Tesis Doctorals en Xarxa
Not a member yet
46997 research outputs found
Sort by
Control del territorio, medidas represivas y urbicidios en la Corona de Aragón a raíz de la guerra de Sucesión de España (1705-1715)
Este trabajo tiene como objetivo estudiar los mecanismos represivos aplicados en la Corona de Aragón a raíz de la guerra de Sucesión de España, las estrategias político-militares borbónicas utilizadas para someter y asimilar políticamente a su población, así como detectar posibles casos de urbicidio y la razón política y pragmática que los impulsó. Veremos las peculiaridades de este proceso de dominación, las motivaciones que lo precipitaron y si este fue un caso singular o, por el contrario, se puede enmarcar dentro de unas dinámicas represivas que, paralelamente, padecieron otros territorios europeos.This work aims to study the repressive mechanisms applied in the Crown of Aragon following the War of the Spanish Succession, the Bourbon political-military strategies used to subdue and politically assimilate its population, as well as detect possible cases of urbicide and the political and pragmatic reason that drove them. We will see the peculiarities of this process of domination, the motivations that precipitated it and whether this was a singular case or, on the contrary, it can be framed within repressive dynamics that, in parallel, other European territories suffered.Programa de Doctorat en Històri
Driving Success in the Fast-Moving Consumer Goods Industry: Innovation Dynamics
Context: La innovació és un motor fonamental per al creixement i la competitivitat en el sector dels béns de consum (FMCG), però les tendències recents indiquen una disminució de la innovació i un baix èxit dins de la indústria, especialment a Espanya. Simultàniament, l'augment de la demanda dels consumidors de productes més saludables i sostenibles està influint en les trajectòries d'innovació, especialment en el sector de les begudes alcohòliques.
Objectius: Aquesta tesi té com a objectiu explorar els factors crítics que contribueixen a la innovació reeixida en la indústria de l'FGM a Espanya. La recerca busca identificar els impulsors d'aquestes innovacions i avaluar el seu impacte en la percepció de la marca i l'èxit del mercat.
Mètodes: Es va utilitzar un enfocament de mètodes mixtos, incloent estudis de casos qualitatius, entrevistes exploratòries, entrevistes en profunditat i grups focals, així com mètodes quantitatius d'enquestes i observacions del punt de compra.
Resultats: Aquesta tesi explora els motors de l'èxit de la innovació en el sector FMCG a Espanya, centrant-se en tres objectius principals. En primer lloc, un estudi de cas que revela com la innovació de productes, la comunicació estratègica i la distribució robusta poden impulsar el creixement en una categoria estable del mercat. En segon lloc, l'aplicació d'aquestes estratègies crucials a una caterologia sostenible dels productes posa de manifest la importància de la consciència sanitària en les intencions de compra dels consumidors, malgrat les barreres socials i recreatives a l'adopció. Finalment, es va examinar l'impacte de les innovacions sostenibles en el rendiment i la distribució de la marca, demostrant que les estratègies de comunicació i distribució exitoses milloren significativament la visibilitat de la marca i la presència al mercat.
Implicacions: Els resultats proporcionen coneixements pràctics per a les marques de FMCG que busquen innovar amb èxit en el mercat espanyol. Per als professionals, la investigació subratlla la importància d'alinear la innovació del producte amb les tendències actuals de salut i sostenibilitat i aprofitar les estratègies de distribució i màrqueting per millorar el rendiment de la marca. L'estudi també ofereix contribucions teòriques a la literatura sobre l'adopció de la innovació, particularment en el context paradoxal del comportament del consumidor cap a opcions d'estil de vida més saludables i patrons de consum tradicionals.Contexto: La innovación es un motor fundamental para el crecimiento y la competitividad en el sector de los bienes de consumo de rápida rotación (FMCG), sin embargo, las tendencias recientes indican un declive en la innovación y poco éxito dentro de la industria, particularmente en España. Al mismo tiempo, la creciente demanda de productos más saludables y sostenibles por parte de los consumidores está influyendo en las trayectorias de innovación, especialmente en el sector de las bebidas alcohólicas.
Objetivos: Esta tesis pretende explorar los factores críticos que contribuyen al éxito de la innovación en la industria de bienes de consumo de alta rotación en España. La investigación pretende identificar los factores que impulsan estas innovaciones y evaluar su impacto en la percepción de la marca y el éxito en el mercado.
Métodos: Se empleó un enfoque de métodos mixtos, incluyendo estudios de caso cualitativos, entrevistas exploratorias, entrevistas en profundidad y grupos focales, así como métodos cuantitativos de encuestas y observaciones en el punto de venta.
Resultados: Esta tesis explora los factores que impulsan el éxito de la innovación en el sector español de bienes de consumo de alta rotación, centrándose en tres objetivos principales. En primer lugar, un estudio de caso que revela cómo la innovación de productos, la comunicación estratégica y una distribución sólida pueden impulsar el crecimiento en una categoría de mercado estable. En segundo lugar, la aplicación de estas estrategias cruciales a una catergoría de productos sostenibles pone de relieve la importancia de la conciencia de salud en las intenciones de compra de los consumidores, a pesar de las barreras sociales y recreativas para su adopción. Por último, se examinó el impacto de las innovaciones sostenibles en el rendimiento y la distribución de las marcas, lo que demuestra que el éxito de las estrategias de comunicación y distribución aumenta significativamente la visibilidad de la marca y su presencia en el mercado.
Implicaciones: Los resultados aportan ideas prácticas para las marcas de gran consumo que buscan innovar con éxito en el mercado español. Para los profesionales, la investigación subraya la importancia de alinear la innovación de productos con las tendencias actuales de salud y sostenibilidad y de aprovechar las estrategias de distribución y marketing para mejorar el rendimiento de la marca. El estudio también ofrece contribuciones teóricas a la literatura sobre la adopción de innovaciones, especialmente en el contexto paradójico del comportamiento de los consumidores hacia opciones de estilo de vida más saludables y patrones de consumo tradicionales.Context: Innovation is a pivotal driver for growth and competitiveness in the Fast-Moving Consumer Goods (FMCG) sector, yet recent trends indicate a decline in innovation and low success within the industry, particularly in Spain. Simultaneously, rising consumer demand for healthier and more sustainable products is influencing innovation trajectories, especially in the alcoholic beverages sector.
Objectives: This dissertation aims to explore the critical factors that contribute to successful innovation in the FMCG industry in Spain. The research seeks to identify the drivers behind these innovations and assess their impact on brand perception and market success.
Methods: A mixed-methods approach was employed, including qualitative case studies, exploratory interviews, in-depth interviews, and focus groups, as well as quantitative methods of surveys and point-of-purchase observations.
Results: This dissertation explores the drivers of innovation success in Spain's FMCG sector, focusing on three main objectives. First, a case study that reveals how product innovation, strategic communication, and robust distribution can drive growth in a stable market category. Second, the application of these crucial strategies to a sustainable catergory of products highlights the importance of health consciousness in consumer purchase intentions, despite social and recreational barriers to adoption. Finally, the impact of sustainable innovations on brand performance and distribution was examined, showing that successful communication and distribution strategies significantly enhance brand visibility and market presence.
Implications: The findings provide practical insights for FMCG brands seeking to innovate successfully in the Spanish market. For practitioners, the research underscores the importance of aligning product innovation with current health and sustainability trends and leveraging distribution and marketing strategies to enhance brand performance. The study also offers theoretical contributions to the literature on innovation adoption, particularly in the paradoxical context of consumer behavior toward healthier lifestyle choices and traditional consumption patterns
El Relieve Escultórico de Estilo Clásico, antiguo y moderno, en el Coleccionismo Español de Época Moderna
En territori espanyol es conserven un nombre considerable de col·leccions que alberguen escultura d’estil clàssic. Aquesta escultura, generalment procedent de col·leccions italianes o del mercat amb Itàlia, és un reflex del gust i els costums de les elits socials de l’Espanya de l’època moderna. En les darreres dècades, són notables els estudis que s’han dedicat a indagar sobre aquestes col·leccions, els vincles dels seus col·leccionistes amb Itàlia i l’estudi concret de les peces. No obstant això, malgrat aquests avenços, el relleu escultòric, que forma part implícita del corpus d’escultura, ha rebut una atenció significativament menor en els estudis especialitzats.
El present treball explora el paper del relleu escultòric d’estil clàssic conservat en les col·leccions de l’època moderna a Espanya. L’objectiu principal és identificar la funció, el valor i la recepció d’aquesta tipologia escultòrica dins del camp de la història de l’art. Per a això, s’ha realitzat una identificació dels relleus conservats actualment en institucions espanyoles, s’han catalogat i estudiat de manera detallada, i s’han analitzat els aspectes rellevants que permeten aprofundir en els temes proposats en els objectius. L’estudi crític consisteix en una anàlisi i interpretació de la informació sobre la procedència de les peces, per conèixer el paper d’aquestes en el mercat antiquari de l’època moderna. En segon lloc, s’ha realitzat un estudi iconogràfic dels relleus organitzat per grups temàtics, a partir dels motius i els temes, per identificar canvis i continuïtats en la representació dels temes en l’època moderna i, en conseqüència, millorar la comprensió sobre la recepció del llenguatge clàssic en espais de col·lecció o culturals. En tercer lloc, s’han examinat les dades relatives a la disposició dels relleus, així com la seva apreciació a nivell perceptiu i monetari. Aquest últim punt permet entendre millor el valor del relleu antiquari, no només des d’un punt de vista econòmic, sinó també estètic, per millorar la comprensió sobre la recepció, funció i abast del relleu escultòric.
Les troballes i els resultats de l’estudi crític permeten identificar quina posició ocupa el relleu escultòric d’estil clàssic dins del mercat antiquari entre Espanya i Itàlia i les relacions diplomàtiques. Determina aquesta tipologia escultòrica com un transmissor de la fortuna de l’antiguitat en època moderna, en contextos artístics i de col·lecció, així com permet reconèixer l’apreciació i la funció del relleu dins d’un context de recepció de l’antiguitat en relació amb els espais de col·lecció i representació.En territorio español se conservan una suma de colecciones que albergan escultura de estilo clásico. Esta escultura, generalmente procedente de colecciones italianas o del mercado con Italia, es el signo del gusto y las costumbres de las élites sociales de la España de época moderna. En las últimas décadas, son notables los estudios que se han dedicado a indagar sobre esas colecciones, los vínculos de sus coleccionistas con Italia y el estudio concreto de las piezas. Sin embargo, a pesar de estos avances, el relieve escultórico, que forma parte implícita del corpus de escultura, ha recibido una atención significativamente menor en los estudios especializados.
El presente trabajo explora el papel del relieve escultórico de estilo clásico conservado en las colecciones de época moderna en España. El objetivo principal es identificar la función, el valor y la recepción de esta tipología escultórica dentro del campo de la historia del arte. Para ello, se ha realizado una identificación de los relieves conservados actualmente en instituciones españolas, se han catalogado y estudiado de manera pormenorizada, y se ha analizado los aspectos relevantes que permiten indagar en los temas propuestos en los objetivos. El estudio crítico consiste en un análisis i interpretación de la información sobre la procedencia de las piezas, para conocer el papel de estas en el mercado anticuario de época moderna. En segundo lugar, se ha realizado un estudio iconográfico de los relieves organizado por grupos temáticos, a partir de los motivos y los temas, para identificar cambios y continuidades en la representación de los temas en época moderna y, en consecuencia, mejorar la comprensión sobre la recepción del lenguaje clásico en espacios de colección o culturales. En tercer lugar, se ha examinado los datos relativos a la disposición de los relieves, así como su apreciación a nivel perceptivo y monetario. Este último punto permite entender mejor el valor del relieve anticuario, no solo desde un punto de vista del valor económico, sino también estético, para mejorar la comprensión sobre la recepción, función y el alcance del relieve escultórico.
Los hallazgos y los resultados del estudio crítico permiten identificar que posición ocupa el relieve escultórico de estilo clásico dentro del mercado anticuario entre España e Italia y las relaciones diplomáticas. Determina esta tipología escultórica como un transmisor de la fortuna de la antigüedad en época moderna, en contextos artísticos y de colección, del mismo modo que permite reconocer la apreciación y la función del relieve, dentro de un contexto de recepción de la antigüedad en relación con los espacios de colección y representación.In Spanish territory, there are numerous collections that house classical sculptures. These sculptures, generally originating from Italian collections or the Italian market, are indicative of the taste and customs of the social elites of modern Spain. In recent decades, significant studies have been devoted to exploring these collections, the connections of their collectors with Italy, and the detailed study of the pieces. However, despite these advancements, sculptural reliefs, which are an implicit part of the sculptural corpus, have received significantly less attention in specialized studies.
The present doctoral dissertation explores the role of classical-style sculptural reliefs preserved in modern collections in Spain. The primary objective is to identify the function, value, and reception of this sculptural typology within the field of art history. To achieve this, the reliefs currently held in Spanish institutions have been identified, cataloged, and studied in detail, and key aspects have been analyzed to address the objectives of the study. The critical examination involves analyzing and interpreting information regarding the provenance of the pieces to understand their role in the modern antiquities market. Secondly, an iconographic study of the reliefs has been conducted, organized into thematic groups based on motifs and subjects, in order to identify changes and continuities in the representation of themes in modern times. This approach enhances the understanding of the reception of classical imagery in collections or cultural spaces. Thirdly, data related to the placement of the reliefs, as well as their perceptual and monetary value, have been examined. This final point provides insights into the value of ancient reliefs, not only from an economic perspective but also from an aesthetic one, thereby improving the understanding of the reception, function, and significance of sculptural reliefs.
The findings of this critical study help to clarify the position of classical-style sculptural reliefs within the antiquities market between Spain and Italy, and in the context of their diplomatic relations. This sculptural typology is identified as a transmitter of the legacy of antiquity in modern times, within both artistic and collection contexts. It also highlights the appreciation and function of these reliefs in relation to spaces of collection and representation.Universitat Autònoma de Barcelona. Programa de Doctorat en Història de l'Art i Musicologi
Anaerobic co-digestion of agri-industrial waste for energy and agricultural valorization purposes
Programa de Doctorat en Enginyeria i Ciències Aplicades / Tesi realitzada conjuntament amb la Universidad de la Sabana (Colòmbia)[eng] Anaerobic codigestion (AcoD) is the anaerobic degradation of two or more substrates with complementary properties. It is a waste treatment and recovery alternative that has shown better results than anaerobic digestion (AD). Still a research gap, as most studies have been carried out under mesophilic and thermophilic conditions, due to the misconception that psychrophilia (T ≤20 ºC) is not viable for biomethane production. In areas with these temperature conditions, various agro-industrial activities are carried out, such as the production of dairy products, which generate waste that, in some contexts, is not properly managed and is, therefore, a source of contamination.
AD and AcoD studies were carried out using whey CW and CW, by-products of the dairy chain, as substrates. Firstly, the risk of inhibition and methane production at 20 and 35 ºC was evaluated using CW as substrate under four (1, 2, 3, and 4) different inoculum/substrate ratios (ISR). The results showed that the process is viable at 20 ºC, but there is a plausible risk of inhibition, and the process takes longer to stabilise than at 35 ºC. Based on these results, AcoD tests between CW and CM were developed. The mixing ratio (% W/W in VS basis) and ISR at 20 ºC were evaluated. The results showed that the best mixing ratio (65:35 %w/w of CW and CM, respectively) and that with an ISR of 3 (OL 0.6 gVS/L) is the best of each variable for the development of the process.
Based on this information, semi-continuous set ups were carried out to evaluate these conditions. Three reactors of 5L total volume were used. Initially, a 1:3 ratio of CM:water was introduced to allow the microbial population to develop and degrade the organic matter. After that, the reactor was loaded to test the previously identified mixture and OL, yields of 0.51 m3CH4/kgVS were found. An 8 m3 reactor was then installed at the Rancho Los Álamos farm in Ubatè. The reactor was initially loaded with 375 kg of CM and 6000 L of water. After three months, the loading was started, maintaining the proportions added to the 5 L reactors evaluated in the previous stage. The scaled-up reactor showed yields of 11447 m3 of biomethane per month, taking into account the available biomass that can be valorised within the farm (19 m3/month of CW and 10.46 t/month of CM). The LCA also showed that by incorporating AcoD into the cheese production process, it is possible to reduce indicators such as climate change, eutrophication and acidification by 23%, 3.84% and 5.26% respectively.
The fertiliser potential of digestate produced was evaluated. A field trial was conducted with ryegrass (Lolium perenne) with three urea digestate ratios (100:0 (U), 50:50 (UD), 0:100 (D)) and a control (C) without fertiliser. Over a period of 60 days, the dry matter yield of three cuttings and the nitrogen content in the aerial part of the plant were measured. After the final cutting, other chemical and biological properties of the soil were also analysed. An economic evaluation was also carried out. The results showed that yields in relation to biomass production were similar in the U and UD treatments (4179 and 4282 kg/ha, respectively). Therefore, a 50% reduction in urea use on the farm would be possible.
II
Finally, an economic analysis was carried out considering two scenarios, the current scenario and a scenario of use and valorisation of the above-mentioned quantities and wastes. The economic analysis showed that the scenario with the CoDA system resulted in a positive Net Present Value (NPV) of approximately USD 1,962,124, a Benefit Cost Ratio (BCR) of more than 1 (6.15) and an Internal Rate of Return (IRR) of 7.51%, indicating financial viability over the project horizon. In addition, the Value Added (VA) was consistently USD 148,861.91.[spa] Aún existe un vacío de investigación en la digestión anaerobia (DA), ya que la mayoría de los estudios se han realizado en condiciones mesófilas y termófilas, debido a la idea errónea de que la psicrofilia (T ≤20 ºC) no es viable para la producción de biometano. Además, en las zonas con estas condiciones de temperatura se desarrollan diversas actividades agroindustriales, como la elaboración de productos lácteos, que generan residuos que, en algunos contextos, no se gestionan adecuadamente y son, por tanto, fuente de contaminación.
Se realizaron varios estudios de AD y codigestión anaerobia utilizando como sustratos lactosuero y estiércol bovino, subproductos de la cadena láctea. Inicialmente, se estudió la inhibición de la AD utilizando LS como sustrato comparando el proceso a temperaturas psicrófilas y mesófilas. Posteriormente y en función de los resultados, se identificó la mejor relación de mezcla entre el LS y el estiércol de vaca (EB) y la mejor relación entre inóculo y sustrato (RIS). Con estos resultados, se analizó una relación LS:EV de 65:35 y una carga orgánica de 0,6 g/L en reactores de 5 L y un reactor piloto de 8 m3 ubicado en una finca en ambiente psicrófilo en el altiplano cundiboyacense colombiano. Una vez estabilizado el reactor, se analizó el potencial fertilizante del digestato obtenido, se encontró que una mezcla 50:50 urea:digestato era la mejor. Teniendo en cuenta los resultados de los análisis de biometano y digestato, se identificó mediante un análisis económico que el proyecto es viable para la finca donde se realizó el estudio, teniendo en cuenta un horizonte de 20 años.
Ell objetivo de esta tesis fue evaluar la viabilidad técnica, ambiental y económica del proceso de codigestión de LS y EB con fines bioenergéticos y de recuperación de suelos. En este sentido, esta tesis contribuyó a aumentar el conocimiento sobre el funcionamiento del régimen psicrófilo, sobre el que no existen muchos estudios en el ámbito científico. Además, generó conocimiento y valor sobre el digestato, ya que la mayoría de los estudios se centran en la valorización y mejora del biogás, pero ignoran el uso potencial del digestato
Essays in Macro-Finance
This thesis consists of three chapters on firm heterogeneity and the role of credit frictions and
regulatory constraints. The first chapter highlights the role of a gender gap in credit access in
distorting capital allocation across firms, which leads to an output loss of 4% for the US economy.
The second chapter examines corporate borrowing choice and its implications on firm activity. We
document the wide usage of cash flow loans among the largest and smallest firms in the economy,
the latter being in contrast to conventional wisdom that small firms are required to pledge collateral
when they borrow. We further show that firms’ loan type choice correlate with their operating
needs. We propose a firm dynamics model with a collateral cost to explain these facts. The third
chapter proposes a theoretical model that formalizes why a long-lasting period of expansionary
monetary policy may amplify banks’ incentives to rollover loans to unviable firms.Esta tesis consta de tres cap´ıtulos sobre la heterogeneidad de las empresas y el papel de las fricciones
crediticias y las restricciones regulatorias. El primer cap´ıtulo destaca el papel de la brecha
de g´enero en el acceso al cr´edito a la hora de distorsionar la asignaci´on de capital entre empresas,
lo que conduce a una p´erdida de producci´on del 4% para la econom´ıa estadounidense. El segundo
cap´ıtulo examina la elecci´on de endeudamiento corporativo y sus implicaciones en la actividad empresarial.
Documentamos el amplio uso de pr´estamos sin garantia entre las empresas m´as grandes
y m´as peque˜nas de la econom´ıa, lo que contrasta con la sabidur´ıa convencional de que las peque˜nas
empresas deben ofrecer garant´ıas cuando solicitan pr´estamos. Adem´as, mostramos que la elecci´on
del tipo de pr´estamo de las empresas se correlaciona con sus necesidades operativas. Proponemos
un modelo de din´amica de empresas con un costo colateral para explicar estos hechos. El tercer
cap´ıtulo propone un modelo te´orico que formaliza por qu´e un per´ıodo prolongado de pol´ıtica monetaria
expansiva puede amplificar los incentivos de los bancos para refinanciar pr´estamos a empresas
inviables.Programa de Doctorat en Economia, Finances i Empres
Soil fungal responses to forest management in Mediterranean ecosystems
La gestió forestal pot tenir un paper clau en la mitigació de l'efecte del canvi climàtic als ecosistemes mediterranis, reduint la cobertura arbòria i redistribuint els nutrients i l'aigua per als arbres restants. Tot i que la reducció de la biomassa aèria dels arbres és evident i fàcilment avaluable, l'efecte de la gestió forestal sobre les comunitats microbianes del sòl és més difícil de quantificar i, per tant, ha rebut menys atenció. Aquesta tesi va analitzar l'efecte dels tractaments silvícoles (i.e. clearcut i thinning) sobre les comunitats fúngiques del sòl a les pinedes mediterrànies.
A l'experiment de clearcut (bosc de Pinus sylvestris), a mitjà termini, la biomassa fúngica va ser menor en les clares en comparació amb les vores del bosc i les àrees circumdants; per contra, les propietats del sòl i la composició de la comunitat fúngica del sòl van ser similars a les del bosc.
En els experiments de thinning, la intensitat del thinning i el gradient altitudinal van ser els principals impulsors del canvi en la composició vegetal del sotabosc (bosc de Pinus pinaster). A més, no es van observar diferències intraespecífiques a les comunitats fúngiques del sòl en una plantació de Pinus halepensis, ni abans ni un any després d'una aclarida del 50%. Finalment, en un bosc mediterrani de Pinus uncinata, la diversitat i composició de cossos fructífers ectomicorísics i saprotròfics, així com d'espores, no es van veure significativament afectades per la intensitat de l'aclarida.La gestión forestal puede desempeñar un papel clave en la mitigación del efecto del cambio climático en los ecosistemas mediterráneos, reduciendo la cobertura arbórea y redistribuyendo los nutrientes y el agua para los árboles restantes. Si bien la reducción de la biomasa aérea de los árboles es evidente y fácilmente evaluable, el efecto de la gestión forestal sobre las comunidades microbianas del suelo es más difícil de cuantificar y, por lo tanto, ha recibido menos atención. Esta tesis analizó el efecto de los tratamientos silvícolas (i.e. clearcut y thinning) sobre las comunidades fúngicas del suelo en pinares mediterráneos.
En el experimento de clearcut (bosque de Pinus sylvestris), a medio plazo, la biomasa fúngica fue menor en las claras en comparación con los bordes del bosque y las áreas circundantes; por el contrario, las propiedades del suelo y la composición de la comunidad fúngica del suelo fueron similares a las del bosque.
En los experimentos de thinning, la intensidad del thinning y el gradiente altitudinal fueron los principales impulsores del cambio en la composición vegetal del sotobosque (bosque de Pinus pinaster). Además, no se observaron diferencias intraespecíficas en las comunidades fúngicas del suelo en una plantación de Pinus halepensis, ni antes ni un año después de un aclareo del 50%. Finalmente, en un bosque mediterráneo de Pinus uncinata, la diversidad y composición de cuerpos fructíferos ectomicorrízicos y saprotróficos, así como de esporas, no se vieron significativamente afectadas por la intensidad del aclareo.Forest management can play a key role in mitigating the effect of climate change on Mediterranean ecosystems, by reducing tree cover, and redistributing nutrients and water for the remaining trees. While the reduction in aboveground tree biomass is evident and easily assessable, the effect of forest management on the soil microbial communities is more challenging to be quantified and has therefore received less attention. This thesis analyzed the effect of silvicultural treatments (i.e., clear-cut and thinning) on the soil fungal communities in Mediterranean pine forests.
In the clear-cut experiment (Pinus sylvestris forest), in the medium term, fungal biomass was lower in clear-cuts compared to the forest edges and surrounding areas, conversely soil properties and soil fungal community composition were similar to forest.
In the thinning experiments, the thinning intensity and the altitudinal gradient were the main drivers of understorey plant compositional change (Pinus pinaster stands). Furthermore, there were no intraspecific differences in the soil fungal communities in a Pinus halepensis plantation, neither before nor one year after a 50% thinning. Finally, in a Mediterranean Pinus uncinata forest, the ectomycorrhizal and saprotrophic fruitbody and spore diversity and composition were not significantly affected by the thinning intensity
The Hajar Mountains of Southeastern Arabia: a laboratory to understand how reptile diversity is generated, distributed and maintained in arid environments
This thesis provides new insights into the evolution of biodiversity in arid regions by exploring the patterns and drivers of reptile diversity in the Hajar Mountains of Southeastern Arabia. We first assemble a genomic dataset including the entire endemic reptile community to unravel the diversity, distribution and structure of reptiles at multiple biological scales. Then, we focus on four particular groups to assess the systematics of some selected taxa, to investigate the effects of gene flow on species delimitation, and to evaluate the conservation status of one of its most imperiled species. Results show that reptile diversity is greatly structured, with paleoclimate emerging as a determinant driver in the evolution of this montane arid community. We reveal high levels of cryptic diversity leading to the description of four new species of geckos, and show that coastal development is having a negative impact on the survival of a Critically Endangered species. Additionally, we evaluate the performance of the genomic techniques used in this thesis and discuss their strengths and limitations for species delimitation and description.Aquesta tesi ofereix nous punts de vista en l’evolució de la biodiversitat en regions àrides, explorant els patrons i processos que afecten la diversitat de rèptils a les muntanyes dels Hajars del sud-est de la Península Aràbiga. Primer, generem un “dataset” genòmic incloent tota la comunitat endèmica de rèptils per descobrir la diversitat, la distribució i l’estructura dels rèptils a diverses escales biològiques. Després, ens centrem en quatre casos d’estudi amb la finalitat de determinar la sistemàtica d’alguns taxons concrets, investigar els efectes del flux genètic en la delimitació d’espècies i avaluar l’estat de conservació d’una de les espècies més amenaçades de les muntanyes. Els resultats mostren que la diversitat de rèptils està molt estructurada, amb el paleoclima emergint com a un procés determinant en la formació i evolució d’aquesta comunitat. També, desvelem alts nivells de diversitat críptica descrivint quatre noves espècies de dragons, i demostrem que el desenvolupament costaner està tenint un impacte negatiu en la supervivència d’una espècie que es troba en Perill Crític d’extinció. Finalment, avaluem les diferents tècniques genòmiques utilitzades en aquesta tesi i discutim les seves avantatges i limitacions per a la delimitació i descripció d’espècies.Programa de Doctorat en Biomedicin
Decoding the epitranscriptomic complexity through computational methods based on long-read sequencing
RNA modifications, collectively known as the ‘epitranscriptome’, play a major role in multiple
biological processes, including splicing regulation, gene expression regulation and antibiotic
resistance. Unfortunately, next-generation sequencing (NGS) based methods rely on reverse
transcription and sequencing-by-synthesis processes that are blind to modified bases. Here,
we propose to develop several computational approaches that allow the detection of RNA
modifications at position and/or single molecule level using datasets obtained from direct RNA
sequencing (DRS), a platform developed by Oxford Nanopore Technologies (ONT). Then, we
aim to employ these methods to study the role of these modifications in: i) antibiotic resistance
mechanisms mediated by ribosomal RNA modifications; ii) the role of RNA modifications in
single-stranded RNA viruses, and iii) vertebrate embryogenesis, specifically in the maternal-
to-zygotic transition (MZT) of zebrafish.El conjunt de les modificacions de l’ARN, conegut com a epitranscriptoma, té un paper
relevant en molts processos biologics, com ara la regulació de l’expressió gènica, el splicing
alternatiu i en mecanismes de resitencia antibiòtica. Malauradament, els mètodes per detectar
aquestes modificacions estan basades en la transcripció inversa i en la seqüenciació per
síntesis i per tant, no poden detectar directament la presència d’aquestes bases modificades.
Durant aquesta tesis, es desenvolupen diversos mètodes computacionals per identificar
aquestes modificacions amb diferents resolucions utilitzant dades generades per direct RNA
sequencing (DRS), una tècnica de seqüenciació desenvolupada per Oxford Nanopore
Technologies (ONT). Després, aquests mètodes s’utilitzen per estudiar el paper d’aquestes
modificacions en diferents contextos biologics: i) mecanismes de resistència antibiòtica
mediats per les modificacions de l’ARN ribosomal; ii) en virus d’ARN de cadena única i; iii) en
la embriogènesis en vertebrats, concretament durant la maternal-to-zygotic transition (MZT)
en el peix zebra.Programa de Doctorat en Biomedicin
Procesos y técnicas constructivas de una sociedad en transformación: análisis de espacios arquitectónicos entre Tarraco e Ilerda durante la Antigüedad tardía
Aquesta tesi doctoral estudia l'Antiguitat tardana en el nord-est de la península ibérica a partir
de l'analisi arqueológica de l'arquitectura. A diferencia de recerques prévies que s'han central principalment en l'arquitectura d'elits i espais públics, aquest treball busca ressaltar la importancia de l'arquitectura que emmarca la vida quotidiana durant aquest període, tant en entorns urbans com rurals. El projecte s'ha concreta! amb una analisi de contextos arquitectónics situats en l'area geografica compresa entre Tarraco i llerda, dues ciutats que en l'Antiguitat tardana es converteixen en referents de la nova xarxa episcopal d'articulació del territori. La metodología emprada se centra en l'Arqueologia de !'Arquitectura, amb émfasi en la caracterització técnica de les estructures. L'aplicació d'aquest enfocament s'ha hagut d'adequar a la realitat dels casos d'estudi, molles vegades amb una entitat material limitada i una documentació arqueológica succinta. S'inclou un cataleg de 27 casos d'estudi, pertanyents a 7 jaciments diferents, que s'analitzen des de diferents perspectives com la ubicació, la disposició espacial, els processos i técniques constructius i les dades estratigrafiques i materials associats.Esta tesis doctoral estudia la Antigüedad tardía en el nordeste de la península ibérica a partir de la análisis arqueológica de la arquitectura. A diferencia de investigaciones previas que se han central principalmente en la arquitectura de élites y espacios públicos, este trabajo busca resaltar la importancia de la arquitectura que enmarca la vida cotidiana durante este periodo, tanto en entornos urbanos como rurales. El proyecto se ha concretar con un análisis de contextos arquitectónicos situados en el área geográfica compresa entre Tarraco y llerda, dos ciudades que en la Antigüedad tardía se convierten en referentes de la nueva red episcopal de articulación del territorio. La *metodología empleada se centra en la Arqueología de !'Arquitectura, con énfasis en la caracterización técnica de las estructuras. La aplicación de este enfoque se ha tenido que adecuar a la realidad de los casos de estudio, mojadas veces con una entidad material limitada y una documentación *arqueológica sucinta. Se incluye un catálogo de 27 casos de estudio, pertenecientes a 7 yacimientos diferentes, que se analizan desde diferentes perspectivas como la ubicación, la disposición espacial, los procesos y técnicas constructivos y los datos estratificaras y materiales asociados.This dissertation studies Late Antiquity in the northeast of the lberian Península from the
archaeological analysis of architecture. Unlike previous research that has focused mainly on the architecture of elites and public spaces, this work seeks to highlight the importance of the architecture that framed everyday life during this period, both in urban and rural environments.
The project has been carried out with an analysis of architectural contexts located in the
geographical area between Tarraco and llerda, two cities that in Late Antiquity became referents of the new episcopal network for the articulation of the territory. The methodology used focuses on the Archaeology of Architecture, with emphasis on the technical characterization of the structures. The application of this approach has had to be adapted to the reality of the case studies, often with a limited material entity and a scarce archaeological documentation.
lt includes a catalog of 27 case studies, belonging to 7 different sites, which are analyzed from
different perspectives such as location, spatial arrangement, construction processes and
techniques, stratigraphic data and associated materials. A detailed examination of each case is combined with a regional comparative approach. This last part ha
Development of linear solvers for large-scale CFD simulations on hybrid supercomputers
Tesi amb menció de Doctorat Internacional i de Doctorat Industrial(English) Divergence constraints are present in the governing equations of many physical phenomena, and they usually lead to a Poisson equation whose solution is one of the most challenging parts of scientific simulation codes. Indeed, it is the main bottleneck of incompressible computational fluid dynamics (CFD) simulations, and developing effective Poisson solvers is a critical task.
On the other hand, the fact that hardware's memory bandwidth tends to grow much slower than its peak performance has led to strongly memory-bound codes. Additionally, extreme-scale problems have comparable memory requirements, which can become problematic given the faster but smaller memory generally available in massively parallel accelerators. Using more computing resources is a natural way to avoid such limitations and tackle larger problems. However, this generally comes at the price of losing parallel efficiency and is exacerbated by the widening gap between memory and network bandwidths in fat nodes.
In this context, this thesis presents a strategy to mitigate several of the challenges above. It consists of exploiting s spatial symmetries to increase the arithmetic intensity of the simulations and reduce their memory requirements. Remarkably enough the proposed strategy is identical regardless of the mesh connectivity (structured or unstructured) and the geometric complexity of the problem, therefore applying to a wide range of academic and industrial configurations.
First of all, by proving the existence of an inexpensive block diagonalisation that transforms the original Poisson equation into a set of 2ŝ^s fully decoupled subsystems, we can accelerate significantly the iterative solvers' convergence. Additionally, imposing an adequate grid points' ordering allows reducing the operators' footprint and replacing the standard sparse matrix-vector product (SpMV) with the more compute-intensive sparse matrix-matrix product (SpMM). Numerical experiments making Algebraic Multigrid (AMG) and preconditioned Krylov subspace methods exploit a varying number of symmetries showed reductions of up to 23% and 72% in the iterations ' count, resulting in up to 1.7x and 5.6x overall speedups, respectively.
This approach is successfully extended to the preconditioning stage, giving rise to LRCFSAI(k), an enhanced variant of the Factored Sparse Approximate Inverse (FSAI) preconditioner. LRCFSAI(k) arises from introducing another level of approximation by taking advantage of the decoupled subsystems' close similarity to apply the same FSAI to all of them, therefore replacing SpMV with SpMM and leading to notable memory savings and increases in the arithmetic intensity. Of course, recycling the same preconditioner on all the subsystems worsens its convergence. Although being this effect much smaller than expected, it motivated the introduction of relatively cheap but very effective low-rank corrections. A key feature of these corrections is that thanks to being applied to each subsystem independently, the more symmetries being exploited, the more effective they become, leading to up to 5.7x faster convergences than the standard FSAI. Numerical experiments on up to 1.07 billion grids confirm the quality of LRCFSAI( k), which, despite being 2.6x lighter, outperforms the standard FSAI by a factor of up to 4.4x.
Finally, the advantages of exploiting symmetries and replacing SpMV with SpMM are extended throughout the simulations. As a result, matrix multiplications are accelerated, whereas their memory footprint is reduced, making massive simulations more affordable. As an example of practical application, we consider the numerical simulation of turbulent incompressible flows using a low-dissipation discretisation of unstructured collocated grids on both CPU and GPU. All the required matrices are classified into three sparsity patterns, showing up to 5.0x speed-ups and 8.0x memory savings.(Català) Les equacions de conservació estan presents en molts fenòmens físics, i sovint condueixen a una equació de Poisson la solució de la qual és una de les parts més costoses dels codis de simulació numèrica. De fet, és el principal coll d'ampolla en les simulacions de dinàmica de fluids computacionals (CFD) incompressibles, i desenvolupar solucionadors de Poisson és una tasca crítica.
D'altra banda, el fet que l'amplada de banda de la memòria tendeixi a créixer molt més a poc a poc que el rendiment màxim ha portat a codis fortament memory-bound. A més, els problemes a exaescala tenen requisits de memòria comparables, la qual cosa pot ser problemàtica vist que la memòria en els acceleradors massivament paral·lels és més ràpida, però generalment més limitada. Utilitzar més nodes de càlcul és una manera natural d'evitar aquestes limitacions i abordar problemes més grans. Tanmateix, generalment comporta una pèrdua d'eficiència exacerbada per l'augment de la bretxa entre amplada de banda de memòria i xarxa als fat nodes.
En aquest context, aquesta tesi presenta una estratègia per mitigar diversos dels reptes anteriorment. Consisteix a explotar s simetries espacials per augmentar la intensitat aritmètica de les simulacions i reduir els seus requisits de memòria. L'estratègia proposada és idèntica independentment de la connectivitat de la malla (estructurada o no estructurada) i de la complexitat geomètrica del problema, i per tant és aplicable a una àmplia gamma de configuracions acadèmiques i industrials.
En primer lloc, demostrant l'existència d'una diagonalització per blocs que transforma l'equació de Poisson en un conjunt de 2^s subsistemes totalment desacoblats, podem accelerar significativament la convergència dels mètodes iteratius. A més, imposant un ordenament adequat de la malla podem reduir la memòria ocupada pels operadors i substituir el producte matriu-vector (SpMV) pel producte de matriu-matriu (SpMM), d'intensitat aritmètica major. Experiments numèrics basats en Algebraic Multigrid (AMG) i mètodes de Krylov explotant un nombre variable de simetries mostren reduccions de fins al 23% i 72% en el nombre d'iteracions, amb acceleracions generals de fins a 1,7x i 5,6x, respectivament.
Aquesta estratègia és estesa als precondicionadors donant lloc a LRCFSAI(k), una variant millorada del precondicionador Factored Sparse Approximate Inverse (FSAI). LRCFSAI(k) sorgeix d'introduir un nou nivell d'aproximació aprofitant la similitud dels 2^s subsistemes per aplicar el mateix FSAI a tots ells, substituint així SpMV per SpMM i garantint estalvis notables de memòria i increments en la intensitat aritmètica. És clar que reciclar el mateix precondicionador a tots els subsistemes empitjora la convergència. Tot i ser aquest efecte molt menor de l'esperat, va motivar la introducció de correccions de baix rang molt efectives. Una característica clau d'aquestes correccions és que, gràcies a ser aplicades a cada subsistema per separat, com més simetries s'exploten, més efectives esdevenen, donant lloc a convergències fins a 5,7x més ràpides que el FSAI estàndard. Experiments numèrics en malles de fins a 1.070 milions confirmen la qualitat de LRCFSAI(k), el qual, tot i ser 2,6x més lleuger, accelera el FSAI estàndard fins a 4,4x vegades.
Finalment, els avantatges d'aprofitar simetries i substituir SpMV per SpMM s'estenen a tota la simulació. Com a resultat, les multiplicacions per matrius s'acceleren, mentre que el consum de memòria es redueix, fent més assequibles les simulacions massives. Com a exemple d'aplicació pràctica, considerem la simulació numèrica de fluxos incompressibles turbulents mitjançant una discretització poc dissipativa de malles col·locades no estructurades tant en CPU com GPU. Finalment, classificant tots els operadors discrets en tres tipus podem generalitzar els guanys obtinguts, amb acceleracions de fins a 5,0x i estalvis de memòria de fins a 8,0x.(Español) Las ecuaciones de conservación están presentes en muchos fenómenos físicos, y a menudo conducen a una ecuación de Poisson la solución de la cual es una de las partes más costosas de los códigos de simulación numérica. De hecho, es el principal cuello de botella en las simulaciones de dinámica de fluidos computacional (CFD) incompresibles, y desarrollar solvers de Poisson es una tarea crítica. Por otro lado, el hecho que el ancho de banda de la memoria tienda a crecer mucho más despacio que el rendimiento máximo ha llevado a códigos fuertemente memory-bound. Además, los problemas a exaescala tienen requisitos de memoria comparables, lo cual puede ser problemático ya que la memoria en los aceleradores masivamente paralelos es más rápida, pero generalmente más limitada. Utilizar más nodos de cálculo es una forma natural de evitar tales limitaciones para abordar problemas más grandes, pero generalmente comporta una pérdida de eficiencia. En este contexto, esta tesis presenta una estrategia para mitigar varios de los retos anteriores. Consiste en explotar s simetrías espaciales para aumentar la intensidad aritmética de las simulaciones y reducir sus requisitos de memoria. La estrategia propuesta es idéntica independientemente de la conectividad de la malla (estructurada o no estructurada) y de la complejidad geométrica del problema, siendo así aplicable a una amplia gama de configuraciones académicas e industriales. Demostrando la existencia de una diagonalización por bloques que transforma la ecuación de Poisson en 2^s subsistemas totalmente desacoplados podemos acelerar significativamente la convergencia de los métodos iterativos. Además, imponiendo un ordenamiento adecuado de la malla podemos reducir la memoria ocupada por los operadores y sustituir el producto matriz-vector (SpMV) por el producto matriz-matriz (SpMM), de intensidad aritmética mayor. Experimentos numéricos explotando un número variable de simetrías con Algebraic Multigrid (AMG) y con métodos de Krylov muestran reducciones de hasta el 23% y 72% en el número de iteraciones, con aceleraciones de hasta 1,7x y 5,6x, respectivamente. Esta estrategia es extendida a los precondicionadores dando lugar a LRCFSAI(k), una variante mejorada del preacondicionador Factored Sparse Approximate Inverse (FSAI). LRCFSAI(k) surge de introducir otro nivel de aproximación aprovechando la similitud de los 2^s subsistemas para aplicar el mismo FSAI en todos ellos, sustituyendo así SpMV por SpMM y garantizando ahorros de memoria e incrementos de intensidad aritmética. Está claro que reciclar el mismo preacondicionador empeora la convergencia. Aun ser este efecto muy menor de lo esperado, motivó la introducción de correcciones de bajo rango muy efectivas. Una característica de estas correcciones es que, gracias a ser aplicadas a cada subsistema por separado, se tornan más efectivas al explotar más simetrías, dando lugar a convergencias hasta 5,7x más rápidas que con el FSAI estándar. Experimentos numéricos en mallas de hasta 1.070 millones confirman la calidad de LRCFSAI(k), el cual, a pesar de ser 2,6x más ligero, acelera el FSAI estándar hasta 4,4x. Finalmente, las ventajas de aprovechar simetrías y sustituir SpMV por SpMM se extienden a toda la simulación. Como resultado, las multiplicaciones por matrices se aceleran, mientras que el consumo de memoria se reduce, haciendo más asequibles las simulaciones masivas. Como ejemplo de aplicación práctica, consideramos la simulación numérica de flujos incompresibles turbulentos tanto en CPU como GPU. Así clasificando los operadores discretos en tres tipos podemos generalizar las ganancias obtenidas, con aceleraciones de hasta 5,0x y ahorros de memoria de hasta 8,0x.DOCTORAT EN ENGINYERIA TÈRMICA (Pla 2012