University of Groningen Digital Archive
Not a member yet
    80723 research outputs found

    Reducing virulence of the human pathogen Burkholderia by altering the substrate specificity of the quorum-quenching acylase PvdQ

    No full text
    The use of enzymes to interfere with quorum sensing represents an attractive strategy to fight bacterial infections. We used PvdQ, an effective quorum-quenching enzyme from Pseudomonas aeruginosa, as a template to generate an acylase able to effectively hydrolyze C8-HSL, the major communication molecule produced by the Burkholderia species. We discovered that the combination of two single mutations leading to variant PvdQLα146W,Fβ24Y conferred high activity toward C8-HSL. Exogenous addition of PvdQLα146W,Fβ24Y dramatically decreased the amount of C8-HSL present in Burkholderia cenocepacia cultures and inhibited a quorum sensing-associated phenotype. The efficacy of this PvdQ variant to combat infections in vivo was further confirmed by its ability to rescue Galleria mellonella larvae upon infection, demonstrating its potential as an effective agent toward Burkholderia infections. Kinetic analysis of the enzymatic activities toward 3-oxo-C12-L-HSL and C8-L-HSL corroborated a substrate switch. This work demonstrates the effectiveness of quorum-quenching acylases as potential novel antimicrobial drugs. In addition, we demonstrate that their substrate range can be easily switched, thereby paving the way to selectively target only specific bacterial species inside a complex microbial community.

    Genetica op het web

    No full text
    Inleiding Klinische Genetica is de sectie van de afdeling Genetica in het UMCG die zich dagelijks bezighoudt met de patiëntenzorg van patiënten van de afdeling. Bij hen komen patiënten en zelfs families die erfelijkheidsonderzoek ondergaan. Per jaar verwerken zij ongeveer 6000 patiënten met erfelijke kanker, hartziekten of aangeboren aandoeningen. Het probleem van Klinische Genetica is dat de website tekortschiet in de presentatie naar de verschillende doelgroepen. Hierdoor is de informatievoorziening voor patiënten en verwijzers onvoldoende. Methode Om dit probleem op te lossen heb ik onderzoek gedaan naar de verschillende stakeholders voor de website. Ook verrichte ik deskresearch voor meer achtergrondinformatie. Ik hield verschillende interviews met patiënten, verwijzers en medewerkers om erachter te komen wat zij belangrijk vonden voor de website van Genetica en wat zij hier op willen zien. Daarnaast maakte ik gebruik van concurrentie, doelgroep en trendanalyses om erachter te komen hoe andere UMC’s zich verhouden tot het UMCG en welke trends er spelen binnen de bevolking en in welke segmenten de doelgroepen te verdelen zijn. Resultaten Tijdens mijn vooronderzoek kwam naar voren dat patiënten in veel verschillende groepen versplinterd zijn en dat deze kleine groepen zeer selecte wensen hebben. Ook maakt de bevolking steeds meer gebruik van nieuwe communicatietechnologie en stijgt de bevolkingsdichtheid evenals de zorgrekening. De UMC’s trekken steeds meer behandelingen naar zich toe en de ontwikkelingen op het gebied van genetica volgen elkaar in rap tempo op. Uit mijn interviews kwam naar voren dat de ondervraagden de website als niet goed ervaren. Zij vinden deze moeilijk te vinden en merken op dat de gebruikte woorden en labels te ingewikkeld zijn om snel te begrijpen. Dit nodigt hen niet uit om verder te klikken. Zij willen graag meer functionaliteit zien op de website die hun ervaring verbeterd en meer bruikbare informatie biedt. In de adviezen wordt getracht elke doelgroep en subgroep zo goed mogelijk tevreden te stellen door voor elk wat wils te bieden. Conclusie Ik adviseer Klinische Genetica onder andere om een lijst met links voor patiënten op te stellen, een filmpje te maken met een voorbeeldconsult en een lijst met uitslagtermijnen van onderzoek te presenteren. Daarnaast zou Klinische Genetica haar teksten moeten aanpassen en labels verduidelijken. De implementatie hiervan kan het beste verzorgd worden door stages en opdrachten te bieden aan studenten, zij zijn vele malen goedkoper maar kunnen niet voor elk punt ingezet worden vanwege hun gelimiteerde kennis en kunde. Door deze adviezen te implementeren verwacht ik dat de website van Klinische Genetica een sterke plaats inneemt bij de doelgroepen en hen duidelijk en helder kan informeren.

    Recently created man-made habitats in Doñana provide alternative wintering space for the threatened Continental European black-tailed godwit population

    No full text
    Over the last decades the Continental European population of black-tailed godwits, Limosa limosa limosa, has shown steep declines as a consequence of agricultural intensification on the breeding grounds. Although numbers have also declined in their traditional wintering areas in West-Africa, in the Doñana wetlands of southwestern Spain high nonbreeding numbers have persisted. Here we provide a long-term (35 year, 1977–2011) analysis of godwit numbers in Doñana. In fact, from the mid 1990s there has been a steep increase in numbers so that the fraction of godwits along this flyway that winters in Doñana increased from 4% in the late 1980s to 23% in 2011. These changes were not correlated with climatic conditions in Spain, nor in Sahel, but they were associated with changes in habitat availability – mainly an increase in man-made artificial wetlands. Commercial fish-farms and rice fields provide alternative habitats to the original seasonal marshlands for daytime roosting (mainly in the fish ponds) or nocturnal foraging (probably rice fields in addition to fish ponds). For migrating waterbirds, degradations of natural wetlands can thus be compensated by man-made alternative habitats. As the availability especially of such man-made areas is highly sensitive to short-term political/economic driven decision-making, they should be given greater consideration in global conservation plans.

    Monitoring and reducing the consumption of home electric appliances

    No full text
    De begeleider en/of auteur heeft geen toestemming gegeven tot het openbaar maken van de scriptie. The supervisor and/or the author did not authorize public publication of the thesis.

    Head and neck cancer in elderly patients

    No full text
    Hoofd-halskanker is de 6e meest voorkomende vorm van kanker. De behandeling kan bestaan uit een operatie, bestraling en chemotherapie, of een combinatie daarvan. Het aantal nieuwe gevallen van hoofd-halskanker blijft in de laatste jaren gelijk. Het percentage ouderen in de populatie stijgt echter en daarmee ook het aantal ouderen met hoofd-halskanker. Vaak worden oudere patiënten in de huidige praktijk anders behandeld dan jongere patiënten, hierbij wordt deze keus is gemaakt puur op leeftijd. De vraag is of dit terecht is, en daarom wordt in dit proefschrift gekeken of er verschillen tussen oudere en jongere patiënten zijn, met name als het gaat om complicaties na de behandeling. De resultaten zou kunnen helpen bij het maken van de beste keuze wat betreft behandeling. Uit de onderzoeken in dit proefschrift blijkt dat geen aantoonbaar verschil is in complicaties na de behandeling tussen oudere en jongere patiënten. Wel blijkt dat bij oudere patiënten complicaties moeilijker te voorspellen zijn op basis van factoren die voor de behandeling bekend zijn. Ook blijkt dat patiënten die naast de hoofd-halskanker nog met andere (chronische) ziektes belast zijn, vaker complicaties hebben die gerelateerd zijn aan deze ziektes. Complicaties gerelateerd aan operaties in het hoofd-halsgebied bleken daarentegen moeilijk te voorspellen. Concluderend kan gezegd worden dat keuze van behandeling bij hoofd-halskanker patiënten lastig blijft, maar dat hoge leeftijd alleen geen reden lijkt te zijn om andere beleid voeren. Dit geeft proefschrift een aantal handvatten om behandelkeuzes te onderbouwen en ingangen om verder onderzoek te doen. Head and neck cancer is the 6th most common type of solid cancer. Several types of treatment are available including surgery, radiation therapy and chemotherapy. The number of new cases of head and neck cancer is stabile over last couple of years. However the elderly population is increasing, therefore the absolute number of elderly patients with head and neck cancer is growing. In current practise, elderly patients with head and neck cancer are often treated differently compared to younger ones, based solely on age. There is a debate in literature whether elderly patients should be treated differently. Therefore this thesis aims to study differences between younger and elderly patients, with an emphasize on complications after treatment. The results can possibly guide the choice of treatment of elderly patients with head and neck cancer. The results from this thesis show that there is no significant difference in complications after treatment between younger and elderly patients. However, these complications are harder to predict in elderly patients. Patients with chronic diseases, aside from the head and neck cancer, more often develop complications after treatment related to their pre-existent illnesses. Complications related head and neck cancer surgery are harder to predict. In conclusion, choice of treatment remains difficult in elderly head and neck cancer patients, however there were no reasons found to treat elderly patients differently. This thesis provides more insights to better predict treatment outcomes, and new directions for future research.

    Weerbaarheidstraining binnen NOVO, een verkenning van motivatie en doelen

    No full text
    Samenvatting Uit de praktijk en de literatuur komt naar voren dat mensen met een verstandelijke beperking minder weerbaar zijn dan leeftijdsgenoten zonder een verstandelijke beperking. Ook is bekend dat weerbaarheidstrainingen effectief kunnen zijn om de kwetsbaarheid te verminderen en de weerbaarheid te vergroten. Om deze reden organiseert NOVO (zorginstelling voor mensen met een verstandelijke beperking) weerbaarheidstrainingen voor de cliënten. Voorafgaand aan de weerbaarheidstraining worden doelen opgesteld, die de cliënt wil behalen. In dit onderzoek is nagegaan of cliënten de vooropgestelde doelen realiseren met de training. Ook is onderzocht of er samenhang bestaat tussen de motivatie van de cliënt (onderzocht in eerder onderzoek van Van Schaick ) en het realiseren van de doelen. In dit onderzoek is sprake van secundaire gegevensanalyse op basis van het databestand van Van Schaick. Zij verzamelde data aan de hand van enerzijds dossiers van cliënten en anderzijds vragenlijsten aan gedragswetenschappers die de betreffende cliënten hebben doorverwezen naar de weerbaarheidstraining. In totaal zijn van 48 cliënten gegevens geanalyseerd. Uit de resultaten blijkt dat de cliënten over het algemeen gemotiveerd zijn om aan de weerbaarheidstraining deel te nemen. Als gekeken wordt naar de factor motivatie is het niet zo dat hoe gemotiveerder de cliënt is hoe meer doelen hij/zij met het volgen van de weerbaarheidstraining wil behalen. Gemiddeld worden 6.4 doelen per cliënt genoemd. De belangrijkste doelen die voorafgaand aan de weerbaarheidstraining worden gesteld hebben betrekking op het aangeven van grenzen, hebben van zelfvertrouwen en staande houden in sociale situaties. Over het algemeen wordt aangegeven dat het doel door het volgen van de weerbaarheidstraining ook daadwerkelijk is gerealiseerd. Ook blijkt dat na de gevolgde weerbaarheidstraining naast de opgestelde doelen ook andere doelen zijn gerealiseerd, welke niet zijn geformuleerd voorafgaand aan de training. Doelen die hierbij genoemd zijn, zijn op het gebied van geleerde vaardigheden, ontspannen en beheersing.

    An ultrafast surface-bound photo-active molecular motor

    No full text
    We report the synthesis and surface attachment of an ultrafast light-driven rotary molecular motor. Transient absorption spectroscopy revealed that the half-life of the rate determining thermal step of the rotary cycle in solution is 38 ± 1 ns, the shortest yet observed, making this the fastest molecular motor reported. Incorporation of acetylene legs into the structure allowed the motors to be grafted to azide-modified quartz and silicon substrates using the “click” 1,3-dipolar cycloaddition reaction.

    Conversational Flow

    No full text
    Alledaagse interacties beïnvloeden sociale relaties. In gesprekken met vrienden of vreemden, met individuen of groepen, letten we vaak op wat er gezegd wordt. Maar onafhankelijk van de inhoud, kan de vorm van het gesprek ook een sterke invloed hebben op gevoelens van saamhorigheid. Dit onderzoek laat zien dat aspecten van het gesprek die op het eerste gezicht triviaal lijken, als belangrijke signalen kunnen dienen voor de kwaliteit van sociale relaties en de mate waarin we denken het onderling eens zijn. De kunst van het gesprek speelt daarmee een rol in het ontstaan, bedreigen, veranderen en bevestigen van sociale relaties en sociale realiteit. Social interactions shape social relations. When engaged in conversation with friends or strangers, with individuals or groups, we often pay close attention to what is being said. But independent of content, the form of a conversation has a strong influence too, particularly for feelings of ‘we-ness’ and solidarity. In this thesis, we show that seemingly trivial aspects of a conversation act as signals for the quality of social relations and for levels of agreement among us. Whether conversations flow smoothly or whether a brief silence occurs can substantially change how certain we are about the relationship and about common views. The art of conversing can thus establish, threaten, change, or confirm social relations and social realities.

    Absence of hyperfine effects in 13C-graphene spin-valve devices

    No full text
    The carbon isotope 13C, in contrast to 12C, possesses a nuclear magnetic moment and can induce electron spin dephasing in graphene. This effect is usually neglected due to the low abundance of 13C in natural carbon allotropes (~1%). Chemical vapor deposition (CVD) allows for artificial synthesis of graphene solely from a 13C precursor, potentially amplifying the influence of the nuclear magnetic moments. In this work we study the effect of hyperfine interactions in pure 13C-graphene on its spin transport properties. Using Hanle precession measurements we determine the spin relaxation time and observe a weak increase of τs with doping and a weak change of τs with temperature, as in natural graphene. For comparison we study spin transport in pure 12C-graphene, also synthesized by CVD, and observe similar spin relaxation properties. As the signatures of hyperfine effects can be better resolved in oblique spin-valve and Hanle configurations, we use finite-element modeling to emulate oblique signals in the presence of a hyperfine magnetic field for typical graphene properties. Unlike in the case of GaAs, hyperfine interactions with 13C nuclei influence electron spin transport only very weakly, even for a fully polarized nuclear system. Also, in the measurements of the oblique spin-valve and Hanle effects no hyperfine features could be resolved. This work experimentally confirms the weak character of hyperfine interactions and the negligible role of 13C atoms in the spin dephasing processes in graphene.

    1,394

    full texts

    80,723

    metadata records
    Updated in last 30 days.
    University of Groningen Digital Archive
    Access Repository Dashboard
    Do you manage Open Research Online? Become a CORE Member to access insider analytics, issue reports and manage access to outputs from your repository in the CORE Repository Dashboard! 👇