Centre Marc Bloch

Publikationsserver der Humboldt-Universität zu Berlin
Not a member yet
    31325 research outputs found

    Konkurrierende Raumproduktionen zwischen religiöser Praxis, kulturellem Erbe und touristischer Inwertsetzung

    No full text
    Das „Freitagsleiden“ der katholischen Stigmatisierten Therese Neumann (1898-1962) zog seit den 1920er Jahren Besucherströme in ihren Wohnort Konnersreuth (Oberpfalz/Bayern). Ihr 2005 eröffneter Seligsprechungsprozess und ein Regionalentwicklungsprozess im Rahmen des EU-Förderprogramms LEADER befördern die Inszenierung der „Sakralen Landschaft“ Konnersreuths als Ensemble „authentischer“ historischer Orte des geistigen wie materiellen Erbes der Stigmatisierten, unter maßgeblicher Beteiligung der Zivilgesellschaft. In den Raumproduktionen treffen konträre Wertzuschreibungen dieses Erbes aufeinander: Sakralisierung, Heritageifizierung, Somatisierung. Profanierung und Resakralisierung. Als Sakralisierung beschreibe ich die religiöse Überhöhung Therese Neumanns zur „Sühneseele“, die eine rechtskatholische, antiliberale Politotheologie verkörpert. Heritageifizierung bezeichnet die Inwertsetzung des Kults als Kulturerbe und Touristenattraktion sowie die Aktivierung der Bevölkerung zur ehrenamtlichen Arbeit im Rahmen von LEADER; ein „postsäkulares“ Verständnis des Religiösen als Ausdruck kultureller Vielfalt und Ressource zivilgesellschaftlicher Selbstregierung ignoriert dabei Transzendenzbezüge. Drei eigensinnige Aneignungsweisen des Erbes Therese Neumanns durchkreuzen Sakralisierung und Heritageifizierung: Profanierung lehnt die öffentliche Inszenierung des Erbes ab und beharrt auf der lebensweltlichen Einbettung Therese Neumanns in lokale Machtverhältnisse und der Ambivalenz ihrer Heiligkeit. Somatisierung verknüpft im Rekurs auf leibliche Heilungserfahrung devotionale Konzeptionen von Agency mit EU-Imperativen ehrenamtlichen Engagements sowie touristische Erholungsangebote mit religiösen Heilsversprechen. Re-Sakralisierung schließlich benutzt eine „postsäkulare“ Inszenierung der Stigmatisierten als Kulturerbe, um Transzendenzbezüge zu betonen und ein politisch-religiöses Projekt der Rechristianisierung Europas zu verfolgen.The “Friday Suffering” of the Catholic stigmatic Therese Neumann (1898-1962) drew streams of visitors to her hometown of Konnersreuth (Upper Palatinate, Bavaria) since the 1920s. Her beatification process, initiated in 2005, and the regional development within the framework of the EU funding approach of LEADER are promoting the staging of Konnersreuth’s “Sacred Landscape” as an ensemble of “authentic” historical sites of the stigmatic’s spiritual and material heritage, with significant participation from civil society. In these productions of space, contradictory valorizations of this heritage are negotiated: sacralization, heritageification, somatization, profanation, and resacralization. I describe sacralization as the religious elevation of Therese Neumann to the status of a “victim soul”, which embodies a right-wing, anti-liberal Catholic political theology. Heritageification refers to the valorization of the cult as cultural heritage and tourist attraction as well as to the activation of citizens to voluntary work for “their” heritage within the framework of LEADER; in accordance with “post-secular” conceptions of religion as expression of cultural diversity and a resource for citizens’ self-government, religious references to transcendence, however, are ignored. Sacralization and heritageization are contested by three local valorizations of Therese Neumann’s heritage: Profanation rejects the public staging of the heritage and insists on the stigmatics embeddedness in local power relations and the ambivalence of her holiness. Somatization, by recourse to bodily healing experiences, links devotional conceptions of agency with EU imperatives for volunteer work, as well as touristic provisions of well-being with religious promises of salvation. Finally, re-sacralization uses a “post-secular” staging of the stigmatic to emphasize the transcendental aspects and political-theological implications of her material heritage in a project of re-Christianizing Europe

    Variations of Environmental Niche Breadth, Range Sizes and Geographic Exclusion With Bat Species Richness

    No full text
    Aim: More species‐rich communities are often assumed to contain more specialist species with narrower niches and smaller ranges. Stronger interspecific competition in species‐rich communities is thought to be a key mechanism explaining these patterns. Yet, the relationship between richness and specialisation has so far only been studied for a few taxa, and characterising the effects of interspecific competition on species distributions is challenging. Here, we assess broad‐scale relationships between niche breadth, range sizes and geographic exclusion along richness gradients of bats. Location: Eastern Mediterranean, Western Asia, and Central Asia. Taxon: Bats (Chiroptera). Methods: Based on a novel integrated species distribution modelling approach that combines occurrence information with expert range maps, we assessed how environmental niche breadth and range sizes varied with species richness. In addition, by contrasting species' potential and realised distributions in areas where species pairs overlap, we derived indicators of geographic exclusion to understand how potential interspecific competition is affecting range limits along richness gradients. Results and Main Conclusions: We found a nonlinear association between environmental niche breadth and richness, with the most specialised species occurring in species‐poor regions and niche breadth peaking at intermediate richness. Despite a positive association of niche breadth and range sizes at the species level, range sizes in predicted bat communities declined continuously with species richness. In addition, patterns of geographic exclusion were linked to patterns of niche breadth, with species filling less of their potential range overlaps when overlapping species were more specialised. Our findings suggest that small range sizes in species‐rich bat communities are better explained by the number of interacting species than by environmental specialisation or stronger exclusion between individual species. More broadly, we show how integrated distribution modelling approaches can shed new light on the interplay of species richness, specialisation and community structure, and caution against generalising relationships between richness and specialisation across taxa and geographies.Leibniz‐Gemeinschaft 10.13039/501100001664Istanbul Teknik Üniversitesi 10.13039/501100007504Peer Reviewe

    Traceable Characterization of Complex-Shaped Nanoparticles using Small-Angle X-Ray Scattering

    No full text
    Die Charakterisierung von Nanopartikeln (NP) ist in vielen Bereichen des Lebens von großer Bedeutung. Um die Eigenschaften von NP zu bestimmen, stehen der Wissenschaft heute diverse Messmethoden zur Verfügung. Besonders geeignet für die Messung von NP ist die Röntgenkleinwinkelstreuung (SAXS), da sie Partikelensembles zerstörungsfrei und mit minimaler Probenpräparation in ihrer natürlichen Umgebung charakterisieren kann. SAXS liefert statistisch relevante Informationen, wie Größenverteilung und Anzahlkonzentration. In Kombination mit Synchrotronstrahlung können SAXS-Experimente in einem breiten Energiebereich mit hoher Brillanz und bekannter, auf SI-Einheiten (Internationales Einheitensystem) rückgeführter Strahlungsleistung durchgeführt werden, was eine rückführbare und zuverlässige Messung ermöglicht. Trotz der Vorteile von SAXS fehlten bislang praktische Auswertemethoden für die Charakterisierung der zunehmenden Vielfalt von Partikelformen. Die Verwendung analytischer Formfaktoren zur Berechnung der Streukurve eines komplex geformten Partikels ist schwierig, da sie die Berechnung der Fourier-Transformation der Elektronendichteverteilung des Partikels erforderlich macht. Zudem erschwert die isotrope Orientierung von NP in Suspension die Berechnung und erhöht den Rechenaufwand. Mit dieser Dissertation wird daher ein numerischer Ansatz vorgestellt, der es ermöglicht, NP beliebiger Form mit SAXS zu charakterisieren. Dieser Ansatz basiert auf der Berechnung der Debye-Gleichung und verwendet numerische Approximationen, um den Rechenaufwand zu minimieren. Durch die Kombination mit statistischen Auswertemethoden wie Markov Chain Monte Carlo können darüber hinaus Unsicherheitsbudgets umfassend abgeschätzt werden.The characterization of nanoparticles (NPs) is of great importance in many areas of life. To determine the properties of NPs, various measurement methods are available to science today. Small-angle X-ray scattering (SAXS) is particularly suitable for measuring NPs, as it can characterize particle ensembles non-destructively and with minimal sample preparation in their natural environment. SAXS provides statistically relevant information such as size distribution and number concentration. In combination with synchrotron radiation, SAXS experiments can be performed in a wide energy range with high brilliance and known radiation power traceable to SI (International System of Units) units, which enables traceable and reliable measurements. However, despite the advantages of SAXS, there is a lack of practical evaluation methods for characterizing the increasing variety of particle shapes. The use of analytical form factors to calculate the scattering curve of a single particle is difficult as it requires the calculation of the Fourier transform of the electron density distribution of the particle. In addition, the isotropic orientation of NPs in suspension complicates the calculation and increases the computational effort. This dissertation therefore presents a numerical approach that enables NPs of arbitrary shape to be characterized using SAXS. This approach is based on the calculation of the Debye equation and uses numerical approximations to minimize the computational effort. By combining it with statistical evaluation methods such as Markov Chain Monte Carlo, uncertainty budgets can be comprehensively estimated

    „Der Tiepolo geht leider nicht in unser Auto herein ...“. Objektwege im Exil am Beispiel der Geschwister Stern und ihrer West’s Galleries

    No full text
    Objektwege im Exil sind unmittelbar mit Personen im Exil verknüpft, die Objekte handeln, sammeln, leihen und transportieren. Ein Teil davon sind Kunsthändler:innen deutsch-jüdischer Herkunft, die England während des Nationalsozialismus als Zufluchtsland wählten. Sie stehen im Fokus meiner Dissertation, die in diesem Werkstattbericht vorgestellt wird. Ein konkreter Fall, jener der Geschwister Hedi Stern (1900–1983) und Max Stern (1904–1987), dient als Fallstudie, weil die sehr gute Quellenlage einen detaillierten Einblick in die Biographien als auch in ihre Geschäftsgeschichte erlaubt. Mit dem Kriegseintritt Großbritanniens wurde aus der vermeintlichen Sicherheit im Exil erneut eine Verfolgungssituation, die für Max Stern in Internierung, Verschiffung nach Kanada und Zwangsarbeit endete. In meinem Beitrag spreche ich grundlegende Fragen an, wie etwa die Flucht nach Großbritannien gelang, obwohl die Hindernisse für Flüchtende massiv waren; wie es trotz Arbeitsverbots gelingen konnte, eine Galerie im Exil zu gründen, oder wer die Kund:innen waren. Biographische Dokumente sowie die erhaltene Korrespondenz der Galerie im Umfang von über 1.000 Seiten lassen eine umfassende Analyse zu. Methodisch wird der Komplexität des Materials durch die Verschränkung von Biographie- und Objektforschung sowie mit einem Blick durch ein Brennglas auf die Gesamtsituation begegnet. Dieses Modell, adaptiert vom Modell des Ökosystems, wurde 2022 von Anne Helmreich als zukunftsweisend für die Provenienzforschung vorgestellt. Die herausgearbeiteten Verlust- und Verfolgungsumstände besitzen besondere Relevanz für sogenanntes Fluchtgut, also Objekte, die im Exil veräußert wurden, um die Flucht und das Überleben im Exil zu finanzieren.Peer Reviewe

    Radiation Damage Studies of Monolithic Silicon Sensors for Particle and Astroparticle Physics Applications

    No full text
    Die Entwicklung und Charakterisierung neuer Detektortechnologien ist ein wichtiger Forschungspfad, um künftige Hochenergie- und Astroteilchenphysikexperimente zu ermöglichen. Sowohl für die raue Strahlungsumgebung moderner Collider-Experimente als auch für die protonen-, elektronen- und schwerionenreiche Umgebung in der äußeren Erdumlaufbahn ist die Strahlungshärte moderner Detektoren eine ihrer wichtigsten Leistungsmerkmale. In dieser Arbeit werden die Strahlungshärte und die Optimierung von Detektoren sowohl für die weltraumgestützte Astroteilchenphysik als auch für moderne Beschleuniger-Experimente untersucht. Im ersten Teil wird die Strahlungshärte der Kamera für die ULTRASAT Weltraummission quantifiziert. ULTRASAT ist ein Weitwinkel-Weltraumteleskop, das tiefe zeitaufgelöste Untersuchungen im nahen ultravioletten Spektrum durchführen wird. ULTRASAT wird vom Weizmann Institute of Science in Israel und der israelischen Weltraumbehörde geleitet und soll 2027 gestartet werden. Die CMOS-Kamera (Complementary Metal Oxide Semiconductor) wurde von DESY entwickelt und gebaut. Die Strahlungshärte der CMOS-Bildsensoren wurde sowohl im Hinblick auf kumulative Effekte als auch auf Einzelereignisse bewertet. Darüber hinaus wird die gemessene Degradation genutzt, um die Auswirkungen auf die Nachweisgrenzen der Kamera abzuschätzen. Im zweiten Teil wird die Strahlungshärte des Depleted Monolithic Active Pixel Sensor Tracker MALTA untersucht. MALTA ist ein Tracking-Sensor, dessen Design für die An-forderungen der äußeren Pixelschicht des ATLAS Inner Tracker ausgelegt ist. Es wurden verschiedene Varianten der Pixelgeometrie und des Siliziumwachstums untersucht, um bessere Tracking-Leistungen für künftige Collider-Experimente zu erzielen.The development and characterization of new detector technologies is an important research path in order to facilitate future high energy and astroparticle physics experiments. For both the harsh radiation environment of modern collider experiments and the proton, electron and heavy ion rich environment in the outer earth orbit, the radiation hardness of modern detectors is one of their most important figures of merit. This thesis explores the radiation hardness and optimization of detectors for both space-borne astroparticle physics and modern collider experiments. In the first part, the radiation hardness of the ULTRASAT space mission's camera is quantified. ULTRASAT is a wide-angle space telescope that will perform deep time-resolved surveys in the near ultraviolet spectrum. ULTRASAT is led by the Weizmann Institute of Science in Israel and the Israel Space Agency and is planned for launch in 2027. The Complementary Metal Oxide Semiconductor (CMOS) camera was designed and built by DESY. The radiation hardness of the CMOS Imaging Sensors was evaluated in terms of both cumulative damage and single event effects. Furthermore, the measured degradation is used to estimate the impact on the detection limits of the camera. In the second part, the radiation hardness of the depleted monolithic active pixel tracker MALTA is investigated. MALTA is a tracking sensor with a design that targets the ATLAS Inner Tracker outer pixel layer requirements. Several pixel geometries and silicon growing variations have been investigated in order to achieve better tracking performances for the future collider experiments

    Eine ethnographische Studie der Kaspischen Region anhand der Beispiele Aqtóbe/Westkasachstan und Sumqayıt/Aserbaidschan

    No full text
    Die ethnographische Studie untersucht Migration, Mobilität und Informalität in der Kaspischen Region anhand der Beispiele Aqtóbe/Westkasachstan und Sumqayıt/Aserbaidschan. Im als internationalen Stadt angepriesenen Sumqayıt wurden von der Errichtung an lokale Ethnien mit einbezogen, während für den Ausbau der Schwerindustrie zwar Spezialisten aus dem europäischen Teil der UdSSR nach Aqtóbe geschickt wurden, Kasachen ihren Platz aber auf den entfernten sovchozen fanden. Sumqayıt entwickelte sich rasch und lockte junge Menschen aus den Kaukasusdörfern in die Stadt durch eine geregelte Arbeitszeit und der Aussicht auf eine eigene Wohnung. Ende der 1980er-Jahre wurden jedoch die großen Umweltbelastungen spürbar und Geflüchtete suchten nach Schutz vor dem Karabachkrieg. Die Migration von Kasachen nach Aqtóbe begann erst Ende der 1980er-Jahre. Neben Kasachen aus dem Oblast zog Aqtóbe auch repatriierte Kasachen (oralman) vor allem aus Usbekistan und Turkmenistan an. Sumqayıt bot Bildungsmigranten die Möglichkeit, zu Hoch- und Berufsschulen nach Baku zu pendeln. Bildung der jungen Generation zusammen mit der Arbeitsplatzsuche der älteren Generation war ein ausschlaggebender Moment zur Migration des Haushalts in die beiden Großstädte. In Aqtóbe hofften Migranten durch Bildung einen Job außerhalb der prekären Beschäftigungsverhältnisse in der Rohstoffindustrie zu ergattern, die von vielen aber als Katalysator genutzt wurde, um das Startkapital für den Umzug zu erwirtschaften. Junge Frauen von Land konnten durch Migration ihren Lebensunterhalt selbst erwirtschaften und dem Druck auf eine frühe Eheschließung ausweichen. Großstädte wie Aqtóbe und Sumqayıt nehmen eine zentrale Rolle im Mobilitätsgeflecht der Kaspischen Region ein. Das Verhältnis von Chancen zu Risiken erweist sich als wesentlich günstiger als in den jeweiligen Hauptstädten, zudem sind die Informationskosten geringer. Als Ankunftsorte bieten sie Zugang zu informellem Wohnraum und Arbeitsmarkt.This ethnographic study examines migration, mobility and informality in the Caspian region using the examples of Aqtóbe/Western Kazakhstan and Sumqayıt/Azerbaijan. In Sumqayıt, praised as an international city, local ethnic groups were involved from the very beginning, while specialists from the European part of the USSR were sent to Aqtóbe for the establishment of heavy industry, but Kazakhs found their place in distant sovkhozs. Sumqayıt developed rapidly and attracted young people from the Caucasus villages to the city with regular working hours and the prospect of their own apartment. At the end of the 1980s, however, severe environmental pollution became evident and refugees searched for protection from the Karabakh War. The migration of Kazakhs to Aqtóbe only began at the end of the 1980s. In addition to Kazakhs from the oblast, Aqtóbe also attracted repatriated Kazakhs (oralman), mainly from Uzbekistan and Turkmenistan. Sumqayıt offered educational migrants the opportunity to commute to higher education and vocational schools in Baku. The education of the younger generation together with the job search of the older generation was a decisive factor in the household’s migration to the two major cities. In Aqtóbe, migrants hoped that education would enable them to find a job outside the precarious employment conditions in the resource industry, which many used as a catalyst to earn the start-up capital for the move. Young rural women were able to earn their own living through migration and avoid the pressure of early marriage. Large cities such as Aqtóbe and Sumqayıt play a central role in the Caspian region's mobility network. The ratio of opportunities to risks proves to be much more favorable than in the respective capitals, and information costs are also lower. As arrival cities, they offer access to informal housing and the labor market

    Unter Anwendung eines eigens konzipierten KI-Adoptionsindex (AIAI) untersucht diese Arbeit den Zusammenhang zwischen Künstlicher Intelligenz und der Arbeitsproduktivität in Deutschland

    No full text
    Unter Anwendung eines eigens konzipierten KI-Adoptionsindex (AIAI) untersucht diese Arbeit den Zusammenhang zwischen Künstlicher Intelligenz und der Arbeitsproduktivität in Deutschland.Using a custom-developed AI Adoption Index (AIAI), this study analyzes the relationship between artificial intelligence and labor productivity in Germany

    Equipping Commercial Silica Phases with Selected Peptide-Based Binding Domains to Tailor Affinity

    No full text
    The article processing charge was funded by the Open Access Publication Fund of Humboldt-Universität zu Berlin.A set of peptide-functionalized mesoporous silica particles is synthesized by chemoselective inverse electron-demand Diels-Alder (IEDDA) ligation, exploiting the robust and cost-effective norbornene/tetrazine coupling chemistry. The peptides program the capabilities of the silica particles to specifically complex and host small organic entities. Customized chromatography columns are packed that are tailored to specifically retard the respective compounds, while other substances elute rapidly. Using combinatorial means, the 7-mer peptides QFFLFFQ, QFFEFFQ, and QFQQSFF have been previously selected as good, medium, and poor binders, respectively, for the photosensitizer 5,10,15,20-tetrakis(3-hydroxyphenyl)chlorin (m-THPC). These sequences are C-terminally functionalized with 1,2,4,5-tetrazine (Tz) moieties to enable IEDDA ligation to silica material presenting endo- /exo-norbornene (Nb) moieties to give pyridazine (Pz)-linkages. The resulting silica-Pz-Peptide materials (Sil-Pz-X) retain their pore systems and show peptide loadings of up to 0.19 mmol g−1. The capabilities of the different Sil-Pz-X materials to bind the photosensitizer are investigated by incubation/elution batch assays, confirming that the peptides define the binding selectivity and capacity in a sequence-dependent manner. Professional packing of Sil-Pz-X results in a set of high-performance liquid chromatography (HPLC) columns. HPLC elution studies of m-THPC and a functional relative, Chlorin E6, show a compound-specific retardation that clearly reflects the complexation properties of the peptides for the respective photosensitizers.Peer Reviewe

    Next Generation Chromophores to Interrogate Cell Surface Proteins

    No full text
    Die Dissertation "Next Generation Chromophores to Interrogate Cell Surface Proteins" stellt eine Reihe von Studien vor, die sich auf die Weiterentwicklung und Anwendung von Chromophoren in der biologischen Forschung konzentriert und dabei einen besonderen Fokus auf Zelloberflächenproteine legt. Sie umfasst die Synthese neuartiger Chromophore und die Optimierung bestehender sowie deren Anwendung in verschiedenen biologischen Studien. Der erste Abschnitt stellt eine neue Klasse von Cyaninfarbstoffen vor, die SiliconCyanines (SiCys). Beginnend mit der konzeptionellen Idee geht die Studie über ein rationales Design unter Verwendung fortschrittlicher chemischer Techniken voran und gipfelt in einem detaillierten Plan zur Verwirklichung des vorgeschlagenen Nahinfrarot-Farbstoffs. Die Helligkeit, Lebensdauer und chemische Stabilität bestehender Fluorophore wird durch eine neuartige Methode der isotopischen Markierung verbessert, was anhand N-methyl-deuterierter Rhodamine in verschiedenen Umgebungen demonstriert werden konnte und auf andere Farbstoffgruppen übertragbar ist. Diese Methodik wird auch auf Azobenzol-Photoschalter angewandt, was zu einer verbesserten Lichtempfindlichkeit und einer effizienteren Photoschalterkinetik führt. Dies wurde erfolgreich zur optischen Kontrolle von Ionenkanälen und G-Protein-gekoppelten Rezeptoren in lebenden Zellen verifiziert. Zudem wurde ein einstufiges Protokoll entwickelt, um Halo-Tag-Substrate durch Einführung von Sulfonaten undurchlässig zu machen und so eine exklusive Membranfärbung von extrazellulär Halo-Tag exprimierenden Zellen zu erreichen. Schließlich werden undurchlässige Fluorophore über eine Disulfidbrücke mit einem SNAP- oder Halo-Tag-Liganden versehen, um den Transport von Zelloberflächenrezeptoren zu untersuchen. Die Disulfidbrücke wird durch ein membran-undurchlässiges Reduktionsmittel gespalten, wodurch das Signal nicht-internalisierter Proben an der Zellmembran verschwindet.The thesis, "Next Generation Chromophores to Interrogate Cell Surface Proteins" introduces a series of studies focused on advancing chromophores' development and application in biological research with a special focus on cell surface proteins. This extensive research covers the synthesis of novel chromophores, optimization of existing ones, and their diverse applications in biological studies. The first section unveils a new class of cyanine dyes, the SiliconCyanines (SiCys). Starting with the conceptual idea, the study progresses through rational design using advanced chemistry techniques and culminates with a detailed roadmap to achieve the proposed near-infrared dye. The brightness, lifetimes, and chemical stability of existing fluorophores is enhanced by a novel methodology of isotopic labelling, which is demonstrated on N-methyl deuterated rhodamines in several different settings and applied to further dye groups. This approach is transferred to azobenzene photoswitches, resulting in increased light sensitivity, improved photoswitch efficiency, and accelerated photoswitch kinetics, which was successfully verified in the optical control of ion channel and G protein-coupled receptor function in live cells. A one-step protocol is developed to achieve exclusive membrane staining of extracellular Halo-tag expressing cells by incorporation of sulfonates in Halo-tag substrates. Finally, impermeable probes are enhanced with a disulfide bond between the fluorophore and SNAP- or Halo-tag scaffold to investigate cellular surface receptor trafficking events by enabling to cleave non-internalized, yet bound probe via an impermeable reducing agent

    Strategies to Improve the Brightness of Nucleic Acid Hybridization Probes for mRNA Detection in Live T Cells

    No full text
    Jüngste Fortschritte in der intrazellulären RNA-Bildgebung haben die Untersuchung der mRNA-Lokalisation und Genexpressionsmuster in biologischen Systemen ermöglicht. In diesem Zusammenhang wurden von der Arbeitsgruppe von Prof. Dr. Oliver Seitz sogenannte FIT-Sonden (forced intercalation) eingeführt, die ein intern markiertes Monomethin-Cyaninfarbstoff aus der Thiazolorange(TO)-Familie als Basensurrogat enthalten. FIT-Sonden bleiben ohne Ziel-RNA dunkel und zeigen bei Hybridisierung eine deutlich erhöhte Fluoreszenz. Trotz ihrer Anwendung in der RNA-Bildgebung bleibt der Nachweis endogener RNAs mit niedriger Kopienzahl eine Herausforderung. Im ersten Teil dieser Arbeit werden neue TO-abgeleitete Cyaninfarbstoffe in FIT-Sonden integriert. Die Optimierung einer bestimmten Fluorophorstruktur wird im Rahmen der FIT-Methodik erstmals systematisch untersucht. Acht neue TO-Derivate werden hinsichtlich ihrer Bindungsaffinitäten und optischen Eigenschaften in sechs Sequenzkontexten geprüft und mit bestehenden TO-FIT-Sonden verglichen. Ein N-Propano-überbrücktes TO-Derivat zeigt sich dabei als besonders helles und reaktionsfreudiges Basensurrogat in DNA-FIT-Sonden. Im zweiten Teil wird eine neuartige, FRET-basierte Strategie vorgestellt, um die Leistung von FIT-Sonden zu verbessern. In diesem Design, genannt „auxiliary dye enhanced FIT probes“, dienen extrem leuchtstarke Alexa-Fluor-Farbstoffe (AF) als FRET-Donoren für die Interkalatoren TO/QB. Die Fluoreszenz einzelsträngiger Sonden wird durch Farbstoff-Wechselwirkungen und FRET effizient gequencht. Nach Hybridisierung trennt sich das Farbstoffpaar, was zu einer verstärkten Emission führt. Die kombinierten Extinktionskoeffizienten erhöhen die Gesamthelligkeit bei gleichzeitig hoher Fluoreszenzverstärkung. Abschließend werden die Sonden zur Detektion von TCR-mRNA in lebenden T-Lymphozyten mittels Durchflusszytometrie eingesetzt. Eine einzige „auxiliary dye enhanced“ FIT-Sonde ermöglicht die Unterscheidung verschiedener T-Zell-Klone auf Basis ihrer mRNA-Expression.Recent advances in intracellular RNA imaging enabled the study of mRNA localization and gene expression patterns. As part of this, forced intercalation (FIT) probes were introduced by Prof. Dr. Oliver Seitz’s group, featuring an internally labeled monomethine cyanine dye from the thiazole orange (TO) family serving as a nucleobase surrogate. FIT probes remain dark without target RNA and produce enhanced emission upon hybridization. Despite their applications in RNA imaging, detecting endogenous RNA expressed at low levels remains challenging. In the first part of this thesis, new TO-derived cyanine dyes are incorporated into FIT probes. The optimization of a given fluorophore structure is explored within the FIT methodology for the first time. Eight new TO derivatives are evaluated for their binding affinities and optical properties in six sequence contexts and compared with analogous TO-FIT probes. An N-propano bridged TO derivative is identified as a bright and responsive nucleobase surrogate in DNA FIT probes. In the second part, a novel FRET-based strategy is introduced to improve FIT probe performance. This design, termed “auxiliary dye enhanced FIT probes,” uses extremely bright Alexa Fluor (AF) dyes as FRET donors for the TO/QB intercalators. Emission from the single-stranded probe is quenched by dye-dye interactions and FRET. Upon hybridization, the dyes are separated, resulting in enhanced emission. The combined extinction coefficients provide improved brightness while maintaining a high fluorescence turn-on. Finally, the probes are used to detect TCR mRNA in live T-lymphocyte cells via flow cytometry. A single auxiliary dye enhanced FIT probe enables the distinction of one T cell clone from another based on mRNA expression

    25,626

    full texts

    31,325

    metadata records
    Updated in last 30 days.
    Publikationsserver der Humboldt-Universität zu Berlin is based in Germany
    Access Repository Dashboard
    Do you manage Open Research Online? Become a CORE Member to access insider analytics, issue reports and manage access to outputs from your repository in the CORE Repository Dashboard! 👇