CorpusUL Université Laval
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Les barrières au traitement et l'issue d'un traitement en ligne chez les hommes et les femmes évacués lors des feux de forêt de Fort McMurray
No full textLa présente thèse s'inscrit dans un projet de plus grande envergure évaluant les besoins des personnes évacuées lors des feux de forêt de Fort McMurray de 2016 et l'efficacité d'une thérapie cognitivo-comportementale en ligne visant la réduction des symptômes post-traumatiques, dépressifs et liés à l'insomnie (RESILIENT). Elle s'intéresse plus précisément à l'influence du genre en lien avec divers éléments liés au processus thérapeutique, soit la recherche d'aide psychologique, l'efficacité du traitement en ligne ainsi que l'utilisation objective et l'appréciation subjective de ce traitement. Les résultats ont montré plusieurs différences entre les hommes et les femmes. D'abord, les femmes étaient plus susceptibles d'utiliser des services psychologiques dans l'année qui a suivi les feux. Parmi les participants ayant reçu le traitement RESILIENT, les hommes et les femmes ont réagi différemment en termes de stratégies d'adaptation orientées vers les buts. De plus, l'amélioration des hommes au niveau de l'insomnie et des cognitions post-traumatiques liées au blâme personnel s'est avérée supérieure à celle des femmes. Les résultats montrent également que les femmes ont écrit un plus grand nombre de mots dans certains modules de traitement que les hommes. Les hommes avaient une plus grande perception d'avoir mis beaucoup d'efforts dans la stratégie de restructuration cognitive que les femmes, tandis que les femmes ont rapporté dans une plus grande proportion une intention de continuer d'utiliser l'activité physique comme stratégie d'activation comportementale. Les résultats ont toutefois révélé une absence d'effet du genre dans la présence de barrières au traitement dans l'année suivant les feux, dans la diminution des symptômes post-traumatiques et dépressifs à la suite du traitement, dans l'utilisation de plusieurs stratégies d'adaptation, dans l'adhésion aux cognitions post-traumatiques négatives envers soi et envers le monde, dans l'amélioration du soutien social perçu et dans la plupart des indicateurs d'utilisation du traitement en ligne. D'un côté, il semble que le fait d'avoir offert aux participants une variété d'options thérapeutiques dans le cas du présent traitement en ligne ait constitué une option bénéfique pour les participants et participantes. Quoi qu'ils aient des rapports différents envers la recherche d'aide, qu'ils aient évolué et utilisé le traitement de manière quelque peu différente, leur amélioration somme toute similaire suggère qu'un traitement multi-composante respectant le rythme des participants corresponde autant aux besoins des participants hommes que femmes. D'un autre côté, l'étude met en évidence que des différences de genre existent à différents plans au niveau du processus thérapeutique et souligne l'importance de développer des traitements en ligne sensibles aux caractéristiques individuelles . Comme notre compréhension de la notion du genre est en évolution, d'autres études sont nécessaires pour bien comprendre comment genre et traitements psychologiques interagissent, afin d'offrir à tous les utilisateurs des options qui conviennent à leurs besoins à leurs caractéristiques sociodémographiques uniques.This doctoral thesis is situated within a larger project evaluating the needs of evacuees of the 2016 Fort McMurray wildfires and the effectiveness of an online cognitive behavioral therapy aimed at reducing posttraumatic symptoms, depressive symptoms, and insomnia (the RESILIENT treatment). Specifically, it examined the influence of gender in various aspects of the therapeutic process, namely psychological help-seeking, therapeutic efficacy, and treatment usage. The results showed several differences between men and women. First, women were more likely to use psychological services in the year following the fires. Among participants who received the RESILIENT treatment, men and women responded differently in terms of goal-oriented coping strategies. In addition, men's improvement in insomnia and self-blame post-traumatic cognitions was found to be greater than women's. The findings also showed that women wrote a greater number of words in some treatment sessions than men. Men had a greater perception of having put a lot of effort into the cognitive restructuring strategy than women, while women reported in a greater proportion an intention to continue using physical activity as a behavioral activation strategy. Results, however, revealed no gender effect in the presence of barriers to treatment in the year following the fires, in the reduction of posttraumatic and depressive symptoms following treatment, in the use of several coping strategies, in the adherence to negative posttraumatic cognitions about the self and the world, in the improvement of perceived social support, and in most indicators of online treatment usage. On the one hand, it appears that offering participants a variety of therapeutic strategies in this online treatment was beneficial for both men and women. Although they related to help-seeking in different ways, evolved and used the treatment somewhat differently, their similar improvement suggests that a multi-component, self-paced treatment is as suitable for men as it is for women. On the other hand, the study highlights that gender differences exist in various aspects of the treatment process and underscores the importance of developing online treatments that are sensitive to individual characteristics. As our understanding of gender evolves, further research is needed to fully understand how gender and psychological treatments interact, so that individuals can be offered options that are appropriate to their needs
Étranger chez soi : le syndrome de l'imposteur culturel chez les Canadiens de deuxième génération et Canadiens d'origines mixtes
No full textCette présente recherche introduit le syndrome de l'imposteur culturel (CISS, 2021), une adaptation du phénomène de l'imposteur initialement développé par Clances et Imes (1978), au contexte culturel (Clances & Imes, 1978). Les Canadiens de deuxième génération et les Canadiens d'origines mixtes peuvent se sentir comme des imposteurs au sein de leur(s) propre culture(s) d'origine, lorsqu'ils sentent ne pas avoir suffisamment de connaissances, d'aptitudes et/ou de compétences culturelles (compétence culturelle, LaFromboise et al., 1993). En plus de devoir apprendre la culture dominante, ces individus doivent également apprendre et conserver leur(s) culture(s) d'origine (Kim et Alamilla, 2017 ; Berry et al., 2006). En ne vivant pas dans leur pays d'origine, les individus multiculturels ne suivent pas un processus de socialisation culturelle traditionnel (contact direct et constant avec leur culture d'origine), ce qui rend cet apprentissage d'autant plus complexe (Ferguson et al., 2016). Ces derniers sont également plus susceptibles d'être confrontés à la discrimination et au rejet des membres de leurs deux groupes culturels (majorité et origine), ce qui est connu pour avoir un impact négatif sur leur bien-être (Campion, 2019, Lui et Quezada, 2019). En explorant l'expérience multiculturelle des Canadiens de deuxième génération et d'origine mixte, cette étude cherche à examiner comment l'implication culturelle et les expériences de discrimination prédisent le syndrome de l'imposteur culturel de ces derniers. Les résultats ont démontrés qu'une faible implication culturelle ainsi que la discrimination sont des prédicteurs du syndrome de l'imposteur culturel. Le syndrome de l'imposteur culturel aurait un effet médiateur sur la relation entre l'implication culturelle et le bien-être, ainsi que la discrimination et le bien-être. Finalement, la discrimination n'aurait aucun effet modérateur sur la relation médiatrice entre l'implication culturelle, le syndrome de l'imposteur culturel et le bien-être. Notre recherche rejoint les multiples autres études qui réitèrent l'importance du processus de l'enculturation sur le développement et le bien-être des individus multiculturels.This research introduces the cultural impostor syndrome (CISS, 2021), an adaptation of the impostor phenomenon originally developed by Clances and Imes (1978), to the cultural context (Clances & Imes, 1978). Second-generation Canadians and Canadians of mixed origins may feel like imposters within their own culture(s) of origin, when they feel they lack sufficient knowledge, skills and/or or cultural competence (cultural competence, LaFromboise et al., 1993). In addition to having to learn the dominant culture, these individuals must also learn and maintain their culture(s) of origin (Kim and Alamilla, 2017; Berry et al., 2006). By not living in their country of origin, multicultural individuals do not follow a traditional process of cultural socialization (direct and constant contact with their culture of origin), which makes the task of learning about their culture all the more complex (Ferguson et al., 2016). The latter are also more likely to face discrimination and rejection from members of their two cultural groups (majority and origin), which is known to have a negative impact on their well-being (Campion, 2019, Lui et Quezada, 2019). By exploring the multicultural experience of second-generation and mixed-origin Canadians, this study seeks to examine how cultural involvement and experiences of discrimination predict the latter's cultural impostor syndrome. The results demonstrated that low cultural involvement as well as discrimination are predictors of the cultural impostor syndrome. The cultural impostor syndrome has a mediating effect on the relationship between cultural involvement and well-being, as well as discrimination and well-being. Finally, discrimination has no moderating effect on the mediating relationship between cultural involvement, cultural impostor syndrome and well-being. It is concluded that second-generation Canadians and Canadians of mixed origins face challenges specific to their multicultural experience, which can create in them the feeling of being impostors within their cultural group(s) of origin. While research on multicultural individuals is very often centered on their adaptation to the dominant culture (acculturation), our research joins the many other studies that reiterate the importance of the process of enculturation on development and well-being of multicultural individuals
L'alimentation éthique dans le cursus scolaire québécois : questions d'éthique animale
No full textL'objectif de cette recherche est de démontrer qu'il serait pertinent d'aborder des questions éthiques en lien avec l'alimentation dans le cadre du cursus scolaire québécois. Bien que l'alimentation soit un concept déjà présent, il n'y a que très peu de place aux questionnements éthiques émergents de celui-ci. Toutefois, il sera démontré dans cette recherche que les enjeux éthiques en alimentation sont multiples et qu'ils méritent leur place au sein du programme scolaire. Parmi les enjeux explorés dans cette recherche, ceux de l'éthique animale et de l'élevage de masse ont été choisis pour illustrer l'importance de se questionner sur notre alimentation d'un point de vue éthique. Par la suite, nous examinerons ces pratiques sous l'angle des grandes théories en éthique animale pour comprendre pourquoi il est important, voire essentiel, de se questionner sur celles-ci. Finalement, dans le dernier chapitre, nous explorerons les impacts de l'enseignement sur l'alimentation éthique sur les jeunes
Influence de la pandémie de COVID-19 sur la pratique de l'hygiène des mains : analyse exploratoire de changements de comportements induits par la pandémie
No full textPour lutter contre la pandémie de COVID-19, le Québec, comme de nombreux autres endroits dans le monde, a dû mettre en place des mesures de contrôle pour ralentir la propagation du SARS-CoV-2. Ces mesures ont eu un impact direct sur la vie quotidienne des Québécois, notamment sur la santé mentale de la population étudiante. Cependant, aucune donnée n'existe, à notre connaissance, concernant l'influence de la pandémie de COVID-19 sur la pratique de l'hygiène des mains des étudiants universitaires québécois. Cette étude quantitative a pour objectif de décrire l'influence de la pandémie de COVID-19 sur le comportement d'hygiène des mains, à l'aide du cadre des domaines théoriques (CDT), chez les étudiants de l'Université Laval. Pour ce faire, nous tenterons de répondre à la question suivante : Quelle est l'influence de la pandémie de COVID-19 sur l'hygiène des mains chez les étudiants de l'Université Laval? Le CDT est une synthèse de théories et de construits théoriques liés au changement de comportement. L'intégration du CDT à ce projet se justifie par son utilité originale, à savoir l'identification des domaines théoriques pertinents au comportement étudié, par des analyses descriptives et de corrélation. Chaque domaine du CDT a été corrélé au comportement d'hygiène des mains par des analyses de corrélation et par un modèle de régression linéaire multiple. Cette étude à devis descriptif corrélationnel a été réalisée au sein de la population étudiante de l'Université Laval (n = 630) en se basant sur des données recueillies dans le cadre d'un questionnaire autoadministré comprenant des énoncés tirés des écrits en accord avec chacun des domaines théoriques. De plus, ces énoncés ont fait l'objet d'une analyse de cohérence interne au préalable (n = 30). Les résultats de notre étude montrent que les variables du CDT qui ont un lien significatif avec le comportement préventif étudié sont : l'intention, la mémoire, les croyances en ses capacités, le rôle social, le but, le contexte environnemental et les récompenses. Certaines variables sociodémographiques se sont également avérées significativement liées au comportement préventif étudié : la source d'information du ministère de la Santé et des Services sociaux du Québec pour se renseigner sur la COVID-19, l'âge avancé ainsi que la peur de la COVID-19. Hormis les capacités elles-mêmes, notre étude révèle que la croyance sur les capacités des individus est un facteur plus important à considérer pour adopter un comportement. En plus de l'intention, déjà établie comme étant un facteur important dans l'adoption d'un comportement par les théories antérieures (théorie du comportement planifié ou théorie de l'action raisonnée), les résultats de notre étude révèlent des pistes de recherches futures qui pourraient aider à instaurer un comportement préventif, comme miser sur les croyances de la population en leur capacité à accomplir un comportement, plutôt que la capacité elle-même. Elle remet aussi en cause l'influence des pairs et donc la norme sociale, dans ce contexte spécifique. En outre, notre étude révèle l'importance de l'instauration d'une communication saine et efficace au sein des médias, notamment par les réseaux sociaux, plus prisés que les sources nationales traditionnelles, par ce groupe d'âge spécifiquement.In order to fight the SARS-CoV-19 pandemic, Quebec, like many other places in the world, had to put in place control measures to slow the spread of SARS-CoV-2. These measures have had a direct impact on the daily lives of Quebecers, particularly on the mental health of the student population. However, to our knowledge, no data exist concerning the influence of the COVID-19 pandemic on the hand hygiene practices of Quebec university students. The purpose of this quantitative study is to describe the influence of the COVID-19 pandemic on hand hygiene behavior, using the theoretical domains framework (TDF), among Laval University students. To do so, we will attempt to answer the following question: What is the influence of the COVID-19 pandemic on hand hygiene among Laval University students? TDF is a synthesis of theories and theoretical constructs related to behavior change. The rationale for incorporating the TDF into this project is its original utility, namely the identification of theoretical domains relevant to the behavior being studied, through descriptive and correlation analyses. Each domain of the TDF was correlated with hand hygiene behavior through correlation analyses and a multiple linear regression model. This descriptive correlational study was conducted in the student population of Laval University (n = 630) based on data collected from a self-administered questionnaire that included statements from the literature consistent with each of the theoretical domains. In addition, these statements were subjected to a prior internal consistency analysis (n = 30). The results of our study show that the TDF variables that have a significant link with the preventive behavior studied are intention, memory, beliefs about ability, social role, purpose, environmental context, and rewards. Some sociodemographic variables were also found to be significantly related to the preventive behavior studied: source of information from the Quebec Ministry of Health and Social Services to learn about COVID-19, advanced age, and fear of COVID-19. Apart from ability itself, our study reveals that belief in one's ability is a more important factor to consider in adopting a behavior. In addition to intention, which has already been established as an important factor in behavior adoption by previous theories (theory of planned behavior or theory of reasoned action), the results of our study reveal avenues for future research that may help to institute preventive behavior, such as focusing on people's beliefs in their ability to perform a behavior, rather than the ability itself. It also calls into question the influence of peers, and thus the social norm, in this specific context. Furthermore, our study reveals the importance of establishing healthy and effective communication within the media, including social networks, which are more popular than traditional national sources, specifically for this age group
Prebiotic-like effects of berry polyphenols on the gut microbiota : akkermansia muciniphila and its molecular adaptation mechanisms to phenolics
No full textLes liens entre le microbiote intestinal, la diète et les désordres métaboliques sont maintenant établis. Les polyphénols des petits fruits affectent les bactéries pathogènes dans le côlon, et stimulent les bactéries symbiotiques, particulièrement Akkermansia muciniphila chez l'homme et dans des modèles murins. Cette bactérie muciphile contribue à l'homéostasie intestinale et induit une réponse immunitaire et métabolique bénéfique chez l'hôte. Cependant, on comprend mal comment les polyphénols peuvent sélectivement l'affecter et l'analyse traditionnelle métagénomique obtenue d'études in vivo n'offre qu'une image partielle des mécanismes impliqués. Cette thèse vise à évaluer, par des approches in vivo et in vitro, comment les polyphénols modifient le microbiote intestinal, la morphologie de l'épithélium du colon, la niche écologique d'Akkermansia, et par extension affectent le métabolisme de souris soumises à une diète obésogène. Une attention particulière a été portée à l'effet de ces composés sur la croissance d'A. muciniphila et les mécanismes moléculaires qu'ils induisent chez la bactérie. Dans un premier chapitre, l'effet des poudres de fruits canneberge et de bleuets riches en polyphénols et leurs fractions fibreuses a été étudié chez des souris soumises à une diète obésogène (HFHS) pendant 8 semaines afin d'évaluer lesquels des polyphénols ou des fibres sont responsables de l'effet prébiotique observé. Cette étude a démontré que ce sont surtout les polyphénols contenus dans les poudres de canneberges et de bleuets entiers qui sont responsables de l'action prébiotique, notamment en stimulant A. muciniphila. En effet, la poudre de canneberge comme celle de bleuets inhibent particulièrement les pathogènes induits par la diète HFHS. En outre, l'analyse de redondance fonctionnelle a révélé que la consommation de poudre de canneberge riche en polyphénols permettait au microbiote de souris obèses de retrouver les fonctions de celui de souris maigres. Ces souris présentaient un poids et une efficacité énergétique inférieurs à celui des souris non traitées. De plus, d'autres bactéries symbiotiques étaient favorisées par les poudres de fruits entiers : Muribaculaceae, Dubosiella newyorkensis et Eggerthellaceae. Fait intéressant, les fibres de canneberge inhibaient également les pathogènes, favorisaient des bactéries dégradant les polyphénols et réduisaient les triglycérides hépatiques chez les souris obèses. Ces résultats mettent en évidence le potentiel des polyphénols, même lorsqu'ils sont associés aux fibres, à atténuer les désordres métaboliques. Le deuxième chapitre s'intéresse à identifier les catégories de polyphénols impliquées dans l'accroissement du nombre de bactéries symbiotiques et particulièrement d'A. muciniphila. Les souris soumises à une diète obésogène ont été traitées avec un extrait de bleuet ou trois de leurs fractions polyphénoliques : F1, riches en anthocyanes et en acides phénoliques; F2, riche en oligomères de proanthocyanidines (PACs) ainsi qu'en flavonols; et F3 riches en polymères de PACs. Ces sous-fractions ont été administrées aux souris dans les mêmes concentrations que celles retrouvées dans l'extrait entier. Globalement, les fractions polyphénoliques ont restauré l'épaisseur de la couche de mucus, mais particulièrement les fractions riches en PACs ont significativement stimulé A. muciniphila, tout en améliorant la proportion de cellules caliciformes et le métabolisme du glucose chez les souris obèses. Enfin le dernier chapitre s'intéresse aux mécanismes par lesquels les polyphénols favorisent la croissance de A. muciniphila dans l'intestin. Des cultures d'A. muciniphila ont donc été effectuées dans des milieux enrichis en polyphénols afin d'évaluer les gènes impliqués dans le métabolisme cellulaire et dans la résistance aux antimicrobiens; les pompes à efflux non spécifiques, les polysaccharides capsulaires (CPS), les exopolysaccharides (EPS), les transporteurs de type ABC-2 et de resistance-nodulation-cell division (RND) ont joué un rôle crucial dans la résistance et l'adaptation de la bactérie aux polyphénols. La croissance d'A. muciniphila n'a pas été inhibée par l'extrait de canneberge entier ni par ses fractions polyphénoliques, mais elle a été stimulée par l'urolithine-A. Cette expérience in vitro a démontré que les polymères de PACs favorisent davantage les mécanismes d'adaptation antimicrobienne impliqués dans la protection des parois cellulaires et la régulation énergétique chez Akkermansia. Parallèlement à l'urolithine-A, les polymères de PACs ont induit la production du CPS et du EPS chez A. muciniphila. Ces CPS/EPS pourraient contribuer aux rôles immunomodulateur et anti-obésité d'A. muciniphila et par conséquent constituer des postbiotiques prometteurs. Cette thèse démontre la sélectivité des polyphénols, principalement des PACs, dans l'inhibition des pathogènes associés à l'obésité et dévoile les mécanismes moléculaires qui sous-tendent leurs effets prébiotiques sur A. muciniphila.The link between gut microbiota, diet and metabolic diseases is now established. Polyphenols from berries and other dietary sources have been shown to inhibit opportunistic pathogens and stimulate symbiotic bacteria, particularly Akkermansia muciniphila in humans and animals. A. muciniphila is a mucus-living bacterium shown to contribute to the intestinal homeostasis and to drive beneficial immune and metabolic response in the host. However, it is not yet known how polyphenols can selectively affect A. muciniphila from in vivo studies, since regular metagenomic analysis of the gut microbiota only provide a partial picture of the mechanisms involved. This thesis aims to determine, through in vivo and in vitro approaches, the prebiotic effect of polyphenols and how they affect the physiology and intestinal morphology and the ecological niche of Akkermansia in obesogenic diet-fed mice. Particularly, it focusses on the molecular capacity of A. muciniphila to induce defence mechanisms and adapt to distinct polyphenolic fractions. In the first chapter, in order to assess which constituent of berries was responsible for the prebiotic action, we compared the effect of the dietary supplementation with polyphenol-rich cranberry and blueberry fruit powders to their respective fibrous fractions (cell wall polysaccharides) of high-fat high-sucrose (HFHS) fed mice for 8-weeks. We demonstrated that the polyphenols from cranberry and blueberry fruit powders are mainly responsible for the selective prebiotic effects on A. muciniphila rather than their fibre-rich fractions. Both cranberry and blueberry whole fruit powders inhibited HFHS-induced pathobionts associated with obesity. A functional redundancy analysis revealed that the gut microbiota functions of obese mice were remarkably changed by polyphenol-rich whole cranberry powder, restoring it back to that observed in lean mice; that is, they presented lower body weight and energy efficiency as compared to untreated mice. Furthermore, other symbiotic bacteria were influenced by polyphenol-rich berry powders, notably Muribaculaceae, Dubosiella newyorkensis, and the polyphenol-degrading Eggerthellaceae; these mice presented a lower body weight and energy efficiency as compared to untreated mice. Surprisingly, cranberry fibrous fraction also inhibited pathobionts and promoted polyphenol-degrading families and reduced the hepatic triglycerides level in HFHS-fed mice. Altogether, these findings highlight the role of polyphenols associated with fibres, in attenuating obesity. The second chapter aimed to identity which polyphenolic category was mostly responsible for the prebiotic effect and the abundance of A. muciniphila. HFHS-fed mice were treated with a whole blueberry extract and with the three constitutive polyphenolic fractions: F1, rich in anthocyanins and phenolic acids, F2, rich in oligomeric proanthocyanidins (PACs) and flavonols, and F3 rich polymeric PACs. These sub-fractions were administered to mice at the same concentration as encountered in the whole extract. All in all, the polyphenolic fractions restored the mucus thickness, but the PAC-rich fractions besides stimulating A. muciniphila, increased the proportion of goblet cells and improved the glucose homeostasis in obese mice. Finally, the third chapter looks at the mechanisms by which polyphenols promote the growth of A. muciniphila. Growing assays of A. muciniphila were carried out in polyphenols enriched media in order to assess the expression of genes involved in cell metabolism and antimicrobial resistance. Genes coding for multidrug efflux pumps, capsular polysaccharide (CPS) family, exopolysaccharides (EPS), and ABC-2 type and resistance-nodulation-cell division (RND) transporters were shown to play a crucial role in allowing the bacteria to withstand the different cranberry polyphenolic fractions and adapt to the stress they caused. A. muciniphila growth was not inhibited by the whole cranberry extract neither by its polyphenolic fractions, but enhanced by the phenolic metabolite urolithin-A. Moreover, we showed that the polymeric PACs were triggering most intensively the antimicrobial adaptation mechanisms involved in cell-wall protection and energy management in A. muciniphila. Both of these fractions up-regulated CPS and EPS in A. muciniphila. CPS/EPS secretion in presence of polyphenols might represent promising post-biotic products, possibly involved in the immune modulatory and anti-obesity potential by A. muciniphila. Altogether, this thesis demonstrates for one of the first times that berry polyphenols and their PAC-rich fractions are responsible for the prebiotic-like effect on A. muciniphila, and the inhibition of specific pathobionts associated with obesity and unveils the molecular mechanisms underpinning the resilience of this bacterium to phenolics
Détermination des effets de la tique d'hiver (Dermacentor albipictus) sur la santé des orignaux : une approche expérimentale
No full textMalgré que les effets des tiques d'hiver (Dermacentor abipictus) sur l'orignal (Alces alces) ont été étudiés en captivité, peu d'études, à l'échelle individuelle, se sont penchées sur la relation entre la tique et l'orignal en milieu naturel. En effet, bien que l'orignal soit un cervidé généralement bien adapté aux conditions hivernales, ce n'est pas tout à fait le cas des veaux orignaux qui vivent leur premier hiver. Ainsi, les réponses physiologiques des veaux orignaux faisant face à cette épreuve s'ajoutent à celles enclenchées par une infestation par la tique d'hiver. Afin d'éclaircir les conséquences de la tique d'hiver sur la santé des veaux orignaux, il importe de départager l'effet du parasitisme par la tique de l'effet des conditions hivernales. Pour ce faire, nous avons testé l'efficacité d'un acaricide en application topique à base de perméthrine visant à réduire la charge de tiques d'hiver chez les veaux orignaux traités. Nous avons également effectué un suivi de ces mêmes veaux orignaux qui évoluaient dans deux régions du Nouveau-Brunswick le long d'un gradient latitudinal en utilisant un plan d'échantillonnage par capture-recapture au cours d'un hiver. L'objectif étant d'étudier les effets des tiques d'hiver et de la sévérité de l'hiver, dans deux régions distinctes, sur la masse et les paramètres sanguins en tant qu'indices de la condition corporelle des veaux orignaux. À la suite de cette étude, nos résultats nous indiquent que le traitement acaricide n'a pas réussi à réduire suffisamment la charge de tiques afin d'influencer la condition corporelle des animaux traités. Malgré ce constat, les résultats des analyses sanguines révèlent tout de même des différences entre les individus des deux régions dont certaines pourraient s'expliquer en partie par la présence des tiques d'hiver. Cependant, ces résultats doivent être considérés avec prudence étant donné le nombre réduit d'individus et l'absence de données en lien avec les ressources alimentaires qui influencent aussi la condition corporelle des animaux.Even though the effects of winter ticks (Dermacentor abipictus) on moose (Alces alces) have been studied in captivity, few studies, at the individual scale, have examined the relationship between ticks and moose in the wild. Although moose are generally well adapted to winter conditions, this is not entirely true for moose calves in their first winter. Thus, the physiological responses of moose calves facing their first winter are additional to those triggered by winter tick infestation. In order to clarify the consequences of winter ticks on the health of moose calves, it is necessary to separate the effect of tick parasitism from the effect of winter conditions. To do this, we tested the efficacy of a permethrin based topical acaricide in reducing winter tick burden in treated moose calves. We also followed these same moose calves as they moved along a latitudinal gradient in two regions of New Brunswick using a capture-recapture sampling design over the course of a winter. The objective was to investigate the effects of winter ticks and winter severity, in two distinct regions, on mass and blood parameters as indices of body condition of moose calves. As a result of this study, our results indicate that the acaricide treatment was not successful in reducing the tick load sufficiently to influence the body condition of treated animals. Despite this setback, the blood test results still show differences between individuals in the two regions, some of which may be explained in part by the presence of winter ticks. However, these results must be considered with caution given the small number of individuals and the absence of data related to food resources that influence the body condition of the animals as well
Développement d'outils exploitant les loci CRISPR pour l'étude des interactions phages-bactéries
No full textTitre de l'écran-titre (visionné le 15 mai 2023)La métagénomique virale a permis l'identification de milliers de nouvelles séquences de phages dans une variété d'écosystèmes. Leur caractérisation est limitée par leur grande diversité, puisque la majorité des nouvelles séquences virales ne ressemble à aucun phage connu et répertorié. Pour faire face à ce défi, de nouveaux outils de la bio-informatique doivent être développés permettant de mieux comprendre les interactions phages-bactéries et ainsi élucider le rôle des phages dans leur écosystème. Une approche pour étudier les interactions phages-bactéries repose sur l'exploitation des systèmes CRISPR-Cas. Chez les bactéries et les archées, ces systèmes servent de mécanismes de défense contre le matériel génétique envahisseur comme le génome des phages. Grâce à de courtes séquences appelées espaceurs, incorporées dans leur locus CRISPR, les bactéries qui portent ce système peuvent reconnaître rapidement un génome de phage, le couper et ainsi bloquer l'infection. Les espaceurs sont archivés et continuent d'être ajoutés au fil des infections, rendant le locus CRISPR très dynamique. Pour les analyses bio-informatiques, les espaceurs ont plusieurs utilités, notamment pour le typage de souches bactériennes et pour la prédiction des hôtes bactériens de séquences virales. Cependant, les quelques outils existants ont été développés avant l'accélération massive dans la découverte de nouvelles séquences de phages offerte par la métagénomique virale. Ainsi, beaucoup de travail répétitif, manuel et non standardisé était requis pour utiliser les espaceurs CRISPR dans le contexte d'études de métagénomique. Les deux premiers chapitres de cette thèse sont dédiés au développement d'outils bio-informatiques exploitant les loci CRISPR. Dans un premier temps, le logiciel CRISPRStudio a été développé pour automatiser la création de figures représentant les loci CRISPR. Ce logiciel offre une grande polyvalence, tout en accélérant la production de figures. Dans un deuxième temps, un second logiciel a été créé pour prédire les hôtes bactériens des phages. Celui-ci s'appuie sur une base de données d'espaceurs de plus de 11 millions de séquences et d'une série de critères fondés sur la biologie des systèmes CRISPR-Cas pour sélectionner l'hôte bactérien le plus probable d'un phage. Cet outil a permis d'améliorer les performances, la standardisation et la facilité d'utilisation des approches de prédiction de l'hôte utilisant les espaceurs CRISPR. Puis, les deux outils ont été mis à profit dans le troisième chapitre pour l'étude spécifique des interactions phages-bactéries entre Escherichia coli et ses phages, dans le contexte du microbiote intestinal. La caractérisation des loci CRISPR a permis d'élucider le rôle probable du système CRISPR-Cas chez cette espèce, soit un mécanisme anti-prophages. À ma connaissance, il s'agit également de la première étude identifiant une aussi grande proportion des cibles des espaceurs, en trouvant l'origine de 60 % des proto-espaceurs.Viral metagenomics has allowed the identification of thousands of new phage sequences in various ecosystems. Yet, their characterization is still limited by their great diversity, as the majority of new viral sequences resembles no known phages in reference databases. To tackle this challenge, new bioinformatic tools are needed to better understand phage-bacteria interactions and to elucidate the role of phages in their ecosystem. One approach to study phage-bacteria interactions consists in taking advantage of CRISPR-Cas systems. In bacteria and archaea, these systems act as defense mechanisms against invading genetic material, such as phage genomes. Thanks to short sequences called spacers incorporated in their CRISPR locus, bacteria that carry this system can rapidly recognize a phage genome and block its infection, analogous to an adaptive immune system. Spacers are archived and continue to be added upon phage infection, which makes the CRISPR locus highly dynamic. In bioinformatics analyses, spacers can be utilized to perform strain typing and to predict the bacterial hosts of phages. However, the few existing tools were developed before the metagenomics era and the massive discovery of new phage sequences. Thus, exploiting CRISPR loci for viral metagenomics projects requires repetitive, manual, and non-standardized work. The first two chapters of this thesis are dedicated to developing bioinformatics tools exploiting CRISPR loci. First, a software was developed to automatize the creation of figures representing CRISPR loci. CRISPRStudio offers versatility, is user-friendly and accelerates the figure production. Second, another software was created to predict the bacterial hosts of phages. It relies on a spacer database containing more than 11 million sequences and on a set of criteria inspired by CRISPR-Cas biology to select the most likely bacterial host for a phage genome. This tool improved the performances, the standardization, and the ease of use of host prediction approaches using CRISPR spacers. In the third chapter, the two tools were used to specifically study phage-bacteria interactions between Escherichia coli and its phages, present in the gut microbiota. CRISPR characterization allowed us to uncover the probable role of the CRISPR-Cas system in this species, being an anti-prophage mechanism. To my knowledge, this is the first study that identified a large proportion of spacer targets, by finding the origin of 60% of the protospacers
Impact des biofilms de bactéries associées à la flore commensale des végétaux sur la résistance des norovirus
No full textThèse ou mémoire avec insertion d’articles.La consommation d'aliments contaminés par le norovirus humain, tels que les baies et les légumes feuillus, est une cause majeure de gastro-entérite épidémique dans le monde. Par conséquent, les stratégies de contrôle visant à limiter l'adhésion du norovirus à la surface des produits végétaux ont fait l'objet de plusieurs études. Pendant la dernière décennie, les interactions entre les virus entériques et les bactéries commensales de l'intestin des mammifères ont été étudiées. Cependant, peu de travaux ont été réalisés sur les communautés bactériennes associées à la surface des baies et des légumes feuillus et leur rôle dans la transmission du norovirus humain. D'ailleurs, certaines bactéries de la flore commensale des végétaux sont connues pour leur capacité à former des biofilms dans lesquels des substances analogues aux récepteurs des norovirus sont sécrétées. La présence de biofilms bactériens pourrait ainsi contribuer à l'adhésion du norovirus à la surface des végétaux et favoriser sa persistance. Puisque les produits végétaux sont délicats et susceptibles d'être endommagés, les traitements conventionnels ne sont pas toujours appropriés pour inactiver les virus sans compromettre la qualité des aliments. Dans ce mémoire, neuf bactéries associées à la surface des baies et des légumes feuillus sous forme de biofilms ont été étudiées selon leur effet protecteur sur la persistance de deux virus modèles du norovirus humain, le norovirus murin (MNV-1) et le virus Tulane, après un traitement d'inactivation par la lumière pulsée à une fluence de 11,52 J/cm². Aucune différence significative n'a été détectée dans les réductions du titre viral de MNV-1 en présence de biofilms par rapport au MNV-1 seul après le traitement par la lumière pulsée. Le virus Tulane a montré une résistance plus élevée au traitement par la lumière pulsée lorsqu'il était en présence des biofilms formés par Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Kocuria kristinae, Pantoae agglomerans et Pseudomonas fluorescens.Consumption of contaminated food with human norovirus, such as fresh berries and leafy vegetables, is a major cause of epidemic gastroenteritis worldwide. Consequently, several studies have focused on strategies to prevent norovirus attachment to fresh produce. Over the last decade, interactions between enteric viruses and commensal bacteria of the mammalian gut have been investigated, but limited work has been done on the bacterial communities associated with the surface of fresh produce and their role in norovirus transmission. Some bacterial species can form a matrix of extracellular polymeric substances, called biofilm, in which molecules like norovirus receptors can be secreted. Thus, bacterial biofilms associated with the surface of berries and leafy vegetables could interplay with norovirus through direct interactions and modulate its attachment and persistence. Since fresh produce are susceptible to damage, conventional treatments are not always appropriate to inactivate viruses without compromising food quality. Therefore, there is an urgent need to understand how norovirus interacts with epiphytic bacteria, and more specifically with bacterial biofilms. Nine bacterial species were studied in terms of their protective effect on the persistence and infectivity of two norovirus surrogates, murine norovirus 1 (MNV-1) and Tulane virus, when subjected to a pulsed light inactivation treatment at a fluence of 11.52 J/cm². No significant difference was detected in reductions of MNV-1 when attached to bacterial biofilms compared with the control whereas Tulane virus showed a significantly higher resistance to pulsed light treatment when attached to biofilms formed by Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Kocuria kristinae, Pantoae agglomerans, and Pseudomonas fluorescens
Essays on incentive effects, excess burden of taxation and post-secondary wage disparities
No full textTitre de l'écran-titre (visionné le 3 juillet 2023)Cette thèse est composée de trois chapitres distincts portant sur la microéconométrie et les politiques publiques avec un accent particulier sur le travail, la taxation, le bien-être et le capital humain. Le premier chapitre contribue à la littérature sur la taxation sur le salaire. Il apporte des preuves directes sur les effets induits par la taxation sur le salaire et son coût social en exploitant des données issues d'une expérience de terrain. Nos données proviennent d'une firme de plantation d'arbres en Colombie-Britannique où les travailleurs sont recrutés pour planter des arbres sur des blocs de terrain et sont payés à la pièce. L'expérience consistait en deux traitements de base qui appliquent des taux d'imposition de 4 cents et 6 cents par arbre avec différents niveaux de salaire de base. Ces taux correspondent à des taux marginaux d'imposition allant de 15% à 33% selon la rémunération à la pièce en vigueur sur les blocs de terrain. Nos résultats montrent que pour une production journalière moyenne de 2000 arbres par travailleur et un taux d'imposition initial de 15%, une augmentation de 10% du taux d'imposition entraîne une baisse de la production journalière de 28 arbres par travailleur. Cet effet augmente à 39 et 52 arbres pour des taux d'imposition initiaux de 20% et 25% respectivement. Le coût social moyen journalier sur les observations expérimentales représente 0,12 des recettes fiscales générées avec une hétérogénéité substantielle entre les travailleurs. Nous généralisons nos résultats au-delà des taux d'imposition observés dans notre expérience. On montre que le ratio du coût social de la taxation sur les recettes fiscales augmente disproportionnément avec le taux d'imposition. Ce ratio atteint plus de 0,65 au taux d'imposition de 0,56 qui maximise les recettes fiscales. Notre étude fournit des arguments en faveur d'un système d'imposition à assiette large mais à taux faibles. Le deuxième chapitre examine les réactions des travailleurs suite à des variations de leur taux de rémunération. Nous utilisons des données provenant d'une expérience de terrain au sein d'une firme de plantation d'arbres en Colombie-Britannique où les travailleurs sont recrutés pour planter des arbres et sont payés à la pièce. Nous développons deux types d'expérience pour introduire des variations exogènes dans le taux à la pièce des travailleurs. La première consiste en une réduction du taux à la pièce du travailleur couplée à un salaire de base. La seconde est une augmentation du taux à la pièce. Nous mesurons les effets induits par des variations positives et négatives du taux à la pièce sur la productivité. Notre étude fournit une comparaison directe entre les effets induits par une hausse du taux à la pièce et ceux induits par une baisse du taux à la pièce. Nos résultats montrent que les réactions des travailleurs sont asymétriques. En effet, ceux-ci réagissent plus fortement à une baisse du taux à la pièce qu'à une hausse. Ces résultats établissent une piste empirique sur la rigidité à la baisse des salaires. Le troisième chapitre porte sur le capital humain et les disparités salariales post-secondaires. Il étudie l'impact du décrochage post-secondaire aussi bien permanent que temporaire sur les salaires. La plupart des études jusqu'à présent se concentrent généralement sur le décrochage permanent et s'intéressent peu au décrochage temporaire. Il existe cependant des preuves empiriques substantielles que les trajectoires scolaires sont discontinues avec des épisodes d'interruptions temporaires et de réinscriptions. En utilisant les données longitudinales de deux cohortes distinctes de l'Enquête sur les Jeunes en Transition au Canada, nous fournissons des preuves empiriques de l'impact des interruptions scolaires aussi bien permanentes que temporaires sur les salaires. Nos résultats sont robustes pour les deux cohortes et montrent qu'il existe une très légère pénalité salariale - moins de 5% - associée à un décrochage permanent et temporaire des études postsecondaires. Nos analyses montrent toutefois que le salaire des décrocheurs temporaires évolue très rapidement par rapport à celui des décrocheurs permanents et des non-décrocheurs. En effet, les décrocheurs temporaires bénéficient de meilleures perspectives sur le marché du travail pour ajuster leurs compétences et formations lorsqu'ils retournent à l'école. Ces résultats sont utiles pour les politiques éducatives en matière d'orientation et parcours scolaires.This thesis is composed of three separate chapters in microeconometrics and public policies with a focus on labor, taxation, welfare and human capital. The first chapter contributes to the wage taxation and excess burden literature by providing field experiment evidence on tax-induced effects and its associated social cost. Our experiment was conducted in a tree-planting firm in British Columbia where workers are hired to plant trees on given blocks and are paid on a piece rate basis. It involved two basic treatments, applying tax rates of 4 cents and 6 cents per tree with different levels of base wage. This corresponds to marginal tax rates ranging from 15% to 33% depending on the standard piece rate in place on the blocks. We show that for an average daily production of 2000 trees per worker and an initial tax rate of 15%, an increase of 10% of the tax rate will induce a decline of daily production of 28 trees per worker. This increases to 39 and 52 trees for initial tax rates of 20% and 25% respectively. We generalize our results to tax rates beyond those observed in our experiment and observe that the ratio of the excess burden of taxation to tax revenue rises disproportionately with the tax rate attaining more than 0.65 at the tax rate of 56% that maximizes tax revenue. Our analysis advocate for a broad-based and low tax rate system. The second chapter studies workers' reactions to changes in wage rates. We use field experimental data from a tree-planting firm in British Columbia where workers are hired to plant trees on given blocks and are paid on a piece rate basis. We conduct two basic experiments to introduce exogenous variations in the worker's piece rate. The first one is a reduction of the worker's piece rate coupled with a base wage. The second one is an increase in the worker's piece rate. At the intensive margin, we measure completely piece rate effects on productivity accounting for both piece rate reductions and increases. Our study also provides a direct comparison between the impact of wage cuts and pay raises on productivity within the same framework and highlights significant asymmetries in worker's response. It establishes an empirical foundation for downward wage rigidity The third chapter studies the impact of both permanent and temporary school post-secondary interruptions on wages. While most studies focus on the impact of permanent interruptions, little attention has been accorded so far to the impact of temporary school interruptions. There is however substantial empirical evidence that educational trajectories are discontinuous with episodes of temporary interruptions and re-enrollments. Using longitudinal data from two distinct cohorts of the Youth in Transition Survey in Canada, we provide empirical evidence on the impact of both permanent and temporary school interruptions. Our results are robust across these cohorts and show that there is a very slight wage penalty - less than 5% - associated to both permanent and temporary post-secondary interruption. Our study, however, shows that the wage of temporary interrupters evolves very rapidly compared to leavers and continuers. Indeed, temporary interrupters may benefit from better prospects on the labor market to tailor conveniently their skills. These results are relevant for educational policies
La coupe partielle comme outil de lutte et d'adaptation aux changements climatiques en forêt boréale
No full textThèse ou mémoire avec insertion d'articles.Devant l'urgence climatique, l'aménagement forestier peut contribuer à la lutte contre les changements climatiques, notamment par la production de produits du bois qui stockent du carbone hors de l'atmosphère pendant de longues périodes en substituant par le fait même des matériaux plus polluants. La coupe partielle, un procédé sylvicole qui tarde à être utilisé plus largement au Québec, fait tranquillement ses preuves en forêt boréale quant à son potentiel pour l'adaptation et l'atténuation des changements climatiques. Le but de ce mémoire était d'évaluer la capacité à créer des produits du bois de haute valeur et de longue durée de vie de deux types de coupe partielle en forêt boréale. Plus spécifiquement, le but était de comparer l'effet de la coupe progressive irrégulière à couvert permanent et de l'éclaircie commerciale sur le potentiel de croissance des arbres résiduels et leur rendement en produits du sciage et ce, par rapport au scénario de référence de la coupe totale. En utilisant la Forêt Montmorency comme étude de cas, le modèle 3-PG a été utilisé pour simuler la croissance et la coupe de peuplements monospécifiques de sapin baumier (Abies balsamea (L.) Mill) et d'épinette blanche (Picea glauca (Moench) Voss). Grâce à StatSAW, l'assortiment de produits du bois issu des récoltes a été établi selon les différents traitements de récolte. Les résultats les plus marquants ont été observés sur le diamètre quadratique des tiges résiduelles. Pour le sapin baumier, des gains de 1,9, 2,5 et 3,3 cm ont été observés lors de la coupe finale à 70 ans pour les peuplements ayant subi à 30 ans des éclaircies commerciales de 25%, 33% et 40% de la surface terrière respectivement, par rapport à des peuplements non traités. Pour des peuplements soumis à la coupe progressive irrégulière à couvert permanent, un gain de 5,6 et 3,3 cm a été observé comparativement au contrôle à 70 et 90 ans. Pour l'épinette blanche, des gains de 1,8, 2,5 et 3,2 cm ont été observés pour l'éclaircie commerciale à 25%, 33% et 40% respectivement. Pour la coupe progressive irrégulière à couvert permanent, un gain de 5,1 et 3,6 cm a été observé comparativement au contrôle à 70 et 90 ans. Malgré les gains significatifs en diamètre chez les deux essences, l'assortiment de produits du bois cumulatif des scénarios avec éclaircie commerciale à la suite de la coupe finale à 70 ans ne s'est pas distingué du scénario de référence de la coupe totale (sans éclaircie). Cependant, dans une perspective de récolte à perpétuité, la coupe progressive irrégulière à couvert permanent a démontré le meilleur potentiel de génération de produits du bois de grandes dimensions pouvant stocker du carbone sur de longues périodes. En effet, la transition vers une structure de peuplement irrégulière, complétée à 90 ans, devrait permettre des coupes subséquentes qui affichent les meilleures proportions de sciage, avec les dimensions de produits les plus grandes ayant un fort potentiel d'utilisation en construction, où les meilleurs temps de demi-vie sont observés. Dans l'optique de mieux établir le potentiel des coupes partielles à lutter contre les changements climatiques, un bilan carbone complet serait nécessaire, en incluant l'ensemble de la dynamique du carbone de l'écosystème et des produits du bois. Également, il serait nécessaire d'évaluer l'impact de perturbations naturelles, comme la tordeuse des bourgeons d'épinettes, sur les peuplements issus de ce type de coupe. Somme toute, les résultats suggèrent que les coupes partielles, notamment celles faisant partie d'un système de récolte à couvert permanent, ont un fort potentiel de lutte contre les changements climatiques.In the face of the climate emergency, forest management can contribute to the fight against climate change, notably through the production of wood products that sequester carbon out of the atmosphere for long periods of time, thereby substituting more polluting materials. Partial cutting, a silvicultural process that has been slow to be used more widely in Quebec, is gradually proving its potential in the boreal forest for adaptation and mitigation of climate change. The purpose of this thesis was to evaluate the performance of two types of partial cutting to create high quality wood products with long half-life cycle in the boreal forest. More specifically, the goal was to compare the effect of continuous cover irregular shelterwood and commercial thinning on growth potential of residual stems and wood product yield compared to the control scenario of clearcutting only. Using the Montmorency Forest as a case study, the 3-PG model was used to simulate the growth and harvesting of monospecific stands of balsam fir (Abies balsamea (L.) Mill) and white spruce (Picea glauca (Moench) Voss). Using StatSAW, the assortment of wood products from harvests was estimated for the different treatments. The most striking results were observed on the quadratic diameter of residual stems. For balsam fir, a gain of 1.9, 2.5 and 3.3 cm was observed following commercial thinning of 25%, 33% and 40% of the basal area respectively. For stands submitted to the continuous cover system, a gain of 5.6 and 3.3 cm was observed compared to the control at 70 and 90 years. For white spruce, a gain of 1.8, 2.5 and 3.2 cm was observed for the commercial thinning at 25%, 33% and 40% respectively. For the continuous cover, a gain of 5.1 and 3.6 cm was observed compared to the control (clearcut only) at 70 and 90 years. Despite the significant gains in diameter in both species, the cumulative assortment of products of the commercial thinning at the final cut of 70 years did not differ from the reference of clearcutting (without thinning). However, from a perpetual harvesting perspective, continuous cover irregular shelterwood showed the best potential for generating larger-sized wood products that can store carbon over long periods. The last harvest, which would be repeated in subsequent cuts, shows the highest sawnwood proportions, with the largest product sizes having high potential for construction use, where the longest half-life times are observed. To better establish the potential of partial cuts to address climate change, a full carbon budget would be required, including the carbon dynamics in ecosystems and wood products. Also, it would be necessary to evaluate the impact of natural disturbances, such as the spruce budworm, on stands treated by this type of harvesting. In conclusion, the results suggest that partial cuts, particularly when included in a continuous cover harvest system, have a strong potential to contribute to climate change mitigation