CorpusUL Université Laval
Not a member yet
24527 research outputs found
Sort by
Étude des propriétés structurales des nouveaux gènes et leurs effets sur la valeur adaptative de la levure
No full textPendant plusieurs décennies, la communauté scientifique a supposé que pratiquement tous les gènes émergeaient par la duplication et la divergence de gènes préexistants. Récemment, les scientifiques ont découvert un nouveau mécanisme d'émergence des gènes, l'évolution de novo. Les gènes de novo émergent de séquences non codantes du génome et pourraient ainsi acquérir de nouvelles fonctions, à condition que leurs effets initiaux sur la valeur adaptative ne soient pas délétères. L'objectif de cette étude est d'identifier les propriétés structurales des gènes de novo qui ont un impact sur leur émergence. Nous nous intéressons aux très jeunes gènes de novo apparus au cours des 200 000 dernières années en utilisant des levures bourgeonnantes sauvages comme espèces modèles. Pour évaluer l'impact des gènes de novo sur la valeur adaptative, nous avons effectué un test de compétition de masse et une analyse de croissance différentielle avec des souches exprimant artificiellement 396 gènes de novo insérés sur un plasmide dans la levure bourgeonnante. Nous avons également analysé les propriétés structurales de ces séquences. Nous avons constaté que les gènes plus longs ont plus d'impact sur le taux de croissance. Nous avons également observé que les gènes de novo ayant un effet délétère ont tendance à être moins intrinsèquement désordonnés et ont un plus grand potentiel de formation d'agrégats. Enfin, nous avons découvert que les gènes de novo ayant un effet positif sur la valeur adaptative ont une propension plus élevée pour les domaines transmembranaires. Nous concluons qu'il existe une variation substantielle dans les propriétés structurelles des protéines codées par les gènes de novo et, par leur effet sur la valeur adaptative, ces propriétés pourraient déterminer quels gènes sont les plus susceptibles d'être maintenus sur une longue période et ainsi contribuer à la diversité du protéome.For several decades, the scientific community assumed that virtually all genes emerged through the duplication and divergence of pre-existing genes. Recently, scientists have discovered a new mechanism of gene emergence, de novo evolution. De novo genes emerge from non-coding sequences of the genome and could thus acquire novel functions, provided their initial effects on fitness are not deleterious. The objective of this study is to identify structural properties of de novo genes that have an impact on their emergence. We are interested in very young de novo genes that appeared in the last 200 thousand years using wild budding yeasts as model species. To assess the impact of de novo genes on fitness, we performed a bulk competition assay and differential growth analysis with strains overexpressing 396 de novo genes inserted on a plasmid in budding yeast. We also analyzed the structural properties of these sequences. We found that longer genes have more impact on fitness. We also observed that de novo genes with a deleterious effect tend to be less intrinsically disordered and are predicted to have a greater potential to form aggregates. Finally, we discovered that de novo genes with a positive effect on fitness have a higher propensity for transmembrane domains. We conclude that there is substantial variation in the structural properties of the proteins encoded by de novo genes and, through their effect on fitness, these properties could determine which genes are more likely to be maintained and thus contribute to proteome diversity
Prévalence et facteurs associés aux infections sexuellement transmissibles chez les hommes ayant des relations sexuelles avec d'autres hommes initiant la prophylaxie préexposition contre le virus de l'immunodéficience humaine au Bénin
No full textLes hommes ayant des relations sexuelles avec d'autres hommes (HARSAH) ont un risque accru d'infections sexuellement transmissibles (IST). Les données sur les IST chez les HARSAH sont rares au Bénin. Cette étude visait à évaluer la prévalence et les facteurs associés à Neisseria gonorrhoeae (NG), Chlamydia trachomatis (CT) et Treponema pallidum (TP) chez 204 HARSAH VIH-négatifs de Cotonou au Bénin initiant la prophylaxie préexposition en prévention du VIH. Un questionnaire a été complété et un médecin a réalisé un examen physique des participants. Des échantillons de sang, anaux, pharyngés et urinaires ont été prélevés. Les prévalences des IST ont été présentées avec un intervalle de confiance à 95% et la régression de Poisson a permis d'identifier leurs déterminants. La prévalence était de 18,6%, 15,2%, 9,8% et 27,9% pour CT, NG tous sites confondus, NG anorectal et l'infection par NG ou CT (NG/CT) respectivement. Les IST étaient généralement asymptomatiques (84,2% pour NG/CT) et de localisation extra-génitale (61,4% pour NG/CT). Un seul cas de syphilis non confirmée a été observé. En analyse multivariée, le fait d'avoir moins de 25 ans, de ne pas être célibataire et d'avoir plus de quatre partenaires féminines étaient associés à CT et NG/CT alors qu'un faible revenu mensuel était associé à NG/CT seulement. Le jeune âge, le sexe anal réceptif et ne pas avoir de rapports sexuels payants étaient associés à NG. Seul, le sexe anal réceptif était associé à NG anorectal. Les infections à NG et à CT sont fréquentes chez les HARSAH VIH-négatifs de Cotonou au Bénin. Leur caractère asymptomatique et extra-génital rend la prise en charge syndromique inefficace et le dépistage aux sites anal et pharyngé nécessaire. La syphilis est rare chez ces HARSAH. Les interventions de contrôle et de prévention des IST devraient cibler particulièrement les jeunes HARSAH et leurs partenaires sexuelles féminines.Men who have sex with men (MSM) are at increased risk of sexually transmitted infections (STIs). Data on STIs among MSM are scarce in Benin. This study aimed to assess the prevalence and factors associated with Neisseria gonorrhoeae (NG), Chlamydia trachomatis (CT) and Treponema pallidum (TP) among 204 HIV-negative MSM in Cotonou, Benin initiating pre-exposure prophylaxis (PrEP) for HIV prevention. A questionnaire was completed, and participants underwent a physical examination by a physician. Blood, anal, pharyngeal, and urinary samples were collected. Prevalences are presented with a 95% confidence interval. Poisson regression was used to determine factors associated with STIs. The prevalence was 18.6%, 15.2%, 9.8% and 27.9% for CT, NG-all sites, anorectal NG, and infection by either NG or CT (NG/CT) respectively. STIs were generally asymptomatic (84.2% for NG/CT) and of extra-genital location (61.4% for NG/CT). Only one case of unconfirmed syphilis was observed. In multivariate analysis, younger age, not being single, having more than four female sexual partners were associated with CT and NG/CT while lower monthly income was associated with NG/CT alone. Younger age, receptive anal sex and paid sex were associated with NG. Only receptive anal sex was associated with anorectal NG. NG and CT infections are common among HIV-negative MSM in Cotonou, Benin. Their asymptomatic and extra-genital nature makes syndromic management ineffective and screening at anal and pharyngeal sites necessary. Syphilis is rare among these MSM. STI control and prevention interventions should target young MSM and their female sexual partners
Repenser l'engagement romanesque de Gabrielle Roy : entre subjectivité et nuance
No full textL'engagement de Gabrielle Roy n'ayant pas toujours été considéré comme allant de soi, ce mémoire se veut en quelque sorte une mise au point sur la question. En suivant la progression de deux tendances significatives qui traversent l'œuvre de la romancière, soit la subjectivation de la voix et la nuance du discours, notre recherche vise à mieux comprendre le rapport complexe que l'écrivaine entretient dans ses livres avec les enjeux de domination et à retracer, à même l'œuvre, l'évolution de son engagement pour la justice sociale. Notre hypothèse veut qu'il y ait non seulement un processus de nuance du discours au fil de la carrière romanesque de Gabrielle Roy, mais que celui-ci est indissociable du phénomène de subjectivation de la voix qui se trace en parallèle et que c'est précisément là, dans cette tension réconciliée par l'écriture, que se trouve le véritable engagement régien pour la cause des groupes dominés. Pour apporter des éléments de réponse à cette hypothèse, nous posons notre regard sur trois « chapitres » de la carrière romanesque de Gabrielle Roy (Bonheur d'occasion [1945], Rue Deschambault [1955] et La détresse et l'enchantement, [1984]) pour ainsi retracer l'évolution des stratégies narratives et stylistiques permettant à l'écrivaine de protéger son intégrité tout en forgeant un plaidoyer implicite en faveur de l'égalité et de l'inclusion
Réappropriations du genre policier dans le roman français du 20e siècle : parodies et prolongements d'une forme paralittéraire
No full textLa sphère littéraire a tôt fait de séparer la paralittérature de la littérature restreinte. Pourtant, une tendance émerge dans la seconde moitié du 20e siècle, rapprochant les deux sphères, alors que plusieurs auteurs de la modernité se réapproprient le genre du roman policier pour élaborer des œuvres qui rompent avec les attentes de l'époque. Ce mémoire porte sur trois de ces œuvres, L'Emploi du temps, de Michel Butor, Rue des Boutiques Obscures, de Patrick Modiano, et Pandore et l'ouvre-boîte, de Postel et Duchâtel, que nous analyserons afin de comprendre l'intérêt qu'a la littérature restreinte d'emprunter à un genre paralittéraire comme le roman policier. En partant du postulat que ces œuvres constituent des parodies du genre policier, nous allons tout d'abord nous attarder sur le rôle du détective qui, entre la quête personnelle et l'enquête policière, symbolise l'entre-deux générique qui caractérise les romans du corpus. Ensuite, nous analyserons le processus de l'enquête et la structure des œuvres, pour voir comment Butor, Modiano, Postel et Duchâtel subvertissent le mécanisme de la « double histoire » policière afin de proposer des formes romanesques novatrices, qui s'affichent comme constructions. Finalement, nous verrons comment l'absence (ou la multiplicité) de solution en fin de récit contribue au projet moderniste des auteurs, ces parodies refusant à la fois le positivisme du roman policier et l'illusion réaliste véhiculée jusque-là par le roman traditionnel
Fictions d'enfance : le personnage-enfant dans les récits francophones
No full textThèse en cotutelle entre l'Université Laval, Québec, Canada et l'Université de Strasbourg, Strasbourg, FranceThèse en cotutelle entre l'Université Laval, Québec, Canada et l'Université de Strasbourg, Strasbourg, FranceCette thèse se propose d'examiner l'identité du personnage-enfant dans un corpus de huit récits francophones, réunis autour de la notion de « fiction d'enfance » (Le Nez qui voque de Réjean Ducharme, La Vie devant soi de Romain Gary, Le Grand Cahier d'Agota Kristof, Chemin-d'école de Patrick Chamoiseau, La Fille du Gobernator de Paule Constant, Transit d'Abdourahman A. Waberi, Solo d'un revenant de Kossi Efoui et Demain j'aurai vingt ans d'Alain Mabanckou). Par ce terme, nous entendons désigner la manière dont ces œuvres présentent, dans la construction du personnage-enfant, une tension entre deux pôles : des « effets d'enfance » et une mise en avant du leurre du personnage. Nous montrerons que les fictions d'enfance se basent sur des stéréotypes littéraires et socioculturels (comme l'association entre enfance et innocence ou le cliché de l'enfant-victime dans les littératures africaines), que les auteurs se plaisent à démanteler par l'usage de stratégies littéraires diverses, telles les ruptures temporelles du récit, les contradictions dans les perceptions des personnages, le recours à des images suggérant le merveilleux, le fantastique, l'étrange, ou encore des intrusions métatextuelles. Il en résulte un portrait spéculaire et critique du personnage-enfant, que nous examinerons sous l'angle du dédoublement, de la mise en abyme, de la métatextualité et du rapport des protagonistes à la littérature. Nous analyserons ainsi comment les fictions d'enfance de Ducharme, Gary, Kristof, Chamoiseau, Constant, Waberi, Efoui et Mabanckou s'accompagnent d'une réflexion plus générale sur la littérature, dont le personnage-enfant, affichant souvent la double posture du lecteur et de l'écrivain, se fait volontiers le porte-parole. À travers lui, l'auteur peut réfléchir, voire construire, son rapport à sa pratique et à l'institution, jouer avec les codes et les normes.In this thesis, we propose to analyze the child character in a corpus consisting of eight francophone novels, gathered around the notion of "child fiction" (Le Nez qui voque by Réjean Ducharme, La Vie devant soi by Romain Gary, Le Grand Cahier by Agota Kristof, Chemin-d'école by Patrick Chamoiseau, La Fille du Gobernator by Paule Constant, Transit by Abdourahman A. Waberi, Solo d'un revenant by Kossi Efoui and Demain j'aurai vingt ans by Alain Mabanckou) The expression "child fiction" depicts the way these novels show, in the construction of the child character, a tension between two poles : "childhood effects" and the lure of the character's childhood. We will show that child fictions are based on literary and sociocultural stereotypes (like the association between Childhood and innocence or the cliché of the child victim in the African literatures), which the authors seemingly enjoy dismantling with the use of numerous literary strategies, like temporal breaks in the narrative, contradictions between the characters' perception, images evoking the wondrous, the fantastic, the bizarre, or metatextual intrusions. The result is a critical and specular portrait of the child character, which we will examine from the angle of the duplication, the mise en abyme, the metatextuality, and the protagonists' relationship to literature. We will thus analyze how the child fictions of Ducharme, Gary, Kristof, Chamoiseau, Constant, Waberi, Efoui and Mabanckou are accompanied by a more general reflection on literature, for which the child character, often displaying a dual posture of reader and writer, makes himself a willing spokesperson. Through him, the author can think, and even construct, his relationship to his practice and his institution, and play with codes and norms
Le sentimentalisme moral de Jesse Prinz : une théorie métaéthique cohérente ?
No full textTitre de l'écran-titre (visionné le 24 juillet 2023)L'objectif de ce mémoire est de tester la rigidité et la cohérence théorique du sentimentalisme constructif que le philosophe américain Jesse J. Prinz présente dans son ouvrage The Emotional Construction of Morals. Pour ce faire, nous commençons par exposer les multiples thèses métaéthiques qui structurent son sentimentalisme et surlignons ensuite celles qui méritent à notre avis une analyse et un regard critique plus amples. Parmi les thèses sélectionnées figurent le naturalisme, l'émotionisme et, finalement, le relativisme moral. Ainsi, notre analyse débute par la remise en question de la portion naturaliste, de la validité de son origine, de la justesse de son interprétation et si oui ou non Prinz l'utilise correctement afin de justifier sa théorie des émotions. Nous concluons que Prinz a une utilisation plutôt radicale du naturalisme empirique, et ce, parce qu'il interprète de manière erronée la pensée naturaliste du philosophe écossais David Hume. De plus, nous jugeons que les recherches empiriques autour des émotions morales sont encore dans leurs balbutiements et qu'il est trop tôt pour dire qu'elles supportent ou non l'émotionisme. Nous déplaçons ensuite notre regard critique sur la portion relativiste du modèle prinzien. Nous concluons que le relativisme culturel et le subjectivisme moral sont des thèses largement incompatibles qui mènent à des contradictions insoutenables. Plus encore, nous croyons que Prinz est incapable de démontrer l'admissibilité et l'existence du progrès moral d'un point de vue relativiste. Les critères extra-moraux, l'explication généalogique nietzschéenne ou le darwinisme moral qu'il élabore sont des remèdes inaptes à résoudre les problèmes de la progression morale et du « nihilisme de l'abondance sans direction ». Finalement, nous proposons que Prinz abandonne l'émotionisme en faveur de l'émotivisme, et qu'il accepte le nihilisme moral comme une conséquence inévitable (quoique valable) de son relativisme moral
Normative data for the Tower of London (Drexel version) in the Quebec-French population aged between 50 and 88 years
No full textThe Tower of London (ToL) is a neuropsychological test used to assess several executive functions such as strategical reasoning, mental planning, and problem-solving. Like other cognitive tests, performance on the ToL can vary according to age, level of education, sex, and cultural background of individuals. The present study aimed to establish normative data for the Drexel version of the ToL among French-Quebec people aged 50 years and over. The normative sample consisted of 174 healthy individuals aged 50–88 years, all from the province of Quebec, Canada. Analyses were performed to estimate the associations between age, sex, and education level on one hand, and ToL performance, on the other hand. Results indicated that Total Execution Time was associated with age, whereas the Total Type II Errors and Total Rule Violation score (Type I + II Errors) were associated with both age and education level. All other scores were not significantly associated with the demographic characteristics of the participants. Since the distributions of the data were all skewed, the normative data are presented in the form of percentile ranks. To conclude, the present norms will ease the detection of executive impairments in French-Quebec middleaged and older adults
L'accès aux accommodements scolaires pour les étudiants en situation de handicap durant la pandémie de COVID 19
No full textTitre de l'écran-titre (visionné le 27 avril 2023)Quelles sont les expériences des étudiants universitaires en situation de handicap concernant l'accès aux accommodements scolaires pendant la pandémie de COVID-19 au Québec ? Malgré l'augmentation des inscriptions d'étudiants universitaires handicapés, les études continuent de montrer un écart croissant dans leurs résultats scolaires par rapport à leurs pairs (Santos et al., 2019 ; Toutain, 2019). Avant la pandémie, la plupart des établissements d'enseignement inclusifs étaient équipés pour répondre à des besoins d'accessibilité déjà connus, comme l'ont indiqué des études antérieures de McGregor (2016), Moh (2012), Erten (2011) et Cawthon (2010). À cette époque, il existait une compréhension générale des défis ou des obstacles existants souvent rencontrés par ces étudiants, et l'un des problèmes les plus courants était lié à la fourniture ou à l'accès aux accommodements scolaires; les expériences rapportées étant assorties d'incohérences en fonction de plusieurs facteurs de l'environnement universitaire ou de la condition de l'étudiant (Somma & Bennett, 2020). Un examen supplémentaire de la littérature révèle également que la pandémie de COVID-19 continue d'exacerber les pressions sur ces étudiants, car les changements dans les modalités d'apprentissage, de l'enseignement en ligne à l'enseignement en face à face et hybride, sont considérés comme conduisant souvent à une négligence involontaire de ces groupes dans l'environnement d'apprentissage (Greta, 2020 ; Soleterre, 2020 ; Sutton, 2020). En raison des défis identifiés en matière d'accessibilité avant la pandémie, l'ère COVID-19 soulève la question de savoir si ce qui constituait auparavant des services de soutien scolaire appropriés pour des handicaps spécifiques reste cohérent dans son efficacité à soutenir ces étudiants devant cette nouvelle réalité académique. Par conséquent, la présente étude, dont le cadre théorique est fondé sur l'approche par les capacités de Sen (1994), s'est concentrée sur l'exploration des expériences individuelles en matière d'accès aux accommodements scolaires en raison de la pandémie dans une université québécoise francophone. L'étude qualitative basée sur l'analyse thématique est utilisée pour comprendre l'expérience des étudiants avec les processus et l'accès aux accommodements scolaires; il explore de manière unique leurs récits basés sur des enquêtes et des entretiens, tout en examinant simultanément leurs aptitudes uniques et leurs conditions particulières ont un impact sur ces expériences. La méthodologie comprend l'exploration des récits des étudiants participants, sur la base d'une enquête démographique et d'un entretien ultérieur (annexes D et E) pour recueillir des données avant de mener une analyse approfondie d'un logiciel qualitatif (NVivo). L'utilisation d'un processus d'analyse thématique en six phases (comme indiqué dans la Figure 5) par Braun & Clarke (2006, 2021) a été adoptée pour identifier les thèmes dans les différents récits rassemblés à partir des transcriptions des entretiens. Enfin, les résultats de l'étude ont montré que la plupart des étudiants ont trouvé que l'université cible était un environnement d'apprentissage inclusif, avec un accès adéquat aux accommodements scolaires malgré la pandémie De même, la plupart des participants ont préféré l'apprentissage en ligne aux modalités en face à face ou hybrides car elles leur permettaient d'accéder plus facilement à l'apprentissage et de gérer leurs conditions simultanément depuis leur domicile. Cependant, certains étudiants ont identifié des défis dans l'apprentissage en ligne comme la perte de la socialisation par les pairs et un impact négatif sur leur santé mentale. En outre, certains participants ont constaté que certains enseignants n'étaient pas disposés à autoriser l'utilisation d'aménagements scolaires dans leurs cours. Cependant, tous les participants ont déclaré avoir eu des expériences positives avec lede soutien despar les pairs dans l'université cible.What are the experiences of university students with disabilities regarding access to academic accommodations during the COVID-19 pandemic in Quebec? Despite rising enrollments of university students with disabilities, studies show an increasing gap in their academic achievements compared to peers (Santos et al., 2019; Toutain, 2019). Prior to the pandemic, most inclusive education institutions were equipped to cater to previously known accessibility needs, as was identified in earlier studies by McGregor (2016), Moh (2012), Erten (2011) & Cawthon (2010). At that time, there was a general understanding of existing challenges or barriers often experienced by these students, with one of the most common issues related to the provision or access to academic accommodations, with students relaying inconsistencies in their experiences, depending on several factors in the academic environment or the condition of the student (Somma & Bennett, 2020). Further, an additional review of literature likewise revealed that the COVID-19 pandemic continues to exacerbate pressures on these students, as changes in learning modalities from online to in-person and hybrid instructions are seemingly leading to an inadvertent oversight of these groups in their learning environment (Greta, 2020; Soleterre, 2020; Sutton, 2020). Due to previously identified challenges to accessibility prior to the pandemic, the COVID-19 era brings on the argument on if what previously constituted appropriate academic support services for specific disabilities remains consistent in its efficacy for supporting these students during the pandemic. Therefore, the current study grounding its theoretical framework on the Capability Approach by Sen (1994), explored individual experiences on access to critical learning supports (resources' conversion to functions), especially due to the changes from the pandemic, at a Francophone Quebec University. The qualitative study uses thematic analysis to explore students' narratives on processes and access to academic accommodations. The data instruments are based on a survey and interview, which examined their unique capabilities against their present academic accommodations, using their conditions to gauge accessibility to their experiences. The methodology encompassed an exploration of the narrations of participating students based on a demographic survey and a subsequent interview (Appendix D and E) to gather data prior to conducting the research study using Qualitative software (NVivo) for an in-depth analysis. The suggested use of a six-phased thematic (as shown in Figure 5) analysis process by Braun & Clarke (2006,2021) was adopted to identify themes across the various narratives as pooled from the interview transcripts. Finally, the study's outcome showed that most students found that the target University was an inclusive learning environment with adequate academic accommodations despite the pandemic. Likewise, most participants preferred online learning to face-to-face or hybrid modalities, as it better supported their access to learning and medical conditions. However, some students identified online learning with the loss of peer socialization and negatively impacting their mental health. In addition, some participants observed that specific instructors were unwilling to allow academic accommodations in their classrooms. Nevertheless, all participants expressed having supportive peer experiences at the target University
Développement d'une thérapie génique basée sur l'utilisation d'oligonucléotides antisens dans la dystrophie myotonique de type 1
No full textTitre de l'écran-titre (visionné le 25 juillet 2023)La dystrophie myotonique de type 1 (DM1) est la plus fréquente des dystrophies musculaires chez l'adulte avec une prévalence de 1/8,000. Il s'agit d'une maladie multisystémique qui touche non seulement le muscle, mais aussi de nombreux organes et systèmes comme le cœur, le cerveau, les poumons, les yeux, les systèmes endocrinien et digestif. Une particularité de cette maladie est l'existence de la forme congénitale sévère responsable de 20 % de décès. La DM1 est causée par une expansion d'un triplet CTG dans la région 3' non codante du gène DMPK et que les ARNs mutés s'accumulent dans les noyaux formant des foci nucléaires. Ces foci séquestrent un facteur d'épissage de la famille des protéines muscle blind (MBNL) et perturbent la fonction de CUGBP-Elav-like (CELF), conduisant à une dérégulation de l'épissage alternatif et à des symptômes cliniques. La DM1 est une maladie qui affecte la qualité de vie, conduit à l'invalidité et réduit l'espérance de vie des sujets atteints, et actuellement il n'existe aucun traitement curatif. Notre hypothèse stipule que la destruction des ARNm DMPK mutés par l'utilisation des oligonucléotides antisens (ASOs) empêchera la fixation du MBNL, et améliorera ainsi le phénotype DM1 dans des modèles in vitro et in vivo. La première partie de ma thèse consiste à développer un modèle cellulaire de la DM1. Nous avons d'abord élaboré une procédure standardisée pour dériver les cellules souches humaines pluripotentes induites (hiPSCs) à partir de lignées cellulaires lymphoblastiques (LCL) en utilisant la méthode Sendeï. Nous avons généré des hiPSCs d'un homme atteint de la forme adulte de la DM1 avec 200 répétitions CTG. Les hiPSCs obtenues conservent la mutation génétique de la DM1, présentent un caryotype normal, expriment les marqueurs de pluripotence et sont capables de se différencier en trois couches germinales. Par la suite, nous avons développé un modèle de cellules neuronales humaines de patients DM1 ayant 1300 CTG pour vérifier l'efficacité des ASOs. Les cellules neuronales récapitulent les principaux phénotypes moléculaires de la DM1 par la présence de foci nucléaires qui se co-localisent avec les protéines MBNL1 et MBNL2 et l'existence des défauts d'épissage alternatif. La deuxième partie est consacrée à améliorer l'efficacité des ASOs pour le traitement des manifestations musculaires, cardiaques et cérébrales en étudiant l'ASO IONIS-486178 conjugué à un acide palmitique via un linker HA (C16-HA): le IONIS-877864. Nos résultats montrent que C16-HA améliore considérablement l'absorption des ASOs dans les muscles striés des souris DMSXL après administration systémique. L'injection sous-cutanée de IONIS-877864 entraîne une destruction de 92 % des ARNm de hDMPK mutés dans les muscles squelettiques et de 78 % dans le cœur. Toutefois, aucun effet n'a été observé dans le cerveau. La diminution des transcrits mutés de hDMPK dans les muscles squelettiques causée par IONIS-877864 a été associée à une amélioration significative de la force musculaire, confirmant ainsi la pertinence des ASOs conjugués à l'acide palmitique C16-HA pour le traitement aussi bien des tissus musculaires que cardiaques. Dans la troisième partie du travail, nous testons l'administration intrathécale des ASOs comme traitement des déficits cérébraux observés chez les patients DM1, étant donné qu'aucune chimie à ce jour n'a été capable de franchir la barrière hémato-encéphalique. IONIS-486178 a été évalué à la fois in vitro dans les cellules neurales DM1 et in vivo chez les souris DMSXL. L'ASO a détruit 80 % des foci nucléaires dans les cellules neurales. Cette destruction a permis la redistribution de MBNL1 et 2 et la correction de certaines anomalies d'épissage. L'injection intracérébroventriculaire de IONIS-486178 chez des souris DMSXL adultes a permis une diminution de jusqu'à 70 % des ARNm de hDMPK mutés dans les différentes régions du cerveau, un effet maintenu pendant douze semaines, et une biodistribution de l'ASO dans toutes les régions cérébrales. Enfin, l'analyse de l'activité globale des souris DMSXL par le test Open field montre qu'une seule injection intracérébroventriculaire des souris DMSXL néonatales par IONIS-486178 améliore significativement les anomalies comportementales 3 semaines après le traitement. Dans l'ensemble, cette thèse soutient la faisabilité d'un traitement par injections systémiques d'ASO pour les manifestations musculaires et cardiaques, et par administration intrathécale pour le traitement des déficits cérébraux chez les patients DM1.Myotonic dystrophy type 1 (DM1) is the most common muscular dystrophy in adults with a prevalence of 1/8,000. It is a multisystem disease that affects not only the muscle, but also many organs and systems such as the heart, brain, lungs, eyes, endocrine and digestive systems. A particularity of this disease is the existence of the severe congenital form responsible for 20 % of deaths. DM1 is caused by an expansion of a CTG triplet in the 3' non-coding region of the DMPK gene and the mutated RNAs accumulate in the nuclei forming nuclear foci. These foci sequester a splicing factor of the muscle blind protein family (MBNL) and disrupt CUGBP-Elav-like (CELF) function, leading to deregulation of alternative splicing and clinical symptoms. DM1 is a disease that affects quality of life, leads to disability, and reduces life expectancy of affected individuals and currently there is no curative treatment. Our hypothesis states that the destruction of mutated DMPK mRNAs using antisense oligonucleotides (ASOs) will prevent MBNL binding, and thus improve the DM1 phenotype in in vitro and in vivo models. The first part of my thesis consists in developing a cellular model of DM1. We first developed a standardized procedure to derive human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) from lymphoblastic cell lines (LCL) using the Sendeï method. We generated hiPSCs from a man affected by an adult form of DM1 with 200 CTG repeats. The resulting hiPSCs retained the DM1 genetic mutation, had a normal karyotype, expressed pluripotency markers and were able to differentiate into three germ layers. Subsequently, we developed a human neuronal cell model of DM1 patients with 1300 CTG to verify the efficacy of ASOs. The neuronal cells recapitulate the main molecular phenotypes of DM1 by the presence of nuclear foci that co-localize with MBNL1 and MBNL2 proteins and the existence of alternative splicing defects. The second part is devoted to improving the potency of ASOs for the treatment of muscle, heart and brain events by studying the IONIS-486178 ASO conjugated to a palmitic acid (C16) via an HA linker (the IONIS-877864). Our results show that C16-HA significantly enhances ASO uptake in striated muscles of DMSXL mice after systemic administration. Subcutaneous injection of IONIS-877864 results in 92 % destruction of mutant hDMPK mRNAs in skeletal muscle and 78 % in heart. However, no effect was observed in the brain. The decrease in mutant hDMPK transcripts in skeletal muscles caused by IONIS-877864 was associated with a significant improvement in muscle strength, thus confirming the suitability of C16-HA palmitic acid-conjugated ASOs for the treatment of both muscle and cardiac tissues. In the third part of the work, we test intrathecal administration of ASOs as a treatment for brain deficits observed in DM1 patients, as no chemistry to date has been able to cross the blood-brain barrier. IONIS-486178 was evaluated both in vitro in DM1 neuronal cells and in vivo in DMSXL mice. ASO destroyed 80 % of nuclear foci in neural cells. This destruction allowed the redistribution of MBNL1 and 2, and the correction of some splicing defects. Intracerebroventricular injection of the IONIS-486178 in DMSXL mice adult resulted in a decrease of up to 70 % in hDMPK mutated mRNA levels in different brain regions, an effect maintained for twelve weeks, and biodistribution of ASO in all brain regions. Finally, analysis of the global activity of DMSXL mice by the Open field test shows that a single intracerebroventricular injection of neonatal DMSXL mice with IONIS-486178 significantly improves behavioral abnormalities 3 weeks after treatment. Overall, this thesis supports the feasibility of treatment with systemic injections of ASO for muscle and cardiac manifestations, and intrathecal administration for the treatment of brain deficits in DM1 patients
L'articulation du brevet et du secret d'affaires au cœur de la stratégie d'innovation des entreprises
No full textTitre de l'écran-titre (visionné le 1er mai 2023)Le but de ce mémoire est d'examiner la relation du brevet et du secret d'affaires d'un point de vue juridique et stratégique. En effet, les deux protections, étant différentes, entretiennent des liens très étroits. Le régime du secret d'affaires a été renforcé par la directive européenne n°2016/943 qui a été transposée en droit français par la Loi de transposition n° 2018-670 relative à la protection du secret des affaires du 31 juillet 2018. Ainsi, le secret d'affaires constitue une alternative au brevet. Dans un premier temps, il convient d'analyser le caractère alternatif des deux protections, qui constitue, selon nous, une preuve de complémentarité des deux régimes. Dans un second temps, le lien entre brevet et secret est analysé de manière successive, à chaque stade du processus de mise en œuvre de l'innovation. Nous en concluons que les deux protections ont un lien étroit qui permet une complémentarité juridique et stratégique