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A paradoxical Shakespeare under the Second Empire? Examples in the operas of Hector Berlioz, Charles Gounod and Ambroise Thomas.
No full textSi le romantisme français a semblé découvrir les œuvres de Shakespeare et a contribué à leur divulgation, leur étude et leur diffusion jusque dans les années 1850, il est à noter que les livrets d’opéras sur le thème des œuvres de Shakespeare, tels que Béatrice et Bénédict (1862) d’Hector Berlioz (1803-1869), Roméo et Juliette (1867) de Charles Gounod (1818-1893) et Hamlet (1868) d’Ambroise Thomas (1811-1896), ont tous été écrits après cette période et ont rencontré un succès pendant le Second Empire. Certes, depuis le XVIIIe siècle, certains opéras français partageaient déjà des points communs avec les pièces de Shakespeare. Cependant, ces opéras comportaient plusieurs différences par rapport aux œuvres originales. En revanche, les opéras du Second Empire montrent davantage « d’authenticité » shakespearienne, rappelant aux spectateurs les pièces anglaises. Dans cette thèse, nous chercherons à comprendre le développement et l’apogée des reproductions des pièces de Shakespeare, tout en examinant les créations du XVIIIe siècle jusqu’au Second Empire à l’aune de celles du romantisme français (1820-1850). Tout d’abord, nous commençons à examiner chronologiquement les opéras qui ont été conçus sous l’inspiration des œuvres Roméo et Juliette et Hamlet du XVIIIe siècle au Second Empire. Puis nous confronterons l’influence des œuvres de Goethe dans les opéras français à celle de Shakespeare, tout en analysant les œuvres telles que La Damnation de Faust de Berlioz (1845-46), Faust de Gounod (1859, 1869) et Mignon de Thomas (1866). En effet, alors que les créateurs ont reproduit les œuvres allemandes, ils sont toujours influencés par les éléments shakespeariens et ont les mêlé avec ceux goethéens. Nous comprenons ainsi comment les pièces de Shakespeare ont régulièrement inspiré les opéras français. Nous examinerons alors d’autres opéras créés avec divers éléments shakespeariens, tels que Le Songe d'une nuit d'été de Thomas (1850), Les Troyens (1858-1859) et Béatrice et Bénédict (1862) de Berlioz, synthèses typiques du post-romantisme français qui nous permettrons de découvrir quel « Shakespeare » émergeait à l’époque de Berlioz, Gounod et Thomas.If the French Romanticism appeared Shakespeare’s works and contributed to their dissemination, studies and popularity until the 1850’s, it should be noted that the opera librettos on the themes of Shakespeare’s works, such as Béatrice et Bénédict (1862) composed by Hector Berlioz (1803-1869), Roméo et Juliette (1867) by Charles Gounod (1818-1893) et Hamlet (1868) by Ambroise Thomas (1811-1896), were all produced after this period and achieved success during the Second Empire. Certainly, since the 18th century, some French opera had already shared commonalities with Shakespeare’s plays, but these opera exhibited significant differences when compared to the original pieces. In contrast, operas during the Second Empire provided a more “authentic” Shakespearian experience, reminding the audience of English plays. In this thesis, we aim to understand the development and apogee of reproductions of Shakespeare’s works, while examining creations from the 18th century to the Second Empire in the light of French romantic productions (1820-1850). Firstly, we chronologically explore operas inspired by Roméo et Juliette and Hamlet from 18th century to the Second Empire. Subsequently, we compare the influence of Goethe’s works in French operas to that of Shakespeare, analyzing compositions such as La Damnation de Faust by Berlioz (1845-46), Faust by Gounod (1859, 1869) and Mignon by Thomas (1866). In essence, while creators reproduced the German works, they were consistently influenced by Shakespearian elements, blending them with Goethean ones. This helps us understand how Shakespeare’s pieces regularly inspired French operas. Following that, we examine other operas created with various Shakespearian elements, such as Le Songe d'une nuit d'été composed by Thomas (1850), Les Troyens (1858-1859) and Béatrice et Bénédict (1862) by Berlioz, typical synthesis of French post-Romanticism that enable us to discover what kind of “Shakespeare” emerged during the period of Berlioz, Gounod and Thomas
Experimental Developments for the Analysis and Optimization of Supercritical CO2 Assistance in Machining
No full textAvec l’apparition de matériaux de plus en plus difficiles à usiner et la volonté des réglementations REACH d’aller vers des solutions de lubrifications moins nocives pour l’environnement, cette étude s’est intéressée à l’usinage avec CO2 supercritique (scCO2).Le premier chapitre présente des essais d’usure en fraisage montrant des gains en durée de vie avec l’assistance scCO2, en comparaison à une lubrification avec émulsion conventionnelle. Ensuite dans le deuxième chapitre, divers lubrifiants (liquides ioniques, huiles végétales, eau, huiles minérales) ont été combinés avec le scCO2, afin d’évaluer par des essais tribologiques, le potentiel de nouveaux mélanges à base de scCO2. Les plus grandes réductions de coefficients de frottement ont été observées pour les mélanges scCO2 + liquides ioniques.Dans le troisième chapitre, pour comprendre le refroidissement avec le scCO2, une méthode optique nommée « Background Oriented Schlieren (BOS) », a été utilisée pour obtenir les cartographies de températures dans le jet. Cette étude a permis d’évaluer l’influence des paramètres physiques du fluide en amont, sur le refroidissement en sortie de buse. L’ensemble des essais réalisés a contribué à la construction d’un modèle empirique permettant de prédire la température le long de l’axe du jet en fonction du diamètre de la buse, de la pression et de la température du fluide en amont.Enfin, le dernier chapitre de la thèse présente un banc d’essai conçu pour étudier les coefficients d’échanges thermiques entre le jet et un solide. Ce banc est destiné à analyser l’influence des géométries de buse, de la distance jet-solide, et de l’orientation du jet par rapport au solide, sur l’efficacité du refroidissement.Toutes ces études ont pour but de poser les bases nécessaires pour une compréhension approfondie, en vue d’une utilisation optimisée de l’assistance scCO2 en usinage.With the advent of increasingly difficult-to-machine materials and the requirements of REACH regulations to move toward more environmentally friendly lubrication solutions, this study focused on machining with supercritical CO₂ (scCO₂).The first chapter presents wear tests in milling, showing tool life improvements with scCO₂ assistance compared to emulsion-based cooling. In the second chapter, various lubricants (ionic liquids, vegetable oils, water, mineral oils) were combined with scCO₂ to evaluate, through tribological tests, the potential of new scCO₂-based mixtures. The greatest reductions in friction coefficients were observed for scCO₂ + ionic liquid mixtures.In the third chapter, to understand scCO₂ cooling, an optical method called Background Oriented Schlieren (BOS) was used to obtain temperature maps in the jet. This study evaluated the influence of upstream fluid parameters on cooling efficiency at the nozzle outlet. The experimental results contributed to developing an empirical model to predict centerline temperature, based on nozzle diameter, upstream pressure, and fluid temperature.Finally, the last chapter of the thesis presents a test rig designed to study heat transfer coefficients between the jet and a solid. This rig is intended to analyze the influence of nozzle geometry, jet-to-solid distance, and jet orientation relative to the solid on cooling efficiency.All these studies contribute to a better understanding, for an optimized use of the scCO₂ assistance in machining
Biosourced thermal insulation, from formulation to demonstrator : hygrothermal performance, fire-retardant behaviour and fungal resistance
No full textL’objectif des travaux est de développer un isolant biosourcé à base de fibres de chanvre. Différentes matières fibreuses et procédés d’affinage sont étudiés. Le lien entre les paramètres morphologiques, la masse volumique et la conductivité thermique apparente de l’isolant fibreux est mis en évidence. L’étude conduit à l’identification d’un produit dont les propriétés constituent un compromis technique. La réaction au feu et la résistance fongique sont abordées en veillant à limiter les impacts sanitaires et environnementaux des traitements. Une méthode d’évaluation du risque de développement fongique est proposée. Après son développement, l’isolant est appliqué en rénovation dans le comble d'une maison habitée. Ce démonstrateur est suivi pendant 18 mois (6 mois avant et 12 après rénovation). La température, l'humidité relative et le flux de chaleur sont enregistrés afin d’évaluer in situ le comportement hygrothermique de l’isolant. Cette étude expérimentale est complétée par une étude numérique sous WUFI®. Afin d’évaluer le risque de développement fongique les conditions extrêmes mesurées in-situ sont reproduites en laboratoire avec inoculation. Une isoplèthe de la fibre de chanvre non traitée est ainsi construite. L’étude multi échelle montre que l’isolation développée est performante. Le confort d’été et la capacité de régulation de l’hygrométrie sont notables. Les conditions d’exploitation de l’isolant ne conduisent pas à un risque de développement fongique.The aim of the work is to develop a biobased insulation made of hemp fibres. Various fibrous materials and refining processes are being studied. The link between the morphological parameters, density and apparent thermal conductivity of the fibrous insulation is highlighted. The study led to the identification of a product whose properties represent a technical compromise. Reaction to fire and fungal resistance are addressed, to limit the health and environmental impact of the treatments. A method for assessing the risk of fungal growth is proposed. Once developed, the insulation is applied in the attic of an inhabited house. This demonstrator is monitored for 18 months (6 months before and 12 months after renovation). Temperature, relative humidity and heat flow are recorded to assess the hygrothermal behaviour of the insulation in situ. This experimental study was supplemented by a numerical study using WUFI®. To assess the risk of fungal growth, the extreme conditions measured in situ were reproduced in the laboratory with inoculation. An isopleth of untreated hemp fibre was then constructed. The multi-scale study shows that the developed insulation product performs well. Summer comfort and the ability to regulate hygrometry were significant. The conditions under which the insulation is used do not pose a risk of fungal growth
Towards example based neural machine translation
No full textLes méthodes de traduction neuronale s'appuient sur l'apprentissage et l'exploitation de très gros modèles probabilistes paramétriques, nourris par des corpus parallèles collectés de manière opportuniste, et rassemblant des textes souvent très divers. Une approche alternative de la traduction à base de corpus s'appuie sur des méthodes non-paramétriques et exploite de petits corpus très spécialisés et bien adaptés à une tâche donnée. Si les méthodes neuronales constituent aujourd'hui l'état de l'art, des travaux récents ouvrent la voie pour développer des méthodes hybrides, exploitant des mémoires de traduction, et qui permettraient en particulier d'apporter des réponses opérationnelles aux problème de traçabilité des modèles probabilistes. L'objectif de cette thèse est d'étudier et d'évaluer ces modèles hybrides pour traduire des textes en domaine de spécialité.Neural translation methods are based on the learning and exploitation of very large parametric probabilistic models, fed by parallel corpora that are often collected in an opportunistic matter, and which gather very diverse texts. An alternative approach to corpus-based machine translation relies on non-parametric methods and exploits small, highly specialised corpora that are well adapted for a given task. While neural methods currently constitute the state of the art, recent work is paving the way for the development of hybrid methods, exploiting translation memories, and which would in particular provide operational answers to the problem of traceablity of probabilistic models. The objective of this thesis is to study and evaluate these hybrid models for translating texts in specialised domains
Mechanisms and treatment of ischemia-reperfusion injury of the renal graft
No full textCette thèse explore les mécanismes cellulaires et moléculaires liés aux lésions et à la réparation des greffons rénaux dans le contexte de la transplantation, avec un accent particulier sur l'ischémie-reperfusion et les processus prolifératifs. Les lésions d'IR, inévitables lors de la transplantation, déclenchent une cascade complexe d'événements, incluant le stress oxydatif, l'inflammation et des altérations mitochondriales, compromettant la qualité du greffon. Nos travaux ont démontré que si la prolifération cellulaire est essentielle pour réparer les lésions tubulaires, ses dérèglements peuvent est responsable d'une déplétion énergétique et d'une période de fragilisation de l'organe. Dans une approche complémentaire, nous avons étudié le rôle de NUPR1, un facteur clé dans l'adaptation cellulaire au stress. Nos résultats ont montré que NUPR1 protège les cellules rénales de l'apoptose et limite les perturbations énergétiques, tout améliorant la fonction des greffons une fois induit par une période de circulation réoxygénée. Ces observations, validées sur des modèles murins et porcins, soulignent son potentiel thérapeutique pour améliorer la viabilité des greffons, notamment dans les situations de double agression rénale ou d'exposition à des donneurs dits "limites". En mettant en lumière des cibles moléculaires spécifiques et en évaluant des stratégies innovantes comme la circulation régionale normothermique, ce travail propose des pistes concrètes pour optimiser les protocoles de transplantation. Ces avancées ouvrent des perspectives prometteuses pour réduire la pénurie d'organes et améliorer la survie des patients transplantés.This thesis explores the cellular and molecular mechanisms involved in graft injury and repair in the context of kidney transplantation, with a particular focus on ischemia-reperfusion (IR) and proliferative processes. IR injuries, which are inevitable during transplantation, trigger a complex cascade of events, including oxidative stress, inflammation, and mitochondrial alterations, ultimately compromising graft quality. Our findings demonstrate that while cellular proliferation is essential for repairing tubular damage, its dysregulation can lead to energy depletion and a period of organ vulnerability. In a complementary approach, we investigated the role of NUPR1, a key factor in cellular stress adaptation. Our results revealed that NUPR1 protects renal cells from apoptosis, mitigates energy disturbances, and enhances graft function when induced by a period of reoxygenated circulation. These observations, validated using murine and porcine models, highlight its therapeutic potential to improve graft viability, particularly in cases of double renal insult or exposure to "marginal" donors. By identifying specific molecular targets and evaluating innovative strategies such as normothermic regional perfusion, this work proposes concrete pathways to optimize transplantation protocols. These advancements open promising perspectives for alleviating organ shortages and improving the survival of transplant recipients
Study of pathogenesis of polymyalgia rheumatica and giant cell arteritis
No full textLa pseudo polyarthrite rhizomélique (PPR) et l’artérite à cellules géantes (ACG) sont deux pathologies fréquemment associées se caractérisant respectivement par des douleurs inflammatoires des ceintures scapulaire et pelvienne et une vascularite des gros vaisseaux, chez des patients > 50 ans. Au cours de l’ACG, il est admis que l’infiltration inflammatoire de la paroi artérielle est initiée par la maturation des cellules dendritiques résidentes de la paroi artérielle. Certains auteurs ont rapporté la présence de cellules dendritiques matures au cours de la PPR posant la question d’un continuum physiopathologique entre ces deux conditions. L’objectif de ce travail a été d’étudier les liens physiopathologiques entre PPR et ACG. Un premier axe de ce travail a confirmé la présence de cellules dendritiques (DCs) matures au sein de la paroi artérielle au cours de l’ACG. Cependant, ces cellules dendritiques exprimaient un phénotype de DCs dérivées de monocytes (CD209+CD83+CCR7+) les distinguant des DCs résidentes d’origine myéloïde. Cette différenciation pourrait être médiée par le GM-CSF et l’IFN-γ, 2 cytokines impliquées dans la physiopathologie de l’ACG. A l’inverse, l’étude des artères issues de patients PPR a montré un profil identique aux artères issues de patients témoins, sans identification de DCs matures au sein du mur artériel. Un deuxième axe a permis d’identifier des biomarqueurs sériques reflétant le remodelage vasculaire. Les ratios des taux sériques de MMP-3/CD141 et d’IL-6/CXCL9 ont montré de bonnes performances diagnostiques à l’échelle individuelle et ont permis de discriminer les patients atteints de PPR isolées versus les patients atteints d’ACG. La différence majeure entre PPR et ACG étant le site de l’inflammation (l’artère pour l’ACG, le tissu synovial pour la PPR), un troisième axe s’est intéressé au rôle du tissu synovial au cours de la PPR et de l’influence des cytokines IL-17 et IFN-γ sur son activation. L’IL-17A et l’IFN-γ sont capables d’activer les fibroblastes synoviaux qui produisent alors de fortes quantités d’IL-6, de CCL2 et de GM-CSF. L’étude de la polarisation de la réponse lymphocytaire par les fibroblastes synoviaux est en cours.Ces travaux montrent que la PPR et l’ACG, malgré certaines similitudes, présentent des différences permettant de les distinguer. La source tissulaire des médiateurs inflammatoires pourrait être différente, représentée par l’artère au cours de l’ACG et par le tissu synovial au cours de la PPR.Polymyalgia rheumatica (PMR) and giant cell arteritis (GCA) are two frequently overlapped diseases characterized respectively by inflammatory pain of the scapular and pelvic girdles and vasculitis of the large vessels, in patients > 50 years. In GCA, the maturation of resident dendritic cells (DCs) of the arterial wall is considered as the first step to arteries inflammation. Some authors have reported the presence of mature DCs during PMR, raising the question of a pathophysiological continuum between these two conditions. The aim of this study was to investigate the pathophysiological links between PMR and GCA. The first part of this work confirmed the presence of mature DCs in the arterial wall during GCA. However, these DCs expressed a monocyte derived DCs phenotype (CD209+CD83+CCR7+) distinguishing them from resident DCs of myeloid origin. This differentiation could be mediated by the in situ production of GM-CSF and IFN-γ, two cytokines strongly involved in the pathogenesis of GCA. Conversely, the study of PMR arteries revealed a similar profile to arteries from control patients, with no identification of mature DCs within the arterial wall. The second part of this work studied serum biomarkers reflecting vascular remodeling in isolated PMR and PMR/GCA overlap patients. Ratios of serum MMP-3/CD141 and IL-6/CXCL9 levels had good diagnostic accuracy and were able to discriminate between patients with isolated PMR and those with GCA. The main difference between PMR and GCA is the site of inflammation (the artery for GCA, the synovial tissue for PMR), the third part of this work examined the role of synovial tissue during PMR and the influence of the cytokines IL-17A and IFN-γ on synovial fibroblast activation. IL-17A and IFN-γ are able to activate synovial fibroblasts, which then produce large amount of IL-6, CCL2 and GM-CSF. The polarization of T cells co-cultured with synovial fibroblasts is currently being studied.This works demonstrated that PMR and GCA share some similarities but that the origin of pro-inflammatory mediators could be fundamentally different, represented by the artery during GCA and by synovial tissue during PMR
Contribution to the consideration of ecosystem services in the integrated assessment of nature-based solutions in urban environments
No full textL'urgence de la lutte contre le changement climatique et l'effondrement de la biodiversité ne sont plus à démontrer. Les solutions fondées sur la nature (SFN) et les services écosystémiques qu'elles fournissent sont identifiés comme des leviers d'action importants dans cette lutte conjointe. Les conditions de vie urbaines, concernant la majorité de l'humanité, accroissent cet enjeu. Dans ce contexte, l'évaluation des impacts des SFN est capitale. Cependant, il manque encore d'une méthode d'évaluation considérant à la fois les impacts positifs des SFN (services rendus) et les impacts négatifs (coûts environnementaux de la mise en place des SFN). Pour répondre à ce manque, le CSTB développe depuis plusieurs années une méthode d'évaluation intégrée, la méthode HIBOU 2030, basée sur l'analyse de cycle de vie (ACV) et visant une évaluation objective des SFN et des services écosystémiques qu'elles fournissent. La thèse se place dans le cadre de la méthode HIBOU 2030 et a ainsi pour objectif de contribuer au développement de cette méthode intégrée d'évaluation des SFN, en se concentrant sur les modèles pour caractériser les services écosystémiques de gestion des eaux pluviales (GEP) et d'accueil de la biodiversité, à l'échelle d'un projet d'aménagement, et en s'appuyant sur l'ACV pour l'évaluation des coûts environnementaux des SFN. Trois SFN sont prises en compte : les toitures végétalisées, les arbres urbains et les sols drainants végétalisés. Les apports principaux de la thèse sont : - Le développement d'un modèle pour la réalisation d'un bilan hydrique intégré à l'échelle du projet incluant différentes typologies de surfaces dont les trois SFN et permettant le calcul de différents indicateurs de GEP (ex : ruissellement, rétention, etc.) ; - Le développement d'un modèle pour le service d'accueil de la biodiversité permettant le calcul d'un indicateur de diversité fonctionnelle, le FAD (Functional Attribute Diversity), dans le contexte urbain ; - La construction de fiches d'impacts ACV pour les arbres urbains et les sols drainants végétalisés. Ces développements méthodologiques ont d'abord été appliqués aux différents types de surfaces (ex : toitures végétalisées, sols drainants végétalisés, arbres en fosses ou en bacs, surfaces perméables avec sol nu, végétation basse ou arbres, surfaces imperméables avec ou sans arbres, etc.) puis sur cinq scénarios d'un cas d'étude (ensemble formé par le site Bienvenue et l'ENPC, à Champs-sur-Marne, Île-de-France). Les résultats du cas d'étude montrent l'importance cruciale d'une approche multicritère et intégrée, permettant d'aborder les différents aspects évalués (ACV, GEP et biodiversité), pour permettre une prise de décisions efficace. Le scénario le plus avantageux variant grandement en fonction de l'objectif recherché. Le travail effectué est ensuite discuté et les principales perspectives sont identifiées : amélioration des modèles, de leur validation et des bases de données utilisées, opérationnalisation et automatisation de la méthode et prise en compte des interactions entre les différents aspects considérés (ex : GEP et biodiversité).The urgency of the fight against climate change and the collapse of biodiversity no longer needs to be demonstrated. Nature-based solutions (NBS) and the ecosystem services they provide have been identified as important levers of action in this joint struggle. Urban living conditions, which affect the majority of humankind, increase this challenge. In this context, assessing the impacts of NBS is vital. However, we still lack an evaluation method that considers both the positive impacts of NBS (provided services) and the negative impacts (environmental costs of NBS implementation). To fill this gap, the CSTB has been developing an integrated assessment method for several years, the HIBOU 2030 method, based on life cycle assessment (LCA) and aimed at an objective evaluation of NBS and the ecosystem services they provide. This thesis is part of the HIBOU 2030 method and aims to contribute to the development of this integrated method for evaluating NBS, focusing on models for characterizing the ecosystem services of stormwater management and biodiversity support, at the development scale of a project, and using LCA to assess the environmental costs of NBS. Three NBS are considered: green roofs, urban trees and vegetated permeable pavements. The main contributions of the thesis are: - The development of an integrated water balance model at the project scale that considers different surface typologies, including the three NBS, and that enables the calculation of different stormwater management indicators (e.g. runoff, retention, etc.); - The development of a model for the biodiversity support service, that enables the calculation of a functional diversity indicator, the FAD (Functional Attribute Diversity), in an urban context; - The construction of LCA impact sheets for urban trees and vegetated permeable pavements. These methodological developments were first applied to different types of surfaces (e.g. green roofs, vegetated permeable pavements, trees in pits or boxes, permeable surfaces with bare soil, short vegetation or trees, impermeable surfaces with or without trees, etc.) and then to five scenarios of a case study (the ensemble formed by the Bienvenue site and the ENPC, in Champs-sur-Marne, in the French Île-de-France region). The results of the case study demonstrate the crucial importance of a multi-criteria, integrated approach, addressing the various aspects assessed (LCA, stormwater management and biodiversity support), to enable effective decision-making. The most advantageous scenario varies greatly according to the objective sought. The work carried out is then discussed, and the main prospects are identified: improvement of the models, their validation and the databases used, operationalization and automation of the method, and consideration of the interactions between the different aspects considered (e.g. stormwater management and biodiversity support)
a disease of misfortunes : High blood pressure in Gabon
No full textDans les années 1970, lorsque l’hypertension artérielle commençait à être traitée au Gabon, celle-ci avait été construite par l’expertise médicale gabonaise comme une maladie des personnes adoptant un mode de vie occidental. Sous-entendu que l’hypertension artérielle est une maladie des Blancs et des personnes qui vivent en ville. Cette construction médicale, produite notamment par le cardiologue André Pierre Kombila Koumba en 1978, fut scientifiquement erronée. Dans la mesure où une crise d’AVC aiguë apparait lorsque les pressions systoliques et diastoliques des souffrants dépassent respectivement les seuils de 18/15 millimètre de mercure (mmHg). De ce fait, l’AVC et bien d’autres maladies chroniques faisant augmenter la pression artérielle étaient déjà présentent dans les milieux ruraux. Par exemple, l’ethnie ipunu la nomme ibate ditengu, signifiant la gifle du fantôme, à cause des handicaps qu’elle produit soudainement sur les corps : perte de l’usage de la voix; paralysie d’une partie du corps, etc. Par contre, cette construction médicale définissant l’hypertension artérielle comme une maladie des Blancs avait pour fonction sociale de protéger la santé des citadins, sollicitant fréquemment le service de cardiologie. Toutefois, ce trouble évoluait dans d’autres espaces de vie excepté la ville. De nos jours, c’est un problème de santé publique traité dans les hôpitaux sans avoir fait l’objet d’une enquête épidémiologique à l’échelle nationale, afin de dresser le profil social d’un hypertendu gabonais. Aussi, cette maladie est perçue par les malades comme le résultat des malchances, des blocages et des malédictions lignagères qu’ils connaissent dans le cours de leur vie. Le croisement entre cette construction médicale injuste, servant de point d’appui à sa prise en charge par l’expertise médicale et les explications données par les malades, s’appuyant sur les conditions générales de vie précaires, malheureuses et donc lamentables, fait apparaitre ce trouble comme une maladie d’infortunes. Ces infortunes conduisent les malades à trouver des réponses thérapeutiques vers des filières de soins hors secteur biomédical : églises et médecine traditionnelle. Si l’effet thérapeutique de ces filières demeure relatif, l’analyse a permis d’identifier des pratiques corporelles dont l’efficacité, dans le traitement de l’hypertension artérielle, a été attestée avec des méthodes scientifiques. Compte tenu du contexte, l'émergence d'une politique de santé publique, intégrant l'usage des médicaments faits à base des plantes médicinales via ces méthodes scientifiques, est nécessaire.Mots clés : hypertension artérielle, malchance, blocage, malédiction lignagère, infortunes, précarité, cadre de la relation médicale.In the 1970s, when high blood pressure began to be treated with Gabon, this had been constructed by Gabonese medical expertise as a disease of people adopting a Western lifestyle. Implied that high blood pressure is a disease of white people and people who live in cities. This medical construction, produced in particular by the cardiologist André Pierre Kombila Koumba in 1978, was scientifically erroneous. To the extent that an acute stroke attack appears when the systolic and diastolic pressures of the sufferers respectively exceed the thresholds of 18/15 millimeters of mercury (mmHg). As a result, stroke and many other chronic diseases that increase blood pressure were already present in rural areas. For example, the Ipunu ethnic group calls it ibate ditengu, meaning the slap of the ghost, because of the disabilities it suddenly produces on the body: loss of the use of voice; paralysis of a part of the body, etc. On the other hand, this medical construction defining high blood pressure as a disease of white people had the social function of protecting the health of city dwellers, frequently requesting the cardiology department. However, this disorder evolved in other living spaces except the city. Nowadays, it is a public health problem treated in hospitals without having been the subject of a large-scale epidemiological investigation in order to establish the social profile of a Gabonese hypertensive person. Also, this disease is perceived by patients as the result of bad luck, blockages and lineage curses that they experience during their lives. The intersection between this unjust medical construction, serving as a point of support for its treatment by medical expertise and the explanations given by patients, based on the precarious, unhappy and therefore lamentable general living conditions, reveals this disorder as a disease of misfortunes. These misfortunes lead patients to find therapeutic responses in care sectors outside the biomedical sector: churches and traditional medicine. If the therapeutic effect of these sectors remains relative, the analysis made it possible to identify bodily practices whose effectiveness, in the treatment of arterial hypertension, has been attested using scientific methods. Given the context, the emergence of a public health policy, integrating the use of medicines made from medicinal plants via these scientific methods, is necessary.Keywords : high blood pressure, bad luck, blockage, lineage curse, misfortunes, precariousness, male absence, female single parenthood, framework of the medical relationship
Methods for comparative analysis of prokaryotic pangenomes : exploring interspecies genomic diversity for a better understanding of metabolism
No full textL'essor des projets de séquençage a généré plus d'un million de génomes procaryotes dans les bases publiques, nécessitant de nouvelles approches pour analyser cette masse de données. La suite logicielle PPanGGOLiN a été développée pour structurer ces informations sous forme de graphes de pangénome, permettant de compresser les données tout en conservant l'information de colocalisation des gènes. Elle intègre également des méthodes d'analyse de pangénome, panRGP, qui identifie les régions de plasticité génomique, et panModule, qui caractérise ces régions variables en sous-modules fonctionnels. Malgré ces avancées, aucune méthode ne permettait de comparer des pangénomes. Les travaux de cette thèse ont consisté à développer de nouvelles approches pour combler cette lacune. Tout d'abord, PPanGGOLiN a été enrichie par l'intégration de nouvelles méthodes, comme la recherche de contextes génomiques, et par une amélioration de son environnement logiciel. Ensuite, la méthode PANORAMA, qui se base sur les graphes de PPanGGOLiN, a été conçue pour annoter des systèmes macromoléculaires, en combinant des critères de présence/absence de fonctions et de colocalisation génomique, et pour comparer des pangénomes. Appliqué aux systèmes de défense bactériens contre les phages, PANORAMA a permis d'identifier des systèmes et des sites d'insertions conservés entre différentes espèces. Finalement, un premier prototype de base de données orientée graphe a été développé pour intégrer les données de plusieurs pangénomes afin d'exploiter au mieux leur information. Cette approche a permis d'analyser et de comparer des milliers de génomes bactériens et d'identifier des modules d'antibiorésistance communs à plusieurs espèces, mettant en lumière des mécanismes évolutifs partagés. Ces travaux ouvrent la voie à la pangénomique comparée, offrant un cadre inédit pour explorer le potentiel adaptatif des procaryotes et mieux comprendre leur dynamique évolutive. En facilitant la comparaison des pangénomes et l'identification de contextes génomiques conservés, ces développements contribuent à l'étude des interactions entre bactéries et à la caractérisation de systèmes biologiques d'intérêt.The boom in sequencing projects has generated over a million prokaryotic genomes in public databases, requiring new approaches to analyze this mass of data. The PPanGGOLiN software suite has been developed to structure this information in the form of pangenome graphs, enabling data compression while preserving gene colocalization information. It also integrates pangenome analysis methods : panRGP, which identifies regions of genomic plasticity, and panModule, which characterizes these variable regions into functional submodules. Despite these advances, there was no method for comparing pangenomes. The aim of this thesis was to develop new approaches to fill this gap. Firstly, PPanGGOLiN was enriched by integrating new methods, such as genomic context search, and by improving its software environment. Secondly, the PANORAMA method, based on PPanGGOLiN graphs, has been designed to annotate macromolecular systems, combining criteria of presence/absence of functions and genomic colocalization, and to compare pangenomes. Applied to bacterial phage defense systems, PANORAMA identified systems and insertion sites conserved between different species. Finally, a first prototype of a graph-oriented database was developed to integrate data from several pangenomes in order to make the most of their information. This approach has made it possible to analyze and compare thousands of bacterial genomes, and to dentify antibiotic resistance modules common to several species, highlighting shared evolutionary mechanisms. This work paves the way for comparative pangenomics, offering a novel framework for exploring the adaptive potential of prokaryotes and better understanding their evolutionary dynamics. By facilitating the comparison of pangenomes and the identification of conserved genomic contexts, these developments contribute to the study of interactions between bacteria and the characterization of biological systems of interest
Le rôle du complexe GATOR1 dans la fonction mitochondriale et le contrôle de qualité
No full textLa voie mTORC1 joue un rôle clé dans l'homéostasie cellulaire en intégrant des signaux provenant de diverses stimuli intracellulaires et extracellulaires. Parmi ses nombreuses fonctions, la régulation de l'homéostasie mitochondriale est l'une des plus complexes. mTORC1 est essentiel pour la biogenèse mitochondriale, la phosphorylation des protéines mitochondriales et la régulation de la mitophagie. La régulation de mTORC1 elle-même constitue un processus hautement complexe, influencé par de multiples modulateurs en amont et effecteurs en aval. Le complexe GATOR1, composé de NPRL2, NPRL3 et DEPDC5, agit comme un régulateur négatif clé en amont de mTORC1 en réponse à la disponibilité en acides aminés. Chez la levure, la suppression des homologues de GATOR1 altère le métabolisme oxydatif et la mitophagie. La conservation de ces fonctions chez les mammifères restait inconnue.Nous démontrons ici que les cellules HEK293 et BEAS-2B déficientes en GATOR1 présentent de multiples anomalies mitochondriales, notamment une réduction du potentiel membranaire mitochondrial, une morphologie mitochondriale altérée, une dysfonction de la chaîne respiratoire, une diminution de la production d'ATP, ainsi que des niveaux anormaux d'enzymes du cycle de Krebs. Ces défauts mitochondriaux provoquent une mitophagie basale accrue et compromettent la dégradation mitochondriale lors de l'induction de mitophagie par des agents dommageables pour les mitochondries. Ces résultats révèlent un nouveau rôle du complexe GATOR1.En résumé, notre étude met en lumière une fonction inédite du complexe GATOR1 en démontrant son implication dans la coordination de la fonction mitochondriale et de la mitophagie, potentiellement via des mécanismes distincts de son rôle canonique dans la régulation de mTORC1.The mTORC1 pathway plays a key role in cellular homeostasis by integrating signals from a variety of intracellular and extracellular cues. Among its many functions, one of the most complex is the regulation of mitochondrial homeostasis. mTORC1 is essential for mitochondrial biogenesis, phosphorylation of mitochondrial proteins, and the regulation of mitophagy. The regulation of mTORC1 itself is a highly complex process, influenced by multiple upstream modulators and downstream effectors. The GATOR1 complex, composed of NPRL2, NPRL3, and DEPDC5 serves as a key upstream negative regulator of mTORC1 in response to amino acid availability. In yeast, deletion of the GATOR1 homologues, impairs oxidative metabolism and mitophagy. Whether these functions are conserved in mammals remained unknown.Here, we demonstrate that GATOR1-deficient HEK293T and BEAS-2B cells exhibited multiple mitochondrial abnormalities, including reduced mitochondrial membrane potential, altered mitochondrial morphology, respiratory chain dysfunction, reduced ATP production, accompanied by abnormal TCA cycle enzyme levels. These mitochondrial defects trigger elevated basal mitophagy and impair mitochondrial degradation upon mitophagy induction by mitochondria-damaging drugs. These findings uncover a novel role of the GATOR1. In summary, our study reveals a novel role of the GATOR1 complex provides new findings demonstrating that GATOR1 complex in coordinating mitochondrial function and mitophagy, possibly through mechanisms distinct from its canonical role in mTORC1 regulation