Universidad de Los Andes
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Diseño computacional y tamizaje de potenciales inhibidores de GAP50 como posibles antimaláricos
No full textMalaria is a globally impactful infectious disease, particularly in tropical and subtropical regions, where it remains a major public health concern. The increasing resistance to current antimalarial treatments highlights the urgent need to identify new therapeutic targets and develop effective compounds. In this context, the GAP50 (Glideosome-Associated Protein 50) of the Plasmodium parasite has emerged as a promising target due to its essential role in erythrocyte invasion. This thesis focused on the identification of novel GAP50 inhibitors as potential antimalarial agents, utilizing virtual screening strategies. We applied computational tools, including structural modeling, pharmacophore generation, molecular docking, molecular dynamics simulations,binding energy estimation via MMGBSA, and compound design using Ligand Designer, a tool integrated into the Maestro platform of the Schrödinger software suite41. These approaches enabled the identification of candidate compounds with high affinity for GAP50. Among the most promising were (A) Alprazolam, (B) Analog 31 of MMV023227, (C) Analog 63 of MMV023227, (D) Mol_Ligand_273, and (E) Mol_Ligand_366, all of which showed better performance than bedaquiline. The latter has demonstrated affinity for GAP50 and, in vivo studies with P. bergheiinfected mice, led to the recovery of 3 out of 7 animals, indicating its antiparasitic potential. These results provide a foundation for future experimental validation and the rational development of new antimalarial therapies.La malaria es una enfermedad infecciosa de gran impacto global, especialmente en regiones tropicales y subtropicales, donde representa un importante problema de salud pública. La resistencia creciente a los tratamientos antipalúdicos actuales resalta la necesidad urgente de identificar nuevos blancos terapéuticos y desarrollar compuestos efectivos. En este contexto, la proteína GAP50 (Glideosome-Associated Protein 50) del parásito Plasmodium ha surgido como un blanco prometedor, debido a su papel esencial en la invasión de eritrocitos. Esta tesis se enfocó en la identificación de nuevos inhibidores de GAP50 como potenciales agentes antimaláricos, utilizando estrategias de cribado virtual. Se emplearon herramientas como el modelado estructural, generación de un modelo farmacofórico, acoplamiento molecular, dinámica molecular, estimación de energías de unión mediante MMGBSA, y el diseño de compuestos mediante la herramienta Ligand Designer, integrada en la plataforma Maestro del software Schrodinger41. Estas aproximaciones permitieron identificar compuestos candidatos con alta afinidad por GAP50. Entre ellos destacan (A) Alprazolam, (B) Análogo 31 de MMV023227, (C) Análogo 63 de MMV023227, (D) Mol_Ligand_273 y (E) Mol_Ligand_366, los cuales mostraron mejor desempeño que la bedaquilina. Esta última ha demostrado afinidad por GAP50 y, en ensayos in vivo con ratones infectados con P. berghei, permitió la recuperación de 3 de 7 animales, evidenciando su potencial antiparasitario. Los resultados obtenidos constituyen una base para futuras validaciones experimentales y el desarrollo de nuevas terapias contra la malaria.Pregrad
Rastro vivo
No full textEste proyecto parte de una reflexión sobre los residuos orgánicos, específicamente la cáscara de banano, y su potencial para ser resignificados como materiales con valor estético, simbólico y funcional. A través de una metodología de experimentación basada en el DIY-Materials, la biomímesis y el pensamiento material, se desarrolló un proceso de creación que permitió transformar este desecho común en un textil vegetal denominado Musa x Paradisiaca. Durante el proceso se estableció una relación íntima y mutua entre el material y la experimentadora, revelando una tecnología del cuidado en la que el gesto, el cuerpo y la memoria se entrelazan.
El resultado es un material que no solo tiene propiedades físicas aprovechables, sino también una dimensión narrativa y afectiva que cuestiona los límites entre lo natural y lo cultural, lo humano y lo más-que-humano. El proyecto propone una mirada crítica al concepto de desecho y una invitación a repensar los ciclos de vida de los materiales desde la sensibilidad, la sostenibilidad y el diseño como práctica relacional.Pregrad
Modelo de detección de audios en español y videos deepfake contra ataques de ingeniería social
No full textTeniendo en cuenta el creciente empleo de deepfakes con fines negativos como dañar reputaciones, difundir noticias falsas o realizar burlas, este trabajo presenta una plataforma de detección de contenidos deepfake en audio y video. Se evaluaron distintos modelos de aprendizaje profundo, analizando precisión, eficiencia y escalabilidad.
La solución permite subir archivos mediante una API web y ofrece una clasificación con un intervalo de confianza, además de registrar resultados para facilitar futuros entrenamientos. Los resultados superan los estándares actuales y demuestran la viabilidad de la herramienta en entornos académicos y profesionales.Pregrad
Paseo urbano: integración sostenible entre La Plata y su Río
No full textEste registro incluye dos tipos de contenido: (1) el libro del proyecto de grado (80 páginas), que recopila el proceso completo de investigación, análisis y diseño del Paseo Urbano en el borde del río La Plata, y (2) las planchas finales en formato PDF, que condensan gráficamente la propuesta y sus principales resultados. Ambos documentos forman parte integral del trabajo desarrollado en el curso Proyecto Integrador Final – Travesías, en la Universidad de los Andes.Este proyecto propone el diseño de un paseo urbano multifuncional en el borde del río La Plata, en el municipio de La Plata, Huila. Surge como respuesta a la desconexión histórica entre el territorio y su río, así como a la amenaza constante de inundaciones. A través de franjas estratégicas de intervención, el proyecto busca integrar el paisaje fluvial con el tejido urbano cercano, mediante soluciones basadas en la naturaleza, infraestructura ligera en guadua, zonas de amortiguación y espacios públicos accesibles.
La propuesta articula la gestión del riesgo con la regeneración ecológica, la equidad territorial y el fortalecimiento comunitario, devolviendo protagonismo al río como eje cultural, ambiental y social.Pregrad
Resilient routes: leveraging deep learning to identify critical transportation links for humanitarian response
No full textThis research presents a novel application of graph neural networks (GNN) for identifying critical links in transportation networks during disaster response operations. We simulated diverse transportation networks with varying topologies, weight patterns, and source-terminal configurations to construct a comprehensive training dataset. For each network, we calculated critical link scores using three established vulnerability indexes—Cantillo’s index, global efficiency, and number of independent paths. Traditional approaches are computationally intensive, relying heavily on network size, supply/demand nodes, and disruption scenarios, making them impractical for large networks. Our GNN approach addresses this limitation by learning vulnerability patterns directly from network structures, eliminating the need for exhaustive scenario evaluation during inference. To validate the proposed approach, we applied it to both simulated and real-world transportation networks with diverse topological characteristics. We assess performance by sequentially removing links according to their criticality rankings and measuring the Global Importance Index (GII), which quantifies unsatisfied demand and importance post-disruption. This sequential disruption analysis allows direct comparison between GNN predictions and traditional vulnerability indexes. Comparative timing analyses demonstrate that our model identifies critical links with comparable accuracy but at a fraction of the computational cost, even under varying disruption scenarios. This work offers a scalable methodology for conducting vulnerability assessments on previously unmanageable network scales, advancing the planning of humanitarian aid distribution during natural disasters.Maestrí
Me robaron, pero denunciar no sirve para nada: estudio de casos sobre la experiencia de miedo vivido por las víctimas de delitos de hurto callejero en el municipio de Neiva
No full textEste estudio analiza las razones por las cuales algunas personas en el municipio de Neiva, Colombia, optan por no denunciar situaciones de violencia o conflictividad. A través de entrevistas semiestructuradas realizadas en 2025, se identificaron factores como la desconfianza en las instituciones, el temor a represalias y la percepción de ineficacia de los mecanismos formales de denuncia. Como insumo contextual, se examinaron videos publicados en redes sociales por medios locales para comprender cómo las narrativas mediáticas configuran los imaginarios sociales sobre la denuncia. Los resultados muestran que tanto las experiencias previas de frustración como la representación pública de los procesos de denuncia inciden de manera significativa en la decisión de no acudir a las autoridades.Maestrí
Environmental Impacts and Transitions across Illicit, Informal and Licit Economies in Colombia: Coca-Cocaine, Gold, and Cattle
No full textIllicit economies have been related in complex ways to the armed conflict and criminal governance in Colombia (CEV, 2022; Rettberg, Cárdenas, Ortiz-Riomalo, 2017). The development of these activities, along with state responses to control them, have had significant consequences for local economies and have also impacted the environment (Brombacher, Garzón & Vélez, 2021; UNODC, 2022; UNODC, 2021; Rubiano, Vélez & Rueda, 2020). The aim of this report is to analyze the functioning of the coca, cocaine, and gold mining production markets in Colombia to assess their relationships with environmental damages, such as deforestation. In addition to the functioning of these markets, this research explores the interactions of these illicit activities with other productive sectors that also generate environmental costs, such as cattle ranching. This research was conducted using a mixed-methods approach, integrating quantitative, spatial, and qualitative data based on field work conducted in three field sites. Using quantitative and spatial methods, it presents a comprehensive analysis of national dynamics on how these economies drive deforestation, influence environmental degradation, and interact with local socio-economic dynamics. The report also includes a qualitative component with insights from case studies in Meta, Putumayo, and Nariño and a literature review of the state's responses to the economies under study
Los efectos económicos y sociales del establecimiento del orden colonial en Nueva Granada (1650-1800)
No full textCódigos JEL.: N96, O43, O54Este artículo examina las repercusiones del establecimiento del orden colonial en la Nueva Granada entre mediados del siglo XVII y finales del siglo XVIII. Se argumenta que la colonización española configuró una economía fuertemente dependiente de la minería aurífera, la cual estructuró el comercio exterior y condicionó la producción agrícola y artesanal, subordinada a las necesidades de los centros mineros. A lo largo del siglo XVIII, la intensificación de esta producción coincidió con un mayor control fiscal y político por parte de la Corona, en el marco de las reformas borbónicas. En cuanto al trabajo, se evidenció una transición desde formas coercitivas —como la encomienda y la esclavitud— hacia regímenes semilibres con bajos salarios, cuya forma y valor variaban según región, sector y ocupación. Este proceso implicó además una recomposición étnica de la fuerza laboral, con el incremento de mestizos y blancos pobres ante el declive de la población indígena. El resultado fue una sociedad profundamente desigual, donde la propiedad de tierras, esclavos y minas era restringida y jerarquizada. Finalmente, el Estado colonial tuvo una presencia desigual, particularmente limitada en territorios con alta segregación racial y escasa provisión de bienes públicos.This article examines the repercussions of the establishment of the colonial order in New Granada between the mid-17th and late 18th centuries. It argues that Spanish colonization shaped an economy heavily dependent on gold mining, which structured foreign trade and conditioned agricultural and artisanal production, subordinated to the needs of the mining centers. Throughout the 18th century, the intensification of this production coincided with greater fiscal and political control by the Crown, within the framework of the Bourbon reforms. Regarding labor, there was a transition from coercive forms—such as the encomienda and slavery—to semi-free regimes with Iow wages, the form and value of which varied by region, sector, and occupation. This process also entailed an ethnic recomposition of the labor force, with an increase in mestizos and poor whites in the face of a declining indigenous population. The result was a deeply unequal society, where ownership of land, slaves, and mines was restricted and hierarchical. Finally, the colonial state had an uneven presence, particularly limited in territories with high racial segregation and scarce provision of public goods
Lo que ya no me entra tampoco me habita
No full textEste proyecto surge de una experiencia personal y de un acto cotidiano, el abrir mi closet y encontrar prendas colgadas que representan versiones anteriores de mí misma. Ropa que ya no me queda, que ya no uso, que ya no me gusta o incluso que ya no sirve. Durante muchos años tuve la idea en mi cabeza de que guardaba las prendas que ya no me quedaban de talla, que no se sentían cómodas o que estaban des-gastadas porque algún día volvería a usarlas. Prendas que algún día amé, ahora solo cuelgan de los ganchos y son testigos de un cuerpo que ya no habito.
Lo que antes creía era apego por la ropa, hoy sé que es apego por un cuerpo pasado, un cuerpo con el que me sentía más cómoda, aceptada y delgada. Entender esto me hizo reflexionar y comprender la relación que existe entre mi cuerpo y mi ropa. Me di cuenta de que no guardaba las prendas por estética, las guardaba con la esperanza de volver a tener el cuerpo que las lucía o quizás por negación a un miedo, el miedo a aceptar que mi cuerpo cambió. Como si de alguna manera al seguir colgadas en mi clóset el tiempo se pudiera detener, en mi cabeza solo el hecho de conservarlas me aseguraba que algún día me iban a quedar de nuevo y solo entonces iba a poder mostrar esa versión de mí que tenía idealizada.Pregrad
Valorization strategy of peach-palm fruit (Bactris gasipaes) from Guaviare through extraction and characterization of carotenoid-rich and starch-rich fractions
No full textPeach-palm, known locally as chontaduro, is a key crop within the agricultural sector of Guaviare, valued for its high nutritional and functional properties. In 2023, Colombia produced a total of 71,917.85 tons of peach-palm, of which Guaviare contributed 13.35% (9,603.50 tons) cultivated over 2,281 hectares. This crop represents 6.81% of the department’s net agricultural production, ranking fifth after plantain, sugarcane, cassava, and pineapple. Its cultivation has gained importance as a sustainable economic alternative following the eradication of illicit crops, offering viable livelihood options to families previously dependent on coca farming. Traditional uses of the fruit include boiling the fruit for direct consumption or processing it into flour for animal feed and artisanal human consumption in baked goods, beverages, desserts, and ice cream.
Peach-palm has been highly valued as a nutrient-dense food due to its rich content of health-promoting components, including unsaturated fatty acids, dietary fiber, certain essential amino acids, and especially its high levels of carotenoids. These attributes have motivated interest in obtaining carotenoid-rich extracts as value-added compounds, highlighting the importance of environmentally responsible extraction methods. Conventional solvents may compromise both safety and extract quality, particularly given the sensitivity of carotenoids to light, oxygen, and heat—factors that remain key challenges in developing stable functional ingredients from this fruit.
Among alternative extraction techniques, ultrasound-assisted extraction (UAE) has been widely applied for the recovery of carotenoids from natural sources such as tomato peel, mango, and even peach-palm. This method relies on acoustic cavitation, where ultrasonic waves induce cell wall disruption, enhancing the release of intracellular compounds. The combination of UAE with GRAS solvents—including edible oils, ethanol, and ethyl acetate—improves extraction efficiency while minimizing environmental and health risks. Additionally, supercritical fluid extraction (SFE) using CO₂ at supercritical conditions (above 73.8 bar and 31.4 °C) has proven effective for extracting lipophilic compounds. SFE ensures high selectivity and compound stability, leaves no solvent residues, and reduces waste generation.
Furthermore, given that peach-palm is a notable source of starch, a circular and zero-waste processing approach allows the valorization of the residual biomass remaining after carotenoid extraction. This byproduct contains a significant amount of starch—a natural polymer that can be extracted, modified, and utilized as a food additive offering an alternative to conventional commercial starches. Additionally, peach-palm starch can be thermoplasticized using environmentally friendly formulations to produce biodegradable films, with promising applications in sustainable food packaging.
The circularity approach, previously mentioned in relation to the valorization of residual starch after peach-palm carotenoids extraction, aligns with the broader framework of biorefineries—integrated systems that apply clean and efficient technologies to fractionate biomass into multiple high-value products. Within this model, product-driven biorefineries prioritize the generation of bio-based food ingredients, biomaterials, and bioactive compounds over energy production. This perspective is especially relevant for the economic diversification in Guaviare, where peach-palm represents a promising yet underutilized crop.
Thus, the objective of this research was to develop a product-oriented biorefinery strategy for peach palm (Bactris gasipaes) cultivated in the Guaviare region, focusing on the recovery and valorization of high-value fractions, specifically carotenoids and starch, within the framework of circular bioeconomy principles.Maestrí