Repositório Científico de Acesso Aberto da ULisboa
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    95032 research outputs found

    The Project We Act: Informed Collective Activism Regarding Real-Life Problems as Part of an Ecojustice Network

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    The ‘We Act’ project was created in 2012 on the initiative of the author of this text and with the collaboration of a small group of educators from different levels of education—from pre-school to university—united by their common interest in Socio-Scientific Issues (SSI) and Socio-Environmental Issues (SEI) and convinced of the power of collective action grounded on research in empowering students as active citizens and social protagonists committed to promoting social and environ- mental justice. The activities developed by this initial group have succeeded in captivating the interest of many educators and students from different countries who have joined the project community.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

    Identifying determinants and consequences of drug-induced acute kidney injury

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    The thesis focuses on identifying the determinants and consequences of drug-induced acute kidney injury (AKI), investigating risk factors to enhance prevention strategies. Chapter 1 introduces the topic of AKI, providing a definition of the concept, its epidemiological context and summarising the evidence of its risk factors, diagnostic approaches and impact on the health system and the individuals' health and well-being. The main objective of the thesis (Chapter 2) was to contribute to the existing knowledge on the impacts of AKI on health and thus lead to formulate a hypothesis that an important proportion of medication-induced AKI cases occurring in hospitalized patients may be prevented by clinical pharmacy interventions. This thesis is structured into five chapters. We first take a health-system approach to understand why systems fail in preventing AKI (Chapter 3), we then focus on the individuals (Chapter 4), by exploring pharmacovigilance reports, and finalise by analysing the role of the clinical pharmacist in preventing AKI (Chapter 5), inferring on the extent to which international good practice examples could be adapted to the national context. In Chapter 3, we evaluated the real-world impact of hospital practices related to serum creatinine (SCr) testing on the identification and classification of AKI and its implications for drug dose adjustments. A historical cohort study was conducted using clinical records of all adult patients over a two-and-a-half-year period in a public general hospital serving the Tejo Estuary region, integrated into Portugal's National Health Service. The Acute Kidney Injury Network (AKIN) and Kidney Disease: Improving Global Outcomes (KDIGO) criteria were applied to determine AKI, considering the time intervals between two SCr tests as outlined by these criteria. Additionally, patients with SCr increases exceeding AKI limits, regardless of the time interval, were also identified. Estimated glomerular filtration rate (eGFR) and kinetic eGFR (KeGFR) were calculated, and medications requiring dose adjustment were identified. Any stage of AKI was identified in 7.0% of patients using AKIN criteria and in 9.1% using KDIGO criteria. Ignoring time limits for both criteria revealed AKI in 1,942 patients (11.2%), suggesting a potential underdiagnosis of AKI by 37.5% or 19.1%, depending on the criterion used. A total of 76 medications requiring dose adjustments in patients with eGFR ≤50 mL/min were prescribed in 78.5% of hospitalizations. These medications were prescribed in 87.9% of patients potentially underdiagnosed by AKIN criteria and in 88.9% considering KDIGO criteria. To identify the medications most frequently reported as AKI inducers, we conducted a case/non case study based on the Portuguese National Pharmacovigilance Database (Chapter 4). Over an 11-year period, we identified the effects of specific therapeutic classes and individual medications. Significant disproportionality was observed in three therapeutic subgroups: antithrombotic, antiviral, and antineoplastic agents. Eleven medications were identified as potentially associated with AKI, some well documented and others requiring further investigation. Disproportionality analysis suggested an association between AKI and dabigatran etexilate, simvastatin, emtricitabine, and mycophenolic acid. Chapter 5 discusses the results of the previous chapters, highlighting the strenghts of the work conducted while acknowledging the limitations of the conducted studies. Overall, this project underscored the necessity of modifying hospital protocols to increase the frequency of SCr testing. Early identification of patients who could benefit from pharmaceutical intervention was emphasized. The project also underlined the importance of spontaneous reporting of adverse drug reactions (ADRs), allowing the identification of some medications requiring additional investigation to validate their association with AKI. This study underscores the risks associated with certain drugs, emphasizing that these risks may be influenced by existing healthcare practices. As the healthcare professional responsible for pharmaceutical validation, the clinical pharmacist can play a pivotal part in the systematic monitoring of renal function, particularly in patients with known risk factors or those receiving medications associated with an increased risck of AKI. To ensure timely monitoring and appropriate therapeutic adjustments, organizational changes would be required, aligning with international best practices where pharmacists are authorized to request laboratory tests and adjust medication dosages as needed. Implementing these measures could significantly enhance the early detection of AKI and support preventive strategies, such as minimizing the use of medications with the potential to cause AKI or nephrotoxicity in at-risk populations

    Exploring quinone reductases from pathogenic bacterium Staphylococcus aureus

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    Tese de Mestrado, Bioquímica e Biomedicina, 2024, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasStaphylococcus aureus é um agente patogénico oportunista com uma grande versatilidade para colonizar diferentes ambientes. Este patógeno é capaz de colonizar praticamente todos os tecidos do corpo humano, causando doenças com diferentes manifestações e graus de severidade. Estas infeções são tratadas com antibióticos, no entanto, a continua exposição de S. aureus a estes, outrora eficazes para o seu combate, levou ao aparecimento de estirpes resistentes à meticilina (MRSA). Apesar de existirem antibióticos específicos e eficazes contra MRSA, esta é responsável pela maioria dos casos de infeções nosocomiais, especialmente em ambientes hospitalares, tornando-se uma ameaça para a saúde pública. MRSA é responsável pelo maior número de mortes por infeção, em indivíduos com idade superior ou igual aos quinze anos. Desta forma, o desenvolvimento de novos fármacos para combater este patógeno é prioritário. Compreender e identificar quais os fatores que conferem versatilidade a este microrganismo podem ser propostos como alvos terapêuticos. Alguns dos fatores que se sabem ser fundamentais para a sobrevivência deste organismo patogénico estão relacionados com o metabolismo energético e com a cadeia respiratória do mesmo. Assim, visando alargar os conhecimentos nestas áreas, o trabalho desenvolvido no âmbito desta dissertação focou-se na investigação da proteína piruvato quinona oxidoreductase (PQO), a qual se encontra possivelmente associada à cadeia respiratória de S. aureus. Esta investigação levou a uma caracterização integrada da PQO a níveis moleculares e celulares. Segundo a literatura a PQO é uma proteína monotópica, isto é, que se liga somente a um lado da membrana, e catalisa a descarboxilação oxidativa de piruvato a acetato com a redução de menaquinona a menaquinol, fornecendo assim este substrato à cadeia respiratória. Realizou-se, primeiramente, uma análise in silico desta proteína de maneira a formular hipóteses quanto à sua estrutura, nomeadamente, domínios e locais de ligação à membrana. A partir destas análises foi possível verificar que a PQO é maioritariamente composta por hélices alfa, cerca de 61 %, assim como outras proteínas monotópicas. De acordo com a literatura pode-se determinar os locais de ligação dos substratos e cofatores à proteína com base em softwares de predição. Procedeu-se assim à identificação dos domínios que a proteína contém, sendo estes: dois domínios de ligação ao pirofosfato de tiamina (TPP), um domínio de ligação à flavina (FAD) e o C-terminal. Por fim, e tendo em conta o comportamento de proteínas que desempenham a mesma função, mas em outros organismos, em particular a piruvato oxidase de E. coli, realizou-se um estudo quanto à função do C-terminal da PQO de S. aureus. Neste verificou-se que o C-terminal pode ser considerado o responsável pela ligação da PQO à membrana de S. aureus e estudos preliminares de docking molecular sugerem também que é no C-terminal que ocorre a interação da menaquinona com a proteína. A produção de PQO recombinante de S. aureus foi realizada na estirpe Rosetta de E. coli. Através de vários passos de purificação foi possível obter extratos solúveis, que foram submetidos a uma cromatografia de afinidade, na qual se adquiriu frações contendo PQO. A pureza foi avaliada por géis de SDS-PAGE. Foi igualmente avaliada a capacidade redox da proteína para determinar a viabilidade da mesma para futuros testes de atividade. Tratando-se de uma flavoproteína, ou seja, que contém FAD como cofator, a PQO apresenta um espetro de absorção UV-visível característico, com bandas a 375 nm e a 450 nm, quando no estado oxidado. A redução da proteína e, consequentemente, do FAD leva ao desaparecimento destas bandas. Deste modo, é possível seguir o estado de oxidação da PQO pelos diferentes espectros de absorção UV-visível. Através das análises realizadas verificou-se que a PQO isolada era reduzida por piruvato e oxidada por 2,3-Dimethyl-1,4-naphthoquinone (DMN), um análogo da menaquinona. Assim, conclui-se que a PQO se encontra redox ativa e é capaz de utilizar aqueles dois compostos como substratos. Para que a reação da PQO ocorra, segundo a literatura, é necessária a presença de FAD, TPP e Mg2+ como cofatores. A dependência destes cofatores foi confirmada em ensaios de atividade enzimática com a PQO presente na membrana, no entanto, verificou-se ainda que outro componente importante para a mesma era a presença de fosfatos. A importância destes sugere que a reação da PQO leva à formação de acetil-fosfato em vez de acetato como produto final. Diferentes substratos aceitadores de eletrões (DCPIP, DMN e citocromo c) foram testados na reação enzimática da PQO. Os resultados obtidos sugerem que o local de ligação à DMN na PQO isolada possa estar obstruído, dado que a atividade especifica em DMN e DMN-citocromo c foi menor que o esperado. Por outro lado, verificou-se que a atividade especifica com DCPIP era bastante superior à dos outros dois aceitadores de eletrões o que sugere que este tenha um local de ligação diferente do local onde o DMN se liga, permitindo-lhe uma maior acessibilidade. Desta forma, utilizando DCPIP como aceitador de eletrões, elaborou-se o perfil de pH para a PQO de modo a verificar-se qual o pH ideal para a atividade enzimática da proteína. A partir do valor obtido, pH 6.25, realizaram-se os ensaios cinéticos dos quais se concluiu que a atividade da PQO é inibida por um dos seussubstratos, neste caso, o piruvato, e por citrato. De modo a estudar a interação proteína-substrato realizaram-se ensaios de fluorescência da emissão dos triptofanos, nos quais se observou um quenching de fluorescência aquando da adição dos substratos testados. Estes revelaram que a PQO tem uma afinidade semelhante para o piruvato e para a DMN e que esta é maior do que a afinidade da PQO para o citrato. Estes resultados estão de acordo com o esperado, dado que o piruvato e a menaquinona são os substratos da proteína in vivo. A realização dos mesmos ensaios, mas na presença do inibidor citrato, revelaram ainda que a afinidade da PQO para a DMN e para o piruvato não é afetada pela sua presença, sugerindo assim que a inibição do citrato ocorre por um mecanismo não competitivo. O estudo da importância da PQO para S. aureus foi realizado através de ensaios celulares em que se fez o crescimento das estirpes de S. aureus MW2 wild type e knockout do gene da pqo. Estes estudos revelaram que a PQO desempenha um papel crucial na sobrevivência de S. aureus em condições com excesso de glucose, sendo que dos três crescimentos em excesso de glucose (10 mM, 14 mM e 15 mM), apenas na condição com a menor concentração de glucose a estirpe ∆pqo sobreviveu. Os ensaios sugerem também que a expressão da PQO é influenciada pelo pH do meio, mas especialmente pela concentração de glucose, em que uma maior concentração leva à maior expressão de PQO. Observouse que quanto maior a concentração inicial de glucose no meio, menor era o pH deste às 5 horas de crescimento, indicativo de uma maior produção de acetato. Através desta observação é provável que a importância da PQO na sobrevivência de S. aureus esteja relacionada com o mecanismo de inibição de expressão de cidC, gene que codifica a PQO. Sob stress acídico, o gene cidA inibe a expressão de cidC, levando a menores quantidades de PQO e, consequentemente, menor quantidade de acetato produzido. Em suma, os resultados obtidos neste trabalho avançaram a nossa compreensão do enzima piruvato quinona oxidoreductase, bem como reforçam a hipótese de se tratar de uma proteína da cadeia respiratória de S. aureus. Revelaram ainda que esta proteína é essencial para a sobrevivência de S. aureus em condições com excesso de glucose.Staphylococcus aureus is an opportunistic pathogen and represents the most frequent cause of nosocomial infections. As cases of S. aureus infection increase, various antibiotics have been developed. Although these are viable strategies to treat these infections, new strains of S. aureus with resistance to antibiotics continue to emerge. This has led S. aureus to become a major global health issue, making the development of new drugs against this pathogen urgent. Since energy metabolism is essential to all organisms, studying the proteins and mechanisms involved in it may lead to novel approaches for targeting this pathogen. We aim to contribute to the understanding of S. aureus metabolism by exploring pyruvate:quinone oxidoreductase (PQO), a monotopic protein hypothesized to be involved in its respiratory chain. We performed a throughout characterization involving biochemical, biophysical, and cellular methodologies. In silico analyses of PQO indicate that its C-terminal is responsible for the binding to the membrane and for the interaction with menaquinone. Optimal conditions for PQO’s activity were determined, showing that it exhibits maximal activity at pH 6.25. The kinetic parameters were obtained, indicating that PQO’s reaction is inhibited by one of its own substrates, pyruvate. Activity assays performed with 2,3-Dimethyl-1,4-naphthoquinone (DMN) support the idea that PQO uses menaquinone as an electron acceptor in vivo, and therefore is part of the respiratory chain of S. aureus. Citrate was shown to act as an inhibitor of PQO’s reaction through a non-competitive mechanism. Cellular analysis revealed that PQO is crucial for S. aureus survival at high levels of glucose and suggested that PQO’s expression is influenced by glucose concentration and pH. Overall, these findings improve our understanding of PQO’s role in S. aureus and its relevance to the pathogen’s survival in high glucose environments

    Comparative genome analysis of morphologically distinct populations of Rhipicephalus sanguineus (Latreille, 1806)

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    Tese de mestrado, Biologia Humana e Ambiente, 2024, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasTicks are arthropod hematophagous parasites that can transmit pathogens to animals, including humans. So, the accurate discrimination of species is important for understanding epidemiological context of the pathogens they might transmit. Closely related tick species, and different populations within a tick species, can evidence diverse ability to transmit pathogens. The main objective of the present study was to know if the Rhipicephalus sanguineus specimens of different populations collected from vegetation with two distinct morphologies may be distinguished by the mitochondrial genes COI and rRNA 16S, and the nuclear ribosomal internal transcribed spacer 2 (ITS2). A total of 75 specimens were collected in four areas with two set of morphologies, which were morphometrically characterised based on female genitalia and male and female spiracles. DNA was successfully extracted from 38 specimens and 56 products of PCR were obtained for COI, 16S and ITS2 markers. Sequences obtained were subjected to Blast in the NCBI databases, p–distance estimations and Maximum Likelihood (ML) phylogenetic reconstructions. The morphologies identified, designated as morphology A and morphology B, evidenced significant differences (p–value 0.01) in all studied traits of female and male. While 16S and ITS2 markers did not fully contribute for accurate molecular distinctions, COI sequences from individuals of both morphologies evidenced values of p-distance of 1%, in strict correspondence to four polymorphic positions, also segregating in distinct well-supported clades in the ML phylogenetic tree. For the first time, a clear molecular distinction between the two morphologies was identified but, unless further studies prove specific discrimination, most likely they still are members from the same species. However, few sequences were analysed for 16S and ITS2 markers. Further research on nuclear markers and whole genome sequencing are required to fully elucidate the level of genomic discrimination between these morphotypes, like between mitochondrial and nuclear genes

    Metabolomics and top-down proteomics for the characterization and identification of Bacillus cereus strains as biowarfare agents

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    Tese de mestrado, Bioquímica e Biomedicina, 2025, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasThe use of bio-toxins and microorganisms as bioweapons represents a significant threat to society, leading to increased focus on microbial forensics for the identification and characterization of these biological agents. Matrix-assisted laser desorption-ionization-time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometry (MS) has been commonly employed for bacterial and spore biotyping. Contrary to genome sequencing, MALDI-TOF MS allows a fast classification of a wide range of bacteria, by low trained personal, being used in clinical and biodefense fields. However, as a fingerprinting method, MALDITOF MS identifies species by comparing the spectral pattern of unknown organisms with multiple spectra of characterized microorganisms stored in a database. Consequently, it struggles to differentiate species with high genetic similarity, such as the genus Bacillus, which includes both harmful (e.g., B. cereus) and harmless strains. This biotyping challenge can have deeply social and economic implications, especially during outbreaks. This study aims the development of a new molecular approach for microorganism classification, from its spores, using metabolomics and proteomics coupled with Fourier transform ion cyclotron resonance (FT-ICR) MS. Despite the similarity shared between the six spore strains analysed, including five from B. cereus and one from B. cytotoxicus, untargeted metabolomics reveals specific compound classes – such as long-chain fatty acids (LCFA), monoacylglycerols (MGs), and acylcarnitines, to name a fewthat enabled effective spore segregation. Furthermore, despite the enigmatic nature of spore population heterogeneity, the same metabolic cohort enabled a fine classification of hydrophobic and hydrophilic spores arising during the inactivation procedure. The detection of proteins during the MS analysis triggered the development of a new software tool, CapiDown, validated for the identification of unknown bacterial proteins under a single-shot top-down approach. Using both metabolomics and top-down proteomics to classify Bacillus cereus spores a complementary and comprehensive understanding of their biochemical profile is obtained, providing new insights for microbial forensic research

    The ADnet Bayesian belief network for alder decline: Integrating empirical data and expert knowledge

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    The globalization in plant material trading has caused the emergence of invasive pests in many ecosystems, such as the alder pathogen Phytophthora ×alni in European riparian forests. Due to the ecological importance of alder to the functioning of rivers and the increasing incidence of P. ×alni-induced alder decline, effective and accessible decision tools are required to help managers and stakeholders control the disease. This study proposes a Bayesian belief network methodology to integrate diverse information on the factors affecting the survival and infection ability of P. ×alni in riparian habitats to help predict and manage disease incidence. The resulting Alder Decline Network (ADnet) management tool integrates information about alder decline from scientific literature, expert knowledge and empirical data. Expert knowledge was gathered through elicitation techniques that included 19 experts from 12 institutions and 8 countries. An original dataset was created covering 1189 European locations, from which P. ×alni occurrence was modeled based on bioclimatic variables. ADnet uncertainty was evaluated through its sensitivity to changes in states and three scenario analyses. The ADnet tool indicated that mild temperatures and high precipitation are key factors favoring pathogen survival. Flood timing, water velocity, and soil type have the strongest influence on disease incidence. ADnet can support ecosystem management decisions and knowledge transfer to address P. ×alni-induced alder decline at local or regional levels across Europe. Management actions such as avoiding the planting of potentially infected trees or removing man-made structures that increase the flooding period in disease-affected sites could decrease the incidence of alder disease in riparian forests and limit its spread. The coverage of the ADnet tool can be expanded by updating data on the pathogen's occurrence, particularly from its distributional limits. Research on the role of genetic variability in alder susceptibility and pathogen virulence may also help improve future ADnet versions.info:eu-repo/semantics/acceptedVersio

    Deteção da mutação do gene MDR1 em cães de raças portuguesas com aptidão para o pastoreio

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    Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina Veterinária, área científica de ClínicaUma deleção de 4 pares de bases no gene MDR1, mais recentemente referido como gene ABCB1, leva à formação de codões stop que fazem com que a síntese da glicoproteína P (gp-P) termine precocemente. A gp-P é uma proteína transportadora de efluxo de grande importância, sendo expressa principalmente na barreira hematoencefálica, no fígado e nos intestinos, bem como em alguns tumores. Consequentemente, os cães portadores de pelo menos um alelo mutado, apresentam alterações no metabolismo de certos fármacos e uma maior suscetibilidade à toxicidade dos mesmos. Esta mutação foi detetada em várias raças em diferentes países, sendo a maioria delas raças pastoras, como Collie e Pastor Australiano, mas também Whippet de pelo comprido e alguns cães de raças cruzadas. Até à data, segundo o nosso conhecimento, apenas se realizou um estudo em cães de raças pastoras portuguesas, onde se detetaram alguns genótipos heterozigóticos em cães da raça Barbado da Terceira. No entanto, ainda permanece por averiguar a presença desta mutação noutras raças pastoras portuguesas. Por esta razão, o principal objetivo deste estudo foi avaliar a presença da mutação MDR1 em cães de raça Rafeiro do Alentejo. As amostras de saliva para extração de DNA foram obtidas através de zaragatoas orais realizadas aos animais incluídos no estudo. O processamento da amostra incluiu a realização de PCR e sequenciação de DNA. Para avaliar se houve evidência da ocorrência de efeitos adversos que possam ser associados à administração de substratos da gp-P, foi enviado aos detentores um questionário que visava obter informação que levasse à identificação da ocorrência da mutação. A amostra populacional incluiu 42 cães da raça Rafeiro do Alentejo, 3 da raça Barbado da Terceira, 10 da raça Pastor Australiano, 4 da raça Pastor Alemão, 1 da raça Pastor de Shetland e 1 da raça Bobtail. Os resultados obtidos indicaram que todos os animais apresentavam genótipo wild-type, com exceção de um cão da raça Pastor Australiano que apresentava genótipo heterozigótico. Os resultados obtidos neste estudo não evidenciam a presença da mutação do gene MDR1 na raça Rafeiro do Alentejo, o que é positivo para os seus criadores, que assim podem reproduzir os animais sem restrições, mas também para os médicos veterinários que poderão utilizar com maior confiança os fármacos substratos da gp-PABSTRACT - DETECTION OF THE MDR1 GENE MUTATION IN PORTUGUESE HERDING DOGS - A 4-base pair deletion in the ATP-binding cassette subfamily B member 1 (ABCB1) gene, also known as the multidrug resistance gene (MDR1), results in stop codons that prematurely terminate the synthesis of P-glycoprotein (gp-P), a critical efflux transporter expressed mainly in the blood-brain barrier, liver and intestines, as well as in some tumors. As a result, dogs carrying the mutation exhibit impaired drug metabolism and heightened susceptibility to drug toxicity. This mutation has been detected in several breeds in different countries, being most of them herding breeds, like Collie and Australian Shepherd but also Longhaired Whippet and some mixed breed dogs. To our knowledge, only one study was conducted on Portuguese herding breed dogs and this study found some heterozygote genotypes in Barbado da Terceira dogs. However, there´s still some information lacking regarding this mutation in other Portuguese herding breed dogs. For this reason, the main objective of this study was to assess the presence of the MDR1 mutation in Rafeiro do Alentejo. Saliva samples for DNA extraction were obtained through oral swabs taken from the animals included in the study. Sample processing included PCR and DNA sequencing. To assess whether there was evidence of adverse effects that could be associated with the administration of gp-P substrates, a survey was sent to the owners with the aim of obtaining information that would lead to the identification of the occurrence of the mutation. The population sample included 42 Rafeiro do Alentejo, 3 Barbado da Terceira, 10 Australian Shepherd, 4 German Shepherd, 1 Shetland Shepherd and 1 Bobtail. The results showed that all the animals had a wild-type genotype, apart from one Australian Shepherd which had a heterozygous genotype. The results obtained in this study do not show the presence of the MDR1 gene mutation in Rafeiro do Alentejo, which is positive for its breeders, who can then breed the animals without restrictions, but also for veterinarians who will be able to use gp-P substrate drugs with greater confidenceN/

    50 anos de construção de uma democracia participativa em matérias ambientais

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    info:eu-repo/semantics/publishedVersio

    Bacterial virulence, the site of infection and patient age in critical care medicine: impact on the outcomes : cluster analysis

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    Trabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2024A sépsis é uma doença complexa prevalente entre os doentes críticos, embora a sua evolução não seja necessariamente semelhante em todos os doentes. Para melhor compreender a heterogeneidade da sépsis e otimizar o tratamento e o prognóstico destes doentes, este estudo procurou identificar clusters distintos e significativos entre os doentes infetados. Realizámos uma análise retrospetiva de uma base de dados observacional prospetiva. O principal objetivo foi obter informações sobre a influência da virulência bacteriana, do local de infeção e da idade do doente nos resultados em Medicina Intensiva. Foram analisados retrospetivamente os dados dos doentes admitidos entre janeiro de 2015 e dezembro de 2019 no Serviço de Cuidados Intensivos do Hospital Vila Franca de Xira. Identificámos quatro outcomes primários: Taxa de mortalidade na UCI e no Hospital, Tempo de internamento na UCI e no Hospital (LOS). Foram incluídos no estudo 1923 doentes, dos quais 721 (37.5%) apresentaram pelo menos um isolamento microbiológico positivo durante o internamento. Os doentes infetados foram mais velhos e tinham gravidade clínica, traduzida na pontuação SAPS II mais elevada. A mortalidade e o tempo de internamento, tanto na UCI como no hospital, foram significativamente mais elevados nos doentes infetados, e estes necessitaram mais frequentemente de terapêutica de suporte de órgãos. Através da análise de clusteres, foi possível individualizar 5 grupos: doentes com Enterobacterales em amostras urinárias (1), doentes mais jovens com S. aureus isolado em hemocultura (2), doentes mais velhos com Candida spp isolada em amostras respiratórias (3), doentes com Pseudomonas aeruginosa isolada a partir de exsudados (4) e doentes com bacilos gram-negativo isolados em hemoculturas (5). Registaram-se diferenças significativas nas suas trajetórias, quer na UCI quer no hospital. Em conclusão, a análise de clusters realizada forneceu informações importantes sobre a complexa interação entre a virulência bacteriana, o local da infeção e os outcomes dos doentes em medicina intensiva, apoiando estudos futuros para o desenvolvimento de intervenções mais personalizadas e novas estratégias terapêuticas para a população de doentes sépticos.Sepsis is a complex disorder that remains prevalent among critically ill patients. Contrary to the classical “one-size-fits-all” approach, sepsis does not seem to progress and manifests similarly in all patients, due to many intrinsic and extrinsic variables. To better understand the heterogeneity of sepsis and improve treatment and prognostication, this study sought to identify meaningful distinct clusters among infected patients. We conducted a retrospective analysis of a prospective observational database. The main goal of this study was to provide information about the influence of bacterial virulence, the site of infection, and the patient’s age on the outcomes in Critical Care Medicine. Data from patients admitted between January 2015 and December 2019 in the Intensive Care Department of Hospital Vila Franca de Xira was retrospectively analyzed. We identified four primary outcomes: ICU and Hospital mortality rate, ICU and Hospital length of stay (LOS). We included 1923 patients, of whom 721 (37.5%) had at least one microbiological isolate during their ICU stay. Infected patients were older and had a higher SAPS II score. Their ICU and Hospital, both mortality and LOS, were significantly higher and they more often required organ support therapy. We identified 5 clusters: patients with Enterobacterales recovered from urinary samples (1), younger patients with S. aureus isolated in the bloodstream (2), older patients with Candida spp isolated from respiratory samples (3), patients with Pseudomonas aeruginosa isolated from purulent skin discharges (4) and patients with gram-negative organisms isolated in the bloodstream (5). Notable differences were found in their ICU and hospital trajectories. In conclusion, the cluster analysis conducted provided valuable insights into the complex interplay between bacterial virulence, infection site, and patient outcomes in critical care medicine, supporting future studies to develop tailored interventions and new clinical therapies

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