Repositório Científico de Acesso Aberto da ULisboa
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Exploring silicone functionalization with surfactins towards the improvement of medical devices antimicrobial properties
No full textTese de mestrado, Química Medicinal e Biofarmacêutica, 2023, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia.O uso recorrente de antibióticos, seja em ambiente hospitalar, na alimentação animal, ou mesmo na agricultura, tem desencadeado resistência bacteriana e levado a dificuldades na prevenção e tratamento de infeções bacterianas (1,2). Segundo a Organização Mundial da Saúde (OMS), mais de 50% das infeções bacterianas, que podem levar à morte, estão associadas ao desenvolvimento de resistências, colocando assim a população em perigo (3). As infeções associadas aos cuidados de saúde (IACs) são a principal causa de morte evitável em doentes hospitalizados, sendo um problema alarmante nos dias de hoje. Dentro destas é possível destacar as infeções relacionadas com o uso de dispositivos médicos que embora salvem muitas vidas possuem superfícies propicias à colonização por microrganismos.
Considerando os dados relatados, os estudos atuais devem focar-se em estratégias eficazes para prevenir a colonização das superfícies dos dispositivos médicos, a fim de evitar infeções por bactérias altamente resistentes ou mesmo multirresistentes. Diferentes estratégias têm vindo a ser desenvolvidas para melhorar as propriedades antimicrobianas dos dispositivos médicos, evitando a adesão de microrganismos e novas infeções. Estas estratégias podem ser passivas, repelindo bactérias através de modificações físicas ou químicas, por exemplo, modificando a hidrofilia das superfícies, ou abordagens ativas, que revestem superfícies com agentes antimicrobianos capazes de interferir com as células microbianas. Têm sido sugeridos revestimentos que e incluem a libertação de agentes antibacterianos (e.g., antibióticos, antissépticos, óxido nítrico e prata), estratégias de morte por contacto (e.g., compostos amónio quaternário, quitosano, peptídos antimicrobianos e enzimas) ou estratégias anti adesivas (4,5). Os biotensioativos (BT) podem ser uma alternativa interessante nesta temática uma vez que são biocompatíveis, biodegradáveis e pouco tóxicos, apresentam diferentes aplicações ambientais e atividade antimicrobianas (6,7).
O principal objetivo deste trabalho é o desenvolvimento de um novo biomaterial revestido com BT, indicado para a utilização como cateteres médicos que seja eficaz contra a formação de biofilmes.
Neste trabalho é apresentado o uso de BT como potenciais agentes antimicrobianos contra a Staphylococcus aureus. O primeiro passo foi realizar a produção de soforolípidos (SLs) pela levedura Starmerella bombicola e da surfactina (SF) pela pela bactéria Bacillus subtilis. Os SLs foram produzidos em meio GPY suplementado com ácido oleico, obtendo-se um rendimento médio de 11,07 0,59 g/L. Para a produção de SF foram testados três meios de cultura diferentes, suplementados ou não com Mn2+, tendo as produções terminado ao fim de 72h ou 144h. Verificou-se que o rendimento foi superior (0,69 ± 0,09 g/L) quando se usou o meio MSM não suplementado com Mn2+ ao fim de 72 h.
A caracterização dos BT produzidos foi realizada por cromatografia em camada fina (TLC) e cromatografia líquida de alta eficiência acoplada à espectrometria de massa (HPLC-MS). A mistura de SLs obtida apresentou na sua composição SLs acídicos (C18:1 de, mono e di-acetilados) e lactónicos (C16:0 diacetilado, C18:0 diacetilado, C18:1 mono e diacetilado e C18:2 diacetilado). A análise das amostras da produção de SF revelou a existência de cinco congéneres de surfactina e também iturina (um BT da mesma família). Os congéneres de iturina apresentaram um tempo de retenção entre os 14,86 min e 16,42 min, com m/z [M+H]+ 1030, 1044, 1058, 1072 e 1086. Os congéneres de surfactina apresentaram um tempo de retenção entre 34,24 min e 47,80 min, sendo possível identificar o congénere C12 com m/z 995 [M+H]+ e 1017 [M+Na]+, o congénere C13 com m/z 1009 [M+H]+ e 1031 [M+Na]+, o congénere C14 com m/z 1023 [M+H]+ e 1045 [M+Na]+, o congénere C15 com m/z 1037 [M+H]+ e 1059 [M+Na]+ e por fim, o congénere C16 com m/z 1051 [M+H]+ e 1073 [M+Na]+. Através do cromatograma do ião extraído foi possível concluir que o congénere C15 é o mais característico nas amostras de SF. Para além disso, também foi possível verificar que a surfactina é produzida em maior quantidade que a iturina. Foi possível identificar um padrão de fragmentação para surfactina e iturina identificando fragmentos alifáticos e peptídicos. Pela análise HPLC-MS dos produtos eluídos na análise por cromatografia em camada fina foi possível observar que quer a SF quer a iturina estão presentes nas três manchas obtidas na TLC. Foi ainda utilizado um método de extração em fase sólida com o objetivo de separar os dois BS lipopeptídos presentes nas amostras, onde se verificou a possibilidade de separar as impurezas iniciais da amostra e obter a surfactina pura.
Com o objetivo de melhorar as propriedades antimicrobianas de silicone de grau médico realizou-se a funcionalização da superfície por ligação covalente às moléculas de SF produzidas. Esta ligação covalente foi conseguida através de uma série de etapas. Primeiramente, a superfície do silicone é oxidada com uma “solução piranha” (H2SO4/H2O2) e ligada ao (3-Aminopropil)trietoxissilano (APTES). A SF ativada (com EDC e NHS) é por fim ligada através do grupo COOH ao grupo NH2 da superfície (conferido pelo APTES). Espera-se que a SF seja ligada covalentemente à superfície do silicone utilizando apenas um dos ácidos carboxílicos livres; deixando o outro grupo COOH livre para uma nova ligação amida. Desta forma, foi realizada uma tentativa para adicionar uma carga positiva à SF, a fim de aumentar a sua interação com as membranas celulares dos microrganismos. Para este efeito, o grupo COOH foi ativado com uma solução de EDC e NHS para poder reagir com o composto 4-dimetilaminobutilamina, apresentando uma amina terciária terminal, podendo assim sofrer uma reação de metilação. Esta estratégia teve como objetivo a repulsão e/ou morte de agentes patogénicos, através de interações físico-químicas ou por contato, respetivamente. Por fim, foi abordada uma outra estratégia realizando um revestimento adicional de SLs ao silicone funcionalizado com SF através de adsorção. Esta última estratégia adiciona à primeira uma abordagem de libertação de compostos antimicrobianos. Assim, foram efetuados três tipos de funcionalização: silicone funcionalizado com SF (SSF), silicone funcionalizado com derivado de surfactina carregado positivamente (SSF+) e silicone funcionalizado com SF e SLs adsorvidos (SSF+SLs).
A caracterização das superfícies funcionalizadas foi efetuada através da avaliação do ângulo de contacto (i.e., molhabilidade da superfície) e por espectroscopia de infravermelho com transformada de Fourier (FTIR) com reflexão total atenuada (ATR). Os resultados demostraram uma diminuição significativa do ângulo de contato nas amostras funcionalizadas comparativamente ao controlo, indicando alterações na superfície do silicone. Obteve-se um ângulo de contacto de 72,72 1,03º para o controlo, 39,53 5,59º para a amostra SSF, 52,41 5,60º para a amostra SSF+ e por fim, 10,87 1,35º para a amostra SSF+SLs ao fim de 5 min. O revestimento do silicone com SLs foi comprovado por FTIR-ATR, exibindo bandas características dos grupos funcionais do biotensioativo e do silicone.
Para atingir o objetivo final do trabalho, foi avaliada a atividade antibiofilme das amostras funcionalizadas contra S. aureus. Através da contagem de unidades formadoras de colónias (UFC), os resultados demonstraram uma redução de 1 log para as amostras SSF+, 0,5 log para SSF e 0,2 para SSF+SLs. Para além disso, quantidade de células bacterianas aderidas às amostras funcionalizadas comparativamente ao silicone não tratado foi avaliada por microscopia eletrónica de varrimento (MEV).
Em resumo, neste trabalho realizou-se a produção, caracterização e funcionalização de biotensioativos, especificamente surfactina e soforolípidos, em superfícies de silicone de grau médico para prevenir a formação de biofilmes de S. aureus, sendo a amostra SFF+ a que demonstrou maior sucesso na redução do biofilme. Este trabalho demonstra mais uma vez que os biotensioativos podem representar uma abordagem muito importante na prevenção da formação de biofilme em superfícies de dispositivos médicos e infeções relacionadas com estes.Medical devices-related infections are an emergent burden and preventive strategies are a demand. The improvement of the antimicrobial properties of biomaterials surfaces has been tested, functionalization with different antimicrobials and antimicrobial biosurfactants might be a suitable alternative.
This work aims at the development of a new coated/functionalized biomaterial with surfactins intended for medical catheters production and effective against biofilm formation. Thus, the use of biosurfactants (BS) as antimicrobial agents for the functionalization of silicone surfaces was explored. Surfactins was produced by Bacillus subtilis, in MSM medium, presenting a yield of 0.69 ± 0.09 g/L, while SLs were produced by Starmerella bombicola, in GPY medium added of oleic acid, with a yield of 11.07 ± 0.59 g/L. The biosurfactants were characterized trough TLC and HPLC-MS. Surfactins was identified as a set of five congeners by mass spectrometry namely, C12 m/z 995 [M+H]+, C13 m/z 1009 [M+H]+, C14 m/z 1023 [M+H]+, C15 m/z 1037 [M+H]+, and C16 m/z 1051 [M+H]+. Iturin was also identified as a mixture of five congeners with m/z [M+H]+ 1030, 1044, 1058, 1072 and 1086. Solid phase extraction was selected as separative method and it was possible to separate initial impurities and surfactins from iturin. For silicone functionalization with surfactins the biomaterial surface was first oxidized, treated with APTES and then covalently bonded with previously activated surfactins (i.e., with EDC and NHS). Achieved surfaces were also covered with sophorolipids or submitted to a reaction with 4-dimethylaminobutylamine followed by a methylation reaction to obtain a positively charged surface. Surfaces functionalization was confirmed by surface wettability and FTIR-ATR analysis while antibiofilm activity was assessed by colony forming units count and SEM analysis. The antibiofilm activity showed a reduction of 1 log for the SSF+ samples, 0.5 log for the SSF samples and 0.2 for the SSF+SLs samples. This work highlights the need for continuous research on the prevention of medical devices-related infections, namely vascular medical catheters.Faculdade de Farmácia da Universidade de Lisboa
Análise da incidência de anemia pré-operatória e utilização de hemoderivados em cirurgia cardíaca
No full textTrabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2023Introdução: A cirurgia cardíaca é uma das áreas médicas com maior elevada taxa de transfusão de hemoderivados, apresentando também uma incidência importante de anemia no pré-operatório. O presente estudo pretendeu avaliar a incidência da anemia pré-operatória em cirurgia cardíaca e a morbimortalidade associada, bem como o seu impacto no que à taxa de transfusão de hemoderivados diz respeito. Pretendeu-se ainda inferir acerca da viabilidade de implementação de uma estratégia de Patient Blood Management no Hospital de Santa Maria. Metodologia: Realizou-se um estudo de caráter observacional, transversal e retrospectivo, aplicado aos doentes submetidos a cirurgia cardíaca no Serviço de Cirurgia Cardiotorácica do Hospital de Santa Maria, no último trimestre de 2022. Os doentes foram divididos em dois grupos distintos: doentes com anemia no pré-operatório versus doentes sem anemia no pré-operatório, segundo a definição da OMS. Resultados: Foram incluídos 178 doentes, 55 (30.9%) deles com anemia pré-operatória e 123 (69.1%) sem anemia à apresentação. Quando comparados, os doentes com anemia apresentavam uma maior taxa de transfusão de unidades de concentrado eritrocitário (UCE), quer no período intra- (p < 0,001) como no período pós-operatório (p < 0,001), o que se relaciona com um maior tempo total de internamento e em unidade de cuidados intensivos, uma maior incidência de lesão renal (p = 0,002) e valores de PCR pré-operatório (p < 0,001) e EuroSCORE II (p < 0,001) mais elevados. No entanto, não se verificou uma maior incidência de sépsis ou mortalidade nos 30 dias de pós-operatório. Conclusão: Os doentes com anemia pré-operatória apresentam uma maior taxa de transfusão alogénica de concentrado eritrocitário e apesar de não se ter registado uma maior morbimortalidade, a implementação de uma estratégia de PBM seria benéfica.Purpose: Cardiac surgery is one of the medical areas with higher rates of blood products transfusion and preoperative anemia incidence. The present study aimed to evaluate the impact of preoperative anemia in cardiac surgery and its associated morbimortality, as well as its impact on the blood products transfusion rate. It also aimed to infer about the feasibility of implementing a Patient Blood Management strategy at Santa Maria Hospital. Methods: We conducted an observational, cross-sectional and retrospective study, applied to patients undergoing cardiac surgery at the Cardiothoracic Surgery Service of Santa Maria Hospital in the last quarter of 2022. Patients were divided into two distinct groups: patients with preoperative anemia versus patients without preoperative anemia, according to the WHO definition. Results: 178 patients were included in this study, with 55 (30.9%) of them presenting preoperative anemia and 123 (69.1%) without anemia in the pre-operative period. When contrasted, patients with anemia had a higher rate of transfusion of packed red cells, both intraoperatively (p < 0.001) and postoperatively (p < 0.001), which is related to a prolonged length of stay, both in nursery and in intensive care unit, a higher incidence of kidney injury (p = 0.002) and higher preoperative CRP (p < 0.001) and EuroSCORE II (p < 0.001) values. However, there was no increased incidence of sepsis or mortality at 30 days postoperatively. Conclusion: We conclude that patients with preoperative anemia have a higher rate of packed red cells transfusion and that although a higher morbidity and mortality were not observed, the implementation of a PBM strategy would be beneficial
Contribution of the innovative medicines initiative for the scientific advances on Alzheimer’s disease
No full textTese de mestrado, Regulação e Avaliação do Medicamento e Produto de Saúde, 2025, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia.A doença de Alzheimer (AD) afeta profundamente indivíduos, famílias e sociedade, pelo que o seu impacto e complexidade exige uma abordagem multifacetada e a Innovative Medicines Initiative (IMI) tem procedido a avultados investimentos na sua investigação. Até à data, a IMI financiou dezoito projetos relacionados à AD, nomeadamente, PharmaCog, EMIF, AETIONOMY, EBiSC, EPAD, PRISM, ADAPTED, AMYPAD, MOPEAD, PHAGO, ROADMAP, IMPRiND, EQIPD, IM2PACT, RADAR-AD, NEURONET, PRISM2 e EPND.
Esta dissertação teve como propósito compilar os resultados desses projetos, organizando-os em quatro pilares de investigação identificadas pela Agenda Estratégica da IMI (SRA): 1) Identificação de Alvos e Biomarcadores, 2) Paradigmas Inovadores de Ensaios Clínicos, 3) Medicamentos Inovadores e 4) Programas de Adesão Personalizados ao Paciente.
Este estudo é pertinente ao refletir a contribuição da IMI para o avanço e compreensão do Alzheimer, obtendo uma imagem mais abrangente e clarificadora dos projetos individuais e os benefícios da sua complementaridade. Em termos científicos a dissertação constitui um contributo para tornar mais visível os avanços do entendimento da patologia, tais como a identificação de biomarcadores e alvos terapêuticos, e a inovação em ferramentas de diagnostico, metodologias de ensaios clínicos e tecnologias de monitorização digital.
Concretamente, foi realizada uma revisão literária, utilizando dados provenientes dos websites oficiais dos projetos, comunicações com coordenadores e a base de dados CORDIS. Dos 1.371 artigos inicialmente identificados, 246 foram incluídos para análise.
Após a análise dos resultados foi possível verificar que, notavelmente, uma parte significativa da pesquisa focou-se no eixo de "Identificação de Alvos e Biomarcadores", com todas as recomendações aplicáveis da SRA sendo alcançadas por projetos como PharmaCog, AETIONOMY, EMIF, EPAD, PRISM, ADAPTED, AMYPAD, PHAGO, IMPRiND, IM2PACT, EPND, EBiSC, RADAR-AD, EQIPD, MOPEAD e PRISM2. Os esforços destes projetos conduziram a avanços significativos no entendimento da patologia da AD, ao revelarem uma complexa interação de mecanismos ligados à progressão da doença, incluindo patologias amiloide e tau, neuroinflamação, alterações da substância branca, distúrbios do sono e fatores metabólicos. Fatores que contribuem para a variabilidade da doença—como variações no gene APOE, outras variantes genéticas, idade e sexo—também foram estudados, sendo cruciais na progressão da AD. Esta complexidade destacou a necessidade de abordagens multifacetadas no diagnóstico e tratamento.
Adicionalmente, os projetos contribuíram para o aprimoramento do diagnóstico e monitorização por meio de novos biomarcadores e desenvolvimento de instrumentos, abrindo portas a novas terapias ao identificarem alvos terapêuticos promissores. Por fim, foram desenvolvidos modelos preditivos, ferramentas e recursos que melhoraram a transição das descobertas pré-clínicas para aplicações clínicas, aumentando a capacidade de estudar os mecanismos da AD, identificar alvos terapêuticos e apoiar o desenvolvimento de novos medicamentos.
Sob o eixo “Paradigmas Inovadores de Ensaios Clínicos”, as contribuições de projetos como EPAD, AMYPAD, PRISM e RADAR-AD ajudaram na inovação do design de ensaios clínicos, na otimização de técnicas de neuroimagem e na adoção de endpoints digitais.
Projetos como PharmaCog, AETIONOMY, PHAGO, IMPRiND e IM2PACT avaliaram os benefícios de diferentes estratégias terapêuticas sob o eixo “Medicamentos Inovadores”, inclusive medicamentos reaproveitados, suplementos dietéticos e técnicas mais avançadas como a imunoterapia.
Finalmente, sob o eixo “Programas de Adesão Personalizados ao Paciente” os esforços de projetos como MOPEAD, RADAR-AD, EPAD e ROADMAP, concentraram-se no desenvolvimento de estruturas para rastreio proativo, na colaboração entre profissionais de saúde e aperfeiçoamento de métodos para apoiar a adesão à medicação e gerir fatores de risco.
A nossa análise demonstrou que os projetos da IMI contribuíram substancialmente para o avanço do conhecimento sobre o Alzheimer, fomentando a inovação em diagnósticos, desenvolvimento de tratamentos e cuidados ao paciente. Neste âmbito é ainda discutido o potencial de uma integração coordenada dos projetos que impulsionaria o impacto de cada projeto na pesquisa da doença. Ao abordar colaborativamente os desafios complexos da DA—desde os mecanismos moleculares até aos cuidados ao paciente—estes projetos aprimoram a compreensão, facilitam a deteção precoce e promovem intervenções oportunas. Esta abordagem global não só informa as políticas de saúde e acelera descobertas terapêuticas, mas também melhora significativamente os resultados para os pacientes.
Persistem, no entanto, desafios na otimização entre projetos e o envolvimento dos pacientes no processo de investigação. A NEURONET, um dos projetos, destacou estas questões e forneceu recomendações para colmatar as lacunas entre a IMI e a sua sucessora, a Iniciativa de Saúde Inovadora (IHI).
A doença de Alzheimer apresenta-se, como já mencionamos, uma patologia complexa onde a integração de saberes, experiências e necessidades é fundamental. Nesta dissertação ficou visível como a IMI, uma parceria público-privada, consegue, pela natureza dos esforços conjuntos dos stakeholders, avanços no entendimento e cuidados a ter com os pacientes.
Numa perspetiva de futuro parece-nos que esta dissertação pode encorajar análises posteriores que abranjam outros critérios de investigação tal como pode ser um ponto referenciador de iniciativas sucessoras da IMI.Alzheimer's disease (AD) profoundly affects individuals, families, and society, necessitating a multifaceted approach due to its impact and complexity. The Innovative Medicines Initiative (IMI) has made significant investments in AD research. To date, the IMI has funded eighteen projects related to AD, including PharmaCog, EMIF, AETIONOMY, EBiSC, EPAD, PRISM, ADAPTED, AMYPAD, MOPEAD, PHAGO, ROADMAP, IMPRiND, EQIPD, IM2PACT, RADAR-AD, NEURONET, PRISM2, and EPND.
This dissertation aimed to compile the results of these projects, organizing them into four research pillars identified by the IMI Strategic Research Agenda (SRA): (1) Target and Biomarker Identification, (2) Innovative Clinical Trial Paradigms, (3) Innovative Medicines, and (4) Patient-Tailored Adherence Programs.
This study is pertinent as it reflects the IMI's contribution to advancing and understanding Alzheimer's disease, providing a more comprehensive and clarifying overview of individual projects and the benefits of their complementarity. Scientifically, the dissertation contributes to highlighting advances in understanding this pathology, such as the identification of biomarkers and therapeutic targets, and innovations in diagnostic tools, clinical trial methodologies, and digital monitoring technologies.
Specifically, a literature review was conducted using data from the official websites of the projects, communications with coordinators, and the CORDIS database. Of the 1,371 articles initially identified, 246 were included for analysis.
Upon analysing the results, it was noted that a significant portion of the research focused on the "Target and Biomarker Identification" axis, with all applicable SRA recommendations achieved by projects such as PharmaCog, AETIONOMY, EMIF, EPAD, PRISM, ADAPTED, AMYPAD, PHAGO, IMPRiND, IM2PACT, EPND, EBiSC, RADAR-AD, EQIPD, MOPEAD, and PRISM2. The efforts of these projects led to significant advances in understanding the pathology of AD by revealing a complex interaction of mechanisms linked to disease progression, including amyloid and tau pathologies, neuroinflammation, white matter changes, sleep disturbances, and metabolic factors. Factors contributing to disease variability—such as variations in the APOE gene, other genetic variants, age, and sex—were also studied, being crucial in AD progression. This complexity highlighted the need for multifaceted approaches in diagnosis and treatment.
Additionally, the projects contributed to improving diagnosis and monitoring through new biomarkers and the development of instruments, opening doors to new therapies by identifying promising therapeutic targets. Predictive models, tools, and resources were developed that improved the transition from preclinical discoveries to clinical applications, enhancing the ability to study AD mechanisms, identify therapeutic targets, and support the development of new medications.
Under the "Innovative Clinical Trial Paradigms" axis, contributions from projects such as EPAD, AMYPAD, PRISM, and RADAR-AD facilitated innovation in clinical trial design, optimization of neuroimaging techniques, and adoption of digital endpoints.
Projects like PharmaCog, AETIONOMY, PHAGO, IMPRiND, and IM2PACT evaluated the benefits of different therapeutic strategies under the "Innovative Medicines" axis, including repurposed drugs, dietary supplements, and advanced techniques such as immunotherapy.
Finally, under the "Patient-Tailored Adherence Programs" axis, efforts from projects such as MOPEAD, RADAR-AD, EPAD, and ROADMAP focused on developing frameworks for proactive screening, enhancing collaboration among healthcare professionals, and improving methods to support medication adherence and manage risk factors.
Our analysis demonstrated that the IMI projects have substantially contributed to advancing knowledge about Alzheimer's disease, fostering innovation in diagnostics, treatment development, and patient care. In this context, we discuss the potential of coordinated integration of these projects, which would amplify the impact of each project on disease research. By collaboratively addressing the complex challenges of AD—from molecular mechanisms to patient care—these projects enhance understanding, facilitate early detection, and promote timely interventions. This comprehensive approach not only informs health policies and accelerates therapeutic discoveries but also significantly improves patient outcomes.
Challenges persist, however, in optimizing collaboration among projects and involving patients in the research process. NEURONET, one of the projects, highlighted these issues and provided recommendations to bridge the gaps between the IMI and its successor, the Innovative Health Initiative (IHI).
Alzheimer's disease presents itself, as we have already mentioned, as a complex pathology where the integration of knowledge, experiences, and needs is fundamental. In this dissertation, it became evident how the IMI, a public-private partnership, through the nature of the joint efforts of stakeholders, achieves advances in understanding and caring for patients.
From a future perspective, we believe that this dissertation may encourage further analyses that encompass other research criteria and serve as a reference point for successor initiatives to the IMI.Faculdade de Farmácia da Universidade de Lisboa
HIV/HBV coinfection : double trouble? : retrospective study outlining its negative synergistic effect
No full textTrabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2024A prevalência de infeção pelo vírus da hepatite B (VHB) é de 7,4% nas pessoas que vivem com infeção pelo vírus da imunodeficiência humana (VIH), com percentagens maiores em países em vias de desenvolvimento, nomeadamente na região da África Sub-Sariana de acordo com a Organização Mundial da Saúde (OMS). A coinfeção VIH/VHB está associada a um aumento do risco de morte relacionada com o fígado, comparativamente a doentes monoinfetados pelo VHB. Este risco é reduzido usando terapia anti-retroviral que tem atividade contra ambos os vírus. Existe um número reduzido de registos relacionados com a prevalência e efeitos clínicos desta co-infeção. Consequentemente, o autor decidiu investigar a informação disponível sobre esta t´pico e descrever uma coorte de pacientes com coinfeção VHB/VIH, com seguimento médico no Hospital Professor Doutor Fernando Fonseca (HFF) em Portugal, um contexto com um número particularmente elevado de migrantes provenientes da África Sub-Sariana
O autor compilou informação recente e disponível acerca desta co-infeção. Para além disto, uma coorte de doentes co-infetados do HFF foi descrita, retrospetivamente, analizando vairáveis sociodemográficas, caracterizando ambas as infeções, descrevendo os tratamentos e demonstrando resultados clínicos e baseados em scores de fibrose hepática não invasivos. Adicionalmente, aferiu-se a prevalência de coinfeções por outros vírus hepatotrópicos. Para medicão dos resultados de fibrose, foram usados dois scores internacionalmente reconhecidos, aspartate aminotransferase to platelet ratio index (APRI) e o Fibrosis-4 index (Fib-4).
Os resultados revelaram que regimes terapêuticos baseados em Tenofovir foram eficazes a atingir estabilidade clínica. Além disto, os scores de fibrose mostraram uma diminuição no seu valor ao longo do tratamento. A troca de fármacos entre regimes terapêuticos baseados em Tenofovir Disoproxil fumarato (TDF) para regimes baseados em Tenofovir Aladenamida mostrouser segura em termos de outcomes clínicos.There is a prevalence of 7.4% of Hepatitis B Virus (HBV) infection in people living with Human Immunodeficiency Virus (HIV), with higher rates in developing countries, namely, sub-Saharan Africa according to the World Health Organization. HIV/HBV coinfection is associated with an increased risk of liver-related mortality, compared with patients with HBV infection alone. This risk is lowered by using antiretroviral therapy that has activity against both viruses. There is underreport of HIV/HBV coinfection prevalence and clinical outcomes. Consequently, the author decided to investigate accessible information on this subject and describe a cohort of patients with HIV/HBV coinfection, under medical follow-up in Hospital Professor Doutor Fernando Fonseca (HFF), Portugal, a setting with a particularly elevated number of migrants from sub-Saharan Africa.
The author compiled recent and available information regarding HIV/HBV infection. In addition, cohort of co-infected patients from HFF was described retrospectively analyzing sociodemographic variables, characterizing both infections, describing treatment, clinical and non-invasive fibrosis scores outcomes and assessing the prevalence of additional coinfections by other hepatotropic viruses. To measure fibrosis outcomes, two internationally recognized scores were used, Aspartate aminotransferase to platelet ratio index (APRI) score and Fibrosis-4 index (Fib-4).
Results revealed that Tenofovir based therapy was effective in achieving clinical stability. Moreover, fibrosis scores showed a decrease in value, over the course of therapy. Drug switch from Tenofovir Disoproxil Fumarate (TDF)-based therapy to Tenofovir
Alafenamide (TAF)-based therapy appeared to be safe in terms of clinical outcomes
FSC forest certification effects on bird biodiversity: Insights from Eucalyptus plantations in central-East Portugal
No full textTese de mestrado, Biologia da Conservação, 2025, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasForests are vital for ecological balance, supporting biodiversity and providing essential ecosystem
services. However, increasing demand for forest products has led to extensive conversion of natural
forests into agricultural lands and to the expansion of forestry areas. These changes disrupt community
composition and ecological processes, contributing to biodiversity loss. While natural forests are
declining globally, planted forests are expanding, raising concerns about their impact on biodiversity
and highlighting the need to balance human demands with ecosystem protection. Mitigating forestry
impacts on biodiversity can be achieved through conservation-oriented practices like forest certification.
The Forest Stewardship Council (FSC) aims to promote forest integrity and biodiversity conservation.
In Portugal, exotic Eucalyptus plantations (EPs) cover about 308,000 hectares, half of which are FSCcertified. Despite offering limited resources, EPs can still support some wildlife. However, there’s still
little knowledge on how bird communities persist in EPs and how they respond to sustainable forest
management. To understand how FSC certification affects bird communities, point-count surveys of
bird species were conducted in central-east Portugal across seven areas representing three forest
management types: FSC-certified (n=3), non-certified (n=2), and protected areas (n=2), during winter
and spring. Our findings indicate that native forests consistently support greater bird species richness,
diversity, and abundance, highlighting their importance for bird conservation in plantation-affected
landscapes. FSC-certified plantations, while not equated to native forests, host bird communities
sometimes more similar to them than to non-certified plantations, suggesting a mitigation role of
certification. Non-certified plantations had the lowest levels of biodiversity metrics, reflecting the
negative impact of intensive, less-regulated forestry practices. Seasonal habitat shifts, vegetation cover
and forestry activities further shape bird assemblages, reinforcing the importance of multi-season
monitoring and improved management practices. To maximise FSC’s conservation benefits, efforts
should focus on strengthening ground-level native vegetation, integrating mixed-use landscapes, and
implementing standardised monitoring and harvesting limits
Novas perspetivas diagnósticas e terapêuticas na Enterocolite necrotizante : revisão narrativa da literatura científica
No full textTrabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2024A enterocolite necrotizante (NEC) é uma doença predominantemente associada à prematuridade, condicionando morbilidade e mortalidade elevadas, que permanecem praticamente imutáveis nas últimas duas décadas. O mecanismo fisiopatológico subjacente da NEC compreende uma extensa ativação da cascata inflamatória com consequente isquemia e necrose intestinal, podendo evoluir para a perfuração, peritonite, sépsis e morte. O conhecimento crescente dos fatores de risco interligados como a imaturidade gastro-intestinal, o tipo de nutrição entérica e a disbiose tem permitido a melhoria das estratégias preventivas. No entanto, na evolução da doença, a inespecificidade da apresentação clínica torna difícil o diagnóstico e tratamentos precoces que são essenciais para evitar o desfecho fatal. A abordagem terapêutica permanece igualmente inespecífica e reside na instituição da antibioterapia de largo espetro, no tratamento de suporte e, se possível, na intervenção cirúrgica. Decorrem há alguns anos investigações incidindo em novos biomarcadores precoces da doença e em abordagens terapêuticas como por exemplo fatores de crescimento ou as células estaminais. Neste enquadramento, este estudo tem como objetivo rever a literatura científica relativamente às novas perspetivas diagnósticas e terapêuticas da NEC. A metodologia foi baseada na pesquisa de publicações científicas de 2010-2023 nas bases PubMed/Medline e CENTRAL, através dos descritores definidos (recém-nascido; enterocolite necrotizante; diagnóstico; biomarcadores; tratamento). As conclusões da revisão visaram oferecer um ponto de situação quanto à abordagem da doença procurando a atualização científica e a mudança do paradigma da morbimortalidade associada à NEC.Necrotizing enterocolitis (NEC) is a disease predominantly associated with prematurity, causing high morbidity and mortality, which have remained virtually unchanged over the last two decades. The pathophysiological mechanism of NEC comprises an extensive activation of the inflammatory cascade with consequent intestinal ischemia and necrosis, which can progress to perforation, peritonitis, sepsis and death. Growing knowledge of risk factors interconnected such as gastrointestinal immaturity, type of enteric nutrition and dysbiosis has allowed preventive strategies to be improved. However, as the disease progresses, the nonspecificity of the clinical presentation makes it difficult to diagnose and treat early, which is essential to avoid a fatal outcome. The therapeutic approach remains equally unspecific and consists of broad-spectrum antibiotics, supportive treatment and, if possible, surgical intervention. Research into new early biomarkers of the disease and therapeutic approaches such as growth factors or stem cells has been ongoing for some years. In this context, this study aimed to review the scientific literature on new diagnostic and therapeutic perspectives for NEC. The methodology was based on a search of scientific publications from 2010-2023 in the PubMed/Medline and CENTRAL databases, using the defined filters (newborn; necrotizing enterocolitis; diagnosis; biomarkers; treatment). The conclusions of the review aimed to provide an overview of the approach to the disease, seeking to update the scientifical knowledge and change the paradigm of morbidity and mortality associated with NEC
Biological therapies in cancer treatment: efficacy and safety: non-small cell lung cancer
No full textTrabalho Final de Mestrado Integrado, Ciências Farmacêuticas, 2024, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia.O cancro do pulmão é caracterizado pelo crescimento descontrolado de células malignas nos tecidos pulmonares, sendo classificado em cancro do pulmão de pequenas células e cancro do pulmão de não pequenas células, que representa a maioria dos casos e tem muitas vezes um mau prognóstico, uma vez que é frequentemente detetado em fases avançadas, o que leva a opções de tratamento limitadas. Este tipo de cancro continua a ser uma doença complexa e desafiante, sendo o segundo tipo de cancro mais comum entre homens e mulheres e a principal causa de incidência e mortalidade de cancro no mundo. Assim, é crucial avaliar novos tipos de tratamento e direcioná-los para terapias que possam melhorar a qualidade de vida do doente e a taxa de sobrevivência.
Com a necessidade de melhorar estas estatísticas, é importante rastrear a população de alto risco, como os fumadores, a população exposta a taxas elevadas de poluição atmosférica e a locais de trabalho tóxicos, ou os que tenham sofrido algum tipo de infeção grave. Para melhorar a taxa de sobrevivência, o diagnóstico precoce pode ser eficaz utilizando a fenotipagem molecular, testes de imagem e análises patológicas. A prevenção primária, como as medidas de controlo do tabaco e a redução da exposição a fatores de risco ambientais, é também essencial para reduzir a incidência.
As terapias biológicas visam ativar ou potenciar a ativação do sistema imunitário, possibilitando uma abordagem terapêutica mais dirigida ao tipo tumor do doente. Foram realizados vários ensaios clínicos para avaliar a eficácia destas terapias, o que levou à aprovação de sete inibidores de checkpoint imunitário, a resultados encorajadores no que diz respeito à avaliação de vacinas terapêuticas e ao desenvolvimento de células CAR-T, vírus oncolíticos e terapias combinadas, com resultados muito promissores.
Esta monografia aborda a sua eficácia terapêutica e segurança, demonstradas em diversos ensaios clínicos. No entanto, é ainda um desafio em curso, com apenas um subconjunto de doentes a beneficiar da imunoterapia e com os desafios associados à autoimunidade e às reações imunes adversas graves. Assim, é crucial continuar a avaliar a eficácia e a segurança a longo prazo destas terapias, a fim de tornar as terapias biológicas o futuro do tratamento do cancro do pulmão de células não pequenas.Lung cancer is characterized by the uncontrolled growth of malignant cells within the lung tissues, being classified in small-cell lung cancer, and non-small cell lung cancer, which accounts for the majority of lung cancer and often has a poor diagnosis since it is frequently detected at advanced stages, leading to limited treatment options. This type of cancer remains a complex and challenging disease, being the second most common type of cancer among men and women and the leading cause of cancer incidence and cancer-related mortality worldwide. Thus, it is crucial to evaluate new treatments rather than the traditional ones and move towards therapies that may improve the patient´s quality of life and survival outcomes.
With the urge to improve these statistics, it is important to screen high risk individuals such as smokers, the ones exposed to high rates of air pollution, and toxic occupational places, or the ones who have been through critical infection. Early diagnosis can be effective in improving survival rates using molecular and immunophenotyping evaluation, image testing, and pathologic reviews. Primary prevention, such as tobacco control measures and reducing exposure to environmental risk factors are also essential to reduce the incidence of non-small cell lung cancer.
Biological therapies aims to specifically activate or boost the activation of the immune system against cancer, making it possible for a more directed therapeutic approach towards the patient´s molecular type of tumor with less off-target events. Several clinical trials have been carried out to evaluate the effectiveness of these therapies, leading to the approval of seven immune checkpoint inhibitors, encouraging results on therapeutic vaccines and development of CAR-T cells, oncolytic virus and combination therapies, with very promising results.
This monograph discusses its therapeutic efficacy and safety, which are demonstrated in diverse clinical trials. However, it remains a challenge, with only a subset of patients benefit from immunotherapy and with the ongoing challenge of autoimmunity and severe immune related adverse events. Thus, it is crucial to continue to evaluate the long-term efficacy and safety of these therapies, in order to empower biological therapies as the future of non-small cell lung cancer´s treatment
Microbioma intestinal na saúde e na doença: obesidade e diabetes mellitus tipo 2
No full textTrabalho Final de Mestrado Integrado, Ciências Farmacêuticas, 2024, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia.O intestino humano abriga uma grande diversidade de microrganismos, estimados em centenas de milhões de células microbianas, sendo a maioria bactérias. Estes microrganismos, denominados de microbiota, interagem entre si e com o hospedeiro num ecossistema dinâmico de elevada complexidade - o microbioma intestinal. Esta comunidade inclui além das bactérias, Arqueas, fungos e algas.
Existe uma relação mutualista entre a microbiota intestinal e o organismo humano. Por um lado, os microrganismos comensais desempenham funções essenciais à fisiologia do hospedeiro, como manutenção da homeostase energética, digestão e síntese de nutrientes, incluindo algumas vitaminas, e desempenham um papel fundamental no desenvolvimento e regulação do sistema imunitário. Adicionalmente, atua como barreira contra agentes patogénicos e é crucial na manutenção da integridade da barreira intestinal. Por outro lado, o organismo humano fornece à microbiota um ambiente propício ao seu desenvolvimento e sobrevivência, rico em nutrientes e a uma
temperatura constante. Por este motivo, alterações drásticas na composição e função da microbiota intestinal, definidas como disbiose intestinal, estão associadas a estados patológicos, como inflamação intestinal, obesidade, diabetes mellitus tipo 2 e doenças auto-imunes.
Várias estratégias têm mostrado benefícios em doenças como obesidade e diabetes mellitus tipo 2, através da modulação da microbiota intestinal. A administração de prebióticos, probióticos, pós-bióticos e simbióticos, assim como a modificação da dieta, transplante de microbiota fecal e a cirurgia bariátrica, são abordagens que têm tido sucesso nos outcomes clínicos das patologias metabólicas mencionadas, mostrando o papel central da microbiota na saúde e na doença.The human gut harbors a great diversity of microorganisms, estimated at hundreds of millions of microbial cells, most of which are bacteria. These microorganisms, known as microbiota, interact with each other and with the host in a highly complex dynamic ecosystem - the intestinal microbiome. This community includes bacteria, archaea, fungi and algae.
There is a mutualistic relationship between the intestinal microbiota and the human organism. On the one hand, commensal microorganisms perform essential functions for the host's physiology, such as maintaining energy homeostasis, digestion and synthesis of nutrients, including some vitamins, and play a fundamental role in the development and regulation of the immune system. In addition, it acts as a barrier against pathogens
and is crucial in maintaining the integrity of the intestinal barrier. On the other hand, the human body provides the microbiota with an environment that is conducive to its development and survival, rich in nutrients and at a constant temperature. For this reason, drastic changes in the composition and function of intestinal microbiota, defined as intestinal dysbiosi, are associated with pathological conditions such as intestinal inflammation, obesity, type 2 diabetes mellitus and autoimmune diseases.
Several strategies have shown benefits in diseases such as obesity and type 2 diabetes mellitus, through the modulation of the intestinal microbiota. The administration of prebiotics, probiotics, postbiotics and synbiotics, as well as dietary modification, fecal microbiota transplantation and bariatric surgery, are approaches that have been successful in the clinical outcomes of the aforementioned metabolic pathologies, showing the central role of the microbiota in health and disease
"Neither brute nor human": Poe’s poetical critters and some subsequent re-vampings
No full textThis work is financed by portuguese national funds through the FCT – Foundation for Science and Technology, I.P., within the scope of the projects UIDB/00114/2020 and UIDP/00114/2020.info:eu-repo/semantics/publishedVersio