Laboratoire de Physique Théorique
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Hétérogénéité ribosomique et régulation de la traduction des ARNm des facteurs de croissance (lymph)angiogéniques dans les cardiomyocytes stressés
Get PDFL'ischémie cardiaque, définie comme la baisse de perfusion sanguine d'une partie du cœur, soumet les cellules à différents stress induits par la baisse de l'apport en oxygène et nutriments. S'ils perdurent, ces stress induisent la mort cellulaire et par la suite un infarctus du myocarde. Afin de rétablir l'homéostasie tissulaire et de revasculariser le tissu ischémique, les cellules activent différents mécanismes tels que l'angiogenèse et la lymphangiogenèse. Mon projet de thèse a porté sur l'étude de ces voies et leur régulation au niveau traductionnel dans des cardiomyocytes soumis à différents stress. L'analyse semi-globale du transcriptome et du traductome en condition hypoxique nous a montré que, dans les cardiomyocytes, les gènes (lymph)angiogéniques sont majoritairement régulés au niveau traductionnel. Parmi ces gènes, ceux possédant des structures IRES (Internal Ribosome Entry Site) sont recrutés de manière plus efficace dans les polysomes. Or, la régulation de la traduction via ces structures représente un mécanisme-clé dans la réponse à l'hypoxie. Nous avons identifié une protéine, la vasohibine 1, liée à l'ARN et présentant lors de l'hypoxie une fonction d'ITAF (IRES Trans-Acting Factor). Dans un deuxième volet de cette thèse, nous avons caractérisé le rôle d'un long ARN non codant, Neat1, dans la régulation de la traduction IRES dépendante en réponse à l'hypoxie. Neat1 est le composant principal d'un corps nucléaire, le paraspeckle, qui se forme en réponse au stress. Le paraspeckle est formé de Neat1 et de plusieurs protéines qui interagissent avec ce long ARNnc, dont certaines présentent aussi une fonction d'ITAF, suggérant un rôle du paraspeckle dans le contrôle de la traduction. Ainsi nous avons identifié par des expériences de déplétion que Neat1, plus particulièrement sa grande isoforme Neat1-2, possède un rôle d'ITAF qui régule tous les IRES des facteurs (lymph)angiogéniques. D'autres composants du paraspeckle, p54nrb et pSPC1, régulent différents sous-groupes d'ARNm à IRES. L'analyse de l'intéractome de p54nrb a permis d'identifier de nouveaux partenaires nucléaires et cytoplasmiques de cette protéine, spécifiques de l'hypoxie, dont la protéine ribosomique uS5 (RPS2) et la nucléoline, qui présentent elles aussi une fonction d'ITAF. Ces résultats suggèrent que le paraspeckle pourrait être une plateforme d'assemblage de l'IRESome, complexe responsable de la traduction IRES-dépendante, dont Neat1 est un acteur majeur. Le troisième volet de ma thèse porte sur l'identification de ribosomes spécialisés responsables de la traduction IRES-dépendante lors du stress. L'analyse de la composition des polysomes de cardiomyocytes humains soumis à un stress du RE nous a permis de découvrir plusieurs protéines ribosomiques mitochondriales associées aux polysomes. Pour certaines d'entre elles cette association augmente significativement (MRPS15, MRPS12) alors que pour d'autres elle diminue lors du stress (MRPS35, MRPL52), appuyant le concept de ribosomes spécialisés. Nous avons par la suite confirmé l'interaction de MRPS15 avec le ribosome en réalisant des expériences de PLA (proximity ligation assay) et d'immunoprécipitations. De plus MRPS15 comporte une fraction cytoplasmique qui augmente en réponse au stress. Cette localisation cytoplasmique s'accompagne d'un rôle dans le contrôle traductionnel : des expériences de déplétion et de surexpression démontrent que MRPS15 est impliquée dans l'activation de la traduction IRES-dépendante. Enfin l'analyse par RNAseq du traductome permet de montrer que les ribosomes composés de MRPS15 régulent la traduction d'un ensemble d'ARNm à IRES ainsi que ceux codant les effecteurs de la réponse UPR. Ces résultats mettent en lumière un rôle nouveau des protéines ribosomiques mitochondriales dans la formation de ribosomes spécialisés de la réponse au stress du RE dans les cardiomyocytes.Cardiac ischemia, defined as a blood perfusion diminution in a part of the heart, subjects cells to various stresses caused by oxygen and nutrient supply diminution. If they persist, these stresses induce cell death and subsequently myocardial infarction. In order to restore tissue homeostasis as well as the vascularization of ischemic tissue, cells activate various mechanisms such as angiogenesis and lymphangiogenesis. My thesis project focused on the study of these pathways and their regulation at the translational level in cardiomyocytes subjected to different stresses. The semi-global analysis of the transcriptome and the translatome in hypoxic condition showed us that angiogenic and lymphangiogenic genes are not drastically regulated at the transcriptional level while the majority of them are induced at the translational level in murine cardiomyocytes. Among these genes, those having IRES (Internal Ribosome Entry Site) structures are recruited more efficiently into polysomes. Regulation of translation through the presence of these structures is a key mechanism in the response to hypoxia. We have identified a protein, vasohibin 1, bound to FGF1 IRES and presenting during hypoxia an ITAF (IRES Trans-Acting Factor) function. In a second part of this thesis work, we characterized the key role of a long non-coding RNA, Neat1, in the regulation of IRES-dependent translation in response to hypoxia. Neat1 is the main component of a nuclear body, the paraspeckle, which forms in response to stress. The paraspeckle is made up of Neat1 and several proteins, that interact with this long ncRNA, and are also known to exhibit ITAF function, hence the hypothesis of a role of the paraspeckle in the control of translation. Thus we have identified by depletion experiments, that Neat1, more particularly the long isoform of this ncRNA, Neat1-2, has a role of ITAF promoting the IRES-dependent translation of angiogenic and lymphangiogenic factors. Other components of the paraspeckle, p54nrb and pSPC1, regulate different subgroups of IRESs. The analysis of the interactome of p54nrb by mass spectrometry allowed to identify new nuclear and cytoplasmic partner specific of hypoxia, among them the ribosomal protein uS5 (RPS2) and nucleolin, which both present an ITAF function. These results suggest that the paraspeckle could be an assembly platform for IRESome, a complex responsible for IRES-dependent translation, and that Neat1 is a key regulator of this mechanism. The third part of my thesis concerns the identification of specialized ribosomes involved in IRES-dependent translation during stress. Analysis of the composition of polysomes of human cardiomyocytes under endoplasmic reticulum (ER) stress allowed us to discover several mitochondrial ribosomal proteins associated with the polysomes. Cellular stresses induced a switch in polysome composition, inducing an increase of the association with some mitochondrial ribosomal proteins (MRPS12 and MRPS15) while others were decreased (MRPS35 and MRPL52). The rest of the study focused on MRPS15. First, experiments with PLA (proximity ligation assay) and immunoprecipitations from cytosolic and polysomal fractions confirmed the interaction of this mitochondrial protein with the ribosome. In addition, a cytoplasmic fraction of MRPS15 increases in response to stress. This cytoplasmic localization allowed a role in translational control : depletion and overexpression experiments demonstrate that MRPS15 behaves as an activator of IRES-dependent translation. Finally, polysome immunoprecipitation profiling experiment showed translationnal regulation of a subset of IRESs mRNA and mRNA coding UPR response proteins by specialized ribosomes composed of MRPS15. These results highlight a novel role for mitochondrial ribosomal proteins in the translationnal regulation in stressed cardiomyocytes
Développement d'un revêtement haute température anticorrosion pour pièces en acier fonctionnant jusqu'à 450 °C et respectant la réglementation REACH
Get PDFActuellement, les revêtements "haute température" sacrificiels utilisés pour protéger certaines pièces de turbomachines en acier de la corrosion sont appliqués par pulvérisation de peintures inorganiques chromatées impactées par la réglementation REACH. Il est nécessaire de développer de nouveaux revêtements compatibles avec cette réglementation. L'application par pulvérisation de ces peintures s'accompagne de difficultés d'obtention de revêtements d'épaisseurs uniformes à la surface de grandes pièces de géométries complexes. L'objectif de cette thèse est de développer une méthode d'élaboration de revêtement "haute température" anticorrosion sur acier respectant la réglementation REACH et permettant de réaliser des dépôts d'épaisseur uniforme sur des pièces de forme complexe. Le processus d'élaboration du revêtement développé au cours de cette thèse est composé de trois étapes. La première étape est dédiée au dépôt électrophorétique de particules d'aluminium jouant le rôle de protection cathodique sacrificielle vis-à-vis du substrat en acier. Au cours de ces travaux de thèse, deux formulations de suspension, disposant de caractéristiques physico-chimiques différentes, ont été étudiées. Une étude sur géométrie plane a permis de définir l'influence des paramètres procédés permettant d'obtenir les épaisseurs cibles. Les essais conduits ont permis d'aboutir à une formulation optimisée. La seconde étape d'élaboration est consacrée à l'ajout d'une matrice inorganique via une étape d'imprégnation de silicate de sodium, afin d'obtenir une tenue mécanique du revêtement suffisante. Les revêtements obtenus restent cependant poreux et isolants électriquement. Les conditions opératoires d'incorporation du liant ont été optimisées en lien avec la tenue des revêtements à l'étape densification. La troisième étape est dédiée à la percolation des particules d'aluminium et la création de chemins de conduction électrique. Cette opération de densification a été réalisée par projection mécanique d'un média sur les revêtements (aussi appelée compactage). Cette étape a pour conséquence une activation de la protection cathodique. Les revêtements développés au cours de la thèse permettent d'offrir une résistance pour au moins 1 000 h à l'essai d'exposition en Brouillard Salin Neutre (BSN). Une nouvelle méthode d'évaluation accélérée des performances sacrificielles, basée sur la polarisation anodique, est proposée au cours de la thèse afin de proposer une méthode complémentaire à l'essai de Brouillard Salin Neutre. Cette approche permet de réduire significativement les durées d'évaluation des performances anticorrosion des revêtements développés. Enfin, les premiers essais de transfert du procédé de l'éprouvette plane vers une pièce de forme complexe ont été réalisés.Sacrificial "high temperature" coatings, currently used to protect turbomachine steel parts from corrosion, are applied by spray of inorganic paints containing hexavalent chromium compounds. As chromium trioxide is forbidden in Europe by REACH regulation since 21 september 2017, it is necessary to develop new performant coatings more efficient than the current paint system. Furthermore, paint application by spray display important limitations and serious difficulties of implementation on larges pieces with complex geometries. It is to address these two issues - formulation and application - that this thesis work has been undertaken. The objective of this thesis is to develop an elaboration method of anticorrosion "high temperature" on steel meet REACH requirements and permitting realize uniform thickness deposit onto complex shape part. Coating elaboration process developed during this thesis is composed of several steps. The first step is the electrophoretic deposition of aluminum particles deposit acting as sacrificial cathodic protection toward steel substrate. During this thesis work, two suspension formulations, with different physico-chemical characteristics, have been studied. A two plane and parallel electrode cell have been set up to investigate process parameters (deposition time and applied electric field) influence on thickness and microstructure deposit. Hull cell deposits, electric field over the suspension measurement and 2D simulation have been performed to select the most suitable suspension formulation for obtaining uniform thickness deposit onto complex shape part. The second coating elaboration step is dedicated to the incorporation of inorganic binder by liquid sodium silicate impregnation. Mechanical resistance coatings are obtained by particles linking together and with the steel substrate. However, as-obtained coatings are porous and insulating. Operational conditions of binder incorporation have been optimized regarding the coating mechanical strength associated with the next step. The third step is a mechanical densification by media projection on the coating. Aluminum particles are percolated and electrical conduction paths are obtained. The obtained coatings are dense and cathodic protection is effective. Developed coating during thesis work meet anticorrosion requirement specifications, 1 000 h in neutral salt spray test. A new accelerated evaluation method, assessing sacrificial performances by electrochemical polarization, has been proposed during this thesis to replace the salt spray test. Evaluation time is lowered from several tens of hours to few hours for the new test. Finally, first process transfer tests from plane electrode to a complex shape part have been performed. Optimization of the cell geometry has been preliminary realized by COMSOL software simulation
Sources de variabilité en lien avec les paramètres du procédé au sein de singularités géométriques de structures composites aéronautiques
Get PDFLa thèse porte sur l'étude des origines et des effets d'un certain nombre de variabilités, au sein d'une structure composite carbone/Epoxy présentant des singularités géométriques. Le 1er chapitre est une étude bibliographique où on montre que l'étude des variabilités sur des pièces composites reste un problème ouvert qui peut être abordé de plusieurs manières et à plusieurs échelles. Il est bien établi que les propriétés d'une structure composite dépendent à la fois du choix des matières premières comme de celui du procédé de fabrication. Ces propriétés sont influencées par plusieurs types de variabilités comme la variation de la position des arrêts de pli, le désalignement des fibres et la présence de porosités. Ces trois questions sont abordées dans le cadre de cette thèse. Pour illustrer la méthodologie proposée, nous considérons comme exemple de structure avec géométrie complexe, un prototype de lisse composite inspiré d'un fuselage aéronautique. Elle constitue dans ce travail le réceptacle d'un certain nombre de contraintes de fabrication comme la présence de rayons convexes et concaves, de parois verticales, de changements d'épaisseur et d'association de plusieurs matériaux. Le 2ème chapitre est dédié à la présentation du protocole expérimental utilisé et des observations de variabilité pour l'analyse des arrêts de plis, de la porosité et de désalignement des fibres. Les observations sont réalisées tout au long du processus de fabrication, et font appel à un large éventail de techniques de mesures comme les observations optiques, micrographiques, tomographiques, etc. Chaque observation est dédiée au suivi d'un ou plusieurs types de variabilité étudiée pour des phases différentes du processus de fabrication. Le 3ème chapitre comporte l'étude mathématique des résultats d'observation et la représentation des tendances statistiques. Les données acquises sont triées en regard de leur position vis-à-vis des singularités géométriques, et analysées afin d'en proposer des modélisations mathématiques pertinentes. L'originalité du travail porte principalement sur la volonté de ne pas se limiter à des analyses statistiques, en caractérisant des tendances d'évolutions spatiales réalistes pour chaque type de variabilité observée, en lien avec la présence ou non d'une singularité géométrique à proximité. Une fois les lois mathématiques représentatives identifiées, des analyses statistiques sont menées sur les paramètres qui pilotent ces lois, principalement sous la forme de moyennes et d'écarts types. Le but du 4ème chapitre est de proposer une approche numérique pour évaluer l'influence de ces variabilités sur les propriétés de la structure. On montre en quoi il est possible de créer une famille de modèles numériques représentant des pièces virtuelles (non encore fabriquées) de façon réaliste. Le réalisme recherché cible autant l'amplitude des variabilités simulées que l'évolution spatiale de cette variabilité au sein de la pièce. Les simulations numériques doivent permettre de proposer des gammes de variation des propriétés et du comportement des structures en fonction de la variabilité étudiée. Le modèle fait appel à des éléments coques 2D, pour être en capacité de mener un grand nombre de simulations basées sur des tirages aléatoires des paramètres des lois mathématiques étudiées. Enfin une autre étude numérique est proposée. Elle concerne l'effet des variabilités au sein d'une peau de fuselage composée de plis UD à partir de résultats issus d'une thèse précédente. En conclusion, ce travail a mis en place une approche permettant l'évaluation des effets d'incertitude dans des calculs mécaniques appliqués aux structures en matériaux composites à géométrie complexe. La question abordée est de s'assurer de la robustesse d'un résultat de manière plus physique qu'en ayant recours à des facteurs de sécurité. Les perspectives de ces travaux sont ensuite présentées.The thesis focuses on the study of the origins and effects of a number of variabilities within a carbon/Epoxy composite structure with geometric singularities. The first chapter is a bibliographical study in which it is shown that the study of variabilities in composite parts remains an open problem that can be approached in several ways and at several scales. For the analysis and manufacture of composite structures, there are a large number of methods, multi- scale or not, which allow the influence of variabilities to be taken into account in the study of composite structures. It is well established that the properties of a composite structure depend on both the choice of raw materials and the manufacturing process. These properties are influenced by several types of variability such as variation in the position of ply stops, fibre misalignment and the presence of porosities. These three issues are addressed in this thesis. To illustrate the proposed methodology, we consider as an example of a structure with complex geometry, a prototype of a composite stringer inspired by an aeronautical fuselage. In this work, it constitutes the receptacle of a certain number of manufacturing constraints such as the presence of convex and concave radii, vertical walls, changes in thickness and the association of several materials. The second chapter is dedicated to the presentation of the experimental protocol used and the observations of variability for the analysis of ply stops, porosity and fibre misalignment. The observations are carried out throughout the manufacturing process, using a wide range of measurement techniques such as optical, micrographic, tomographic observations, etc. Each observation is dedicated to the monitoring of one or more types of variability studied for different phases of the manufacturing process. The third chapter includes the mathematical study of the observation results and the representation of statistical trends. The acquired data are sorted according to their position with respect to geometric singularities, and analysed in order to propose relevant mathematical models. The originality of the work lies mainly in the desire to do not limit itself to statistical analyses, by characterising realistic spatial evolution trends for each type of variability observed, in relation to the presence or absence of a geometric singularity nearby. Once the representative mathematical laws have been identified, statistical analyses are carried out on the parameters driving these laws, mainly in the form of means and standard deviations. The aim of the 4th chapter is to propose a numerical approach to evaluate the influence of these variabilities on the properties of the structure. It is shown how it is possible to create a family of numerical models representing virtual parts (not yet manufactured) in a realistic way. The realism sought targets both the amplitude of the simulated variabilities and the spatial evolution of this variability within the part. The numerical simulations must make it possible to propose ranges of variation of the properties and behaviour of the structures according to the variability studied. The model uses 2D shell elements to be able to carry out a large number of simulations based on random draws of the parameters of the mathematical laws studied. Finally, another numerical study is proposed. It concerns the effect of variabilities within a fuselage skin composed of UD plies, based on results from a previous thesis. In conclusion, this work has set up an approach allowing the evaluation of uncertainty effects in mechanical calculations applied to composite structures with complex geometry. The question addressed is to ensure the robustness of a result in a more physical way than by using safety factors. The perspectives of this work are then presented
Exploration des fines échelles océaniques dans le détroit de Gibraltar : simulation numérique, observation et mélange induit
Get PDFCette thèse se focalise sur la région du spectre océanique dit des fines échelles, s'étendant des processus de sous-mésoéchelles jusqu'aux grandes structures turbulentes qui amorcent la cascade de Richardson directe menant elle-même au mélange moléculaire. C'est ce mélange, processus irréversible, qui fixe les propriétés des masses d'eaux circulant dans les bassins océaniques. Si la cascade directe est plutôt bien décrite depuis les travaux de Kolmogorov (1941), les instabilités qui l'amorcent dans l'océan sont peu observées et encore moins simulées, le domaine des fines échelles constitue en quelque sorte une "Terra Incognita" (Scotti, 2010). L'amélioration des performances des moyens de calcul et des modèles numériques, couplés à de nouveaux algorithmes, permettent néanmoins désormais d'aborder la simulation des grandes structures turbulentes et donc d'étudier cette Terra Incognita. Une exploration originale de la fine échelle est proposée dans la région du détroit de Gibraltar qui relie la mer Méditerranée à l'océan Atlantique. Là, se rencontrent des masses d'eaux de densités très différentes au-dessus d'un relief accidenté et relativement peu profond où l'amplitude de la marée est non-négligeable. Des processus de fine échelle émergent de l'interaction de ces éléments dans le détroit, rythmé par le cycle de la marée semi-diurne : un contrôle hydraulique du flux dans le détroit évolue au cours du cycle de marée, entraînant la formation puis la relaxation d'un ressaut hydraulique interne. Lorsqu'il est en place, ce ressaut amplifie le mélange lié aux instabilités de cisaillement dans la veine méditerranéenne, et sa relaxation marque le début de la propagation d'un train d'ondes internes solitaires vers la mer Méditerranée. Propagation des trains de solitons et instabilités de cisaillement dans le détroit de Gibraltar ont été étudiés pendant cette thèse par la simulation numérique, mais aussi au cours d'une campagne d'observation dédiée. La simulation des fines échelles dans le détroit est rendue possible grâce au développement original du coeur non-hydrostatique, compressible et à toit libre du code CROCO, présenté dans le chapitre 2 de ce manuscrit. La simulation régionale du détroit est ensuite abordée en deux temps : tout d'abord est élaborée une configuration 2D verticale qui permet d'évaluer les paramètres numériques à un faible coût numérique avec une dynamique correcte à l'échelle de la marée. Cette méthodologie est ensuite appliquée à une configuration 3D réaliste qui constitue une LES océanique originale. Cette maquette a été utilisée pour étudier la variabilité du lien entre forçage de marée, évolution du contrôle hydraulique, et intensité du mélange au cours du cycle mortes-eaux vives-eaux. En effet, les grandes structures turbulentes, simulées explicitement, ont été localisées au niveau des seuils, et une intensification de leur génération est observée en période de vives-eaux. La propagation des trains d'ondes solitaires, quant à elle, est mise en relation avec des observations de mouillage, et révèle un mécanisme secondaire de génération des ondes internes de grande amplitude dans le détroit lors des mortes-eaux. Une étude de sensibilité des grandes structures turbulentes et, par rétroaction, des caractéristiques des masses d'eaux à la fermeture sous-maille est aussi proposée. Le dernier chapitre aborde la question de la quantification du mélange diapycnal en se basant sur l'évolution de l'énergie potentielle. Un nouveau terme a été ajouté au bilan de cette quantité pour prendre en compte l'évolution du volume avec les mouvements de la surface libre. L'application a des cas tests de complexité et de réalisme croissants montre que ce terme est non-négligeable, sa prise en compte permettant de proposer une évaluation précise du mélange turbulent.This thesis focuses on the so-called fine-scale dynamics of the ocean spectrum, ranging from sub-mesoscale processes to the largest turbulent eddy scales leading to the direct Richardson cascade, itself ending up to molecular mixing. The properties of the ocean's water masses are partly ascribed to this irreversible mixing. While energy transfers in the direct cascade are well-known since Kolmogorov (1941)'s work, observations of the instabilities leading to those scales are few and their numerical simulation is seldom carried out, so that fine-scale dynamics constitutes a real Terra Incognita (Scotti, 2010). Improvements in efficiency of computation means and numerical models, along with new algorithms, now allow for the simulation of the largest turbulent eddies and the study of this Terra Incognita. An exploration of fine-scale dynamics is performed in the strait of Gibraltar linking the Mediterranean sea to the Atlantic ocean. In this area, water masses of contrasting density meet over an uneven, relatively shallow seafloor, where the tidal amplitude is large. Fine-scale processes are a consequence of these forcing in the strait : an hydraulic control of the flow evolves over each tidal period, generating and then relaxing an internal hydraulic jump. Mixing by shear instabilities is amplified when this jump is active, and the propagation of a train of internal solitary waves toward the Mediterranean sea follows. The generation of solitary waves and the shear instabilities in the strait of Gibraltar are studied in this manuscript through numerical simulations, and in-situ observations, the latter having been carried out during a dedicated oceanographic campaign. Simulation of the fine scale dynamics is made possible by the developments of the non-hydrostatic, compressible, free-surface kernel of CROCO detailed in chapter (2). Regional simulations of the strait are then addressed in two steps : first as a dynamically-simplified 2D configuration then as a 3D, realistic, LES configuration. The latter configuration allows to study the link between tidal forcing, hydraulic control, and mixing, and its evolution during the spring/neap tidal cycle. Indeed, an original explicit simulation of large turbulent eddies has been carried out : the turbulent eddies have consequently been localized in the region of the sills and their intensification with the spring/neap cycle has been highlighted. Propagation of solitary waves in simulations is compared to mooring observations, pointing to a secondary generation mechanism in the strait for neap tide periods.
A sensitivity study of the characteristics of turbulent eddies and water masses to subgrid models is also performed.
The final chapter of this manuscript revolves around the quantification of mixing based on the evolution of potential energy. A new term is added to the evolution equation of this quantity to take into account the variations of volume with free-surface movements. A careful evaluation of this equation in increasingly complex and realistic flow conditions proves that this term cannot be neglected, highlighting its importance when evaluating mixing with sufficient accuracy
Groupe fondamental de Morse stable
Get PDFCette thèse propose de donner une présentation du groupe fondamental d'une variété exclusivement en à partir de la dynamique du gradient d'une fonction de Morse stable.
En général, une interprétation d'un invariant algébrique en termes dynamiques est un outil riche pour explorer les interactions entre ces deux mondes. C'est en particulier l'idée qui est à la base de la théorie de Floer, dont la théorie de Morse stable peut être vue comme un modèle de dimension finie. S'il est bien connu que l'homologie de la variété peut être décrite en termes de la dynamique du flot de gradient d'une fonction de Morse stable, le cas du groupe fondamental est bien plus délicat. En particulier, M. Damian a montré qu'il existe des fonctions de Morse stable ayant strictement moins de points critiques que le nombre minimum de générateurs du groupe fondamental. Le cas des générateurs dans le cadre Morse stable a toute fois été résolu par J.-F. Barraud dans l'article "J.-F. Barraud. A Floer fundamental group. Ann. Sci. Éc. Norm. Supér. (4), 51(3) :773–809, 2018.", mais une description intrinsèque des relations manquait toujours tout en étant pourtant d'intérêt pour répondre à des questions d'injectivité qui apparaissent naturellement, en particulier dans le l'usage de techniques basées sur le théorème de s-cobordisme. L'idée explorée à plusieurs reprises afin d'obtenir une définition appropriée pour les relations est la réinterprétation de l'action du flot sur un lacet topologique en termes d'espaces de modules de trajectoires de gradient. Le résultat principal du manuscrit est la définition d'une présentation du groupe fondamental de Morse stable et la preuve de son invariance par rapport aux données fixées. La première partie du manuscrit décrit la présentation connue du groupe fondamental de Morse de la variété, en adoptant un point de vue qui a pour but de se généraliser le plus fidèlement possible au cadre Morse stable. On y détaille précisément la nature des espaces de trajectoires utilisés, leur géométrie et la combinatoire de leurs composantes de bord. La seconde partie du manuscrit propose une présentation du groupe fondamental en théorie de Morse stable. En particulier, de nouveaux espaces de modules sont introduits et étudiés pour fournir des générateurs du sous groupe des relations. On montre alors que le groupe obtenu est invariant et isomorphe au groupe fondamental usuel.The object of this thesis is to define a presentation of the fundamental group of a manifold exclusively out of the dynamics of the gradient of a stable Morse function.
In general, relating topological invariants to dynamical properties is a fruitful tool to explore the interplay of the two worlds; it is in particular the main idea behind the celebrated Floer theory, for which the stable Morse theory can be thought of as a finite dimensional model. It is well known that the homology of the manifold can be recovered from the dynamics of the gradient even in the stable Morse case, but the case of the fundamental group is much more challenging. In particular, as shown by M. Damian, stable Morse functions may have strictly less critical points than the minimal number of generators of the fundamental group. The question of the generators was solved by J.-F. Barraud in "J.-F. Barraud. A Floer fundamental group. Ann. Sci. Éc. Norm. Supér. (4), 51(3) :773–809, 2018. », but an intrinsic description of the relations was still missing and of interest to deal with injectivity questions arising naturally, in particular when working with techniques based on the s-cobordism theorem. The main idea to get an appropriate definition of the relations is to reformulate the action of the flow on topological loops in terms of moduli spaces of trajectories. The main result is a definition of a presentation of the stable Morse fundamental group and the proof that the resulting group is invariant and isomorphic to the usual fundamental group. The first part of the thesis describes the known presentation of the fundamental group in Morse theory, taking a point of view which can naturally be extended towards the stable Morse setting. The spaces of trajectories involved in this description are detailed, as are their geometry and the combinatorics of their boundary components.
The second part of the thesis defines a presentation of the "stable Morse fundamental group". On top of the generators, new spaces of trajectories are introduced and used to define generators of the subgroup of relations. It is then shown that the resulting quotient group is invariant and isomorphic to the usual fundamental group
Oxyde de graphène fonctionnalisés par des dendrons et dendrimères pour des applications en oncologie
No full textLe graphène, une monocouche d'atomes de carbone densément tassée dans un réseau en nid d'abeille, a été isolé pour la première fois en 2004. Ces dernières années, la recherche sur le graphène et ses dérivés a suscité un intérêt considérable dans un large éventail d'activités de recherche grâce à ses propriétés intéressantes. La voie la plus facile et polyvalente pour obtenir des nanocomposites à base de graphène consiste à oxyder le graphite naturel pour obtenir l’oxyde de graphène (GO), un matériau ayant une surface riche en fonctions chimiques modifiables. Des nanocomposites à base d’oxyde de graphène ont été synthétisés pour des applications potentielles dans l'électronique, le stockage d'énergie, la catalyse et la sorption, le stockage, la séparation et la détection de gaz ainsi que dans le domaine biomédical. Les dendrimères sont des macromolécules particulièrement intéressantes pour un très grand nombre d'applications dans des domaines extrêmement variés. Cet intérêt réside essentiellement dans leurs propriétés de coopérativité et de multivalence, ainsi que dans leur très haute capacité d'encapsulation ou de fixation de petites molécules, et ceci dans un volume de taille nanométrique. Cette caractéristique structurale est la conséquence de leur architecture unique ramifiée contenant un cœur central et possédant de nombreuses fonctions périphériques. Les dendrimères sont donc des outils très intéressants pour la délivrance de médicaments et d'acides nucléiques. Dans ce travail nous allons développer des approches simples pour décorer la surface de l’oxyde de graphène avec des dendrons et dendrimères phosphorés pour des applications en oncologie. Dans un premier temps on va effectuer la synthèse des dendrimères phosphorés classiques, et des dendrons AB5, ensuite le greffage des différents monomères sur leur surface. En parallèle la préparation de l’oxyde de graphène (GO) ainsi que la modification de la surface de GO par différentes méthodes a été effectué, et finalement le greffage des différents dendrons sur la plateforme de l’oxyde de graphène a permis d'obtenir de nouveaux matériaux hybrides qui seront testés biologiquement.Graphene, a monolayer of carbon atoms densely packed in a honeycomb lattice, was first isolated in 2004. In recent years, research on graphene and its derivatives has generated considerable interest in a wide range of research activities thanks to its interesting properties. The easiest and most versatile way to obtain graphene-based nanocomposites is to oxidize natural graphite to obtain graphene oxide (GO), a material with a surface rich in modifiable chemical functions. Graphene oxide nanocomposites have been synthesized for potential applications in electronics, energy storage, catalysis and sorption, gas storage, separation and detection as well as in the biomedical field. Dendrimers are particularly advantageous macromolecules for a very large number of applications in extremely varied fields. This interest resides essentially in their properties of cooperativity and multivalence, as well as in their very high capacity for encapsulation or fixing of small molecules, and this in a volume of nanometric size. This structural characteristic is the consequence of their unique branched architecture containing a central core and having many peripheral functions. Dendrimers are very interesting tools for the delivery of drugs and nucleic acids. In this work we will develop simple approaches to decorate the surface of graphene oxide with phosphorus dondron and dendrimers in order to create new hybrid materials with new properties. First, the synthesis of classical phosphorus dendrimers and of AB5 dendrons will be carried out, followed by the grafting of the different monomers on their surface. In parallel the preparation of graphene oxide (GO) as well as the modification of the GO surface with different methods will be carried out, and finally the grafting of the different dendrons on the platform of graphene oxide will afford new hybrid materials that will be biologically tested
Mécanismes de plasticité dans l'alliage CoCrFeMnNi : une étude in situ MET
Get PDFL'objectif de ce travail est de donner un aperçu complet des mécanismes de plasticité, plus particulièrement, du comportement des dislocations, dans l'alliage CoCrFeMnNi, un alliage à haute entropie équiatomique monophasé cristallisant dans la structure cfc. Ses propriétés mécaniques comprennent une résistance élevée, en particulier à basse température, une bonne ductilité et un grand nombre de systèmes de glissement, dont dépend largement sa plasticité. Pour mieux comprendre ses propriétés et ses mécanismes de plasticité, des expériences de déformation MET in situ ont été réalisées aux températures ambiante et cryogénique pour analyser le comportement et les mouvements des dislocations. Les dislocations se comportent comme dans un alliage cfc classique avec une faible énergie de faute d'empilement : des dislocations parfaites de type a/2 [110] glissent dans des plans type {111}, et elles se dissocient en partielles de Shockley a/6 [112]. Les mécanismes responsables de la plasticité sont le glissement planaire et le maclage. Au cours des essaies de traction de cette étude, ils ont été observés aux deux températures d'essai, ce qui permet de conclure que la dissociation des dislocations qui conduit à la formation du maclage est dominée par l'orientation cristalline de l'échantillon. Les mécanismes de déformation sont le résultat de l'interaction classique dislocation/obstacle, mais aussi des distorsions locales du réseau soumis aux dislocations en mouvement. Ceci est mis en évidence dans les expériences de déformation MET in situ sous forme d'obstacles qui épinglent les dislocations (mis en évidence par la courbure de la boucle des dislocations en mouvement sous une contrainte appliquée). Ces obstacles semblent être plus forts à basse température, un fait qui est étudié plus en détail dans ce travail. Les points d'épinglage semblent être le résultat du paysage atomique local de l'alliage CoCrFeMnNi, ce qui provoque également le déplacement "saccadé" des dislocations qui a été rapporté pour cette alliage.The aim of this work is to give a comprehensive compendium of plasticity mechanisms, more specifically dislocation behaviour, in single-phase equiatomic CoCrFeMnNi, a high entropy alloy that crystallizes in the fcc structure. Its mechanical properties include high strength, particularly at low temperatures, good ductility and a large number of slip systems, on which its plasticity largely depends. To have a better understanding of its properties and its plasticity mechanisms, in situ TEM straining experiments were carried out at room and cryogenic temperatures to analyse dislocation behaviour and movements. Dislocations behave as they do in a classic fcc low SFE alloy: perfect a/2[110] dislocations glide in {111}-type planes, and they dissociate into a/6[112] Shockley partials. The mechanisms responsible for plasticity are planar slip and twinning. They both occur at the two testing temperatures in this study, leading to conclude that the dissociation of dislocations that lead to twin formation is dominated by the crystalline orientation of the specimen. The strengthening mechanisms are a result of the classical dislocation/obstacle interaction, but also of the local lattice distortions subject to moving dislocations. This is evidenced in the in situ TEM straining experiments as obstacles than pin dislocations (evidenced by the curvature of dislocations loop while moving under applied stress). These obstacles seem to be stronger at low temperature, a fact that is further studied in this work. The pinning points seem to be a result of the local atomic landscape of CoCrFeMnNi alloy, which also causes dislocations to move in the reported "jerky" manner for the alloy
Évaluation du potentiel de co-produits agricoles locaux valorisables dans le domaine des matériaux de construction (PALOMAC)
Get PDFLe secteur de la construction devrait reconsidérer ses activités en raison de ses impacts négatifs sur l'environnement. L'usage de matériaux de construction biosourcés comme les agrobétons a été proposé depuis une vingtaine d'années pour améliorer le bilan environnemental peu flatteur de ce secteur. Le béton de chanvre est le matériau le plus étudié dans le domaine. Cependant, les chènevottes de chanvre utilisées pour leur fabrication ne sont pas les agro-ressources les plus disponibles dans le Sud-Ouest de la France. Au regard de ce contexte, et en partenariat avec une entreprise de recherche et développement agricole, Ovalie Innovation, l'objectif de cette thèse est de mettre en place des protocoles de caractérisation adéquats pour les granulats végétaux utilisables dans la construction, et ce afin d'évaluer le potentiel de ces co-produits agricoles locaux, de formuler des blocs de bétons végétaux préfabriqués, et de relier les propriétés d'usage des composites à celles des matières premières entrant dans leur formulation. Neuf granulats locaux et une chènevotte, étudiée comme granulat de référence, ont été soumis à une série de caractérisations chimiques, multi-physiques et mécaniques proposées ou adaptées à partir des recommandations existantes dans la littérature. Ces neuf granulats sont les anas de lin oléagineux, la moelle et l'écorce de la tige de tournesol, la paille de coriandre, la paille de blé, les menues pailles de blé, les spathes de maïs, la tige de miscanthus et les sarments de vigne. Pour les caractérisations chimiques, il a été montré que la quantité d'hydrosolubles à pH 12 est plus pertinente que celle à pH 7 pour évaluer l'effet néfaste de ces constituants sur les composites avec des liants réactifs. En ce qui concerne les caractérisations physiques, le plan d'expériences mis en œuvre a permis de valider les diverses méthodes de détermination des masses volumiques et des porosités intra et inter-particulaires, de la masse volumique compactée à l'état humide puis séchée et de l'absorption réelle d'eau après compaction qui se sont avérées être de bons paramètres de formulation des composites. Le comportement mécanique à la compression des empilements des granulats végétaux a permis de distinguer deux familles de granulats selon la rupture ou la rigidification de l'enchevêtrement des particules. A l'issue de la fabrication des composites formulés à partir des paramètres précédemment définis, leurs propriétés d'usage, thermiques et mécaniques, ont été évaluées. Deux séquences de malaxage et deux types de liants minéraux ont également été étudiés. La conductivité thermique des composites est influencée par la masse volumique compactée, la porosité particulaire et la conductivité thermique des granulats mais elle n'est pas affectée par la séquence de malaxage ni par le type de liant. Les performances mécaniques en compression et en flexion des composites sont influencées simultanément par la porosité inter-particulaire, le module élastique de l'empilement compacté et la quantité d'hydrosolubles des granulats. Au vu de ces propriétés d'usage, la chènevotte de référence, les anas de lin oléagineux, la moelle et l'écorce de tournesol ont été retenus et combinés avec trois types de liant pour une étude plus approfondie. Les microstructures poreuses des granulats et des composites formés ont été explorées afin de les relier aux performances hygrothermiques et mécaniques des composites. Les travaux réalisés dans cette thèse contribuent à l'établissement d'un référentiel de caractérisation des agro-ressources applicable aux différents co-produits agricoles disponibles dans chaque région. L'usage de matières premières disponibles localement constitue en effet un paramètre prépondérant de l'impact environnemental des matériaux de construction biosourcés. Afin de compléter ce référentiel de caractérisation, des travaux additionnels concernant l'Analyse de Cycle de Vie (ACV) des granulats végétaux seront donc nécessaires.The building industry should reconsider its activities, due to its negative environmental impacts. The use of bio-based construction materials such as bio-aggregates based concretes, known for their insulating property and their capacity to regulate indoor humidity, has been proposed for twenty years to improve the less-than flattering environmental record of this sector. Hemp concrete is the most studied material in this field. However, hemp shives are not the most available agroresources in southwestern France. In view of this context, and in partnership with an agricultural research and development company called Ovalie Innovation, the objective of this thesis is to set up relevant characterization methods for the plant aggregates that can be used in construction, in order to assess the potential of these local agricultural co-products, to allow the formulation of prefabricated vegetal concrete blocks, and to correlate the use properties of the composites to those of the raw materials used in their formulation. Nine local aggregates and a hemp shiv, chosen as reference aggregate, were subjected to a series of chemical, multi-physical and mechanical characterizations proposed or adapted from existing recommendations in the literature. These nine local aggregates are flax shiv, sunflower pith and bark from stalk, coriander straw, wheat straw, wheat chaff, corn shuck, miscanthus stem and vine shoot. For chemical characterizations, it has been shown that the amount of water-solubles at pH 12 is more relevant than that at pH 7 to assess the detrimental effect of these constituents on composites with reactive binders. With regard to the physical characterizations, the implemented experimental plan allowed to validate the various methods of determination of the densities and intra and interparticle porosities, the dry density of aggregates compacted in wet state and the real water absorption after compaction which have been proven to be good formulation parameters for composites. The mechanical behavior in compression of the stacks of plant aggregates allowed to identify two families of aggregates depending on the rupture or the stiffening of the entanglement of the particles. After the manufacture of composites formulated from previously defined parameters, their thermal and mechanical use properties were evaluated. Two mixing sequences and two types of binder were also studied. The thermal conductivity of the composites is influenced by the dry density compacted in wet state, the particle density and the thermal conductivity of the aggregates but it is not affected by the mixing sequence or the binder type. The mechanical performance in compression and flexion of composites is influenced simultaneously by the interparticle porosity, the elastic modulus of the compacted stack and the amount of water-solubles of the aggregates. In view of these use properties, the reference hemp shiv, flax shiv and sunflower pith and bark were selected and combined with three types of binder for further study. The porous microstructures of aggregates and composites have been explored in order to relate them to the hygrothermal and mechanical performances of the composites. The work carried out within the framework of this thesis contributes to the establishment of a benchmark for the characterization of agroresources workable to the various agricultural co-products available in each region and to the constitution of a database of valuable agricultural co-products in construction. The use of locally available raw materials is indeed a major parameter of the environmental impact of bio-based construction materials. In order to complete this characterization benchmark, additional work on the Life Cycle Analysis (LCA) of plant aggregates will therefore be necessary
La détection d'anomalies comme outil de renforcement d'analyse des données et de prédiction dans l'éducation
Get PDFLes établissements d'enseignement cherchent à concevoir des mécanismes efficaces pour améliorer les résultats scolaires, renforcer le processus d'apprentissage et éviter l'abandon scolaire. L'analyse et la prédiction des performances des étudiants au cours de leurs études peuvent mettre en évidence certaines lacunes d'une formation et détecter les étudiants ayant des problèmes d'apprentissage. Il s'agit donc de développer des techniques et des modèles basés sur des données qui visent à améliorer l'enseignement et l'apprentissage. Les modèles classiques ignorent généralement les étudiants présentant des comportements et incohérences inhabituels, bien qu'ils puissent fournir des informations importantes aux experts du domaine et améliorer les modèles de prédiction. Les profils atypiques dans l'éducation sont à peine explorés et leur impact sur les modèles de prédiction n'a pas encore été étudié dans la littérature. Cette thèse vise donc à étudier les valeurs anormales dans les données éducatives et à étendre les connaissances existantes à leur sujet. La thèse présente trois études de cas de détection de données anormales pour différents contextes éducatifs et modes de représentation des données (jeu de données numériques pour une université allemande, jeu de données numériques pour une université russe, jeu de données séquentiel pour les écoles d'infirmières françaises). Pour chaque cas, l'approche de prétraitement des données est proposée en tenant compte des particularités du jeu de données. Les données préparées ont été utilisées pour détecter les valeurs anormales dans des conditions de vérité terrain inconnue. Les caractéristiques des valeurs anormales détectées ont été explorées et analysées, ce qui a permis d'étendre les connaissances sur le comportement des étudiants dans un processus d'apprentissage. L'une des principales tâches dans le domaine de l'éducation est de développer des mécanismes essentiels qui permettront d'améliorer les résultats scolaires et de réduire l'abandon scolaire. Ainsi, il est nécessaire de construire des modèles de prédiction de performance qui sont capables de détecter les étudiants ayant des problèmes d'apprentissage, qui ont besoin d'une aide spéciale. Le deuxième objectif de la thèse est d'étudier l'impact des valeurs anormales sur les modèles de prédiction. Nous avons considéré deux des tâches de prédiction les plus courantes dans le domaine de l'éducation: (i) la prédiction de l'abandon scolaire, (ii) la prédiction du score final. Les modèles de prédiction ont été comparés en fonction de différents algorithmes de prédiction et de la présence de valeurs anormales dans les données d'entraînement. Cette thèse ouvre de nouvelles voies pour étudier les performances des élèves dans les environnements éducatifs. La compréhension des valeurs anormales et des raisons de leur apparition peut aider les experts du domaine à extraire des informations précieuses des données. La détection des valeurs aberrantes pourrait faire partie du pipeline des systèmes d'alerte précoce pour détecter les élèves à haut risque d'abandon. De plus, les tendances comportementales des valeurs aberrantes peuvent servir de base pour fournir des recommandations aux étudiants dans leurs études ou prendre des décisions concernant l'amélioration du processus éducatif.Educational institutions seek to design effective mechanisms that improve academic results, enhance the learning process, and avoid dropout. The performance analysis and performance prediction of students in their studies may show drawbacks in the educational formations and detect students with learning problems. This induces the task of developing techniques and data-based models which aim to enhance teaching and learning. Classical models usually ignore the students-outliers with uncommon and inconsistent characteristics although they may show significant information to domain experts and affect the prediction models. The outliers in education are barely explored and their impact on the prediction models has not been studied yet in the literature. Thus, the thesis aims to investigate the outliers in educational data and extend the existing knowledge about them. The thesis presents three case studies of outlier detection for different educational contexts and ways of data representation (numerical dataset for the German University, numerical dataset for the Russian University, sequential dataset for French nurse schools). For each case, the data preprocessing approach is proposed regarding the dataset peculiarities. The prepared data has been used to detect outliers in conditions of unknown ground truth. The characteristics of detected outliers have been explored and analysed, which allowed extending the comprehension of students' behaviour in a learning process. One of the main tasks in the educational domain is to develop essential tools which will help to improve academic results and reduce attrition. Thus, plenty of studies aim to build models of performance prediction which can detect students with learning problems that need special help. The second goal of the thesis is to study the impact of outliers on prediction models. The two most common prediction tasks in the educational field have been considered: (i) dropout prediction, (ii) the final score prediction. The prediction models have been compared in terms of different prediction algorithms and the presence of outliers in the training data. This thesis opens new avenues to investigate the students' performance in educational environments. The understanding of outliers and the reasons for their appearance can help domain experts to extract valuable information from the data. Outlier detection might be a part of the pipeline in the early warning systems of detecting students with a high risk of dropouts. Furthermore, the behavioral tendencies of outliers can serve as a basis for providing recommendations for students in their studies or making decisions about improving the educational process
Analyse génétique et moléculaire de l'immunité des hydathodes et du système vasculaire des Brassicacées
Get PDFLes hydathodes sont décrits pour la première fois à la fin du XIXe siècle, par le botaniste chirurgien microbiologiste Prussien Anton de Bary. Depuis, ces organes, pourtant présents sur les feuilles de la majorité des plantes vasculaires, ne sont étudiés que sporadiquement par la communauté scientifique. Sites de la guttation, les hydathodes se retrouvent à la pointe de la dentelure des feuilles. Constitués de pores dans l'épiderme et d'un parenchyme distinctif lié au système vasculaire, les hydathodes font le lien direct entre le milieu extérieur et les vaisseaux du xylème des feuilles. De façon surprenante, cette voie d'entrée dans les tissus végétaux n'est utilisée que par une poignée d'agents pathogènes. Parmi eux, Xanthomonas campestris pathovar campetris (Xcc) est l'agent responsable de la nervation noire de Brassicacées. Cette bactérie constitue une menace pour l'agriculture, puisqu'elle est capable d'infecter de nombreuses espèces cultivées, telles que les choux et choux-fleurs, le navet, la moutarde, le radis, etc. Si les facteurs de virulence de Xcc sont bien connus, peu d'études se sont attelées à décrypter le rôle des hydathodes dans l'immunité des plantes, alors qu'ils sont le premier lieu de contact entre Xcc et la plante. Au cours de ce projet de thèse, j'ai étudié les spécificités transcriptomiques des hydathodes par rapport au mésophylle et les particularités du métabolome du fluide de guttation en comparaison de celui de la sève brute. J'ai ensuite établi les premières bases génétiques de l'immunité post-invasive des hydathodes de chou-fleur (cultivar Clovis) en comparant leur réponse à une souche virulente et avirulente de Xcc, durant les étapes précoces de l'infection. Dans la deuxième partie du projet, j'ai mis en place un système permettant de cribler un grand nombre de mutants d'Arabidopsis thaliana en réponse à Xcc, qui sera utilisé au sein de l'équipe. Grâce à cette nouvelle méthode, j'ai entamé le criblage d'une collection de mutant d'A. thaliana et identifié plus d'une cinquantaine de lignées dont la sensibilité à Xcc est altérée. Pour finir, dans la troisième partie réalisée dans le cadre d'une collaboration, j'ai exploré le lien entre le nombre d'hydathodes, l'état hydrique des tissus et le comportement infectieux de Xcc.
Ce projet apporte des données originales et des outils qui permettront de mieux comprendre le fonctionnement des hydathodes en tant qu'organes ainsi que leur rôle au cours des interactions plantes-pathogènes.Hydathodes were first characterized at the end of the XIXth century by Anton de Bary, a Prussian botanist, surgeon and microbiologist. Since, theses organs are studied sporadically, even if they are present on leaves of most vascular plants. Localized at the leaf serration tips, hydathodes are the sites of guttation. They are composed of pores in the epidermis and of a peculiar parenchyma connected to the vasculature. Hydathodes are thus a link between leaf xylem vessels and the outside world. Surprisingly, only a handful of pathogens can penetrate the plant this way. Xanthomonas campestris pathovar campestris (Xcc), causal agent of black rot of Brassica is one of them. Xcc represent a threat to agriculture, because it can infect many Brassica crops, such as cabbage, cauliflower, turnip, mustard or radish. Xcc virulence factors are well studied, but not much is known about plant immunity inside hydathodes, even if they are the first contact point between Xcc and the plant. During this PhD project, I studied hydathode transcriptomic and guttation fluid metabolomics characteristics. I also established the genetic bases of cauliflower hydathode post-invasive immunity, by comparing hydathodes responses to an Xcc virulent or avirulent strain, during the early stages of infection. In the second part of the project, I set up a method to screen immune defect in many Arabidopsis thaliana mutants in response to Xcc infection. This method will be a future asset for my host team. I also used it to start the screen of a collection of A. thaliana mutants. I identified more than fifty lines with a modified susceptibility to Xcc. Last, I delved into the link between number of hydathodes, water status of tissues and Xcc infectious strategy. This work brings original results and a protocol that will help us to better understand hydathodes biology as plant organs as well as their role during plant-pathogen interactions