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Developmental trajectories of speech and language in neglected children aged 3 to 5 years : results of the ELLAN study
No full textBackground: Neglected children are at high risk for significant difficulties in speech and language development. Because no longitudinal study has been conducted to date, the dynamic description of development during the preschool period is unknown.
Objectives: Establish the developmental trajectories of speech sounds, receptive and expressive vocabulary, and morphosyntax among neglected children during the preschool years and compare them with those of non-neglected children.
Participants and setting: Participants are 69 neglected children and 99 same age non-neglected peers (37 and 46 males respectively) recruited at 36 months of age. Data were collected at home. Methods: Data were collected at six-month intervals between the ages of 3 and 5.5 years using psychometrically robust tools. Neglected and control groups were compared according to age using repeated measures ANOVAs on all variables. A discrete mixture model for clustering lon- gitudinal data was used for testing the heterogeneity of the language trajectories among neglected children.
Results: The language development of the neglected children as a whole group is lower than that of the control group for all variables. Two subgroups are identified within the neglected group: one with a developmental trajectory similar to that of the non-neglected children, and another whose trajectory is far below that of the control group. The effect sizes of these differences vary between 1.4 and 3 standard deviations under the mean.
Conclusions: A large proportion of neglected children present significant speech and language difficulties from the age of 3, but some of them catch up and develop similarly to non-neglected children
Contribution of farms to the microbiota in the swine value chain
No full textIntroduction: A thorough understanding of the microbial ecology within the swine value chain is essential to develop new strategies to optimize the microbiological quality of pork products. To our knowledge, no study to date has followed the microbiota through the value chain from live farm animals to the cuts of meat obtained for market. The objective of this study is to evaluate how the microbiota of pigs and their environment influence the microbial composition of samples collected throughout the value chain, including the meat plant and meat cuts.
Method and results: Results from 16S rDNA sequencing, short-chain fatty acid concentrations and metabolomic analysis of pig feces revealed that the microbiota from two farms with differing sanitary statuses were distinctive. The total aerobic mesophilic bacteria and Enterobacteriaceae counts from samples collected at the meat plant after the pre-operation cleaning and disinfection steps were at or around the detection limit and the pigs from the selected farms were the first to be slaughtered on each shipment days. The bacterial counts of individual samples collected at the meat plant did not vary significantly between the farms. Alpha diversity results indicate that as we move through the steps in the value chain, there is a clear reduction in the diversity of the microbiota. A beta diversity analysis revealed a more distinct microbiota at the farms compared to the meat plant which change and became more uniform as samples were taken towards the end of the value chain. The source tracker analysis showed that only 12.92% of the microbiota in shoulder samples originated from the farms and 81% of the bacteria detected on the dressed carcasses were of unknown origin.
Discussion: Overall, the results suggest that with the current level of microbial control at farms, it is possible to obtain pork products with similar microbiological quality from different farms. However, broader studies are required to determine the impact of the sanitary status of the herd on the final products
Approches par bandit : inférence statistique et partage d'information
No full textTitre de l'écran-titre (visionné le 6 septembre 2023)Ce mémoire aborde l'utilisation de stratégies d'allocation typiquement optimales pour des bandits contextuels, Lin-TS et Lin-RUCB, pour résoudre un problème d'inférence statistique sur des données collectées adaptativement par ces stratégies. L'inférence statistique est une étape très importante qui permet de tirer des conclusions par rapport aux données étudiées. Faire de l'inférence statistique sur des données collectées sur un environnement de bandit contextuel pose un défi technique parce qu'on cherche à tester une fonction. Ces stratégies apportent un biais dans les données collectées. Nous introduisons à cet effet des notions permettant de définir le concept d'inférence statistique sur des fonctions d'espérances. L'outil proposé est utilisé pour évaluer la qualité de l'inférence statistique conduite sur des données collectées par les stratégies d'allocation typiques optimales pour des bandits contextuels. Il est commun dans certains problèmes d'inférence statistique de séparer les données en groupe lorsque l'hypothèse sur les actions est qu'elles auront des fonctions de récompense différentes dans les différents groupes. Cependant, en pratique, il arrive que cette hypothèse soit fausse. Dans cette situation, il pourrait être bénéfique de partager les données recueillies sur cette action à travers les différents groupes, d'une part pour accélérer l'apprentissage et d'autre part pour améliorer la qualité de l'inférence statistique. Nous abordons donc ce nouvel environnement pour étudier les bénéfices du partage d'information entre des agents apprenant sur des problèmes de bandits contextuels. Une approche y est présentée pour étendre facilement les stratégies d'allocation existantes de manière à permettre un partage de données pour des actions spécifiques. À cet effet, nous introduisons Lin-TS-AC et Lin-RUCB-AC. Nous explorons ensuite l'application des stratégies proposées à des données simulées provenant d'une ancienne étude randomisée. En effet, nous montrons comment simuler un problème à partir de vraies données, ce qui nous permet d'évaluer les approches proposées sur un environnement plus proche de la réalité.This thesis discusses the use of typically optimal allocation strategies for contextual bandits, Lin-TS and Lin-RUCB, to solve a statistical inference problem on data collected adaptively by these strategies. Statistical inference is a very important step in drawing conclusions about the data under study. Doing statistical inference on data collected on a contextual bandit environment is technically challenging because we are trying to test a function. These strategies bring a bias in the collected data. To this end, we introduce notions to define the concept of statistical inference on expectation functions. The proposed tool is used to evaluate the quality of statistical inference conducted on data collected by typical optimal allocation strategies for contextual bandits. It is common in some statistical inference problems to separate the data into groups when the assumption about the actions is that they will have different reward functions in the different groups. However, in practice, sometimes this assumption is wrong. In this situation, it might be beneficial to share the data collected on this action across the different groups, both to speed up learning and to improve the quality of statistical inference. We therefore approach this new environment to study the benefits of information sharing between agents learning on contextual bandit problems. An approach is presented to easily extend existing allocation strategies to allow data sharing for specific actions. To this end, we introduce Lin-TS-AC and Lin-RUCB-AC. We then explore the application of the proposed strategies to simulated data from an old randomized study. Indeed, we show how to simulate a problem from real data, which allows us to evaluate the proposed approaches on an environment closer to reality
Beyond Hans Island : the Canada–Denmark agreement's possible impact on mobility and continental shelves
No full textThe governments of Canada and Denmark signed a historic agreement on Hans Island on 14 June 2022. Although most of the agreement was devoted to the resolution of the Hans Island dispute, it also settled other issues. We argue that provisions on mobility and the continental shelf in the Labrador Sea give rise to interesting precedents that could have far-reaching effects for northerners. The agreement on enhanced mobility could represent a first step in a more ambitious process of facilitating Inuit mobility across Nunavut and Greenland, while the settlement on the continental shelf illustrates how states could collaborate on other continental shelf cases, including the continental shelf in the Central Arctic Ocean
L'utilisation des sucres libres en remplacement des sucres totaux améliore-t-elle la performance des outils de profilage nutritionnel ?
No full textTitre de l'écran-titre (visionné le 2 octobre 2023)Avec une offre alimentaire grandissante et l’arrivée constante de nouveaux produits sur le marché, il peut devenir difficile d’identifier les produits alimentaires plus sains et de suivre l’évolution de la qualité de l’offre alimentaire. Le profilage nutritionnel se définit comme la science visant à classifier les aliments selon leur composition nutritionnelle dans le but de prévenir les maladies chroniques et de promouvoir la santé. Les outils de profilage nutritionnel ont été développés, entre autres, pour la caractérisation de l’offre alimentaire. Ils permettent de caractériser la qualité nutritionnelle globale d’un aliment ou d’une boisson en tenant compte de plusieurs nutriments et/ou composantes d’intérêt de santé publique. Plusieurs outils de profilage nutritionnel ont été développés à travers le monde, mais une faible proportion d’entre eux ont été validés. De plus, la majorité de ces outils incluent les sucres totaux dans leur algorithme, malgré les plus récentes évidences scientifiques associant plutôt les sucres libres comme étant principalement reliés aux problèmes de santé. Actuellement, aucun outil de profilage nutritionnel caractérisant la qualité globale des aliments n’a été spécifiquement validé au pays. Dans l’optique de déterminer quel outil de profilage nutritionnel serait le plus adapté au contexte québécois pour caractériser l’offre alimentaire, nos travaux ont évalué la validité de trois outils de profilage nutritionnel – le Health Star Rating System, le Nutri-Score et le Nutrient Rich-Food Index 6.3 – dans une cohorte québécoise. Les travaux ont également permis d’évaluer si l’inclusion des sucres libres en remplacement des sucres totaux dans l’algorithme de ces outils améliore leur performance. Les résultats de cette étude ont permis de démontrer que les trois outils évalués pourraient être utilisés au Québec, mais qu’aucun de ces outils ne se démarque des deux autres. De plus, le remplacement des sucres libres par les sucres totaux ne semble pas avoir une réelle valeur ajoutée actuellement. Ce mémoire met donc en lumière le potentiel d’utilisation d’outils de profilage nutritionnel au Québec et les différentes considérations à prendre en compte lors du choix d’un outil.With a growing food supply and the constant arrival of new products on the market, it can become difficult to identify healthier food products and to monitor the quality of the food supply. Nutrient profiling is defined as the science of classifying foods according to their nutritional composition to prevent chronic diseases and promote health. Nutritional profiling models have been developed, among other applications, for the characterization of the food supply. They evaluate the overall nutritional quality of a food or drink by considering several nutrients and/or components of public health interest. Several nutritional profiling models have been developed around the world, but only a small proportion of them have been validated. Furthermore, most of these models include total sugars in their algorithm, despite recent scientific evidence associating free sugars as being primarily related to health problems. Currently, no nutritional profiling tool characterizing the overall quality of foods exists in Canada or Québec. To determine which nutritional profiling model would be the most adapted to the Québec context to characterize the food supply, our work evaluated the validity of three nutritional profiling tools - the Health Star Rating System, the Nutri-Score and the Nutrient Rich-Food Index 6.3 - in a Québec cohort. The work also assessed whether the inclusion of free sugars as a replacement for total sugars improves the performance of these three models. The results of this study showed that the three tools evaluated could be used in Québec, but that none of these tools stood out from the other two. In addition, the replacement of free sugars by total sugars does not seem to have any real added value at present. This thesis therefore highlights the potential use of nutritional profiling models in Québec and the various considerations to be considered when choosing a nutrient profiling model
Copepods’true colors : astaxanthin pigmentationas an indicator of fitness
No full textPigmentation is often overlooked in zooplankton, since these organisms are mostly colorless to fit the translucid water medium. However, one of the dominant zooplankton taxa in aquatic ecosystems - copepods - often show a bright red-orange or blue coloration owing to the accumulation of carotenoid pigments in some parts of their bodies. Even though there are many functional traits describing copepod’s performance (e.g. size, feeding and reproductive modes), it is surprising that the role of such a simple and visible trait as coloration has not been studied in a coherent manner yet. Here, by reviewing 95 studies, we demonstrate that carotenoid-based pigmentation (mainly caused by astaxanthin molecules) is a widespread functional trait in freshwater and marine copepods. We propose a way to disentangle the complex and thus intriguing patterns of pigment expression along latitudinal and altitudinal gradients, addressing its relationship to diet quality and quantity, temperature, ultraviolet radiation stress, predation pressure, lipid metabolism, and reproduction. We also show that large scale variations in pigmentation are difficult to tackle because of the fundamental plasticity of this trait at short time scales (i.e. hours, days), and the most recent information about carotenoid bioconversion are addressed (genes and enzyme identification, influence of microbiota). From this literature review, we hypothesize that pigments play a “swiss-army knife” role for copepod’s fitness, useful in various ecosystem conditions, owing to the strong antioxidant power and the finely-tuned metabolism of astaxanthin. With larger antioxidant capacities (survival), higher metabolisms (growth) and more offspring in better condition (reproduction), red morphs appear more successful than their uncolored siblings. Also, the potential camouflage strategies allowed by red and blue pigmentation are discussed. We finally formulate new directions and future research fields from molecular to ecosystem scales. Routine quantifications of copepod’s pigmentation through trait-based approaches could be useful (1) to obtain an accurate copepod fitness indicator and (2) to better estimate the transfer of antioxidant to higher trophic levels in ecosystems, including humans
Modélisation de l'écoulement du béton frais
No full textTitre de l'écran-titre (visionné le 5 septembre 2023)Au vu de l'urgence climatique actuelle et des différents rapports scientifiques au sujet du dérèglement climatique, il est primordial et même vital de réduire drastiquement la pollution générée par l'Homme. Le dernier rapport du GIEC (Groupe d'experts Intergouvernemental sur l'Évolution du Climat) (2022) indique qu'il faut effectivement réduire de moitié les émissions d'ici 2030 et insiste fortement sur la nécessité d'agir immédiatement afin de préserver la planète. Dans ce sens, l'industrie de la production de béton est responsable de 4 à 8% des rejets totaux humains de dioxyde de carbone et doit donc urgemment évoluer afin de réduire son impact environnemental. L'objectif principal de cette étude est de participer à cette transition industrielle en développant un modèle numérique fiable et exploitable afin d'optimiser la production, diminuer le temps de malaxage et réduire le gaspillage du béton à l'aide des outils technologiques de contrôle qualité déjà mis en place. En effet, développer une simulation numérique permettant de mieux comprendre le comportement et les profils d'écoulement du béton frais à l'intérieur d'une toupie de malaxage est extrêmement prometteur puisqu'elle permet alors d'encore mieux optimiser les temps et les coûts de malaxage. Afin d'espérer exploiter un tel outil numérique complexe, la mise en place de modèles élémentaires d'écoulement du béton frais est essentielle afin de valider, caractériser et calibrer les simulations numériques. Dans ce mémoire, le développement de trois modèles simples d'écoulement est traité et les résultats obtenus ont permis de valider le comportement numérique de l'écoulement du béton frais. Chacun de ces modèles présente des forces et faiblesses et participe à la création d'un environnement de travail numérique qui permet de beaucoup mieux appréhender la rhéologie et le comportement d'écoulement du béton frais. Ce projet de recherche est donc une véritable porte d'entrée vers la modélisation complète de la production du béton frais.In view of the current climate emergency and the various scientific reports on climate change, it is essential and even vital to drastically reduce man-made pollution. The latest IPCC (Intergovernmental Panel on Climate Change) report (2022) indicates that emissions must be halved by 2030 and strongly emphasizes the need to act immediately to preserve the planet. In this sense, the concrete production industry is responsible for 4-8% of total human carbon dioxide emissions and therefore urgently needs to evolve to reduce its environmental impact. The main objective of this study is to participate in this industrial transition by developing a reliable and exploitable numerical model to optimize the production, reduce mixing time and also reduce concrete waste by using technological quality control tools already available. Indeed, developing a numerical simulation allowing to better understand the behavior and flow profiles of fresh concrete inside a mixing-truck is extremely promising as it allows for further optimization of mixing times and costs. In order to be able to exploit such a complex numerical tool, the implementation of elementary fresh concrete flow models is essential to validate, characterize and calibrate the numerical simulations. In this thesis, the development of three simple flow models is discussed and the results obtained are used to validate the numerical behavior of fresh concrete flow. Each of these models has strengths and weaknesses and contributes to the creation of a numerical working environment that provides a much better understanding of the rheology and flow behavior of fresh concrete. This research project is therefore a real gateway to a full modelling of fresh concrete production
Développement d’un analyseur de spectre optique cohérent utilisant un module laser à rétroaction répartie comme oscillateur local
No full textTitre de l'écran-titre (visionné le 2 octobre 2023)Ce mémoire s'intéresse au développement d'un analyseur de spectre cohérent (COSA) utilisant un module laser à rétroaction répartie (DFB) comme oscillateur local (LO). L'objectif est de concevoir un analyseur de spectre cohérent plus petit, robuste et moins chers en remplaçant les lasers à cavité externe normalement utilisés, permettant ainsi d'employer de tels appareils autant dans des environnements de recherche scientifique et d'ingénierie que sur des lignes de productions ou de liens de communication déployés. L'introduction présente les méthodes d'analyse du spectre optique existantes ainsi que leurs limitations et les avantages des analyseurs de spectre optique cohérents par rapport à ces méthodes. Les bases théoriques derrière le fonctionnement des COSA sont également présentées. Le premier chapitre décrit le montage expérimental du COSA utilisé dans le cadre du mémoire. Les deux branches le composant sont décrites et la calibration nécessaire au fonctionnement de l'appareil est présentée. Le deuxième chapitre caractérise les performances de l'appareil. Le rapport signal sur bruit optique (OSNR) et la largeur de raie du signal à la sortie de l'amplificateur optique semi-conducteur (SOA) du module laser DFB sont mesurés et comparés aux performances de la portion électrique du montage afin de déterminer la dynamique et la résolution du COSA. L'appareil est ensuite utilisé pour mesurer le spectre d'un laser à cavité externe, avec et sans modulation d'amplitude, ainsi qu'avec un laser DFB. On trouve expérimentalement que le système possède une dynamique pouvant atteindre plus de 50 dB et une résolution de 10 MHz correspondant à la largeur de bande des filtres RF utilisés
Multi-Modality Imaging in Aortic Stenosis an EACVI Clinical concensus Document
No full textIn this EACVI clinical scientific update, we will explore the current use of multi-modality imaging in the diagnosis, risk stratification, and follow-up of patients with aortic stenosis, with a particular focus on recent developments and future directions. Echocardiography is and will likely remain the key method of diagnosis and surveillance of aortic stenosis providing detailed assessments of valve haemodynamics and the cardiac remodelling response. Computed tomography (CT) is already widely used in the planning of transcutaneous aortic valve implantation. We anticipate its increased use as an anatomical adjudicator to clarify disease severity in patients with discordant echocardiographic measurements. CT calcium scoring is currently used for this purpose; however, contrast CT techniques are emerging that allow identification of both calcific and fibrotic valve thickening. Additionally, improved assessments of myocardial decompensation with echocardiography, cardiac magnetic resonance, and CT will become more commonplace in our routine assessment of aortic stenosis. Underpinning all of this will be widespread application of artificial intelligence. In combination, we believe this new era of multi-modality imaging in aortic stenosis will improve the diagnosis, follow-up, and timing of intervention in aortic stenosis as well as potentially accelerate the development of the novel pharmacological treatments required for this disease
Étude de la contribution de scores polygéniques à la prédiction du rendement en mathématiques à l'enfance
No full textTitre de l'écran-titre (visionné le 29 mai 2023)Introduction : Dans une perspective de prévention des difficultés scolaires, le rendement en mathématiques est à privilégier, notamment parce qu'il est fortement associé à la réussite scolaire et professionnelle ultérieure. Des facteurs environnementaux et génétiques contribuent à l'explication des différences individuelles quant au rendement en mathématiques. Néanmoins, les facteurs génétiques spécifiques et leur importance relative dans la prédiction du rendement en mathématiques demeurent inconnus. L'objectif de la présente étude est de mieux comprendre le rôle des facteurs génétiques mesurés en regard des facteurs sociodémographiques dans le développement des mathématiques à l'enfance. Méthode : La présente étude se base sur les données de 712 participants génotypés dans le cadre de l'Étude longitudinale du développement des enfants du Québec (ÉLDEQ). Un modèle d'équations structurelles de médiation a été testé, dans lequel deux scores polygéniques (Polygenic Scores, PGS) récemment construits, soit le PGS associé au niveau de diplomation (EduYears3 ou EY3) et le PGS lié aux habiletés cognitives générales (IQ3), ainsi que des facteurs sociodémographiques de la famille (revenu familial et niveau de scolarité des parents) prédisent le rendement en mathématiques à la fin du primaire via la connaissance des nombres à l'âge préscolaire. Résultats : La continuité du développement des mathématiques à l'enfance (de la connaissance des nombres au préscolaire au rendement en mathématiques à la fin du primaire) est prédite par un ensemble commun de facteurs étiologiques génétiques (IQ3) et sociodémographiques de la famille. Ces facteurs précoces prédisent la connaissance des nombres dans la direction attendue. La connaissance des nombres médie l'association prédictive entre ces facteurs précoces et le rendement ultérieur en mathématiques et tous les prédicteurs précoces, y compris EY3, contribuent directement au rendement ultérieur en mathématiques. La contribution de la connaissance précoce des nombres au rendement ultérieur en mathématiques s'avère plus importante pour les filles que pour les garçons et EY3 prédit la connaissance des nombres chez les garçons uniquement. Conclusion : Les résultats suggèrent qu'au-delà des facteurs sociodémographiques, les scores polygéniques EY3 et IQ3 prédisent de manière unique le rendement en mathématiques à la fin du primaire et que le rôle prédictif de IQ3 est en partie médiée par la connaissance des nombres à l'âge préscolaire. Cette étude souligne l'importance de considérer la génétique dans la compréhension des voies de développement des mathématiques. Les résultats contribuent au développement d'un modèle théorique du développement des mathématiques à l'enfance.Background : From the perspective of preventing academic difficulties, mathematical achievement is to be given priority, because it is strongly associated with subsequent academic and professional success. Environmental and genetic factors contribute to individual differences in mathematical achievement. Nevertheless, the specific genetic factors and their relative importance in predicting math achievement remain unknown. The objective of this study is to better understand the role of specific genetic factors above sociodemographic factors in the development of mathematics in childhood. Method : This study is based on data from 712 participants genotyped as part of the Quebec Longitudinal Study of Child Development (QLSCD). An integrated structural equation model (SEM) was tested, whereby two recently constructed polygenic scores (PGSs), namely the PGS associated with educational attainment (Eduyears3 or EY3) and the PGS associated with general cognitive abilities (IQ3), as well as family sociodemographic factors (family income and parents' educational attainment) predict math achievement at the end of primary school via preschool number knowledge. Results : Continuity in childhood mathematics development (from preschool number knowledge to math achievement at the end of primary school) is predicted by a common set of genetic (IQ3) and family sociodemographic factors. These early factors predict number knowledge in the expected direction. Number knowledge mediate the predictive association between these early factors and later math achievement and all early predictors, including EY3, directly contribute to later achievement in mathematics. The contribution of early number knowledge to later math achievement is greater for girls than for boys and EY3 predicts number knowledge in boys only. Conclusion : The results suggest that the polygenic scores EY3 and IQ3 predict achievement in mathematics at the end of primary school beyond well known sociodemographic factors and that the prediction from IQ3 is partly mediated by preschool number knowledge. This study highlights the importance of considering genetics in understanding the developmental pathways of mathematics. The results contribute to the development of a theoretical model of childhood mathematics development