Archivio Aperto di Ateneo
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Identification and characterization of regulatory networks controlling the expression and activity of the alternative sigma factor pvds in Pseudomonas aeruginosa
Pseudomonas aeruginosa is one of the most dreaded opportunistic pathogens in the hospital setting and represents the first cause of morbidity and mortality in cystic fibrosis patients. P. aeruginosa is able to produce several virulence factors; among them, the siderophore pyoverdine plays a critical role in P. aeruginosa pathogenicity. This siderophore is not only the main iron uptake system of P. aeruginosa but also a signaling molecule which promotes the expression of other virulence factors (i.e. exotoxin A, extracellular protease PrpL). The key role of pyoverdine in P. aeruginosa infections makes this siderophore a promising target for the development of anti-virulence drugs.
The antimicrobial agents currently used in clinical practice induce a strong selective pressure which causes the development and spreading of resistant bacteria. An alternative antibacterial strategy, which should reduce the emergence of resistance, is the development of anti-virulence drugs able to disarm pathogens without inhibiting their growth.
In the first part of this PhD thesis the use of a drug repurposing approach to search for anti-pyoverdine compounds is described. This approach is based on the search for side activities in old drugs already used in humans. A library of 1,120 marketed drugs was screened with a purpose-generated reporter strain, leading to the identification of a promising hit compound, the antimycotic drug flucytosine, which strongly reduced pyoverdine production in vitro without affecting bacterial growth. The anti-virulence activity of flucytosine was also confirmed in vivo in a mouse model of lung infection. This work provided the first evidence that pyoverdine inhibition is a suitable strategy for anti-virulence therapy against P. aeruginosa, and that drug repurposing is a cheap and rapid approach to search for novel anti-virulence compounds.
The prominent role of pyoverdine in P. aeruginosa virulence emphasized the importance of knowledge of pyoverdine regulation full understand P. aeruginosa pathogenicity. Previous transcriptomic studies suggested that the Gac system, which regulates the switch between the planktonic and biofilm lifestyles, could also influence pyoverdine gene expression in P. aeruginosa, although different studies obtained opposite results. In the second part of this PhD thesis the role of Gac system in the regulation of pyoverdine production has been investigated. It has been demonstrated that the Gac system and high intracellular levels of the intracellular signaling molecule bis-(3’-5’)-cyclic dimeric guanosine monophosphate (c-di-GMP) coordinately promote pyoverdine production. In more detail, these two systems indirectly control pyoverdine genes by modulating the expression of the operons encoding the enzymes involved in the synthesis of the two aggregative exopolysaccharides Pel and Psl. The deletion of both the pel and psl operons caused a strong reduction in the production of pyoverdine and pyoverdine-dependent virulence factors, irrespective of the Gac activation state or the intracellular c-di-GMP levels, indicating that these exopolysaccharides plays an important role in the regulation of this siderophore. We also found that the effect of Pel and Psl on pyoverdine production depends on their ability to support the formation of planktonic aggregates, rather than on the exopolysaccharides per se. Indeed, we observed that the simulation of aggregation in a Pel- and Psl-independent manner is able to restore pyoverdine production in the exopolysaccharide-null mutant. These results indicate that pyoverdine, and consequently, pyoverdine-dependent virulence factors are also controlled by a new regulatory system activated by the cellular aggregation.
In conclusion, this thesis shows that cell aggregation is not only important in the first stages of biofilm formation, but also in the regulation of virulence in P. aeruginosa. The formation of cellular aggregates depends on the production of the Pel and Psl exopolysaccharides, which are regulated by the Gac system. Therefore, given the role of Gac also in the activation of pyoverdine-dependent virulence, this system could represent a potential target to inhibit simultaneously biofilm formation and the production of several virulence factors. The drug repurposing approach was thus used to search for Gac inhibitors. Although the initial screening led to identify three promising anti-Gac compounds, subsequent experiments revealed that these molecules promote, rather than inhibit, biofilm formation in P. aeruginosa, in a Gac-independent manner. Consequently, they were not further investigated as potential anti-virulence drugs
Uniaxial material model for reinforcing bar including buckling in RC structures
The constitutive model of steel reinforcing bar incorporating inelastic buckling is rucial to accurate seismic performance evaluation of the existing reinforced concrete structures. According to experimental observations, in presence of inelastic buckling the absolute maximum stress of the rebar in compression could reduce to half of the value in absence of buckling.
In this thesis, based on fiber element model, the effect of the yield strength on the critical slenderness of the rebar is studied. Then the formulas, incorporating the effect of yield stress, are given to calculate the computational slenderness critical slenderness. Next the anisotropy of some stainless steel rebar is studied according to a series of monotonic and cyclic tests on bare stainless steel rebars. Two parameters are proposed to consider the effects of anisotropy of rebar. Considering the above studies, the modified Monti-Nuti Model is proposed to improve the applicability. In order to eliminate overestimation of stress when the model is subjected to generalized loading, the criteria to update the parameters in the model for each half branch at the reversal are discussed and new strategies to update the model parameters in different unloading or reloading cases are proposed. The Framework adopting Genetic Algorithm is designed to identify the parameters in the modified Monti-Nuti model. By minimizing the stress difference between the numerical curve and experimental curve at each strain step of the cyclic loading histories, the optimized parameters could be identified. Then the empirical formulae are proposed to calculate the values of the parameters in a simpler, more efficient and still robust way. The modified Monti-Nuti model is implemented into OpenSees as a new material model named as “steel05”. Then validation of this material model with the experimental curves of carbon steel rebars and stainless steel rebars confirms the effectiveness and significance of this new model.
Furthermore, the application of the new material in the structural analysis of circular reinforced concrete piers is made and the numerical curves are compared with the experimental curves to verify the effectiveness of the new material. Finally, the effects of corrosion of the rebar, which is inevitable in aged reinforced concrete structures, are studied based on a series of experiments on the bare corroded reinforcing bars. It is found that the mean yield stresses of the corroded rebar could be different in tension and in compression. The computational length of the rebar increases resulting from the deterioration of the confinement from the transverse loop. The corrosion extended model is proposed to consider the aforementioned characteristics resulting from corrosion
Isrogrogidda Falka Af-soomaaliga: Aragti ku aadan Midaynta Qoraalkiisa
Qoraagu wuxuu diraasad ku sameeyey sidii loo midayn lahaa af Soomaaliga qoraaal ahaan loo adeegsada. Gaar ahaan wuxuu diiradda saarayaa sidii loo midayn lahaa qaababka isrogrogga falalka oo haatan loo adeegsado siyaabo aan midaysanayn.In questo articolo, l'autore analizza e avanza una proposta relativamente alla standardizzazione del somalo scritto, in particolar modo delle forme di coniugazione dei verbi somali che attualmente non sono scritte in modo omogenea.In this article, the author analyzes and provides a proposal about the standardization of written Somali, in particular relating to verb conjugation forms whose orthography still differs today.Cabdirashid M. Ismaaciil, Cabdalla C. Mansuur, Saynab A. Sharci (eds.
Sheekooyin fogaan iyo dhowaan ba leh
Buuggani, oo la qoray 1972dii ka hor inta Af-soomaaliga rasmi ahaan loo qorin, maadaama xarafka "x" uu ka maqanyahay, oo kaalintiisa loo adeegsaday 2 xaraf "ch", wuxuu ka koobanyahay sheeko-dhaqameedyo badan oo xiisa leh.Il volume raccoglie vari racconti tradizionali somali molto interessanti, nel testo l'uso della grafia 'ch' per il suono oggi reso con la lettera 'x' rivela che la stesura è antecedente al 1972.The book contains several Somali traditional tales which are very interesting, in the text the use of the spelling 'ch' for the sound today spelled with the letter 'x' reveals that the writing is prior to 1972.Dokumentigan waxaa dadka u soo bandhigay "The Digital Somali Library", jaamacadda "Indiana University".Documento messo a disposizione dalla Digital Somali Library, Indiana University.Document provided by the Indiana University's Digital Somali Library.Link: http://www.indiana.edu/~libsalc/african/Digital_Somali_Library/history.htm
[Fotografie della Somalia: Attività e lavori agricoli]
Immagini appartenenti al Fondo iconografico Carlo Pedrini e messe a disposizione dalla Biblioteca di storia moderna e contemporanea (BSMC).Sawwirro iska leh Fondo iconografico Carlo Pedrini, waxaana soo bandhigtay maktabada "la Biblioteca di storia moderna e contemporanea (BSMC)".Images belonging to the Iconographic Fund "Carlo Pedrini" and provided by Biblioteca di storia moderna e contemporanea (BSMC).http://www.bsmc.it/modules.php?name=Content&pa=showpage&pid=5
Ai margini dei giganti : la vita intellettuale dei romani nel XIV secolo (1305-1367 ca.)
La tesi si propone di rivisitare un antico paradigma storiografico che continua a influenzare ancora oggi i lavori di sintesi sulla cultura italiana tardomedievale, paradigma
secondo il quale la città di Roma, in seguito al trasferimento della Curia pontificia ad Avignone all’inizio del Trecento, piombò in una fase di forte decadenza culturale fino al
ritorno stabile dei pontefici alla fine degli anni ’70. Sulla base di un nutrito corpus di codici e di diverse altre testimonianze manoscritte, si cerca così di ricostruire la realtà culturale romana ex novo, insistendo in maniera decisa sul periodo compreso tra il 1305 e il 1367.
Viene anzitutto riportata alla luce la complessa vita intellettuale svolta entro lo spazio
cittadino, prestando particolare attenzione al panorama scolastico, a quello librario e ai più importanti eventi culturali della città, qui osservata come luogo di cultura (cap. I). Il
discorso si focalizza in seguito sui principali attori culturali dell’Urbe, delineandone i profili, biografici, culturali e mentali, e riconducendo ciascun individuo al suo più generale contesto sociale e socio-professionale di appartenenza (cap. II). Si arriva così ad illustrare l’ampio e articolato quadro delle pratiche intellettuali dei romani, a partire dal consumo (ricerche librarie, letture) per giungere alla produzione culturale propriamente detta, con il fine di far emergere la diversità delle scelte operate da ciascun gruppo sociale nel campo della cultura, nonché di delineare i diversi sviluppi di queste attività nel corso del periodo trattato (cap. III). Ci si sofferma infine sulle applicazioni pratiche di due saperi specifici, l’ars dictaminis e la cultura storica, esplorati il primo attraverso l’analisi di un gruppo di testi epistolari, pubblici e privati, il secondo invece per mezzo di uno studio di quelle particolari elaborazioni genealogiche note agli storici come «genealogie incredibili» (cap. IV). Tutto ciò permette, in generale, di affermare che la realtà ricostruita è particolarmente ricca e difficilmente qualificabile come decadente. Perfettamente inseribile nel panorama italiano trecentesco, tale realtà non è però priva di caratteristiche d’avanguardia dal punto di vista della storia della cultura. Nel particolare, lo studio consente poi di rivisitare diverse interpretazioni avanzate di recente in merito ad alcuni aspetti della vita culturale romana
Impressioni Note
Documenti inediti a firma del Capitano Corso sull'istituzione delle residenze coloniali in Somalia di Balad-Teteilè e Barire, note sul territorio, la produzione e la popolazione.Qoraal aan horay loo daabicin oo ku sixiixan Kabtan Corso, wuxuu ka hadalyaa hoy gumaysi oo ku yaalla Beled Teteyle ee Bariire, sida uu yahay degaanka, waxsoosaarka iyo dadka ku nool.Unpublished documents by Captain Corso on the establishment of colonial residences of Balad-Teteilè and Barire in Somalia, notes on territory, production and population
Intensità urbana : un rapporto ragionato a partire dal caso di Roma
La Tesi di Dottorato intende ragionare attorno al concetto d’intensità urbana con cui descrivere città e territori contemporanei. Il termine intensità rimanda alle relazioni che s’instaurano fra individui e spazio, alle pratiche che, ad una scala più ampia, disegnano traiettorie che s’intrecciano e sovrappongono sul territorio. Un territorio abitato, una realtà che oggi non “impone” più un dentro e un fuori, o ne propone molteplici, città e territorio infatti non sono più in antitesi ma fra loro si comprendono. E se il termine urbano intendeva specificare la natura delle relazioni indagate risentirà necessariamente di questo nuovo rapporto. La pratica quindi assume un ruolo strumentale: l’intensità urbana allude alla somma delle diverse tracce e traiettorie che le pratiche realizzano sui territori abitati e può diventare un mezzo con il quale esplorare la città contemporanea, difficilmente interpretabile dal punto di vista fisico.
Un’“immagine” di città diversa da quella percepita o consolidata nell’immaginario collettivo e che tenta di mettere a sistema parti di territorio praticate, vicine o lontane che siano. Si propone quindi un mezzo finalizzato all’interpretazione di una dimensione “non fisica” della città. Una categoria di lettura delle pratiche che restituisce la città nella sua interezza e contemporaneamente una descrizione dell’“urbano” legato, entro questa interpretazione, all’esperienza dei territori piuttosto che alla loro dimensione fisica, non più certa e/o misurabile. Il percorso di ricerca cerca dapprima di restituire una definizione preliminare d’intensità urbana attraverso una narrativa teorica che guarda alla pratica in quanto dimensione “relazionale”, ovvero che produce un rapporto fra spazio, “luogo praticato” (De Certau, ‘L’invention du quotidiane’, 1980), e individuo, costruttore di narrative personali e attuatore di senso nel pastiche postmoderno (Amendola, ‘La città postmoderna’, 2003), ponendosi all’interno di un passaggio che ha a che fare con il modo di fare e interpretare la città associato alle profonde azioni di ristrutturazione urbana, riflessi dei più ampi cambiamenti che hanno interessato l’economia mondiale a partire dagli anni ‘60 (ci si riferisce allo scarto postmoderno che secondo Soja - Postmetropolis, 2000 - ha messo in crisi anche le strutture tradizionali di analisi e interpretazione urbana). Successivamente il percorso assume carattere laboratoriale perché, una volta ottenuti gli “strumenti”, si confronta con una porzione di “frangia” dell’area metropolitana di Roma cercando prima di leggere le forme assunte da questa porzione di territorio e le pratiche ad essa associate e successivamente applicarvi le questioni sollevate sul tema. L’approccio utilizzato vuole porsi entro il passaggio evidenziato da Soja in Postmetropolis (2000) che non può che essere utilizzato come suggestione per osservare e mettere alla prova i fenomeni e i processi di metropolizzazione e ragionare sull’intensità urbana nel contesto romano. Prendendo per buoni gli assunti teorici citati nella prima parte, ci si confronta con la forma della città contemporanea e con le sue pratiche. Sempre diversa, difficilmente assoggettabile a un modello ed esportabile. Ci si cala, inoltre, in una situazione di frontiera che sfuggendo al paradigma, perché in evoluzione, obbliga a lavorare per tentativi per giungere a un risultato. Si propone quindi un percorso esplorativo, che può disorientare esploratore e lettore, ma che tenta di produrre/individuare ipotesi (che forse non sono esportabili). Da Roma si parte non s’intende arrivare. Lavorare sull’apparente marginalità di questa porzione di territorio permette di capire cosa queste aree possono offrire, anche di diverso da Roma, se è possibile rifuggire da un immaginario consolidato, metropolitano radiocentrico, “centripeto”, se questi territori possono risultare in parte autonomi. S’intende quindi trovare una forma nella discontinuità fisica dei territori, una rottura nella struttura metropolitana continua il tutto sostenuto da una dimensione non fisica della città
Ololihii barashada farta soomaaliga
Taariikh kooban oo ku saabsan qoraalka farta soomaaliga, sidii ay ku dhalatay iyo heerarakii ay soo martay, horumarkii ololayaashii akhris-qoraalka, xaaladda ay hadda ku sugan tahay iyo aayatiinka dambe. Mar kale ma loo baahan yahay olole kale oo akhris-qoraal.Breve storia della lingua somala: come è nata, come si è sviluppata, le campagne di alfabetizzazione risalenti agli anni 1972-1974, la situazione odierna e cosa fare nel futuro prossimo. Il documentario si pone la seguente domanda: c'è ancora bisogno oggi di altre campagne di alfabetizzazione?A brief history of the Somali language: its origin, its development, the literacy campaigns dating back to the years 1972-1974, the current situation and what to do in the near future. Moreover the documentary poses the following question: do we still need today other literacy campaigns in Somalia?Link: https://www.youtube.com/watch?v=jCjh4wH5jx