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MAMAOT (2012). Estratégia Marinha para a subdivisão do\ud Continente. Diretiva Quadro Estratégia Marinha. Ministério da Agricultura, do Mar, do Ambiente e do Ordenamento do Território. Outubro de 2012.
AVALIAÇÃO DE POTENCIAIS IMPACTOS DA ACTIVIDADE DA PESCA NA POPULAÇÃO DE ROAZES DO ESTUÁRIO DO SADO
O estuário do Sado apresenta uma elevada riqueza biológica e é, um habitat de extrema importância para uma população de golfinhos-roazes (Tursiops truncatus), a qual constitui uma das poucas residentes em estuários europeus. Esta população depende do estuário em particular para a alimentação, sendo o choco (Sepia officinalis) uma das \ud
suas presas preferenciais. Dada a importância conservacionista e ecológica que esta espécie representa, pretendeuse com este trabalho avaliar os possíveis impactos da actividade da pesca na população de roazes. Para o efeito foram realizados censos de artes de pesca fundeadas no interior do estuário do Sado e inquéritos aos pescadores de várias comunidades do estuário. As artes de pesca mais utilizadas no estuário são o tresmalho e os covos. Através da avaliação do esforço de pesca nas diferentes zonas de amostragem, observou-se que a distribuição de covos se encontra maioritariamente entre o Canal de Alcácer e o Canal da Gâmbia. Quanto aos tresmalhos foram registados ao longo de todo o Canal Sul, no Canal da Comporta, no Canal de Alcácer até à Ilha do Cavalo e próximo dos estaleiros \ud
da Lisnave (Canal Norte). Através da análise das zonas de maior incidência de artes de pesca e de ocorrência de \ud
golfinhos-roazes, verificou-se que há uma sobreposição destas zonas, contudo, pela análise dos inquéritos efectuados aos pescadores não se verifica a existência de conflitos entre estes e os golfinhos. Estes resultados permitem-nos concluir que, apesar da actividade piscatória no estuário do Sado ser intensa, não se verificam impactos significativos sobre os roazes. No entanto, no futuro, a possível diminuição dos recursos disponíveis para a pesca e para a alimentação dos roazes ao longo do tempo, poderá conduzir a uma competição por recursos
Report of the Working Group on Acoustic and Egg Surveys for Sardine and Anchovy in ICES Areas VIII and IX (WGACEGG). 26-30 November 2012. Fuengirola, Spain.
Primeiro ano de monitorização de arrojamentos\ud 2011/12
No âmbito do projecto FAME – Future of the Atlantic Marine Environment, a SPEA definiu 5 transetos\ud
nas praias de maior extensão de areia na costa Sudoeste e Sul de Portugal, entre a Costa da\ud
Caparica e Vila Real de Santo António, para serem percorridos 3 vezes por ano (primavera, outono e\ud
inverno), com o intuito de monitorizar animais arrojados. Foi realizada uma parceria com a Polícia\ud
Marítima no sentido da utilização dos veículos “Rhino”. Entre Março de 2011 e Março de 2012 foram\ud
encontradas 58 aves marinhas, 6 cetáceos, 1 tartaruga-de-couro e 1 ave terrestre.\ud
No total de 327 km cobertos nos 3 períodos, a espécie mais comum foi a gaivota-de-patas-amarelas\ud
Larus michahellis (14 indivíduos), seguida da gaivota-d’asa-escura Larus fuscus (13 ind.), e o alcatraz\ud
Morus bassanus (12 ind.). As gaivotas foram o grupo mais representado, com a presença de 35\ud
indivíduos de 5 espécies. O período em que foram encontrados mais animais arrojados foi o outono.\ud
Este facto pode estar relacionado com a passagem pós-reprodutora de espécies invernantes (Larus\ud
fuscus e Morus bassanus) ou condições climatéricas adversas em alto mar.\ud
Não foi possível avaliar as causas de morte da maioria dos animais, no entanto 3 cadáveres\ud
apresentavam indícios de morte por contacto com artes de pesca.\ud
De referir ainda que a matéria vegetal compõe a maior parte dos resíduos encontrados na totalidade\ud
dos transetos (50%), sendo o restante composto por resíduos provenientes da pesca (27,54%) e\ud
recicláveis (22,6%). Este relatório refere-se apenas ao primeiro ano de monitorização
VMStools: open-source software for the processing, analysis and visualisation of fisheries logbook and VMS data.
Vmstools is a package of open-source software, build using the freeware environment R, specifically developed for the processing, analysis and visualisation of landings (logbooks) and vessel location data (VMS) from commercial fisheries. Analyses start with standardized data formats for logbook (EFLALO) and VMS (TACSAT), enabling users to conduct a variety of analyses using generic algorithms. Embedded functionality handles erroneous data point detection and removal, métier identification through the use of clustering techniques, linking logbook and VMS data together in order to distinguish fishing from other activities, provide high-resolution maps of both fishing effort and landings, interpolate vessel tracks, calculate indicators of fishing impact as listed under the Data Collection Framework at different spatio- temporal scales. Finally data can be transformed into other existing formats, for example to populate regional databases like FishFrame. This paper describes workflow examples of these features while online material allows a head start to perform these analyses. This software incorporates state of-the art VMS and logbook analysing methods standardizing the process towards obtaining pan-European, or even worldwide indicators of fishing distribution and impact as required for spatial planning
The role of breeding experience on the\ud foraging specialization of a pelagic marine\ud predator, the Cory's sheawater
Experience is believed to be an important factor determining the foraging\ud
success of animals, but there are still very few studies investigating how foraging\ud
abilities develop over time. In this study, the spatial distribution and foraging tactics\ud
of inexperienced and experienced individuals of a Procellariiform seabird species, the\ud
Cory’s shearwater (Calonectris diomedea borealis) breeding on the Portuguese\ud
continental shelf was compared. Kernel analysis and a multivariate analysis\ud
(MADIFA) showed that while the experienced birds were relying on known static\ud
features such as the bathymetry of the area, inexperienced birds were using larger\ud
areas that were explained by different static and dynamic variables each year. The\ud
foraging areas of the two groups overlapped less and less for each year, while stable\ud
isotope signatures were becoming more and more similar, as inexperienced birds were\ud
foraging on higher trophic prey closer to the coast, like the experienced birds. Linear\ud
mixed models comparing home ranges and foraging areas calculated for each group\ud
showed that the experienced birds were in general more successful in detecting\ud
favourable foraging grounds, except in 2011, when the results showed the opposite.\ud
Interestingly, the reproductive success of the inexperienced birds was significantly\ud
higher than for experienced birds during that season
Protecting Persistent Dynamic Oceanographic Features: Transboundary Conservation Efforts Are Needed for the Critically Endangered Balearic Shearwater
The protection of key areas for biodiversity at sea is not as widespread as on land and research investment is necessary to identify biodiversity hotspots in the open ocean. Spatially explicit conservation measures such as the creation of representative networks of marine protected areas (MPAs) is a critical step towards the conservation and management of marine ecosystems, as well as to improve public awareness. Conservation efforts in ecologically rich and threatened ecosystems are specially needed. This is particularly urgent for the Mediterranean marine biodiversity, which includes highly mobile marine vertebrates. Here, we studied the at sea distribution of one of the most endangered Mediterranean seabird, the critically endangered Balearic shearwater Puffinus mauretanicus. Present knowledge, from vessel-based surveys, suggests that this species has a coastal distribution over the productive Iberian shelf in relation to the distribution of their main prey, small pelagic fish. We used miniaturised satellite transmitters to determine the key marine areas of the southern population of Balearic shearwaters breeding on Eivissa and spot the spatial connections between breeding and key marine areas. Our tracking study indicates that Balearic shearwaters do not only forage along the Iberian continental shelf but also in more distant marine areas along the North African coast, in particular W of Algeria, but also NE coast of Morocco. Birds recurrently visit these shelf areas at the end of the breeding season. Species distribution modelling identified chlorophyll a as the most important environmental variable in defining those oceanographic features characterizing their key habitats in the western Mediterranean. We identified persistent oceanographic features across time series available in the study area and discuss our results within the current conservation scenario in relation to the ecology of the species
Ecological segregation inferred using chemical tracers and contamination assessment of five toothed whales in the Northwest Iberian Peninsula
The first objective of this PhD was to determine the degree of ecological segregation between five sympatric species of toothed whales (i.e. common dolphin Delphinus delphis, harbour porpoise Phocoena phocoena, bottlenose dolphin Tursiops truncatus, striped dolphin Stenella coeruleoalba and long finned pilot whale Globicephala melas) inhabiting a restricted and highly productive area, the North West Iberian Peninsula (NWIP). To this end, chemical parameters analyses were used as an “alternative method” of assessing diet and habitat of these animals over different periods of integration, complementing the information given by traditional methods of investigation such as stomach contents, faeces analyses and field observations. The second objective was to evaluate the contamination status of these species in order to estimate the toxicological risk these populations face and to complete the existing database. In this context, trace elements, carbon and nitrogen stable isotopes, as well as persistent organic pollutants (POPs) were selected as chemical parameters for our investigations. Firstly, the chemical parameters were used as ecological tracers of populations (or parts of populations) by drawing an image of the diet and habitat of the species at different time scales. We estimated that the food web has five trophic levels, with toothed whales occupying the top positions, with no significant difference in trophic positions among them, ranging from 4.3 to 5.3. While the analysis of a single chemical parameter did not completely segregate between the five species, the information gained by combining the analyses of several long-term ecological tracers (i.e. nitrogen and carbon stable isotopes in teeth and renal cadmium concentrations) revealed ecological niche segregation in two dimensions of this niche (the trophic and the spatial dimensions). However, year-to-year or seasonal variations could not be investigated, except for in common dolphin, and thus temporary overlap cannot be excluded. Additionally, we showed that polychlorinated biphenyls (PCBs) profiles could be a relevant tracer of the foraging ecology of taxonomically close species, allowing a fine separation of the species as result of their different patterns. This was particularly clear for the harbour porpoise and striped dolphin. Secondly, the contamination status of the species in this area was evaluated, with concentrations interpreted in the light of biological and ecological factors. But the bioaccumulation of trace elements appeared to be less predictable than that of POPs. Bottlenose dolphins and harbour porpoises were found to have higher PCBs concentrations than the rest of the analysed NWIP toothed whales, as well as those of adjacent NE Atlantic waters. The main results of this PhD highlight the relevance of exploiting these chemical parameters as ecological tracers, as well as their usefulness in the comprehensive study of structure and function of ecosystems through the role of top predators. Combined with the information on anthropogenic activities, this work can also contribute to the development and implementation of management plans and mitigation measures for these five species of toothed whales in the NWIP.\ud
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O primeiro objetivo desta tese foi determinar qual grau de segregação ecológica existente entre cinco espécies simpráticas de cetáceos odontocetes (i.e. golfinho-comum Delphinus delphis, bôto Phocoena phocoena, roaz-corvineiro Tursiops truncatus, golfinho-riscado Stenella coeruleoalba e baleia-piloto Globicephala melas) que habitam numa área restrita e altamente produtiva, o Noroeste da Península Ibérica (NOPI). Para este fim, foram analisados parâmetros químicos como um "método alternativo" que pode refletir a dieta e habitat em diferentes períodos de integração destes animais, complementando a informação obtida através de métodos tradicionais tais como as análises de conteúdos estomacais, as análises de fezes e a observação de campo levadas a cabo no NOPI. O segundo objetivo foi avaliar o estado de contaminação destas espécies, obtendo dados de base de contaminantes nestas populações e estimar o risco toxicológico. Os elementos traço, os isótopos estáveis de carbono e nitrogênio e os poluentes orgânicos persistentes (POPs) foram seleccionados como parâmetros químicos para responder aos nossos objectivos. Em primeiro lugar, os parâmetros químicos foram utilizados como traçadores ecológicos de populações (ou partes das populações) pondo em evidência a dieta e habitat das espécies em estudo ao longo de diferentes escalas temporais. Estimou-se que a cadeia trófica possui um total de cinco niveis tróficos onde os cetáceos odontocetes estudados ocupam as posições mais elevadas sem apresentar diferenças significativas entre elas, variando desde 4.3 para 5.3. Embora a análise de um único parâmetro químico não tenha permitido segregar completamente as cinco espécies, a informação obtida combinando as análises de vários traçadores ecológicos a longo prazo (i.e. isótopos estáveis de carbono e nitrogênio em dentes e concentrações de cádmio nos rins) revela uma segregação do nicho ecológico entre as cinco espécies em duas dimensões do nicho (a dimensão trófica e a dimensão espacial). Porém, não pode ser excluída uma sobreposição temporal, uma vez que não foi possível investigar variações sazonais ou interanuais, excepto no caso do golfinho-comum. Adicionalmente, mostramos que perfis de policloro bifenis (PCBs) podem ser un traçador pertinente da ecologia alimentar de espécies taxonomicamente próximas permitindo uma boa separação das espécies bôto e golfinho-riscado de acordo com os seus diferentes padrões. Em segundo lugar, foi avaliado o estado de contaminação das espécies nesta área. As concentrações foram interpretadas tendo em conta factores biológicos e ecológicos. No entanto, a bio-acumulação dos elementos traço mostrou-se menos previsível que a bio-acumulação dos POPs. O roaz-corvineiro e o bôto exibiram as concentrações mais elevadas de PCBs com respeito dos outros cetáceos odontocetes do NOPI e com respeito aos outros indivíduos de águas vizinhas do Oceano Atlântico Nordeste. Os principais resultados desta tese mostram a relevância destes parâmetros químicos como os traçadores ecológicos e a sua utilidade no estudo da estrutura e funcionamento dos ecossistemas através do papel dos predadores de topo. Combinando estes dados com a informação sobre as atividades antropogénicas, este trabalho pode contribuir ao desenvolvimento e implementação de planos de gestão e mitigação para estas cinco espécies de cetáceos odontocetes no NOPI.\ud
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Le premier objectif de ce travail de thèse était de déterminer quel est le degré de ségrégation écologique entre cinq espèces sympatriques de cétacés odontocètes (i.e. le dauphin commun Delphinus delphis, le marsouin commun Phocoena phocoena, le grand dauphin tursiops truncatus, le dauphin bleu et blanc Stenella coeruleoalba et le globicéphale noir Globicephala melas) fréquentant l’aire marine restreinte et très productive du Nord-Ouest de la Péninsule Ibérique (NOPI). Pour cela, des paramètres chimiques ont été analysés dans les tissus biologiques, en tant que “ méthode alternative ” pouvant refléter de façon précise le régime alimentaire et l’habitat de ces animaux à différents échelles de temps d’intégration, et ainsi compléter les informations apportées par des méthodes plus traditionnelles tels que l’analyse des contenus stomacaux ou des fèces, ou encore les données d’observations en mer. Le second objectif de ce travail était d’évaluer l’état de contamination de ces espèces, pour acquérir une base de données de référence complète les concernant et estimer le risque toxicologique auquel elles peuvent faire face. Dans ce contexte, les éléments traces, les isotopes stables du carbone et de l’azote, et les polluants organiques persistants (POPs) sont les paramètres chimiques qui ont été sélectionnés pour répondre aux objectifs fixés. Dans un premier temps, les paramètres chimiques ont été utilisés comme traceurs écologiques des populations (ou de segments de population), procurant une image du régime alimentaire et de l’habitat des espèces à différentes échelles de temps. Nous avons calculé que le réseau trophique du NOPI avait cinq niveaux trophiques, au sein duquel les espèces étudiées occupaient les plus hautes positions, comprises entre 4,3 à 5,3, et sans qu’il y ait de différence significative de position trophiques entre les espèces. Alors que l’analyse d’un seul paramètre chimique ne permettait pas ségréger les cinq espèces, les informations apportées par l’analyse de plusieurs traceurs de long terme (i.e. rapport des isotopes stables du carbone et de l’azote dans les dents et concentrations de cadmium dans les reins) ont révélé une ségrégation de leur niche écologique dans deux des dimensions possibles (les dimensions trophique et spatiale). Cependant, les variations pouvant survenir d’une année sur l’autre ou saisonnières n’ont pas pu être étudiées, excepté pour le dauphin commun, et un chevauchement temporaire des niches ne peut donc pas être totalement exclu. De plus, nous avons montré que les profils de polychlorobiphényles (PCBs) pouvaient être un traceur pertinent de l’écologie trophique d’espèces taxinomiquement proches, en permettant une séparation fine des espèces telles que le marsouin commun et le dauphin bleu et blanc, d’après les différents profiles d’accumulation de ces deux espèces. Dans un second temps, l’état de contamination des espèces dans la zone d’étude a été évalué. Les concentrations ont été interprétées à la lumière des facteurs biologiques et écologiques pouvant influencer ces concentrations, et la bioaccumulation des éléments traces s’est révélée moins prévisible que celle des POPs. Le grand dauphin et le marsouin commun présentaient les concentrations de PCBs les plus élevées par rapport aux autres cétacés odontocètes du NOPI et par rapport à d’autres individus des eaux adjacentes de l’Atlantique Nord-Est. Les résultats principaux de ce travail de thèse ont mis en évidence la pertinence d’utiliser ces paramètres chimiques comme traceurs écologiques, et leur utilité dans la compréhension de la structure et le fonctionnement des écosystèmes à travers le rôle des prédateurs supérieurs. En combinant ces résultats à des informations concernant les activités anthropiques, ce travail peut contribuer au développement et à l’implémentation de mesures de gestion pour ces cinq espèces de cétacés odontocètes du NOPI
Censo da População\ud Reprodutora do Corvo-marinho-de-crista\ud no Arquipélago das Berlengas em 2012
É no arquipélago das Berlengas que se encontra o maior núcleo reprodutor de Corvo-marinho-de-crista Phalacrocorax a. aristotelis em Portugal. Nas últimas décadas, a população aqui nidificante, que concentra mais de 60% do efectivo reprodutor nacional, tem vindo a ser monitorizada. Em 2012 foi efectuado um censo no arquipélago das Berlengas. A população nidificante foi estimada em 82 casais reprodutores, estando a sua maioria concentrada na ilha da Berlenga, à excepção de 6 casais nidificantes no Farilhão Grande. A população nidificante neste arquipélago aparenta estar estável. O ligeiro decréscimo observado (ca. 10%) comparativamente aos censos anteriores, poderá estar relacionado com a variação decorrente da dinâmica natural da espécie, sendo importante continuar a monitorização desta colónia. Este estudo vem confirmar a importância do arquipélago das Berlengas para o Corvo-marinho-de-crista em Portugal. No decorrer dos trabalhos de campo foi ainda observado um Airo Uria aalge, sem ter sido possível confirmar a sua nidificação, que parece actualmente bastante improvável. O escasso número de indivíduos registado nos últimos anos, no único local onde a espécie foi encontrada a reproduzir-se recentemente, aponta para a extinção iminente e irreversível da população nidificante desta espécie no território português