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Análisis bioinformático del gen de la polimerasa del virus de la hepatitis B en muestras de individuos colombianos no sometidos a tratamiento antiviral
No full textIntroducción: La infección por el virus de la hepatitis B (VHB) representa un factor de riesgo para el desarrollo de carcinoma hepatocelular (HCC). La Organización Mundial de Salud (OMS) estima que existen 254 millones de individuos infectados a nivel global. El VHB se clasifica en la familia Hepadnaviridae. Este virus se caracteriza por tener un genoma de ADN de doble cadena parcial (rcDNA) de 3.2kb y por la incorporación de sustituciones nucleotídicas debido a la falta de actividad correctora de la polimerasa viral (HBpol). Esta variabilidad le imprime una gran diversidad genética, representada en la circulación de 9 genotipos caracterizados (designados A-I). Aunque existen nucleós(t)idos análogos aprobados para el uso clínico como terapia antiviral, mutaciones en la secuencia que codifica la polimerasa viral (HBpol) pueden reducir su eficacia. En este contexto es de alta relevancia identificar la circulación de variantes de resistencia antiviral en países y regiones endémicos.
Métodos: Se estudiaron secuencias disponibles de VHB (GenBank; NCBI) a partir de aislados obtenidos en poblaciones colombianas sin evidencia de tratamiento antiviral previo. Se alinearon las secuencias de ADN viral (Clustalw), luego se dedujeron las secuencias de aminoácidos y se limitaron al dominio de la transcriptasa inversa de HBpol (MEGA X, BioEdit v7). Posteriormente, se realizó un análisis comparativo de secuencias para identificar sustituciones y estimar la frecuencia.
Resultados: De las 120 secuencias incluidas en este análisis, el genotipo F fue el más frecuente, seguido por los genotipos E y A. Se detectaron 23 sustituciones, algunas asociadas con resistencia antiviral contra terapias de primera línea disponibles en Colombia. Hubo diferencias en la tasa de mutación por genotipo y grupo de población analizada.
Conclusiones: Se sugiere la realización de estudios in vitro para establecer el significado biológico de la combinación de mutaciones observadas.
Producción de una proteína recombinante de interés farmacéutico derivada del virus del síndrome reproductivo y respiratorio porcino (PRRSV)
No full textIntroducción: El síndrome respiratorio y reproductivo porcino (PRRSV) es una enfermedad que provoca problemas respiratorios, como neumonía intersticial, en cerdos y mortalidad. Se caracteriza por una viremia prolongada y su replicación en macrófagos alveolares pulmonares. El PRRSV es altamente variable y antigénicamente complejo, lo que dificulta su control y prevención. Está compuesto por proteínas como la nucleocápside y las glicoproteínas GP2, GP3, GP4 y GP5. Esta última es crucial para la interacción del virus con la célula huésped y contiene epítopos inmunodominantes que generan una respuesta inmune contra el PRRSV. En Colombia es una enfermedad endémica que se presenta en más de 11 departamentos, y en alguno se ha logrado identificar 11 cepas.
Métodos: Este estudio se enfoca en la producción de una proteína recombinante basada en la fusión de la GP5 con la proteína de choque térmico Hsp90.3 de Nicotiana benthamiana, utilizada como carrier. Las propiedades chaperonas se han relacionado con un mejor plegamiento en sistemas bacterianos, lo cual incrementa su capacidad antigénica. Para esto, se amplificó el gen GP5 con sitios de restricción PstI y XhoI mediante PCR convencional. El ADN amplificado se purificó y se ligó a los vectores pGEMT (clonación) y pRSET-A (expresión); posteriormente se transformaron células competentes BL21 y Rosseta, y se estandarizaron parámetros de expresión de la proteína recombinante como su reconocimiento por anticuerpos.
Resultados: Se confirmó la amplificación exitosa del gen GP5 (615 pb) y su clonación, confirmado por secuenciación, en la que se obtuvo una identidad del 97.84 %, tanto en su versión sola como fusionada con la Hsp90.3. Se expresó una proteína de 26 y 107 kDa, respectivamente. Estas reaccionaron con Ab anti6XHis y con sueros de cerdas seropositivas contra PRRSV.
Conclusiones: Estos avances representan una alternativa en el diagnostico serológico de PRRSV y en el posible uso de otros sistemas de expresión en eucariotas.
Detección de la infección por DENV y ZIKV en mujeres embarazadas y complicaciones materno-fetales: una revisión sistemática con metaánalisis
No full textIntroducción: La infección ZIKV y DENV durante el embarazo se ha asociado a un incremento de efectos adversos, tanto para la madre como para el feto/neonato. Por ello, se llevó a cabo una revisión sistemática con metaanálisis con el objetivo de evaluar el efecto de la infección por ZIKV y DENV durante la gestación en la ocurrencia de complicaciones materno-fetales.
Métodos: La búsqueda se realizó en las bases de datos Pubmed, Web of Sciencie y Scopus utilizando la estrategia de búsqueda “(Dengue OR Zika) AND (pregnancy) AND (screening OR outcomes)”, siguiendo las recomendaciones de la declaración PRISMA. Se incluyeron estudios observacionales que informaban datos originales sobre infecciones por ZIKV o DENV en mujeres embarazadas, diagnosticadas mediante métodos de laboratorio y evaluaban resultados adversos maternos-fetales durante el embarazo.
Resultados: La búsqueda identificó 3152 estudios publicados, después del tamizaje por título, se evaluó la elegibilidad de 455 estudios. Finalmente, se incluyeron un total de 90 manuscritos para la revisión sistemática y 35 para el metaanálisis. El aborto fue la complicación materna más reportada en mujeres infectadas por ZIKV. Entre los desenlaces fetales asociados al ZIKV, las anomalías cerebrales fueron las más frecuentes, destacando la microcefalia. En el caso del DENV, el desenlace fetal más común fue el parto prematuro. Se identificó que la infección por ZIKV en mujeres embarazadas incrementa el riesgo de aborto (OR=1·68, 95 % IC:1·15 – 2·46, I2:0 %), muerte fetal (OR = 1·68, 95 % IC:1·12 - 2·51, I2:0 %), microcefalia (OR = 3·85, 95 % IC:1·97 - 7·50, I2:27·8 %), nacimiento prematuro (OR = 1·32, 95 % IC:1·04 - 1·67, I2:14·03 %) y en la ocurrencia de cualquier efecto adverso (OR = 2·19, 95 % IC:1·55 - 3·09, I2:39·46 %); para la infección por DENV se identificó que incrementa el riesgo de mortalidad materna (OR = 9·03, 95 % IC:2·09 - 39·02, I2:41·07 %) y muerte fetal (OR = 1·93, 95 % IC:1·06 - 3·50, I2:0 %).
Conclusiones: Este metaanálisis evidencia la relevancia clínica de ZIKV y DENV en el desarrollo de complicaciones materno-fetales.
La (in)completitud de la persona mayor amputada: Una experiencia del cuidado de enfermería
No full textObjectives: To analyze nursing care from the perspective of older adults with diabetes mellitus who have undergone amputation. The theoretical framework is grounded in Watson's theory of transpersonal caring, Le Breton's concept of corporeality in its completeness, and Kübler-Ross theory of grief and loss.
Materials and methods: A qualitative, descriptive-exploratory study was conducted. The sample consisted of 13 older Mexican adults with diabetes mellitus who had undergone lower limb amputation, selected using theoretical saturation criteria. Data were collected through in-depth interviews conducted in the surgical ward of a public hospital. For the analysis of qualitative data, Souza's three-phase approach was followed: pre-analysis, exploration of material, treatment of results, and interpretation, considering the study's theoretical foundations. Data organization involved the identification of recording units, coding, classification, and categorization. Content analysis was used.
Results: The main empirical category that emerged from the analysis of discourses was “Caring for Completeness in the Incompleteness of the Older Adult”. Two subcategories were identified: 1) Helping to make the loss of the phantom limb real; 2) Nursing: Promoting the search for meaning in life during the grieving process.
Conclusions: Individuals with lower limb amputation experience the incompleteness of their corporeality, with profound repercussions on their quality of life. In this context, nurses provide healing care from a perspective of completeness that enables these individuals to transcend pain and suffering and (re)construct the meaning of their existence with their new bodily condition.Objetivos: Analizar el cuidado de enfermería desde la perspectiva del adulto mayor con diabetes mellitus amputado. La base teórica se sustenta en Watson con el cuidado transpersonal, Le Breton: la corporeidad en su completitud y Kübler-Ross: duelo por proceso de pérdida.
Material y métodos: Investigación cualitativa descriptiva-exploratoria. La muestra estuvo conformada por 13 adultos mayores mexicanos con diabetes mellitus, en postoperatorio mediato por amputación de miembros inferiores, seleccionados por criterio de saturación teórica. La recolección de datos fue mediante entrevistas en profundidad, realizadas en el servicio de cirugía de una institución hospitalaria pública. Para el tratamiento y análisis de los datos cualitativos, se siguió los criterios de Souza, en tres fases: preanálisis, exploración del material, tratamiento de resultados e interpretación, considerando las bases teóricas del estudio. La organización de datos: identificación de unidades de registro, codificación, clasificación y categorización. Se usó el análisis de contenido.
Resultados: Del análisis de discursos emergió la categoría empírica principal: “Cuidado de la completitud en la incompletitud del adulto mayor”, con dos subcategorías: 1) Ayudando a hacer real la pérdida por pie fantasma; 2) Enfermería: promoviendo encontrar el sentido de la vida en el duelo ante la pérdida.
Conclusiones: Las personas con amputación de miembro inferior vivencian la incompletitud de su corporeidad con profundas repercusiones en su calidad de vida. En esta realidad, las enfermeras proporcionan cuidados-sanación desde una mirada de completitud que permita a estas personas trascender el dolor y el sufrimiento para (re)construir el sentido a su existencia con su nueva condición corporal
Estudio de la actividad sinérgica antiviral de fármacos inhibitorios de la función de clivaje de la furina y la síntesis de ácidos grasos como potencial tratamiento contra el COVID-19
No full text.Introducción: La pandemia actual de SARS-CoV-2 subraya la urgencia de nuevos antivirales, especialmente ante la constante evolución genética del virus que dificulta el desarrollo de tratamientos duraderos. Una estrategia prometedora se centra en dianas celulares del huésped, como las proteasas (ej., furina) y las lipasas, que son invariables genéticamente y cruciales para la replicación viral. Diversos esfuerzos de reposicionamiento de fármacos han explorado moléculas para su uso en politerapias antivirales. Entre ellas destacan las tiazolidinedionas (TZD), la pirfenidona (PFD) y las tetrahidrolipstatinas. En este estudio se evaluó la actividad sinérgica antiviral de fármacos inhibitorios de la función de clivaje de la furina y la síntesis de ácidos grasos como potencial tratamiento contra el COVID-19.
Métodos: La metodología se desarrolló en etapas secuenciales y complementarias. Inicialmente, ensayos enzimáticos midieron la capacidad directa de las TZD para inhibir la actividad catalítica de la furina. Seguidamente, se determinó su eficacia antiviral in vitro contra SARS-CoV-2 y sus variantes, las cuales serán obtenidas por aislamiento de novo en células Vero-E6 y caracterizadas genéticamente mediante secuenciación de nueva generación.
Resultados: Los resultados mostraron que las TZD y la PFD inhibieron la infección por SARS-CoV-2 en todos los ensayos. Se observó una reducción significativa del ARN viral en los sobrenadantes a las 24, 48, 72 y 96 horas posinfección, con la mayor diferencia en la carga viral después de 96 horas. La PFD inhibió la infección con 50 TCID50/ml, aunque el porcentaje de protección fue menor al aumentar el inóculo viral a 100 TCID50/ml, con una disminución del ARN viral a las 72 horas. Aunque los fármacos inhibieron parcialmente la infección en DMEM, la actividad antiviral aumentó al 100 % de protección con DMSO como disolvente.
Conclusiones: Los resultados sugieren que los tres fármacos son candidatos terapéuticos potenciales para el tratamiento de COVID-19.
Evaluación del potencial inmunomodulador de ?-glucanos de hongos funcionales sobre células humanas primarias expuestas a virus respiratorio sincitial (RSV)
No full textIntroducción: El virus respiratorio sincitial (RSV) es un agente causal de gran importancia en las infecciones respiratorias agudas, especialmente en poblaciones vulnerables. Su control se ve limitado por la falta de tratamientos y vacunas eficaces. Ante esta problemática, los hongos funcionales han ganado interés por sus compuestos bioactivos, en particular los ?-glucanos, reconocidos por su capacidad inmunomoduladora. Gracias a esta propiedad, se consideran una alternativa natural prometedora para modular la respuesta inmune frente a diversas enfermedades, incluyendo infecciones virales como la causada por RSV. El objetivo de este estudio fue evaluar el potencial inmunomodulador de extractos de ?-glucanos de tres hongos funcionales (Trametes versicolor, Inonotus obliquus y Cordyceps militaris) sobre células mononucleares de sangre periférica (CMSP) expuestas al virus.
Métodos: Se desarrolló un estudio experimental in vitro con células mononucleares de sangre periférica (CMSP) obtenidas de al menos tres donantes sanos, las cuales fueron tratadas con extractos comerciales de los hongos y posteriormente expuestas a RSV. Se evaluó la citotoxicidad de cada uno los extractos, la producción de citoquinas proinflamatorias (IL-8, TNF-? e IL-1?) y antiinflamatorias (IL-10 y TGF-?) mediante ELISA, así como la expresión de sus genes mediante qPCR.
Resultados: Los extractos no inducen citotoxicidad en las concentraciones evaluadas. Además, la exposición combinada a los extractos fúngicos y al RSV generó un aumento significativo en la producción de IL-8, IL-1? TNF-? e IL-10 en comparación con las condiciones en las que las células fueron tratadas solo con los hongos o solo con el virus.
Conclusiones: Los extractos de ?-glucanos de T. versicolor, I. obliquus y C. militaris presentan un efecto inmunoestimulante aditivo o sinérgico al combinarse con RSV, lo que sugiere que podrían modular la respuesta inmune frente a infecciones virales para construir una alternativa natural complementaria para su manejo.
Circulación de genogrupos del virus de la Enfermedad de Gumboro en Colombia: implicaciones para el control en granjas avícolas
No full textIntroducción: IBDV (Infectious Bursal Disease Virus) es el agente causal de la Enfermedad de Gumboro, una patología viral que genera inmunosupresión en aves domésticas, particularmente en pollos. Este virus, perteneciente al género Avibirnavirus, posee un genoma de ARN de doble cadena y se distingue por su alta tasa de mutación, reasociación y recombinación genética, lo cual favorece el aumento de su virulencia y la modificación de su antigenicidad. Debido a estos factores, la caracterización molecular del virus resulta esencial para orientar eficazmente las estrategias de prevención y control. En Colombia y en gran parte de Sudamérica, la información sobre la epidemiología molecular del IBDV es limitada. Por ello, el objetivo de este estudio fue determinar la distribución de genogrupos del virus en granjas de pollos de engorde en el país.
Métodos: Se extrajo ARN viral de bursas de Fabricio de aves entre 21 y 48 días de edad, provenientes de dos regiones con alta producción avícola. Se amplificó un fragmento de 260 pb del gen VP2 mediante RT-PCR, y los productos fueron secuenciados para realizar análisis filogenéticos, incluyendo cepas vacunales utilizadas en Colombia. Se identificó la presencia del gen VP2 en las 32 muestras analizadas.
Resultados: Los virus se distribuyeron en tres genogrupos: el genogrupo 1 (clásico) en el 71,9 % de las muestras, el genogrupo 2 (variante antigénica) en el 21,9 %, y el genogrupo 4 (dIBDV, linaje genético emergente) en el 6,2%. Dentro de los genogrupos se detectaron variaciones, especialmente en el genogrupo 2, en el que se identificaron linajes G2b y G2c.
Conclusiones: La presencia de estos tres genogrupos, también prevalentes a nivel global, resalta la necesidad de implementar modelos de clasificación más específicos que permitan asociar mejor la variabilidad genética con los signos clínicos observados en campo y las estrategias de control en el país.
Mechanisms of HIV Drug Resistance: Survival of the Fittest?
No full textIntroduction: Despite the success of antiretroviral therapy (ART) in transforming HIV from a fatal disease into a manageable chronic condition, the emergence of drug resistance remains a major obstacle to sustained virological suppression.
Methods: This presentation explores the complex interplay of molecular mechanisms driving resistance to nucleoside/nucleotide reverse transcriptase inhibitors (NRTIs), with a focus on excision and discrimination pathways mediated by mutations in the HIV-1 reverse transcriptase (RT).
Results: In addition, we also present evidence that RNase H activity and its modulation by the nucleocapsid (NC) protein—particularly the immature forms NCp9 and NCp15—significantly influence drug resistance by destabilizing the primer-template complex and suppressing excision-based rescue of chain-terminated primers. Using biochemical assays, structural modeling, and a large-scale bioinformatics analysis of over 6,000 viral genomes, we identify specific RT and Gag mutations—including insertions—that may act as compensatory mechanisms for maintaining replication fitness in resistant strains.
Conclusions: Our findings support a systems-level view of HIV replication, highlighting the interconnected roles of RT, NC, and Gag in shaping drug resistance phenotypes. These insights may inform future therapeutic strategies aimed at limiting viral escape and improving ART durability.
Efecto de la permeabilidad en el factor de seguridad de presas de tierra bajo precipitaciones
No full textIn this research, permeability and volumetric water content are related to evaluate their influence on the safety factor of 30-meter-high homogeneous earthen dams. For this, five analysis cases are considered, including clayey soils in the embankment, one for each case: a drainage prism and a waterproof base. Establishing three relationships between permeability and volumetric water content, based on the parameters of the soil studies and with the use of the Terzaghi and Schlichter equations, the fundamental conditions of the investigation are established. Five days of continuous rain are considered for three intensities, related to the saturated permeability of each soil. For this, a hybrid model of finite elements and limit equilibrium is used, through the GeoStudio (2018) program. The result allows establishing a relationship between the failure time, the permeability estimation method and the safety factor for the rain intensities, observing that, with the application of the Schlichter method, the safety factor decreases abruptly in the first 48 hours, while for the Terzaghi method the results show a greater similarity with those obtained from the parameters of the soil studies.En esta investigación, se relacionan la permeabilidad y el contenido volumétrico de agua para evaluar su influencia en el factor de seguridad de presas de tierra homogéneas de 30 metros de altura. Para ello, se consideran cinco casos de análisis, incluyendo suelos arcillosos en el terraplén, uno para cada caso; un prisma de drenaje y una base impermeable. Estableciendo tres relaciones entre la permeabilidad y el contenido volumétrico de agua, a partir de los parámetros propios de los estudios de suelos y con el empleo de las ecuaciones de Terzaghi y Schlichter, se constituyen las condiciones fundamentales de la investigación. Se consideran cinco días de lluvia continua para tres intensidades, relacionadas con la permeabilidad saturada de cada suelo. Para ello, se emplea un modelo híbrido de elementos finitos y de equilibrio límite, mediante el programa GeoStudio (2018). El resultado permite establecer una relación entre el tiempo de falla, el método de estimación de la permeabilidad y el factor de seguridad para las intensidades de lluvia, observando que, con la aplicación del método de Schlichter, el factor de seguridad decrece abruptamente en las primeras 48 horas, mientras que para el método de Terzaghi los resultados muestran una mayor similitud con los obtenidos a partir de los parámetros propios de los estudios de suelos
Concepciones de la escritura académica en estudiantes universitarios
No full text: The present study aimed to identify the conceptions of university students about different facets of academic writing (uses and functions of writing, representation of the task, planning and textualization, revision and correction) in its epistemic dimension (associated with the elaboration and situated structuring of ideas and learning from the written production) and reproductive (linked to the repetition of information in writing processes). Likewise, their variation according to gender, semester of studies and academic performance was compared. 359 medical students participated, who responded to the Instrument of Conceptions on Academic Writing. The results in all the comparatives show elevated epistemic conceptions, at the same time indicate reproductive ideas about the representation of the task at an intermediate level or close to it. Given this, students are unable to consolidate their epistemic perspective on writing. In addition, differences are detected in the reproductive conceptions of planning and textualization, depending on academic performance. It is concluded that the coexistence of both epistemic and reproductive conceptions in students has been corroborated, as well as the importance of knowing in depth through research the conceptions of writing of students in order to generate educational strategies. in accordance with their needs, which favor the development of concepts that promote the elaboration of ideas, the construction of learning through written production and the development of academic texts of adequate quality. El presente estudio tuvo como objetivo identificar las concepciones de estudiantes universitarios sobre distintas facetas de la escritura académica (usos y funciones de la escritura, representación de la tarea, planificación y textualización, revisión y corrección) en su dimensión epistémica (asociada a la elaboración y estructuración situada de ideas y al aprendizaje a partir de la producción escrita) y reproductiva (vinculada a la repetición de información en los procesos de escritura). Asimismo, se comparó su variación en función del género, semestre de estudios y rendimiento académico. Participaron 359 estudiantes de medicina de una universidad mexicana, quienes respondieron, de manera voluntaria y anónima, al Instrumento de Concepciones sobre Escritura Académica, el cual es de tipo autoinforme con diseño en escala Likert. Los resultados en todos los comparativos muestran concepciones epistémicas elevadas, a la vez que indican ideas reproductivas sobre la representación de la tarea en un nivel intermedio o cercano a este. Dado ello, los estudiantes no logran consolidar su perspectiva epistémica sobre la escritura. Además, se detectan diferencias en las concepciones reproductivas de la planificación y textualización, en función del rendimiento académico. Se concluye respecto de que se ha corroborado la coexistencia de concepciones tanto epistémicas como reproductivas en los estudiantes. Aunado a ello, se señala la importancia de realizar investigación que profundice en el conocimiento de las concepciones de escritura de los estudiantes y con ello favorezca el diseño e implementación de estrategias educativas para el desarrollo de concepciones que promuevan la elaboración de ideas, la construcción de aprendizajes mediante la producción escrita y el desarrollo de textos académicos de adecuada calidad