragmente, die auf beiden Targets im niedrig mikromolaren Bereich inhibierend wirken. Einer dieser dualen Fragmente wurden anschließend als Basis für eine Substruktursuche in einer Inhouse Datenbank verwendet. Die daraus resultierende Verbindung, die einen Teil des ursprünglichen Fragments beinhaltet, wirkt sowohl auf sEH als auch 5-LO in nanomolaren Konzentrationen inhibierend. Auch diese Verbindung wird zu diesem Zeitpunkt weiter charakterisiert und stellt eine vielversprechende Basis als Leitstruktur neuer dualer sEH/5-LO-Liganden dar.
Zusammenfassend lässt sich sagen, dass die vorgestellten Methoden neue Möglichkeiten bieten, das rationale Design von multitarget Liganden zu unterstützen. Die Pharmakophor-basierte Methode kann besonders dann von Vorteil sein, wenn bereits Strukturinformationen für beide Targets bzw. die bioaktiven Konformationen der Liganden vorliegen. Für einen ausschließlichen Liganden-basierten Ansatz stellt die Verwendung der MultiSOM, und damit die Identifizierung gemeinsamer Strukturelemente der Liganden, die bessere Methode dar.
Im zweiten Teil dieser Arbeit werden Studien zur Identifizierung neuer Farnesoid-X-Rezeptor (FXR) Partialagonisten beschrieben. Auch in diesem Fall wurden zwei unterschiedliche Strategien verfolgt. Da FXR eine starke strukturelle Anpassung abhängig vom gebundenen Liganden aufweist („induced fit“), sind rein strukturbasierte virtuelle Screening-Methoden nur eingeschränkt einsetzbar. Aus diesem Grund sollte zunächst ein Liganden-basierter Drug Repurposing Ansatz verfolgt werden, bei dem bereits zugelassene Wirkstoffe mit potentiell FXR-modulierenden Eigenschaften identifiziert werden sollten. Der Vorteil des Drug Repurposing besteht darin, dass die betrachteten Wirkstoffe bereits intensiv hinsichtlich Sicherheit und Bioverfügbarkeit untersucht wurden. Somit kann man sich bei der Entwicklung verstärkt auf die biologische Aktivität auf das neue Target konzentrieren.
Erneut wurden selbstorganiserende Karten (SOMs) verwendet, um zugelassene Wirkstoffe mit FXR-Aktivität zu identifizieren. Trainiert wurde die SOM auf einem Datensatz bestehend aus bekannten FXR-Agonisten zum einen und der DrugBank Datenbank mit zugelassen Wirkstoffen zum anderen. Die Eigenschaft der SOM Verbindungen mit ähnlicher biologischer Aktivität in räumlicher Nähe auf der Karte zu clustern führte zu einer Anhäufung an bekannten FXR-Agonisten auf einigen wenigen Neuronen. Auf solchen sogenannten Aktivitätsinseln wurden zusätzlich auch zugelassene Wirkstoffe platziert, wenn ihre Ähnlichkeit zu den FXR-Agonisten ausreichend hoch war. Die auf den Aktivitätsinseln angesiedelten Wirkstoffe wurden anschließend bestellt und hinsichtlich ihrer FXR-Aktivität in einem Transaktivierungs-Assay untersucht. Unter den bestellten Verbindungen konnten sechs Liganden mit einer signifikanten relativen FXR-Aktivierung identifiziert werden. Weitere Hinweise auf eine mögliche FXR-Aktivierung der Verbindungen gaben in der Literatur beschriebene Nebeneffekte, die mit einer FXR-Aktivierung in Zusammenhang stehen könnten. Die potentenste Verbindung, der zugelassenen Tyrosinkinase-Inhibitor Imatinib, wurde zusätzlich in Bezug auf FXR-basierte SHP mRNS Induktion untersucht. In qPCR-Experimenten konnte dabei eine mit GW4064 vergleichbare Induktion in HepG2 Zellen gezeigt werden. Diese Ergebnisse untermauern die aus der Literatur gewonnen Vermutung, dass Imatinib FXR-modulierende Eigenschaften besitzt und somit eine interessante Grundlage für die Entwicklung neuer FXR-Partialagonisten darstellt. Zu diesem Zeitpunkt werden weitere Imatinib-Derivate synthetisiert und diese Struktur als mögliche Leitstruktur charakterisiert.
In einer zweiten Studie wurde eine Kombination aus Liganden- und Struktur-basierten Ansatz verfolgt. Dabei wurden sämtliche Struktur-Informationen aus publizierten FXR-Kristallstrukturen und den darin kokristallisierten Liganden gebündelt, um die Auswirkungen des zu Beginn erwähnten induced-fit Effekts zu minimieren. Auf Basis der ko-kristallisierten Liganden wurden zunächst zwei Konsensus-Pharmakophormodelle erstellt. Diese Modelle wurden in einem anschließenden Schritt jeweils mit einem Konsensus-Pharmakophormodell, das mit Hilfe von Protein-Ligand-Interaktions-Fingerprints (PLIF) aus den korrespondieren Kristallstrukturen abgeleitet wurde, überlagert und kombiniert. Diese kombinierten Modelle vereinten sowohl Informationen der strukturellen Gemeinsamkeiten der Liganden als auch gemeinsame, relevante Interaktionspunkte zwischen Ligand und Rezeptor aus den Kristallstrukturen. Das Pharmakophor-Screening mit anschließender Docking Analyse führte zu 42 getesteten Verbindungen, von denen 12 Strukturen eine signifikante relative FXR-Aktivierung zeigten. Darunter konnte ein Partial-Agonist mit einem EC50 von 480 nM bei einer maximalen Aktivierung von ca. 14% im Vergleich zur Referenz GW4064 identifiziert werden. Auch diese Verbindung wird zum aktuellen Zeitpunkt weiter charakterisiert und könnte in Zukunft als Leitstruktur für neue FXR-Partialagonisten dienen.
In beiden Studien konnten neue FXR-Agonisten mit bisher noch nicht beschriebenen Scaffolds identifiziert werden. Es konnte gezeigt werden, dass die Verwendung bereits zugelassener Wirkstoffe für neue Indikationen eine attraktive Quelle für neue Leitstrukturen darstellen kann und im Zuge dessen bisher ungeklärte Nebeneffekte bekannter Wirkstoffe aufgeklärt werden können.
Abschließend lässt sich festhalten, dass selbstorganisierende Karten eine universelle Methode zur Erkennung und Analyse von polypharmakologischen Zusammenhängen darstellen. Des Weiteren lassen sich mit ihrer Hilfe chemische Räume repräsentieren und durch den in dieser Arbeit entwickelten MultiSOM-Ansatz direkt vergleichen. Dies ermöglicht auf intuitive und effiziente Weise die Identifizierung von überlappenden chemischen Räumen und somit möglicher polypharmakologischer Zusammenhänge
Cholonek, czyli obraz Górnoślązaków? Kilka uwag o powieści Janoscha z perspektywy imagologicznej
The following article is an attempt to re-read the famous novel Cholonek albo dobry Pan Bóg z gliny by Janosch. Contrary to popular opinions that the novel shows the true image of the Upper Silesia and its residents, the author tries to find a different point of view. The analysis focuses on the auto- and heterostereotypes of the Upper Silesians, the narrative perspective and the aesthetics of the text. The conclusion is that the technics of unreliable narrator, repetition and hyperrealism undermine the realism and question the suggested compatibility of the story with the regional reality
VAMMPIRE: A Matched Molecular Pairs Database for Structure-Based Drug Design and Optimization
Computational tools for polypharmacology and repurposing
Most drugs act on a multitude of targets rather than on one single target. Polypharmacology, an upcoming branch of pharmaceutical science, deals with the recognition of these off-target activities of small chemical compounds. Due to the high amount of data to be processed, application of computational methods is indispensable in this area. This review summarizes the most important in silico approaches for polypharmacology. The described methods comprise network pharmacology, machine learning techniques and chemogenomic approaches. The use of these methods for drug repurposing as a branch of drug discovery and development is discussed. Furthermore, a broad range of prospective applications is summarized to give the reader an overview of possibilities and limitations of the described techniques. </jats:p
