1277 research outputs found

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    Attività didattiche e formative del CILEA

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    Corsi per Utenti di SistemiCorsi per Gestori e Amministratori di SistemiCorsi per Utenti di Servizi Reti/Internet

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    LA FACILITY DI CALCOLO TELETHON: VERSO UNA MEDICINA PERSONALIZZATA

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    Negli ultimi 10 anni, da quando è stata pubblicata la sequenza del genoma umano, la velocità con cui si raggiungono gli obiettivi nella ricerca biomedica è cambiata considerevolmente. Le nuove tecnologie di sequenziamento (Next Generation Sequencing – NGS) permettono un’analisi rapida, accurata ed economica dell’informazione contenuta nel genoma e nel trascrittoma di un organismo. Il trattamento dell’enorme produzione di dati di sequenze (Short Reads, SR) associate a ogni esperimento – in termini di data transfer, storage e controllo di qualità, analisi computazionale per assemblare e allineare le SR, sistemi di information management per tracciare i campioni e gestire i processi – costituisce una sfida per la ricerca HPC. La bioinformatica ha ormai assunto un ruolo cruciale nell’ambito della ricerca biomedica e diviene sempre più essenziale per l’analisi e la gestione dei dati prodotti dai nuovi sequenziatori che hanno aperto prospettive di ricerca impensabili fino a pochi anni fa

    LA COMUNITÀ SCIENTIFICA PARLA DI SÉ: DALLA VISIONE COMMERCIALE ALL’OPEN ACCESS

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    Una visione d’insieme dell’evoluzione che l’editoria scientifica in rete ha avuto nelle ultime due decadi non può prescindere da un’analisi prospettica di come l’editoria serve la ricerca mentre quest’ultima evolve nel tempo.Senza ombra di dubbio, le tecnologie dell’informazione hanno avuto un forte impatto non solo sulla gestione dell’informazione, ma anche sul modo stesso di fare ricerca. Alla luce di ciò in questo articolo analizzeremo i cambiamenti tecnologici nell’editoria ma soprattutto lo stretto rapporto tra tecnologia e ricerca, ovvero il significato che le evoluzioni tecnologiche hanno avuto e avranno sul modo di “fare scienza” oggi e domani

    ASSISTENZA SISTEMISTICA A UNIVERSITÀ E ENTI DI RICERCA

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    Dal 1994, anno della sua costituzione, il Gruppo Sistemi del CASPUR è stato attivamente coinvolto nella progettazione, configurazione, messa in produzione e gestione quotidiana di una vasta gamma di sistemi di calcolo, oltreché delle relative infrastrutture e di numerosi servizi ausiliari. Tra le attività svolte è possibile citare anche le indagini mirate all’individuazione di soluzioni innovative, nonché all’ottimizzazione e al tuning delle risorse già in esercizio. Forte delle conoscenze tecnologiche e delle esperienze gestionali acquisite nel corso degli anni, il CASPUR oggi è in grado di offrire servizi di assistenza sistemistica ad alto contenuto tecnologico a Università ed Enti di Ricerca nazionali e internazionali

    RICERCA DI QUALITÀ E TECNOLOGIA D’AVANGUARDIA: UN BINOMIO VINCENTE PER LA CHIMICA COMPUTAZIONALE

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    L’analisi e il controllo dei meccanismi che governano i più interessanti processi biologici, tecnologici e ambientali richiedono una comprensione approfonditadelle caratteristiche strutturali e dinamiche di sistemi molecolari e supra-molecolari operanti in ambienti complessi. Anche se molte informazioni sperimentali indirette sono disponibili grazie a tecniche spettroscopiche sofisticate, l’organizzazione di tali informazioni e la loro interpretazione richiede strumenti computazionali accurati, efficienti e user friendly. Riveste, quindi, un ruolo determinante l’interazione costante tra innovazione scientifica e tecnologica

    I MODELLI DEL CLIMA ALLA FRONTIERA DELLA SCIENZA E DELLA TECNOLOGIA

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    Lo studio del clima si basa su dati e osservazioni, oggi disponibili in quantità e qualità inimmaginabile fino a pochi anni fa. Tuttavia, per ottenere “previsioni climatiche” (o meglio “proiezioni” visto il carattere statistico del problema), è necessario utilizzare modelli matematici che descrivano, al meglio delle nostre conoscenze, il funzionamento del sistema climatico. Questi modelli, per la loro complessità, richiedono enormi risorse di calcolo e continua innovazione scientifica, tecnologica e informatica nella descrizione dei processi e nella loro implementazione numerica

    STRUMENTI COMPUTAZIONALI PER LA MEDICINA E LA BIOLOGIA: DINAMICA MOLECOLARE DI PROTEINE E DNA

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    Le simulazioni di dinamica molecolare consentono di analizzare la struttura e la flessibilità di macromolecole importanti dal punto di vista biomedico, come proteine e DNA. Questo permette di studiare le cause di molte malattie genetiche, spesso provocate da una mutazione di un gene che codifica per una proteina, ma anche di progettare nuovi farmaci più efficaci. In particolare, lo studio delle mutazioni che insorgono su proteine di membrana come i canali ionici voltaggio-dipendenti permettono di delucidare i meccanismi molecolari alla base delle più importanti patologie neurologiche e muscolari. Le moderne risorse di calcolo parallelo, basate sui nuovi processori GPU ad architettura multi-core, consentono di estendere la simulazione di questi sistemi biologici su scale di tempo molto maggiori e quindi di modellare funzioni biologiche più complesse. Ma lo sviluppo non è solo nelle tecnologie. Nuovi algoritmi e campi di forza che regolano le interazioni inter-atomiche vengono continuamente proposti e implementati nell’ambiente di calcolo del CASPUR

    IL WEB: UN MERAVIGLIOSO GIARDINO... APERTO O CHIUSO?

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    La nascita del web viene comunemente fatta risalire al 6 Agosto 1991 quando, presso il Cern di Ginevra, Tim Berners Lee mise on-line il primo sito. Da quel giorno sono passati venti anni, o poco più. Alla luce di ciò l’articolo prende in analisi l’evoluzione della rete, interrogandosi sullo stato di salute di questo straordinario ambiente tecnologico e comunicativo che caratterizza la vita di ciascuno di no

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