Repozytorium Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza (AMUR)
Not a member yet
24938 research outputs found
Sort by
Classifying a handwriting sample as to its type
No full textWydział Prawa i AdministracjiGłównym celem badawczym pracy było udzielenie odpowiedzi na pytanie, czy możliwe jest klasyfikowanie pisma ręcznego według jego typu (na podstawie jego cech graficznych), a jeśli tak - opracowanie takiej metody. W tym celu dokonano przeglądu literatury przedmiotu i przeprowadzono badania naukowe. Badania wykazały, że pewne cechy graficznie istotnie różnicują typy prób i że możliwe jest opracowanie metody klasyfikowania pisma ręcznego według typu. Opracowano 3 metody klasyfikowania i wykazano, że pozwalają one na skuteczne klasyfikowanie prób pisma ręcznego według typu.The main aim of the dissertation was to answer the question if it is possible to classify handwriting samples as to their type (based on their graphic features) and if so – to find such a method of classification. In order to perform it, a review of the literature on the subject was done and scientific research was carried out. The results confirmed that some graphic features of the handwriting do differentiate the types of handwriting samples and that it is, indeed, possible to find a method of such a classification. During the research the 3 methods of classification were found and it was proved that they can be used to effectively classify the handwriting samples as to their type
The Mechanism of "Targeted Killing" as a Part of Israeli Counter-Terrorism Policy
No full textWydział Nauk Politycznych i DziennikarstwaWyjątkowość tego badania polega na próbie przedstawienia innej perspektywy dotyczącej mechanizmu „ukierunkowanych zabójstw” i jego wpływu na elementy terrorystyczne. Jednym z powodów przeprowadzenia badania są fundamentalne różnice między światem kultury oraz zasadami i wartościami wolnych i demokratycznych państw, a stojącymi w wyraźniej z nimi sprzeczności zasadami, którymi kieruje się terroryzm. W literaturze naukowej, w tym prawnej, istnieje tendencja do akceptowania „ukierunkowanych zabójstw”, ale z ograniczeniami. Niniejsze opracowanie obszernie omawia kwestię skutecznej walki z terroryzmem i korzystania przez państwa demokratyczne z mechanizmu ukierunkowanych zabójstw w obliczu braku innego wyboru, ze szczególnym uwzględnieniem Izraela podczas intifady Al-Aksa w latach 2000-2009. Studium zajmuje się zasadami prawa międzynarodowego, które zrównoważają względy humanitarne i prawa człowieka ze względami wojskowymi. Występuje tu konflikt między prawami człowieka a bezpieczeństwem państwa; badano działania antyterrorystyczne dwoma sposobami, udaremniając operacje i/lub uderzając w dowódców traktując to jako samoobronę, pod względem moralnym i prawnym. Okazuje się, że taka możliwość jest uzasadniona, ponieważ powoduje, że dowódcy terroru będą rozważać swoje kroki, mając na uwadze ich bezpośredni wpływ na nich. Badanie ujawniło, że podczas intifady Al-Aksa i okresu objętego dochodzeniem przeprowadzono około 127 operacji ukierunkowanych zabójstw, w których zginęło 212 terrorystów. Wśród nich byli działacze terenowi i dowódcy różnych szczebli, z których najważniejszym był przywódca ruchu terrorystycznego Hamas, szejk Ahmad Yassin. Wydarzenia z 11 września zwiększyły zainteresowanie badaniami zjawiska terroryzmu kładąc nacisk na publikacje poruszające aspekty koncepcyjne i teoretyczne. Grupy badawcze i konferencje naukowe zajmujące się tym zjawiskiem przyspieszają procesy badawcze. Skuteczna walka z terroryzmem opiera się na odstraszaniu, ale ta podstawowa przesłanka jest wątpliwa w przypadku organizacji terrorystycznych. Pomimo badań nad terroryzmem wciąż nie ma definicji, która będzie akceptowalna w środowisku akademickim i będzie stanowić uzgodniony punkt wyjściowy do badań w tej dziedzinie. Badanie wykazało, że według badaczy Fleminga, Stohla i Schmida, którzy badali różne typologie w dziedzinie terroryzmu w celu ich rozróżnienia, tak aby stanowiły podstawę do uogólnienia, a nawet teoretyzowania na temat zjawiska społecznego gwałtu, takiego jak terroryzm. Na przykład dokładna typologia ideologicznych cech charakterystycznych organizacji terrorystycznej może stanowić podstawę do badania związku między ideologią, celami i metodami działania takich organizacji. Hipotezy i kwestie badawcze dotyczą polityki uruchamiania i wykorzystania mechanizmu ukierunkowanego zabijania oraz powodzenia lub niepowodzenia w zmniejszeniu liczby ataków terrorystycznych na Państwo Izrael. Zbadano również sukces lub niepowodzenie działania poprzez atak na czołowych przywódców organizacji terrorystycznych oraz wpływ tego mechanizmu na liczbę ataków terrorystycznych. Z ustaleń wynika, że ukierunkowane zabijanie przyczyniło się do spadku liczby ofiar terroryzmu. Okazało się, że dokonywanie aresztowań jest czasem skuteczniejsze niż ukierunkowane zabijanie. Ponieważ w przeciwieństwie do zabójstw, poprzez aresztowania i przesłuchania gromadzone są informacje i ujawniona zostaje cała siatka terrorystyczna, aresztowania zwiększają ryzyko sił bezpieczeństwa, ale zmniejszają ryzyko dla ludności. Ponadto ustalenia obalają twierdzenie o wpływie ataków na głównych przywódców terroru na zmniejszenie liczby ataków terrorystycznych, jakkolwiek można zauważyć znaczny spadek i spowolnienie liczby ataków terrorystycznych, jednakże nie można ustalić bezpośredniego związku przyczynowego w odniesieniu do rangi działaczy. Ustalenia wykazują, że dokonywanie ukierunkowanych zabójstw jest skuteczne, ale status terrorysty nie ma większego znaczenia, mimo że liczba zamachów terrorystycznych spadła.1
Wkład tego badania pozwala zrozumieć, że mechanizm ukierunkowanego zabijania przyczynia się do zmniejszenia liczby aktów terrorystycznych. Ponadto wkład badań polega na poszerzeniu zarówno teoretycznej, jak i praktycznej dyskusji w zakresie rozwijania wiedzy i narzędzi potrzebnych do zrozumienia składników terroryzmu oraz zbadania skutecznych sposobów radzenia sobie z tym zagrożeniem przez państwo demokratyczne jak w przypadku Izraela.The uniqueness of this research study is the attempt to offer other perspectives regarding the mechanism of "targeted killing” and its influence on factors of terrorism. One of the reasons for carrying out the research study lies in the essential difference of the world of the culture and values of the free and democratic countries, which is contradictory to the values of terrorism. The tendency in the research literature, including the legal literature, is to accept "targeted killing”, but with limitations. This research study discussed at- length the topic of the effective fight against terrorism and the use as a last option of the mechanism of targeted killing by democratic countries, with emphasis on Israel, during the Al- Aqsa Intifada in the years 2000-2009. This research study addressed the rules of international law that balance between the humanitarian considerations and human rights and the military considerations. There is a conflict between human rights and state security. Counterterrorism activity is examined in two ways, harm to the terrorists carrying out the attack and/or to the commanders as self-defense, in aspects of morality and in aspects of law. It becomes clear that this possibility is legitimate, since it will cause the terrorist commanders to consider their steps, in light of the direct influence on them. In the research study it became clear that during the Al-Aksa Intifada and the researched period about 127 targeted assassination operations were carried out, in which 212 terrorists were killed, including field operatives and commanders at different levels, when the most senior was the leader of the Hamas movement, Sheikh Ahmad Yassin.
The events of September 11 increased the interest in the research of the phenomenon of terrorism, with emphasis on conceptual and theoretical articles. Research groups and academic conferences that engage in the phenomenon will promote the research processes. Effective counterterrorism is based on deterrence, but this fundamental assumption is cast in doubt when referring to terrorist organizations. Despite the research engagement in terrorism, there is still no definition that will be accepted in the academic community and will constitute an agreed-upon starting point for researches in the field. This research study indicated according to the researchers Fleming, Stohl, and Shmid a variety of typologies in the field of terrorism, for these to constitute a basis for generalization and even theorization of a violent social phenomenon like terrorism. For example, a fundamental typology of the ideological characteristics of the terrorist organization can constitute a basis for the examination of the relationship between ideology, goals, and methods of action of such organization. The research hypotheses and questions addressed the policy of the deployment and use of the mechanism of targeted killing and the success or lack of success in reducing the number of terrorist attacks against the State of Israel. The success or lack of success was examined through preventative arrests. Furthermore, the lack of influence of this mechanism was examined on the number of terrorist attacks. The research also examined the policy of targeted killing against low- level operatives and senior operatives of the terrorist organization and the degree of reduction of the terrorist attacks. The findings indicate that targeted killing contributed to the decline of the number of terrorist victims. It became clear that the performance of arrests is sometimes more effective than targeted killings, since in arrest and interrogation intelligence is collected and the entire terrorist network is exposed. Arrests increase the risk to the security forces but also reduce the risk to the population. In addition, the findings disconfirm the influence of the harm to the senior terrorist operatives on the reduction of number of terrorist attacks. While it is possible to notice a significant decrease in the number of terrorist attacks, it is not possible to create a causal correlation on the issue of the seniority of the operatives. The findings show that the carrying out of targeted killing is effective but the status of the terrorist operative does not have considerable meaning although the number of terrorist victims decreased.
The contribution of this research study enables the understanding that the mechanism of targeted killing contributes to the reduction of the number of terrorist attacks. In addition, the contribution of the research study is its broadening of the discussion, both theoretical and practical, development of knowledge and tools for understanding components of terrorism, and examination of effective ways of coping with this threat by a democratic state, through the Israeli case
Audiovisual participatory culture in the era of media convergence and divergence on the example of YouTube platform in Poland
No full textWydział Nauk Politycznych i DziennikarstwaProblemem badawczym dysertacji są zmiany jakie zachodzą w mediach audiowizualnych, w szczególności to jak postęp technologiczny, dostępność urządzeń rejestrujących i Internet zmieniają dotychczasowe formy audiowizualne, a także jak popularna platforma internetowa do rozpowszechniania treści jaką jest YouTube oddziałuje na kulturę oraz inne media, zwłaszcza „tradycyjne”. Przedmiotem badań była platforma YouTube oraz internetowi twórcy funkcjonujący w polskiej przestrzeni serwisu. Głównym celem było zbadanie i przedstawienie specyfiki funkcjonowania twórców internetowych publikujących treści w obrębie platformy YouTube. Praca wykorzystuje metody jakościowe, a dokładniej - ustrukturyzowany pogłębiony wywiad indywidualny (IDI). Dodatkowo dysertacja poddaje analizie społeczność serwisu, platformę YouTube samą w sobie oraz zakres usług jakie oferuje, a także dokonana zostaje próba określenia jej pozycji względem mediów „tradycyjnych”, zwłaszcza telewizji. Rozprawa została także poszerzona o kontekst pandemii COVID-19 i jej skutków względem twórców funkcjonujących w polskiej przestrzeni platformy YouTube. Praca poddaje również analizie pojęcie audiowizualności oraz czynniki, zwłaszcza technologiczne, które umożliwiły wielu osobom tworzenie i rozpowszechnianie materiałów audiowizualnych na szeroką skalę oraz podejmowanie atrakcyjnych działań zarobkowych. Dysertacja podejmuje również rozważania nad pojęciami konwergencji i dywergencji mediów oraz kultury uczestnictwa, które to w dobie współczesnych przemian, zdają się materializować na platformie YouTube.The research problem of the dissertation are the changes taking place in audiovisual media, in particular how technological progress, the availability of recording devices and the Internet change the existing audiovisual forms, as well as how the popular internet platform for disseminating content, i.e. YouTube, affects culture and other media, especially "traditional ". The subject of the research was the YouTube platform and internet creators operating in the Polish space of the website. The main goal was to investigate and present the specificity of the functioning of internet creators publishing content on the YouTube platform. The work uses qualitative methods, and more precisely - a structured in-depth individual interview (IDI). In addition, the dissertation analyzes the website community, the YouTube platform itself and the range of services it offers, and an attempt is made to determine its position in relation to "traditional" media, especially television. The dissertation was also expanded to include the context of the COVID-19 pandemic and its effects on creators operating in the Polish space of the YouTube platform. The work also analyzes the concept of audiovisualism and factors, especially technological ones, which enabled many people to create and disseminate audiovisual materials on a large scale and to undertake attractive profit-making activities. The dissertation also considers the concepts of media convergence and divergence as well as the participatory culture, which seem to materialize on the YouTube platform in the era of modern transformations
Synthesis and analysis of new molecular macrocyclic and cage-like systems containing reversible disulfide bonds
No full textWydział ChemiiCelem tej pracy była synteza i analiza nowych molekularnych makrocykli i klatek opartych na wiązaniu disulfidowym. Synteza funkcjonalnych architektur molekularnych stanowi intrygujące wyzwanie badawcze ze względu na liczne zastosowania takich struktur.
Pierwsza część pracy została poświęcona syntezie i analizie pięciu dimerycznych klatek molekularnych rozpuszczalnych w wodzie. Przedstawiono pełny opis syntezy i analizę spektroskopową każdej klatki. Dodatkowo wykazano potencjał aplikacyjny otrzymanych struktur jako fluorescencyjne sensory wybranych lantanowców w wodzie.
W drugiej części opisano metodę modyfikowania rozpuszczalności złożonych multidynamicznych klatek molekularnych. Modyfikacja bloków budulcowych o dodatkowy łańcuch boczny wprowadziła nową funkcjonalność do struktury całej klatki. W efekcie otrzymano i zbadano dwie nowe wieloskładnikowe klatki molekularne o zróżnicowanej polarności i właściwościach fluorescencyjnych.
W ostatniej części pokazano oryginalne podejście do stymulowania biblioteki dynamicznej. W syntezie mikrofalowej otrzymano ditiolowy blok budulcowego, który zawiera grupy imidowe. Hydroliza in situ tych grup w warunkach zasadowych uwolniła nieoczekiwaną labilność konformacyjną komponentu. Zaowocowało to różnorodną strukturalnie biblioteką disulfidowych makrocykli. Opracowano metodę kontroli tego zjawiska poprzez modulację pH i przez dodatek DMSO.The aim of this thesis was the synthesis and analysis of the new molecular macrocycles and cage-like systems based on reversible disulfide bonds. The synthesis of functional architectures continues to pose an intriguing challenge due to the numerous applications of such structures.
The first part of this work deals with the synthesis and analysis of five different water-soluble dimeric molecular cages. A full description of the synthesis and analysis of each cage is provided. Additionally, the application potential of the obtained structures is presented as fluorescent sensors of selected lanthanides in water.
The second part presents the solubility tuning in multi-dynamic molecular cages. By the structural modification of building blocks, the new functionality was introduced to the structure of the entire cage. That way, two new multi-component molecular cages with various polarity and fluorescent properties were obtained.
The last part presents an unorthodox approach to stimulating a dynamic library. The use of microwave-assisted synthesis has resulted in a dithiol building block containing imide groups. The in situ hydrolysis of those imides under basic conditions caused unexpected conformational flexibility of this component that resulted in the library of disulfide macrocycles. The method of controlling this phenomenon by pH tuning and the addition of DMSO has been developed
Response of the water bears (Tardigrada) on the hypomagnetic conditions
No full textWydział BiologiiZaliczane do ekstremofili niesporczaki (Tardigrada), to drobne bezkręgowce szczególnie odporne na różnego rodzaju niesprzyjające warunki środowiskowe. Niemniej jednak ich odporność na niskie i wysokie temperatury, promieniowanie, próżnię kosmiczną, zawsze badane były w obecności pola geomagnetycznego. Jak dotąd nie prowadzono badań nad wpływu warunków hipomagnetycznych na ekstremofilne bezkręgowce, w tym na niesporczaki. Głównym celem mojej pracy było określenie stopnia śmiertelności niesporczaków w trakcie wchodzenia i wychodzenia ze stanu kryptobiozy, ale w przeciwieństwie do wcześniejszych badań analizy prowadzone były w warunkach izolacji układu eksperymentalnego od pola geomagnetycznego.
Wszystkie zebrane informacje oraz otrzymane wyniki wskazały całkiem nowy kierunek badań geomagnetobiologicznych skoncentrowanych na wpływie zmian w polu geomagnetycznym na organizmy ekstremofilne, poszerzając jednocześnie wiedzę na temat odporności niesporczaków na ekstremalne warunki środowiskowe zwłaszcza w kontekście badań kosmicznych.Tardigrades, are small extremophilic invertebrates, especially resistant to various unfavorable environmental conditions. Nevertheless, their resistance to low and high temperatures, radiation, and space vacuum has always been tested under the influence of a geomagnetic field. So far, no studies have been conducted on the influence of this type of physical force on active and anhydrobiotic tardigrades. Therefore, the main goal of my work was to determine the mortality rate of tardigrades entering and leaving the state of cryptobiosis (more precisely anhydrobiosis), in the isolation of the experimental system from the geomagnetic field.
All the collected data and the obtained results indicated a completely new direction of geomagnetobiological research focused on the impact of changes in the geomagnetic field on extremophilic organisms, at the same time broadening the knowledge on the resistance of tardigrades to extreme environmental conditions, especially in the context of space research
Parent Resources of Adolescents with ADHD: analysis of the narrative
No full textWydział Studiów EdukacyjnychDo realizacji badania, którego głównym celem było zrozumienie doświadczenia rodziców młodzieży z ADHD , wybrano jakościowy model badań. W niniejszym badaniu zebrano dane, uzyskane podczas zajęć grupowych dla rodziców, przy czym w każdej grupie uczestniczyło około siedmiorga rodziców. Każda grupa odbyła dziesięć spotkań, raz na dwa tygodnie, przy czym przed spotkaniami grupowymi przeprowadzono wywiady z rodzicami.
Wyniki badań potwierdzają to, co dotąd opisano w literaturze przedmiotu, poświęconej rodzicielskim problemom dotyczącym radzenia sobie z pierwotnymi i wtórnymi objawami ADHD u dzieci, a także tym wynikającym z trudności w relacjach w rodzinie, także dalszej i szerzej rozumianej społeczności. Owo zmaganie się z problemami wpływa negatywnie na poczucie skuteczności rodziców. Miewają oni poczucie bycia ocenianymi przez społeczeństwo jako „niewystarczająco dobrzy rodzice”. W niniejszych badaniach akcent położono na określenie i wydobycie psychicznych zasobów rodziców, które mogłyby stanowić swoistą przeciwwagę i remedium na wspomniane powyżej trudności.
Wnioski, jakie nasunęły się po przeprowadzeniu badań, wskazują, że rodzice adolescentów z ADHD niejednokrotnie odczuwają izolację społeczną i emocjonalną, ponieważ mają do czynienia z zaburzeniem, która jest niemożliwe do prostego zaobserwowania- można o nim jedynie wnioskować.This research is done in a qualitative methodology. The aim of the study was to examine the resources of parents of adolescents with ADHD, to describe their parenting experience, to identify the causes of their children's ADHD, and to examine the contribution of the parent care group. The data in the study were collected from 3 parent groups who shared the parenting experiences to adolescents with ADHD, their difficulties, and ways of coping. During narrative analysis, 4 main themes were found that indicate: parents 'experiences and understanding of the parental role, parents' perception of the abilities and difficulties of adolescents with ADHD, coping with the various relationships in the family and community, and intervention. The group's contribution to parental capacity. The conclusions of the study were aimed at a better understanding of the experience of parents dealing with an adolescent with attention deficit disorder and drew attention to the role of the various social systems in providing support to the adolescent and his or her parents. It has also been found that parents can make changes and improve their parenting when there is an empowering framework that offers them a way to learn their parental role, develop insights and take responsibility for their children’s behavior. Thus, there is room to allocate resources and implement support groups for parent counseling for children with ADH
Electrochemically-derived Graphite Oxide: Oxidation, Functionalization, Oxygen-clustering, Ni-electrodeposition and Characterization
No full textWydział ChemiiSzacunki teoretyczne wskazują, że szkieletowe związki tlenku grafitu (GOFs) dzięki oddziaływaniom van der Waalsa pomiędzy sąsiednimi warstwami grafenowymi, działają jak „nanopompy”, umożliwiając magazynowanie wodoru w znacznych ilościach. W strukturze GOFs, sąsiednie warstwy tlenku grafenu usieciowane są przez aminy, co zapewnia mechaniczną stabilność, zwiększa odstępy między warstwami i zapewnia selektywną adsorpcję małych cząsteczek gazu, zależnie od ich upakowania w szkielecie. Sposobem na zwiększenie zdolności do magazynowania wodoru jest aktywacja mechanizmu „spillover”, polegającego na tym, że rozproszone w szkielecie GOF nanocząstki metalu chemisorbują wodór.
W niniejszej pracy przeprowadzono elektrochemiczne utlenianie grafitu. Zbadano również proces chemicznego przetlenienia tlenku grafitu otrzymanego metodą elektrochemiczną. Stosując różne prekursory aminowe otrzymano różne materiały GOF, charakteryzujące się strukturami o różnych gęstościach połączeń aminowych. Fakt ten potwierdziły badania związane z adsorpcją barwnika. W końcowym etapie badań, na materiałach GOF zostały naniesione w sposób elektrochemiczny nanocząstki niklu. Wszystkie otrzymane materiały GOF zostały poddanej kompleksowej charakterystyce w kierunku poznania ich unikalnych właściwości, co w konsekwencji pozwoliło na zaproponowanie ich potencjalnego wykorzystania w procesach magazynowania wodoru.Graphite oxide frameworks (GOFs) had been theoretically predicted to harness collective van der Waals interactions, wherein adjacent layers act as nanopumps, allowing for sizeable hydrogen storage capacity. Within frameworks, adjacent graphene oxide layers are crosslinked by amine species, which: provide mechanical stability, increase the interlayer spacing, and provide selective adsorption of small gas molecules depending on the density of pillars within the framework. Additional means to boost hydrogen storage capacity is through activating the hydrogen spillover mechanism, wherein metal nanoparticles dispersed within framework dissociatively chemisorb hydrogen molecules.
In this thesis, (electro)chemical oxidation of graphite has been investigated. Overoxidation of electrochemically-derived graphite oxide has also been explored. Different graphite oxide frameworks have been produced using different amine precursors yielding frameworks with various density of pillars confirmed by dye adsorption experiments. Frameworks are decorated with nickel nanoparticles by electrochemical reduction. The frameworks have been characterized and studied to understand their properties in order to reflect on their promising potential application in hydrogen storage
Folding and aggregation of the human prion protein: biophysical studies of interactions with metal ions and the NCAM1-Aβ peptide construct
No full textWydział FizykiProces nieprawidłowego fałdowania komórkowej formy białka prionowego (PrPC), jest związany z rozwojem śmiertelnych chorób neurodegeneracyjnych znanych jako pasażowalne encefalopatie gąbczaste, do których należy choroba Creutzfeldta-Jakoba występująca u ludzi lub choroba „szalonych krów” występująca u bydła. Proces ten nie jest zjawiskiem wyjątkowym: w odpowiednich warunkach wszystkie białka mogą ulec zmianie strukturalnej z dobrze rozpuszczalnego stanu natywnego do nierozpuszczalnego i włóknistego stanu amyloidowego. Takie błędne fałdowanie białek połączone z ich agregacją związane jest również z kilkoma innymi chorobami neurodegeneracyjnymi.
Ludzkie białko PrPC jest zbudowane z 208 aminokwasów i składa się z dwóch strukturalnie różnych domen: nieustrukturyzowanej domeny N-terminalnej (DNT) oraz ustrukturyzowanej, głównie α-helikalnej, domeny C-terminalnej (DCT). DNT posiada ośmioaminokwasową powtarzającą się sekwencję (ang. octarepeat, OR), która poprzez reszty histydynowe wiąże jony metali Cu(II) i Zn(II). Wiele kofaktorów, włączając w to jony metali, wpływa na błędne fałdowanie białka PrPC. W niniejszej pracy zastosowałem różnorodne, komplementarne metody biofizyczne do zbadania strukturalnych skutków wiązania jonów Cu(II) i Zn(II) przez ludzkie białko PrPC oraz przez peptyd zawierający sekwencję OR.
Wyniki spektroskopii dichroizmu kołowego (ang. circular dichroism, CD) sugerują, że peptyd OR wiąże cztery jony Cu(II) oraz dwa jony Zn(II). Bliskie stechiometrycznym stężenia jonów obu metali wywołują zmianę helisy poliprolinowej typu II w zwrot β, natomiast stechiometryczne stężenia obu jonów metali wywołują powstanie antyrównoległych arkuszy β. Symulacje dynamiki molekularnej peptydu OR związanego z jonami metalu wskazują formowanie struktur spinek do włosów posiadających antyrównoległe arkusze β. Bezpośrednie dodanie jonów Zn(II) do peptydu OR skutkuje wiązaniem barwników, charakterystycznych dla włókien amyloidowych takich jak tioflawina T oraz czerwień Kongo. Po inkubacji peptydu OR z jonami Zn(II) obrazowanie z zastosowaniem mikroskopii sił atomowych oraz transmisyjnej mikroskopii elektronowej ujawniło obecność włóknistych struktur. Charakterystyczny obraz dyfrakcji promieniowania rentgenowskiego wykazał obecność poprzecznych arkuszy β, typowych dla włókien amyloidowych. W związku z powyższym wiązanie jonów Cu(II) i Zn(II) przez peptyd OR może prowadzić do powstania struktur amyloidowych.
W przypadku ludzkiego białka PrPC wiązanie jonów Zn(II) przez region OR skutkuje oddziaływaniem pomiędzy DNT i DCT. Spektroskopia CD wskazuje na utratę struktury α-helikalnej na skutek wiązania jonów Zn(II), prawdopodobnie w obrębie helisy drugiej i trzeciej, zlokalizowanych w DCT, oraz powstanie zwrotów β, prawdopodobnie dokoła związanego jonu Zn(II). Wyniki miareczkowania z zastosowaniem spektroskopii fluorescencji oraz CD sugerują, że pozorna stała dysocjacji dla kompleksu PrPC·Zn(II) mieści się w granicy niskich stężeń mikromolowych, przez co można wnioskować, że takie oddziaływanie jest możliwe w warunkach fizjologicznych. Symulacje dynamiki molekularnej dla kompleksu PrPC·Zn(II) wskazują stabilizację trzeciej α-helisy, podczas gdy wyniki małokątowego rozpraszania promieniowania rentgenowskiego sugerują bardziej kompaktowe zwinięcie białka PrPC związanego z cynkiem. Jako że wiązanie cynku do białka PrPC faworyzuje oddziaływanie międzydomenowe i stabilizuje trzecią α-helisę, cynk może hamować proces agregacji lub tworzenia włókien amyloidowych przez białko PrPC.
Ponadto zbadano wpływ zaprojektowanego peptydu NCAM1-Aβ na agregację i tworzenie włókien amyloidowych przez ludzkie białko PrPC. Białko PrPC i peptyd NCAM1-Aβ same tworzą struktury amyloidowe, jednak ich wspólna inkubacja przez trzy dni skutkowała powstaniem wyłącznie niewielkich agregatów. Uzyskane wyniki sugerują bezpośrednie oddziaływanie peptydu NCAM1-Aβ z ludzkim białkiem prionowym, prawdopodobnie poprzez oddziaływania hydrofobowe, oraz inhibicję agregacji białka PrPC.Misfolding of the cellular prion protein (PrPC) is associated with the development of fatal neurodegenerative diseases known as Transmissible Spongiform Encephalopathies (TSEs), such as Creutzfeldt-Jakob disease in humans and the corresponding “mad cow” disease in cattle. The misfolding of PrPC is not unique process: under specific conditions all proteins can undergo structural transitions from a native soluble state into insoluble and fibrillar amyloid state. Such misfolding followed by aggregation of the proteins is connected with several different neurodegenerative diseases.
The 208-residue long human PrPC protein consists of two structurally distinct domains: an intrinsically disordered N-terminal domain (NTD), and a structured, mainly α-helical, C-terminal domain (CTD). The NTD contains the so-called octarepeat (OR) region, which is known to bind Cu(II) and Zn(II) ions by histidine residues. Many cofactors, including metal ions, seem to play an important role in PrPC misfolding. Here, I have used multiple complementary biophysical methods to investigate the structural effects of Cu(II) and Zn(II) binding to the human full-length PrPC protein, and to the isolated OR peptide.
Circular dichroism (CD) spectroscopy suggest that OR peptide binds up to four Cu(II) ions, and up to two Zn(II) ions. At sub-stoichiometric concentrations, both metal ions induce polyproline type II helix to β-turn transitions in the OR peptide secondary structure, whereas stoichiometric concentrations of the metal ions seem to induce formation of an antiparallel β-sheet secondary structure. Molecular dynamics (MD) simulations of the isolated OR peptide together with bound metal ions indicate formation of hairpin structures with antiparallel β-sheet properties. Direct addition of Zn(II) ions to the OR peptide results in binding of the amyloid-specific dyes such as Thioflavin T and Congo Red, indicating amyloid formation. After incubation of the OR peptide with Zn(II) ions, imaging with atomic force microscopy (AFM) and transmission electron microscopy (TEM) revealed the presence of fibrillar structures. X-ray diffraction (XRD) analysis identified the amyloid-specific cross-β structure. Hence, binding of Cu(II) and Zn(II) ions to the OR peptide may induce formation of fibrillar amyloid structures.
For the full-length human PrPC protein, binding of Zn(II) to the OR region results in an intra-domain interaction between the NTD and CTD. CD spectroscopy suggest loss of α-helical secondary structure upon Zn(II) binding, possibly at helices 2 and 3 from the CTD, together with formation of β-turn secondary structures, probably around the Zn(II) ion. Fluorescence and CD spectroscopy titrations suggest a low micromolar apparent dissociation constant for the PrPC·Zn(II) complex, which makes such interactions possible under physiological conditions. MD simulations of the PrPC·Zn(II) complex indicate stabilization of α-helix 3, while small angle X-ray scattering (SAXS) data suggest an overall more compact conformation of the Zn(II)-bound PrPC protein. As Zn(II) binding to PrPC favorites intra-domain interactions and stabilization of α-helix 3, Zn(II) might have an inhibitory effect on PrPC aggregation or fibrillation.
Furthermore, I have investigated a possible inhibitory effect of a bioengineered NCAM1-Amyloidβ (NCAM1-Aβ) peptide on PrPC aggregation and fibrillation. PrPC and NCAM1-Aβ peptide alone formed fibrillar structures. However when incubated together up to three days only small aggregate clumps were observed. The results suggest a direct interaction between the PrPC and NCAM1-Aβ molecules, resulting in inhibition of PrPC aggregation, probably involving hydrophobic forces.The work presented in this thesis was supported by the National Science Center under the project “Molecular basis of amyloidogenesis - structure and conformational dynamics of selected human PrPC prion protein complexes with metal cations (2014/15/B/ST4/04839)”, granted to Prof. dr hab. Maciej Kozak
Integration policies towards persons under international protection at the local level. Selected cases of European agglomerations
No full textCelem artykułu jest analiza polityk integracji osób objętych ochroną międzynarodową w wybranych aglomeracjach europejskich (takich jak między innymi Barcelona, Berlin, Glasgow czy Amsterdam). Szczególna uwaga została skierowana na wyzwania lokalne po 2015 roku i tzw. kryzysie migracyjnym. Większość dostępnych opracowań długo pomijało bowiem aspekty odpowiedzialności miast za zarządzanie długofalowymi procesami społeczno-demograficznymi, skupiając się głównie na polityce i rozwiązaniach unijnych czy ogólnokrajowych. Wyzwania związane z rynkiem pracy, aktywizacją zawodową osób zagrożonych wykluczeniem społecznym, edukacją, antydyskryminacją, partycypacją społeczną i polityczną mieszkańców czy polityką mieszkaniową dotyczą finalnie przyjmujących i przyjmowanych społeczności oraz osób decyzyjnych na poziomie lokalnym.The main aim of the article is to analyse integration policy towards persons under international protection in selected European agglomerations (such as Barcelona, Berlin, Glasgow, and Amsterdam). The main attention has been paid to local challenges after 2015 and the so called “migration crisis”. Most of the articles available have overlooked aspects of the cities’ responsibility for long-term socio-demographic processes. Researchers have focused mainly on EU and national policies and solutions. Challenges related to the labour market, professional integration of people at risk of social exclusion, education, anti-discrimination, social and political participation of residents, and housing policy apply to migrant and host communities, and decision-makers at the local level
Reflectance spectroscopy and machine learning as a tool for the categorization of twin species based on the example of the Diachrysia genus
No full textIn our work we used noninvasive point reflectance spectroscopy in the range from 400 to 2100 nm coupled with machine learning to study scales on the brown and golden iridescent areas on the dorsal side of the forewing of Diachrysia chrysitis and D. stenochrysis. We used our approach to distinguish between these species of moths. The basis for the study was a statistically significant collection of 95 specimens identified based on morphological feature and gathered during 23 years in Poland. The numerical part of an experiment included two independent discriminant analyses: stochastic and deterministic. The more sensitive stochastic approach achieved average compliance with the species identification made by entomologists at the level of 99–100%. It demonstrated high stability against the different configurations of training and validation sets, hence strong predictors of Diachrysia siblings distinctiveness. Both methods resulted in the same small set of relevant features, where minimal fully discriminating subsets of wavelengths were three for glass scales on the golden area and four for the brown. The differences between species in scales primarily concern their major components and ultrastructure. In melanin-absent glass scales, this is mainly chitin configuration, while in melanin-present brown scales, melanin reveals as an additional factor.273121058Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscop