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    Cambiamenti di copertura forestale e dell’uso del suolo nell’inventario dell’uso delle terre in Italia

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    L'articolo è disponibile sul sito dell'editore www.sisef.itChanges of forest coverage and land uses as assessed by the inventory of land uses in Italy. The paper presents the IUTI program, a land use inventory of Italy, based on point sampling. It has been carried out to support the National Carbon Sink Accounting Register and it was realized within the framework of the Italian National Remote Sensing Plan managed by the Italian Ministry of Environment. IUTI has monitored the land use and land use change and forestry in the last two decades over the country at the years 1990, 2000, 2008, adopting a tessellated stratified sampling scheme with about 1.2 million sample points on aerial orthophotos. Following definitions, methods and inventory procedures, the main results are discussed. They show the heavy changes affecting surface and distribution of the various classes for arable lands, forests and urban areas

    Innovative plastic films for agriculture

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    Dottorato di ricerca in OrtoflorofrutticolturaL’obiettivo del dottorato di ricerca è stato quello di valutare, in un ambiente tipico dell’Italia centro-settentrionale, la rispondenza agronomica di nuovi film termici di copertura delle serre, ancora allo stadio di prototipo, su una coltura di ampia diffusione qual è il pomodoro (Lycopersicon esculentum Mill.). L’attività di valutazione è stata portata avanti seguendo due linee di ricerca distinte, cui sono corrisposte due prove biennali di confronto tra materiali plastici di copertura. Nella prima un film termico innovativo contenente poliammide di terza generazione, che rappresenta una delle più recenti e interessanti novità del settore, è stato posto a confronto con un film in polietilene additivato, con funzione di testimone. Nella seconda, invece, ad essere confrontati sono stati due film termici coestrusi LDPE/EVA, uno a luce diretta e l’altro a luce diffusa, ciascuno stabilizzato con tre diverse formulazioni di additivi stabilizzanti alla luce. I parametri presi in considerazione nell’ambito della ricerca hanno riguardato lo sviluppo vegetativo dell’ortiva e gli aspetti legati alla produzione, valutati questi sia dal punto di vista quantitativo che qualitativo. I numerosi dati raccolti hanno permesso di ottenere un quadro assai completo su quelle che sono le potenzialità produttive dei nuovi laminati plastici, fornendo un utile ausilio alla scelta della copertura più idonea allo specifico ambiente di coltivazione.The aim of the research was to evaluate, in a north-central Italy environment, the behaviour of new agricultural thermal films for covering greenhouse, still at the prototype stage, on tomato crops (Lycopersicon esculentum Mill.). Two different two-year trials were carried out. In the first one, an innovative third generation thermal film containing polyamide was compared with a control standard mixed with additives LDPE film. In the second research line, two coextruded LDPE/EVA direct or diffuse light thermal films were compared. Moreover, each type of the above-mentioned film was stabilized with three different formulations of light stabilizing additives, for a total of six combinations film- light stabilizing. The parameters taken into account in the research focused on the vegetative growth and quantitative and qualitative production. The large amount of collected data allowed to obtain a complete picture of the productive potential of the new plastic laminates, providing a useful aid for the choice of the most suitable cover for the specific environment

    L’emigrazione in Brasile (XVII-inizi XX secolo)

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    L'emigrazione in Brasile dal Seicento a oggi attraverso le fonti vaticane

    L’Italia e le migrazioni

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    Introduzione - post printItaly as a cross-road of migrations since the pre-history

    Potenzialità del telerilevamento laser scanner aereo per la classificazione delle coperture forestali in funzione della forma di governo

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    L'articolo è disponibile sul sito dell'editore www.asita.itIn questo studio è stata valutata la potenzialità del telerilevamento laser scanner aereo (ALS) per classificare le forme di governo forestale in un bosco misto di latifoglie. La metodologia applicata prevede l’utilizzo del modello digitale delle chiome (CHM) ottenuto da dati ALS e l’impiego di procedure automatizzate per la segmentazione object-oriented delle immagini telerilevate. La classificazione delle forme di governo si basa sulle metriche estratte dal CHM. I risultati ottenuti indicano che la media delle altezze e il coefficiente di variazione delle altezze estratti dal CHM sono utili per distinguere i boschi governati a ceduo da quelli governati a fustaiaIn this study aerial laser scanning (ALS) data has been tested to classify coppice stands and high forest stands in a mixed broadleaved forest. The method is based on a canopy height model (CHM) obtained from ALS data. Forest stands have been delineated using a object-oriented approach. The polygons have been classified into coppices and high forests based on the metrics derived from CHM. Our results indicate that the mean of the heights and the coefficient of variation of the heights extracted from CHM are useful to discriminate coppices from high forests

    Analisi della variabilità genetica nel bestiame attraverso l'utilizzo di marcatori molecolari: mtDNA e SNPs possono essere utili per valutare struttura genetica e relazione tra le razze

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    Dottorato di ricerca in Ecologia e gestione delle risorse biologicheThe loss of agricultural diversity in the face of increasing pressures from modern farming is a cause for global concern. In Europe, it is necessary to protect the existing great heritage of genetic diversity. The present thesis has been developed by analyzing through molecular markers two different livestock species (Bos taurus, Ovis aries). In the study "Polymorphisms within the Toll-Like Receptor (TLR)-2, -4 and -6 Genes in Cattle" eight SNPs were identified, of which a non-synonymous SNP identified in TLR6 gene is interesting because it causes an amino acid substitution. The frequencies of the SNPs were assessed in 16 different bovine European cattle breeds, and a phylogenetic analysis carried out. In the study "Relationships between Podolic cattle breeds assessed by single nucleotide polymorphisms (SNPs) genotyping" 67 SNPs were genotyped in individuals belonging to the three breeds: Maremmana, Turkish Grey and Hungarian Grey. The data show that the similarity among the examined animals is mainly morphological and that the three Podolic breeds maintain a good level of genetic diversity. In the study "Genetic diversity of sheep breeds from Albania, Greece, and Italy assessed by mitochondrial DNA and nuclear polymorphisms (SNPs)", 154 mtDNA haplotypes were detected by means of D-loop sequence analysis in 313 animals of three countries: Albania, Greece, and Italy. Furthermore, the same sheep breeds were genotyped with 37 previously described SNPs. PCA analysis on SNP data differentiated breeds with good correspondence to geographical locations. The study of molecular markers in livestock is very important for the future. In fact, the biodiversity conservation of farm animals is universally recognized as a challenge for the next years.Studi recenti hanno messo in evidenza una perdita di variabilità genetica negli animali da allevamento nel corso degli ultimi due secoli. In Europa è universalmente riconosciuta la necessità di proteggere il grande patrimonio genetico esistente ponendo l’attenzione sulle razze autoctone. Nella presente tesi ho analizzato la variabilità genetica di due specie (Bos taurus, Ovis aries) attraverso l’utilizzo di marcatori molecolari. Nello studio "Polymorphisms within the Toll-Like Receptor (TLR)-2, -4 and -6 Genes in Cattle" sono stati identificati 8 SNPs, uno dei quali risulta interessante perché causa una variazione amminoacidica nella proteina TLR6. Inoltre, gli stessi SNPs sono stati genotipati in 16 razze bovine europee ed utilizzati per un’analisi filogenetica. Nello studio "Relationships between Podolic cattle breeds assessed by single nucleotide polymorphisms (SNPs) genotyping" 67 SNPs sono stati genotipati in individui appartenenti a tre razze: Maremmana, Turkish Grey and Hungarian Grey. I dati mostrano che le somiglianze morfologiche tra gli animali esaminati non hanno lo stesso riscontro genetico. Nello studio "Genetic Diversity of Sheep Breeds from Albania, Greece, and Italy Assessed by Mitochondrial DNA and Nuclear Polymorphisms (SNPs)", analizzando la sequenza del D-loop di 313 animali, sono stati identificati 154 aplotipi. Inoltre, sono stati genotipati 37 SNPs nucleari e l’analisi mediante PCA mostra una buona corrispondenza tra variabilità genetica e distanza geografica. La conservazione della biodiversità negli animali di allevamento rappresenta ormai una sfida per gli anni a venire, l’analisi dei marcatori molecolari può essere un supporto fondamentale per intraprendere politiche allevatoriali più adeguate

    Identification of molecular markers for the characterization of hazelnut oil

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    Dottorato di ricerca in Biotecnologie degli alimentiIn this project it has been set up a simple method for molecular traceability of hazelnut oil through microsatellite markers. With the aim to achieve the purpose, first of all an amplification/ extraction methodology has been set up on 2 pools of Tonda Gentile Romana hazelnut (TGR). The best technique it is subsequently used to analyze other four hazelnut varieties. Amplification tests performed on DNAs, extracted through the different methodologies, permitted us to evaluate samples quality and to identify the best PCR conditions for microsatellites analysis. Study of 9 microsatellites, performed on the best DNAs, has permitted us to define a fingerprint for each variety. Data obtained from hazelnut varieties compared with a data bank have shown that varieties surely correspond to those declared, except for 2 pools of TGR. The study of two pools with CAC B028 microsatellite has shown that four alleles, instead two, are present in each sample. This result could indicate a non homogeneity of the two matrices. In TGR pools four alleles instead two have been identified have been identified the study of CAC B028 microsatellite marker has shown that each pool ha four alleles, instead of two, were identified with the CAC B028 marker indicating a possible non homogeneity of the two matrices. Molecular approach, set up on hazelnut matrix, has shown to be effective for the study of hazelnut oil matrix too, prepared with the two hazelnut pools of TGR. Molecular analysis of oil matrix, in fact, confirm data obtained from hazelnut matrix, include the anomalous result about CAC B028 marker. To evaluate the homogeneity of one of the TGR pool, analysis on individual hazelnut have been performed, instead on pool, as before. The results show that, for each marker, the global allele number identified in all samples is always more than two expected. This suggest that the matrix isn’t homogeneous and none individual nut belong to the TGR cultivar.In questo progetto è stato messo a punto un metodo per la tracciabilità molecolare dell’olio di nocciola attraverso l’uso dei microsatelliti. Per tale scopo innanzitutto sono state messe a punto le tecniche di estrazione/amplificazione su 2 pool di nocciole di Tonda Gentile Romana (TGR). La migliore tecnica è stata poi utilizzata per l’analisi di altre quattro varietà di nocciole. I test di amplificazione effettuati sui DNA, estratti attraverso le diverse procedure, hanno permesso di valutare la qualità dei campioni e di individuare le miglior condizioni di PCR per l’analisi dei microsatelliti. Lo studio dei dei 9 microsatelliti effettuato sui migliori DNA ha permesso di definire un fingerprint per ciascuna varietà. Il confronto dei fingerprint con una banca dati suggerisce che le varietà possano corrispondere a quelle dichiarate, ad eccezione dei 2 pool di TGR. Nei pool di TGR infatti, Lo studio dei due pool con il marker CAC B028, ha messo in evidenza quattro forme alleliche, anziché due, in ogni campione facendo presupporre una disomogeneità di ciascuna delle due matrici. L’approccio molecolare messo a punto sulla matrice nocciola ha mostrato di essere efficace anche nello studio della matrice olio di nocciola, preparato a partire dai due pool di nocciole TGR, tanto da confermare i dati ottenuti da nocciola compresi quelli relativi al marker CAC B028. Per valutare l’omogeneità di del pool TGR1, sono state eseguite delle analisi su singole nocciole, anziché su pool, come fatto precedentemente. I risultati hanno evidenziato che, per ciascun marker, i campioni nel loro insieme mostrano più dei due alleli attesi. I risultati suggeriscono che la matrice TGR1 non è omogenea e nessuna delle singole nocciole analizzate appartiene alla cultivar TGR. II

    Caratteristiche strutturali e diversità delle comunità microbiche in sistemi acquatici ad alta variabilità ambientale: analisi dei batteri planctonici e dei biofilm

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    Dottorato di ricerca in Ecologia e gestione delle risorse biologicheIl lavoro sperimentale condotto nell’ambito del Dottorato di Ricerca in Ecologia e Gestione delle Risorse Biologiche ha riguardato lo studio delle comunità batteriche in ambienti acquatici sottoposti ad un diverso impatto antropico. In particolare, sono state caratterizzate - le comunità batteriche planctoniche in un ambiente marino-costiero lungo un gradiente di trofia delle acque (costa-largo); - le comunità batteriche associate a biofilm in ambiente fluviale lungo un gradiente di inquinamento delle acque (montevalle). La prima parte dell’attività di ricerca (capitolo 3.1) era inserita in uno studio multidisciplinare del CNR dal titolo “Stima dei flussi biogenici di CO2 in sistemi acquatici” che aveva come scopo generale quello di comprendere il ruolo dei microrganismi negli scambi di CO2 tra i sistemi marino-costieri e l’atmosfera. In particolare l’attenzione è stata focalizzata sulle dinamiche strutturali e sull'attività delle comunità microbiche in aree a diverso stato trofico. Le indagini di campo sono state svolte sui campioni raccolti durante due campagne oceanografiche effettuate nel mese di Marzo e di Novembre 2009 nel Mare Adriatico Settentrionale lungo un transetto perpendicolare alla costa. Lo studio della struttura di comunità ha previsto l’utilizzo di tecniche biomolecolari di ibridazione in situ (CARD-FISH) mentre la diversità filogenetica è stata analizzata tramite il sequenziamento del 16S rDNA e la costruzione di librerie di cloni. L’attività cellulare è stata studiata per mezzo dell’incorporazione di Bromodeossiuridina (BrdU-CARD). Questo studio è stato preceduto da una prima fase di ottimizzazione delle tecniche, anche attraverso la collaborazione e la permanenza per un periodo di tre mesi presso i laboratori del Max Planck Institute for Marine Microbiology (Brema, Germania). I risultati ottenuti mostrano come nel mese di Marzo si assista ad una completa instabilità della colonna d’acqua, caratteristica tipicamente invernale mentre nel mese di Novembre, la colonna d’acqua presenta una stratificazione termica, riconducibile ad una condizione di fine estate. Ulteriori differenze tra le due campagne sono state osservate anche per quanto riguarda le condizioni trofiche delle acque, con una situazione di oligotrofia nel mese di Marzo e di mesotrofia in Novembre, con acque più ricche in nutrienti nelle stazioni costiere e nei siti più superficiali delle stazioni intermedie. In questo contesto la comunità batterica ha mostrato delle forti relazioni con le caratteristiche chimico-fisiche della colonna d’acqua sia in termini di abbondanza che di composizione della comunità. La comunità batterica nelle stazioni costiere raggiunge densità più alte rispetto alle stazioni più al largo; al contrario, non si osservano cambiamenti significativi con il variare della profondità. Nel mese di Marzo la bassa concentrazione di fosforo e l’alto valore del rapporto N/P (156.3) sembrano limitare la crescita batterica. Nel mese di Novembre, il più elevato stato trofico delle acque si riflette in una maggiore abbondanza batterica ed i nutrienti sembrano giocare un ruolo minore nel limitare la crescita batterica, si osserva, infatti, un basso valore del rapporto N/P (7.6) più vicino al rapporto ottimale per la biomassa batterica. Anche l’attività della comunità, misurata come tasso di duplicazione cellulare tramite l’incorporazione di BrdU, mostra valori più elevati nelle stazioni costiere (in particolare nel mese di Novembre). Per quanto riguarda la dinamica dei gruppi filogenetici analizzati, seppur si osservi sempre una forte dominanza degli Alpha-Proteobacteria (con percentuali che raggiungono il 51% di tutte le cellule batteriche visualizzate), la composizione della comunità microbica mostra una forte stagionalità. Nel mese di Marzo si osserva una distribuzione più omogenea dei vari gruppi rispetto a Novembre in cui si evidenzia un aumento dei Cytophaga-Flavobacteria contrapposto ad un netto decremento dell’abbondanza relativa del gruppo dei Gamma-Proteobacteria. L’abbondanza del gruppo degli Alpha- Proteobacteria, con una forte presenza di sequenze relative al ceppo SAR11 prettamente marino (come evidenziato nelle quattro librerie di cloni per un totale di 230 sequenze) conferma l’adattabilità di questo gruppo a variazioni nelle concentrazione dei nutrienti, soprattutto nitrati, lungo il gradiente trofico. Il gruppo dei Cytophaga- Flavobacteria risulta essere fortemente influenzato dalla presenza di un gradiente di salinità e dall’alta concentrazione di materia organica particolata di derivazione alloctona. L’ abbondanza di questo gruppo risulta maggiore sotto costa in relazione a un maggior apporto di materiale organico di derivazione fluviale. Questo dato trova conferma inoltre nella presenza di sequenze associate al genere Fluvicola, prettamente d’acqua dolce, a dimostrazione della forte influenza degli apporti fluviali sulla linea di costa. Anche gli Actinobacteria, gruppo tipico d’acqua dolce, sono stati ritrovati solo nelle stazioni più prossime alla costa. La contestuale presenza di microrganismi prettamente marini e di acqua dolce sottocosta conferma quindi il carattere ecotonale di queste zone in cui la composizione della comunità microbica risulta fortemente determinata dal rimescolamento di masse d’acqua di diversa origine. Le comunità microbiche sono quindi influenzate in termini di abbondanza, di attività e di composizione filogenetica dalle caratteristiche chimico-fisiche della colonna d’acqua, che a loro volta risentono fortemente della stagionalità. La seconda parte del lavoro di Dottorato (capitolo 3.2) è focalizzata sulle comunità microbiche associate a biofilm in ambienti fluviali soggetti a forte impatto antropico. Le variazioni strutturali della comunità sono state studiate tramite l’applicazione della tecnica CARD-FISH. Tale studio, parte integrante di un progetto di ricerca di scambio tra IRSA e Università di Girona (Spagna), è stato effettuato lungo un gradiente di inquinamento monte-valle nel fiume Llobregat (Barcellona). Dopo i 25 giorni di accrescimento, si registra una minore abbondanza batterica nel sito con un minore impatto antropico, mentre nei siti maggiormente inquinati l’abbondanza microbica raggiunge valori significativamente più alti. Inoltre, è stato possibile osservare come nel sito a minore impatto, la comunità presenti una più omogenea distribuzione dei gruppi filogenetici analizzati, mentre nei siti a valle prevalgono i gruppi degli Alpha- e dei Beta-Proteobacteria. Per comprendere come le dinamiche della comunità batterica rispondano ad un diverso livello di impatto antropico si è proceduto alla traslocazione dei biofilm da acque provenienti da siti meno contaminati a quelle maggiormente inquinate. Interessante notare che dopo la traslocazione le comunità cresciute in zone a monte tendano ad assomigliare a quelle presenti nelle aree più impattate. Questi risultati mostrano come le caratteristiche qualitative delle acque rappresentino un fattore estremamente importante nella strutturazione delle comunità microbiche bentoniche e confermano che l’analisi delle risposte qualitative e quantitative delle comunità batteriche potrebbe diventare uno strumento essenziale sia come indice di qualità delle acque sia come early warning system per la contaminazione ambientale. L’ultima parte della tesi (capitolo 3.3) è stata focalizzata sulla messa a punto della CARD-FISH in combinazione con la microscopia confocale a scansione laser (CLSM) per l’applicazione a biofilm direttamente attaccati al substrato di crescita, mantenendone inalterata la loro architettura. Fino ad ora, infatti, i microrganismi presenti nel biofilm venivano analizzati tramite tecniche che prevedevano il distacco e la disgregazione dell’aggregato, con perdita di importanti informazioni sulla distribuzione spaziale dei ceppi batterici. La messa a punto di questo metodo offre quindi la possibilità di visualizzare i singoli ceppi batterici all’interno della struttura tridimensionale del biofilm durante le fasi di sviluppo con importanti implicazioni nello studio delle successioni microbiche.The studies, carried out within the Doctorate, aimed to investigate the structure and the function of the microbial community in different aquatic environments subject to anthropogenic impacts. The Thesis was focused on assessing the structure and diversity of the bacterioplankton in coastal waters with different trophic status and of the bacterial community in riverine microbial biofilms, along a gradient of increasing pollution. The first part of the thesis (Chapter 3.1) was part of a CNR project on the role of bacteria in the carbon cycle in the Adriatic Sea. Bacterial abundance and diversity were assessed by molecular techniques (16S rDNA cloning and sequencing, CARD-FISH), while bacterial activity was estimated by immunofluorescence techniques (BrdU incorporation). All samples were collected during two oceanographic cruises (March and November 2009) along a coastal-offshore transect with increasing values of nutrients concentration. The results showed high seasonality in the water chemicophysical characteristics passing from an oligotrophic state in March to a mesotrophic state in November. In March, the low P concentration and the high values of N/P ratio (156.3) seemed to limit the bacterial growth. In November, the increasing P concentration and the N/P ratio (7.6) closed to the optimal value for bacterial growth, brought to a higher bacterial activity and abundance, with higher values in the coastal sites. Bacterial community structure was also related to the chemical-physical characteristics. The community was dominated by the Alpha-Proteobacteria, typical of marine environment and favoured by the low concentrations of nutrients; Cytophaga- Flavobacteria showed a decreasing abundance in the offshore samples directly related to particle organic matter (POC) concentration. The presence of Actinobacteria, typical of the freshwater environments, found in higher percentages in the coastal stations also confirmed the importance of freshwater input along the Adriatic coast. 230 sequences were analyzed for 4 clone-library from surface and deep samples. Clone library showed that the Alpha-Proteobacteria were mainly represented by with the genus SAR11 while Gamma-Proteobacteria by Alteromonadales and many sequences of Cytophaga- Flavobacteria were affiliated with Flavobacteriales. The second part of the thesis (Chapter 3.2) was focused on the microbial communities associated to biofilm in riverine environments. The study, carried out in the context of an Italy-Spain exchange project, was aimed to investigate the effect of water pollution on bacterial communities in Llobregat River, Spain. Bacterial abundance was lower in the site subject to a lower antrophic impact in comparison with the downstream sites where the community showed higher abundance. In these sites a dominance of Alphaand Beta-Proteobacteria was observed. To better understand how the bacterial communities respond to the pollutant impacts, biofilms growth in less polluted sites were exposed to water from downstream sites in a traslocation experiment. At the end of the experiment, the traslocated biofilm quickly became similar to the biofilm in the impacted sites. Our results showed that quantitative and qualitative assessment of the bacterial community composition could become an useful indicator of the water quality and an early warning system for environmental changes. The last part of thesis (Chapter 3.3), was focused on the optimization of CARD-FISH protocol in combination with Confocal Laser Scanning Microscopy for the inspection of riverine intact biofilm attached to the original substrate for simultaneous identification and spatial localization of cells. Bacterial community composition was assessed during the biofilm development by using artificial substrates following the dynamics of specific bacterial clusters. Overall, we demonstrated that bacterial successional changes can be described by applying the CARD-FISH protocol to intact biofilms, which are ultimately from rivers, thereby avoiding biofilm detachment or manipulations. Our approach, in combination with an appropriate image analysis procedure, could contribute to elucidate how specific bacterial clusters participate to the development of the complex biofilm structures and the mechanisms that regulate community composition dynamic and cell dispersion in aquatic environments

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