University of Groningen Digital Archive
Not a member yet
80723 research outputs found
Sort by
Bacterial mass transport and adhesion using macroscopic fluorescense imaging
No full textMeer inzicht in transport bacteriën
In dit onderzoek, is er gekeken naar de effectiviteit van eerder gepubliceerde operon predictiemethodes en zijn er nieuwe methodes hiervoor ontwikkeld. Van de 29 gepubliceerde operon predictiemethoden waren er vier vrijelijk beschikbaar. Uit deze methoden is een lijst van vaak gebruikte indicatoren van operonen gedestilleerd en met deze lijst hebben we eigen operon predictiemethoden ontwikkeld. Deze methoden zijn gebaseerd op een minimale set van indicatoren die zijn gecombineerd met verschillende machine learning algorithmen.
In this research, we checked the effectiveness of previously developed operon prediction methods and we developed new methods for the prediction of operons. A total of 29 operon prediction methods were reviewed of which only 4 had implementations which were freely available. From these methods, the most commonly used indicators for operons were distilled. With these features we developed our own operon predictions. These predictions are based on minimal feature sets combined with various machine learning methods to yield accurate fast-learning cross-organism operon predictors. In the second part of this research, gene expression during the growth of L. lactis MG1363 was monitored using DNA microarrays. Trends in known processes were analyzed and new actors in these processes were identified. This resulted in a genetic network which can aid in the formulation of testable hypotheses and associated experiments.
Testosterone influences song behaviour and social dominance – But independent of prenatal yolk testosterone exposure
No full textIn the last two decades, maternally derived yolk androgens have been shown to significantly alter offspring development, and a number of these effects persist into adulthood. However, little is known about their underlying mechanisms. Mechanisms that have been suggested are changes in the endogenous androgen production post-hatching or changes in the sensitivity towards circulating androgens.
We tested the effects of yolk testosterone on the plasma testosterone levels and the sensitivity to testosterone in 5 months old male canaries that hatched from eggs that were either injected with testosterone (yT-males) or with a control solution (yC-males). Changes in sensitivity were investigated via the behavioural response to an experimental elevation of the plasma testosterone levels. We performed the experiment in fall (low endogenous testosterone production), focusing on testosterone dependent response traits (aggression and song).
Before implantation, there was a non-significant trend that the plasma testosterone levels were lower in yT-males than in yC-males. Elevating the plasma testosterone concentrations increased aggressiveness, song bout length and similarity of repeated song elements (=consistency), with the latter likely being a consequence of testosterone-driven song crystallization. However, these effects were not different among yT- or yC-males in any of the parameters. Thus, our findings render it unlikely that changes in the sensitivity to testosterone post-hatching would form the main underlying mechanism of hormone-mediated maternal effects in birds. Further experiments are urgently needed in order to understand the nature of the phenotypic effects resulting from embryonic exposure to maternal yolk testosterone.
Toward opening up the black box for market orientation
No full textThis thesis focuses on the concept of market orientation,
referring to the way in which a fi rm is organized such that it
may respond to changes in the market (Kohli and Jaworski
1990). This thesis studies how MO develops and induces innovation.
The central research question this thesis tried to
answer is: “How do intrafirm social networks of employees
produce or help produce MO and, consequently, improve
firm performance?”
This thesis assumes that employee’s social interactions
are a key element to shape individual employee’s MO and
innovation output. To further study how employees’ social
interactions affect Market Orientation to performance
link, this thesis used a Social Network (SN) perspective to
improve current understanding of how employees’ status
of being connected to others infl uence their MO behaviors
and innovation output. Four interrelated studies provide
an answer to this central research question, thus allowing
this thesis to contribute to the MO literature by accounting
for the role of social interactions in the workplace.
Essay: Perspectives in the research and safety of H2S-releasing NSAIDs for human use
No full textDe begeleider en/of auteur heeft geen toestemming gegeven tot het openbaar maken van de scriptie.
The supervisor and/or the author did not authorize public publication of the thesis.
Research report 2: Role of Dnmt3a isoforms in hematopoietic stem cell fate
No full textDe begeleider en/of auteur heeft geen toestemming gegeven tot het openbaar maken van de scriptie.
The supervisor and/or the author did not authorize public publication of the thesis.
Essay: Encoding process of neutral and emotional memory during stress
No full textDe begeleider en/of auteur heeft geen toestemming gegeven tot het openbaar maken van de scriptie.
The supervisor and/or the author did not authorize public publication of the thesis.
El Largo viaje de Semprún, testimonio ficción e historia.
No full textOnderzoek naar de functie van scriptie in het werk van Jorge Semprún en de plaats die het werk bemachtigd heeft in de Spaanse holocaust literatuur.
Local Adaptation or Dispersal? : How Pied Flycatchers Cope with Climate Change
No full textDit proefschrift onderzoekt de ecologische relatie tussen de timing van broeden bij vogels en voedselbeschikbaarheid in gematigde bossen. Fitness consequenties van asynchrone veranderingen tussen trofische niveaus, als gevolg van opwarming van het klimaat, worden experimenteel bestudeerd, en de mogelijkheden voor aanpassing door dispersie.
Bij Bonte Vliegenvangers, een lange-afstandstrekvogel, resulteerde klimaatverandering in een versterkte mismatch tussen broedtijd en het voedselpiek. Als gevolg daarvan wordt verwacht, dat fitness afneemt en de vogels zich moeten aanpassen: lokaal kan dit door het vervroegen van de timing van broeden, of anders door dispersie naar een meer geschikte locatie. De belangrijkste bevinding in dit proefschrift is dat, op dit moment, Bonte Vliegenvangers in deze Nederlandse populatie relatief goed omgaan met de veranderingen in het milieu. Verder werd aangetoond dat vroege broedsels grotere hoeveelheden rupsen in het dieet van de jongen hebben, maar alleen in eikenbos en niet in andere boshabitats. De experimentele studies geven aan dat synchronisatie met de rupsenpiek waarschijnlijk minder belangrijk is voor de fitness van de vogels dan eerder gerapporteerd. Gevonden werd, door experimentele translokatie van vliegenvangers naar Zweden, dat dispergerende individuen met hun genen en fenotypes kunnen bijdragen aan een andere populatie. Daarom zou lange afstanddispersie evolutionaire verandering naar een vervroegde broedtijd kunnen versnellen. In de toekomst zou dispersie een steeds belangrijker proces kunnen worden, waardoor mobiele soorten zich succesvol kunnen aanpassen aan de klimatologische veranderingen.
This thesis investigates the ecological links between timing of avian breeding and food abundance in temperate forests. Fitness consequences of asynchronous changes between trophic levels, resulting from climate warming, are experimentally studied, and the possibilities for adaptation through dispersal. In the migratory Pied Flycatcher, climate change resulted in an increased mismatch between brood rearing time and the food peak. As a consequence, fitness is expected to decline and birds need to adapt, either locally by advancing the timing of breeding, or through dispersal to a more suitable location. The main finding in this thesis is that, currently, Pied Flycatchers in this Dutch population cope relatively well with the environmental changes. Furthermore, it was shown that breeding early results in higher amounts of caterpillars in the nestling diet, but only in oak habitats and not in other forest habitats. However, the experimental studies indicated that synchrony with caterpillars is generally less important for the birds’ fitness than previously reported. It was found, by experimentally translocating flycatchers to Sweden, that dispersing individuals could contribute with their genes and phenotypes to another population. Hence, long-distance dispersal could potentially speed up evolutionary change towards earlier breeding. In the future, dispersal might be an increasingly important process by which mobile species can successfully adapt to on-going climatic changes.
Complex Regional Pain Syndrome type I and Amputation
No full textBij het Complex Regionaal Pijn Syndroom type I (CRPS-I) is er sprake van hevige pijn in een arm of been, die zich zonder aanwijsbare oorzaak of na een letsel ontwikkelt. De ernst van de pijn is disproportioneel in verhouding tot het uitlokkende moment. De pathofysiologie van CRPS-I is nog on¬bekend. De behandeling van patiënten met CRPS-I is intensief en duurt vaak lang. Bij een klein deel van de patiënten zijn de symptomen therapieresistent en de symptomen kunnen maanden tot jaren voortduren. Het aangedane ledemaat kan het doen van activiteiten van het dagelijks leven en arbeidsparticipatie fors negatief beïnvloeden. Wan¬neer alle geprobeerde behandelingen niet effectief zijn, komen sommige patiënten met het verzoek om een amputatie van het aangedane ledemaat.
Dit proefschrift heeft als doel behandelaars die geconfronteerd worden met patiënten met CRPS-I die vragen om een amputatie van goed gefundeerde informatie te voorzien. In hoofdstuk 2 wordt, op basis van een systematische literatuurstudie, beschreven wat er bekend is over de positieve en negatieve effecten van een amputatie bij CRPS-I. In hoofdstuk 3 wordt de impact van een amputatie op pijn, ADL- activiteiten en kwaliteit van leven beschreven. De relatie tus¬sen “veerkracht” en de uitkomsten na amputatie bij patiënten die vanwege CRPS-I een amputatie hebben ondergaan, wordt beschreven in hoofdstuk 4. In hoofdstuk 5 komt het proces van geïnformeerde besluitvorming tot amputatie bij CRPS-I aan bod. In hoofdstuk 6 worden de resultaten beschreven van een histopathologische studie waarin de karakteristieken van zenuwweefsel van de door CRPS-I aangedane en geamputeerde armen en benen werden onderzocht.
Complex Regional Pain Syndrome type I (CRPS-I) is characterized by severe pain in the distal part of an extremity that may develop spontaneously or after a noxious event. The intensity of the pain is disproportionate to the inciting event. The pathophysiology of CRPS-I is (still) unknown. Patients with CRPS-I may require long, intensive treatment (in accordance with national or international guidelines). In a small number of patients, the syndrome is therapy-resistant and persist for months or years. The dysfunctional limb may cause difficulties with daily life activities and the ability to work. After long series of failed treatment some of these patients request an amputation of the affected limb as a last resort therapy.
This thesis aimed at providing evidence for clinicians who are faced with requests for amputation from patients who are affected by CRPS-I. What is known in literature on beneficial and adverse effects of amputation in case of CRPS-I is described and discussed in the systematic review of the literature in chapter 2. The impact of an amputation on pain, participation in daily life activities, and quality of life is described in chapter 3. The association between resilience and post-amputation outcome of patients amputated because of CRPS-I is described in chapter 4. In chapter 5 aspects of the process of informed decision making in amputation for CRPS-I are described. In chapter 6 results from histopathological research on nerve tissue from the CRPS-I affected amputated limbs are described.
Selected Topics in International Monetary Economics
No full textOnderzoek naar de interbancaire markt van Pakistan
Muhammad Omer onderzocht de ongedekte rentepariteit (UIP) en overtollige liquiditeit in de interbancaire markt van Pakistan.
Interbank market of Pakistan has experienced a structural shift in June 2008
Muhammad Omer shows that Uncovered Interest rate Parity (UIP) holds for the LIBOR currencies over short horizon. This finding is an important addition to the existing literature on UIP.
A detailed examination of persistent liquidity in the interbank market of Pakistan shows that the interbank market has experienced a structural shift in June 2008. Before June 2008, low credit demand was driving (involuntary) excess liquidity holdings by banks. After June 2008, banks’ precautionary investments in risk free securities drive their (voluntary) liquidity holdings.
On studying the impact of this excess liquidity on monetary transmission, the results suggest that excess liquidity significantly affect the pass-through of the policy tools to the lending rate. It has no long-run impact on the pass-through of the policy tools to deposit rate and (growth of) exchange rate.