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État des connaissances sur l'émyde lépreuse (Mauremys Leprosa) - création d'une base de données bibliographique
Get PDFL’Émyde lépreuse (Mauremys leprosa) est la tortue présente de manière naturelle en France la plus menacée avec une présence estimée de seulement 660 individus sur le territoire. Dans ce contexte, un Plan National d’Actions (PNA) a été mis en place de 2012 à 2016 et un nouveau PNA est actuellement en cours de rédaction. L’Association du Refuge des Tortues (ART), située à Bessières (31) s’implique fortement dans la conservation de cette espèce au travers du projet « Sauvons l’Émyde lépreuse ». C’est dans le cadre de ce projet que cette étude a été réalisée. La création d’une base de données bibliographique sur cette espèce à été réalisée par différents acteurs de ce projet. A partir de cette base déjà constituée, des outils de recherche et d’analyses ont été créés afin de faciliter l’exploitation et le suivi de ces données par pays, année et thématique d’étude. Ceci a permis de faire un panorama de la littérature officielle et grise disponible et ainsi de mettre en évidence des sujets pour lesquels des études complémentaires seraient bénéfiques tant à la préservation de cette espèce menacée qu’à l’amélioration des connaissances. Cette base bibliographique peut également servir d’outil de recherche pour les futures études qui seront réalisées. L’enrichissement de cette base au fil du temps est indispensable principalement pour l’actualisation des données face aux évolutions environnementales et aux évolutions de l’espèce
Détection précoce des infections bactériennes chez le chiot nouveau-né.
Get PDFLa mortalité néonatale chez l’espèce canine est un enjeu majeur, avec l’un des plus forts taux de mortalité (entre 9 et 34%) parmi les espèces domestiques. Les causes principales de cette mortalité sont les dystocies suivies des infections bactériennes. Le diagnostic de ces infections est souvent post-mortem. Après avoir défini la notion de sepsis et de biomarqueurs nous avons étudiés six paramètres (protéine C-réactive, procalcitonine, protéines totales, albumine, rapport albumine/globulines et immunoglobulines G) chez une population de chiots sains (56 individus) et une population de chiots décédés d’infection bactérienne (44 individus). L’analyse statistique multivariée a permis de mettre en évidence des effets de l’âge des chiots, ainsi que du format racial sur les valeurs de ces paramètres. Aucun des biomarqueurs étudiés n’a une valeur diagnostique suffisante pour permettre le diagnostic précoce des infections bactériennes chez les chiots. Cette étude a permis de calculer des intervalles de références pour chacun des paramètres pour les chiots nouveau-nés
Utilisation de la microscopie confocale et à feuille de lumière en 3D dans l'étude de l'anatomie de la mouche d'étable, Stomoxys calcitrans
Get PDFLes stomoxes (Stomoxys calcitrans), mouches piqueuses cosmopolites piquant Homme et animal, font partie des principaux ectoparasites des bovins. Ces mouches sont des agents de nuisance majeure en élevage engendrant des pertes économiques notables pour l’éleveur, et sont également vecteurs, le plus souvent mécaniques, confirmés ou supposés de nombreux agents pathogènes (virus, bactéries, parasites). Cependant les modalités précises du portage et de la transmission mécanique par les stomoxes ne sont pas parfaitement connues et certains paramètres nécessitent d’être confirmés (rôle du jabot dans le stockage d’un agent pathogène, rôle des glandes salivaires, caractère infectieux de l’agent pathogène transmis). Ainsi, il est fondamental de préciser les structures anatomiques impliquées dans le stockage de l’agent pathogène et de sa cinétique chez le stomoxe, afin de mieux maitriser les modalités de vectorisation mécanique, encore méconnues. Une bonne connaissance de l’anatomie de ces vecteurs est donc nécessaire. Ainsi dans ce travail de thèse, nous proposons pour la première fois chez ce vecteur, l’utilisation de la microscopie en 3D (microscopie confocale et à feuille de lumière) afin de décrire avec précision ses structures anatomiques. Cette thèse a eu également pour objectif la standardisation d’un protocole de transparisation, étape indispensable à l’observation microscopique des tissus, et l’apport d’images de références sur l’anatomie interne des stomoxes. L’utilisation de la microscopie en 3D sur stomoxes transparisés pourra être envisagée dans l’étude de la transmission d’agents pathogènes, et étendue par la suite à d’autres vecteurs d’intérêt médical et vétérinaire
11CO2 positron emission imaging reveals the in-situ gas concentration profile as function of time and position in opaque gas-solid contacting systems
Get PDFThe in situ analysis of industrial processes, mostly conducted in opaque equipment is difficult. Whereas previously the positron emission technique was successfully applied to study the flow and mixing in gas-solid and liquid-solid systems using radio-active tracer particles, research on imaging a radio- active tracer gas is scarce. The present paper demonstrates the use of a fully three-dimensional (3D) Positron Emission Tomography (PET) in imaging the adsorption of 11CO2 tracer gas, while validating the measurement by conventional exit gas analysis. It will be demonstrated that PET can be used to measure the kinetics of high-pressure CO2 adsorption in situ, including the essential breakthrough and mass transfer zone characteristics. Such high-pressure operation is characteristic of pre-combustion CO2 capturing processes. It is expected that this work will foster further studies of gas-solid systems of adsorption, gas-solid catalysis, gas-solid hydrodynamics, and processes where the gas-solid
interaction is of primary importance
Periodic flow structures in a turbofan fan stage in windmilling
Get PDFIn a fan stage under windmilling conditions, the stator operates under negative incidence, leading to flow separation, which may present an unsteady behaviour due to rotor/stator interactions. An experimental study of the unsteady flow through the fan stage of a bypass turbofan in windmilling is proposed, using hot-wire anemometry. Windmilling conditions are reproduced in a ground engine test bed by blowing a variable mass flow through a bypass turbofan in ambient conditions. Time-averaged profiles of flow coefficient are independent of the mass flow, demonstrating the similarity of velocity triangle. Turbulence intensity profiles reveal that the high levels of turbulence production due to local shear are also independent of the inlet flow. A spectral analysis confirms that the flow is dominated by the blade passing frequency, and that the separated regions downstream of the stator amplify the fluctuations locked to the BPF without adding any new frequency. Phase-locked averaging is used to capture the periodic wakes of the rotor blades at the rotor/stator interface. A spanwise behaviour typical of flows through windmilling fans is evidenced. Through the inner sections of the fan, rotor wakes are thin and weakly turbulent, and the turbulence level remains constant through the stage. The rotor wakes thicken and become more turbulent towards the fan tip, where flow separation occurs. Downstream of the stator, maximum levels of turbulence intensity are measured in the separated flow. Large periodical zones of low velocity and high turbulence intensity are observed in the outer parts of the separated stator wake, confirming the pulsating motion of the stator flow separation, locked at the blade passing frequency. Space-time diagrams show that the flow is chorochronic, and a 2 D non-linear harmonic simulation is able to capture the main interaction modes, however, the stator incidence distribution could be affected by 3 D effects
Safety and Certifiability Evaluation of Distributed Electric Propulsion Airplane in EASA CS-23 Category
Get PDFDistributed Electric Propulsion (DEP) is one of the unconventional airplane architectures of interest in the quest for decreasing aviation environmental footprint. This configuration integrates strong and innovative couplings between systems and aircraft design disciplines. To address limitations of the traditional approach for certification and of the associated means of compliance when certifying innovative products, the European Union Aviation Safety Agency (EASA) issues in 2017 a novel certification philosophy that relies on high-level objective-based safety requirements. In this context, this paper presents a safety and certifiability evaluation of DEP airplane in EASA CS-23 category, with a methodology for aircraft-level safety assessment during preliminary design, a certification gap analysis with regards to existing means of compliance, and some proposals to clear the certification path for DEP configuration
Simulations of ionic liquids confined in surface-functionalized nanoporous carbons: implications for energy storage
Get PDFPorous carbons are used in a wide range of applications, including electrochemical double-layer capacitors for energy storage, in which electrolyte ion properties under confinement are crucial for the performance of the systems. While many synthesis techniques lead to the presence of surface functional groups, their effect on the adsorption and diffusion of electrolyte ions is still poorly understood. In this study, we investigate the effect of surface chemistry on the dynamical and structural properties of adsorbed ions through molecular dynamics simulations of a neat ionic liquid in contact with several zeolite-templated carbons, used here as model materials for the larger range of existing ordered microporous carbons. The steric and specific influence of functional groups is explored using three structures: a structure without any functional groups; a structure with ester, hydroxyl, anhydride acid, and carboxyl functional groups; and a structure where the oxygen and hydrogen atoms are replaced by carbon atoms. We calculate quantities of adsorbed ions and diffusion coefficients, which show variations with the addition of functional groups in agreement with experimental data for similar systems. We observe that the functionalization has a limited impact on the structure of the confined electrolyte but affects the ion mobility more markedly, and that the relative importance of the structure and chemical nature of the functional groups is not the same depending on the ion type and property considered
Mise en ligne d'un atlas tomodensitométrique d'images normales de la tortue de Floride (Trachemys scripta elegans)
Get PDFLa pratique du scanner se démocratise chaque jour un peu plus au sein la médecine vétérinaire, notamment pour les animaux de compagnie. Cependant son utilisation reste encore récente et il existe encore un manque de connaissances autour des principes physiques, et l’interprétation des images est toujours complexe pour une partie des vétérinaires. Cette thèse ne se concentre que sur la Tortue de Floride, qui est fréquemment rencontrée dans des parcs zoologiques et autres structures spécialisées. Elle fait cependant partie d’un ensemble de thèses qui ont pour but de mettre à disposition des images de scanner en ligne, que ce soit pour les animaux de compagnie ou pour la faune sauvage. L’intérêt de cet atlas est de proposer des images légendées d’un animal sain, obtenues à la fois avec une fenêtre osseuse, une fenêtre pulmonaire et une fenêtre tissu mou (avec et sans produit de contraste). Cet outil est mis en ligne pour permettre à tout·e·s professionnel·le·s et étudiant·e·s de se l’approprier
Sers in microchannels from the integration of a nanostructured silver layer by electrodeposition and study of the photothermal effect
Get PDFA new method is described and used to integrate an immobilized Surface Enhanced Raman Spectroscopy (SERS) substrate in microchannels. This is based on the direct and fast electrodeposition of an adherent Ag layer on a microchannel wall. This layer exhibits a spatially uniform nanostructure allowing the enhancement of the Raman signal by an analytical factor of 2.10+4 for crystal violet molecules. The microsystem thus elaborated is used to examine the photothermal effect, induced by the laser used, on the SERS spectra under liquid flow
Potentiel des informations de la génomique et du microbiote intestinal pour la sélection de l'efficacité alimentaire en porc
Get PDFL'objectif principal de la thèse était d'étudier comment les informations génomiques de l'animal et de son microbiote peuvent contribuer à améliorer la sélection pour l'efficacité alimentaire chez le porc. La thèse s'est appuyée sur les données de deux lignées de porcs issues de 10 générations de sélection divergente pour l'efficacité alimentaire. En plus de phénotypes enregistrés pour environ 200 porcs par lignée et par génération, 588 échantillons de fèces ont été collectés en générations 9 et 10. De plus, des génotypes pour environ 1000 animaux par lignée étaient disponibles. Cinq caractères ont été étudiés: la consommation moyenne journalière résiduelle, l’indice de consommation, la consommation moyenne journalière, le gain moyen quotidien et l'épaisseur de lard dorsal. Dans cette thèse, nous avons montré que les informations moléculaires sur les porcs ou leur microbiote peuvent améliorer la sélection pour l'efficacité alimentaire. Ce caractère est coûteux à enregistrer, alors que les informations moléculaires pourraient être plus faciles à obtenir sur un grand nombre de porcs. Dans ce projet, le potentiel du génotypage des animaux a été examiné dans le premier chapitre, et celui du microbiote intestinal a été exploré dans les deux suivants. Nous avons d'abord montré que lorsque la disponibilité des données est limitée, la prédiction génomique avec une population de référence combinant des animaux de lignées génétiquement liées peut être aussi précise qu’une prédiction génomique utilisant une population de référence de la lignée cible uniquement. Comparant de nombreux scénarios, nos résultats ont fourni des repères pour la construction de populations de référence pour initier la sélection génomique dans des lignées petites, qui ne disposent pas d'un grand nombre d'échantillons ou de données historiques et sont développées simultanément. Cette situation peut être rencontrée en volaille et en porc ainsi que dans d'autres populations en croisement. Des études complémentaires seront nécessaires pour quantifier le potentiel économique de cette approche et clarifier l'équilibre optimal entre génotypage et de phénotypage. Dans les chapitres suivants, nous avons montré que la variabilité du microbiote intestinal, captée par séquençage partiel du gène de l'ARNr 16S, contribue à la variabilité des caractères de production, en particulier de l'efficacité alimentaire. Dans un premier temps, nous avons identifié des composantes du microbiote (genres, OTU, indices de -diversité) héritables (48 genres sur les 75 analysés, plus deux indices de -diversité). Vingt et un de ces genres, appartenant aux familles Lachnospiraceae, Ruminococcaceae, Prevotellaceae, Lactobacillaceae, Streptococcaceae, Rikenellaceae et Desulfovibrionaceae, et les deux indices de -diversité étaient génétiquement corrélés à certains caractères. Deuxièmement, l'étude de la microbiabilité a montré une contribution substantielle des effets microbiote à la variabilité de l'efficacité alimentaire (> 10%) et une contribution négligeable pour les autres caractères (< 5%). De plus, cette étude a révélé que la génétique de l'hôte avait une contribution plus élevée que le microbiote à la variance des caractères étudiés (héritabilité plus élevée que les valeurs de microbiabilité). Cette dernière étude a également montré des associations significatives de certains taxons microbiens avec les performances. Ces résultats ont souligné la possibilité d'utiliser certains caractères microbiens comme marqueurs pour la sélection de l'efficacité alimentaire chez les porcs. Des études complémentaires seront nécessaires pour évaluer comment les informations génomiques de l'hôte et du microbiote peuvent être combinées dans des modèles de prédiction pour soit mieux prédire les valeurs génétiques elles-mêmes, soit même obtenir des prédictions conjointes des valeurs génétiques et microbiote, qui conduiraient à la sélection de l'hologénome pour une efficacité de production améliorée