Hochschulschriftenserver der TH Wildau
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Novel long non-coding RNAs are specific diagnostic and prognostic markers for prostate cancer
Current prostate cancer (PCa) biomarkers such as PSA are not optimal in distinguishing cancer from benign prostate diseases and predicting disease outcome. To discover additional biomarkers, we investigated PCa-specific expression of novel unannotated transcripts. Using the unique probe design of Affymetrix Human Exon Arrays, we identified 334 candidates (EPCATs), of which 15 were validated by RT-PCR. Combined into a diagnostic panel, 11 EPCATs classified 80% of PCa samples correctly, while maintaining 100% specificity. High specificity was confirmed by in situ hybridization for EPCAT4R966 and EPCAT2F176 (SChLAP1) on extensive tissue microarrays. Besides being diagnostic, EPCAT2F176 and EPCAT4R966 showed significant association with pT-stage and were present in PIN lesions. We also found EPCAT2F176 and EPCAT2R709 to be associated with development of metastases and PCa-related death, and EPCAT2F176 to be enriched in lymph node metastases. Functional significance of expression of 9 EPCATs was investigated by siRNA transfection, revealing that knockdown of 5 different EPCATs impaired growth of LNCaP and 22RV1 PCa cells. Only the minority of EPCATs appear to be controlled by androgen receptor or ERG. Although the underlying transcriptional regulation is not fully understood, the novel PCa-associated transcripts are new diagnostic and prognostic markers with functional relevance to prostate cancer growth
Ermittlung des Energiebedarfs zur Bewegung von Fahrzeugen in mikroskopischen Verkehrssimulationen
Die Integration von Modellen für Fahrzeuge mit alternativen Antrieben in Verkehrssimulationen erfordert eine genauere Betrachtung der Energieflüsse in den einzelnen Fahrzeugen. Diese Arbeit betrachtet den Energiebedarf für die Bewegung von Fahrzeugen und evaluiert vorhandene klassische Modelle zur Abstraktion der physikalischen Einflüsse. Aufgrund der fehlenden Einstimmigkeit der Autoren bei der Beschreibung solcher Modelle in der Literatur wird letztlich der Ansatz verfolgt, ein entsprechendes Modell von der physikalischen Basis ausgehend neu zu entwickeln. Zusätzlich dazu wird festgestellt, dass die Beschränkungen der geläufigen Verkehrssimulationsumgebungen einen signifikanten Einfluss auf die Berechenbarkeit einzelner Komponenten derartiger Modelle haben. Das geschaffene Modell wird anschließend in verschiedenen Varianten in einem Vergleich mit einem weit verbreiteten Modell evaluiert. Zu guter Letzt muss konstatiert werden, dass eine Erhöhung der Realitätsnähe der Simulation – insbesondere im situativen Bereich – erreicht werden konnte, für wesentliche Verbesserungen jedoch eine Beseitigung bestehender Restriktionen der Simulationsumgebungen erforderlich wäre.The integration of models for alternative fuel vehicles in traffic simulation requires a closer examination of the energy flows in the individual vehicles. This work considers the energy required for the movement of vehicles and evaluates existing classical models for the abstraction of the physical influences. Due to the lack of unanimity of the authors in the discribing of such models in the literature, the approach ultimately pursued requires redeveloping an appropriate model of the physical basis as a starting point. Additionally, it has been established that the restrictions of the common traffic simulation environments have a significant impact on the computability of individual components of such models. The created model is then evaluated in different variants in comparison with a widely used model. Finally, it is notable that increasing simulation realism could be achieved, however, for in order to see substantial improvements, the elimination of certain restrictions of current simulation environments would be required
Automated recognition of sleep stages by electroencephalograms
The assessment of different sleep stages and their disorders in diseases is an important part of telematic medicine. With an electroencephalogram, the different stages of sleep can be monitored and classified with respect to brain activity. By means of modern data management such as the patient monitor ixTrend, for example, the data can be recorded for long sleep phases and evaluated by a computer using appropriate software, such as Dataplore. Here, a new mathematical model for the automated classification of sleep stages is introduced. The statistical method of autocorrelation, applied to six known sleep stages, was extended by one new class for unknown signals. Due to this new class, it is not necessary to sort all recorded EEG signals into one of the known classes, thereby, minimising the probability of errors. Further, the dependence of the error probability on the duration of the analysed EEG signal was assessed. A minimal error probability of pmin = 0.15 was detected. Exemplary data for one patient are reported.Die Beurteilung der verschiedenen Schlafphasen und deren Störungen bei Erkrankungen spielt eine wichtige Rolle in der telematischen Medizin. Mit einem Elektroenzephalogramm können die Schlafphasen überwacht und in verschiedene Klassen der Hirnaktivität eingeteilt werden. Durch moderne Methoden des Datenmanagements, wie etwa den Patientenmonitor ixTrend, können die Daten über längere Schlafphasen aufgezeichnet und am Computer mit geeigneter Software, etwa Dataplore, analysiert werden. Hier wird ein neues mathematisches Modell zur automatischen Klassifizierung der Schlafphasen vorgestellt. Die statistische Methode der Autokorrelation, angewendet auf sechs bekannte Schlafphasen, wurde erweitert um eine neue Klasse nicht zuordenbarer Muster. Durch diese neue Klasse wird es vermieden, jedes aufgezeichnete EEG-Muster in eine der bekannten Klassen hineinzuzwingen. Dadurch wird der Fehler bei der Zuordnung verringert. Weiter wird der Einfluss der Länge des analysierten EEG auf die Fehlerquote der Zuordnung untersucht. Es zeigte sich eine minimale Fehlerquote von pmin = 0,15. Es werden beispielhafte Daten eines Patienten gezeigt
E-Assessments in der Hochschullehre: Chancen und Herausforderungen
Dieser Beitrag stellt die im Rahmen des Forschungsprojekts „SOS – Strukturierung und Optimierung des Selbststudiums“ entwickelten Ansätze zur qualitätsgesicherten Erstellung von E-Assessments vor. Er beleuchtet die Anforderungen an E-Assessments unter verschiedenen Aspekten, wobei der Schwerpunkt auf den Möglichkeiten der inhaltlichen Umsetzung von Fragen liegt. Der erste Teil behandelt die Erstellung von qualitätsgesicherten elektronischen Fragen, indem fünf verbreitete Vorurteile zu E-Assessments beschrieben und widerlegt werden. Beispiele aus dem im Rahmen des oben genannten Projektes erstellten „Leitfaden zur Erstellung von elektronischen Fragen und Tests der TH Wildau [FH]“ illustrieren dies. Im zweiten Teil werden praktische Erfahrungen mit dem Einsatz von E-Assessments in der Lehre vorgestellt. Dies erfolgt insbesondere unter den Aspekten Einarbeitungsaufwand seitens der Lehrenden, der benötigten personellen Ressourcen sowie der technischen und organisatorischen Rahmenbedingungen.This article presents an approach for quality assurance of e-assessments that was developed by the research project „SOS – Strukturierung und Optimierung des Selbststudiums“ („Structuring and Improving Self-Studies“). Different requirements for e-assessments are highlighted, emphasising possible implementations in both form and content. The first part deals with the development of electronic questions and focuses on quality demands. Five prevalent misconceptions relating to e-assessments are discussed and refuted. Examples gathered from the „TH Wildau Guidelines for Development of Electronic Questions and Tests“, which were addressed by the above mentioned research project, illustrate the line of reasoning. The second part covers practical experience using e-assessments in teaching at a tertiary institution. In so doing, the focal points address the efforts required by academics to familiarise themselves with the software, the necessary human resources as well as the general technical and organisational conditions to facilitate this
Die gelöschte Limited mit Restvermögen in Deutschland
In der Arbeit wird untersucht, wie mit dem in Deutschland belegenen Vermögen einer gelöschten private company limited by shares (kurz: Limited, Ltd.) sachgerecht zu verfahren und welchem Recht dieses unterliegt
Konzeption und Entwicklung einer universellen, kosteneffizienten und unbemannten Flugrettungsplattform
To this day, charities have not been able to provide individual help for people in need. The aim of the thesis was to develop and construct a universal aerial transporter which could be used to support charities in disaster scenarios. The focus was on the technical development based on the results of a feasibility study. The main requirements for the development were in particular: the lowest possible cost for acquisition and maintenance, providing an easy way of reproduction and the ability to control the system using mobile devices. The legal aspects and the collision avoidance were given less priority or were not considered.
In order to identify the current capabilities of charities and their actual problems, a survey among different organisations was done. The results suggested the need for a transport solution. As suitable transport solutions already exist for goods of a mass of at least 50 kg and a transport distance of not less than 100 km, this thesis focuses on the development of a solution below that range and mass.
Various other research works were considered, and it became obvious that most of the research was not concerned with the individual support in rescue operations. These findings were used to gather the requirements for the solution.
Subsequently, a market research was carried out and possible solutions were compared. As it became apparent that there was no suitable solution available, it was decided to develop a new aerial vehicle. To this end every part that was needed and suitable was individually compared and selected. After the transport vehicle had been developed, the system was built. Parts which were not available, especially for the frame and the universal mounting system, were also developed and produced. In order to increase the flight time of the vehicle, materials of a very low mass were used.
During the project a prototype of a universal and unmanned aerial vehicle was successfully developed and constructed. For the transport of different types of goods two different types of universal payload mounting systems were designed. The latter was capable of holding goods with a mass of up to 5 kg. The system allows control of the vehicle in a very convenient way using a mobile device like a smartphone or a tablet. No regular remote control was needed, though still being supported by the system. By means of an android application missions could be created and transmitted wirelessly to the vehicle. After the transmission the system performed the mission autonomously.
Due to an insufficient stiffness of the frame, a longer flight test is still outstanding. The automatic release of the payload at the destination required an adjustment of the used application or at least a regular radio control in range. The servo motors used for the mounting system tended to yaw their arms and also required a permanent power supply. Further developments should review the use of alternative motors for the mounting system.Hilfsorganisationen waren bisher nicht in der Lage, Menschen in Notsituationen individuell zu helfen. Das Ziel der Arbeit war daher, die Entwicklung und den Bau eines universellen Flugsystems zum Transport von Lasten, welches in der Lage ist, Hilfsorganisationen in Katastrophenszenarien zu unterstützen. Der Fokus lag dabei auf der Entwicklung einer technischen Lösung in Anlehnung an eine Machbarkeitsstudie. Bei der Entwicklung wurde vor allen Dingen auf möglichst niedrige Anschaffungs- und Wartungskosten, eine leichte Reproduzierbarkeit und die Möglichkeit einer sehr einfachen Steuerung geachtet. Rechtliche und Zulassungsaspekte wurden nur am Rande berücksichtigt. Ein System zur Kollisionsverhütung war nicht Bestandteil der Arbeit.
Um herauszufinden, was die aktuellen Möglichkeiten und Probleme von Hilfsorganisationen sind, wurde eine Umfrage unter vielen großen Hilfsorganisationen durchgeführt. Diese sorgte dafür, dass sich die Notwendigkeit einer Transportlösung herauskristallisierte. Da die aktuelle Versorgung mit Gütern ab 50 kg und über eine Distanz von 100 km bereits sehr gut funktioniert, wurde der Fokus auf die Entwicklung einer Transportlösung unterhalb dieses Bereichs konzentriert.
Viele sehr interessante Forschungsarbeiten wurden im Rahmen der Arbeit studiert, führten jedoch zu der Erkenntnis, dass sich die meisten Forschungsarbeiten nicht mit der individuellen Versorgung von Personen in Not beschäftigen. Anschließend wurden aus den gewonnenen Erkenntnissen die Anforderungen für die zu entwickelnde Lösung zusammengetragen.
Um die Möglichkeit zur Nutzung einer bestehenden Lösung zu überprüfen, wurde eine Marktrecherche durchgeführt und mögliche Systeme miteinander verglichen. Dies führte zu der Erkenntnis, dass aktuell keine fertige und geeignete Lösung existiert und eine neue entwickelt und gebaut werden musste. Dafür wurden alle benötigten Teile mit aktuell verfügbaren und geeignet scheinenden Teilen verglichen und daraus ein System entwickelt. Teile, welche nicht beschaffbar waren, wurden ebenfalls neu entwickelt und selbst hergestellt. Um eine möglichst lange Flugzeit des Fluggeräts zu erreichen, wurde bei der Entwicklung ein Fokus auf die Verwendung von Leichtbaumaterialien gelegt
Umweltbericht 2015
Inhalte: Umwelt und Nachhaltigkeit, Stadt der Wissenschaft und Innovation, Umweltmanagement an der TH Wildau, Kernthemen 2013/2014, Forschungsberichte, Interview „Fracking vs. Erneuerbare Energien – wie kann man den Bürger stärker beteiligen?", sO2lutions, Autorinnen und Autore
Automatisierung des Bio-Plex Pro Analyseverfahrens
Für den simultanen Nachweis mehrerer Analyten innerhalb einer Probe ist die Bead-basierte Multiplexanalytik ein häufig verwendetes Verfahren und wird beispielsweise zur Quantifizierung von Proteinen genutzt. Die aufwendige Durchführung der Assays soll durch Automatisierung einerseits dem Anwender abgenommen werden, während andererseits die Genauigkeit und Reproduzierbarkeit der Analyse gesteigert wird. Die Automatisierung des Bio-Plex Pro™ Assays ist mit dem Pipettierroboter Tecan Freedom EVO 200 umgesetzt worden. Es ist ein Skript mit der Software Freedom EVOware® entwickelt worden, welches die Probenvorbereitung des Assays vollständig übernimmt. Für einen Vergleich der manuellen und automatisierten Methode sind die humanen Zytokine IL-2, IL-4, IL-10, GM-CSF, IFN-γ und TNF-α in einer achtstufigen Standardverdünnungsreihe und in unterschiedlich konzentrierten Proben gemessen worden. Die Berechnung der Streuungen (Standardabweichung und Variationskoeffizient) der einzelnen Standardverdünnungsreihen sowie der Vergleich von gemessenen und erwarteten Konzentrationen der automatisierten und manuellen Methode zeigen, dass die Automatisierung neben der zeitlichen Optimierung auch die Genauigkeit und Reproduzierbarkeit der Analyse verbessert.Bead-based multpiplex analysis is frequently used for the simultaneous detection of multiple analytes within a sample. Such assays are commonly used to quantify proteins. The automation of the process relieves the user from the complex assay conductance and on the other hand increases the accuracy and reproducibility of the analysis. The automation of the Bio-Plex Pro™ assay has been successfully implemented with the pipetting-robot Tecan Freedom EVO 200. A script has been developed, using the Freedom EVOware® which has the ability to perform the complete assay procedure. For a comparison between manual and automated methods, the human cytokines IL-2, IL-4, IL-10, GM-CSF, IFN-γ and TNF-α were analysed by an eight-point standard dilution series and with samples of different concentrations. The calculation of the variances (standard deviation and coefficient of variation) of the single standard dilution series as well as the comparison of the observed and expected concentrations of the manual or automated method show the higher precision and reproducibility of the automated process in addition to its time-saving nature
Publish or Perish? Neue Ansätze in der Evaluation von Wissenschaftlerleistungen
Wenn es um die Bewertung von wissenschaftlichen Leistungen geht, berücksichtigt die aktuelle Evaluationspraxis nur eine begrenzte Anzahl an Dimensionen von Qualität und Relevanz von Forschung und Lehre und entspricht damit nicht mehr den Anforderungen, die aus der Komplexität des Wissenschaftssystems resultieren. Mit dem im Rahmen dieses Beitrages skizzierten ACUMEN-Portfolio wird ein ganzheitlicher Bewertungsansatz prototypisch vorgestellt, der Differenzierungen im Hinblick auf unterschiedliche Wissenschaftsdisziplinen ermöglicht und die Perspektive des einzelnen Wissenschaftlers in den Mittelpunkt der Evaluation rückt. Das ACUMEN-Portfolio ist ein Ergebnis des im Europäischen 7. Forschungsrahmenprogramm durchgeführten Projektes ACUMEN – Academic Careers Understood trough Measurements and Norms. Das Projekt wurde von März 2011 bis Februar 2014 gemeinsam von neun Partnern aus sieben Ländern unter der Leitung der Universität Leiden (NL), Centre for Science and Technology Studies (CWTS) durchgeführt.When researchers are evaluated, current evaluation practices consider only a limited number of aspects in terms of quality and relevance for research and teaching. However, today, the scientific system is characterised by increasing levels of complexity and dimension that are not fully represented by predominant evaluation practices and their methodological shortcomings. In this article, we present the ACUMEN portfolio prototype as a holistic approach, which considers differences between several scientific disciplines and puts the perspective of the single researcher in the focus of evaluation. The ACUMEN portfolio is one result of the European FP 7 research project ACUMEN – Academic Careers Under-stood trough Measurements and Norms. The project took place from March 2011 until February 2014 in joint collaboration with nine partners from seven countries under the lead of the University of Leiden (NL), Centre for Science and Technology Studies (CWTS)
Lernen von der Natur – Biologie trifft Technik
Durch die Initiative des Studiengangs Biosystemtechnik/Bioinformatik entstand 2008 das Schülerlabor „Biologie trifft Technik“. Zunächst als reine Vortragsreihe konzipiert, erweiterte sich das Angebot auf Nachfrage vieler SchülerInnen und LehrerInnen auch auf experimentelle Labormodule