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Organic Carbon and Nitrogen Isotopes of the Palaeocene-early Eocene: Implications on Stratigraphy, Paleoenvironment and Paleoclimatology
No full textThis PhD focuses on organic carbon stable isotope geochemistry of particulate organic carbon (δ13Corg) during the Palaeocene and earliest Eocene. A huge number of isotopic analyses have been performed by the development of a robust organic carbon isotope methodology reliable for marine and continental settings. Thanks to this methodology, more than five hundreds samples have been analysed. A complete δ13Corg record is established for several sections encompassing the whole Palaeocene, giving a chemo-stratigraphic framework for this stage. Some “high resolution” analyses of this integrative proxy propose an accurate and precise stratigraphic reference mark for some short “transient” events like at Palaeocene Eocene boundary (PETM = Palaeocene Eocene Thermal Maximum) on one hand and at the Danian Selandian boundary on the other hand. Organic carbon isotope record developed in this PhD brings a supplementary dimension in the understanding of the carbon cycle variations at short and long-term for the Palaeocene and earliest Eocene interval. These records improve our knowledge of “short-term” (high-frequency) carbon isotope variations often comprised in a much more long-trend evolution (long-term, low-frequency) of the carbon cycle in marine as well as in continental settings. This proxy, associated to the nitrogen isotope of organics (δ15Norg), palynofacies, Rock-Eval analyses and magnetic susceptibility data allows possible the study of complex environmental and climatic phenomenons occurring before, during and after the carbon cycle perturbation, which affect the evolution of mammals, plants and other organisms. Geological research implied in the definition of stratigraphic boundary proposes here a powerful proxy, more and more precise, in the geological timescale, which improve our knowledge of this complex “greenhouse world” when associated to others proxies.Cette thèse de doctorat se consacre à la géochimie isotopique du carbone de la matière organique particulaire (δ13Corg) durant la période géologique du Paléocène et de l’Eocène inférieur. De nombreuses données isotopiques ont été acquises par le développement d’une méthodologie analytique robuste des isotopes du carbone de la matière organique, à partir de la roche totale d’origine marine ou continentale. Grâce à cette méthode, plus de cinq cents échantillons ont pu être analysés. Il en résulte un enregistrement complet du δ13Corg pour l’ensemble du Paléocène sur plusieurs coupes, fournissant un canevas chémo-stratigraphique pour cet étage. Des analyses similaires à haute résolution sont également effectuées à la limite entre les étages Paléocène et Eocène (PETM = Palaeocene Eocene Thermal Maximum = Maximum Thermique du Paléocène/Eocène) d’une part et à la limite entre les étages Danien et Selandien d’autre part. L’enregistrement isotopique de ces évènements « rapides » (haute fréquence) précise nos connaissances sur les variations du cycle du carbone à « court termes », souvent incluses dans une tendance isotopique à plus long terme (basse fréquence). La stratigraphie isotopique du carbone ainsi établie, est également comparée aux informations bio-stratigraphiques disponibles (mammifères, foraminifères et nannoplanctons) afin d’observer la réponse des organismes et comprendre l’évolution de ceux-ci face aux perturbations climatiques et environnementales liées au cycle du carbone. Des reconstructions paléo-environnementales et paléo-climatiques sont également proposées. Elles intègrent les données isotopiques du carbone combinées à celles des isotopes de l’azote organique (δ15Norg), des analyses du palynofaciès et Rock-Eval. Les fluctuations du niveau marin associées aux variations du cycle du carbone sont confrontées grâce aux résultats issus de la susceptibilité magnétique des roches. Les isotopes du carbone de la matière organique sont ainsi comparés à plusieurs autres « proxies » afin d’intégrer ces résultats dans le contexte géologique et environnemental complexe du Paléocène et de l’Eocène inférieur. Le caractère « global » du signal isotopique du carbone en fait un outil performant tant d’un point de vue stratigraphique que paléo-écologique.(DOCSC04) -- FUNDP, 201
On automatic, constraint-based test-case generation for Mercury and its application to imperative languages
No full textCreating a piece of software behaving the way the user expects it to behave is a central problem in computer science. Once a system is implemented, it needs to be evaluated in order to verify that it accurately and completely fulfils the initial expectations. Arguably the most commonly applied strategy to achieve this is testing. In testing terminology, we call a test case the combination of a single
input for a software component with the expected result of its execution using that input, whereas a test suite refers to a collection of individual test cases.
Testing refers to the activity of running a software component with respect to a well-chosen test suite and comparing, for each test case, the output that is produced with the expected result in order to find errors.
The difficulty in software testing is due to the complexity of the systems; this complexity has never stopped growing over the years, which renders the need for constant improvement of testing techniques crucial. In particular, a test suite must be constructed in such a way that it will allow the testers to discover as many errors as possible in the program. While it is provably impossible to design test suites in such a way that the program is exercised in all the possibles ways it can possibly be, computer scientists have defined different adequacy criteria which, if satisfied by a given test suite, indicate that the successful execution of this test suite will sufficiently increase the confidence of the testers in the correctness of a program.
The hard part of the testing process is constructing a test suite which satisfies the chosen adequacy criteria. This activity can be very time-consuming when performed manually; moreover, the resulting test suites are very large and complex, to such an extent that they can themselves contain errors. There exists therefore a strong interest in automating this process.
In this work, we present a testing framework for the logic programming language Mercury able to generate and execute test suites that satisfy a given set of adequacy criteria. The technique we define is based on symbolic execution and constraints, and is able to deal with complex (possibly user-defined) data types. We also show how we can adapt this method in order to generate test suites satisfying sets of adequacy criteria in the context of imperative programming languages using heap-allocated pointer-based data structures.La création de logiciels fonctionnant de la manière attendue par l'utilisateur est un problème central de l'informatique. Lorsqu'un système a été implémenté, il doit être évalué afin de vérifier s'il satisfait complètement et précisément aux attentes initiales. La stratégie la plus répandue pour effectuer cette évaluation est sans doute le test. Dans la terminologie du testing, un cas de test est la combinaison d'une donnée d'entrée pour un composant logiciel avec le résultat attendu de l'exécution de ce composant en utilisant cette donnée d'entrée ; d'autre part, une suite de test désigne un ensemble de cas de test. Le test lui-même consiste donc en l'exécution du composant logiciel avec une suite de test bien choisie et en la comparaison, pour chaque cas de test, du résultat produit en regard du résultat attendu, dans le but de détecter des erreurs.
La difficulté du test de logiciels est dûe à la complexité des systèmes ; cette complexité n'a cessé de grandir avec les années, rendant crucial le besoin d'une amélioration continue des techniques de test. Plus particulièrement, la construction d'une suite de test doit être réalisée d'une façon telle qu'elle permette aux testeurs de découvrir un maximum d'erreurs présentes dans le programme. Si l'impossibilité de concevoir des suites de test éprouvant un programme de toutes les manières possible a été formellement établie, les informaticiens ont toutefois défini différents critères d'adéquation qui, s'ils sont satisfaits par une suite de test donnée, indiquent que l'exécution réussie de cette suite de test pourra suffisamment accroître la confi- ance des testeurs en l'exactitude d'un programme. La phase la plus difficile du processus de test est la construction d'une suite de test satisfaisant des critères d'adéquation sélectionnés. Cette activité peut être extrêmement consommatrice en temps lorsqu'elle est effectuée manuellement ; de plus, les suites de test qui en résultent sont généralement très longues et complexes, à tel point qu'elles peuvent elles-mêmes contenir des erreurs. Il existe dès lors un fort intérêt dans l'automatisation de cette procédure.
Dans cet ouvrage, nous présentons une plate-forme de test pour le langage de programmation Mercury capable de générer et exécuter des suites de test satisfaisant un ensemble de critères d'adéquation. Notre technique basée sur l'exécution symbolique et les contraintes est capable de traiter des types de données complexes (éventuellement définis par l'utilisateur). Nous montrons ensuite une adaptation de notre méthode capable de générer des suites de test satisfaisant des ensembles de critères d'adéquation dans le contexte de langages de programmation impératifs utilisant des structures de données basées sur les pointeurs.(DOCSC06) -- FUNDP, 201
A biomimetic approach for improved light extraction from solid-state sources: from fireflies to light-emitting diodes
No full textSince their first use, solid-state lighting devices have received a growing interest and popularity from engineers, physicists, industry and consumers. Their promising internal efficiencies, i.e. the high conversion rates of injected current to produced light, make them very appealing for the replacement of incandescent or fluorescent light sources. The major challenge for the development of these light sources is to enhance the external light extraction: the active material of light emitting diodes is in general a semiconductor with a high refractive index, which considerably limits the extraction of light into free space due to total reflection. This lack of high external efficiency has generated an important amount of research and publications. Very different approaches have been considered to enhance the external light extraction efficiency: photonic crystals, photonic structures inside and above the active material, graded refractive index layer to reduce the high index contrast between the active material and air, plasmonic resonances and more.
In the present research, the bioluminescent organ's morphology of a Panamanian firefly is used as a source of inspiration to improve the light extraction efficiency of light-emitting devices. The internal efficiencies of light-emitting devices are nowadays very high, yet, the overall efficiency is limited by the total internal reflection due to the high refractive index of the incident medium. Fireflies emit light in their dense bioluminescent organ and light extraction is equally limited by total internal reflection. During their million years of evolution, the bioluminescent organ had the time to improve both, its internal functioning and its light extraction efficiency.
The thorough analysis of the lantern's morphology shows several structures added on the light path, that could influence the light extraction efficiency. The jagged scales form a micrometric, two-dimensional and asymmetric structure which is shown, through simulations, to influence the light extraction positively. The new arrangement of the interface leads to a considerable increase in the light extraction efficiency. A similar analysis is then carried out with a two-dimensional and a three-dimensional symmetric structure. From the simulations it has been concluded that the firefly inspired structure is the most suitable for fabrication on light-emitting diodes. In the framework of a collaboration with microelectronics experts, the jagged-scale structure inspired from fireflies has been adapted to enhance the light-extraction efficiency of an GaN-based LED. Measurements confirm tendency that light extraction increases, as predicted by the simulations.Les diodes électroluminescentes ont reçu un intérêt croissant de la part des ingénieurs, physiciens, industriels et consommateurs, depuis leur première utilisation. Leur efficacité interne élevée, c'est-à-dire le taux de conversion élevé de courant injecté en lumière émise, les place en bonne position pour remplacer les sources lumineuses incandescentes et fluorescentes. Une limitation persiste néanmoins sur l'efficacité globale de la diode: les matériaux actifs ont des indices de réfraction élevés par rapport au milieu émergent (l'air), ce qui limite considérablement l'extraction de lumière, et ainsi l'efficacité externe, à cause du phénomène de réflexion totale. Ce manque d'efficacité externe a généré une activité de recherche considérable avec une grande variété d'approches différentes pour résoudre le problème: cristaux photoniques, structures photoniques dans et au dessus du milieu actif, couches d'indice de réfraction adaptative pour réduire le contraste élevé entre le milieu incident et émergent.
L'organe bioluminescent d'une luciole du Panama est utilisé comme source d'inspiration pour l'amélioration de l'efficacité d'extraction de lumière des diodes dans la recherche présentée dans ce manuscrit. La lumière émise par les lucioles est générée chimiquement dans son organe bioluminescent, qui présente un matériau dense par rapport à milieu émergent (l'air). Pendant les millions d'années d'évolution, l'organe bioluminescent a pu avoir le temps d'améliorer son fonctionnement interne ainsi que l'extraction de lumière, c'est-à-dire son efficacité externe. L'étude morphologique de la lanterne a montré différentes structures qui peuvent influencer la propagation de la lumière entre l'organe émetteur et l'air libre. Les écailles inclinées forment un réseau micrométrique, bidimensionnel et asymétrique. Les simulations associées montrent que cette structure augmente considérablement l'extraction de lumière. Une analyse similaire est conduite pour deux modèles inspirées: une structure triangulaire (bidimensionnelle et symétrique), ainsi qu'une structure pyramidale (tridimensionnelle et symétrique). Les simulations permettent de conclure que la structure à écailles inclinées de la luciole est la mieux adaptée à la fabrication. Dans le cadre d'une collaboration avec des experts en microélectronique, la structure à écailles inclinées, inspirée par les lucioles, a été adaptée pour augmenter l'efficacité d'extraction de lumière d'une diode basée sur le GaN. La mesure réalisée confirme la tendance prédite par les simulations.(DOCSC01) -- FUNDP, 201
Etude du rôle de l’autophagie et de la réponse UPR dans la résistance des cellules cancéreuses contre l’apoptose induite par le paclitaxel.
No full textCancer cell resistance against chemotherapy is still a heavy burden to improve anticancer treatments. Understanding the mechanisms responsible for the resistance against chemotherapy-induced cell death is of interest since the number of patients with cancer increases and relapse is commonly observed. Development of hypoxic regions is known to promote cancer cell adaptation to the stressful tumoral microenvironment and resistance against anti-cancer therapies. The HIF-1 signaling pathway, activated under hypoxia, promotes cancer cell adaptation and resistance against chemotherapy. Other biological processes are also activated under hypoxia and/or after chemotherapy treatment and are known to promote cancer cell survival. Autophagy and UPR (unfolded protein response) are part of these processes. Therefore, during the first part of this work, we sought to evaluate the role of autophagy and hypoxia on the taxol-induced apoptosis in MDA-MB-231 breast cancer cells. Results showed that taxol induced apoptosis after 16 h of incubation, and that hypoxia protected MDA-MB- 231 cells from taxol-induced apoptosis. In parallel, taxol induced autophagy activation already after 2 h of incubation both under normoxia and hypoxia. Autophagy activation during taxol exposure was shown to be a protective mechanism against taxol-induced cell death both under normoxia and hypoxia. However, at longer incubation times, the autophagic process reached a saturation point under normoxia leading to cell death, whereas under hypoxia, autophagy flow still correctly took place allowing the cells to survive. Autophagy induction was initiated via mechanistic target of rapamycin (mTOR) inhibition, which is more important in cells exposed to hypoxia. Taxol also induced c-Jun N-terminal kinase (JNK) activation and phosphorylation of its substrates B-cell CLL/lymphoma 2 (Bcl2) and Bcl2-like 1 (BclXL) under normoxia and hypoxia very early after taxol exposure. Bcl2 and BclXL phosphorylation was decreased more importantly under hypoxia after long incubation times. The role of JNK in autophagy and apoptosis induction was studied using siRNAs. The results showed that JNK activation promoted resistance against taxol-induced apoptosis under normoxia and hypoxia without being involved in induction of autophagy. In conclusion, the resistance against taxol-induced cell death observed under hypoxia can be explained by a more effective autophagic flow activated via the classical mTOR pathway and by a mechanism involving JNK, which could be dependent on Bcl2 and BclXL phosphorylation but independent of JNK-induced autophagy activation. During the second part of this work, the impact of UPR combined to hypoxia on autophagy and apoptosis activation during taxol exposure was investigated in MDA-MB-231 breast cancer cells. Results showed that taxol rapidly induced endoplasmic reticulum (ER) stress and UPR activation and that hypoxia modulated taxol-induced UPR activation. The putative involvement of PERK (protein kinase double-stranded RNA-dependent (PRK)-like ER Kinase), ATF6 (activating transcription factor 6) and IRE1 (inositol-requiring enzyme-1) signaling pathways in autophagy or in apoptosis regulation after taxol exposure was investigated. No link between the activation of these three ER stress sensors and autophagy or apoptosis regulation was evidenced. However, UPR played a role in the induction of VEGF (vascular Endothelial Growth Factor) secretion triggered by taxol exposure specifically in cells incubated under hypoxia. Results also showed that ATF4 (activating transcription factor 4) activation was involved in taxol-induced autophagy completion and in the mechanisms leading to cancer cell adaptation and resistance against taxol-induced cell death. Finally, our results demonstrate that the expression of ATF4, in association with hypoxia-induced genes, could be used as a biomarker of a poor prognosis in human breast cancer patients supporting the conclusion that ATF4 might play a role in adaptation and resistance of breast cancer cells to chemotherapy in hypoxic tumors.La résistance des cellules cancéreuses à la chimiothérapie est un problème crucial pour améliorer les traitements anticancéreux. La compréhension des mécanismes responsables de la résistance à la mort cellulaire induite par la chimiothérapie est toujours d’actualité car le nombre de patients atteints d’un cancer ne cesse d’augmenter et des rechutes sont souvent observées. Le développement de régions hypoxiques au sein des tumeurs est connu pour favoriser l’adaptation des cellules cancéreuses à leur environnement stressant et la résistance aux thérapies anticancéreuses. Les voies de signalisation dépendantes de HIF-1 (hypoxiainducible factor-1), qui sont activées en hypoxie, favorisent l’adaptation des cellules cancéreuses et la résistance à la chimiothérapie. D’autres processus biologiques, activés en hypoxie et/ou suite à un traitement chimiothérapeutique, sont également connus pour favoriser la survie des cellules cancéreuses. L’autophagie et l’UPR font partie de ces processus biologiques. Pour cette raison, durant la première partie de ce travail, nous avons étudié le rôle de l’autophagie et de l’hypoxie dans l’apoptose induite par le taxol dans les cellules MDA-MB- 231 issues d’un cancer du sein triple négatif. Les résultats montrent que le taxol induit l’apoptose après 16 heures d’incubation et que l’hypoxie protège les cellules MDA-MB-231 de l’apoptose induite par le taxol. En parallèle, le taxol induit l’activation de l’autophagie après 2 heures d’incubation en normoxie et en hypoxie. L’activation de l’autophagie dans les cellules incubées avec du taxol est un mécanisme protecteur contre l’apoptose induite par le taxol en normoxie et en hypoxie. Cependant, après des temps d’incubation plus longs, le processus autophagique atteint un seuil de saturation en normoxie, conduisant à la mort cellulaire. En hypoxie, le flux autophagique se déroule correctement même après des temps d’incubation plus longs, ce qui permet aux cellules de survivre. L’autophagie est activée via l’inhibition de mTOR (mechanistic target of rapamycin), qui est plus importante dans les cellules incubées en hypoxie. Le taxol induit également l’activation de la JNK (c-Jun Nterminal kinase) et la phosphorylation de ses substrats Bcl2 (B-cell CLL/lymphoma 2) et BclXL (Bcl2-like 1) en normoxie et en hypoxie, très tôt au cours de l’exposition au taxol. Après des temps d’incubation plus longs, la phosphorylation de Bcl2 et BclXL diminue de manière plus importante dans les cellules incubées en hypoxie. Le rôle de la JNK dans l’activation de l’autophagie et de l’apoptose a été étudié à l’aide de siRNAs. Les résultats montrent que l’activation de la JNK favorise la résistance à l’apoptose induite par le taxol en normoxie et en hypoxie sans être impliquée dans l’activation de l’autophagie. En conclusion, la résistance à la mort cellulaire induite par le taxol observée en hypoxie peut être expliquée par un flux autophagique plus efficace activé par la voie classique mTOR et également pas un mécanisme impliquant la JNK, qui pourrait dépendre de la phosphorylation de Bcl2 et BclXL mais qui ne dépend pas de l’activation de l’autophagie par la JNK. Durant la seconde partie de ce travail, l’impact de l’UPR, combinée à l’hypoxie, sur l’activation de l’autophagie et de l’apoptose, durant une exposition au taxol, fut étudié dans les cellules MDA-MB-231. Les résultats montrent que le taxol induit rapidement un stress au réticulum endoplasmique et l’activation de l’UPR et que l’hypoxie module l’activation de l’UPR induite par le taxol. L’implication des voies de signalisation en aval de PERK (protein kinase double-stranded RNA-dependent (PRK)-like ER Kinase), d’ATF6 (activating transcription factor 6) et d’IRE1 (inositol-requiring enzyme-1) dans la régulation de l’autophagie ou de l’apoptose lors d’une incubation en présence de taxol fut investiguée. Aucun lien entre l’activation de ces trois senseurs du stress au RE et la régulation de l’autophagie ou de l’apoptose ne fut mis en évidence. Cependant, l’UPR régule la sécrétion du VEGF (vascular Endothelial Growth Factor) induite par le taxol uniquement dans les cellules incubées en hypoxie. Les résultats montrent aussi qu’ATF4 (activating transcription factor 4) favorise l’accomplissement de l’autophagie et est impliqué dans les mécanismes qui permettent l’adaptation des cellules cancéreuses et la résistance à l’apoptose induite par le taxol. Enfin, les résultats montrent que l’expression d’ATF4, en association avec l’expression de gènes induits en hypoxie, peut être utilisée comme biomarqueur reflétant un mauvais pronostic pour les patients atteints d’un cancer du sein. Ces résultats renforcent la conclusion qu’ATF4 peut jouer un rôle dans l’adaptation et la résistance des cellules cancéreuses du sein contre la chimiothérapie, en hypoxie.(DOCSC03) -- FUNDP, 201
Paramètres collisionnels de raies d'absorption infrarouge d'hydrocarbures : des basses jusqu'aux hautes températures.
No full textThe aim of this work was the study of collisional parameters of hydrocarbon lines such as ethane, allene and methane, from low to high temperatures. The determination and the study require the precise knowledge of the spectral parameters of absorption lines, in particular the collisional broadening coefficients, on a wide range of temperature. In this context, we studied different gas mixture presenting an interest for the study of our atmosphere as well as that of Titan.
First, to measure these parameters for temperature up to room temperature, we have conceived, developed and realized the set up of an "high temperature" absorption cell allowing spectroscopic studies of line profiles and collisional parameters of gaseous molecules between 300 and 750 K.
With the help of this device and of low-temperature absorption cells developed previously in the Laboratory Lasers and Spectroscopies of the University of Namur, we measured the collisional broadening coefficients of infrared absorption lines of hydrocarbons as well as their temperature dependences. Nine gas mixtures have been studied : ethane (C2H6−O2, C2H6−air), allene (C3H4−C3H4, C3H4−N2, C3H4−O2, C3H4−air) and methane (CH4−N2, CH4−O2 et CH4−air).
The spectra have been recorded in the Laboratory Lasers and Spectroscopies of the University of Namur, with the help of a diode-laser spectrometer and, in the Center of Microsystems and Photonics of the University of Strathclyde of Glasgow, with the help of a difference frequency generation (DFG) spectrometer. The spectral parameters have been deduced from individual fits of theoretical lineshape models on the experimental profiles of each line at each pressure and at each temperatures. Various theoretical models were used taking into account Doppler and collisional broadenings, but also fine effects as the Dicke narrowing and the speed dependence effect.
A lot of these results are totally originals. However, as soon as it was possible we compared our results with the previous works.L’objectif de cette thèse était d'étudier les paramètres collisionnels de raies d’absorption infrarouge de différents hydrocarbures, tels que l'éthane, l'allène et le méthane, depuis les basses jusqu'aux hautes températures. La détermination des profils verticaux de concentrations d’espèces en trace dans l'atmosphère et l'étude des gaz résiduels de combustion nécessitent la connaissance précise des paramètres spectraux de raies d'absorption, en particulier les coefficients d'élargissement collisionnel, sur une large gamme de température. Dans ce contexte, nous avons étudié différents mélanges gazeux présentant un grand intérêt pour l'étude de notre atmosphère ainsi que celle de Titan.
Afin de mesurer ces paramètres à des températures supérieures à la température ambiante, nous avons, dans un premier temps, conçu, développé et mis au point une cellule d'absorption "haute température" permettant l'étude spectroscopique de profils de raies et de paramètres collisionnels de molécules en phase gazeuse entre 300 et 750 K.
A l'aide de ce nouveau dispositif et de cellules d'absorption basse température développées précédemment au Laboratoire Lasers et Spectroscopies de l'Université de Namur, nous avons mesuré les coefficients d'élargissement collisionnel de raies d'absorption infrarouge d'hydrocarbures ainsi que leurs dépendances vis-à-vis de la température. Neuf mélanges gazeux ont été étudiés : éthane (C2H6−O2, C2H6−air), allène (C3H4−C3H4, C3H4−N2, C3H4−O2, C3H4−air) et méthane (CH4−N2, CH4−O2 et CH4−air).
Les spectres ont été enregistrés au Laboratoire Lasers et Spectroscopies, à l'aide d'un spectromètre diode-laser accordable en fréquence et, au Centre of Microsystems and Photonics de l’Université de Strathclyde de Glasgow, à l'aide d'un spectromètre à génération par différence de fréquence. Les paramètres spectraux ont été déterminés en ajustant de manière individuelle un profil théorique sur le profil expérimental et ce, pour chaque raie à chaque pression et à chaque température. Différents modèles théoriques ont été utilisés prenant en compte les élargissements Doppler et collisionnel, mais aussi des effets fins comme
le rétrécissement Dicke et la dépendance en vitesse des molécules en interaction.
La plupart de ces résultats sont totalement originaux. Cependant, dès que cela a été possible nous avons comparé nos travaux avec ceux de la littérature.(DOCSC01) -- FUNDP, 201
Im interkulturellen Spannungsfeld: das französische Vaudeville und Elfriede Jelineks Theatertexte
No full textBy means of the notion of rhythm developed by Henri Meschonnic, this study attempts to analyse Elfriede Jelinek's translations of the farces of Feydeau (as in "La Dame de chez Maxim") and Labiche (as in "L'affaire de la rue de Lourcine"). It then aims to understand the mechanisms which underpin the staging of a type of theatre, long considered to be an inferior style of comedy. Finally, it presents answers to the question of knowing to what extent Jelinek's work as translator has shaped her literary production as a whole.A travers la notion de rythme développée par Henri Meschonnic, la présente étude tente d'analyser les traductions réalisées par Elfriede Jelinek des vaudevilles de Feydeau (en l'occurrence "La Dame de chez Maxim") et de Labiche (en l'occurrence "L'affaire rue de Lourcine"). Elle vise, dans un second temps, à comprendre les mécanismes qui sous-tendent les mises en scène d'un genre longtemps considéré comme une forme inférieure de la comédie. Enfin, elle apporte des réponses à la question de savoir dans quelle mesure l'activité traductrice de Jelinek a façonné son oeuvre littéraire.(DOCFILO01) -- FUNDP, 201
Étude des effets de radiations par rayons X ou par particules alpha sur les interactions entre cellules tumorales et cellules endothéliales
No full textCancer is a leading cause of death worldwide and the number of deaths due to this disease is increasing from year to year. Unfortunately, lung cancer has the highest mortality rate among all types of cancers, in Belgium or worldwide. Thus, it is essential to improve treatments already in use and to develop new modalities to fight cancer. Radiotherapy plays an important role in cancer treatment since about 50% of all cancer patients will undergo at least one radiotherapeutic session during their illness. Any improvement in radiotherapy may therefore be of benefit for a large number of patients.
One way to improve radiotherapy is to maximize the dose delivered to the tumour while minimizing damages to healthy tissues. Hadrontherapy has the advantage to spare normal tissues surrounding the tumour because of the particular ballistic of charged particles, which is characterized by the Bragg peak. Indeed, charged particles release most of their energy at the end of their track in the matter whereas the energy deposition of photons (X-rays) is intense at the entrance in the tissues and decreases exponentially with depth. Another way to improve radiotherapy is to limit tumour radioresistance by increasing our knowledge of the radioresistance mechanisms in order to disrupt them. It has been demonstrated that tumour cells are able to protect tumour associated endothelial cells by secreting growth factors which inhibit endothelial cell apoptosis and promote angiogenesis. A reciprocal dialogue seems also to occur. Consequently, the therapeutic effect of ionizing radiations is limited.
In the first part of this work, we compared the effects of X-ray and alpha particle irradiations on tumour cells, derived from a lung cancer, and endothelial cells. We demonstrated that alpha particles were more effective that X-rays and that mitotic catastrophe was the main type of cell death induced by both types of irradiation. We also demonstrated that X-ray and alpha particle irradiations induced the overexpression of genes implicated in cell death, angiogenesis and inflammation.
In the second part of this work, we set up a co-culture system in order to study the interplay between tumour cells and endothelial cells after alpha particle irradiation. Lastly, we performed a gene expression study of proteins, cytokines and growth factors that could play a role in tumour radioresistance. We also observed gene expression changes for proteins that could be implicated in a crosstalk between the two cell types that could activate radioresistant or radiosensitive pathways.
The study of the interplay between tumour cells and endothelial cells suggests the existence of an active communication between both cell types after irradiation that could be implicated in radioresistance mechanisms. The identification of molecules involved in these radioresistance processes could lead, in a near future, to the development of new targeted drugs which will block these radioprotective signals in order to improve radiotherapy effectiveness.La radiothérapie occupe une place importante dans le traitement contre le cancer. Un grand nombre de patients pourrait donc profiter de l’amélioration des traitements radiothérapeutiques. L’hadronthérapie possède l’avantage de mieux épargner les tissus sains environnants par rapport à la radiothérapie conventionnelle qui utilise des rayons X, grâce à la balistique particulière des particules chargées. Ainsi, l’essentiel de l’énergie de la particule est déposé à la fin du parcours de celle-ci contrairement aux photons (rayons X) qui perdent leur énergie tout au long de leur trajet. Une autre piste pour améliorer la radiothérapie serait de limiter la résistance des tumeurs aux radiations ionisantes en étudiant plus avant les mécanismes responsables de cette radiorésistance. En effet, un dialogue réciproque entre cellules tumorales et cellules endothéliales, via la sécrétion de facteurs de croissance et de cytokines, peut limiter les effets thérapeutiques des radiations ionisantes.
Le premier objectif de cette thèse était donc de comparer les effets des rayons X et des particules alpha sur des cellules tumorales et des cellules endothéliales. Nous avons montré que les particules alpha sont plus efficaces que les rayons X et que la mitose catastrophique est le principal type de mort induit par ces deux types de radiation. Nous avons également montré que les irradiations par particules alpha et par rayons X induisent la surexpression de gènes impliqués dans la mort cellulaire, l’angiogenèse et l’inflammation.
La seconde partie de ce travail consistait à mettre au point un système de co-culture permettant d’étudier le dialogue entre les cellules tumorales et les cellules endothéliales après irradiation au moyen de particules alpha. Nous avons à nouveau mis en évidence des changements d’expression de gènes codant pour des protéines pouvant être impliquées dans un dialogue entre les deux types cellulaires et pouvant conduire à des phénomènes de radiorésistance ou inversement de radio-sensibilisation.(DOCSC03) -- FUNDP, 201
Conception, synthèse et étude d’inhibiteurs de latryptophane 2,3-dioxygénase (TDO), une cibleprometteuse pour le traitement du cancer
No full textAn immune system, enhanced by the immunotherapy, is able to recognize and destroy tumor
cells. In vivo, cancer cells are able to develop mechanisms for tumors to resist and escape the
immune system. Among these, two enzymes are the key players: indoleamine 2,3-
dioxygenase (IDO) and tryptophan 2,3-dioxygenase (TDO). These enzymes catalyze the
breakdown of an essential amino acid, L-tryptophan (L-trp) in kynurenine, to form different
physiologically active molecules. This results in a local decrease in L-trp, which is
significantly affecting the proliferation of T lymphocytes. The activity of IDO and TDO is
particularly immunosuppressive, justifying this choice of therapeutic targets for cancer
therapy. In this work, we will focus on TDO, to date, the unique reference inhibitor, the
fluoroindole 680C91. Nevertheless, in vivo, it has a poor oral bioavailability. Therefore, the
aim of this thesis is to design new specific inhibitors of TDO and characterize their
interactions with the enzyme using theoretical and experimental approaches.
Once the compounds synthesized, a global cellular assay has identified promising inhibitors.
The first series has, throughout a fundamental study, led to the characterization of three
chloride isomers namely: 5, 6, 7-chloro-3-(2-pyridin-3-ylvinyle)-1H-indole, resulting into a
better understanding of the influence of the position of a halogen on the structural and
physico-chemical properties. This study highlights the crystalline packing and intermolecular
interactions between different molecules of the lattice. Moreover, a study of electronic
properties exhibited the dipole moment and the electrostatic potential. Finally, the model
study of inhibition was correlated with the biological results, the IC50 on hTDO. The second
set of molecules has two acid derivatives of the vinyl-1H-indoles series. The characterization,
in vitro, of these molecules has shown that they are not substrates of hTDO. It also permits to
determine their Ki. Additionally, the IC50 of these molecules on cells was evaluated. Then,
structural and physico-chemical characterization provided different properties, ie, pKa,
solubility, selectivity and stability. Finally, crystallographic assays were conducted in the
presence of active and purified enzyme (rmTDO), alone or in complex with the inhibitor, in
order to better understand the interactions within the active site. All these studies have
highlighted the most promising molecules in terms of inhibition but also pharmaceutically.
The latter has been studied in vivo with mices and shows promise.L’immunothérapie est une stratégie qui vise à stimuler le système immunitaire afin qu’il
reconnaisse et détruise les cellules tumorales. Pourtant, in vivo, les cellules cancéreuses sont capables de
développer des mécanismes permettant aux tumeurs de résister et d’échapper au système immunitaire.
Parmi ceux-ci, deux enzymes représentent les acteurs essentiels : l’indoleamine 2,3-dioxygénase (IDO) et
la tryptophane 2,3-dioxygenase (TDO). Ces enzymes catalysent la dégradation d’un acide aminé essentiel,
le L-tryptophane (L-trp) en N-formyl-L-kynurénine pour former ensuite différentes molécules
physiologiquement actives. Ceci résulte en une diminution locale en L-trp qui affecte de manière
importante la prolifération des lymphocytes T. L’activité d’IDO et de TDO est donc particulièrement
immunosuppressive ce qui en fait des cibles thérapeutiques de choix pour le traitement du cancer. Dans ce
travail, nous nous intéresserons à TDO dont il existe, à ce jour, un seul inhibiteur de référence, le
fluoroindole 680C91. Néanmoins, in vivo, celui-ci présente une faible biodisponibilité orale. Dès lors le
but de cette thèse est de concevoir de nouveaux inhibiteurs spécifiques de TDO et de caractériser leur
mode d’interaction avec l’enzyme en utilisant une approche théorique et expérimentale.
Une fois les composés synthétisés, un test cellulaire global a permis d’identifier les inhibiteurs
prometteurs. La première série d’inhibiteurs a permis une étude plus fondamentale avec la
caractérisation de trois isomères chlorés à savoir: 5 ; 6 ; 7-chloro-3-(2-pyridin-3-ylvinyle)-1H-indole
afin de mieux comprendre l'influence de la position d’un halogène sur les propriétés structurales et
physico-chimiques. Cette dernière a mis en évidence le packing cristallin et les interactions
intermoléculaires entre les différentes molécules de la maille. D’autre part, une étude des propriétés
électroniques a mis en évidence le moment dipolaire ainsi que le potentiel électrostatique. Enfin,
l’étude du modèle d’inhibition a été corrélée avec les résultats biologiques, l’IC50 sur hTDO. La
seconde série d’inhibiteurs comporte deux dérivés acides en série vinyl-1H-indoles. La caractérisation
in vitro de ces molécules a montré qu’ils ne sont pas substrats et de déterminer leur Ki sur l’enzyme
hTDO et l’IC50 de ces molécules sur cellules. Deuxièmement, la caractérisation structurale et physicochimique
a fourni différentes propriétés, à savoir, le pKa, la solubilité, la sélectivité et la stabilité.
Enfin, les essais de cristallogenèses ont été réalisés en présence d’enzyme (rmTDO) purifiée et active
seule ou en complexe avec l’inhibiteur de manière a mieux comprendre les interactions au sein du site
actif. L’ensemble de ces études ont permis de mettre en évidence la molécule la plus prometteuse du
point de vue inhibition mais également du point de vue pharmaceutique. Cette dernière a pu être
étudiée in vivo chez la souris et s'avère prometteuse.(DOCSC02) -- FUNDP, 201
Synthesis, Physical Properties and Supramolecular Organization of B-doped Molecular Material
No full textπ-conjugated structures have been at the center of a growing interest regarding their applications in material science, for OLED, for solar cells and for information storage. In order to extend their applications field, the electronic properties of these molecules can be tuned by substituting the π-conjugated backbone with electron donating or withdrawing groups. An alternative strategy is to tune these properties by replacing the carbon atoms of a compound by heteroatoms. This leads to compounds presenting large arrays of tuned properties. For example, replacing a carbon-carbon pair, in a π-conjugated compound, by a boron-nitrogen pair can lead to bathochromically or hypsochromically shifted fluorescence, which can be exploited for emitting materials in OLED. The objective of the present thesis is to gain a detailed understanding of both the properties and the molecular and supramolecular structures of such compounds.
The present thesis describes the synthetic strategies for the obtainment of π-conjugated structure where carbon-carbon pairs have been replaced by boron-nitrogen pairs. Upon substitution of the central phenyl ring, of hexasubstituted derivative, by a borazine ring, as a slight hypsochromic shift of the fluorescence in the UV region has well as an increase of quantum yield was noticed. The adsorption behavior on metallic surface was later probed, followed by the incorporation of the compound inside the emissive layer of OLED devices.
In a second part, the self-assembly of phenylboronic acid with hydrogen bond acceptors was probed in the solid state by X-ray crystallography and in solution by ITC analysis. The equilibrium between these derivatives and their anhydride form was studied, with parameters such as the temperature and the position of the substitution by electron withdrawing/donating groups.(DOCSC02) -- FUNDP, 201
Development of service innovation capabilities in knowledge-intensive organisations: evidence from business consultancies and Research & Technology Organizations
No full textThe aim of this manuscript is to present the results of the doctoral research project titled “Development of service innovation capabilities in knowledge-intensive organizations”. The rationale for carrying out the project was the disproportionately limited insight academics currently have into how knowledge intensive organisations develop and dynamise their service innovation capabilities, compared to the already very high and constantly growing importance of knowledge-intensive services in the developed economies. In order to explore this relatively under-investigated field, we have carried out six case studies in two groups of knowledge-intensive organisations – business consultancies and Research and Technology Organisations. Our work lays foundations for better understanding of the key service innovation capabilities building blocks, as well as related practices used by successful organisations. We also propose a set of concrete organisational capabilities identified as important for service innovation, namely (1) committing to service innovation, (2) spotting trends in the market, (3) partnering for service innovation, (4) dialoguing with (potential) clients, (5) inventing new service solutions (6) focusing organisational service innovation efforts, (7) locating required expertise, (8) integrating different skills and perspectives, (9) cultivating new service growth, (10) demonstrating new service value (11) leveraging organisational service experience and (12) de-contextualising developed services for future re-use. Finally, in an attempt to illustrate how organisations ensure the dynamisation of these capabilities in a continuous fashion in practice, we propose the following as drivers: (a) constant ‘flow’ or movement in the organisation, (b) continuous improvement philosophy, (c) regular ‘change of scenery’, (d) ‘pause and reflect’ time, (e) no-blame culture, (f) trust and openness, (g) open invitation of criticism and ideas, (h) outside-in perspective, (I) diversity, (j) empowerment, (k) simplification and (l) feedback follow up management. Based on our findings, we propose several discussion points relating to both service innovation and to the more general topic of capabilities dynamisation, raising some important questions about the currently dominant models of these aspects in management literature. Taking into account both the novel contributions of our work and its inherent limitations, we have sketched a roadmap for future research on service innovation capabilities development and dynamisation.(DOCSESG00) -- FUNDP, 201